4OHDA

Leopard syndrome-associated shp2/a461t mutant
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
526
structure length
494
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFEPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSTGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular basis of gain-of-function LEOPARD syndrome-associated SHP2 mutations.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 145
structure length 494
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2014-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4ohdA03
1C85A 2MC1A 1XM2A 2DXPA 2BGEA 1LUMA 2CM2A 2EOBA 5J3XA 1G4WR 1SHBA 1O4IA 4Y2EA 3QCEA 1O4GA 1CSZA 1NWEA 2F6VA 2F6FA 2HY3A 1R1PA 2Q05A 3TL0A 1LKKA 2FJNA 2CBLA 1I9SA 2J17A 1A1EA 1BLJA 1LQFA 1YVLA 3VRZA 4K2RA 4NWGA 1NRVA 4WWQA 2P6XA 2EYVA 1CJ1A 3OB1B 1NO6A 3ZM2A 2VEXA 1BHHB 1AD5A 4AZ1A 5I6VA 2BZLA 2B4SA 3QCCA 4RDDA 3BKBA 1BKLA 3MOWA 1GHUA 2H4KA 3V0GA 1D5RA 1T49A 1YGUA 3BM8A 2EU0A 1JYRA 5DC0B 1NNYA 1B47A 2YU7A 3BRHA 3EZZA 1LUNA 3RO1A 2ESBA 3V0FA 4D3RA 1BFIA 1V3AA 4QBWA 2BV5A 3S8OA 3U96A 1O4CA 5KA1A 3PFVA 4ZI4A 2LNWA 5IBSA 2F6ZA 1I3ZA 2NT2A 4R0SA 3ZMQA 4JBCA 2I6PA 2HDXA 1JYUA 1G1HA 1Q6SA 1SPSA 2CNEA 2B4PA 3ZV2A 1QXKA 4DGPA 3SR9A 3US4A 3N0AA 3EU0A 5KACA 1PYNA 5AULA 4RHGA 3VROA 1BFJA 3D1QA 3OP0A 3EMUA 1XA6A 2MRJA 1FBZA 2NTAA 3A5JA 5HKWA 2Y1NA 3F81A 4WU2A 3RZ2A 1G1FA 2PSZA 5HKZA 1Q6PA 1GWZA 1QADA 2ZMMA 4DGXA 2E0TA 2I4HA 1ONYA 1PH0A 2Y3AB 4LUEA 3O4TA 2AZRA 1RQQC 3CXLA 2H8HA 1MKPA 2DX0A 1TZEE 1KAKA 1XBOA 1O4AA 2MRKA 2CMCA 2H03A 2LQWA 1FQ1A 2CNHA 3EAZA 1AYAA 3QCGA 2Y2FA 1O46A 1Y57A 3VRRA 2VIFA 5IBMA 1OESA 1M3GA 4S0GA 1RJAA 5KAAA 2IUIA 4QBEA 5KA3A 4PVGA 1WAXA 2GP0A 3CWEA 1U26A 1G7FA 4Z6BA 5BUGA 2RMXA 2DVJA 5J8RA 3VS1A 2C7SA 3PJPA 3VRNA 1BG1A 1ZC0A 4WOHA 1OEVA 5M43A 2NT7A 3QCKA 3S8LA 2J16A 1C83A 3GQIB 4WTYA 3CWGA 3O3LA 3OV1A 2B4OA 4P9ZA 3CBLA 3M7FA 1G83A 3S9KA 3O4SA 1O4DA 2PTKA 4OHEA 4M4ZA 1O4EA 1RPMA 2CIAA 1JU5A 2YSXA 1CWDL 1O4NA 2CMAA 4GPLB 2I6MA 1O41A 1TCEA 1Q6TA 1O44A 3GXXA 2L4KA 2ABLA 1JYQA 5K25A 1PICA 1PA1A 3S3HA 1A07A 3PSKA 3VS2A 1A08A 2IMGA 2CNGA 4NWFA 2I75A 1O4JA 1Z3KA 2H5KA 3QKQA 2IZVA 5KAZA 1FHSA 2HC2A 3T04A 3VGOA 1NL9A 5KA0A 4JEGA 3V0IA 3N8MA 2I1YA 5K9VA 3AWFA 3MMJA 3SMEA 2R0BA 3PSJA 1O4PA 4EIHA 4QAHA 4GE2A 2C46A 3S4EA 2A8BA 1G1GA 4F5AA 1YWFA 1A81A 1BHHA 2HCKA 5KA4A 3NHNA 2QCTA 4R30A 1OEUA 2NV5A 2VEUA 3F41A 2LNXA 2F71A 1BM2A 2F6WA 5KADA 1FPZA 3QCJA 2HNPA 2QBPA 1O4FA 1R1SA 4TVVA 4Y14A 1IS0A 3N7YA 2F70A 1WRMA 1SHDA 2I6OA 1JWOA 4GFVA 5DF6A 3GXHA 4H1OA 4K11A 4OHIA 3VRPA 1G4US 1AB2A 2IUGA 4TZIA 4LUDA 2RVFA 4QSYA 2BIJA 2FH7A 3S4OA 3MOZA 3GXWA 2DLYA 3VS4A 5KA8A 1U25A 4J51A 5AXIA 3VS7A 1OEOX 1ZCKA 1ZFPE 2QCJA 4RKKA 5DC9A 2HB1A 3PQZA 2OQ1A 4OHLA 2CNIA 2FJMA 4PYHA 1OETA 4ZRTA 3QCFA 1SPRA 2DM0A 4JMKA 3KFJA 2I3RA 3MAZA 1AAXA 1ECVA 1X24A 1Y1UA 2K79B 1OEMX 4BPCA 5GJHA 4NX8A 2QEPA 1R6HA 3UF4A 1SKJA 3WA4A 1Q1MA 1A1AA 1X6CA 1PXHA 2EO6A 1BLKA 1JF7A 1KSWA 1AYDA 2ECDA 3I80A 3BUOB 5HKYA 2QBQA 4EY0A 2I4GA 3F99A 2PNAA 1YZ4A 4GS0A 2CI9A 5BZXA 2F6YA 3CM3A 1CWEA 2Y96A 3QCNA 1H9OA 2H46E 1OO3A 2HC1A 3RGQA 1I9TA 5BZZA 3V0DA 1LUIA 4A4BA 1O45A 3I36A 4WU3A 2PI7A 3QCLA 3VS0A 1ONZA 2PBNA 2EKXA 5D0JA 1GFYA 2B07A 3I7ZA 1PTYA 3K2MA 1FU5A 5EEQA 4JMJA 4K44A 4JGHA 3QKPA 3S3EA 5BO4A 3BUMB 3M4UA 3NMEA 2PNBA 4OHDA 3BLTA 1A1BA 4QUNA 4K45A 1XRIA 4E68A 3OB2B 1YFOA 2VEVA 2HVLA 2LQNA 1KAVA 1ZZWA 4I8NA 2GJTA 3VS6A 3MXCA 2EYYA 2CM8A 1ZCLA 1L8GA 1LUKA 2HUWA 2RORA 4JE4A 2KNOA 1YVHA 2OZOA 1R1QA 4GL9E 2I4EA 4GRZA 2B49A 4X6SA 4FL3A 4GFUA 3ZM1A 4YAAA 2XP1A 4ICZA 2CI8A 1WQUA 2BGDA 3D9CA 4YR8B 1YTNA 5EELA 2ZN7A 1YPTA 1J4XA 1NWLA 2Y1MA 3D1HA 4KYRA 1HCSB 5MMZB 4GRYA 2IUHA 1Q6MA 1MW4A 2EYZA 1NZVA 2L3TA 2QBRA 2C0TA 2A3KA 3TKZA 1Q6JA 1LARA 3A5KA 4B04A 1SUGA 2QDPA 3D44A 4JNBA 4XZ0A 3IMDA 1AYCA 5AWXA 5KA9A 2SHPA 1A1CA 5DC4A 1BZJA 2SRCA 4F5BA 3F9AA 1O43A 1VHRA 1BMBA 2PA5A 4NNDA 5GJIA 2K7AB 3HCKA 4OHHA 3BUNB 2AOBA 1NZLA 1D4WA 1L8KA 1K9AA 1RPYA 4QAPA 1C86A 5KA2A 2OOQA 1HCTB 1OHEA 1YTWA 2AHSA 4KYQA 3BUXB 1NZ7A 2PLEA 1C87A 1O4BA 4IKCA 2MQIA 2F6TA 1F1WA 5K23A 4HRFA 4XZ1A 2FCIA 1FU6A 4RI4A 4E93A 2G6ZA 2QMSA 1Q6NA 2NZ6A 1LYVA 1O42A 1X27A 1BZHA 1YGRA 2QDCA 3RGOA 1D4TA 2B4UA 1AOTF 2AOAA 2DCRA 4QUMA 1O4QA 3OVEA 5KABA 3O5XA 1T48A 3ZNIA 2ETZA 2I42A 4RH9A 1U24A 4D3QA 3IN8A 4ZN5A 5EHPA 1CSYA 2I3UA 2VEWA 3V0HA 1GRIA 1PTVA 1OPKA 2CRHA 2WGPA 1A5YA 3VRQA 2MK2A 4F59A 1XXVA 1C88A 1AOUF 1D1ZA 2CR4A 1P13A 3HHMB 2I6JA 1O4KA 2M3VA 4GWFA 4U17A 2VEYA 4P9VA 5HDEA 1FPRA 1OPLA 1UURA 4D8KA 3OMHA 5K9WA 2GSBA 4NYHA 3QCMA 2GE9A 4BJOA 1BHFA 1FMKA 1AYBA 1JLNA 1F2FA 2F46A 5K22A 1BF5A 5KA7A 1C84A 3D1OA 5EHRA 2OUDA 1QCFA 1O47A 5CDWA 2CM3A 2MBCA 1KC2A 4H34A 2H04A 2JJDA 4ROJA 3HIZB 3S3KA 3UYOA 2H4VA 3QWYA 3MXYA 1QZ0A 2I5XA 4GE6A 2CFVA 2EL8A 1PTTA 4R0TA 1T4JA 2B3OA 3BLUA 3H2XA 3BUWB 3GXGA 1O4MA 3PLFB 4L1BB 1LKLA 1WCHA 3IN7A 2FO0A 3QCBA 3EB1A 4FBNA 1EEOA 3OLRA 2QBSA 2HMHA 2I6IA 2AUGA 3ZM0A 1YN9A 2HNQA 1MILA 3F9BA 2JYQA 2C9WA 2KK6A 2G59A 1BZCA 3C7IA 2OZ5A 3VS3A 1P15A 1IJRA 4KI9A 1O4HA 1PTUA 1LCKA 2HXPA 4ERCA 1O49A 4RI5A 1SHAA 3O4UA 4RH5A 2RF6A 4U1PA 1KA7A 1LCJA 2LCTA 2PT0A 3B7OA 3V0EA 3VRYA 1EENA 3AWGA 2RSYA 3ZM3A 2P4DA 3VS5A 2PQ5A 3N84A 1M61A 2BBUA 3QCIA 3PS5A 2CJZA 2CS0A 3S8NA 1QG1E 1FBVA 1X0NA 2HCMA 1UUSA 1O4RA 2CM7A 2CMBA 4D3PA 3QCDA 5K24A 1XXPA 1A09A 1BKMA 2QDMA 4HJQA 2L6KA 4A4CA 1I57A 2J16B 2EO3A 1O48A 2NLKA 3CD3A 1OHDA 3S3FA 3IMJA 4HJPA 3EAXA 3AWEA 1OHCA 1O4LA 2GWOA 3V0JA 2C0OA 2Q47A 1KA6A 1O4OA 2DLZA 1RXDA 2PLDA 3QWXX 1M27A 5EG3B 4MBBA 1OO4A 3D42A 1YTSA 1FYRA 1PA9A 2H02A 5GTJA 3LJ8A 2HDVA 3EACA 3QCHA 1G7GA 2OC3A 2YDUA 2C0IA 4GE5A 3ZMPA 5LXQB 4FL2A 2H4GA 5BX1A 2CNFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C85A 2MC1A 1XM2A 2DXPA 2BGEA 1LUMA 2CM2A 2EOBA 5J3XA 1GG4A 1G4WR 1SHBA 1O4IA 4Y2EA 3QCEA 1O4GA 1CSZA 1NWEA 2F6VA 2F6FA 2HY3A 1R1PA 2Q05A 3TL0A 4HV4A 1LKKA 2FJNA 2CBLA 1I9SA 1E0DA 2J17A 1A1EA 1BLJA 1LQFA 1YVLA 3VRZA 4K2RA 4NWGA 2AM2A 1NRVA 2GC5A 4WWQA 2P6XA 2EYVA 1CJ1A 3OB1B 1NO6A 3ZM2A 2VEXA 1BHHB 1AD5A 4AZ1A 5I6VA 2BZLA 2B4SA 3QCCA 2VOSA 4RDDA 3BKBA 1BKLA 3MOWA 1GHUA 2H4KA 3V0GA 1D5RA 1T49A 1YGUA 3BM8A 2EU0A 1JYRA 5DC0B 1NNYA 1B47A 2YU7A 3BRHA 3EZZA 4CVKA 1LUNA 3RO1A 2ESBA 3V0FA 2LRAA 4BUCA 4D3RA 1BFIA 1V3AA 4QBWA 2BV5A 3S8OA 3U96A 1O4CA 5KA1A 3PFVA 4ZI4A 2LNWA 5IBSA 2F6ZA 1I3ZA 2NT2A 4R0SA 3ZMQA 4JBCA 2I6PA 2HDXA 1JYUA 1G1HA 1Q6SA 1SPSA 2CNEA 2B4PA 2JFGA 3ZV2A 1QXKA 4DGPA 3SR9A 3US4A 3N0AA 3EU0A 5KACA 1PYNA 5AULA 4RHGA 3VROA 1BFJA 3D1QA 3OP0A 3EMUA 1W78A 1XA6A 2MRJA 1FBZA 2NTAA 3A5JA 5HKWA 2Y1NA 3F81A 4WU2A 3RZ2A 1G1FA 2PSZA 5HKZA 1Q6PA 1GWZA 1QADA 2ZMMA 4DGXA 2E0TA 2I4HA 1ONYA 1PH0A 2Y3AB 4LUEA 3O4TA 2AZRA 1RQQC 3CXLA 2H8HA 1MKPA 2DX0A 1TZEE 1KAKA 1XBOA 1O4AA 2MRKA 2CMCA 2H03A 2UUOA 2LQWA 1FQ1A 2CNHA 3EAZA 1AYAA 3QCGA 2Y2FA 1O46A 1Y57A 3VRRA 2VIFA 5IBMA 1OESA 1M3GA 4S0GA 1RJAA 5KAAA 2IUIA 4QBEA 5KA3A 4PVGA 1WAXA 2GP0A 3CWEA 1U26A 1G7FA 4Z6BA 1UAGA 5BUGA 3ZL8A 2RMXA 3ZM5A 2DVJA 5J8RA 3VS1A 2C7SA 3PJPA 3VRNA 1BG1A 1EEHA 1ZC0A 4WOHA 1OEVA 5M43A 2NT7A 3QCKA 3S8LA 2J16A 1C83A 3GQIB 4WTYA 3CWGA 3O3LA 3OV1A 2B4OA 4P9ZA 3CBLA 3M7FA 1G83A 3S9KA 3O4SA 1O4DA 2PTKA 4OHEA 4M4ZA 1O4EA 1RPMA 2CIAA 1JU5A 2YSXA 1CWDL 1O4NA 2CMAA 4GPLB 2I6MA 1O41A 1TCEA 1Q6TA 1O44A 3GXXA 2L4KA 2ABLA 2AM1A 1JYQA 5K25A 1PICA 1PA1A 3S3HA 1A07A 3PSKA 3VS2A 1A08A 2IMGA 2CNGA 4NWFA 2I75A 1O4JA 1Z3KA 2H5KA 3QKQA 2IZVA 5KAZA 1FHSA 2HC2A 3T04A 3VGOA 1NL9A 5KA0A 4JEGA 3V0IA 2Y67A 3N8MA 2I1YA 2UUPA 5K9VA 3AWFA 3MMJA 3SMEA 2R0BA 3PSJA 1O4PA 4EIHA 4QAHA 4GE2A 2C46A 3S4EA 2A8BA 1G1GA 4F5AA 3LK7A 1YWFA 1A81A 1BHHA 2HCKA 5KA4A 3NHNA 2QCTA 4R30A 1OEUA 2NV5A 2VEUA 3F41A 2LNXA 2F71A 1BM2A 2F6WA 5KADA 1FPZA 3QCJA 2HNPA 2QBPA 1O4FA 1R1SA 4TVVA 4Y14A 2X5OA 1IS0A 3N7YA 2F70A 1WRMA 1SHDA 2I6OA 1JWOA 4GFVA 5DF6A 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2OZOA 1R1QA 4GL9E 2I4EA 4GRZA 2UAGA 2B49A 4X6SA 4FL3A 4GFUA 3ZM1A 4YAAA 2XP1A 4ICZA 2CI8A 1WQUA 2BGDA 3D9CA 4YR8B 1YTNA 5EELA 2ZN7A 1YPTA 1J4XA 1NWLA 2Y1MA 3D1HA 4KYRA 1HCSB 5MMZB 4GRYA 2IUHA 1Q6MA 1MW4A 2EYZA 1NZVA 1P31A 2L3TA 2QBRA 2C0TA 2A3KA 3TKZA 1Q6JA 1LARA 3A5KA 4B04A 1SUGA 2QDPA 3D44A 4JNBA 4XZ0A 3IMDA 1AYCA 5AWXA 5KA9A 3MVNA 2SHPA 2JFFA 1A1CA 5DC4A 1BZJA 2SRCA 4F5BA 3F9AA 1O43A 1VHRA 1BMBA 2PA5A 4NNDA 5GJIA 2K7AB 3HCKA 4OHHA 3BUNB 2AOBA 1NZLA 1D4WA 1L8KA 1K9AA 1RPYA 2GCBA 4QAPA 1C86A 5KA2A 2OOQA 1HCTB 1OHEA 1YTWA 2AHSA 4KYQA 2VTEA 3BUXB 1NZ7A 2PLEA 1C87A 1O4BA 4IKCA 2MQIA 2F6TA 1F1WA 5K23A 4HRFA 4XZ1A 2FCIA 1FU6A 4RI4A 4E93A 2G6ZA 2QMSA 1Q6NA 2NZ6A 1LYVA 1O42A 1X27A 1BZHA 1YGRA 2QDCA 3RGOA 1D4TA 2B4UA 1AOTF 2AOAA 2DCRA 4QUMA 3NRSA 2XJAA 4CVMA 1O4QA 3OVEA 5KABA 3O5XA 1T48A 3ZNIA 2ETZA 2I42A 4RH9A 1U24A 4D3QA 3IN8A 4ZN5A 5EHPA 1CSYA 3LYVA 2I3UA 2VEWA 3V0HA 3QCZA 1GRIA 1PTVA 1OPKA 2CRHA 2WGPA 1A5YA 3VRQA 2MK2A 4F59A 1XXVA 1C88A 1AOUF 1D1ZA 2CR4A 1P13A 3HHMB 4QDIA 2GCAA 2I6JA 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 1M27 A;  5EG3 B;  4MBB A;  1OO4 A;  3D42 A;  1YTS A;  1FYR A;  1PA9 A;  2H02 A;  5GTJ A;  3LJ8 A;  2HDV A;  3EAC A;  3QCH A;  1G7G A;  2OC3 A;  2YDU A;  2C0I A;  4GE5 A;  3ZMP A;  5LXQ B;  4FL2 A;  2H4G A;  5BX1 A;  2CNF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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