4OHDA

Leopard syndrome-associated shp2/a461t mutant
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
526
structure length
494
Chain Sequence
b'TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFEPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSTGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Molecular basis of gain-of-function LEOPARD syndrome-associated SHP2 mutations.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 145
structure length 494
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2014-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4ohdA03
1B47A 4F59A 3PJPA 1T4JA 2CFVA 2A8BA 1O49A 2I4GA 5K23A 2CJZA 1G4US 4GS0A 1NRVA 1V3AA 2J17A 1Q6MA 3V0FA 2HDVA 2QDPA 4NX8A 2HB1A 1OHEA 5HKWA 1C87A 1FHSA 3GXGA 3HIZB 1SPSA 2EO3A 2IUIA 1U26A 1O4RA 2I1YA 4JMJA 1I9TA 2L3TA 3V0JA 5K9WA 1YGRA 4JMKA 4WU3A 2HCMA 1BZCA 3OMHA 1O45A 2CNEA 1P15A 4QAPA 1OEUA 2HNPA 5K9VA 1XM2A 3EZZA 2RSYA 4GE6A 2MK2A 1O4LA 3ZM3A 1LQFA 1PTUA 2PQ5A 2VEVA 3EB1A 1O4CA 2VIFA 3ZM1A 4RKKA 2I4HA 4HJQA 2CMBA 2FJNA 3V0IA 3TL0A 1AB2A 4PYHA 3VS7A 3K2MA 2LNWA 1G83A 1BFIA 1O4BA 1NWEA 2CM7A 2BGEA 1UURA 3MMJA 1D1ZA 1BHFA 1RPMA 3BUWB 2F6FA 3O4SA 2XP1A 3IN8A 1BM2A 2BIJA 4TVVA 3SMEA 4D3RA 1Y1UA 1Y57A 1M27A 2RVFA 1GRIA 1TZEE 3S8NA 2PNBA 3ZM0A 3F81A 2LQWA 2F6VA 1O4HA 1O4FA 1R1SA 3ZV2A 3CWEA 2ZMMA 4Y2EA 4H1OA 1SKJA 1X24A 1LCKA 2CNGA 3V0EA 1GFYA 1YVHA 2HCKA 1LUNA 3BLTA 4EY0A 2CMAA 4LUEA 4NWGA 2DVJA 1OETA 3F41A 1EEOA 1M61A 2F6ZA 2I6MA 5LXQB 2ETZA 1C88A 1G7FA 3A5KA 3VS1A 1R1QA 3M4UA 2RORA 1LARA 2GP0A 2HVLA 2CNIA 3IMDA 3S8LA 4D8KA 3VS5A 3CM3A 1RJAA 3QCMA 5BO4A 5KA1A 2EL8A 3EU0A 5KACA 4OHHA 4OHLA 4ZRTA 1SHBA 2OUDA 2G6ZA 1O4GA 3PLFB 5D0JA 3VRPA 2G59A 1AYCA 1GHUA 2L6KA 4DGXA 2J16A 2DLZA 1LKKA 4GWFA 1A81A 2OC3A 3D9CA 3QCLA 2IMGA 5DC9A 2P4DA 4BJOA 1OHDA 3MXYA 1I9SA 4WTYA 1A07A 2BV5A 1AYAA 2AOBA 3EAZA 4RI4A 2ZN7A 3HCKA 2QBPA 1LUIA 4TZIA 2BGDA 1KAKA 1YTSA 4RI5A 3RGQA 3OP0A 2NZ6A 3SR9A 2H46E 5EEQA 3VRYA 3U96A 1LUMA 1ZCKA 2CM8A 2Y2FA 1RXDA 1ZFPE 3VGOA 5K24A 4GRZA 2I75A 2RF6A 4NNDA 3BUOB 5KAAA 1ZZWA 4JGHA 2B4SA 2I6PA 1D4WA 3OV1A 1A1EA 3MOWA 5IBMA 1KA6A 5AXIA 3QCNA 2H5KA 1NWLA 3I7ZA 1AAXA 2J16B 2JYQA 1XA6A 5KADA 2A3KA 2I4EA 2GJTA 3D1OA 5M43A 2LQNA 2M3VA 1T49A 2DX0A 1QADA 2EKXA 2IUGA 1SPRA 1PH0A 5KA9A 1I57A 2EO6A 1O41A 2K79B 4FL2A 3QKQA 1O4JA 3QCIA 2DCRA 2HNQA 2IZVA 5KAZA 1KSWA 3CXLA 3MOZA 5BUGA 3S9KA 2CI8A 2SHPA 1YTWA 3S3EA 1YTNA 1BMBA 3CBLA 2I6OA 1NO6A 3AWEA 3EMUA 2H4GA 3O4UA 3N84A 1CWEA 2MQIA 3S4EA 1PTYA 1A1BA 2E0TA 2RMXA 1QZ0A 1FU5A 3CD3A 4QAHA 5EHRA 2OZ5A 2WGPA 4ZI4A 1M3GA 3QCBA 2MRKA 1ONZA 4JNBA 5IBSA 4R0SA 1AOTF 3GXXA 5GJHA 4GPLB 4FL3A 3BUNB 3QCHA 3VS2A 1OEOX 1O4KA 3BRHA 1IS0A 2QBSA 4QBEA 2BBUA 1U24A 2EU0A 4GFUA 4JE4A 1BLJA 3ZNIA 4K44A 1A1AA 1O4AA 2F6YA 1Q1MA 1T48A 4P9ZA 1BHHA 4ICZA 4WU2A 3OB2B 1Q6SA 1RPYA 1K9AA 2F6TA 2LNXA 3N8MA 1AYDA 5DF6A 3UYOA 2VEXA 5BZXA 1Z3KA 2PSZA 1I3ZA 1BKMA 2FH7A 2C0OA 2ABLA 2EYZA 2QDCA 3F99A 3QCCA 1RQQC 1FPRA 4Z6BA 1KC2A 1OO3A 1BG1A 2HMHA 2C46A 2SRCA 3VRQA 3AWGA 3D42A 2OQ1A 4X6SA 1WRMA 3ZM2A 4XZ0A 1FBZA 1OEMX 4KI9A 2PTKA 3S3KA 3ZMPA 3QCDA 2VEUA 3RO1A 1C85A 2CM3A 3N0AA 4HJPA 4QBWA 4H34A 3ZMQA 1BHHB 1O4MA 2F6WA 5CDWA 2H02A 2HC1A 1F2FA 1F1WA 4M4ZA 4EIHA 3EACA 1JWOA 4U17A 1G1GA 1D5RA 4NYHA 1NL9A 3D1HA 2CR4A 3VRNA 4F5AA 1OPKA 1AOUF 3V0GA 1CSZA 5I6VA 2CBLA 3MXCA 1UUSA 4DGPA 5KA0A 4QUMA 1C86A 1FYRA 1XBOA 1WAXA 2VEWA 1O4QA 3BUXB 2OOQA 2FO0A 2KK6A 1PXHA 1BKLA 3LJ8A 1LUKA 1HCTB 3HHMB 5GTJA 1PTTA 1L8GA 3F9BA 3US4A 2Y96A 3T04A 1O4IA 3S4OA 1YZ4A 2PNAA 2HUWA 2ESBA 4YAAA 1KA7A 1X27A 1SUGA 4PVGA 3VS6A 1H9OA 4LUDA 2EOBA 5MMZB 4FBNA 3BLUA 2NLKA 5K22A 1R6HA 3O5XA 2JJDA 2DXPA 1CJ1A 3NMEA 2C0IA 1YVLA 1PICA 3VROA 1ZCLA 3B7OA 4GRYA 1O44A 2Q05A 3OB1B 4F5BA 2CS0A 1NZLA 1A1CA 2AOAA 4K11A 2NT7A 3QCJA 3D1QA 2K7AB 1LCJA 5BX1A 5HKZA 2HC2A 2AHSA 1JYUA 4KYQA 3A5JA 2EYVA 3WA4A 4D3PA 1YGUA 3PS5A 2B4UA 4WOHA 1YFOA 3QCGA 1Q6JA 3F9AA 2QMSA 5GJIA 2B3OA 4ERCA 2C9WA 4HRFA 5BZZA 4A4BA 2MBCA 4MBBA 1LYVA 2QCJA 1JF7A 2QDMA 1G7GA 4R30A 3QCFA 1O42A 3BUMB 1FBVA 1QG1E 5K25A 4IKCA 4OHEA 4E68A 1Q6NA 5EHPA 1NNYA 1PA9A 1TCEA 1XXPA 2NV5A 1D4TA 1LKLA 2PLEA 1OESA 2R0BA 1OPLA 4A4CA 4KYRA 3GXWA 2I5XA 4GE5A 3V0HA 1O4PA 3O3LA 4S0GA 4B04A 2Y1NA 3O4TA 3N7YA 3BKBA 2CM2A 1FPZA 3TKZA 4RDDA 2PT0A 3UF4A 4RH9A 1GWZA 2B49A 3I80A 1A09A 1AD5A 1NZ7A 1WCHA 2YSXA 2CIAA 4U1PA 5DC4A 5KA3A 1SHAA 1O4EA 5KABA 4L1BB 2B07A 2H04A 2HDXA 1ONYA 1FMKA 3PFVA 4RHGA 3QCKA 2F46A 2KNOA 1X6CA 1AYBA 4OHIA 1YPTA 1PTVA 2Y1MA 3VRZA 3BM8A 1BLKA 1OEVA 1O43A 2PI7A 3V0DA 2AZRA 5J3XA 2ECDA 1QXKA 3PSJA 2C7SA 2H03A 2CRHA 3QWYA 2VEYA 5KA8A 2FCIA 3C7IA 2H4KA 5KA7A 2CI9A 2QBRA 2B4OA 4NWFA 1YN9A 3EAXA 4D3QA 2YDUA 4Y14A 2IUHA 3S8OA 1A5YA 1BZHA 1CSYA 1O4NA 2QEPA 1R1PA 5KA4A 2H8HA 1ECVA 2QCTA 3I36A 3IMJA 2Y3AB 1L8KA 3VS4A 1A08A 2AUGA 1X0NA 3AWFA 2DLYA 1P13A 3NHNA 2GWOA 1OO4A 1J4XA 2BZLA 2HXPA 1O48A 1O4OA 2CMCA 4GL9E 3H2XA 2B4PA 1HCSB 1KAVA 1JYRA 4K45A 3VS0A 5AULA 1IJRA 2QBQA 5KA2A 3OVEA 1FQ1A 1O47A 2GE9A 3PQZA 4BPCA 1U25A 4J51A 2PA5A 3RZ2A 2OZOA 3RGOA 3S3FA 2P6XA 1SHDA 1PYNA 4R0TA 3MAZA 4RH5A 4ROJA 2MC1A 2NTAA 2I42A 1G4WR 5DC0B 3QKPA 4I8NA 3OLRA 1XRIA 2PBNA 3D44A 2H4VA 1MW4A 3GQIB 2I6JA 4QUNA 1VHRA 2GSBA 2I3RA 4WWQA 1FU6A 2FJMA 4XZ1A 2YU7A 3IN7A 4QSYA 1O4DA 5HDEA 4GFVA 2EYYA 2HY3A 1BZJA 1ZC0A 3M7FA 2I3UA 1C84A 5HKYA 3KFJA 1CWDL 2I6IA 2F71A 3PSKA 2F70A 2L4KA 1BFJA 2CNFA 3VRRA 1JYQA 1JLNA 3VS3A 2PLDA 4GE2A 2Q47A 5AWXA 3CWGA 1WQUA 1NZVA 2MRJA 2DM0A 1EENA 1BF5A 1MKPA 1PA1A 4OHDA 1XXVA 4YR8B 1O46A 5J8RA 1JU5A 1Q6TA 1YWFA 5EELA 2NT2A 3QCEA 3GXHA 4ZN5A 1MILA 3S3HA 4K2RA 4E93A 1OHCA 4JBCA 2C0TA 1Q6PA 5EG3B 3QWXX 1G1FA 1C83A 2CNHA 1G1HA 4JEGA 1QCFA 2LCTA 4AZ1A 4P9VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B47A 4F59A 3PJPA 1T4JA 2WTZA 2CFVA 2A8BA 1O49A 2I4GA 5K23A 4HV4A 2CJZA 1G4US 4GS0A 1NRVA 1V3AA 2J17A 1Q6MA 3V0FA 2HDVA 2QDPA 4NX8A 2HB1A 1OHEA 5HKWA 1C87A 1FHSA 2XPCA 3GXGA 2VOSA 3HIZB 1SPSA 2EO3A 2IUIA 1U26A 1O4RA 2GC5A 2I1YA 4JMJA 1I9TA 2L3TA 3V0JA 5K9WA 1YGRA 4JMKA 4WU3A 2HCMA 1BZCA 3OMHA 1O45A 2CNEA 2UUPA 1P15A 4QAPA 1OEUA 2HNPA 5K9VA 1XM2A 3EZZA 2RSYA 4GE6A 2MK2A 1O4LA 3ZM3A 1LQFA 1PTUA 2PQ5A 2VEVA 3EB1A 1O4CA 2VIFA 3ZM1A 4RKKA 2I4HA 4HJQA 2CMBA 2FJNA 3MVNA 3V0IA 3TL0A 1AB2A 4PYHA 3VS7A 3K2MA 2LNWA 1G83A 1BFIA 1O4BA 1NWEA 2CM7A 2BGEA 1UURA 3MMJA 1D1ZA 1BHFA 2JFGA 1RPMA 3BUWB 2F6FA 3O4SA 2XP1A 3IN8A 1BM2A 2BIJA 4TVVA 3SMEA 4D3RA 1Y1UA 1Y57A 1M27A 2RVFA 1GRIA 1TZEE 3S8NA 2PNBA 3ZM0A 3F81A 2LQWA 2F6VA 1O4HA 1O4FA 1R1SA 3ZV2A 3CWEA 2ZMMA 4Y2EA 4H1OA 1SKJA 1X24A 1LCKA 2CNGA 2WJPA 3V0EA 1GFYA 2UAGA 1YVHA 2HCKA 1LUNA 3BLTA 4EY0A 2CMAA 4LUEA 4NWGA 2DVJA 1OETA 3F41A 1EEOA 1M61A 2F6ZA 2I6MA 5LXQB 2ETZA 1C88A 1G7FA 3A5KA 3VS1A 1R1QA 3M4UA 3ZM5A 2RORA 1LARA 2GP0A 3LK7A 3NRSA 2HVLA 2CNIA 3IMDA 3S8LA 4D8KA 3VS5A 3CM3A 1RJAA 1P31A 3QCMA 5BO4A 5KA1A 5A5FA 2EL8A 2Y1OA 3EU0A 5KACA 4OHHA 4OHLA 4ZRTA 1SHBA 2OUDA 2G6ZA 1O4GA 3PLFB 5D0JA 3VRPA 2G59A 1AYCA 1GHUA 2L6KA 4DGXA 2J16A 4ZIYA 2DLZA 1LKKA 4GWFA 1JBVA 1A81A 2OC3A 3D9CA 3QCLA 1W78A 2IMGA 5DC9A 2P4DA 4BJOA 1OHDA 3MXYA 1J6UA 1I9SA 4WTYA 1A07A 2BV5A 1AYAA 2AOBA 3EAZA 4RI4A 2ZN7A 3HCKA 2QBPA 1LUIA 4TZIA 2BGDA 1KAKA 1YTSA 4RI5A 3RGQA 3OP0A 2NZ6A 3SR9A 2H46E 5EEQA 3VRYA 3U96A 1LUMA 1ZCKA 2CM8A 2Y2FA 1RXDA 1ZFPE 3VGOA 3LYVA 4GRZA 5K24A 2I75A 2RF6A 4NNDA 3BUOB 5KAAA 1ZZWA 4JGHA 2B4SA 2I6PA 1D4WA 3OV1A 1A1EA 3MOWA 5IBMA 1KA6A 5AXIA 4QDIA 3QCNA 2H5KA 1NWLA 3I7ZA 1AAXA 2J16B 1JBWA 2JYQA 1XA6A 5KADA 2A3KA 2I4EA 4CVLA 2GJTA 3D1OA 5M43A 2LQNA 2M3VA 1T49A 2DX0A 1QADA 2EKXA 2IUGA 1SPRA 1PH0A 5KA9A 1I57A 2EO6A 1O41A 2K79B 4FL2A 3QKQA 1O4JA 3QCIA 2DCRA 2HNQA 2IZVA 5KAZA 1KSWA 3CXLA 3MOZA 5BUGA 3S9KA 2CI8A 2SHPA 1YTWA 3S3EA 1YTNA 1BMBA 3CBLA 2I6OA 1NO6A 3AWEA 3EMUA 2H4GA 3O4UA 3N84A 1CWEA 2MQIA 2XJAA 1O5ZA 3S4EA 1PTYA 1A1BA 2E0TA 2RMXA 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 1YWF A;  5EEL A;  2NT2 A;  3QCE A;  3GXH A;  4ZN5 A;  1MIL A;  3S3H A;  4K2R A;  4E93 A;  1OHC A;  4JBC A;  2C0T A;  1Q6P A;  5EG3 B;  3QWX X;  1G1F A;  1C83 A;  2CNH A;  1G1H A;  4JEG A;  1QCF A;  2LCT A;  4AZ1 A;  4P9V A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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