4OHDA

Leopard syndrome-associated shp2/a461t mutant
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
526
structure length
494
Chain Sequence
TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFEPKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSTGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Molecular basis of gain-of-function LEOPARD syndrome-associated SHP2 mutations.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 145
structure length 494
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2014-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohdA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4ohdA03
3BUXB 1FYRA 1RJAA 4U17A 2LNWA 3BRHA 2H4GA 5KACA 3VROA 2HXPA 1AYAA 1ZFPE 1NZ7A 4NNDA 1Q6JA 1V3AA 2HDVA 3OVEA 4U1PA 1F1WA 2PLDA 1KA6A 4K11A 4OHDA 4OHEA 3K2MA 3AWGA 1O4QA 2Q47A 1JF7A 1OESA 1WRMA 1X24A 1T49A 2BIJA 3PQZA 3D1OA 1KSWA 1X27A 1SHBA 1BF5A 4JMKA 1LKLA 4EIHA 1VHRA 2J16B 4XZ1A 1B47A 1IJRA 2QDCA 5KAAA 2F71A 1ZCKA 1O4EA 1OEUA 5AWXA 4H1OA 1TCEA 3VGOA 1O4GA 1BFIA 4D3QA 1O4RA 4AZ1A 4NYHA 1K9AA 1PXHA 4GE5A 1I9SA 1LQFA 3BUMB 3VS7A 2PA5A 1O43A 3QCEA 2I6MA 3ZM3A 1NZVA 3CWGA 2HY3A 3O4SA 1PA9A 3V0IA 3A5KA 2DXPA 1LUNA 2RVFA 1R1PA 2I6PA 4R0TA 3S3EA 3VRZA 1KC2A 2ECDA 1BLKA 2L6KA 2B07A 2J16A 3GXHA 3I36A 2PBNA 3CBLA 3RO1A 3OB2B 3S3FA 1FBVA 2K7AB 2CBLA 1GHUA 3QCNA 2XP1A 1EEOA 1QG1E 2Y2FA 1C83A 2YSXA 2GSBA 1P15A 1SHAA 3D1HA 1A1CA 3IMJA 2FCIA 1BM2A 1CJ1A 4E68A 2P6XA 3CD3A 5KA8A 4TZIA 1FU6A 2RSYA 3PSKA 1G1HA 1EENA 1IS0A 1O47A 1OO3A 2KK6A 3CWEA 2VEVA 4Y2EA 4X6SA 4OHIA 5KABA 5KA2A 2RMXA 1FBZA 1HCSB 1SPRA 4ROJA 3MMJA 5KA7A 1Y57A 3PSJA 3QCJA 2I3RA 3D1QA 5I6VA 4R30A 2OZ5A 2CMAA 3RGOA 3V0HA 1O4FA 3T04A 1OEVA 3S9KA 1QXKA 3N84A 1PA1A 2HCMA 3QCFA 3KFJA 4JEGA 4RH9A 1LKKA 1AD5A 1Z3KA 2EL8A 2PLEA 5HKWA 3RGQA 4B04A 4BPCA 1PYNA 1SKJA 2F6WA 2CM2A 2OUDA 3EB1A 4WTYA 4FBNA 2LQWA 1YZ4A 3QKPA 3OB1B 4GRYA 1T48A 1YN9A 3QCBA 3S8OA 3IMDA 4JMJA 1X0NA 1YGRA 3VS5A 1RPMA 1LYVA 2AOBA 2LCTA 5K22A 1OHEA 2ZN7A 3MOZA 5K24A 3V0FA 5K25A 2EYZA 5GJIA 1TZEE 4LUDA 1XXPA 1I3ZA 2CIAA 3PFVA 1QADA 1AAXA 3ZM0A 1LCJA 1SPSA 1G4US 3VRRA 1CSYA 1U25A 2F6FA 3ZM1A 1G7FA 3BUWB 4DGXA 4KYQA 4J51A 2BV5A 4YR8B 2DLYA 1AYBA 5BZZA 1O4HA 2CNHA 3CXLA 4TVVA 2AHSA 1D4TA 2KNOA 1YWFA 1M61A 4IKCA 2CM3A 4XZ0A 2QBRA 1JWOA 3VRNA 1YFOA 3MOWA 1O4IA 1P13A 1AYCA 1ECVA 1U26A 1CWDL 1OPLA 4OHHA 2CNIA 1A1BA 1O4LA 1NRVA 2NTAA 4D3RA 2OZOA 2H02A 2I1YA 1Q6TA 2H5KA 2R0BA 2Y96A 1O45A 1O4BA 1AYDA 1O46A 2C46A 3S3KA 2I75A 3VS3A 2EO3A 1XA6A 1LUMA 2F70A 5HDEA 3U96A 1MW4A 3EU0A 5K9VA 3V0EA 1UURA 2HC1A 3SMEA 3QCCA 3ZV2A 1NNYA 5KA9A 2SRCA 2EU0A 2MRKA 3QKQA 1O4JA 4K45A 5DC4A 1LCKA 2PI7A 2DM0A 2Y3AB 3EAXA 1XBOA 1O41A 2BGEA 4F59A 1O4AA 1ONZA 2OQ1A 4D3PA 1XXVA 1O4DA 4A4BA 2CM8A 2F6TA 1O4PA 1A81A 1Y1UA 5K9WA 3A5JA 2Y1MA 4JGHA 2CM7A 2NZ6A 2I5XA 2VIFA 4GL9E 3GQIB 1OEOX 2PNAA 1SHDA 2CNEA 3QCKA 3QCHA 2YDUA 1BKMA 1GRIA 1JYUA 5EHPA 3US4A 3ZMPA 2QCTA 2H4VA 2H46E 4F5BA 2B3OA 4GE2A 1BFJA 3S3HA 3MXCA 4NWGA 5BX1A 1F2FA 3VS1A 2DCRA 2QEPA 3M7FA 2HNPA 1A08A 2FH7A 5KAZA 2ABLA 1JYRA 2GWOA 2GP0A 3QCIA 2EKXA 2FJNA 2OOQA 4HJPA 1Q6NA 3VS0A 1PTYA 1NL9A 3GXWA 1A1AA 5HKZA 2I6IA 1ZZWA 3VS4A 1FPRA 3N8MA 1MKPA 4WOHA 1AB2A 1BZHA 4HJQA 1G1FA 1R1QA 2JJDA 1BZCA 5BZXA 4K44A 1Q6MA 5GJHA 2I42A 4JE4A 3WA4A 1O4CA 2HVLA 2QCJA 2PSZA 2HCKA 4QSYA 2IUGA 2YU7A 3VS6A 1MILA 1FU5A 2AUGA 1YPTA 2ESBA 4ZRTA 4RH5A 2CR4A 2CMBA 1FMKA 1O4NA 3MAZA 3MXYA 1O4KA 4I8NA 5EELA 3CM3A 2G59A 3F41A 1NO6A 2QMSA 3EAZA 3EMUA 2A8BA 5J3XA 3IN7A 3GXXA 1NWLA 2B49A 5EHRA 2I3UA 4QBWA 3S4EA 2BZLA 2CS0A 1FPZA 1WCHA 1M27A 2C0OA 1A5YA 2HNQA 2EO6A 3BUNB 3SR9A 1C86A 2F46A 3M4UA 3QCMA 1Q1MA 2PT0A 1AOTF 4R0SA 1L8KA 2Y1NA 3VRPA 1ONYA 1I57A 3HCKA 2I4HA 5BUGA 3D9CA 5D0JA 1BZJA 3V0GA 1D1ZA 2MQIA 2MC1A 1FQ1A 2A3KA 2H04A 2HMHA 3BKBA 1AOUF 2RF6A 4NX8A 1BMBA 3BM8A 3ZM2A 5KA3A 2CFVA 4QBEA 1Q6PA 4KYRA 2CRHA 1O44A 1O48A 3OP0A 5DC9A 4Y14A 1G7GA 1ZC0A 5EEQA 4P9VA 2I6OA 2BGDA 3BLUA 2I4GA 2RORA 1C87A 4F5AA 1KAKA 2F6VA 2P4DA 2C0IA 4ERCA 4GE6A 2BBUA 2JYQA 2F6ZA 3I80A 2NT7A 1G1GA 1D4WA 4RHGA 1ZCLA 3IN8A 3ZNIA 2PNBA 2IUIA 1D5RA 3QCDA 1BKLA 5IBMA 4HRFA 1L8GA 1T4JA 3VRQA 3OMHA 2E0TA 5KA1A 5LXQB 4RKKA 1KA7A 4NWFA 1I9TA 1WAXA 3B7OA 1LUIA 4GWFA 4A4CA 1R6HA 2FJMA 4YAAA 2FO0A 3ZMQA 4QAPA 2NV5A 2VEYA 1J4XA 2EYVA 2H4KA 3S4OA 4GFVA 2C7SA 1YGUA 2NLKA 1CSZA 4GPLB 1OO4A 1OETA 2CNGA 3PJPA 1PTVA 2QBPA 1QCFA 2MBCA 3EZZA 1BG1A 4ZI4A 3NHNA 2B4PA 4P9ZA 4JBCA 4WU2A 3OLRA 3UF4A 1JLNA 2HDXA 3QCGA 2K79B 4ICZA 4GRZA 2VEXA 3PS5A 3QWYA 3BLTA 1C84A 1FHSA 1BHFA 2DLZA 3F9BA 5AULA 4RI5A 1G4WR 2QDMA 4K2RA 2B4SA 2CI8A 2SHPA 2Q05A 5M43A 3D44A 1YVHA 2DX0A 1O49A 2LNXA 3RZ2A 1NZLA 2CMCA 5GTJA 2C9WA 1X6CA 1M3GA 1O4OA 5BO4A 3O5XA 2G6ZA 1QZ0A 3TKZA 3LJ8A 3O3LA 1GFYA 1RXDA 2DVJA 2GJTA 2ZMMA 5J8RA 1O42A 2CI9A 2MK2A 2MRJA 4EY0A 2VEWA 5DF6A 2AOAA 1O4MA 3C7IA 2M3VA 2VEUA 4S0GA 4ZN5A 2PQ5A 2EOBA 2LQNA 3HHMB 3QWXX 4DGPA 1YTSA 3UYOA 2L3TA 2B4UA 3I7ZA 4Z6BA 1BHHB 3S8LA 1PICA 5CDWA 2F6YA 3AWEA 4KI9A 5KA0A 4FL2A 3D42A 1OPKA 1HCTB 5EG3B 1OHDA 1U24A 2AZRA 4M4ZA 2L4KA 2ETZA 1OEMX 1Q6SA 4PYHA 1UUSA 1WQUA 1G83A 4GS0A 5KA4A 2QDPA 2EYYA 4PVGA 3PLFB 1RQQC 2I4EA 2GE9A 2QBSA 3V0DA 3V0JA 1LARA 1YTWA 2NT2A 3EACA 2B4OA 4FL3A 4RI4A 2IMGA 2HB1A 4L1BB 2I6JA 2OC3A 4WWQA 1XM2A 4BJOA 1CWEA 1C85A 4QUNA 1C88A 2C0TA 3BUOB 1BLJA 4QAHA 1BHHA 2H03A 1GWZA 1PTUA 2HC2A 1YVLA 1A07A 1RPYA 3QCLA 4OHLA 4D8KA 4GFUA 3OV1A 3H2XA 3O4UA 5IBSA 3N7YA 3F99A 4WU3A 4JNBA 5KADA 1H9OA 1R1SA 2HUWA 2WGPA 2CJZA 5AXIA 1JU5A 1NWEA 3N0AA 3F9AA 4RDDA 3S8NA 3HIZB 4LUEA 1A09A 3VS2A 1A1EA 3NMEA 1OHCA 2IZVA 2H8HA 4QUMA 1JYQA 3AWFA 2PTKA 2J17A 1LUKA 1PTTA 5K23A 1KAVA 4H34A 3TL0A 1XRIA 2QBQA 4E93A 1SUGA 3GXGA 3F81A 5HKYA 1PH0A 2CNFA 2IUHA 5DC0B 1YTNA 4MBBA 3O4TA 5MMZB 3VRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BUXB 1FYRA 1RJAA 4U17A 2LNWA 3BRHA 2H4GA 5KACA 3VROA 2HXPA 1AYAA 1ZFPE 1NZ7A 2UUPA 4NNDA 1Q6JA 1GQYA 1V3AA 2HDVA 3OVEA 4U1PA 1F1WA 2PLDA 1KA6A 4K11A 4OHDA 4OHEA 3K2MA 3AWGA 1O4QA 2Q47A 1JF7A 1OESA 1WRMA 1X24A 1T49A 2BIJA 3PQZA 3D1OA 1KSWA 1X27A 1SHBA 1BF5A 4JMKA 1LKLA 4EIHA 1VHRA 2J16B 4XZ1A 1B47A 3UAGA 1IJRA 2QDCA 5KAAA 2F71A 2Y1OA 1ZCKA 3HN7A 1O4EA 4C13A 1OEUA 5AWXA 4H1OA 2Y67A 1TCEA 3VGOA 1O4GA 1BFIA 4D3QA 3ZM6A 1O4RA 4AZ1A 4NYHA 1K9AA 1PXHA 4GE5A 1P3DA 1I9SA 2GC6A 1LQFA 3BUMB 3VS7A 2PA5A 3LYVA 1O43A 3QCEA 2I6MA 3ZM3A 1NZVA 3CWGA 2HY3A 3O4SA 1PA9A 3V0IA 5A5FA 3A5KA 2DXPA 1LUNA 2RVFA 1R1PA 4QF5A 1J6UA 2I6PA 5A5EA 4R0TA 3S3EA 3VRZA 1KC2A 2ECDA 1BLKA 2L6KA 2B07A 2J16A 2XPCA 3GXHA 3I36A 2PBNA 3CBLA 3RO1A 3OB2B 3S3FA 1FBVA 3K2TA 2K7AB 2CBLA 1GHUA 3QCNA 2XP1A 1EEOA 1QG1E 2Y2FA 3LK7A 1C83A 2YSXA 2GSBA 1P15A 1SHAA 3D1HA 1A1CA 3IMJA 2FCIA 1BM2A 1CJ1A 4E68A 2P6XA 3CD3A 5KA8A 4TZIA 2XJAA 1FU6A 2RSYA 3PSKA 1G1HA 1EENA 1IS0A 1O47A 1OO3A 2KK6A 3CWEA 2VEVA 4Y2EA 4X6SA 4OHIA 5KABA 5KA2A 2RMXA 1FBZA 1HCSB 1SPRA 4ROJA 3MMJA 5KA7A 1Y57A 3PSJA 3QCJA 2I3RA 3D1QA 5I6VA 4R30A 2OZ5A 2CMAA 3RGOA 3V0HA 1O4FA 3T04A 1OEVA 4ZIYA 3S9KA 1QXKA 3N84A 1PA1A 2HCMA 3QCFA 3KFJA 4JEGA 4RH9A 1LKKA 1AD5A 1Z3KA 2EL8A 2PLEA 5HKWA 3RGQA 4B04A 4BPCA 1PYNA 1SKJA 4UAGA 2F6WA 2CM2A 2OUDA 3EB1A 4WTYA 4FBNA 2LQWA 1YZ4A 3QKPA 3OB1B 4GRYA 2VTDA 1T48A 1YN9A 3QCBA 3S8OA 3IMDA 4JMJA 1X0NA 1YGRA 3VS5A 1RPMA 1LYVA 2AOBA 2LCTA 5K22A 1OHEA 2ZN7A 3MOZA 5K24A 3V0FA 5K25A 2EYZA 5GJIA 1TZEE 4LUDA 1XXPA 1I3ZA 2CIAA 3PFVA 1O5ZA 1QADA 1AAXA 3ZM0A 1LCJA 1SPSA 1G4US 3VRRA 1CSYA 1U25A 2F6FA 3ZM1A 1G7FA 3BUWB 4DGXA 4KYQA 4J51A 2BV5A 4YR8B 2DLYA 1AYBA 5BZZA 2VORA 1O4HA 2CNHA 3CXLA 4TVVA 2AHSA 1D4TA 2KNOA 1YWFA 1M61A 4IKCA 2CM3A 4XZ0A 3NRSA 2QBRA 1JWOA 3VRNA 1YFOA 3MOWA 1O4IA 1JBWA 1P13A 1AYCA 1ECVA 1U26A 1CWDL 2WJPA 1OPLA 4OHHA 1FGSA 1A1BA 1O4LA 1NRVA 2CNIA 2NTAA 4D3RA 2OZOA 2H02A 2I1YA 1Q6TA 2H5KA 2R0BA 2Y96A 1O45A 1O4BA 1AYDA 1O46A 3QCZA 2C46A 3S3KA 2I75A 3VS3A 2EO3A 1XA6A 1W7KA 1LUMA 2F70A 5HDEA 3U96A 1MW4A 3EU0A 2GCBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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