4OHLA

Leopard syndrome-associated shp2/t468m mutant
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
524
structure length
484
Chain Sequence
b'SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGMFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Molecular basis of gain-of-function LEOPARD syndrome-associated SHP2 mutations.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 144
structure length 484
sequence length 524
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2014-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohlA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4ohlA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4ohlA03
4YAAA 1LKLA 2LQNA 1NNYA 1QXKA 1PTVA 2OUDA 1YPTA 3VRZA 3PSKA 4P9VA 1PH0A 2NV5A 2I75A 1XBOA 3BLTA 4RDDA 3BRHA 2DLZA 1GHUA 2K79B 4F5AA 4DGXA 1U25A 2GJTA 2CNGA 2K7AB 1AD5A 2EO3A 3EMUA 1QZ0A 4GFVA 4WOHA 1Q1MA 4X6SA 2HDVA 1YN9A 3VS6A 2PA5A 2VEUA 4QUNA 3BUNB 1G7FA 3SR9A 3I36A 2ECDA 1BMBA 3QCIA 1YFOA 4D3QA 1CJ1A 2EOBA 1VHRA 2H04A 2I5XA 3MOWA 1BLKA 1CSZA 1TCEA 1ZC0A 1ECVA 1BF5A 3N8MA 2F6ZA 1C83A 1YTSA 4NYHA 2QBPA 3TL0A 4F5BA 2QBSA 2PNAA 1O4KA 2EL8A 2ETZA 3AWEA 1SHBA 5DC0B 2CNHA 1FHSA 3I7ZA 4D3RA 2QCTA 1BHFA 1KA7A 2F6YA 1QG1E 3EAXA 4Z6BA 3F99A 1FPRA 3V0IA 1A1EA 1F1WA 1RJAA 3F9BA 1A5YA 2BV5A 2BGEA 3V0DA 1V3AA 1Y1UA 1ZFPE 5AULA 1JWOA 3D9CA 3ZM2A 5K9WA 5KA3A 4B04A 2QDMA 1X24A 5GJIA 5I6VA 2QDPA 4DGPA 3D44A 2GE9A 1O4IA 1AOTF 3GXXA 2H4GA 3O4SA 4RH9A 5EHPA 4RI4A 1LYVA 1YGRA 5KA1A 3S3FA 1L8GA 5MMZB 4QBWA 2R0BA 1C87A 2I4GA 3C7IA 4JBCA 1SPRA 5K9VA 3RGQA 2F70A 1GWZA 1LKKA 3S4OA 4R0TA 2IUIA 3I80A 2CNFA 2CI9A 2VIFA 3V0JA 1U26A 4NNDA 4D8KA 2YU7A 4ZRTA 2I42A 5IBSA 3V0GA 1O4AA 3VS2A 1Q6NA 1RXDA 4JGHA 1BZHA 3CD3A 3A5KA 2RSYA 1OPLA 3BUXB 3QCEA 4QAPA 2VEXA 3VRRA 1FBZA 1ONYA 2JJDA 4K45A 1O4JA 1BHHA 3D1QA 4HRFA 1A1AA 1AAXA 1P15A 1BFJA 1R6HA 2OQ1A 3F9AA 3EACA 1JYUA 2H46E 1FU5A 1O4FA 2B4PA 1A81A 3MOZA 3O4UA 2AOAA 3EAZA 1MKPA 3U96A 2RF6A 1K9AA 1YTWA 2CMBA 2F6WA 2WGPA 1PA9A 2EO6A 1KAVA 2B4SA 1PTTA 2QMSA 2PQ5A 5DC4A 4WU3A 4FL3A 1PTUA 2AHSA 1CWDL 2A8BA 1A1BA 2HC2A 3AWGA 5GTJA 2PBNA 2LNWA 1O44A 2QBRA 3KFJA 2CJZA 3PJPA 4HJPA 4RKKA 1A1CA 3N84A 1AYAA 3MXCA 3D1HA 5KAAA 1PXHA 1O4LA 5BUGA 4OHHA 1T49A 4Y2EA 3QCMA 2B49A 5DC9A 3VS5A 2Y96A 4GRZA 1Q6JA 4EIHA 1O4PA 3ZNIA 2L6KA 1BHHB 1O45A 2C46A 2J17A 2I1YA 2EYVA 2DLYA 2QEPA 2B3OA 1A09A 1BLJA 5KA9A 3VS1A 1NRVA 1H9OA 5M43A 1MW4A 2IZVA 4A4CA 1YTNA 2EU0A 2B07A 2HCMA 2JYQA 1CWEA 1AYCA 1G83A 1JYQA 1C84A 4L1BB 1FBVA 1JF7A 1X0NA 4GS0A 2HNPA 2RVFA 2HNQA 1OPKA 3OV1A 2L3TA 1J4XA 1OHDA 1JLNA 2IMGA 5KACA 3BUMB 5J8RA 4BPCA 2AZRA 1ZCKA 1WRMA 4D3PA 2C0IA 3VS0A 2C0TA 2HC1A 3OP0A 4KI9A 3UYOA 3SMEA 2PI7A 1M61A 1OHEA 2F46A 1G4WR 1EENA 3IN7A 3HCKA 1LCKA 2C0OA 3PLFB 3PSJA 2PSZA 3WA4A 3MAZA 1OEVA 5CDWA 1HCTB 5D0JA 1FQ1A 3HHMB 2VEYA 2Q05A 3BKBA 3BUOB 1SUGA 2LNXA 2NZ6A 3VS4A 2CIAA 3H2XA 5KA7A 4GE5A 2I6IA 3QCFA 4ICZA 1AB2A 2NT2A 1B47A 3ZV2A 2SHPA 3CWEA 5HKZA 2E0TA 4WU2A 5LXQB 1O41A 4AZ1A 2VEWA 1EEOA 2BIJA 3VRPA 1IS0A 1YVHA 1T48A 3VRQA 4ERCA 3O3LA 1XM2A 1QCFA 2FJMA 2CBLA 4BJOA 4ZI4A 2HCKA 5EHRA 1OESA 1YGUA 3NHNA 1LARA 5KA8A 3T04A 1PICA 4RI5A 1PYNA 2HUWA 2F6FA 2HXPA 3BM8A 4GL9E 1BG1A 4NWFA 4S0GA 2MC1A 2A3KA 3RZ2A 5BZXA 1WAXA 1C85A 2CI8A 1O4BA 2IUHA 2FO0A 2CMCA 3S3KA 1O4QA 3V0EA 1M27A 4OHDA 1Q6TA 1Q6PA 3O4TA 1PA1A 2PNBA 4RH5A 2DM0A 2CR4A 5J3XA 2OOQA 1O4CA 1BM2A 1OETA 1O47A 1I9SA 1JU5A 1D4TA 3F41A 4WWQA 4GRYA 1AYBA 3CXLA 5AXIA 2I6PA 3N0AA 2BBUA 1Q6SA 4FBNA 2H4KA 2P6XA 1RPYA 4M4ZA 1R1SA 1CSYA 3V0HA 1O4EA 1KAKA 1O4NA 2H02A 3ZM3A 5EG3B 2GWOA 2NLKA 5BX1A 4J51A 2Y1NA 1FPZA 3QKQA 2SRCA 2FH7A 3IN8A 3S8NA 3QCKA 5K22A 3US4A 2P4DA 1IJRA 1T4JA 2AUGA 5EELA 5KAZA 3CBLA 1G4US 4EY0A 2I6MA 2NTAA 2EYYA 2Y3AB 4K2RA 2H4VA 1FMKA 2YSXA 2Q47A 2QCJA 2I4EA 5KABA 1O4HA 1ZZWA 4E93A 4ROJA 2LQWA 4YR8B 4JMJA 4GWFA 3S3EA 5EEQA 4GFUA 1O4MA 1A08A 1WQUA 4U1PA 5BZZA 1KA6A 1FU6A 2DVJA 3A5JA 2AOBA 3BLUA 1R1QA 2MK2A 3CWGA 2L4KA 3UF4A 1NL9A 1HCSB 4NX8A 4R0SA 1FYRA 4Y14A 5KA2A 2HDXA 3BUWB 4TVVA 3QCGA 1MILA 3GQIB 3GXHA 4U17A 4XZ1A 1UUSA 1L8KA 4H34A 5HDEA 1SHDA 1XA6A 2HMHA 3HIZB 4IKCA 5HKYA 3OVEA 3EU0A 3V0FA 1F2FA 1X27A 2F71A 2ZMMA 2B4OA 1YVLA 2CNEA 3S3HA 3MXYA 2MBCA 1BKMA 1NZ7A 3EZZA 1SHAA 4OHLA 5K25A 1ZCLA 4PVGA 1BFIA 3ZMPA 1AYDA 5DF6A 3GXGA 4OHIA 1NO6A 5KADA 2I4HA 2CM7A 1SKJA 1BZCA 2ZN7A 3D42A 1UURA 3OB1B 2M3VA 2KNOA 4OHEA 1PTYA 1O42A 2H5KA 1JYRA 3IMDA 3S8OA 2G6ZA 1NZVA 3N7YA 1OO4A 1KC2A 3O5XA 2GSBA 3ZMQA 5KA0A 2PT0A 2QDCA 3QKPA 3ZM1A 2MRJA 1WCHA 2BZLA 2QBQA 1LUNA 2ABLA 4GE2A 1O46A 3RGOA 2DXPA 4QSYA 1D5RA 1RPMA 2CM3A 1LUMA 2OZ5A 5K23A 2FJNA 1O43A 2VEVA 2CNIA 2LCTA 4KYRA 3PQZA 2I6JA 5BO4A 1D4WA 2FCIA 4LUEA 2HB1A 4R30A 1O48A 1G1FA 3QWYA 3AWFA 1AOUF 1R1PA 1GFYA 3QCJA 1O49A 3OMHA 1X6CA 2I6OA 3S4EA 1M3GA 1OO3A 2HY3A 2Y2FA 4JMKA 2CFVA 2NT7A 4E68A 3ZM0A 3S8LA 1TZEE 2F6TA 1LCJA 3VROA 1XRIA 2HVLA 4QAHA 1BZJA 3K2MA 2CRHA 2B4UA 1Z3KA 3QCLA 1NZLA 5IBMA 3QCCA 3GXWA 4ZN5A 4NWGA 1G1GA 1O4RA 3RO1A 2RORA 2J16A 1O4OA 2CM2A 1SPSA 5K24A 2I3RA 4I8NA 2H03A 3LJ8A 4JNBA 2PLEA 4WTYA 3VS7A 2CS0A 1YZ4A 1OEOX 2OC3A 1O4GA 3IMJA 3PFVA 2MQIA 4P9ZA 4F59A 2F6VA 3VGOA 1C88A 2EYZA 1OEMX 1ONZA 1U24A 4HJQA 4LUDA 3F81A 5GJHA 1O4DA 2C7SA 2G59A 2PTKA 2DX0A 1GRIA 1RQQC 3QCNA 1XXVA 3OB2B 3QWXX 3MMJA 1D1ZA 1KSWA 1G1HA 1I3ZA 4GE6A 1Y57A 3QCDA 3VRYA 1LUIA 1I9TA 2GP0A 1P13A 3VS3A 3CM3A 1NWLA 1G7GA 1LQFA 4KYQA 2DCRA 5KA4A 1NWEA 4JE4A 3QCBA 3PS5A 3NMEA 1A07A 1OHCA 1C86A 1YWFA 3TKZA 2IUGA 4A4BA 1Q6MA 2H8HA 3M7FA 4K11A 1OEUA 4JEGA 4H1OA 2XP1A 4K44A 3EB1A 4QBEA 5HKWA 4PYHA 2BGDA 3M4UA 2C9WA 3D1OA 2EKXA 5AWXA 2CMAA 4TZIA 2J16B 1I57A 4FL2A 3QCHA 2RMXA 1QADA 3S9KA 1LUKA 2I3UA 4RHGA 2MRKA 2OZOA 3VRNA 2KK6A 2ESBA 4GPLB 3B7OA 2YDUA 2CM8A 2PLDA 1XXPA 3OLRA 1BKLA 4XZ0A 2Y1MA 4QUMA 4MBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YAAA 1LKLA 2LQNA 1NNYA 1QXKA 2WTZA 1PTVA 2OUDA 1YPTA 3VRZA 3PSKA 4P9VA 1PH0A 2NV5A 2I75A 1XBOA 3BLTA 4RDDA 3BRHA 2DLZA 1GHUA 2K79B 4F5AA 4DGXA 1U25A 2GJTA 2CNGA 2K7AB 1AD5A 2EO3A 3EMUA 1QZ0A 4GFVA 4WOHA 1Q1MA 4X6SA 2HDVA 1YN9A 3VS6A 2PA5A 2VEUA 4QUNA 3BUNB 1G7FA 3SR9A 3I36A 2ECDA 1BMBA 3QCIA 1YFOA 4D3QA 1CJ1A 2EOBA 1VHRA 2H04A 2I5XA 3MOWA 1BLKA 1J6UA 2VOSA 1CSZA 1TCEA 1ZC0A 1ECVA 1BF5A 3N8MA 2F6ZA 1C83A 4CVMA 1YTSA 4NYHA 2QBPA 3TL0A 4F5BA 2QBSA 2PNAA 1O4KA 2EL8A 2ETZA 3AWEA 1SHBA 5DC0B 2CNHA 1FHSA 3I7ZA 4D3RA 2QCTA 1JBVA 1BHFA 1KA7A 2F6YA 1QG1E 3EAXA 4Z6BA 2JFFA 3F99A 1FPRA 3V0IA 1A1EA 1F1WA 1RJAA 3F9BA 1A5YA 2BV5A 2BGEA 2VORA 1V3AA 1Y1UA 3V0DA 1ZFPE 5AULA 1JWOA 3D9CA 3ZM2A 5K9WA 5KA3A 4B04A 2AM1A 2QDMA 1X24A 5GJIA 5I6VA 2QDPA 2GCAA 4DGPA 3D44A 2GE9A 1O4IA 1AOTF 3GXXA 2H4GA 3O4SA 4RH9A 5EHPA 4RI4A 1LYVA 1YGRA 5KA1A 3S3FA 1L8GA 5MMZB 4QBWA 2R0BA 1C87A 2I4GA 3C7IA 4JBCA 1SPRA 5K9VA 3RGQA 2F70A 1GWZA 1GQYA 1LKKA 3S4OA 4R0TA 3LYVA 2IUIA 3I80A 2CNFA 2CI9A 2VIFA 3QCZA 3V0JA 1U26A 4NNDA 4D8KA 2YU7A 4ZRTA 2I42A 5IBSA 3V0GA 1O4AA 3VS2A 1Q6NA 1RXDA 4JGHA 1BZHA 3CD3A 3A5KA 2RSYA 1OPLA 3BUXB 3QCEA 4QAPA 2VEXA 3VRRA 1FBZA 3N2AA 1ONYA 2JJDA 4K45A 3ZM6A 1O4JA 1BHHA 3D1QA 4HRFA 1A1AA 1AAXA 1P15A 1BFJA 1R6HA 2OQ1A 3F9AA 3EACA 1JYUA 2H46E 1FU5A 1O4FA 2B4PA 1A81A 3MOZA 2JFHA 3O4UA 2AOAA 3EAZA 1MKPA 3U96A 2RF6A 1K9AA 1YTWA 2CMBA 2F6WA 2WGPA 1PA9A 2EO6A 1KAVA 2B4SA 1PTTA 2QMSA 2PQ5A 5DC4A 4WU3A 4FL3A 1PTUA 2AHSA 1CWDL 2A8BA 1A1BA 2HC2A 3AWGA 5GTJA 2PBNA 2LNWA 1O44A 2QBRA 3KFJA 2CJZA 3PJPA 4HJPA 4RKKA 1A1CA 3N84A 1AYAA 3MXCA 3D1HA 5KAAA 1PXHA 2X5OA 1O4LA 3K2TA 4UAGA 5BUGA 4OHHA 1T49A 4Y2EA 3QCMA 2B49A 5DC9A 3VS5A 2Y96A 4GRZA 1Q6JA 1W7KA 5A5EA 4EIHA 4C13A 1O4PA 3ZNIA 2L6KA 1BHHB 1O45A 2C46A 2J17A 2I1YA 2EYVA 2DLYA 3UAGA 2QEPA 2B3OA 1A09A 1BLJA 5KA9A 3VS1A 1NRVA 1H9OA 5M43A 1MW4A 2IZVA 4A4CA 1YTNA 2EU0A 2B07A 2HCMA 2JYQA 4BUBA 1CWEA 1AYCA 1G83A 1JYQA 1C84A 4L1BB 1GQQA 1FBVA 1JF7A 1X0NA 4GS0A 2HNPA 4C12A 2RVFA 2HNQA 1OPKA 3OV1A 2L3TA 3HN7A 1J4XA 1E8CA 1OHDA 1JLNA 2IMGA 5KACA 3BUMB 5J8RA 4BPCA 2AZRA 1ZCKA 1WRMA 4D3PA 2C0IA 3VS0A 2C0TA 2HC1A 3OP0A 4KI9A 3UYOA 3SMEA 2PI7A 1M61A 1OHEA 4ZIYA 4CVKA 2F46A 1G4WR 1EENA 3IN7A 3HCKA 1LCKA 2C0OA 3PLFB 3PSJA 2AM2A 2PSZA 3WA4A 3MAZA 1OEVA 5CDWA 1HCTB 2VTDA 5D0JA 1FQ1A 3HHMB 2VEYA 2Q05A 3BKBA 3BUOB 1SUGA 2LNXA 2NZ6A 3VS4A 2CIAA 3H2XA 5KA7A 4GE5A 2I6IA 3QCFA 4ICZA 1AB2A 2NT2A 1B47A 3ZV2A 2SHPA 3CWEA 5HKZA 2E0TA 4WU2A 2KGYA 2GCBA 5LXQB 1O41A 4AZ1A 2VEWA 1EEOA 2BIJA 3VRPA 1IS0A 1YVHA 1T48A 3VRQA 4ERCA 3O3LA 1XM2A 1QCFA 2FJMA 2CBLA 4BJOA 1P3DA 4ZI4A 4CVLA 2HCKA 5EHRA 1OESA 1YGUA 3NHNA 1LARA 5KA8A 3T04A 1PICA 4RI5A 1PYNA 2HUWA 2F00A 2F6FA 2HXPA 3BM8A 4GL9E 1BG1A 4NWFA 4S0GA 2MC1A 2A3KA 5A5FA 3RZ2A 5BZXA 1WAXA 1C85A 2CI8A 1O4BA 2IUHA 2FO0A 2CMCA 3S3KA 1O4QA 3V0EA 1M27A 4OHDA 1Q6TA 2GC5A 1Q6PA 3O4TA 1PA1A 2PNBA 4RH5A 2Y66A 2DM0A 2CR4A 5J3XA 2OOQA 1O4CA 2Y1OA 1BM2A 1OETA 1O47A 1I9SA 1JU5A 1D4TA 3F41A 4WWQA 4GRYA 1AYBA 3CXLA 5AXIA 2I6PA 3N0AA 2BBUA 1Q6SA 4FBNA 2H4KA 2P6XA 1RPYA 4M4ZA 1R1SA 1CSYA 2JFGA 3V0HA 1O4EA 1KAKA 1O4NA 2H02A 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 4FL2 A;  3QCH A;  2RMX A;  1QAD A;  3S9K A;  1LUK A;  2I3U A;  4RHG A;  2MRK A;  2OZO A;  3VRN A;  2KK6 A;  2ESB A;  4GPL B;  3B7O A;  2YDU A;  2CM8 A;  2PLD A;  1XXP A;  3OLR A;  1BKL A;  4XZ0 A;  2Y1M A;  4QUM A;  4MBB A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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