4OMBA

Phosphate binding protein
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
298
structure length
298
Chain Sequence
AIDPALPEYQKASGVSGNLSSVGSDTLANLMTMWAEEYKRLYPNVNIQIQAAGSSTAPPALTEGTANLGPMSRKMKDVELQAFEQKYGYKPTAVPVAVDALAIFVHKDNPIKGLTMQQVDAIFSATRLCGSKQDVKTWGDLGLTGDWAKKPVQLFGRNSVSGTYGYFKEEALCKGDFRPNVNEQPGSASVVQSVSQSLNGIGYSGIGYKTASVKTVALAKKEGAAFVEDNEQNALNGTYPLSRFLYVYVNKAPNKPLDPLEAQFLKLVLSKTGQQVVVKDGYIPLPAKVAEKAIKELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Pseudomonas aeruginosa phosphate transport protein PstS plays a phosphate-independent role in biofilm formation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphate binding protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transport protein
total genus 94
structure length 298
sequence length 298
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ombA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ombA01
1SW2A 1B51A 2AYSA 2NOOA 4MF3A 2ZMBA 4BDQA 2ANJA 4EQ9A 5I2NA 2DSFA 3AXFA 3TTNA 1MS7A 3FXQA 3I3VA 1MPBA 3UK4A 5KDTA 1SD3A 4OFLA 4X9TA 3Q26A 1TFAA 3RN8A 2DWAA 2VOZA 1MXUA 4EQ7A 1H76A 3MAMA 4ZEIA 4HS7A 3TTRA 1B58A 3OEMA 1URSA 1B7HA 1SDXA 4N13A 2M8CA 4XKRA 4GVOA 1QKAA 3M3FA 5I2KA 1NH8A 5CMCA 3T9XB 4Z0IA 2F6PA 1B5JA 3O29A 1JW1A 4G8NA 1TT1A 1PC3A 4HCYA 3O2AA 5EHMA 1CE2A 3LSWA 4ELRA 4R9GA 3MVZA 1ZKBA 1UTHA 3SEUA 1B5HA 3HV1A 4F3PA 5AA1A 3H6WA 1LAXA 4XKNA 1B52A 3RTFB 4NWCA 5H8NA 3IB0A 1O63A 5H8HA 4R2FA 4QFLA 1FTLA 2HEUA 1F9BA 2OK2A 1UIVA 2PYYA 4QSDA 4MLVA 3UIFA 4IO6A 1JEVA 3OENA 4GRKA 4PFTA 1B3LA 3N6TA 1QJMA 2XXVA 2A5TB 3UN6A 4BLAA 2IEEA 2DXRA 4F3SA 1XHYA 5JTYB 4UA8A 3FXRA 2XXIA 1B2HA 3MP6A 2E0SA 2F7AA 3O97A 3Q27A 1XVYA 4XKPA 1LB9A 5CRYA 1YAEA 4FORA 2O6AA 3MP1A 2XXRA 4YICA 1WODA 2DVZA 4G4PA 1MXZA 1YPNA 3RT8A 3LUYA 4NF5B 2E1SA 1OQGA 3MC2A 4YU0A 4DXUA 3EHTA 4AB6A 4U4SA 1KWHA 4FEDA 3K1MA 5CMKA 5AE4A 1LBBA 3TYHA 5ICQA 3QXMA 3FVGA 2P0SA 4G77A 3T9UA 5L9MA 1Y4CA 4RXLA 1D4NA 3CG1A 2O51A 3KSXA 2QS2A 1SYHA 4GOTA 1NL5A 1QVSA 4F29A 5HBCA 2DOJA 1B46A 1AH5A 3MQ9A 4YZZA 3L6GA 3V89B 5AA4A 1PB7A 5TU0A 3GXAA 3VE1B 1FTJA 4OETA 1B4HA 1MH4A 4OERA 4NF8B 3BFUA 3L6HA 1MRPA 3FXUA 5CMBA 3TQLA 3OO8A 4FAJA 4QSEA 3FZVA 4PFYA 2F7BA 2OZZA 3IX1A 1MM6A 1XVXA 3N26A 4QFNA 4OEUA 2PT2A 3DP8A 3B6TA 1GTKA 3RLFE 2CMOA 1US5A 3TTLA 2VD2A 1SW4A 2REGA 4GFRA 1M5EA 4DLDA 1R6ZA 1ATGA 3D4CA 3PU5A 1RYXA 4X1DA 1IEJA 2PT1A 1B0HA 2F34A 1FTOA 3IB1A 3W15C 2D5WA 4F1VA 1FQEA 3OD7A 2FA7A 2Y7KA 2DVCA 1ANFA 3M3LA 4IO3A 2UXAA 3C36A 3KJ7A 2XXHA 1EZPA 1FW0A 2Z22A 1OLAA 1A7LA 3OMBA 4C1UA 3N6UA 4POWA 5DVFA 2F7CA 4MLQA 2QMXA 5JEIA 3G7WA 1MXWA 3E3KA 1OQHA 4H5GA 4R75A 1JW5A 2G93A 4NWDA 2ONRA 3TODA 3THIA 1UTBB 1VFDA 1MY3A 4Q30B 1SI0A 3IOUA 5AA2D 1N0TA 3C4MA 1I69A 1MQDA 1P1NA 1PB8A 4F1UA 1HSLA 3K00A 1ZJLA 4ZEKA 1POY1 3SEXA 5J1DA 2H5YA 4YKPA 3PPRA 4R73A 3CSBA 4YB6A 3C33A 3TPAA 1POTA 4C0RA 4HCWA 5F7VA 3TELA 2QJEA 3OXNA 4H65A 5L8DA 3CVGA 2GHBA 4FE8A 1IXCA 2F36A 1XC1A 1URGA 2V3TA 4JXIA 1EZ9A 2ONKE 2XD3A 1PBQA 3FUZA 4GD5A 3PGFA 2I6EA 2RC9A 3KN8A 1MQGA 1RKMA 3K1NA 1PBPA 3MBPA 3IOVA 3V8XB 4C1TA 4YKKA 3OO9A 3KBRA 2D3IA 1MXXA 4N6PA 4OFOA 3VXBA 1EZOA 2DWHA 3OOAA 3V83A 2XXPA 3VLWA 2R71A 1FQAA 4GL0A 4DIGA 4WEDA 3F11A 2A5TA 4THIA 5JTYA 1I6QA 3I6VA 4KCCA 2I48A 4QFPA 4X1BA 1Y3PA 3E9XA 5H8SA 4FECA 4RPOA 3IB2A 1A8FA 1ZIUA 4PP0A 4DCXA 2GFEA 4YKJA 4TQUQ 4EUOA 2I4CA 3QK6A 4JWXA 2Y84A 3TFLA 3O9PA 4F18A 1NFTA 1P1WA 4EF1A 4ZZAA 3KZGA 1B1HA 1A8EA 1M5FA 4OFJA 4MBPA 3T9VA 1NNTA 3FVKA 4I1DA 1LFGA 4JWYA 1B05A 4ELOA 2OLBA 4U1OA 1LAHE 3KOSA 5H8FB 1SYIA 2XXYA 1N7XA 2B3BA 3QUFA 2QSXA 2R6GE 3MPKA 3RPWA 1H43A 1EU8A 3SEWA 4M4GA 4IO7A 1USYE 4EXKA 2Y7PA 5DYHA 1B3FA 5JK4A 1MDQA 4NF8A 1VE4A 1GGGA 1A54A 2F35A 2H9BA 1ZLQA 4WKMA 2F78A 3QYTA 3OSRA 1TWYA 2YLNA 3R7XA 1BLFA 4BDMA 5I56B 5EHSA 2OWTA 3QSLA 1B1XA 2Q88A 1QUJA 5I58B 3PUYE 5BWJA 3HO7A 4F2QA 1D3KA 1MY0A 5F1QA 4H6DA 3CI8A 3HHGA 1M5CA 2XXXA 3TDJA 4ZEDA 3C9HA 4BDRA 3QUJA 2P1SA 4IY5A 3E4RA 5EYFA 4ZECA 3B6WA 2ONSA 1MXYA 4JSDA 3U72A 1IZ1A 2B65A 4F2OA 4DDDA 3TTMA 3TZAA 1NMUA 1M5BA 5DEXB 1IITA 3TUSA 4IB2A 1Y1ZA 1MPCA 4MFIA 3TTKA 2HAUA 1VSOA 4KQPA 2O7IA 3VFJA 2UVHA 1UTBA 4ZEFA 4GL8A 3HHFA 4XXUA 3TCHA 1RYOA 1VR5A 4ECFA 2Z8FA 2XX7A 3EN3A 3GLBA 2KLFA 4I62A 1B32A 1MH3A 1H44A 3RUMA 3VVDA 3HCQA 2ESNA 4OZ9A 4KR5A 3MUQA 2O84X 1DMBA 3KSJA 4R2BA 3H6TA 2ZYOA 3MZ9A 1B9JA 3VLVA 3MPLA 3U1OA 1LB8A 3W9VA 5B70A 3DELB 3ZKKA 1SBPA 1LGBC 3OO7A 4P11A 4R74A 3CSGA 3Q29A 3K6WA 2V3QA 1DTGA 4OXVA 4FATA 2RC8A 3GBAA 3UP9A 1H45A 4QF9A 3KFMA 4GXSB 3FV1A 2XXQA 2X7PA 3KJTA 2ABHA 3FV2A 1MY4A 3O66A 4LZ5A 4ZE9A 1FQDA 3H6UA 3IAZA 5AA3A 3A3UA 4U1ZA 4EQBA 1S50A 4OMBA 1LAGE 5I57B 2HZLA 1MPDA 3ECRA 4E0WA 3LR1A 1AOVA 2RCBA 3MP8A 4YMAA 4TLLB 3DP6A 3D4GA 4H1XA 1Y3QA 5ITOA 1OVBA 1Y9UA 5K2XA 3ILTB 3EPEA 1AL3A 4GWOA 3RQTA 3K0VA 3ILUB 4ZZEA 3BFTA 3OO6A 1OVTA 3FVNA 1T0KA 2Q2AA 4G8MA 4X48A 3O6GA 1PDAA 2DE4A 2X26A 2RC7A 3C31A 4U4XA 3SERA 4PFUA 1BP5A 1R1NA 1O7TA 1N04A 5H8FA 3PPPA 4ELQA 3U92A 5M2VA 2H25A 1QULA 5FTIA 5CBSA 2YPNA 2RKMA 4JB7A 4GLIA 3TCFA 3FIRA 1S7YA 1XT8A 5CMMA 2W7YA 3PV0E 4GF8A 2RF1A 2ZYKA 1D9VA 3G3GA 4YMBA 4G2ZA 4P0GA 5I56A 4LATA 3T96B 3DM0A 1URDA 3S9EA 4AB5A 1N3XA 5I58A 3SKPA 3P7IA 3CFXA 1B5IA 4IY6A 1JETA 4G68B 3K1PA 3KEIA 3ZS6A 3HN0A 3JV9A 4R9FA 2F5XA 4ZE8A 3IK6B 2DYXA 5IKBA 1SVXB 3ZKLA 2ALUA 1WVJA 3U93A 5CBRA 4IO5A 1MXVA 2HQ0A 3SEVA 5I59A 2GHAA 3S2VA 3MVYA 3ODBA 5TPAB 2GRVA 4EXLA 1Q1KA 1P1OA 4U22A 1MDP1 4RJZA 3UORA 5FTHA 2I0BA 3S9MC 4DXCA 2FYIA 4YB5A 4MH5A 3TEPA 5DEXA 3H7MA 1ELJA 4PQJA 1FCKA 4H67A 2A5SA 2NXOA 1IXIA 4LONB 1MY2A 4ND9A 3B7DA 2FNCA 1H3DA 4LUBA 1A99A 4I9DA 3S9LC 1TXFA 1P99A 1B7ZA 3VVFA 3TAJA 2XXWA 1AMFA 2F6GA 1IXHA 2AIXA 2ZNUA 1B3GA 1VFEA 3G3JA 5H8QB 1OIBA 1QKBA 2XXUA 3HSTA 4KPTA 3DP4A 2VP1A 2I3WA 2QPQA 3BKIB 2YJPA 4PFWA 1LFIA 5FHNA 4IO2A 1B40A 4Z7EA 4ONYA 3FVOA 3E13X 4XIGQ 1MQHA 1N76A 1Z7NE 5LOMA 3V5AA 2HXWA 1LAFE 2F8DA 3UA8A 2RINA 3BBRA 4F1YA 5ISUA 3OEKA 5CC2A 1D9YA 4K3FA 3PPQA 3H3GA 3H4ZA 1GV8A 3WAEA 1MY1A 4JDFA 3C34A 1SW1A 4L17A 2GH9A 2Q89A 4TLMB 1JVXA 1ZMGA 1PEBA 4OTEA 1Z7ME 3Q28A 4KHZE 2Q2CA 3T93B 3EHUA 2I4BA 4OVJA 3IJXB 1R9QA 2V93A 4Q0CA 1NKXA 5ELVA 3PPOA 3C35A 3FGSA 3VV5A 1B0LA 4F22A 2Y7RA 4LA9A 2LAOA 5DVIA 3KN3A 2Q8JA 5KCJB 5CM6A 3QAXA 2HZKA 4NEDA 3PMVA 3IR1A 4JSOA 1II5A 2F97A 5HPQA 1L5TA 5HM4B 3R26A 3ONMA 5I57A 1JQFA 5DTBA 5TP9A 3N94A 4YB7A 2QS4A 4FIMA 2DQVA 2OWSA 2OJTA 1LFHA 1DPPA 1ZU0A 3H6VA 2O1LA 4OWDA 4F3BA 2ZNSA 3PUVE 5CI5A 2O69A 3G3HA 2DWJA 1US4A 5DT6A 2Z23A 3K02A 4YAHX 1M5DA 3MZ1A 4DZ1A 3FJMA 4DE8A 3K6XA 3SEYA 3TCGA 5I59B 1LSTA 3RGYA 3T9HB 4NF4B 4KCDA 3OSQA 3G3KA 3U8QA 2QRYA 1N3WA 2O68A 3QIMA 5B7DA 2QL3A 5FHMA 2ZYNA 4PETA 1MM7A 2Q9TA 1TFDA 1FQCA 4ZS9A 4KYDA 2VD3A 3K2DA 1NNPA 3IL1B 2HFBA 2DE3A 4R6YA 2I58A 3UGWA 4R72A 4U23A 3O6IA 4O3CA 2CZLA 3B6QA 3LSFB 3M8UA 1JW4A 1BTJA 4U21A 3K6UA 1MQJA 3IO6A 4N07A 1P1QA 4WEPA 5L9OA 3FJGA 3CIJA 4NMYA 4RNSA 4BDOA 1LCFA 1XOCA 3Q25A 4RK2A 1JVYA 1XS5A 2XHDA 1HSJA 3SDFA 4Q8RA 4RY1A 3K01A 5L9SA 2PBWA 4IGRA 4R6KA 3KN7A 2Y7WA 5DVJA 3S9NC 3CG3A 1FTMA 3MW0A 2PX1A 3T66A 1I6BA 4G68A 4OHNA 2PVUA 4XTCQ 2NVUB 3RTWB 3VXCA 1O64A 4NF6B 4G8HA 3FASA 3FD3A 2O1MA 3OELA 1HSEA 4LQ5A 3A09A 3N5LA 3JYRA 4OESA 4GXAA 1NNKA 3MZBA 5TPAA 3PUXE 5AA2B 4AQ4A 4GIZA 4PE5B 3R6UA 5A5XB 3GZGA 3LBSA 2VGQA 1UIUA 4ISUA 3PMWA 3MVWA 1IUDA 4ELPA 1B3EA 5I84A 1R9LA 2OBGA 5I2NB 4LZ7A 1JEUA 2QS3A 1QUKA 3IO4A 5TP9B 3ZSFA 2ZYMA 4KFQA 3DLNA 1QW0A 1Y20A 5H8QA 5KDTB 1YCJA 1IXGA 2G29A 2PMSA 3LC8A 1Y3NA 3FATA 3KOTA 5BUUA 1LBCA 4IGTA 4EDPA 4XKQA 2Y7IA 3JZJA 5IAIA 3RT6B 2H99A 1A55A 4JWOA 2P2AA 5I2KB 4F3GA 1DTZA 3LSXA 2XXTA 2DP8A 2UYEA 4FEBA 2OCUA 2Z8DA 2HAVA 4O3AA 4QHQA 1MG1A 4LZ8A 4LQ2A 4IO4A 2I3VA 2D21A 1NH7A 4QRZA 2VHAA 3SESA 3MWBA 4KYSA 2THIA 2H98A 1FQFA 3LSLA 4RPNA 5K2YA 2NWJA 1UTHB 1A40A 1SI1A 2B3FA 4Q5TA 1USYH 1B6HA 1LCTA 1UQWA 3WAFA 3CRBA 3K4UA 5ITPA 5H8NB 3G3FA 1B7UA 1JNFA 4QSCA 5H8HB 4F19A 4KYEA 3SETA 1OMPA 4HW8A 4H8IA 4JBZA 4HTGA 2I49A 3T22A 1ZBMA 3EQ1A 5KCJA 4ESWA 1DSNA 5FHOA 3HPIA 3TKDA 1IQ7A 4P0IA 2DXYA 3O6HA 3K6VA 3A3CA 4OENA 4BDNA 2ZNTA 2AL4A 5KZTA 5ICTA 4DXBA 2O7UA 1NNFA 4YKIA 3MJNA 4G68C 4WXJA 1GR2A 4I8CA 3VLUA 4ESXA 1EH3A 3M3KA 3VVEA 2Z8EA 4NTLA 2UVJA 1AIVA 3C32A 2R9JA 2DS9A 3PUZE 4FJPA 3EF7A 4F31B 3PMXA 1SW5A 4NE4A 1OLCA 1FQBA 1CB6A 3CFZA 3I5OA 4H0WA 4LVQA 1WDNA 4NF4A 3KG2A 2DE2A 3RNNA 3USDA 2V84A 2XD2A 3MVXA 2WKYA 1B3HA 4OQOA 4UACA 1Y1MA 1QUIA 2UYFA 2IA4A 3VDFA 4BDLA 4RK9A 4H5FA 5AA4B 2BJJX 4RA1A 1Y4TA 1Q35A 3U94A 3S4UA 2AL5A 2X7QA 4EF2A 2XX9A 3TMGA 2RCAA 3O28A 3KGCA 1BIYA 2XX8A 2NUVA 1DOTA 1S9TA 2HCAA 4POXA 2ZXTA 1DPEA 3GBBA 2I0CA 3PUWE 1GVCA 4TOZA 2H4IA 4DCYA 4F39A 3H06B 3CR9A 2V3UA 4KD5A 1N84A 3PD8A 2QS1A 1I6AA 3RY3A 4E0XA 4H8JA 2UVIA 3FJ7A 3IORA 1ZTYA 3G3IA 4ZEBA 1YTVA 1J1NA 4NF5A 4QFOA 3IOTA 1B4ZA 3PD9A 4LP2B 3IOWA 3TQWA 1IIWA 3H03A 4NF6A 4M1VA 1MQIA 2DWIA 4U2RA 4R6HA 2REJA 1BKAA 1SQYA 3IJOB 4OYVA 3CFLA 3PPNA 4KI0E 2QMWA 1PB9A 3W9WA 4GQOA 4RYAA 3EHSA 1N7WA 5AA2A 1P1UA 1LLSA 4OEVA 4ZDMA 4O3BA 4QFKA 5A5XA 2V25A 1FTKA 2UVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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