4OO9A

Structure of the human class c gpcr metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain in complex with the negative allosteric modulator mavoglurant
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
425
structure length
407
Chain Sequence
SPVQYLRWGDPAPIAAVVFACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFLIAKPKQIYCYLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTYRAARILAMSKKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKISAAQLVIAFILICIQLGIIVALFIMEPPDIMVYLICNTTNLGVVAPLGYNGLLILACTFYAFKTRNVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITMCFSVSLSATVALGCMFVPKVYIILAKPERN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
publication title Structure of class C GPCR metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Metabotropic glutamate receptor 5, Lysozyme, Metabotropic gl
total genus 160
structure length 407
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00003 7tm_3 7 transmembrane sweet-taste receptor of 3 GCPR
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4oo9A02
2O4WA 1WTHA 3HTGA 1CV0A 1QTZA 201LA 1C6HA 2B73A 4PK0A 156LA 1T8FA 1L00A 1L45A 1L30A 1P2RA 1L95A 1QUHA 1ZURA 3HT6A 2LC9A 258LA 1G0LA 242LA 1L75A 229LA 1L05A 3HTBA 3DN0A 2LCBA 3SB5A 1L36A 1OWYA 2Q9EA 3F8VA 1C6LA 3HWLA 130LA 1LW9A 4I7SA 103LA 111LA 1L89A 138LA 3C8QA 1C60A 112LA 259LA 4YXCA 1C6GA 1L39A 4W54A 1CV1A 4ARQB 1P36A 1C6TA 1L44A 163LA 2B6ZA 185LA 3SN6R 1L84A 2RB1X 3HH3A 139LA 1L14A 126LA 1P7SA 180LA 2B6TA 164LA 2F32A 1L59A 1L77A 1LYEA 1XJUA 4EPFA 1L23A 128LA 1DYDA 3HDFA 1LI2A 3CDVA 4EPIA 108LA 115LA 3DN4A 1L09A 3DN2A 205LA 1L19A 4I7NA 1DYBA 244LA 4ARMA 2Q9DA 186LA 4W52A 1P37A 1L40A 1L08A 1L37A 1LLHA 161LA 1C6MA 1L12A 1OVJA 1LYFA 152LA 219LA 1KY1A 3HT8A 2HUMA 4DJHA 1P3NA 1QUDA 2O7AA 237LA 3GUMA 1QTHA 4W55A 157LA 1PQJA 4I7RA 4EKPA 146LA 3SB9A 1SX2A 3C7WA 246LA 181LA 2HULA 2Z6BA 3HT7A 2HUKA 1G0JA 1L24A 1QT5A 209LA 1QS9A 182LA 2B70A 3HH5A 1L13A 177LA 3RZEA 1C6EA 2OU0X 1JTMA 3LZMA 1L88A 168LA 1L10A 123LA 2RB2X 206LA 192LA 1L90A 1L96A 1SX7A 2RBSA 1L27A 1QT6A 2OTZX 1L83A 1LYJA 1L16A 262LA 129LA 102LA 1L46A 255LA 174LA 1P56A 178LA 1QS5A 1L79A 2RBPA 3HT9A 131LA 4YX7C 1CX6A 1LYDA 2B7XA 107LA 3NY8A 1L82A 1SWZA 2OE7X 211LA 5I14A 1ZYTA 1QUGA 3HTDA 4EKQA 253LA 1QT4A 4DKLA 3NYAA 217LA 1CV6A 2NTHA 2RBNA 230LA 1L76A 1C6BA 1PQIA 3C83A 252LA 195LA 2B6XA 1QTBA 1CTWA 1L25A 1L58A 247LA 1LGUA 1OVHA 2B72A 1SSWA 6LZMA 1L98A 1L21A 4ARLA 1C6DA 3RUNA 187LA 1L70A 1PQKA 240LA 4E97A 1L0JA 1LI3A 1L47A 3HH6A 118LA 245LA 3GUPA 3FADA 1L48A 3C82A 1KS3A 120LA 1L0KA 251LA 1L80A 169LA 213LA 4I7TA 1DYGA 1DYAA 3DN8A 2OU8A 3HDEA 155LA 4ARJA 1G0MA 1L11A 4GRVA 4W56A 3GUOA 183LA 3HUAA 1KNIA 4W58A 1DYEA 167LA 1L55A 249LA 223LA 1DYFA 243LA 1CU3A 1DYCA 1G1VA 1L85A 3DMVA 2RB0X 2RAYX 1QSBA 236LA 3HU9A 4W51A 1LYIA 2B6YA 1L97A 1CX7A 150LA 4I7MA 4LZMA 1CU0A 1ZWNA 141LA 1CV4A 227LA 3C81A 3C8SA 143LA 3DN1A 2ANXA 3HTFA 1XEPA 2A4TA 4I7LA 1C6CA 3DNAA 1P64A 200LA 3CDQA 1CUPA 144LA 3DMZA 1P6YA 1L57A 1D3MA 159LA 2RBOA 113LA 4DAJA 1L91A 1T6HA 4ARQA 114LA 1L06A 171LA 189LA 3GUIA 1PQDA 1C6NA 3SBAA 1L33A 1L22A 1L92A 1SSYA 3QAKA 3DMXA 3L2XA 198LA 1LGXA 257LA 1PQOA 3DKEX 1L64A 4IAPA 3GULA 4S0WA 1L35A 239LA 260LA 3CDRA 4LDLA 1L42A 3GUNA 3OE9A 147LA 1L18A 1L20A 1L49A 1QT3A 232LA 4I7PA 1L38A 1P46A 3VW7A 2LZMA 4EXMA 1KW7A 2IGCA 3G3WA 1D9WA 4EKRA 1L69A 1L94A 173LA 1LPYA 3SBBC 1C6AA 1D3FA 1KY0A 1LYGA 151LA 3HUQA 1QSQA 1CU2A 1C68A 160LA 1L86A 188LA 1L71A 4LDOA 1L65A 3OE0A 1CU6A 2OEAX 4I7KA 1CV3A 3OE6A 3C7YA 127LA 3EMLA 1C67A 2RAZX 104LA 1C66A 3PBLA 3SB7A 2L78A 248LA 2OE4X 1L93A 1C61A 1L74A 110LA 3JR6A 4GBRB 1QTVA 1L72A 162LA 122LA 3C7ZA 158LA 1G06A 1L43A 231LA 109LA 1L66A 2OTYX 137LA 1L07A 3FA0A 1C6FA 228LA 1NHBA 3HH4A 3L64A 1L34A 1B6IA 215LA 1T8GA 1LGWA 254LA 3PDSA 3D4SA 4YXAC 149LA 1C65A 1L52A 1L68A 1L28A 1QT7A 238LA 3C8RA 1C6KA 1I6SA 165LA 1D2WA 1G1WA 119LA 1L73A 256LA 3GUKA 4I7QA 2QARC 4ARMB 2B6WA 190LA 3UONA 2QB0B 3F9LA 234LA 1OV7A 3OE8A 1TLAA 2OE9X 3CDOA 1G0QA 4I7OA 1L17A 1C63A 1QUOA 3HU8A 191LA 1KW5A 1L56A 1LWKA 1L02A 3SB6A 197LA 1QTDA 4ZPUA 1G0GA 225LA 4W53A 1L62A 2F2QA 222LA 1XJTA 4LDEA 2CUUA 1CU5A 1C6QA 1L53A 2RBRA 3G3VA 1OVKA 1CUQA 184LA 220LA 221LA 3DN3A 3FI5A 1P2LA 1L01A 1G0KA 235LA 4ARPA 140LA 1OWZA 1L61A 1L50A 233LA 218LA 1D3NA 1P5CA 1LYHA 226LA 2B74A 1C6PA 2B75A 4PJZA 2RBQA 214LA 1CV5A 1L99A 224LA 196LA 3ODUA 4EJ4A 4EKSA 1QTCA 2F47A 2NTGA 4K5YA 1L04A 1T8AA 1G07A 172LA 1D3JA 1C64A 1L51A 1CVKA 1QT8A 3G3XA 1L87A 170LA 7LZMA 1JQUA 3DN6A 3V2YA 1C6JA 142LA 1G0PA 1EPYA 210LA 1OYUA 3K2RA 4I7JA 4OO9A 1L26A 1L54A 5LZMA 1L15A 3V2WA 1C6IA 4W59A 1L41A 1LWGA 1OV5A 2RH1A 1K28A 3GUJA 3SB8A 1D2YA 175LA 261LA 1L81A 1L63A 241LA 145LA 199LA 3HUKA 148LE 250LA 1SWYA 4AQNA 1PQMA 216LA 1LI6A 1JTNA 3NY9A 166LA 1L67A 125LA 176LA 1C69A 2OU9A 1L32A 1L29A 212LA 1L03A 2ANVA 1T97A 3CDTA 1L31A 4W57A 2O79A 1L60A 3C80A 1C62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HTGA 1VFBC 1C6HA 1GDWA 156LA 4WLTA 1L00A 1L45A 1TEWA 1UBZA 4ETCA 1ZURA 3HT6A 3TMXA 1G0LA 242LA 3OK0A 229LA 3DN0A 2LCBA 3AZ7A 1YKZX 3HWLA 1QDRA 1LZYA 259LA 4W54A 4YOPA 1P36A 1C6TA 163LA 3SN6R 1L84A 1IY4A 2RB1X 1L14A 1NBYC 126LA 180LA 1IC4Y 2B6TA 2BQLA 4H1PA 1LZGA 3WU8A 5D5CA 1L59A 1L77A 1LYEA 194LA 4XJBA 1JSFA 3HDFA 3RU5A 1IOTA 1QIOA 2IHLA 115LA 3DN2A 1HEMA 5M1YA 2IFFY 1IORA 1L19A 1RI8B 3TMUA 2BQCA 1UACY 1BWIA 3LYOA 1LKSA 1A4VA 1JKCA 1L40A 1L08A 1L37A 2FBDA 1LLHA 2MEFA 1OVJA 3LZ2A 1QTEA 3TXEA 2ZNXY 4DDAA 2HUMA 1P3NA 2O7AA 3GUMA 1QTHA 157LA 1WVUA 146LA 1JEFA 1DPXA 1JUGA 4DDBA 1LZBA 1G0JA 2BAAA 4C3WA 182LA 4XJFA 3TXDA 4XJIA 3BKVA 3EO5A 3RZEA 1C46A 4BADA 1DI3A 1JTMA 154LA 1B7PA 4ETAA 2BQGA 1NKHA 1CJ8A 2RB2X 4GCEA 1L90A 2YBMA 4II8A 2RBSA 1L27A 2BQIA 2OTZX 1L83A 1HF4A 4PGJB 102LA 1OUAA 1IP1A 4CFPA 174LA 1GE2A 4Z98A 1ZMYL 4YX7C 1LZ8A 1ZYTA 4HPEA 5KKJA 3E3DA 4EKQA 3TMWA 2C8PA 3WU9A 1JTPL 1CV6A 2NTHA 1KXYA 3C83A 1ALCA 1QTBA 5HNCA 1TDYA 2ZYPA 1LZDA 4G4BA 2B72A 5E4PA 1SSWA 1L98A 4ARLA 1C6DA 4J7VA 3RUNA 5LXWA 1JKAA 3WL2A 1LI3A 1UCOA 3LYMA 3HH6A 1KS3A 4B0DA 1L0KA 3HDEA 5KXKA 1B5XA 4ARJA 4GRVA 4WM3A 4W56A 1EQ4A 3ULRA 3HUAA 1LMTA 3TXHA 1G1VA 1L85A 2BPUA 4NSHA 3HU9A 1NMMA 4NWEA 3A91A 4HJYA 3RNXA 1LZSA 2BQJA 1L97A 5HMVA 1IP3A 1QUSA 1CU0A 141LA 3DN1A 9LYZA 5DLAA 4H8XA 4XN6A 5L9JA 1YAPA 4N1EI 1C6CA 4YM8A 200LA 3CDQA 144LA 3DMZA 1JTOL 4TWSA 5IHGA 1B7RA 159LA 1LSGA 2A7DA 114LA 5KXRA 189LA 2DBTA 1XGRC 4CHXA 1OP9B 1L22A 1LHJA 198LA 1LGXA 1GB0A 3GULA 3CDRA 3IWRA 3WW6A 1JIYA 232LA 4I7PA 1L38A 4EXMA 1KW7A 5LA8A 4EKRA 3MGWA 1L94A 173LA 1HEQA 1LMNA 1GFUA 1QQYA 1LYGA 134LA 1BB3A 1C68A 1O23A 1ZVHL 160LA 1VDTA 1VDPA 1L65A 3A3QA 4LT2A 4I7KA 3C7YA 5C6IA 3EMLA 4G9SA 5HLLA 1GBOA 2L78A 5I4XA 1L74A 1JKDA 162LA 1LYSA 2D4IA 1B7QA 2OTYX 1JTTL 3A8ZA 1LJ4A 4DD2A 4PRUA 1FLQA 1V7TA 3HH4A 3L64A 1L34A 5F14A 4WM6A 2DQEY 254LA 2XQOA 4DD7A 4Z3MA 1C65A 1L68A 1GBXA 1L28A 238LA 3C8RA 1LJKA 1C6KA 1LJIA 4I7QA 4RW2A 4ARMB 4NY5A 4DQ7A 3F9LA 2HEAA 4WLYA 2W1LA 3LYTA 207LA 1BWJA 1XFPL 3ZVQB 2ZILA 1LJJA 3B0IA 191LA 2HECA 3TXKA 4UWVA 4NEBA 1L62A 1GE1A 1IWUA 1C6QA 3G3VA 1OVKA 1LSDA 1IWTA 4GCFA 1GFGA 1LHMA 4Z46A 140LA 1HFZA 4WL7A 2FBBA 4ET8A 3W6FA 1B9OA 1LYHA 4DQJA 1TCYA 4U3XB 1L99A 3ODUA 4H9FA 4EKSA 4NIJA 2NTGA 4WOAA 4H90A 4AXTA 1C64A 1YAMA 1CVKA 1QT8A 4WLDA 1YIKA 3TXBA 1VDSA 1L87A 7LZMA 1DKJA 1JQUA 3DN6A 1C6JA 142LA 1H6MA 4WM2A 3RW8A 1EPYA 2MEEA 3K2RA 1LJ3A 4I7JA 1GFEA 4DYGA 1C6IA 4W59A 1CKGA 1LWGA 1OV5A 2DQGY 2RH1A 3SB8A 1EL1A 2W1YA 4LYMA 1AT6A 3T36A 261LA 4OOOA 1L63A 133LA 1LZ9A 1B5ZA 1P2CC 1ZVYB 1SWYA 216LA 2W1XA 1HERA 1ZV5L 5LVGA 3NY9A 4NSIA 1L67A 4GN4A 1AM7A 1C69A 3P68A 2D4JA 5F16A 1L32A 5A3EA 212LA 4J0LA 3W6EA 4EMNA 2H5ZA 1HEWA 3WVXA 2O79A 2O4WA 1WTHA 1CV0A 3D9AC 1QTZA 3CT5A 2B73A 1GBYA 1LSNA 3WPLA 4PK0A 1XEKA 5KXWA 5HQ1A 1L30A 4QDNA 3RT5X 1LMQA 2LC9A 258LA 4CGEA 1HNLA 4NHTA 2DQIY 1L05A 4ZFPA 4XADA 3SB5A 1L36A 2Q9EA 130LA 4I7SA 103LA 2EIZC 138LA 3C8QA 112LA 3K3TA 4YXCA 4J1BA 1L39A 4ARQB 1LYOA 1L44A 4NGZA 1GF4A 4G49A 1P7SA 1GF9A 164LA 2LHMA 4LT0A 3WPJA 4EPFA 1L23A 1LI2A 3KAMA 4EPIA 5LA5A 108LA 3DN4A 5FHWA 1IOCA 2Q9DA 2XBSA 1JWRA 186LA 3A6BY 2BQOA 4W52A 1P37A 5B07A 1IX0A 1CKCA 1L12A 4W96A 1KY1A 1B5UA 1NF5A 4GCDA 1W08A 4ZIXA 1QUDA 237LA 5KXNA 2EQLA 1PQJA 1GFJA 1WQPA 4XJDA 1LOZA 2Z6BA 2HULA 2HUKA 1QT5A 1QSWA 2DQFC 1C6EA 1L88A 2DQJY 168LA 123LA 1QT6A 4ANRA 1L16A 4QGZA 1HEPA 1F0WA 2BQDA 1P56A 178LA 3LZTA 4PHIA 1LYDA 1RFPA 4P2EA 3WUAA 5FCPA 3HTDA 1IR9A 4TUNA 2XBRA 1WQQA 1LYZA 1GF0A 2AUBA 1IWZA 2RBNA 230LA 1L76A 252LA 3VWOA 5AMYA 2B6XA 1L25A 247LA 4LFXA 1CJ7A 3EXDA 1OVHA 1GXXA 1XEIA 2MECA 5I4WA 2HEFA 4E97A 1GEZA 3A3RX 1GB8A 4ETDA 4B4EA 3QY4A 4WG7A 118LA 4PJ2C 1LMPA 1GFKA 135LA 1L80A 4I7TA 1LSAA 2OU8A 155LA 1L11A 1BVXA 1FBIX 4W58A 3CQLA 2LYZA 4OWAA 5KXZA 3TXGA 243LA 1J1PY 3DMVA 2RB0X 1QSBA 2G4PA 1LJGA 150LA 4I7MA 4DD0A 1ZWNA 5KXMA 3C81A 143LA 2ANXA 1LZEA 4WLXA 3A94A 2CDSA 5LINA 1FLYA 1P64A 1CUPA 1OUGA 1P6YA 2I26L 1GF5A 4GCCA 1C43A 4ET9A 2RBOA 4H91A 3AGHA 1L06A 171LA 1PQDA 3N9EA 1L33A 1SSYA 3DMXA 4HP0A 4N8ZA 3L2XA 257LA 1B5VA 1L64A 1L35A 239LA 260LA 4LDLA 1LJEA 3OE9A 4NGLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HTG A;  1VFB C;  1C6H A;  1GDW A;  156L A;  4WLT A;  1L00 A;  1L45 A;  1TEW A;  1UBZ A;  4ETC A;  1ZUR A;  3HT6 A;  3TMX A;  1G0L A;  242L A;  3OK0 A;  229L A;  3DN0 A;  2LCB A;  3AZ7 A;  1YKZ X;  3HWL A;  1QDR A;  1LZY A;  259L A;  4W54 A;  4YOP A;  1P36 A;  1C6T A;  163L A;  3SN6 R;  1L84 A;  1IY4 A;  2RB1 X;  1L14 A;  1NBY C;  126L A;  180L A;  1IC4 Y;  2B6T A;  2BQL A;  4H1P A;  1LZG A;  3WU8 A;  5D5C A;  1L59 A;  1L77 A;  1LYE A;  194L A;  4XJB A;  1JSF A;  3HDF A;  3RU5 A;  1IOT A;  1QIO A;  2IHL A;  115L A;  3DN2 A;  1HEM A;  5M1Y A;  2IFF Y;  1IOR A;  1L19 A;  1RI8 B;  3TMU A;  2BQC A;  1UAC Y;  1BWI A;  3LYO A;  1LKS A;  1A4V A;  1JKC A;  1L40 A;  1L08 A;  1L37 A;  2FBD A;  1LLH A;  2MEF A;  1OVJ A;  3LZ2 A;  1QTE A;  3TXE A;  2ZNX Y;  4DDA A;  2HUM A;  1P3N A;  2O7A A;  3GUM A;  1QTH A;  157L A;  1WVU A;  146L A;  1JEF A;  1DPX A;  1JUG A;  4DDB A;  1LZB A;  1G0J A;  2BAA A;  4C3W A;  182L A;  4XJF A;  3TXD A;  4XJI A;  3BKV A;  3EO5 A;  3RZE A;  1C46 A;  4BAD A;  1DI3 A;  1JTM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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