4OO9A

Structure of the human class c gpcr metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain in complex with the negative allosteric modulator mavoglurant
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
425
structure length
407
Chain Sequence
SPVQYLRWGDPAPIAAVVFACLGLLATLFVTVVFIIYRDTPVVKSSSRELCYIILAGICLGYLCTFLIAKPKQIYCYLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTYRAARILAMSKKNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKISAAQLVIAFILICIQLGIIVALFIMEPPDIMVYLICNTTNLGVVAPLGYNGLLILACTFYAFKTRNVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITMCFSVSLSATVALGCMFVPKVYIILAKPERN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Metabotropic glutamate receptor 5, Lysozyme, Metabotropic gl
publication title Structure of class C GPCR metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 160
structure length 407
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00003 7tm_3 7 transmembrane sweet-taste receptor of 3 GCPR
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4oo9A02
108LA 131LA 1C6DA 1L34A 215LA 3HTFA 162LA 168LA 1C6IA 1L59A 3GULA 3CDRA 2LCBA 4W51A 1L80A 1LYJA 3L64A 3DN1A 3EMLA 1G0QA 181LA 3HH5A 4LDOA 1B6IA 1L57A 151LA 2OE4X 234LA 1L18A 1JQUA 3DMXA 4W52A 4ARLA 1D2YA 4S0WA 161LA 250LA 1CU2A 1L90A 3CDTA 1L19A 1L77A 4AQNA 4YXAC 1L07A 1SSWA 2QARC 257LA 1L23A 4IAPA 4EXMA 3JR6A 1L20A 1L99A 1P64A 1P37A 1QUGA 6LZMA 242LA 3G3VA 197LA 1T8GA 2Z6BA 3C83A 1C68A 4I7OA 4W59A 173LA 4GBRB 1L0KA 1PQIA 2ANVA 4EKPA 2HULA 255LA 2OU9A 3GUJA 1CV6A 2O7AA 3NY9A 1L39A 2QB0B 1L55A 248LA 1L10A 1CX7A 1G06A 1L14A 3HTDA 141LA 4EJ4A 1QS5A 253LA 1L63A 1QT7A 1L62A 1PQMA 236LA 1SX7A 224LA 1L44A 1T6HA 1L91A 4W56A 190LA 3RUNA 254LA 1C60A 3HU9A 1JTNA 147LA 1LGXA 2F47A 2OE7X 3OE9A 1CUQA 199LA 1L88A 175LA 1L60A 4GRVA 243LA 1QUDA 2RAZX 241LA 1DYDA 1L41A 1LI3A 1T8AA 3GUNA 3GUMA 2HUKA 1L71A 1L00A 1OWZA 3CDQA 1L64A 1QT3A 122LA 1L70A 1XJUA 1L94A 1C6JA 235LA 4PJZA 1L0JA 1PQKA 1C6PA 1L30A 1L73A 1L24A 226LA 1I6SA 155LA 3DKEX 1L65A 2OU0X 4ARMB 4EKSA 157LA 3QAKA 195LA 1G0GA 158LA 1LYDA 222LA 1KS3A 177LA 1CTWA 1L74A 1CU3A 3ODUA 3SB5A 1CU6A 3C80A 1L29A 3GUIA 240LA 1L26A 118LA 3C7WA 3PBLA 1C6TA 233LA 1QSBA 165LA 1P36A 4E97A 1C6MA 1QTDA 123LA 3SB6A 4ZPUA 2RBQA 1G07A 2RAYX 2OU8A 1WTHA 1G0JA 217LA 2RBOA 3HT8A 109LA 1LYGA 1L95A 3C8QA 1C6FA 4LDLA 1OVJA 211LA 110LA 1OWYA 212LA 4I7SA 246LA 163LA 2B6YA 196LA 4DAJA 3HH3A 3NY8A 1LYEA 256LA 1L66A 3F9LA 1LLHA 1NHBA 139LA 229LA 249LA 1L08A 1L50A 205LA 167LA 192LA 2RBRA 2NTGA 1PQDA 1QTCA 4I7RA 104LA 4I7QA 1L81A 1L03A 1G0LA 230LA 1L85A 1L67A 4LZMA 1D3MA 187LA 1DYGA 3DN4A 1L52A 1ZWNA 261LA 3C81A 1L48A 1JTMA 1P2RA 1OYUA 1L04A 1LWKA 1C6HA 1CV5A 1C64A 3GUOA 4W55A 238LA 2OE9X 4YXCA 3HT6A 1C6KA 1T97A 4I7PA 1LGWA 3D4SA 1DYAA 7LZMA 216LA 1L05A 1D2WA 1KW5A 1C6LA 1C6QA 3DN6A 3DNAA 1LYFA 1L38A 2NTHA 182LA 159LA 1G0KA 245LA 112LA 1CX6A 1C61A 1QTVA 2IGCA 126LA 1L11A 1D3FA 262LA 251LA 1L42A 3HDFA 169LA 144LA 1L32A 1L58A 1DYEA 114LA 3FADA 174LA 1CVKA 1G0MA 1L12A 1L53A 171LA 1LYHA 2RB1X 258LA 4ARQB 1P46A 4ARQA 244LA 1C67A 210LA 2OTYX 1L25A 1L31A 1QT4A 1C6GA 1L01A 1P5CA 1L93A 3VW7A 1ZURA 185LA 3CDOA 1L86A 2LZMA 102LA 119LA 166LA 1XEPA 4K5YA 1DYBA 1CV4A 1CU5A 1D9WA 1SWZA 129LA 1P2LA 3SBAA 176LA 137LA 1OV5A 1L96A 228LA 1SSYA 4ARMA 231LA 1L27A 1L35A 1QTZA 3SB9A 145LA 1D3NA 219LA 3F8VA 1KNIA 2F32A 1LW9A 3V2YA 3HH6A 3HTBA 3RZEA 2B75A 4YX7C 3DN0A 3OE8A 1C6EA 1CU0A 1L54A 1L72A 1L45A 1OV7A 1DYCA 1L98A 4PK0A 1T8FA 1LPYA 3K2RA 4I7NA 1L36A 239LA 3CDVA 2ANXA 128LA 1C62A 220LA 214LA 4W58A 1L40A 1QUOA 1KW7A 170LA 191LA 188LA 1LI6A 4I7JA 227LA 1KY1A 213LA 1P6YA 1LYIA 1L76A 3C8SA 1LGUA 2B73A 223LA 4DKLA 113LA 178LA 1G1WA 4EKQA 130LA 111LA 3HH4A 4ARPA 1L84A 3C82A 3DMVA 3HT7A 2B74A 221LA 4W53A 3C8RA 1QUHA 1C69A 1P3NA 1P7SA 4I7KA 1CUPA 3V2WA 189LA 218LA 186LA 1K28A 2RH1A 1TLAA 3FA0A 237LA 2RBSA 1CV0A 260LA 3PDSA 1C6AA 4W57A 3DN3A 3SB7A 4W54A 3DMZA 150LA 3GUKA 1L15A 140LA 1L22A 2O79A 206LA 1C6NA 3L2XA 1QT8A 1L79A 1OVKA 1SWYA 164LA 3HUKA 3HDEA 1KY0A 1L13A 247LA 3NYAA 252LA 3OE6A 3G3WA 1PQOA 5LZMA 1QT5A 1L33A 3OE0A 259LA 1PQJA 1C6CA 1L28A 4EPIA 1L06A 1L87A 1OVHA 2OEAX 184LA 180LA 2CUUA 115LA 2B7XA 1L49A 1L21A 1L83A 1L82A 3HUQA 1L47A 183LA 2RBPA 1QS9A 1EPYA 2Q9DA 1L16A 1LI2A 4OO9A 152LA 3DN8A 1CV3A 120LA 4LDEA 1DYFA 148LE 2RB0X 4EKRA 1L02A 3HUAA 2A4TA 4I7MA 2F2QA 3DN2A 1L51A 2O4WA 1L89A 2B72A 1L69A 5I14A 3GUPA 3HTGA 198LA 2B70A 1G0PA 3HWLA 1C6BA 3SBBC 1CV1A 103LA 1QTHA 160LA 138LA 1C65A 1L61A 2B6WA 2L78A 1L68A 1SX2A 1L09A 200LA 2OTZX 156LA 3FI5A 4I7LA 1L92A 2RB2X 1ZYTA 2RBNA 149LA 2B6TA 1LWGA 209LA 142LA 3SB8A 201LA 4ARJA 1C66A 1P56A 1C63A 2HUMA 143LA 125LA 1L56A 2Q9EA 172LA 1G1VA 1XJTA 2LC9A 3UONA 1L37A 1L17A 2B6XA 1L75A 2B6ZA 127LA 3G3XA 1L97A 1D3JA 1QSQA 3HU8A 4I7TA 225LA 3LZMA 3SN6R 1QT6A 232LA 4DJHA 4EPFA 3C7YA 3C7ZA 1QTBA 3HT9A 107LA 1L43A 1L46A 146LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
108LA 1NBZC 131LA 2PC2A 1L34A 1LSBA 3HTFA 2BQLA 2F4GA 3CDRA 4W51A 3WU8A 2F2NA 5HNCA 3WPLA 1G0QA 1G7JC 4QDNA 4G4HA 5C6LA 5IELA 1ALCA 1LHHA 1IVMA 1LZDA 135LA 1JKCA 3GXRA 2H9KA 4ETBA 5ILCA 1L19A 4AQNA 1IIZA 4YXAC 1WQNA 3WXUA 1L23A 1F6SA 4IAPA 1P37A 1QUGA 1KIPC 4RDSA 1DI3A 4EOFA 1T8GA 3W6BA 3C83A 3P66A 1T6VL 4ZIXA 4XJGA 2DKVA 2ANVA 3T6UA 255LA 4LYCA 3NY9A 1CJ9A 248LA 1AM7A 1G06A 3B72A 5IDDA 253LA 3GXKA 1PQMA 236LA 2HEEA 4XADA 4HJZA 224LA 3W3EA 8LYZA 1KIRC 4W56A 194LA 2CJLA 3HU9A 1JTNA 1LJIA 4OOTA 4NGOA 1GB8A 5KXOA 2EQLA 1IP6A 1LI3A 3GUNA 1XEJA 2B5ZA 4XYYA 3HFMY 4HV2A 1SQ2L 3CDQA 4H8XA 1XJUA 1KXWA 4PJZA 2Z2EA 4N0JA 1PQKA 1L24A 4DD2A 226LA 155LA 3DKEX 4EKSA 1CTWA 4DT3A 3W6EA 1IOSA 2MEDA 1CU3A 4NHSA 1LHKA 3C80A 2BQHA 3D3DA 240LA 3C7WA 1P2CC 233LA 5I5QA 1RJCB 1OUCA 2OU8A 1D6PA 2RBOA 3HT8A 4H92A 1LYGA 1GFTA 1GBWA 3VWOA 1C46A 1GDXA 1XGPC 3WL2A 5FEKA 4NHIA 1IOCA 1UIBA 246LA 4WMGA 1TDYA 1LSCA 3J4GA 1A4VA 1L66A 1LLHA 229LA 249LA 1HMLA 167LA 1GDWA 1QTCA 104LA 3F6ZA 1OUGA 4ET9A 4DQJA 1G0LA 230LA 1L85A 1D3MA 2LYZA 2MEFA 1DYGA 3A96A 1REZA 3EMSA 4OWHA 1LJ4A 1P2RA 1CKFA 3TMUA 9LYZA 1LWKA 1C43A 1C6HA 2I26L 2ZIJA 4N1CC 1LHMA 2DBTA 5APEA 7LZMA 1XGUC 4WO9A 1KW5A 3DN6A 4WO6A 1IWYA 3DNAA 1L38A 3ATNA 159LA 245LA 2YBJA 2IGCA 126LA 1L11A 2G4QA 2HUBA 144LA 3FADA 1G0MA 1L12A 171LA 1P46A 3A6CY 1JEFA 4BADA 2OTYX 5APDA 1L31A 1L01A 5B06A 1L93A 2FYCA 1IR9A 5DN5A 1KXYA 2LZMA 102LA 4FJRA 3TXEA 1CV4A 4YF2A 4HTQA 1P2LA 3A3QA 4CHXA 1SSYA 4ARMA 1TCYA 4WM2A 4NHQA 1D3NA 4C3WA 1REMA 2F32A 4HJVA 1LW9A 3HH6A 3HTBA 2B75A 5LIOA 1RFPA 3WXTA 2BQGA 4I7NA 3EXDA 2ANXA 2IHLA 2W1LA 5K7OA 191LA 1GHLA 227LA 2DQIY 1D9UA 1QUTA 1UIAA 2B73A 223LA 2ZQ4A 113LA 2MEBA 4EKQA 130LA 1GE3A 1L84A 4DWXA 1IP7A 3HT7A 2B74A 1P3NA 4I7KA 1IWUA 3A6BY 2N5ZA 218LA 186LA 2CGIA 1D0MA 4EMNA 1LTMA 3FA0A 237LA 1C6AA 5C6JA 4R0FA 1BGIA 3G3AB 1GFUA 1GF0A 5LA8A 4LT2A 1C10A 1QT8A 4NSJA 1HEWA 1KY0A 1L13A 1N4FA 1PQOA 3TXKA 1VDQA 1L33A 1BB5A 1PQJA 1L28A 1TEWA 3AZ6A 1GEZA 1GFHA 1HEPA 5B1FA 3TXHA 1DQJC 5KXXA 1JSFA 1GBSA 4HTKA 1PZYA 1L47A 1VATA 4KL7A 1EPYA 5D5FA 4OO9A 3DN8A 1DYFA 1JJ1A 4EKRA 4XENA 4NG8A 1DZBX 4I7MA 3DN2A 4H9FA 2O4WA 3AW6A 2Z2FA 3GUPA 1LJHA 198LA 1REXA 2B70A 1RI8B 1C6BA 1CV1A 103LA 160LA 4DC4A 1SX2A 1L09A 2OTZX 1LZSA 4I7LA 2RB2X 1IWTA 1LMOA 4YENA 2FBDA 1W6ZA 3TMWA 142LA 4H9CA 1P56A 2Z18A 3AGIA 2BQCA 2XBSA 4Z41A 3TXFA 172LA 1OP9B 3UONA 5KXZA 3OK0A 2YBHA 1L75A 4L41A 3WVYA 1EQ5A 1WQMA 5DN4A 225LA 3KAMA 5LAFA 1OUHA 1QT6A 232LA 1WTNA 4DJHA 4EPFA 4NG1A 1HEOA 1QTBA 3HT9A 107LA 4GLAA 1LKSA 1IWVA 162LA 4HPEA 3AW7A 3L64A 3WYHA 5LYMA 3EMLA 3HH5A 4YEMA 1L57A 2OE4X 2DQCY 1XGQC 4ARLA 4LFXA 2ZIKA 1L90A 1MLCE 1L77A 3CDTA 5KKIA 1SSWA 2QARC 2ZILA 1JSEA 1L99A 1P64A 1GBXA 4RLNA 6LZMA 3G3VA 4H8ZA 197LA 1C68A 1WVUA 4KT3A 1IC7Y 2BQNA 1PQIA 1NDMC 1MELL 4KPMA 4H90A 1JJ0A 3B0IA 1HSWA 2A7FA 1LZGA 4J1BA 4NSHA 3HTDA 5KJ9A 4H9BA 4ZEEA 2G4NA 4EJ4A 1QS5A 2HEDA 1VEDA 2ZWBA 1GF9A 1T6HA 4WLDA 1FN5A 5F9UA 2FYDA 254LA 1QQYA 1C60A 5AMYA 3OE9A 1CUQA 1L88A 175LA 2MEHA 5FELA 1KXXA 243LA 2BLXA 2RAZX 241LA 3OJPA 3QE8A 1DYDA 1L41A 1LZNA 4WLXA 1LJNA 1QSWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 108L A;  1NBZ C;  131L A;  2PC2 A;  1L34 A;  1LSB A;  3HTF A;  2BQL A;  2F4G A;  3CDR A;  4W51 A;  3WU8 A;  2F2N A;  5HNC A;  3WPL A;  1G0Q A;  1G7J C;  4QDN A;  4G4H A;  5C6L A;  5IEL A;  1ALC A;  1LHH A;  1IVM A;  1LZD A;  135L A;  1JKC A;  3GXR A;  2H9K A;  4ETB A;  5ILC A;  1L19 A;  4AQN A;  1IIZ A;  4YXA C;  1WQN A;  3WXU A;  1L23 A;  1F6S A;  4IAP A;  1P37 A;  1QUG A;  1KIP C;  4RDS A;  1DI3 A;  4EOF A;  1T8G A;  3W6B A;  3C83 A;  3P66 A;  1T6V L;  4ZIX A;  4XJG A;  2DKV A;  2ANV A;  3T6U A;  255L A;  4LYC A;  3NY9 A;  1CJ9 A;  248L A;  1AM7 A;  1G06 A;  3B72 A;  5IDD A;  253L A;  3GXK A;  1PQM A;  236L A;  2HEE A;  4XAD A;  4HJZ A;  224L A;  3W3E A;  8LYZ A;  1KIR C;  4W56 A;  194L A;  2CJL A;  3HU9 A;  1JTN A;  1LJI A;  4OOT A;  4NGO A;  1GB8 A;  5KXO A;  2EQL A;  1IP6 A;  1LI3 A;  3GUN A;  1XEJ A;  2B5Z A;  4XYY A;  3HFM Y;  4HV2 A;  1SQ2 L;  3CDQ A;  4H8X A;  1XJU A;  1KXW A;  4PJZ A;  2Z2E A;  4N0J A;  1PQK A;  1L24 A;  4DD2 A;  226L A;  155L A;  3DKE X;  4EKS A;  1CTW A;  4DT3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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