4OW1A

Crystal structure of resuscitation promoting factor c
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
GPSPNWDAVAQCESGGNWAANTGNGKYGGLQFKPATWAAFGGVGNPAAASREQQIAVANRVLAEQGLDAWPTCGAASGLPIALWSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title The RpfC (Rv1884) atomic structure shows high structural conservation within the resuscitation-promoting factor catalytic domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Resuscitation-promoting factor RpfC
total genus 24
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B, E, S, T, U, W, X
ec nomenclature ec 3.-.-.-:
pdb deposition date 2014-01-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ow1A00
4GLAA 3WUNA 1TEWA 1KXXA 3WU7A 1EL1A 3N9CA 3P66A 1NHEA 1GBXA 1LSEA 1VDSA 4J1BA 5L3IA 1LZAA 1GPQC 1SLYA 2MEGA 4ZEEA 2HEEA 5IHGA 1B7RA 1LKRA 1HEOA 5HQ1A 2MEDA 4GN3A 1IX0A 1LZDA 4GCBA 3CT5A 1NBZC 4OWEA 1CJ8A 2GV0A 1WQOA 3LZTA 1VDPA 2AUBA 2CDSA 1IP5A 1NKHA 1HEWA 4QDNA 1C43A 2LYMA 1D0KA 1VDQA 3AZ6A 4HP0A 4YOPA 5LYMA 3P65A 5JENB 1RI8B 2YVBA 4NG8A 5FELA 3TXBA 4KPMA 1IWZA 1D0LA 1GBYA 1W6ZA 3A90A 3WPJA 4ETDA 3N9AA 1REMA 2BQHA 1LMPA 1B2KA 1ZVHL 1DKKA 1AT6A 1JPOA 2DQJY 4W96A 1IR9A 4GN5C 1YKXX 4NGLA 1JJ1A 1JTPL 1UIAA 1JISA 1WQMA 1YKZX 2FYDA 4H9AA 4H92A 1XEKA 4WM2A 5B59A 3RZ4A 1OUDA 5LAGA 3B6LA 3EXDA 4NGYA 5LA8A 4PRQA 1D6PA 5E4PA 2I6ZA 5C6IA 2F4AA 3J4GA 2XTHA 4H9EA 1IP2A 1WVUA 5M1YA 1IC5Y 4LYBA 5F81A 1CKDA 5T3FA 3B72A 5KXYA 4R6CA 4B4IA 1HENA 1LCNA 2BLYA 4LYTA 4NG1A 4ETCA 1VAUA 2D4JA 4GCEA 4N8ZA 1BVKC 4G4HA 3AZ7A 4XJIA 4NHIA 1LZRA 4IASA 1N4FA 1UIDA 3HFMY 3W6DA 1BB7A 5KY1A 1F0WA 1LYOA 4B49A 1TDYA 1LJ4A 3WW5A 1XGQC 2BQBA 1B5VA 1OUHA 3BKHA 4TTDA 4WM3A 5A3ZA 3LYOA 4FJRA 5LYTA 1B5ZA 1CKFA 1FBIX 5I54A 1GAZA 1XEIA 2ZYPA 1TAYA 4Z46A 1J1OY 1LHJA 4PJ2C 3A6BY 5KKIA 1GE2A 9LYZA 2H9JA 2YBJA 4H8XA 1UCOA 6LYTA 3A93A 4HJZA 2MEFA 3W6BA 2BQLA 3D3DA 1JUGA 3TMXA 4DDBA 1ZV5L 1LZ1A 1B0DA 1NBYC 1FLYA 2ZIJA 1C08C 1DI5A 3LZ2A 4LYOA 1HEQA 4H9IA 2DQHY 2ZNXY 4P2EA 4UWUA 5FDJA 4ET9A 1KXWA 3CT1A 4WLXA 4XN6A 4CHXA 1OUEA 2Z2EA 1MELL 1JKAA 2BQJA 2HECA 4NSIA 5LVJA 1LTMA 4N1CC 1WQPA 3AJNA 5I4WA 2BQNA 1PZYA 4H90A 4UWNA 2B5ZA 5LYZA 3TXEA 3A91A 1GFRA 2BQIA 1LJGA 1IP4A 1GF3A 4CGEA 1V7SA 1C45A 1JSFA 4H91A 3D9AC 1QQYA 1CNSA 1LZEA 2BQDA 5FHWA 4LT1A 1HMKA 2I26L 2HUBA 1G7HC 5KXXA 2I25L 2BQKA 4NHTA 4XJHA 2CJLA 3AGIA 1GFVA 1KXYA 1WVVA 1LJJA 2LYZA 2XBSA 4B1AA 1XEJA 2IFFY 3FI7A 4II8A 4PHIA 4TUNA 5F16A 4XJBA 1EQEA 1DPXA 1LZ6A 4LYZA 2BQOA 2DQFC 4LFPA 3QNGA 4ET8A 4PGJB 1LSGA 1T6VL 5C6JA 1HEPA 1B5WA 2Z19A 1WTMA 3ATOA 1IO5A 4PPOA 4QEQA 3E3DA 4RW2A 3WH1A 4ZIXA 3F6ZA 5KXZA 1IOQA 2Q0MX 5I53A 2EIZC 1D6QA 1JJ3A 1VEDA 4I0CA 5I4YA 5IELA 1XFPL 4LFXA 2ZIKA 1IP6A 3LHMA 1HC0A 1WQRA 4MCKA 4DD7A 4OOTA 1UC0A 4WG7A 1UA6Y 2BPUA 1LZ4A 3QY4A 1GB5A 4Z98A 1UUZC 4M6DA 3W3EA 4DT3A 5KXKA 4NGWA 5DLAA 4H9HA 3CSZA 4G49A 1GF0A 2C8OA 3IJUA 2RSCA 4EMNA 1JHLA 1NQIA 1IWXA 1RJCB 3B0IA 1UIFA 1JWRA 3EBAB 5ILCA 4J0LA 4B0DA 1FLWA 1GEZA 2YBHA 4ML7A 1B9OA 4DDCA 1GB9A 1ZMYL 2G4NA 1GFUA 1GBOA 3WPLA 1LSYA 2PC2A 4D9ZA 1DQJC 3IWRA 4OOOA 1JITA 1FLQA 1HEMA 1OUBA 4CJ2A 5DL9A 1G7LC 1LAAA 5LIOA 1CKCA 1LMOA 1BWJA 3OJPA 4N0JA 1VFBC 2YBNA 4WO9A 3A67Y 1A4VA 1Z55A 1LZBA 2H9KA 4IATA 1PS5A 1GB3A 5APDA 1GD6A 4H1PA 1XGTC 1GDXA 1KIPC 1RCMA 3WL2A 1GF7A 1MLCE 4NGIA 4NGOA 1J1PY 4NGVA 4YENA 5APFA 4B4JA 2F2NA 3B0OA 4ETAA 4NWEA 5AMYA 4I8SA 3B0KA 5ILFA 2ZQ4A 5HLLA 4XADA 2A7DA 3ZEKA 1LZCA 2D4IA 4FDYA 5KXRA 1LYYA 1GAYA 2VB1A 4TSBA 1JEFA 5B05A 1LPIA 1H87A 1LJEA 3AGHA 4WLDA 2W1MA 207LA 4LT3A 2CWIA 5J7CA 1IP3A 4XENA 1JKBA 208LA 1HFYA 1GHLA 4NGZA 2LYOA 1GFHA 1NMMA 2DQIY 1YL0X 1LMQA 3A6CY 3J6KA 5I5QA 5LA5A 4WOAA 5KXNA 4AXTA 1JJ0A 1GFEA 1XGPC 3WW6A 1YIKA 1J1XY 5LXWA 4G9SA 4WM6A 3W6CA 3LN2A 1GFKA 4G4BA 5I4XA 1FKQA 3AW7A 5D5CA 3EO5A 1AZFA 5HNLA 3LYMA 3W6FA 1JKCA 1IIZA 1LZYA 1JTTL 1QDRA 2HEBA 2XBRA 4NSJA 1G7MC 5B06A 1HF4A 4E3UA 4IJ4A 1LSFA 1B7LA 4LYMA 4TSCA 2D6BA 3ZVQA 3KAMA 3WULA 6LYZA 2ZILA 1HELA 5FSTA 135LA 1YROA 1ALCA 4C5FA 4DD2A 2N5ZA 4R0FA 1REZA 1B7PA 1DZBX 4HTKA 3CT0A 5KXOA 1OQMA 4TX7A 1XSFA 1QUTA 4GLVA 1CKHA 5F9XA 5F9UA 5L3HA 1OP9B 3CSRA 2DQGY 3LYZA 3M18B 132LA 2Y8PA 2Z12A 4GCDA 5DN5A 2DKVA 2W1XA 1IR7A 3G3AB 5HMJA 3WXUA 3TXHA 5HNCA 1EQ5A 1B5XA 3AYQA 1D0MA 4LT2A 2HEAA 2HU1A 1YANA 2BAAA 5APCA 3TMVA 5LVIA 3TXGA 2Z38A 1IOTA 1I20A 4ANRA 1IY4A 2WARA 2Z2FA 1LJFA 3SP3A 1A2YC 3RNXA 3A3QA 1OUIA 193LA 3WPKA 1TBYA 4WLYA 1IOCA 4L41A 1EQ4A 1NF5A 1QDTA 1LZ8A 1AKIA 3HBEX 5KXSA 1WQQA 4W94A 3TXJA 3N9EA 2W1LA 3AGGG 5E9RA 4XJDA 1BHZA 4LZTA 1HHLA 2BQAA 1FN5A 1GXXA 2YBIA 4N1EI 1NDGC 2BQMA 4XJFA 2Z37A 3TXDA 4WM5A 1FKVA 4DDAA 4CFPA 4NHPA 1INUA 2ZQ3A 4RLNA 1OUGA 1B7OA 1CJ6A 5KXLA 3ULRA 1REXA 2FYCA 1DXJA 1GEVA 4A7DA 1F6RA 1LJNA 1VATA 3W6AA 1T3PA 3P4ZA 4DD9A 1TCYA 4LYCA 3WXTA 1B7NA 4YM8A 2EQLA 4MSTA 1HMLA 5B07A 4KL7A 5FEKA 3A95A 3WYHA 1VDTA 2BLXA 4H9FA 1LJIA 2HU3A 1JSEA 1LMAA 1YILA 1C7PA 1YAPA 4LT0A 3A92A 4H94A 4WM4A 194LA 3WU8A 3OK0A 4YF2A 1B5UA 4B4EA 4NGJA 4NGKA 2DQDY 4G4CA 1B7QA 4H9BA 4BAFA 5KXTA 1JTOL 2FBBA 2IHLA 153LA 1CJ7A 2BQFA 4RW1A 1GB0A 1BB6A 3AW6A 1YAMA 2YDGA 4NFVA 3WU9A 3WVXA 1GDWA 3GXKA 1LSDA 3IJVA 4XYYA 1GFGA 1B5YA 5LINA 5B1FA 1BB4A 1GFJA 5FCPA 4ZFPA 1UBZA 5A3EA 1LYZA 4XJGA 1H6MA 1LSBA 4DYGA 5II3A 3WMKA 1LJ3A 1LHKA 4PRUA 3RU5A 4CFOA 2ZWBA 5L9JA 4GN4A 4C3WA 1BB3A 3T6UA 1UIHA 2A7FA 7LYZA 2Z39A 1LZGA 5KJ9A 4BADA 4KXIA 1BWHA 1I56A 4N9RA 3BKVA 154LA 4GCFA 4HV2A 2EPEA 2DQEY 4Z3MA 1LOZA 1DPWA 2MEAA 1I1ZA 4QGZA 3TMWA 1KIQC 4NWHA 3MGWA 1GF4A 1LZ9A 2F4GA 133LA 1O23A 4NSHA 2BQEA 4DD1A 2CGIA 4DWXA 1KIRC 1IP7A 2BQGA 2D4KA 2DQAA 4X3BA 1IWWA 1GF8A 2YBLA 1LZSA 1LSNA 2G4QA 1OUFA 2DQCY 4U3XB 5K7OA 1LSCA 4ETBA 4MR1A 1GB6A 3K3TA 4DD3A 4WM1A 1B7SA 5APEA 1LHIA 1LMNA 2LZTA 4YEOA 5LVHA 1SQ2L 2EKSC 3ATNA 4RLMA 3AZ4A 1IEEA 5HMVA 1LZTA 1IC7Y 1LHHA 4HTQA 4Z41A 1ZVYB 1UACY 3P68A 1LMTA 2XJWA 2YBMA 1IWYA 4LGKA 5KXWA 3HBHA 1LSZA 4WMGA 1IWTA 4H8ZA 1QTEA 4NSGA 1JKDA 2ZNWY 5LVKA 1BB5A 5DN4A 3CSQA 1LKSA 2Z18A 3WUAA 2X0AA 4BS7A 4J1AA 1LZNA 2C8PA 1UICA 1NWGA 1GFTA 2LHMA 4NHSA 1V7TA 1GE0A 3LYTA 4OWAA 4DD0A 8LYZA 3CQLA 4HTNA 1W08A 1NDMC 2BQCA 2NWDX 1YL1X 5IDDA 5LAFA 1XGRC 4BAPA 1LSAA 3A8ZA 1BWIA 4ETEA 4M4OA 5F14A 5D5FA 1B7MA 3VWOA 3WUMA 5KXPA 4AGAA 1LJKA 4EOFA 4H93A 1YAOA 1GF9A 1REYA 1F6SA 3AB6A 2W1YA 3CB7A 1GE1A 4GCCA 3WVYA 5EBHA 5LVGA 3FE0A 1FDLY 4NEBA 3A94A 1XGUC 5KXMA 1IOSA 3TXIA 2G4PA 1UIEA 4NIJA 1GWDA 1RFPA 1IORA 1GBWA 1LSPA 2MEBA 4WG1A 4H9CA 1GF5A 1LYSA 2HTXA 1RE2A 1IVMA 1BGIA 1DI4A 4OWHA 1HNLA 4O34A 5B1GA 1IWUA 3A34A 1CJ9A 1QSWA 1GE4A 3M3UA 5DM9A 4WLTA 4DC4A 4HPIA 4OWCA 3RW8A 1OUCA 1GB2A 1GB7A 1CKGA 1IP1A 4WO6A 4NHQA 3ZVQB 4HSFA 1QSAA 134LA 3W6EA 1GF6A 1AT5A 2HEFA 3GXRA 4OW1A 1UIBA 2F30A 4UWVA 1BVXA 3A96A 3G3BB 4H8YA 4HJYA 2MEIA 2HEDA 3A3RX 3T36A 3EMSA 3P64A 4N5RA 1LJHA 1HERA 2DBTA 4YEMA 2MEEA 1IR8A 2MECA 1D9UA 3TMUA 3RT5X 1YQVY 2FBDA 1LMCA 1C10A 1HSWA 1DKJA 1G7JC 1LHMA 1YAQA 1JIYA 1LZ5A 1AM7A 5C6LA 1BQLY 1F10A 1P2CC 2LZ2A 5KKJA 3AZ5A 1OUAA 1HFXA 1LSMA 1GXV2 1C46A 2YSSC 1IY3A 1GB8A 1LHLA 4KT3A 1HFZA 4RDSA 1WQNA 1GBZA 1GBSA 2MEHA 1GE3A 1DI3A 1HSXA 1E8LA 3QE8A 1UIGA 4QY9A 1QTKA 1IWVA 1GFAA 4WL7A 1OUJA 4NY5A 4OWBA 4HJVA 2D91A 3TXKA 1WTNA 4TWSA 2H5ZA 1IC4Y 3TXFA 3HBDA 4J7VA 1QIOA 4WL6A 1FLUA 4HPEA 1YKYX 1G7IC 1QUSA 4HV1A 2ZYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P66A 224LA 1NHEA 1LI6A 1VDSA 4J1BA 1LZAA 1SLYA 2MEGA 4ZEEA 109LA 4DQ5A 1P5CA 4GN3A 232LA 1HEWA 4QDNA 1VDQA 4I7LA 217LA 3WPJA 196LA 249LA 1DKKA 1QUOA 1L40A 1DYGA 1WQMA 4W56A 205LA 4WM2A 2B6XA 1OUDA 1CV5A 3DMXA 1D6PA 189LA 1T8FA 2OTYX 5E4PA 5C6IA 1OYUA 4H9EA 1IP2A 3LZMA 1CKDA 4LYTA 1VAUA 2D4JA 1D3JA 4GCEA 1LZRA 4IASA 3OE9A 253LA 4ARLA 1PQIA 4TTDA 4WM3A 4YXCA 4FJRA 4EXMA 1B5ZA 1FBIX 3FA0A 1XEIA 3A6BY 146LA 5KKIA 1L56A 1GE2A 9LYZA 2H9JA 2YBJA 4H8XA 177LA 6LYTA 1C6JA 1JUGA 3TMXA 220LA 1B0DA 1NBYC 1FLYA 4P2EA 2ZNXY 3GUNA 2HECA 5I4WA 3AJNA 2BQNA 4H90A 1GFRA 1V7SA 1L48A 1JSFA 3GUKA 3C8SA 2HUBA 2RBRA 1GFVA 1WVVA 1LJJA 4W51A 1XEJA 2IFFY 1DPXA 1QTVA 1B5WA 3ATOA 1WTMA 1IO5A 3E3DA 5KXZA 1WTHA 2Q0MX 2EIZC 1CVKA 4LFXA 3DN4A 1WQRA 4DD7A 148LE 1UA6Y 1GB5A 4Z98A 1UUZC 1L41A 4G49A 1XJUA 3IJUA 1B6IA 164LA 142LA 1IWXA 1JQUA 1C62A 1UIFA 1JWRA 1DYCA 1B9OA 1GB9A 1L37A 2PC2A 1CX7A 1SWYA 4I7KA 5DL9A 2B6ZA 1L82A 1LMOA 2YBNA 4DKLA 1GB3A 4W52A 1CU6A 1GD6A 1XGTC 1KIPC 1GF7A 4NGVA 4ETAA 4NWEA 5AMYA 1L60A 1LZCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GLA A;  3WUN A;  1TEW A;  1KXX A;  3WU7 A;  1EL1 A;  3N9C A;  3P66 A;  1NHE A;  1GBX A;  1LSE A;  1VDS A;  4J1B A;  5L3I A;  1LZA A;  1GPQ C;  1SLY A;  2MEG A;  4ZEE A;  2HEE A;  5IHG A;  1B7R A;  1LKR A;  1HEO A;  5HQ1 A;  2MED A;  4GN3 A;  1IX0 A;  1LZD A;  4GCB A;  3CT5 A;  1NBZ C;  4OWE A;  1CJ8 A;  2GV0 A;  1WQO A;  3LZT A;  1VDP A;  2AUB A;  2CDS A;  1IP5 A;  1NKH A;  1HEW A;  4QDN A;  1C43 A;  2LYM A;  1D0K A;  1VDQ A;  3AZ6 A;  4HP0 A;  4YOP A;  5LYM A;  3P65 A;  5JEN B;  1RI8 B;  2YVB A;  4NG8 A;  5FEL A;  3TXB A;  4KPM A;  1IWZ A;  1D0L A;  1GBY A;  1W6Z A;  3A90 A;  3WPJ A;  4ETD A;  3N9A A;  1REM A;  2BQH A;  1LMP A;  1B2K A;  1ZVH L;  1DKK A;  1AT6 A;  1JPO A;  2DQJ Y;  4W96 A;  1IR9 A;  4GN5 C;  1YKX X;  4NGL A;  1JJ1 A;  1JTP L;  1UIA A;  1JIS A;  1WQM A;  1YKZ X;  2FYD A;  4H9A A;  4H92 A;  1XEK A;  4WM2 A;  5B59 A;  3RZ4 A;  1OUD A;  5LAG A;  3B6L A;  3EXD A;  4NGY A;  5LA8 A;  4PRQ A;  1D6P A;  5E4P A;  2I6Z A;  5C6I A;  2F4A A;  3J4G A;  2XTH A;  4H9E A;  1IP2 A;  1WVU A; 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 1XGU C;  5KXM A;  1IOS A;  3TXI A;  2G4P A;  1UIE A;  4NIJ A;  1GWD A;  1RFP A;  1IOR A;  1GBW A;  1LSP A;  2MEB A;  4WG1 A;  4H9C A;  1GF5 A;  1LYS A;  2HTX A;  1RE2 A;  1IVM A;  1BGI A;  1DI4 A;  4OWH A;  1HNL A;  4O34 A;  5B1G A;  1IWU A;  3A34 A;  1CJ9 A;  1QSW A;  1GE4 A;  3M3U A;  5DM9 A;  4WLT A;  4DC4 A;  4HPI A;  4OWC A;  3RW8 A;  1OUC A;  1GB2 A;  1GB7 A;  1CKG A;  1IP1 A;  4WO6 A;  4NHQ A;  3ZVQ B;  4HSF A;  1QSA A;  134L A;  3W6E A;  1GF6 A;  1AT5 A;  2HEF A;  3GXR A;  4OW1 A;  1UIB A;  2F30 A;  4UWV A;  1BVX A;  3A96 A;  3G3B B;  4H8Y A;  4HJY A;  2MEI A;  2HED A;  3A3R X;  3T36 A;  3EMS A;  3P64 A;  4N5R A;  1LJH A;  1HER A;  2DBT A;  4YEM A;  2MEE A;  1IR8 A;  2MEC A;  1D9U A;  3TMU A;  3RT5 X;  1YQV Y;  2FBD A;  1LMC A;  1C10 A;  1HSW A;  1DKJ A;  1G7J C;  1LHM A;  1YAQ A;  1JIY A;  1LZ5 A;  1AM7 A;  5C6L A;  1BQL Y;  1F10 A;  1P2C C;  2LZ2 A;  5KKJ A;  3AZ5 A;  1OUA A;  1HFX A;  1LSM A;  1GXV 2;  1C46 A;  2YSS C;  1IY3 A;  1GB8 A;  1LHL A;  4KT3 A;  1HFZ A;  4RDS A;  1WQN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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