4OW1A

Crystal structure of resuscitation promoting factor c
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
86
structure length
86
Chain Sequence
GPSPNWDAVAQCESGGNWAANTGNGKYGGLQFKPATWAAFGGVGNPAAASREQQIAVANRVLAEQGLDAWPTCGAASGLPIALWSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Resuscitation-promoting factor RpfC
publication title The RpfC (Rv1884) atomic structure shows high structural conservation within the resuscitation-promoting factor catalytic domain.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 24
structure length 86
sequence length 86
chains with identical sequence B, E, S, T, U, W, X
ec nomenclature ec 3.-.-.-:
pdb deposition date 2014-01-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ow1A00
1LMQA 5B06A 4XENA 4OWCA 2EIZC 1NKHA 1LMCA 4DD9A 193LA 5HNCA 2BQBA 1UIGA 1LJKA 1HFXA 1LYYA 2LHMA 4LYZA 1IR9A 1D0MA 4G49A 3AGHA 3AYQA 4WLYA 5KKJA 5APEA 207LA 5APCA 2RSCA 3GXRA 4KPMA 4B1AA 1KIQC 4GCFA 1HF4A 2YBNA 4KXIA 1LZ6A 3A91A 4DC4A 1VFBC 5DLAA 2FYCA 3AB6A 4E3UA 5AMYA 5LVJA 4UWUA 1WTMA 1J1PY 1GWDA 1GFVA 2ZQ4A 3AW6A 1LYZA 4ETAA 4NHQA 1DKJA 4WOAA 1SLYA 1XGPC 5LVHA 1INUA 2W1XA 1LZBA 1JKAA 3MGWA 3K3TA 1VAUA 3W6FA 3WW5A 1LSAA 4H1PA 3QNGA 1OQMA 5IDDA 5LVKA 4HTNA 1AZFA 1JHLA 4ANRA 4GN4A 5II3A 1XFPL 2A7FA 1YL1X 4PPOA 1LSBA 4Z3MA 1EQEA 3KAMA 1BVKC 1J1OY 4DWXA 1YILA 1FN5A 1UIHA 4C5FA 5F81A 2YBJA 194LA 1GB7A 4FJRA 4RLNA 4YM8A 2Z38A 1LYSA 1XSFA 1ZVYB 4B4EA 5LA5A 4GCEA 1LJ4A 2HEBA 3AW7A 3W6CA 4BAPA 1C46A 1LSNA 4CGEA 5LAGA 1NWGA 1GFHA 1GFTA 2IFFY 1DQJC 1EL1A 2YDGA 4DDBA 1LJHA 1LMOA 2LYZA 3WUAA 2D4JA 1GB8A 4BAFA 1AT5A 4N0JA 1QDTA 1GHLA 4NGLA 4UWVA 4KL7A 5FHWA 1GE1A 1UIFA 1UIBA 1GBOA 4NSGA 5LINA 1YQVY 5KJ9A 4WO6A 1IWVA 5APFA 5KXTA 5KXZA 4NGKA 4XJGA 1RE2A 4XADA 3AGGG 3W6BA 2HEEA 1CNSA 1OP9B 4AGAA 1IOTA 3WU9A 1GBXA 1JTOL 1LKSA 1LJGA 2XBSA 1OUCA 3OJPA 2Z2EA 2F4GA 3B6LA 3WU8A 1CJ6A 3TXIA 1WQRA 3WMKA 1GF7A 4J0LA 1IOCA 4NY5A 4OWEA 5F9UA 4MSTA 4WM2A 3AJNA 2DQEY 4OOOA 1XGUC 3AZ6A 1PS5A 1YAMA 1CKDA 3AGIA 3CT0A 4Z46A 4OOTA 2DQHY 1YKXX 1LCNA 2BQAA 1GXV2 2DQAA 1BB4A 3N9CA 2F2NA 4KT3A 4RDSA 1C43A 4NGYA 4TWSA 4Z41A 3P4ZA 1GBWA 1LZAA 3FE0A 1GB3A 1WQNA 3EXDA 3WVYA 1IP4A 2EKSC 1JSFA 5DL9A 4FDYA 3ZEKA 3A96A 1KXWA 2G4PA 1J1XY 1YL0X 2ZNWY 1LHJA 1GFRA 1I20A 5HQ1A 1LZSA 5E4PA 1A4VA 1UCOA 1F6SA 2BAAA 1IWUA 1FLWA 2WARA 4WLDA 4ZIXA 154LA 2MEHA 2Y8PA 4HJVA 1NBZC 1DPWA 1H6MA 1GB6A 3A90A 1XGTC 4H9FA 4CFPA 1AKIA 5A3ZA 1BGIA 1C08C 1UBZA 3RZ4A 1IY3A 5LYZA 5LIOA 1B7RA 3EMSA 1QSAA 5KXLA 5KXKA 2BQLA 4ETBA 2EQLA 4HJZA 1GFUA 1LSEA 4WO9A 2ZIKA 4GN5C 1DPXA 1KXYA 2PC2A 3A94A 1NMMA 2EPEA 3CSRA 4HV1A 4N1EI 1HMKA 3F6ZA 3P65A 1B7PA 1ZVHL 1B7SA 4YENA 1KIRC 4NGJA 1LSYA 1BB6A 1G7HC 3P66A 1DZBX 2I25L 4DD2A 1IP7A 4LYBA 1HC0A 2BPUA 1GF9A 3A34A 1HEOA 4LYOA 4G9SA 1I1ZA 133LA 1Z55A 4YOPA 4H9EA 1VDQA 4NSHA 2CGIA 2DKVA 1REMA 1JUGA 2BLYA 4MR1A 1IOQA 1IP3A 3G3BB 1IP5A 4N5RA 1JTTL 2AUBA 4R0FA 4J7VA 4CJ2A 1LMNA 2BQKA 4NSJA 3TXHA 3AZ5A 1YAOA 3B72A 2W1LA 1WQPA 3TMWA 4QDNA 4W96A 4DDAA 1AT6A 2VB1A 1F10A 1VATA 4NHPA 4BS7A 3ATOA 1JTPL 1LZGA 1YROA 2W1MA 4J1AA 3ATNA 1LSCA 3TXGA 4ETCA 2BQDA 4M4OA 1OUEA 1G7LC 3A95A 1GFJA 5HNLA 3WU7A 5C6IA 3TXDA 5FDJA 4TUNA 1OUDA 1BVXA 4BADA 1GAYA 1GF6A 5F16A 4Z98A 1GB5A 1TCYA 5LAFA 1JKBA 3TMUA 2MEAA 3BKVA 4H9IA 4HPIA 1TAYA 7LYZA 4GCDA 1B5ZA 4QGZA 5J7CA 1JJ3A 2XBRA 4II8A 4LT1A 2HUBA 2MEFA 4WG7A 3T6UA 1NHEA 1LZ4A 1V7TA 1JPOA 5KKIA 1CJ7A 1F0WA 3WUNA 208LA 4G4HA 4ET8A 2Z2FA 1B5WA 4NWHA 2X0AA 1PZYA 1T6VL 3TXJA 1IP6A 1HFZA 4H8YA 4NGOA 4TX7A 4R6CA 4DD7A 2LZ2A 1G7IC 2YBMA 3RU5A 5KXPA 2HTXA 1B5UA 4LFPA 3LHMA 4L41A 1IY4A 1GEZA 5L9JA 1LJFA 2NWDX 4XJDA 1CJ8A 1GE4A 1JISA 2H5ZA 5C6JA 4RLMA 5KXXA 4H8XA 1D0KA 1DI3A 1GAZA 1JWRA 1FBIX 1O23A 4WM6A 2YBIA 1GF3A 3LYTA 5LXWA 2F4AA 2I6ZA 1OUAA 3B0IA 4G4BA 2BQIA 4W94A 4LZTA 1BB5A 1TDYA 4H94A 3W6EA 1GXXA 1D6PA 1GB0A 4GCBA 1FLUA 1CKGA 2MEEA 2YBLA 1GDXA 1HEMA 2BQNA 2G4QA 2ZNXY 3A3QA 1QDRA 4H9CA 1UC0A 3J4GA 4QEQA 4MCKA 5HMJA 1GFGA 4LT3A 3LZ2A 1JJ1A 4DD0A 1HEPA 3CT5A 3A67Y 3AZ4A 4GLVA 2ZYPA 2Q0MX 5DM9A 2BQOA 1LJNA 2MECA 1IVMA 4ETEA 1XEJA 1IEEA 4NGIA 5M1YA 1OUFA 1YAPA 132LA 3N9AA 1IC4Y 2DQCY 1F6RA 2Z37A 2DQJY 2C8OA 3CQLA 2ZILA 4HJYA 2DQIY 5I4YA 3HBHA 8LYZA 4M6DA 4LGKA 1GF0A 1AM7A 1GE2A 4RW2A 4NFVA 1QSWA 5D5FA 1LSZA 4CHXA 2GV0A 1IWXA 1IC7Y 1MLCE 1GFKA 1LYOA 2D6BA 4IATA 2FYDA 1LMAA 4NHSA 4LYCA 4NG1A 1LPIA 1VEDA 2HEAA 4B0DA 1IR7A 2DQDY 1HENA 1B5XA 4P2EA 3TXBA 3ULRA 5I54A 1D6QA 4WM1A 1ZMYL 3B0KA 2YBHA 1SQ2L 4B49A 3WUMA 2BLXA 4IJ4A 2LYMA 4XJBA 3WPJA 2BQHA 1WVUA 3HFMY 2G4NA 3M18B 4XJHA 4A7DA 5E9RA 5KY1A 1C45A 3IJVA 3WYHA 2Z19A 5LA8A 1LOZA 4WM5A 4TSCA 1REYA 1BB3A 2ZIJA 4HTKA 1B7LA 1IIZA 1GB2A 1HERA 1YIKA 2A7DA 1LZCA 1HNLA 4NWEA 2Z18A 1RJCB 1LHMA 1LSGA 1P2CC 1QTKA 1A2YC 2Z12A 2BQCA 5I5QA 3IJUA 1VDTA 5D5CA 4AXTA 1IWYA 4PGJB 5B1FA 3HBDA 2D4KA 1LKRA 3A3RX 3RW8A 1HEWA 5KXRA 1HSXA 1LZ5A 3OK0A 3WXTA 2F30A 3TXKA 4NHTA 1OUJA 3WXUA 1LMPA 1LZTA 1T3PA 5KXYA 3CB7A 3T36A 1CKHA 4UWNA 1GBYA 1OUHA 4OW1A 1REZA 1QUTA 4PRQA 1FKQA 2DBTA 4DT3A 4XJIA 3A6CY 5T3FA 1B7OA 3LYOA 1IWZA 4J1BA 4WM4A 1IO5A 1HFYA 2CDSA 4NG8A 3WL2A 1DXJA 1BQLY 1QIOA 4PJ2C 5HLLA 2N5ZA 3EBAB 5KXSA 4WM3A 1LTMA 3A6BY 2HU3A 3QE8A 5FELA 3RNXA 2BQEA 3CSQA 4LT0A 1DI4A 4NHIA 5L3HA 1REXA 5LYTA 4C3WA 1IWTA 1GEVA 1QUSA 1IORA 135LA 1GBZA 1CKCA 1LSDA 1GD6A 1ZV5L 4LYMA 4NEBA 3CSZA 1C7PA 1CKFA 4ETDA 3W6AA 4ZEEA 1UIDA 1B9OA 2B5ZA 3HBEX 3ZVQB 1LHIA 2XTHA 2XJWA 4LT2A 4EOFA 4WMGA 2D4IA 5DN4A 153LA 2ZQ3A 3B0OA 5ILCA 1YANA 4ET9A 4DD1A 1NBYC 1JKDA 3G3AB 1G7MC 2Z39A 1XEIA 1D0LA 1JJ0A 1NQIA 4OWBA 1GPQC 1MELL 3A93A 5F9XA 1GF4A 3LYMA 4YF2A 1E8LA 1HMLA 1RCMA 2W1YA 3J6KA 5LVGA 3M3UA 4ZFPA 3A8ZA 1GFEA 1QQYA 4PRUA 4XN6A 4DD3A 1FDLY 2IHLA 5ILFA 1BHZA 1RI8B 1GF8A 1I56A 2YVBA 3SP3A 1LJEA 3RT5X 5KXOA 1TEWA 1WQOA 1C10A 4N8ZA 1D9UA 1B7NA 1YAQA 1BWIA 1XGQC 2CWIA 2H9KA 2HEDA 2HU1A 2LZTA 1OUGA 1LJIA 1NDMC 1LZYA 2YSSC 1B2KA 4HP0A 1LHKA 1LSFA 1LZRA 1B7QA 4H90A 3N9EA 4EMNA 5I4WA 1JKCA 1B5VA 1LZ9A 2BQFA 3GXKA 3WH1A 4B4IA 4X3BA 2BQMA 2MEGA 3D9AC 6LYZA 5KXWA 3TMXA 2DQGY 1GDWA 6LYTA 3WULA 1UA6Y 4N9RA 4PHIA 4NIJA 2DQFC 1HEQA 4RW1A 1BB7A 5EBHA 3WW6A 5JENB 3WPLA 1EQ5A 1GFAA 2BQGA 1JEFA 4OWAA 2FBDA 4IASA 4NGZA 4XYYA 4LFXA 1HELA 1TBYA 4HSFA 4H9HA 1XEKA 4XJFA 1GE0A 1WQQA 5FCPA 1LSPA 5K7OA 1RFPA 2ZYCA 3A92A 3D3DA 1DKKA 4H91A 3AZ7A 3EO5A 5A3EA 134LA 1IX0A 1FLYA 1GB9A 4TSBA 1GE3A 5B07A 3W6DA 4HTQA 1IP2A 3WPKA 4HV2A 1LSMA 3LYZA 1LZEA 3TXFA 5LVIA 1NDGC 1BWHA 4WLXA 5L3IA 5FEKA 3LN2A 2MEIA 1FLQA 1VDSA 3P68A 1H87A 4NGWA 1IWWA 1IR8A 1ALCA 1LJJA 1IC5Y 1UUZC 4OWHA 3TMVA 1B5YA 5KXNA 5B59A 1BWJA 2CJLA 5B1GA 1FKVA 4WL6A 1GF5A 1YKYX 2BQJA 9LYZA 4CFOA 1WVVA 4GN3A 5I4XA 1HSWA 2I26L 2D91A 1WTNA 4WG1A 5IELA 1UIEA 4U3XB 2MEBA 4B4JA 2ZWBA 2MEDA 4HPEA 1JIYA 2H9JA 2HECA 1LJ3A 1HHLA 1UIAA 4NSIA 3LZTA 4TTDA 1IOSA 1N4FA 1VDPA 1DI5A 1KXXA 2LYOA 1W6ZA 3CT1A 3TXEA 1XGRC 1OUIA 1WQMA 4G4CA 3FI7A 4YEOA 4DDCA 5I53A 5APDA 5FSTA 1LZ8A 1UICA 2C8PA 1JITA 1EQ4A 4GLAA 5LYMA 5KXMA 1UACY 1LZDA 4H93A 4N1CC 4DYGA 1G7JC 5IHGA 1QTEA 3W3EA 1V7SA 4H92A 4NGVA 4WL7A 5DN5A 1LHLA 1LZ1A 4H9AA 1NF5A 4O34A 1YKZX 5F14A 3ZVQA 1CJ9A 3E3DA 4H8ZA 4WLTA 1W08A 4I8SA 1LAAA 4LYTA 2FBBA 4GCCA 1B0DA 3IWRA 1OUBA 3WVXA 1LMTA 1LZNA 3VWOA 5C6LA 1GBSA 1IP1A 3BKHA 3P64A 1JSEA 3QY4A 5HMVA 4D9ZA 4YEMA 4H9BA 5B05A 1KIPC 2HEFA 4QY9A 1LHHA 1B7MA 4ML7A 4I0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LMQA 4XENA 2EIZC 3AGHA 1LGUA 2RSCA 3C81A 1HF4A 1PQIA 4KXIA 5AMYA 1WTMA 4IAPA 235LA 1XGPC 5LVHA 1INUA 1L49A 1L62A 1LSAA 1G1VA 1L31A 3F9LA 1L83A 5LVKA 1JHLA 4ANRA 4GN4A 1XFPL 120LA 1L48A 1EQEA 3KAMA 169LA 1LYSA 1LJ4A 1NHBA 3NY8A 1CU3A 3W6CA 1C46A 1LSNA 1NWGA 197LA 198LA 2ANVA 2YDGA 2LYZA 1L76A 2XQOA 1GHLA 3GUIA 1GE1A 5LINA 1L92A 5KJ9A 5KXTA 5KXZA 2OE4X 1RE2A 1CNSA 4AGAA 3WU9A 2XBSA 4I7NA 3TXIA 1P56A 3HTFA 1QTVA 4OWEA 4MSTA 4WM2A 256LA 3AZ6A 1PS5A 1YAMA 4Z46A 1LCNA 2BQAA 1GXV2 1C43A 1OWYA 1L38A 1GBWA 1LZAA 1JTMA 4ARMA 1OYUA 3WVYA 1LYDA 2G4PA 1J1XY 5HQ1A 1I20A 3DN0A 1D3NA 4ZIXA 1IWUA 2MEHA 240LA 2Y8PA 4HJVA 4H9FA 1XGTC 1L35A 1AKIA 1UBZA 3CDQA 3RZ4A 237LA 5LIOA 1QSAA 3SBAA 1CV0A 1L07A 206LA 2EQLA 1LSEA 2ZIKA 1DPXA 1KXYA 3VW7A 1HMKA 3F6ZA 1B7PA 1L00A 152LA 3P66A 1G7HC 1DZBX 2B6TA 1GF9A 1HEOA 1I1ZA 1Z55A 4YOPA 4H9EA 1C6PA 123LA 2BLYA 1LYFA 4ARLA 231LA 3AZ5A 4QDNA 4W96A 4DQ5A 4DDAA 1AT6A 2VB1A 1F10A 1SX2A 1L90A 4J1AA 4ZPUA 1L39A 2W1MA 1LSCA 1L73A 146LA 111LA 1TCYA 1JKBA 3TMUA 1L68A 4GCDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LMQ A;  5B06 A;  4XEN A;  4OWC A;  2EIZ C;  1NKH A;  1LMC A;  4DD9 A;  193L A;  5HNC A;  2BQB A;  1UIG A;  1LJK A;  1HFX A;  1LYY A;  2LHM A;  4LYZ A;  1IR9 A;  1D0M A;  4G49 A;  3AGH A;  3AYQ A;  4WLY A;  5KKJ A;  5APE A;  207L A;  5APC A;  2RSC A;  3GXR A;  4KPM A;  4B1A A;  1KIQ C;  4GCF A;  1HF4 A;  2YBN A;  4KXI A;  1LZ6 A;  3A91 A;  4DC4 A;  1VFB C;  5DLA A;  2FYC A;  3AB6 A;  4E3U A;  5AMY A;  5LVJ A;  4UWU A;  1WTM A;  1J1P Y;  1GWD A;  1GFV A;  2ZQ4 A;  3AW6 A;  1LYZ A;  4ETA A;  4NHQ A;  1DKJ A;  4WOA A;  1SLY A;  1XGP C;  5LVH A;  1INU A;  2W1X A;  1LZB A;  1JKA A;  3MGW A;  3K3T A;  1VAU A;  3W6F A;  3WW5 A;  1LSA A;  4H1P A;  3QNG A;  1OQM A;  5IDD A;  5LVK A;  4HTN A;  1AZF A;  1JHL A;  4ANR A;  4GN4 A;  5II3 A;  1XFP L;  2A7F A;  1YL1 X;  4PPO A;  1LSB A;  4Z3M A;  1EQE A;  3KAM A;  1BVK C;  1J1O Y;  4DWX A;  1YIL A;  1FN5 A;  1UIH A;  4C5F A;  5F81 A;  2YBJ A;  194L A;  1GB7 A;  4FJR A;  4RLN A;  4YM8 A;  2Z38 A;  1LYS A;  1XSF A;  1ZVY B;  4B4E A;  5LA5 A;  4GCE A;  1LJ4 A; 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 1LSM A;  3LYZ A;  1LZE A;  3TXF A;  5LVI A;  1NDG C;  1BWH A;  4WLX A;  5L3I A;  5FEK A;  3LN2 A;  2MEI A;  1FLQ A;  1VDS A;  3P68 A;  1H87 A;  4NGW A;  1IWW A;  1IR8 A;  1ALC A;  1LJJ A;  1IC5 Y;  1UUZ C;  4OWH A;  3TMV A;  1B5Y A;  5KXN A;  5B59 A;  1BWJ A;  2CJL A;  5B1G A;  1FKV A;  4WL6 A;  1GF5 A;  1YKY X;  2BQJ A;  9LYZ A;  4CFO A;  1WVV A;  4GN3 A;  5I4X A;  1HSW A;  2I26 L;  2D91 A;  1WTN A;  4WG1 A;  5IEL A;  1UIE A;  4U3X B;  2MEB A;  4B4J A;  2ZWB A;  2MED A;  4HPE A;  1JIY A;  2H9J A;  2HEC A;  1LJ3 A;  1HHL A;  1UIA A;  4NSI A;  3LZT A;  4TTD A;  1IOS A;  1N4F A;  1VDP A;  1DI5 A;  1KXX A;  2LYO A;  1W6Z A;  3CT1 A;  3TXE A;  1XGR C;  1OUI A;  1WQM A;  4G4C A;  3FI7 A;  4YEO A;  4DDC A;  5I53 A;  5APD A;  5FST A;  1LZ8 A;  1UIC A;  2C8P A;  1JIT A;  1EQ4 A;  4GLA A;  5LYM A;  5KXM A;  1UAC Y;  1LZD A;  4H93 A;  4N1C C;  4DYG A;  1G7J C;  5IHG A;  1QTE A;  3W3E A;  1V7S A;  4H92 A;  4NGV A;  4WL7 A;  5DN5 A;  1LHL A;  1LZ1 A;  4H9A A;  1NF5 A;  4O34 A;  1YKZ X;  5F14 A;  3ZVQ A; 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 3WH1 A;  4X3B A;  1T8F A;  2BQM A;  2MEG A;  257L A;  4N9R A;  2DQF C;  187L A;  4RW1 A;  1GFA A;  2BQG A;  1JEF A;  4IAS A;  4LFX A;  1HEL A;  1LGX A;  4HSF A;  4H9H A;  1L99 A;  6LZM A;  230L A;  4OO9 A;  3D3D A;  1DKK A;  219L A;  3AZ7 A;  1L88 A;  5A3E A;  5B07 A;  1JQU A;  1GE3 A;  3W6D A;  1L02 A;  3L64 A;  3WPK A;  1BWH A;  5FEK A;  142L A;  3LN2 A;  1VDS A;  3P68 A;  2B6W A;  1LLH A;  4W51 A;  2OU8 A;  3TMV A;  5KXN A;  5B59 A;  1CU0 A;  128L A;  2B70 A;  258L A;  2MEB A;  4B4J A;  157L A;  2MED A;  220L A;  2HEC A;  1HHL A;  1UIA A;  1OUI A;  5APD A;  5FST A;  1L57 A;  1LZ8 A;  1UIC A;  1JIT A;  4GLA A;  4N1C C;  5IHG A;  1L77 A;  5DN5 A;  1LHL A;  1LZ1 A;  4H9A A;  1NF5 A;  3ZVQ A;  1W08 A;  4LYT A;  1L21 A;  2LZM A;  1B0D A;  141L A;  4ARQ B;  1IP1 A;  209L A;  3BKH A;  3P64 A;  3QY4 A;  5HMV A;  166L A;  4H9B A;  3FA0 A;  248L A;  5B05 A;  2HEF A;  4DKL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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