4OWHA

Ptbr6 binding to hewl
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title The binding of platinum hexahalides (Cl, Br and I) to hen egg-white lysozyme and the chemical transformation of the PtI6 octahedral complex to a PtI3 moiety bound to His15.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4owhA00
2BQGA 1NF5A 4LYBA 4R6CA 1LHMA 3GXRA 3AJNA 4GLAA 2HU1A 4ANRA 1LSEA 1IP2A 4DD0A 1W08A 4WO9A 1GXV2 1J1OY 3P4ZA 3IJVA 1BB4A 2BQFA 1GB6A 1NQIA 3BKHA 1LYYA 4TSBA 4LT2A 1XGTC 1B7LA 4HJVA 3A92A 1B5WA 1YAPA 5ILFA 2IHLA 1MLCE 3HBDA 4BAPA 3W6BA 5LIOA 4CJ2A 1YAQA 5E4PA 1LSBA 4KPMA 1CJ6A 3LZTA 3WPLA 1WQOA 194LA 2EKSC 4XENA 2ZIKA 3P68A 1D0LA 4J7VA 5KJ9A 2Y8PA 4LT0A 2BLXA 1C45A 1IP7A 1LSYA 4B1AA 5E9RA 5F14A 5IHGA 1UIAA 2DQDY 4HTNA 4QY9A 4DWXA 3TXDA 1JKCA 4GCFA 1LHHA 3G3AB 4LYMA 2G4QA 1BGIA 1CKHA 3AZ4A 2Z2FA 4YM8A 2HEDA 3AW6A 5KXZA 5HNLA 4Z46A 3A34A 1CKGA 3TXKA 1JKDA 5I5QA 1GEZA 4YENA 1HSWA 1OUAA 1PS5A 2I6ZA 2BQLA 5FCPA 2BLYA 2W1XA 1IOTA 2HEEA 1G7LC 1LZ8A 2AUBA 4H9CA 5LVJA 3WVYA 1T6VL 1NKHA 3A91A 4CGEA 4OWHA 3A96A 2DQEY 4H9FA 3A67Y 5KXXA 1JIYA 4H8ZA 3BKVA 2F2NA 3A3RX 2PC2A 4DD9A 2Z38A 1G7HC 5HMJA 4X3BA 3WU8A 1IOSA 2EPEA 1HMKA 1ALCA 2Z37A 3WUAA 2FYCA 2BQDA 3LHMA 1VDPA 4N1CC 4AGAA 3TXFA 4DD7A 5KXKA 1LJFA 4FDYA 4NHQA 3CQLA 4TSCA 3EMSA 1IC7Y 1LKSA 3LN2A 2DQHY 1LZCA 4B4JA 4ETBA 1TEWA 2HEBA 1GDWA 1LMQA 3GXKA 4NGKA 1Z55A 1GBXA 2X0AA 3B0KA 3CSQA 1IOCA 2FBBA 4NGWA 1OUBA 1XFPL 4TTDA 4BS7A 2VB1A 4D9ZA 5IELA 3EO5A 3OK0A 3TMVA 4NY5A 1BVXA 4NG1A 5DL9A 3FI7A 1GB3A 4J1AA 1LZ9A 5C6LA 4DD3A 1B5XA 1GF0A 2YBIA 3WW5A 5HQ1A 2HUBA 4HV1A 3A8ZA 5FHWA 1GBSA 3CT5A 1BB3A 1FKQA 3W6DA 1GE2A 5HMVA 1LSFA 1HFZA 1LZ6A 1MELL 1QIOA 1REYA 1GAYA 3SP3A 5LAFA 1FLUA 1CJ8A 1GB8A 1WVVA 3P65A 4WLTA 4B4IA 3WPJA 4LT1A 1ZVHL 1GBZA 1LMPA 5APFA 3WL2A 4RLNA 5ILCA 2XTHA 3G3BB 1KXWA 1IWZA 4GCCA 4ETEA 1JHLA 2W1LA 4PGJB 4WG1A 4WM1A 3T36A 2H9JA 3WW6A 4ZEEA 4N5RA 1GXXA 4NHTA 1JKAA 4YOPA 4N1EI 5KY1A 1LHIA 1UA6Y 4LZTA 4ZFPA 4WL6A 4I0CA 1B5ZA 1LZYA 3F6ZA 1NHEA 1LPIA 4IASA 1B5UA 1UIDA 1UICA 3AZ6A 1VDTA 2D91A 3E3DA 4MSTA 4PJ2C 4EMNA 3TXHA 1I56A 2BQEA 1WQRA 3AGIA 3A95A 3A90A 2MEHA 4H9EA 4H8YA 1JISA 4Z41A 4M4OA 1XGPC 5DM9A 1YAOA 4WMGA 2BQCA 4LYZA 6LYTA 2ZQ4A 4UWUA 1YANA 2DBTA 2Z2EA 2Z39A 1GFTA 3WMKA 1IR9A 3AGGG 4HJZA 1I1ZA 1LYSA 1G7JC 3LYMA 1I20A 1VATA 3TXJA 1YKXX 1HELA 5C6JA 2D4JA 1VDQA 1WTMA 4NHIA 1HEMA 1SLYA 1B9OA 4XJHA 5B1GA 1LZ5A 4H92A 1RFPA 5B06A 4E3UA 1IP4A 2CDSA 2F4AA 4NHPA 4P2EA 3W6FA 1GE3A 1H87A 1B7QA 1KIRC 5KXPA 1HMLA 1INUA 1GFGA 2W1YA 1IORA 1OUGA 3OJPA 1GF6A 1QDRA 4G49A 1YL1X 135LA 4NSHA 5KXMA 1OUEA 3CT1A 1D6PA 1XGQC 4LYOA 4WM6A 3J4GA 3RT5X 1YL0X 3AGHA 5F81A 1JTOL 1LHLA 1WTNA 1LZRA 5I4YA 5B1FA 1DZBX 3WXTA 1LSNA 2C8PA 2LYMA 1IWYA 2YBNA 1D6QA 1OUCA 1HC0A 1B7RA 5DLAA 2Z12A 1BWJA 1B7PA 1JWRA 2CJLA 1G7IC 4HPEA 1LHKA 4ETAA 1LZDA 1BQLY 4H90A 4KL7A 1REZA 5FELA 4DC4A 8LYZA 2Q0MX 1UACY 2HEFA 2A7FA 1CJ9A 2DQAA 4LYCA 5DN4A 4NHSA 3J6KA 4OWBA 5APDA 3HBHA 3WUNA 1ZMYL 1LJKA 2I25L 2ZQ3A 3ATOA 1HF4A 4M6DA 3A3QA 1B7NA 1LTMA 4GCEA 5F9UA 1JITA 3KAMA 1JTTL 1UUZC 1WVUA 4OOOA 5LA8A 3WPKA 4CHXA 4TUNA 1CKFA 1UIFA 4GCBA 1UC0A 3RW8A 3IWRA 1GAZA 1LJEA 1WQPA 1PZYA 208LA 1IR8A 2DQFC 1YKYX 1LYOA 2ZYCA 2ZILA 5J7CA 1FLWA 1QTKA 2ZYPA 4LGKA 4Z98A 3A93A 3WVXA 4UWVA 4A7DA 3RU5A 4G4CA 3T6UA 2BQKA 1KIQC 1FLQA 5KXRA 4HTQA 4RDSA 1FKVA 1JJ1A 1IOQA 1REXA 1LSPA 1HFXA 2LYZA 207LA 2MECA 4LYTA 1J1XY 1P2CC 2RSCA 3LZ2A 1LSMA 1IY3A 1H6MA 2G4PA 1NDGC 4H9IA 4C5FA 1DI4A 1GHLA 2Z19A 1LZEA 1DPXA 1DXJA 2DKVA 3AZ7A 3W6EA 1LJ4A 1UIGA 2BQBA 5L9JA 2MEIA 4WLYA 2F4GA 1LSDA 1FLYA 3K3TA 1B2KA 153LA 2EQLA 3P64A 3W3EA 2LZTA 2GV0A 1IX0A 1VAUA 4GN4A 4DDAA 1TAYA 1F6SA 2XJWA 1LJ3A 1GBWA 4QEQA 134LA 1AZFA 4LFPA 1JKBA 3B72A 193LA 4NGZA 1LKRA 4NGLA 1N4FA 5T3FA 4N9RA 5I4XA 1GFRA 1VEDA 2YBHA 1UCOA 4HTKA 4LFXA 1IWTA 2MEDA 1NBYC 4WM2A 4YEMA 1WQQA 3TXIA 1LMNA 5LAGA 4YEOA 4WM3A 1B5YA 1QDTA 1IO5A 1LSCA 1OUDA 5KXNA 1IEEA 4DYGA 1LJJA 3QY4A 1RCMA 1LSGA 1JJ0A 4NG8A 4OWAA 3WXUA 3WUMA 4XYYA 3VWOA 2BQMA 5LXWA 1F6RA 4II8A 1CJ7A 1A2YC 4XN6A 4H9AA 3WU7A 4QGZA 3EXDA 4ET9A 1FN5A 1GE0A 4DT3A 4RW2A 2BQJA 1GBYA 1LHJA 4NSGA 4BAFA 1IP3A 1XGRC 2YBJA 4HJYA 4DDBA 1DQJC 1D0MA 4WG7A 3QE8A 1JPOA 4J0LA 1WQNA 4IJ4A 4N0JA 4NEBA 5I4WA 5LINA 1SQ2L 5LA5A 2BQNA 1XEIA 3A6CY 4NWEA 3LYZA 1HNLA 3AZ5A 1UBZA 2WARA 4H94A 4NGIA 5M1YA 5KXOA 4NIJA 4CFPA 1GB9A 4OWEA 1C43A 1HEPA 5I53A 1VDSA 5FEKA 3W6AA 1LJHA 4KT3A 9LYZA 4R0FA 1CKDA 3B0IA 1EQ4A 5APCA 2YBMA 1IY4A 4PHIA 1BWHA 1LMAA 3ATNA 4RW1A 1UIHA 1XEKA 2BPUA 3CSRA 1VFBC 4LT3A 4XADA 4B4EA 2D4IA 4IATA 2ZNXY 4G4BA 2D6BA 1IC5Y 3LYOA 4XJBA 1JEFA 1HEOA 2B5ZA 4TWSA 1D0KA 4OOTA 2NWDX 3CSZA 1EQ5A 1LOZA 2BAAA 4PPOA 1B7SA 1GFVA 2XBRA 4FJRA 154LA 3TXEA 4C3WA 1HFYA 3RNXA 4I8SA 3IJUA 2DQJY 1JJ3A 1DPWA 1GE4A 3HBEX 5A3ZA 4OWCA 4ET8A 4BADA 1UIEA 3N9AA 1B5VA 4KXIA 2YVBA 2DQGY 4G9SA 1GBOA 1GF7A 1LSZA 4H9HA 5D5CA 1CKCA 1HERA 1GFEA 5I54A 1GDXA 1JUGA 1LZ4A 2FYDA 4UWNA 1DI3A 5L3HA 1YILA 1LMCA 2HTXA 4H9BA 3ULRA 1NWGA 4N8ZA 2Z18A 2MEBA 4NSJA 1QUSA 3WYHA 5B05A 2BQHA 5HNCA 5F9XA 1DKJA 2I26L 1AT5A 1F10A 4XJIA 1BB6A 1BVKC 5KKJA 4H8XA 2D4KA 4WL7A 3WULA 3N9CA 3CT0A 4ETCA 4WM4A 1EL1A 3N9EA 4NGOA 1HENA 1LAAA 2YBLA 3M3UA 1IWXA 3QNGA 1GF8A 2G4NA 2YDGA 5APEA 3TMWA 1QUTA 1T3PA 1A4VA 1KXYA 3M18B 1XEJA 4O34A 4H1PA 2FBDA 7LYZA 1GF4A 3EBAB 5II3A 1JSEA 4H93A 1FDLY 1HEQA 1XSFA 1YQVY 5D5FA 1YROA 4DD2A 5HLLA 5LVIA 5L3IA 4NGVA 3AW7A 1QSWA 5FSTA 1IC4Y 1REMA 4YF2A 1IP6A 1G7MC 1GEVA 4GCDA 1OQMA 3WU9A 4EOFA 3HFMY 2BQOA 1GFAA 1V7TA 4GLVA 1LZ1A 5KKIA 1AM7A 2F30A 1C08C 1DI5A 1KXXA 3FE0A 2DQCY 4NGJA 4B49A 3B0OA 5B07A 5A3EA 5LYMA 2HU3A 4WLXA 4Z3MA 4DD1A 4GN5C 3TXGA 2EIZC 5K7OA 1IWUA 2MEGA 1BB7A 1IR7A 4PRUA 4W94A 1OUFA 5LYZA 2LZ2A 1C46A 1F0WA 1OP9B 2H5ZA 3RZ4A 1DKKA 1UIBA 1V7SA 1BB5A 3A6BY 3LYTA 2BQAA 1LZAA 4WLDA 4ZIXA 1QQYA 4NFVA 1BHZA 1IP1A 3B6LA 2DQIY 4PRQA 2IFFY 4U3XB 5FDJA 1HHLA 1LJIA 5C6IA 3MGWA 1AT6A 1BWIA 1GB0A 1TDYA 4ML7A 1LZNA 4XJDA 5KXSA 1O23A 4QDNA 1GPQC 2A7DA 1QTEA 5LYTA 1W6ZA 1CNSA 4NSIA 2W1MA 1IWVA 1B7OA 1J1PY 4B0DA 6LYZA 4L41A 133LA 4G4HA 1GF3A 1GFHA 2H9KA 1IVMA 1JTPL 2BQIA 2LHMA 5AMYA 1TBYA 2C8OA 4XJFA 5F16A 2MEEA 1LSAA 4RLMA 2CGIA 2XBSA 1GF5A 1QSAA 1GB7A 1XGUC 2MEFA 1LZTA 1LZGA 1ZV5L 1IWWA 2CWIA 4NGYA 5LVHA 3WH1A 1GF9A 3D3DA 3P66A 1GB2A 1LZSA 2ZNWY 5KXWA 1RE2A 1C10A 1KIPC 5B59A 1RJCB 4H91A 3ZEKA 4WM5A 1ZVYB 1E8LA 2YSSC 5KXLA 3TMUA 4WOAA 2ZWBA 1HEWA 1IIZA 3CB7A 3D9AC 4OW1A 3ZVQB 1GWDA 5EBHA 1FBIX 5IDDA 2MEAA 5JENB 1LCNA 4W96A 1GE1A 1B7MA 1GFKA 4TX7A 1YAMA 1WQMA 1LZBA 1OUHA 1JSFA 1D9UA 2HEAA 5LVKA 1GB5A 3AYQA 4HSFA 4AXTA 1YKZX 4J1BA 1IP5A 1LJNA 4GN3A 1AKIA 1LMTA 1NMMA 2LYOA 4HP0A 3ZVQA 4ETDA 1C7PA 3TXBA 2ZIJA 1NDMC 4HV2A 4DDCA 5KXTA 3A94A 2HECA 4MR1A 5KXYA 4HPIA 1NBZC 1GD6A 132LA 4MCKA 1OUJA 5DN5A 1B0DA 1GFUA 3AB6A 1LYZA 1GFJA 1LMOA 5LVGA 1TCYA 3W6CA 1EQEA 3TMXA 1HSXA 1LJGA 1OUIA 4XJGA 4CFOA 4NWHA 2N5ZA 4WO6A 1YIKA 1RI8B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L17A 4R6CA 1C65A 149LA 252LA 3HDEA 3PDSA 4ANRA 1J1OY 3C7YA 1L66A 1L00A 3BKHA 1XGTC 4HJVA 3HH5A 1LYDA 5ILFA 1D2YA 3C81A 1YAQA 5E4PA 4KPMA 173LA 1L42A 1WQOA 1L90A 2B6YA 3JR6A 5F14A 3SN6R 2DQDY 4GCFA 3G3AB 1CV5A 2HEDA 2O7AA 137LA 1JKDA 1PS5A 2I6ZA 5FCPA 2BLYA 102LA 1IOTA 1G7LC 3VW7A 3WVYA 1TLAA 3A91A 2DQEY 3A67Y 3A3RX 1LI2A 2PC2A 5HMJA 3WU8A 1ALCA 1L62A 2Z37A 2FYCA 4N1CC 4AGAA 3TXFA 1L04A 3HH6A 4FDYA 3HU8A 3CQLA 236LA 3EMSA 2DQHY 4B4JA 2RB0X 2X0AA 4NGWA 2FBBA 141LA 3HDFA 4NY5A 1BVXA 4NG1A 1GB3A 1PQOA 4J1AA 3A8ZA 5FHWA 1LZ6A 4I7PA 3SP3A 2HUKA 1GAYA 1FLUA 3WPJA 5APFA 5ILCA 166LA 3G3BB 4WM1A 4PGJB 1LHIA 4I0CA 1LZYA 148LE 1NHEA 1L77A 1UICA 3AZ6A 4PJ2C 3TXHA 3A95A 4H8YA 2MEHA 4K5YA 4Z41A 1XGPC 3V2YA 6LYTA 212LA 1YANA 248LA 2Z2EA 1I1ZA 3LYMA 3TXJA 5C6JA 1VDQA 1WTMA 123LA 1SLYA 5B1GA 1LZ5A 3DN2A 1IP4A 1CV6A 1LYFA 2F4AA 1KIRC 1GFGA 1OUGA 3OJPA 1GF6A 1YL1X 135LA 4NSHA 1L93A 3RT5X 4LYOA 4WM6A 1WTHA 5B1FA 1DZBX 1OUCA 1BWJA 1B7PA 4ETAA 241LA 1UACY 2HUMA 4NHSA 1JTNA 3A3QA 1QUHA 1JITA 1L31A 1QS9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BQG A;  1NF5 A;  4LYB A;  4R6C A;  1LHM A;  3GXR A;  3AJN A;  4GLA A;  2HU1 A;  4ANR A;  1LSE A;  1IP2 A;  4DD0 A;  1W08 A;  4WO9 A;  1GXV 2;  1J1O Y;  3P4Z A;  3IJV A;  1BB4 A;  2BQF A;  1GB6 A;  1NQI A;  3BKH A;  1LYY A;  4TSB A;  4LT2 A;  1XGT C;  1B7L A;  4HJV A;  3A92 A;  1B5W A;  1YAP A;  5ILF A;  2IHL A;  1MLC E;  3HBD A;  4BAP A;  3W6B A;  5LIO A;  4CJ2 A;  1YAQ A;  5E4P A;  1LSB A;  4KPM A;  1CJ6 A;  3LZT A;  3WPL A;  1WQO A;  194L A;  2EKS C;  4XEN A;  2ZIK A;  3P68 A;  1D0L A;  4J7V A;  5KJ9 A;  2Y8P A;  4LT0 A;  2BLX A;  1C45 A;  1IP7 A;  1LSY A;  4B1A A;  5E9R A;  5F14 A;  5IHG A;  1UIA A;  2DQD Y;  4HTN A;  4QY9 A;  4DWX A;  3TXD A;  1JKC A;  4GCF A;  1LHH A;  3G3A B;  4LYM A;  2G4Q A;  1BGI A;  1CKH A;  3AZ4 A;  2Z2F A;  4YM8 A;  2HED A;  3AW6 A;  5KXZ A;  5HNL A;  4Z46 A;  3A34 A;  1CKG A;  3TXK A;  1JKD A;  5I5Q A;  1GEZ A;  4YEN A;  1HSW A;  1OUA A;  1PS5 A;  2I6Z A;  2BQL A;  5FCP A;  2BLY A;  2W1X A;  1IOT A;  2HEE A;  1G7L C;  1LZ8 A;  2AUB A;  4H9C A;  5LVJ A;  3WVY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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