4OWHA

Ptbr6 binding to hewl
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title The binding of platinum hexahalides (Cl, Br and I) to hen egg-white lysozyme and the chemical transformation of the PtI6 octahedral complex to a PtI3 moiety bound to His15.
pubmed doi rcsb
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4owhA00
2I25L 3TXKA 3CSZA 1C08C 2HEEA 1OP9B 1JISA 1SLYA 5APCA 1OUGA 4OWHA 4DD0A 2BQCA 4CHXA 4H9IA 1GF7A 4H92A 1C43A 4GN3A 4HSFA 1BB5A 1XGUC 1JHLA 4AGAA 1GBXA 2MEHA 2N5ZA 5A3ZA 4ETEA 5LXWA 1FDLY 1WQRA 3CB7A 2Z12A 2BQNA 3CSRA 3ULRA 1IOSA 2CGIA 2YBMA 1MLCE 2EQLA 5LIOA 1GFJA 2YBJA 5HNCA 4DD7A 1FLUA 1ZVYB 3J4GA 4GCBA 1LOZA 1BWIA 5LVHA 1YKZX 2A7FA 2C8PA 1NBZC 4L41A 1FLYA 3IWRA 1LYOA 4LYOA 1LSYA 4GCEA 1IOQA 3T36A 5B59A 5I54A 1TBYA 3WXTA 4AXTA 1LJIA 4HTNA 1AM7A 4NWHA 1IWUA 1UIEA 4HJZA 5APEA 4WG1A 4N8ZA 6LYZA 1XFPL 1JJ1A 4NSHA 1OQMA 4TX7A 1IWZA 1OUDA 2BQBA 4HP0A 5L9JA 5ILCA 3A34A 1LSCA 1TCYA 3CT5A 4CJ2A 1LMQA 2XBSA 4ANRA 1LSNA 4E3UA 1J1PY 1LHMA 3A92A 3N9CA 1UACY 3WYHA 1GF8A 1GF6A 2DQGY 4OOTA 1REXA 4NHSA 2BQDA 5J7CA 3WVXA 3LYZA 5M1YA 1B2KA 1B7SA 3F6ZA 5LA5A 1B7LA 1HEMA 4YOPA 3WU7A 1EL1A 3AZ6A 4DWXA 2MEFA 4CGEA 1HSWA 1JKAA 4XJDA 1LJHA 1LZYA 4DYGA 3AZ4A 3WW6A 1B7QA 3KAMA 4HJVA 3M3UA 1BVXA 3TXGA 4FJRA 2CWIA 2VB1A 4H8YA 1HFXA 1UUZC 2LHMA 2LZTA 4PPOA 4PRUA 1IVMA 4RLNA 4C5FA 4DDCA 1HEQA 3TXJA 3BKVA 1W08A 4TSCA 1GB5A 4NGWA 4NGOA 1LSMA 1IR8A 2ZQ3A 4OWBA 5KXPA 1IC4Y 4NSIA 1IY3A 2MEDA 1GB7A 3TMUA 3W6BA 4Z3MA 3A91A 2B5ZA 5B1FA 6LYTA 4WLXA 1KIRC 154LA 1GAZA 1EQEA 1LYYA 5LVJA 1CKFA 1D0LA 1JKBA 4WL6A 4IASA 3WUAA 4G49A 1XEKA 4LFXA 3P68A 1KIPC 3A6BY 1LTMA 3EXDA 2BQEA 5C6LA 1CKCA 1NQIA 4NGZA 3T6UA 4DD3A 1KXYA 1MELL 2HU1A 4QDNA 1TEWA 1YL1X 1UIGA 1BWJA 1JTOL 2BQJA 3WL2A 1I56A 5IELA 5ILFA 1DQJC 1C7PA 9LYZA 5KXZA 3A96A 4WOAA 2Z38A 5KJ9A 3W3EA 1GBYA 2H9KA 3CT1A 3LN2A 4IATA 3HBEX 4WLTA 3WVYA 1YL0X 1IIZA 2BQOA 3CQLA 193LA 4LT2A 2F2NA 4LYBA 3WPJA 5KXRA 1IWVA 3TMWA 4ML7A 4ETAA 2ZYPA 2D4JA 4LYTA 4UWVA 1LCNA 4U3XB 1LHHA 5DN5A 1IORA 1C10A 2X0AA 3OJPA 4NFVA 4EMNA 4YF2A 4ET9A 3N9EA 4NHQA 2ZQ4A 5HMVA 1IWYA 3TXEA 1GXXA 3WH1A 2EPEA 1G7MC 4XYYA 1XGQC 1GFAA 1NKHA 1DXJA 2YBLA 4H9AA 2G4NA 1BB7A 4YEOA 1REZA 1BWHA 1LHIA 1WQNA 3B72A 5DLAA 2C8OA 3A3QA 1UIDA 1WQMA 1IX0A 1QTEA 1W6ZA 1CJ8A 2W1MA 1B5WA 1DZBX 1NMMA 3AGGG 4H9EA 5C6JA 4A7DA 1REMA 1D6PA 1RCMA 1CKGA 1FLQA 4DD2A 2YBNA 4ZFPA 1D0KA 2W1LA 1LYSA 2DQIY 4PRQA 3A3RX 3AZ7A 1BVKC 4MR1A 5B1GA 1LPIA 4OOOA 1JTTL 1YQVY 1IP5A 4YEMA 1IC5Y 1F6RA 1YAQA 2ZYCA 3D3DA 2W1YA 4N0JA 2BQAA 4H9CA 1B5YA 5I5QA 3WMKA 3LZ2A 1VDPA 2G4PA 1HENA 4TWSA 3A8ZA 5E9RA 2HTXA 3HBHA 4KT3A 1GD6A 1IP1A 4Z46A 3B6LA 1IP3A 1GF5A 1LHLA 3WU8A 4W96A 4OWAA 4HV2A 3MGWA 3AGIA 2I6ZA 4LT3A 1UA6Y 4NEBA 1GF9A 1NHEA 2HU3A 1V7SA 4DD9A 1DI5A 2Z18A 3A67Y 5HNLA 4ET8A 4GLVA 1B5VA 4M6DA 3G3AB 4LGKA 5LYTA 1NDGC 2W1XA 4NIJA 5I4XA 4DDBA 1B5UA 1IO5A 2D4IA 4Z98A 4XENA 4NG1A 3FI7A 2Z37A 207LA 1C45A 4OWEA 3J6KA 1LMNA 2HUBA 1ZMYL 3AYQA 3A94A 194LA 1GB3A 4B4IA 4D9ZA 1B0DA 1GFKA 4LFPA 1IOTA 3QY4A 3WUNA 1F6SA 1JSFA 1GF4A 2BQKA 3TXBA 1JKDA 4H1PA 4C3WA 5B07A 1BB3A 1IC7Y 3CT0A 3IJVA 4H91A 4IJ4A 4J7VA 5KXKA 1BB4A 2MEGA 3VWOA 3TMVA 1RJCB 1WVUA 1CKDA 2ZWBA 3QNGA 4NY5A 1B7NA 3WPKA 1VDTA 4LYMA 3LYOA 2XTHA 4RW2A 4B49A 2EKSC 3A95A 5LINA 2DQCY 1OUCA 3G3BB 4N1EI 3TXFA 1DI4A 1GFVA 1JTPL 1EQ5A 5L3HA 4LT0A 4NGJA 5IHGA 1P2CC 4PJ2C 5DM9A 1JIYA 3WUMA 1B5ZA 1QUTA 4DDAA 2YBHA 4WM3A 3ATNA 4BADA 2Z19A 1XGRC 2AUBA 4ETDA 1GHLA 1HF4A 1QIOA 5KKIA 1GF3A 1IWXA 4GCCA 5FELA 2FYDA 1CJ7A 1WQOA 4MSTA 4II8A 1UC0A 1LZ5A 1GE4A 4XJIA 1LMPA 4XN6A 1LZ6A 4YENA 4NGIA 1HEOA 1UIFA 4NSGA 1HFYA 1WVVA 1YKYX 1LJEA 1NDMC 4J1BA 2LZ2A 4XJBA 1LZTA 1JJ0A 3CSQA 1JKCA 5LA8A 5FEKA 1D0MA 1YAMA 2LYMA 1LYZA 4J0LA 1CKHA 2IHLA 1SQ2L 5KXMA 1JPOA 5D5CA 2MEIA 4LZTA 5KY1A 2CJLA 4TTDA 4BAFA 4LT1A 1LSGA 4WG7A 3WW5A 1LSDA 2BQHA 3GXRA 1J1XY 1XEJA 3EO5A 3P4ZA 2ZILA 1QDRA 4EOFA 1JUGA 1CJ6A 1UBZA 1IY4A 1LJ3A 2NWDX 4LYCA 4TSBA 4WM5A 5FHWA 4HPEA 3ZVQA 1D9UA 1B7OA 1CNSA 1NBYC 2F30A 3RZ4A 1GFTA 1GEVA 1NWGA 1GFUA 4DD1A 2HEDA 1GB0A 4GCFA 3A93A 1LJFA 1LZSA 3FE0A 1GB8A 1UICA 1LMOA 1VEDA 4GN5C 4I8SA 1RFPA 5DL9A 4I0CA 4DC4A 5IDDA 1IWWA 2Z39A 4R0FA 4QGZA 4XJHA 1E8LA 1LZCA 4RDSA 1G7JC 4HTKA 1OUBA 1ALCA 1XEIA 1BB6A 3P64A 2DBTA 1A4VA 1VATA 3AGHA 3W6AA 1GE3A 2HEFA 1DKKA 1LKRA 2H5ZA 3TXIA 1I20A 1LSPA 135LA 1GE1A 4R6CA 1IWTA 1AZFA 1WTNA 1HMKA 5KXLA 5HMJA 5LVGA 1Z55A 2DQEY 4NGYA 3M18B 1A2YC 1RE2A 4N9RA 5D5FA 2DQAA 4NSJA 1LMAA 5FCPA 1GB9A 2H9JA 5F81A 4ZIXA 1J1OY 1JSEA 3OK0A 4PHIA 4NGLA 2HEAA 5FSTA 1GBOA 4CFPA 1INUA 1LZEA 1DI3A 1B9OA 1HSXA 1O23A 3QE8A 3AB6A 1OUFA 4H9FA 4M4OA 3N9AA 2MEBA 4OW1A 1GPQC 1HELA 1YAOA 4KXIA 1WQQA 4NHPA 4TUNA 3W6CA 4G4BA 2GV0A 4ZEEA 1LZDA 4XJGA 1LSEA 2G4QA 4GCDA 4O34A 4WM2A 4N1CC 3TMXA 1B7MA 1EQ4A 1LSFA 2Z2EA 4H8ZA 1F0WA 1TAYA 1F10A 1GF0A 1IOCA 1LJKA 2BQIA 5T3FA 1FLWA 2D6BA 1AT5A 1GE2A 4YM8A 1HFZA 1JITA 4WM4A 3AW6A 4G4HA 3A90A 1OUEA 4B0DA 2I26L 1H87A 1AT6A 4XJFA 1VDQA 2D91A 4B4EA 2F4GA 1GWDA 1GEZA 5KXTA 1HHLA 1WTMA 4CFOA 2BQLA 4QY9A 5L3IA 3LHMA 4MCKA 4WLDA 1OUJA 1GFGA 4WO6A 3WPLA 3P66A 1G7HC 1LZNA 4WLYA 2MEEA 1AKIA 1ZV5L 4PGJB 4WL7A 1XGTC 2DQFC 4Z41A 4P2EA 1HERA 2RSCA 3ZEKA 4HTQA 4NWEA 3HBDA 1LJNA 3K3TA 1FKVA 5I4WA 5HLLA 4LYZA 5F16A 1LAAA 1IP2A 3TXHA 1REYA 2BQMA 1GFEA 1YIKA 2FBDA 2DQJY 4N5RA 1YILA 4NHTA 2MEAA 4BS7A 1B5XA 3A6CY 2YDGA 5F9UA 4UWNA 2BQFA 1LZ4A 1GBZA 3IJUA 1OUIA 1VDSA 3TXDA 5LAGA 1LMTA 1LJ4A 1QDTA 1ZVHL 3E3DA 2LYOA 4H8XA 4HPIA 4KL7A 5KKJA 3EBAB 1HEWA 7LYZA 1JJ3A 3ATOA 3ZVQB 1GFRA 5E4PA 5KXWA 134LA 1GBSA 3GXKA 5KXNA 1HMLA 1PZYA 1G7LC 3WULA 2HECA 2XBRA 2BPUA 1TDYA 2CDSA 1LSAA 3HFMY 5KXYA 3P65A 1YKXX 2BAAA 2IFFY 2BQGA 5JENB 4NG8A 4HV1A 4ETCA 2DKVA 1G7IC 1HNLA 1IP6A 1VAUA 2YBIA 3RW8A 4HJYA 4GN4A 4FDYA 3B0OA 4H90A 5KXOA 5F14A 4NHIA 4UWUA 5FDJA 3W6FA 1C46A 5LYMA 1LZRA 2BLYA 3AZ5A 2ZIKA 5A3EA 2BLXA 2ZNXY 1IP4A 4WMGA 4WO9A 4B1AA 1DPWA 3RNXA 1UIAA 4H93A 5DN4A 8LYZA 1GAYA 1LHJA 1PS5A 4NGKA 5APDA 5LVIA 1LMCA 2XJWA 1FKQA 3B0KA 3SP3A 133LA 4B4JA 4G9SA 1LJGA 1FN5A 3AJNA 1UIBA 1LSBA 1QUSA 4WM1A 5I4YA 1WQPA 1T3PA 2YVBA 3BKHA 5II3A 2ZIJA 3RT5X 3WXUA 1B7PA 1V7TA 5KXSA 2HEBA 5C6IA 1QTKA 1IR7A 5K7OA 1YROA 1OUAA 1LZ1A 208LA 3LYTA 1OUHA 1GBWA 1LZ8A 1T6VL 4GLAA 1GDXA 1KXWA 1BHZA 2Y8PA 5B05A 4BAPA 1BQLY 2MECA 1GE0A 2Z2FA 1KIQC 4H94A 1GDWA 2EIZC 5APFA 3W6DA 2DQHY 1IEEA 153LA 1LZGA 1XSFA 1YAPA 2LYZA 4G4CA 4KPMA 5I53A 5EBHA 4XADA 4W94A 1LHKA 1JWRA 1QSAA 4WM6A 5LAFA 4DT3A 1BGIA 3D9AC 1LJJA 4QEQA 5AMYA 1YANA 1B7RA 1GXV2 2D4KA 1UCOA 1RI8B 3LYMA 2YSSC 1GB6A 3EMSA 2DQDY 4H9HA 3WU9A 1KXXA 1QSWA 4RW1A 5B06A 2ZNWY 1NF5A 1XGPC 1JEFA 2FBBA 4ETBA 1N4FA 5KXXA 5LYZA 2FYCA 132LA 1IP7A 4RLMA 4OWCA 5HQ1A 1CJ9A 1LZBA 3W6EA 1VFBC 1GFHA 3AW7A 3RU5A 2A7DA 1FBIX 1LSZA 1I1ZA 1LZ9A 5F9XA 2F4AA 1H6MA 1UIHA 2WARA 1QQYA 3LZTA 2PC2A 1DKJA 2Q0MX 1HEPA 1LZAA 1GB2A 1HC0A 1DPXA 4H9BA 5LVKA 3B0IA 4X3BA 1IR9A 4NGVA 4J1AA 1D6QA 1LKSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L09A 1LWKA 4DD0A 4OWHA 2BQCA 1C43A 4HSFA 1L95A 2N5ZA 1L64A 3CB7A 2Z12A 1IOSA 2CGIA 5LIOA 2YBJA 1FLUA 3J4GA 2F32A 4LYOA 1LI3A 188LA 1G1VA 1LJIA 2QARC 1JJ1A 1OUDA 3A34A 3CT5A 4EKQA 157LA 1J1PY 1LHMA 3WYHA 1B7SA 177LA 3AZ6A 1L99A 1LZYA 4ARJA 1B7QA 1P64A 259LA 2CWIA 1UUZC 1G0QA 2LZTA 110LA 3BKVA 4TSCA 113LA 4OWBA 2ZQ3A 1L11A 4NSIA 1CUQA 3TMUA 3A91A 1L88A 1LYYA 5LVJA 1D0LA 4LFXA 1KNIA 1LTMA 2BQEA 5C6LA 261LA 3SB7A 1XJTA 1I6SA 1PQJA 216LA 1UIGA 1P2LA 5IELA 5ILFA 3WL2A 1I56A 1DQJC 1L32A 1C7PA 2H9KA 193LA 4LT2A 4ETAA 2ZYPA 2D4JA 1ZWNA 4NFVA 1C10A 1OV5A 3F9LA 3N9EA 1C61A 1L31A 1P46A 1G7MC 1QTVA 1L81A 2G4NA 1REZA 1WQNA 3B72A 5DLAA 102LA 1UIDA 1QUHA 1C6LA 1L58A 1W6ZA 1DZBX 3AGGG 4H9EA 1D6PA 1CKGA 2YBNA 2W1LA 3L2XA 164LA 1LPIA 1YQVY 3D3DA 2ZYCA 1L61A 2W1YA 3DMXA 255LA 258LA 2RBSA 1C6BA 4TWSA 1ZURA 3B6LA 3WU8A 2Q9EA 3MGWA 1L92A 4NEBA 1GF9A 1NHEA 2HU3A 248LA 3NY8A 4ET8A 1B5VA 1L17A 2RAZX 155LA 2W1XA 5I4XA 1LYJA 1IO5A 1L38A 2Z37A 1L40A 3G3VA 1C45A 1LMNA 182LA 3A94A 3G3WA 194LA 1LWGA 4LFPA 1L35A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2I25 L;  3TXK A;  3CSZ A;  1C08 C;  2HEE A;  1OP9 B;  1JIS A;  1SLY A;  5APC A;  1OUG A;  4OWH A;  4DD0 A;  2BQC A;  4CHX A;  4H9I A;  1GF7 A;  4H92 A;  1C43 A;  4GN3 A;  4HSF A;  1BB5 A;  1XGU C;  1JHL A;  4AGA A;  1GBX A;  2MEH A;  2N5Z A;  5A3Z A;  4ETE A;  5LXW A;  1FDL Y;  1WQR A;  3CB7 A;  2Z12 A;  2BQN A;  3CSR A;  3ULR A;  1IOS A;  2CGI A;  2YBM A;  1MLC E;  2EQL A;  5LIO A;  1GFJ A;  2YBJ A;  5HNC A;  4DD7 A;  1FLU A;  1ZVY B;  3J4G A;  4GCB A;  1LOZ A;  1BWI A;  5LVH A;  1YKZ X;  2A7F A;  2C8P A;  1NBZ C;  4L41 A;  1FLY A;  3IWR A;  1LYO A;  4LYO A;  1LSY A;  4GCE A;  1IOQ A;  3T36 A;  5B59 A;  5I54 A;  1TBY A;  3WXT A;  4AXT A;  1LJI A;  4HTN A;  1AM7 A;  4NWH A;  1IWU A;  1UIE A;  4HJZ A;  5APE A;  4WG1 A;  4N8Z A;  6LYZ A;  1XFP L;  1JJ1 A;  4NSH A;  1OQM A;  4TX7 A;  1IWZ A;  1OUD A;  2BQB A;  4HP0 A;  5L9J A;  5ILC A;  3A34 A;  1LSC A;  1TCY A;  3CT5 A;  4CJ2 A;  1LMQ A;  2XBS A;  4ANR A;  1LSN A;  4E3U A;  1J1P Y;  1LHM A;  3A92 A;  3N9C A;  1UAC Y;  3WYH A;  1GF8 A;  1GF6 A; 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 1FKQ A;  3B0K A;  3SP3 A;  133L A;  4B4J A;  4G9S A;  1LJG A;  1FN5 A;  3AJN A;  1UIB A;  1LSB A;  1QUS A;  4WM1 A;  5I4Y A;  1WQP A;  1T3P A;  2YVB A;  3BKH A;  5II3 A;  2ZIJ A;  3RT5 X;  3WXU A;  1B7P A;  1V7T A;  5KXS A;  2HEB A;  5C6I A;  1QTK A;  1IR7 A;  5K7O A;  1YRO A;  1OUA A;  1LZ1 A;  208L A;  3LYT A;  1OUH A;  1GBW A;  1LZ8 A;  1T6V L;  4GLA A;  1GDX A;  1KXW A;  1BHZ A;  2Y8P A;  5B05 A;  4BAP A;  1BQL Y;  2MEC A;  1GE0 A;  2Z2F A;  1KIQ C;  4H94 A;  1GDW A;  2EIZ C;  5APF A;  3W6D A;  2DQH Y;  1IEE A;  153L A;  1LZG A;  1XSF A;  1YAP A;  2LYZ A;  4G4C A;  4KPM A;  5I53 A;  5EBH A;  4XAD A;  4W94 A;  1LHK A;  1JWR A;  1QSA A;  4WM6 A;  5LAF A;  4DT3 A;  1BGI A;  3D9A C;  1LJJ A;  4QEQ A;  5AMY A;  1YAN A;  1B7R A;  1GXV 2;  2D4K A;  1UCO A;  1RI8 B;  3LYM A;  2YSS C;  1GB6 A;  3EMS A;  2DQD Y;  4H9H A;  3WU9 A;  1KXX A;  1QSW A;  4RW1 A;  5B06 A;  2ZNW Y;  1NF5 A;  1XGP C;  1JEF A;  2FBB A;  4ETB A;  1N4F A;  5KXX A;  5LYZ A;  2FYC A;  132L A;  1IP7 A;  4RLM A;  4OWC A;  5HQ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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