4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein/structural protein
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
2E20A 2A6AA 1GLLO 2P9UA 3SK3A 4GNIA 3VF4A 3LL3A 1EQYA 3R6MA 2QWPA 4JHDB 4PKIA 5B8HA 1NBWA 5AQRA 5BPMA 2YI1A 3WQUA 5AQZA 3GL1A 4CD3A 3A8YA 5LY3A 3QB0A 2QWOA 2D4WA 1HKGA 2IIRA 3JXUA 1GLFO 3F9MA 3ZX2A 3R8EA 2HMPA 2VWBA 2CGJA 3CJAA 4IWVA 5AQJA 3CJ1A 2YCHA 4L3QA 4MO4A 3FR0A 4CBXA 3HM8A 2HF3A 1D4XA 3TPQA 3D7EO 5AFUA 2GTDA 4ISFA 4B1UB 1X3NA 2P9PA 3BEXA 2QWNA 4A2BA 2FF3B 2P9KB 1GLBG 3LM9A 3EN9A 2P9NB 2Q31A 2FSKA 5ADXA 1HKCA 3CJ9A 4H5RA 2E1ZA 3VERA 3WXLA 2V7YA 2PBDA 2FXUA 3MN9A 3CQYA 5AFUH 4CZJA 3ENHA 3H45C 1IJJA 1U2VA 3ATVA 4BRNA 1XUPO 1NGAA 1RGIA 3CERA 4MLEA 3WXJA 4LC9B 4EHTA 4PL8A 1BUPA 4XH4A 2E2OA 3ZX3A 4BREA 2VYPA 2WUSA 5AQGA 1E4FT 4CZIA 1BDGA 2V7ZA 5AQVA 4EAHD 4H03B 2GUPA 4XEIA 1BWFO 3QBWA 3ULEA 4BRPA 2BTFA 2GEMA 2E88A 2Q36A 2H3GX 4RCHA 4RTFD 3FE1A 5AQUA 3QICA 1C0FA 2P9UB 1QZ6A 3RSEA 5LJWA 3VF6A 3BF3A 2V52B 4KBOA 3TU5A 1NMDA 3MN5A 4CZGA 3EL2A 4H0PA 4K42A 1YAGA 3EKSA 3R9PA 1QQMA 4CZMA 1TUUA 2GWKA 2YHXA 1NGBA 3CIPA 3WEEB 3U9DA 4CZKA 3EO3A 1SZ2A 2GWJA 3AAPA 2ASMA 3WXIA 3VPZA 4GY2B 4CZHA 3HSCA 2D0OA 5AQYA 3CI5A 3L4IA 5BRFA 1Z6RA 3O6WA 1V4SA 2NZTA 4BROA 3O1WA 4BRHA 2P9PB 3EZWA 2CGLA 5AQPA 2D1KA 2ITMA 1GLAG 4FPAA 2YJFA 4BR9A 1G99A 1NM1A 4DB3A 5BPLA 2IVOA 2QM1A 3H1VX 1JCEA 3ENOA 3LDLA 3GDQA 3LDPA 4NB4A 3SMSA 1U2VB 4M63C 3ZETB 1NGHA 2VCPA 3W0LA 3M1FA 5JLHA 1S22A 2A40A 5AQTA 3BP8A 4FWSA 4DQ8A 1QQNA 3FZMA 4QS8A 1LOTB 4FOEA 3GBTA 4PKGA 4BRQA 4BRKA 3FZFA 1J6ZA 3VOVA 3ULEB 3BF1A 3LM2A 2P9IA 3DJCA 2E2NA 1KAZA 3BUZB 4HTLA 1GLCG 1MWKA 1RDWX 1QHAA 3D2EB 4FL9A 1HUXA 1GLJO 1T6CA 2F9WA 2QW9A 5KPRA 3RSEB 1RFQA 2F9TA 3C7NA 3QDKA 4HWIA 4FWPA 3ZX0A 4BRGA 4BGBA 5KQ8A 3WEEA 3DXMB 4ISGA 4J8FA 2QXLA 2AA4A 2W40A 4QS9A 5CE3A 3LDNA 4FSVA 5AQKA 4H5WA 5AQSA 2A5XA 4BC2A 2NRHA 4XH5A 5F2RA 5BPNA 4RWTA 3H46O 1ATRA 2P9LB 4EFHA 3ATUA 4BR7A 4EIAA 4NO7A 3UKRA 4A61A 4CJ7A 4I6MA 1TYQA 3H3OB 4H5NA 3A5LC 3P4IA 1SAZA 3HBTA 4B1XB 1HPMA 3A5MC 3FZLA 2E2QA 5BRHA 3AY9A 4BR5A 3ZETA 2QWRA 5ADXH 3ID8A 1BO5O 5TKYA 3MK6A 3WT0A 3J8AA 3IUCA 4CZFA 4H0OA 1ATSA 3O1BA 4FWQA 5EY4A 5AQWA 4BR2A 5AQNA 5EXWA 1T44A 4FO0A 1LCUA 1NLVA 1NGIA 1HKBA 1NGFA 4BRCA 2NLXA 4H0XB 3I8BA 5BREA 3D2EA 3O80A 2P9IB 1BU6O 2Q0RA 4H0TB 1GLDG 1NGJA 2ZGYA 3VGLA 1GLEG 5BR9A 1BG3A 4BVOA 1WUAA 2EWSA 3H6EA 1K8KB 4FWKA 1JCFA 3C7NB 3ZEUB 4BVPA 3C0BA 3DXMA 1ZC6A 1C0GA 3KVGA 2CH6A 1BA0A 2PAVA 1MDUB 5AQFA 3VEWA 1ZXOA 3A0IX 2Q0UA 4MLHA 3DXKA 1JCGA 1BA1A 1Z05A 4H5TA 2P9LA 3O4WA 3VENA 4AM6A 1S3XA 3CQXA 1U6ZA 4E1JA 3MN7A 5FPDA 4CZLA 2IVNA 1P8ZA 1ESVA 1XC3A 3VGKA 3UKRB 4I6MB 3A5NC 1TYQB 5AZIA 1HJOA 5FPEA 1HX1A 4B1ZA 2QWMA 2YHYA 1YVNA 2FF6A 4BGAA 1QQOA 1DKGD 4BR4A 1XQSC 4K25A 4BQLA 1E4GT 1T6DA 2OANA 4BRAA 4WQ5A 2D0PA 4M7YA 4QS7A 4C23A 2YJEA 4CBUA 4XH1A 3HZ6A 1NGGA 4WYBA 3FFKB 4B1WB 2ASPA 4BR0A 1H1VA 2E2PA 5AR0A 4Z94A 4WQ5C 4K41A 1ATNA 3FGUA 1KAXA 4JN4A 2HOEA 4YDUA 2E1YA 5AQXA 4AM7A 3O5BA 3MN6A 1DGKN 1K8KA 3IMXA 5AQQA 1SQKA 3DWLA 3ZEUA 1NGCA 4YDUC 3I33A 4IXCA 2I7PA 2GELA 2ZF5O 4DCHA 2IVPA 1YUWA 4H5VA 5I9EB 4CZEA 4K43A 3WUHA 1TUYA 5EX5A 2ZWHA 3FLCO 1X9JA 4JD2A 4H0YB 4BC3A 3G25A 5AQHA 4O5FA 3VEYA 1BOTO 3QFPA 4WQ4A 3DXKB 3O08A 1KXPA 1WOQA 5AQIA 3FZHA 2FSNA 4A2AA 5AQMA 3M6GA 4BG8A 3H1QA 3M3ZA 4IJAA 3QFUA 4WQ4C 3O8MA 3WXKA 2UYTA 3CJCA 3H3NO 5AZIB 3MCPA 4CD1A 2E8AA 3IFRA 3S41A 2ASOA 2CGKA 4BRFA 2Q97A 3AARA 4CI6A 4B9QA 5KPZA 1X3MA 4O8KA 4FWMA 4Y0WA 2KHOA 5BN8A 3UKUB 4ISEA 5JLFA 2ZGZA 4B1VA 2QWLA 3HTVA 4IO8A 3W3DA 3VEVA 3VF2A 5LJVA 2A41A 2A42A 5ELZA 3QMLA 3D2FB 5AQOA 5E26A 5F1XA 3KZBA 1MWMA 4BG9A 1QZ5A 3LDOA 3VEZA 5JMVA 4BRIA 5KQDA 3VEOA 5JICA 1CZAN 1Q18A 1HLUA 1OKJA 1NWKA 1DEJA 3DAWA 3L6QA 3VEXA 2P9SA 3OHRA 2CH5A 2V51B 3KHYA 4JAXA 5AZJB 5BN9A 1KAYA 4FWNA 3CHWA 3QBXA 3IDHA 2J4RA 4JD2B 1Y64A 4JHDA 5AQLA 3UB5A 4BRLA 4IZ9A 3CETA 2W41A 4JNEA 3SJHA 5FPNA 4PKHA 3SMPA 2BUPA 1NGDA 3JS6A 2DPNA 1IG8A 4BC5A 4FWOA 4EHUA 3GOIA 3GE1A 3EKUA 4F9OA 4M7XA 4FWRA 3HI0A 1R59O 2A3ZA 3U9ZA 3VESA 2QWQA 4BQZA 3U4LA 4H0VB 1V4TA 4B1YB 3UKUA 3VETA 2FLOA 2P9KA 3MDQA 4BC4A 2P9NA 3MMVA 5BRDA 4BRDA 4CBWA 2Q1NA 3A5OC 4DHYA 2YHWA 1MA9B 4FOIA 3GG4A 3WQTA 1YXQA 3U8XA 3D2FA 5E84A 5F0XA 2FSJA 2I7NA 4FPBA 1NGEA 3CJBA 2Q2RA 3L0QA 4IJNA 2HF4A 4MO5A 5EOYA 4PL7A 4BRMA 3CJ7A 2AP1A 3SLCA 1ZBSA 3AAQA 3B8AX 4FWLA 5EVZA 3FZKA 3UE5A 5KPTA 3LDQA 5AZJA 4A62A 3VGMA 5FPMA 2P9SB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OA9A 3ZSYA 1HYVA 3KWGA 3SUPA 2P9UA 3THXB 3R6MA 3JAMO 3J7ZO 4DR7K 1W0HA 4IG0A 5B8HA 1NBWA 3MX2A 5DMRA 4FLZA 1HQEA 2VG7A 4AHCA 1XMOK 3A8YA 3HL8A 5LY3A 5TKWA 1G15A 1U47A 3VMFB 4N5SA 3R8EA 1NK4A 1A5VA 2HMPA 2VWBA 3OW2M 1WBDA 4AILC 1OVYA 4DWIA 3B6OA 2BANA 4MO4A 3FR0A 3HM8A 3T1AA 4JI7K 4J2EA 3ZT3A 4F3TA 1X3NA 3CFOA 1RDAA 3BEXA 2NRXA 4FYDA 3ZT1A 1NK5A 3EN9A 2P9NB 2FSKA 4FXDA 4H5RA 2E1ZA 2F4VK 2V7YA 4CGHA 4XJXA 4CZJA 3E9OA 4DFPA 1UA1A 1DT9A 3H45C 1IJJA 1U2VA 3BZKA 2G8KA 3ATVA 4Z4CA 1BUPA 3ZX3A 2IDOA 3L2VA 3RMDA 1KLMA 4HVJA 2WUSA 3T1HK 1KC8O 1QVFM 2V7ZA 3HP9A 4LD0A 2G8VA 4H03B 4E19A 3TR8A 1RBUA 4CJRA 4M3YA 2O8EA 3ULEA 3AVKA 4JKCA 4IO9L 3TWHA 1EWQA 2BTFA 2GEMA 3B6PA 1W97L 4DR4K 3ALYA 5C24A 4Y1CA 3TAMA 4AF1A 3HOSA 2P9UB 4CHNA 3I0RA 5LJWA 3N4QA 4CERA 2RHKA 4KBOA 1NMDA 5GADP 4H0PA 4DTJA 2YHXA 2B5JA 3CIPA 3WEEB 4CJ5A 3PO5A 3R3LA 4CZKA 3EO3A 2HB5A 1VQON 4J2DA 3WXIA 4C8OA 3VPZA 2QTDA 3WNFA 2D0OA 4M41A 5CHIA 3CI5A 1N6QA 2YHAA 3RRGA 4BRHA 5AQPA 4CJLA 5LMNK 1GLAG 3K5NA 1D8YA 4BR9A 1B9FA 1G99A 3H1VX 2QKKA 3KLHA 5HP1A 1U2VB 4I7FA 4M63C 3VQ4A 3CD6N 3KWIA 3M1FA 5JLHA 2A40A 3BP8A 2XY7A 1JLBA 4QS8A 1JLAA 3OYHA 4B9NA 4IEEA 3CCUN 4BRQA 3EE9A 1L3UA 3L8BA 2O8EB 4C8NA 3ULEB 3OY9A 2P9IA 1ASVA 1S5JA 2RF2A 2W6KA 1QHAA 1NJXA 1GLJO 4DTMA 1NK9A 1RFQA 3SAFA 3QDKA 4FWPA 1YTAA 4BRGA 5J2PA 1HRHA 3DXMB 3VA3A 2W40A 4QS9A 2O8BA 1LAVA 3NF8A 4OKJA 1X9SA 4CFCA 5AQKA 3P31A 5AQSA 3PSFA 4E0DA 2NRHA 4AHTA 4IOCL 3H46O 1ATRA 4I2PA 1TV6A 1S6PA 5SZTA 1EXQA 1TYQA 1I39A 3K9JA 4CE9A 1VQPN 1SAZA 4H4MA 3LANA 5BR8K 1RT4A 3FZLA 1VQLN 4PY5A 2E2QA 1IBKK 5BRHA 2QEXN 1L3TA 3ZETA 3T3FA 1FKOA 4LSLA 5ADXH 5H1SQ 3ID8A 4M3RA 1QSYA 4O0JA 5MLCQ 5TKYA 3VQPA 4JI2K 3J8AA 4LF7K 3O1BA 4FWQA 4CHPA 4DF8A 4B3TK 4QOZB 1R0AA 1WSJA 4FO0A 4OPHA 4B3SK 1NGFA 4H0XB 3D2EA 3K0SA 2P9IB 2Q0RA 1IKWA 4X62K 2ZGYA 5D3GA 4BVOA 1OH8A 3CMAN 3D45A 1K8KB 2IS3A 3C0BA 1WNSA 3BY5A 4CJTA 4M3ZA 3ZSXA 2CH6A 1BA0A 1XNQK 3SYZA 4DV0K 4BE1A 2FBTA 4JK9A 2O8BB 3VEWA 4BE2A 1BA1A 4A5AA 3AVCA 3VENA 5T7BA 1WAJA 5I3UA 3MN7A 4JKHA 3VQ5A 4W5TA 2Y1IA 1ESVA 1XC3A 3LPUA 3ZT2A 1TYQB 4YOUA 3I56N 2OCEA 2E6LA 4FK0A 2ATQA 2QI2A 1YVNA 4BDZA 1DKGD 4PUOA 2A1SA 1E4GT 1T6DA 2OANA 4BRAA 4CJPA 3DLEA 4FLTA 4XH1A 4WYBA 3O9TA 4B1WB 3QERA 3PX0A 1KAXA 2LSNA 5AQXA 2ETJA 1HNZK 3O5BA 4C8KA 2KQ2A 3LPTA 4W5RA 1SQKA 3AV9A 3DWLA 4DSJA 4KTQA 4IXCA 4FZXC 2ZF5O 4DCHA 3OYGA 1YUWA 4K43A 4FJ5A 3TANA 3HPHA 1W2BM 4JD2A 3NFAA 3KJVA 5AQHA 4O5FA 1IBLK 4JRQA 3QFPA 4WQ4A 1CZ9A 1KXPA 3FZHA 3AVNA 4A2AA 1FXXA 4B9SA 3ENBA 3AO2A 3M6GA 4BG8A 1EP4A 4IJAA 4YOTA 4CEEA 1IH7A 1VQ4N 2YNHA 2E8AA 3LZJA 3S41A 4CK3A 2ASOA 4BRFA 2ZJQL 3AVGA 1HR0K 2Q97A 5KPZA 4TSXA 3SQ1A 2DFHA 5LMUK 3UKUB 3O3HA 3HTVA 4JK8A 4IO8A 5KRSA 3W3DA 1KTQA 1CXQA 2A41A 3SQ0A 5E26A 2PYLA 3VQQA 2NNWA 5KRTA 1YJNN 4EZ9A 4BG9A 3VEZA 4JI8K 4CJSA 3E9PA 2JGUA 4BRIA 3F9KA 1CZAN 4NXMK 4KHSA 5J2MA 3QINA 1DEJA 4CFBA 4KRFA 3TTCA 3OHRA 4JAXA 3G10A 3RR7A 4M3WA 1GOAA 1HPZA 4A57A 4DFKA 2ZJPL 3CHWA 2RKIA 2OPQA 3IDHA 3M5RA 4JD2B 3WNHA 3J80O 3UB5A 3QEVA 3PLAA 4IZ9A 1VSEA 2WONA 1BCOA 4CGGA 3OJUA 3SJHA 5FPNA 1Q82O 2KW4A 4PKHA 3SMPA 1RT2A 5M1FA 3JS6A 4KTWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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