4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/structural protein
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
1K8KA 2FLOA 1TUUA 4M7XA 1YVNA 3M1FA 3UKUA 4BREA 5F2RA 3VGMA 4B1WB 4BROA 3I8BA 3MN5A 2GELA 1DEJA 3RSEA 3ID8A 4BRPA 4BR4A 2BTFA 4BQZA 5KQDA 4WQ4A 4CZHA 5JLFA 1NGDA 3GE1A 2H3GX 4IWVA 2QWOA 3O80A 3EL2A 1Z6RA 3AAPA 1XUPO 2F9WA 4IZ9A 4K43A 3EZWA 2CGJA 4XH5A 3VEYA 2PBDA 1NBWA 1GLEG 3FLCO 3QBWA 4H0PA 3BEXA 1JCFA 1T6CA 3BP8A 2V7ZA 3DXMA 3R8EA 1RFQA 3VEOA 3WXLA 2E2PA 4BRAA 2E8AA 3LL3A 1NGAA 4H0YB 5AQPA 4BRFA 4B1VA 1RDWX 4FWMA 5AQMA 2FSNA 1NM1A 2P9PB 4H0TB 1ATSA 3VESA 4BR7A 1S3XA 4QS7A 4H5WA 4NB4A 4MLEA 5AQWA 3TU5A 4CBUA 3J8AA 3KZBA 4BR0A 5KPTA 3ENOA 5EY4A 1GLBG 2HMPA 4O8KA 2P9IA 4EIAA 5FPEA 2QWQA 5AQSA 2E2NA 1GLCG 4FPBA 4K25A 3WQTA 2Q1NA 3HI0A 3U8XA 2D0OA 4CZGA 4ISFA 2D1KA 3MMVA 4JD2B 5AZIB 3QFPA 3BF3A 2FXUA 1GLLO 1Y64A 3QB0A 3W3DA 3MK6A 3O4WA 1XC3A 3DJCA 1NGIA 2E1YA 1D4XA 5AZJB 4C23A 1G99A 2FF6A 3L0QA 4MLHA 4JHDB 4M7YA 3B8AX 5EOYA 3U9DA 2D4WA 4MO4A 1NGHA 4CJ7A 3M3ZA 2Q97A 2WUSA 3O08A 2ASMA 3WXIA 2NRHA 5AQKA 4BRCA 1ZXOA 4A2AA 4HTLA 2GEMA 4O5FA 4YDUA 5AQFA 4FWSA 3DWLA 3UKRA 3HZ6A 3D2FB 3H3NO 1QQOA 3O1BA 5F0XA 4HWIA 2A42A 3QBXA 1P8ZA 1ZBSA 5BPNA 4K42A 1HJOA 5BN8A 3GOIA 1YAGA 4FOIA 5F1XA 4H0OA 4BGBA 1EQYA 1NGGA 3FFKB 3IUCA 4BR9A 5LY3A 4B1YB 3DXKA 3WT0A 1NMDA 5AQYA 3A0IX 4BRIA 2EWSA 4GY2B 3U9ZA 1WUAA 3CERA 2P9KA 4DHYA 1DKGD 5AQLA 4RCHA 3IMXA 3LDNA 3QDKA 1BA1A 2ZF5O 1HKCA 3LDLA 3ENHA 3QICA 1C0GA 3HBTA 3ULEB 2ASPA 2IIRA 2AA4A 5BRDA 1E4FT 1HX1A 1V4SA 2A41A 5LJWA 2YHWA 3FZHA 1BO5O 3FZMA 1NGJA 4BG9A 5BPLA 4CD3A 5JLHA 3A5MC 4QS8A 4XH1A 4EAHD 4CD1A 3L4IA 3DAWA 4FL9A 3D2EA 4PKHA 5JICA 2Q0RA 1DGKN 5E26A 2VYPA 4WQ5C 2YJEA 4CZEA 1KAYA 2I7PA 2NLXA 3I33A 5AQVA 3FE1A 1BU6O 3MCPA 4CBXA 4BRLA 4BC3A 2CGKA 2FSJA 3JS6A 3WEEA 4H5TA 1MA9B 1BOTO 4MO5A 3WXJA 1WOQA 2P9UB 1MWKA 1QQMA 5AFUH 2HF4A 1K8KB 3UKUB 1OKJA 1HLUA 1IJJA 1R59O 4DQ8A 5AQQA 2W41A 3RSEB 3L6QA 1U6ZA 3LM9A 4B1ZA 4E1JA 2OANA 3CJAA 3FZLA 2P9LA 4FPAA 2E2OA 1ATRA 3VF6A 1BUPA 2ITMA 4AM6A 2P9SA 3EN9A 5EXWA 4ISGA 2Q2RA 1SZ2A 4PL8A 5AQUA 2GTDA 3P4IA 5FPMA 3DXMB 4BC4A 1NGEA 3GDQA 4IXCA 5FPDA 1U2VA 5KPZA 5ADXH 3VGKA 4DCHA 3FZKA 4FOEA 3CHWA 2QWLA 2A5XA 2NZTA 3GG4A 4H5RA 4BRQA 3CJ1A 5JMVA 3ZX0A 3SJHA 4PKIA 1JCGA 4AM7A 3VEVA 4I6MA 1GLAG 1QZ6A 2V51B 2P9IB 5AQOA 4GNIA 3BUZB 5KPRA 4FO0A 4B1UB 4BG8A 4BRDA 5BR9A 5AQGA 4BRNA 3ATVA 1RGIA 3O6WA 4FWRA 3CJCA 3JXUA 5AR0A 4Y0WA 4IJAA 4RTFD 5BREA 2UYTA 3CETA 4BR5A 4LC9B 2V52B 2ZGZA 3ZX3A 2Q31A 4KBOA 1HKBA 1IG8A 3EKSA 4H5NA 3AAQA 2ZWHA 3VERA 3F9MA 1ATNA 2J4RA 4PKGA 5BN9A 3G25A 4FWNA 5AQRA 2F9TA 4B9QA 3O8MA 1QZ5A 3R6MA 4CZIA 2VCPA 4ISEA 3H1VX 2CGLA 4EHUA 1TYQA 3CQXA 2IVOA 4IO8A 4BRHA 2E2QA 3A5LC 2E1ZA 3EKUA 3UKRB 2HF3A 4FWQA 3ZETA 4B1XB 5EX5A 1HUXA 2P9NA 4H03B 4H0VB 1Z05A 1MDUB 5AQXA 1X3NA 1XQSC 2I7NA 5ADXA 3A5NC 3KHYA 3EO3A 3FGUA 1V4TA 1LCUA 3UB5A 2YHYA 3SMSA 3LM2A 2QWRA 5LJVA 3DXKB 3VEZA 3A8YA 5AQHA 1KAXA 2ASOA 3H6EA 3CIPA 2P9KB 1X9JA 1MWMA 3MN7A 3QMLA 1KXPA 4WQ5A 2V7YA 2A3ZA 3VF4A 3SK3A 3ZETB 1TUYA 4BQLA 3MN9A 3R9PA 3FZFA 2BUPA 3ZEUA 1BDGA 2QWPA 3AY9A 3WQUA 4A62A 2PAVA 5ELZA 1GLDG 1BA0A 5AQIA 2Q0UA 4Z94A 2KHOA 5AQJA 4CBWA 4XEIA 2P9PA 3GL1A 1E4GT 3CJBA 4BRGA 1HPMA 1NWKA 3CJ9A 3SMPA 3VEXA 3D2EB 3QFUA 2QXLA 3LDQA 4H0XB 4WQ4C 5CE3A 3WXKA 3O1WA 1ESVA 2AP1A 1SAZA 1YUWA 4K41A 3HTVA 3BF1A 3OHRA 2E20A 4JD2A 5FPNA 5AZIA 3SLCA 4L3QA 3WEEB 1QHAA 2IVNA 3HM8A 3UE5A 2A40A 4EFHA 3IDHA 4BRMA 5BRHA 1C0FA 4WYBA 4EHTA 3ZX2A 2CH5A 2GWKA 2A6AA 5AZJA 3FR0A 4JHDA 1YXQA 3AARA 4JAXA 2IVPA 3IFRA 3LDOA 4IJNA 3GBTA 3M6GA 4BVOA 5KQ8A 1H1VA 1BG3A 5TKYA 1T44A 2P9LB 5AQZA 2CH6A 2YJFA 3VPZA 1NLVA 4CZJA 3VOVA 2P9SB 4BRKA 4JNEA 1LOTB 4FWOA 3D2FA 1BWFO 1GLFO 4F9OA 4FWKA 4CZLA 3CQYA 1U2VB 1S22A 5EVZA 3CJ7A 3VENA 4BC2A 4CI6A 3O5BA 2YCHA 3MDQA 1HKGA 2E88A 5AFUA 5BRFA 4FSVA 4CZFA 3HSCA 4A61A 3D7EO 1ZC6A 2W40A 4I6MB 2FSKA 2FF3B 5BPMA 3U4LA 5AQTA 5AQNA 3A5OC 5E84A 3VEWA 4PL7A 2GWJA 3ZEUB 3ATUA 1GLJO 4YDUC 4NO7A 1X3MA 2QWNA 3H46O 3H45C 3ULEA 4BR2A 1SQKA 2HOEA 2GUPA 3VGLA 3VF2A 4FWLA 1QQNA 2D0PA 4JN4A 2YI1A 4CZMA 1T6DA 4BVPA 3C7NA 1Q18A 4FWPA 3TPQA 4RWTA 1NGBA 2QW9A 3KVGA 3S41A 4H5VA 4QS9A 1CZAN 2Q36A 4BGAA 5B8HA 2ZGYA 4J8FA 1NGCA 2DPNA 2YHXA 3H1QA 1TYQB 2VWBA 3C0BA 3WUHA 4XH4A 4CZKA 1KAZA 2P9NB 2QWMA 3H3OB 3LDPA 4M63C 1NGFA 4A2BA 3W0LA 4BC5A 3C7NB 3VETA 2P9UA 2QM1A 5I9EB 3CI5A 3MN6A 4DB3A 1JCEA 1J6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F8RA 2QTDA 1SL1A 4BREA 3DMJA 3ZSQA 4BROA 3I8BA 3MN5A 2GELA 5GIOA 2HVIA 3OYMA 4BRPA 1KVCA 4E7IA 5KQDA 5JLFA 2NRZA 4IWVA 2QWOA 4E19A 1Z6RA 4DU3A 4OVLA 4ILHA 4K43A 3EZWA 3ZEUB 3AA4A 3NGZA 3QBWA 3BEXA 3VEOA 4Z0UA 3R8EA 2V7ZA 1NK6A 2IGIA 4BRAA 4KI6A 1BCOA 4GKKK 3LP0A 4N56A 2KW4A 3J7AP 3PIOL 4B1VA 4OLAA 3DLBA 5AQMA 1ATSA 3VESA 5JENA 3V4IA 4JKDA 1KD1O 4H5WA 4OPAA 3J8AA 3WXMB 3K5MA 4BR0A 3F73A 3OW2M 5EY4A 4EIAA 1Q7YO 2E2NA 4KTQA 1RNHA 3THXA 1B9FA 4CK1A 3C6AA 1VQMN 1RCHA 3RWUA 4Z4HA 5I3UA 1Y64A 3W3DA 1VQ4N 2X78A 2E1YA 1D4XA 5AZJB 4IEIA 1S1VA 4IFVA 3L0QA 4CFAA 4A5BA 1KCFA 1NJYA 1HQUA 2G8VA 3K9JA 1U4BA 2BDPA 4HUFA 4WF9L 5FROA 3SNNA 3THVA 2WFBA 2NRHA 4BRCA 1ZXOA 1N32K 3V81A 1W0HA 5CY4A 1KFDA 2GEMA 4FJHA 1TK0A 3KJVA 4YDUA 1ZBLA 1WSEA 3OYGA 3I0SA 3DWLA 1I39A 3HZ6A 4ID1A 3KLFA 1RBUA 1QQOA 3VQ6A 5F0XA 4PA1A 5BPNA 4DTUA 3LWMA 3GOIA 1YAGA 5IWAK 4CVNE 1ZBHA 1L3SA 1NGGA 3FFKB 3IUCA 3PIPL 5HBMA 1KVBA 1U48A 1KFSA 5AQYA 1TL3A 3VTHA 2EWSA 4CIGA 1D9DA 1WUAA 3DLLL 1TAUA 1HNZK 3O9QA 3IMXA 3QDKA 2ZF5O 3ENHA 4PUOA 4OGCA 4JEPA 1KLMA 1S9EA 2IIRA 4N76A 3NF6A 4X66K 4HCCA 2G8KA 1HX1A 4LF6K 2XY7A 4A57A 3K2PA 1EKEA 3FZMA 4EZ9A 1XNQK 2WBNA 4KHWA 4CHOA 1JL2A 4J2EA 3CF5L 2F8SA 1BIUA 3V9XA 1SUQA 3THWB 4N5SA 5JICA 2Q0RA 2DY4A 3VQPA 1VSJA 3S3OA 4DQSA 3V1QA 1KAYA 4I7FA 2I7PA 3MCPA 4CBXA 3RR7A 2FSJA 1QSLA 3ISNC 2YV0X 1WOQA 1MWKA 1J53A 4H4MA 1K8KB 3HP6A 3JSMA 1OKJA 1HLUA 1R59O 4KH6A 2W41A 1X1PA 4OLBA 3LM9A 2GX9A 4B1ZA 4JI8K 2KZMA 2HBLA 2E2OA 2YNIA 1EETA 4C8LA 3QESA 1YTUA 2XY8A 3AVCA 5EXWA 4FLYA 4FJIA 5C2FA 2HVHA 4W5OA 1NGEA 1RDDA 3K5OA 4DCHA 4RW4A 3WNEA 4DTMA 3KD5E 2NZTA 4BRQA 4CJKA 3VQAA 4CGHA 1Z26A 3E01A 5M1PA 4I6MA 1QZ6A 2R7YA 4A59A 2P9IB 3PX0A 1DTTA 3O3HA 4FO0A 4BG8A 2HNYA 3D45A 5AQGA 4BRNA 4CJWA 4FWRA 4LF8K 2KQ2A 3JXUA 3HJFA 4LSLA 3AVNA 3BZKA 4Y0WA 4IJAA 4FJ8A 1LAWA 5BREA 3NH2A 1VK0A 4K0KK 3CETA 4IFEA 3MEDA 3DYAA 4BR5A 4DFPA 4LC9B 3E9PA 3TAEA 2X6SA 1GOBA 3SPZA 1OH7A 5GAHP 4IOXA 1L3TA 5EU7A 2ZGZA 3ZX3A 2FBXA 4KBOA 1HKBA 3EKSA 1T7PA 3SYZA 1RBSA 3TSUA 1ATNA 2J4RA 2F8TA 3LAKA 4FWNA 4WCEL 4B9QA 1ASWA 4DS5A 4B9TA 2YKNA 4FLVA 3CCQN 2VCPA 4ISEA 2B4JA 3CCEN 4FZZA 1ITGA 4EHUA 2DFFA 4IOAL 3ITHA 4IO8A 4CJQA 3S3NA 3NVKA 4FWQA 3NF9A 4IBNA 4B3TK 2P9NA 3PV8A 1XNRK 1MDUB 1X3NA 1XQSC 3A5NC 3VA0A 2YNHA 1U47A 3AV9A 1UAXA 1Q8IA 3UB5A 2QWRA 3DXKB 4JKEA 3VEZA 3J7YP 4J2DA 2ASOA 3OYKA 3CIPA 2QI2A 4CJSA 2A3ZA 4KHSA 4JKFA 4B9VA 3ZETB 4BQLA 4FLXA 1J5EK 3LZJA 2YHBA 4KH4A 3R9PA 3OYFA 3L2UA 3FZFA 4OKEA 2IOCA 2XHBA 3AY9A 1S6QA 5M1QA 4A62A 3M8SA 5ELZA 2O8FB 3KKRA 4DLGA 2XY5A 1BA0A 1JJ2M 2KHOA 4CBWA 2O8DB 4DUYK 2KZZA 1YF5L 2HB5A 1VQ8N 4OO1J 5A2QO 3MECA 3SMPA 4B9NA 4YOXA 1VQON 3LP2A 3O9UA 3TAFA 3Q7CA 4Z4IA 1CZBA 5GADP 3OYBA 4WQ4C 1S1WA 1RDCA 1BGXT 2F7TA 1NMNA 4K41A 4Y1DA 2P5OA 3E9LA 4DSLA 2VGMA 3WEEB 4L3QA 4ILJA 3UE5A 2QEXN 3L3UA 4KV8A 3WNFA 3U3YA 3IDHA 1C0FA 4WYBA 4IFYA 4DV7K 2VGNA 1WB9A 4KHUA 2OPQA 4JHDA 1YXQA 3AARA 3TR8A 1WSHA 3IFRA 4LF9K 3M6GA 3WNHA 4KTWA 3PY8A 4FLWA 4W5QA 4CGDA 2GV9A 5AQZA 4AH9A 4DMNA 4Z4GA 3ZYYX 4NCBA 4BRKA 4JNEA 1LOTB 4OPKA 3D2FA 3AVLA 4CZLA 5EVZA 4HUEA 4CI6A 4ICLA 4QCLA 1HMVA 1LWEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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