4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/structural protein
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
4YDUC 4FL9A 3GDQA 1SZ2A 2ZGZA 3GG4A 3A5LC 4JD2A 3MN7A 2CGLA 4IXCA 1RDWX 2P9LA 4AM7A 4FSVA 5AQJA 4H5RA 1QQNA 1QZ6A 2YHYA 2FSNA 2Q36A 3R9PA 4C23A 3A5OC 5EXWA 3BF1A 2QM1A 5LJWA 5AQUA 3RSEB 4A62A 1T44A 1GLEG 4BR9A 4H0PA 4ISFA 2IVOA 4BRGA 3MCPA 1GLJO 3VOVA 3AY9A 4CZHA 3ZETA 1U2VA 2HMPA 4H0VB 3UKRA 3VETA 4BRNA 4BRCA 4K41A 3GE1A 1YAGA 3MN5A 3H1VX 5AQNA 3IDHA 3SMSA 1T6CA 2A3ZA 4BQLA 2W40A 2GWKA 1SAZA 4BC4A 1GLDG 5AQMA 3D2EB 3DXKA 1T6DA 2P9UA 2W41A 5FPMA 1NGDA 3CQXA 4MO5A 2E2NA 3QDKA 2QXLA 3CIPA 4B1YB 4I6MA 3BEXA 5LY3A 3C7NB 1WOQA 3CI5A 1XUPO 4JN4A 2E88A 1JCGA 3C0BA 1RFQA 3OHRA 5AQXA 4FWOA 3MN9A 3ZEUA 2QWQA 4B1XB 1CZAN 4DQ8A 5AZJB 3CJ9A 3CQYA 4QS8A 4IO8A 5EX5A 1MDUB 2ZGYA 2CH5A 3H46O 4CBUA 5JLFA 2P9PB 1DEJA 2Q97A 4L3QA 3U4LA 3O4WA 3AAQA 2ZF5O 3BUZB 2FSKA 1KAYA 5AZIA 1KAZA 3H3OB 3VENA 4BRIA 1NGAA 2D1KA 2E8AA 1MA9B 3O1BA 3UE5A 1MWMA 5AQQA 4BGAA 1KXPA 2AA4A 4CZGA 1ESVA 3DJCA 4BGBA 3D2FB 3FFKB 1NM1A 4ISEA 3U8XA 3IMXA 1KAXA 4RTFD 5AFUH 3LDPA 3O80A 1E4GT 3BP8A 3O1WA 4JHDA 5BN9A 3FZKA 3MDQA 3CHWA 4FWPA 5AQOA 3VEYA 4XH4A 1BWFO 3ULEA 3A5MC 3JS6A 5CE3A 4BRDA 3HSCA 4CZMA 3KHYA 5AQVA 4BRHA 1QQMA 3FZHA 3LDLA 3GBTA 2E1ZA 1HKGA 3SLCA 3VEZA 3WXKA 4EFHA 4PL7A 2QWMA 5ADXH 3CETA 4H0OA 1SQKA 4BR5A 2P9KA 4MLEA 4IJAA 1BA1A 5KPTA 3VGMA 4B1WB 2P9SB 5AQZA 1LCUA 4J8FA 4M63C 3WXIA 3P4IA 2E2OA 4CZJA 1X3MA 2A40A 4QS7A 1K8KB 2BUPA 5F2RA 3DXMB 2P9NB 3ZX0A 1S22A 2YI1A 3CERA 2QWOA 4O5FA 4BVPA 1Z05A 4H0TB 4BR0A 5BRHA 3LL3A 4BC5A 5BREA 3M1FA 3O6WA 3QMLA 5E84A 1NGBA 2OANA 4BQZA 4FWNA 1MWKA 2UYTA 4BC2A 2EWSA 5AQTA 3H6EA 3WXLA 3VEWA 4XH1A 4EIAA 1U6ZA 4BR4A 4GY2B 3A5NC 3VEXA 3GL1A 5B8HA 4JD2B 1ATRA 4GNIA 1JCEA 3QB0A 4CI6A 3M6GA 1P8ZA 3LDQA 4BVOA 1GLBG 3WT0A 1TYQB 3H1QA 3L4IA 1GLLO 3FZMA 3VF4A 2V7YA 2ITMA 4DB3A 4QS9A 5BPMA 4Z94A 1NGGA 2P9IB 2FLOA 3C7NA 4JAXA 3LDNA 4BRKA 2VWBA 1NLVA 3VF2A 4FWQA 1X9JA 5AQWA 4M7XA 4BREA 3VGLA 2A6AA 3BF3A 3UKRB 4CJ7A 3VF6A 2GWJA 4IJNA 1NMDA 3I33A 3AAPA 1NGFA 4XH5A 3AARA 1X3NA 1NGHA 4K42A 3DXKB 4BR2A 5JICA 3R8EA 2WUSA 4O8KA 4CZLA 4PKHA 2NZTA 3O08A 5JLHA 5LJVA 3L0QA 4DCHA 4I6MB 1D4XA 1DGKN 1NGIA 2Q1NA 4FWMA 3D2FA 3QBXA 3VEOA 3HTVA 4E1JA 3ZEUB 1HPMA 2V51B 1NGJA 1NGCA 4BRQA 3FZFA 4K43A 5KQDA 3VGKA 3CJ7A 4H5TA 5E26A 3VESA 3I8BA 3ATUA 5BRFA 2PAVA 2H3GX 3VEVA 3LDOA 5AQIA 4CZEA 5FPEA 5AZIB 3U9DA 1HJOA 3UKUA 3ZX2A 1NBWA 2FXUA 2Q2RA 2Q0UA 3CJCA 2IVPA 3GOIA 3FE1A 4AM6A 3B8AX 4B1UB 3O8MA 1GLAG 3W3DA 4A2BA 1IG8A 3WEEA 2A5XA 1NWKA 4CZKA 3FZLA 2NRHA 4FOIA 4IZ9A 2NLXA 1YUWA 2I7NA 2IIRA 2FF3B 4NO7A 3SJHA 4FWKA 4WQ4A 2I7PA 3G25A 4JHDB 3VERA 2DPNA 3ULEB 4H5NA 3WXJA 2F9TA 1BUPA 4F9OA 4PKGA 4HWIA 1BU6O 3ID8A 2IVNA 2V7ZA 1OKJA 1RGIA 5AQPA 1WUAA 3IUCA 3W0LA 5FPNA 4BC3A 3HI0A 3IFRA 4BROA 4FWRA 3KZBA 2FSJA 1ATNA 1BOTO 1S3XA 5TKYA 1BG3A 3RSEA 5BRDA 3MK6A 2E20A 3HZ6A 2ASOA 4B1ZA 2P9KB 1V4TA 2QW9A 4PKIA 3ENOA 4WQ4C 1JCFA 3JXUA 4NB4A 4DHYA 2QWPA 5AFUA 2ASPA 5AQHA 2QWNA 4A61A 4H0YB 3U9ZA 1QZ5A 3S41A 1QHAA 3O5BA 3CJ1A 1TYQA 2QWLA 4CD3A 4MO4A 3H3NO 2P9LB 3ENHA 3D2EA 4BG9A 4CZIA 5BR9A 2P9IA 4RWTA 3DAWA 5AQKA 3UB5A 3ATVA 1EQYA 4LC9B 2D4WA 2YJEA 1ZXOA 2Q31A 2HF3A 1Z6RA 1YXQA 3F9MA 5ADXA 4BRMA 4A2AA 3KVGA 1Q18A 2BTFA 3FGUA 4CZFA 1BDGA 5AQRA 4XEIA 3WUHA 5AQGA 4FWLA 3ZETB 2D0OA 1U2VB 2E2QA 2ZWHA 4FO0A 3WQTA 5AZJA 3ZX3A 1TUUA 4BG8A 5AQSA 2GUPA 3EKSA 4BRLA 2P9PA 2CH6A 1XQSC 1HX1A 3FR0A 4B9QA 1YVNA 4H03B 3MN6A 3QFPA 4BRPA 2F9WA 3LM9A 2P9UB 2FF6A 3WQUA 1XC3A 3QFUA 5FPDA 1E4FT 3EL2A 3QBWA 2Q0RA 3A0IX 4FPBA 3HM8A 3SMPA 3TU5A 5AQYA 4H0XB 5ELZA 4BR7A 4FPAA 4Y0WA 1ZBSA 2D0PA 1BO5O 1HKCA 1NGEA 3EKUA 1R59O 2E2PA 1ATSA 2PBDA 5AQFA 5I9EB 1LOTB 1TUYA 3EZWA 2A41A 5EVZA 5KPRA 5EOYA 2GEMA 4WQ5A 3D7EO 4EAHD 3DWLA 2GTDA 3HBTA 1QQOA 3EO3A 3MMVA 1C0FA 5F1XA 2HF4A 4MLHA 4PL8A 2GELA 4EHUA 5BN8A 2KHOA 5EY4A 4CD1A 4B1VA 4H5WA 3EN9A 2E1YA 5JMVA 5KQ8A 3TPQA 1G99A 1GLCG 3J8AA 4EHTA 4FWSA 1HLUA 2YHXA 3QICA 4BRFA 2AP1A 3LM2A 3CJAA 4FOEA 1HKBA 2P9SA 2CGJA 4KBOA 3R6MA 4H5VA 2VCPA 1C0GA 4RCHA 4CBXA 2YCHA 4ISGA 1HUXA 4WQ5C 5AR0A 1K8KA 2CGKA 2YJFA 3DXMA 1IJJA 2P9NA 4HTLA 4YDUA 1Y64A 2QWRA 5BPLA 4CBWA 1H1VA 2VYPA 3CJBA 2A42A 2V52B 1DKGD 4BRAA 2YHWA 3UKUB 4WYBA 2ASMA 5BPNA 1GLFO 5AQLA 4M7YA 4IWVA 2J4RA 3A8YA 1BA0A 4K25A 5KPZA 3M3ZA 3FLCO 4JNEA 3WEEB 3SK3A 1ZC6A 1V4SA 3H45C 3VPZA 5F0XA 2HOEA 3L6QA 1J6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FL9A 4KHYA 2OZMA 4FCYA 3CMAN 4C8KA 1IBKK 4M3XA 4IXCA 4CFBA 3KD1E 2AJQA 4N5SA 3WNHA 3S3OA 1YT3A 3SUQA 5JENA 2FSNA 3O9RA 3QIPA 4AH9A 4JKBA 3A5OC 4CJSA 3BF1A 5AQUA 3RSEB 4KH4A 3TTFA 1GLEG 2G8HA 4H0PA 4C8LA 4CGDA 5CY4A 4BRGA 1C1CA 4O8UA 3LP1A 2HMPA 3QEWA 3H1VX 3P39A 4CF8A 4FM1A 3IDHA 3OYCA 1T6CA 2KZZA 3ZT2A 2ETJA 3DXKA 3IRXA 3NMUA 2W41A 4CEBA 3QDKA 2NNWA 4B9LA 4DV2K 1E3MA 2OA8A 2EHGA 4U67L 2EX3A 4PHTX 1JCGA 1JLQA 3O9UA 4FWOA 1NK9A 1TL3A 3MN9A 4I9LA 1J54A 1JLAA 4OO1J 3VQDA 5EX5A 2E5LK 4JS5A 3HPHA 4XJXA 1DEJA 3AAQA 3SJJA 4FVMA 2FSKA 1KAYA 5AZIA 1O1WA 3H3OB 2D1KA 3AVHA 5C24A 4KHWA 3UE5A 4BGAA 3HM9A 3LPUA 1ESVA 4OGEA 3D2FB 4IDKA 1NM1A 4E19A 3KLIA 3IMXA 4E7IA 1KAXA 4RTFD 5AFUH 3O80A 1SV5A 4BDYA 1IV0A 1E4GT 3BP8A 3O1WA 3AO4A 1TK8A 3MDQA 3VEYA 4M45A 1BWFO 3A5MC 3JS6A 1Q9YA 2YKMA 4BRHA 4IG3A 2E1ZA 3SLCA 3VQQA 4EFHA 5TKWA 4YOXA 4Z4IA 2QKBA 3EE8A 1SQKA 3OYAA 4CJPA 4FLUA 4LF9K 4B1WB 4JI7K 1LCUA 1JLFA 3DM2A 4M63C 3V9UA 2QKKA 3PO4A 1TK0A 4CCHA 4O55A 2OCEA 3QEVA 2W42A 3NCIA 3DXMB 1L3VA 4NCAA 4B9NA 2YI1A 3CERA 2QWOA 4BVPA 1RBSA 4CK3A 1VSEA 1RT2A 1VQPN 3I56N 1BIUA 4Q5VA 1JKHA 4KTZA 4AHCA 2VGMA 5BREA 1VSMA 5SZTA 4CEFA 3O6WA 4BQZA 1MWKA 5AQTA 3PY8A 3CG7A 4BR4A 3KJVA 4GY2B 3BDPA 2LSNA 1RCHA 2XO7A 4IKFA 2W6KA 3QB0A 3M6GA 4EZ6A 3WT0A 1RBRA 4DV3K 3H1QA 3L4IA 2ITMA 3LP3A 4Z94A 1NGGA 2P9IB 2FLOA 3CCVN 2O4IA 3LPTA 1NLVA 4DTNA 3VQPA 5AQWA 4RW8A 4DV0K 2O8DB 2G8FA 4Y1CA 2O8FB 1EP4A 4E89A 3VTHA 3M8QA 1HJRA 1BQMA 4CGIA 1B9FA 3OTOK 3OW2M 4Y1DA 2F8TA 1J5EK 3C94A 4CF1A 3TAQA 1YIJN 1VSDA 2F4VK 3LZIA 3AAPA 4XH5A 1RT1A 4KHPK 1VQMN 3R8EA 3JAMO 4OLBA 1NJWA 1ZBUA 4CZLA 4PKHA 2NZTA 5JLHA 3B6OA 1FK9A 3L0QA 2X78A 2Q1NA 3OYMA 4B9MA 4DSJA 3D2FA 4OPKA 3VEOA 4ZTFA 3HTVA 3U3GA 3CXCM 4CHZA 5FROA 3S5TA 3G0ZA 2UUAK 4Q0BA 1HQEA 2V51B 4O0JA 1NGCA 4BRQA 3KK2A 4K43A 4O0IA 5KQDA 4NLBA 3CJ7A 2XY5A 5BRFA 1DTTA 2UXCK 4CHPA 5AQIA 3OYFA 3HOTA 5FPEA 5J1EA 1C1AA 1HJOA 1UAXA 4OPAA 4DWIA 4Z0UA 2HVIA 2Q0UA 4DFKA 3CJCA 3ZSQA 4AM6A 3B8AX 1GLAG 3WEEA 4B3RK 1W97L 1NK0A 1RDUA 1B9DA 4JEPA 4KB1A 2FF3B 4LF6K 1D9FA 3J80O 3VQ6A 1OH7A 2YV0X 4CK1A 3ULEB 2F9TA 4K8XA 4PWDA 5CZ1A 1YVUA 3HO1A 2DFEA 3ID8A 1L5UA 2IVNA 3KK7A 3F5TA 3CFRA 1WUAA 5KTQA 4X62K 3IFRA 1BI4B 1FXXA 2NRTA 1VRUA 4FWRA 3KZBA 1XMOK 1BOTO 1IG9A 3MCAB 2E20A 3AGRA 4BE2A 2QW9A 2P51A 3E66A 3ENOA 3C95A 4DHYA 3AVKA 5CYMA 1VSHA 2QWNA 4ID5A 1QZ5A 3LP2A 4YOTA 3CJ1A 4HCBA 2ITGA 2YNHA 4ICLA 3L3UA 2P9LB 3ENHA 1O13A 3QEXA 4DQIA 2P9IA 4RWTA 5AQKA 1EQYA 3SZ2A 3LDSA 1XNQK 3IG1A 4JRPA 1ZXOA 3K57A 4ID1A 4IDHA 1YXQA 1S72N 3I0SA 3HVTA 1A5XA 4CZFA 1BDGA 4UQGA 5AQRA 4XEIA 3WUHA 5AQGA 3AO2A 4FWLA 2D0OA 3WQTA 4OPJA 2UU9K 3EKSA 1D5AA 4MQ3A 4FW2A 5HRRA 4E1NA 1XQSC 5C12A 1YVNA 3AA4A 2HVHA 2WC9A 2OPSA 5C42A 3LM9A 2P9UB 4KKOA 5T7BA 4BE1A 2O8BB 1P90A 3K58A 4FPBA 3TU5A 5EU7A 3AVCA 5GAGP 4R79A 3K9KA 3HP9A 1Q81O 4Y0WA 3ITHA 5HRNA 1BO5O 1HKCA 1NGEA 3K59A 3S3NA 3EKUA 2OPQA 1GOAA 2O8CB 4OVLA 3E1YA 4KAZA 4CF2A 2FC0A 5KPRA 1T05A 4YOUA 1BIZA 5C2FA 1FKOA 4W5RA 3D7EO 4EAHD 3DWLA 1I39A 2GTDA 4IEIA 1I94K 1WBBA 3MMVA 4TSXA 1N6QA 2YHAA 4J2BA 2XY6A 4JKHA 4L8RB 3ZT1A 1EXQA 3MAQA 5BN8A 4WE1A 5I3UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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