4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Contractile protein/structural protein
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
1HX1A 4IZ9A 5AQLA 3H1QA 3O1WA 3ULEA 4XH5A 5AQIA 5AFUH 2FSNA 1RDWX 3LDNA 4H5NA 4BRMA 1YXQA 4BC3A 2QWPA 4H0YB 4QS7A 3ID8A 4BRPA 2VYPA 4CZFA 2E2PA 3MCPA 4H0TB 3VEYA 4CZLA 4PL8A 4H5RA 2P9LA 2VWBA 2P9UB 5BRFA 3QFUA 2E2NA 1C0FA 3ENOA 3H45C 2UYTA 1DGKN 2BTFA 2QM1A 5LY3A 1GLEG 1U2VA 3MMVA 1T44A 3LDQA 3VGKA 2P9IB 4BRAA 2A5XA 1NWKA 2V7YA 4EHUA 1KAXA 3WT0A 3CJ9A 5BPMA 3O08A 3SJHA 2QWLA 5AQRA 3M1FA 3O6WA 4F9OA 4FWPA 3VF2A 3FZHA 3R8EA 2Q2RA 3HBTA 3C7NB 3MN7A 2ZGYA 3VERA 4B1XB 2D0PA 5F0XA 2P9NA 1JCFA 3UKRA 4LC9B 3UB5A 4QS9A 3VEZA 4FL9A 5EOYA 4BREA 2IVOA 2QW9A 5KPTA 1QZ5A 4K42A 5JICA 2P9SB 4ISGA 1NGBA 4BRFA 3LM9A 1GLJO 3DXMB 3CHWA 3DAWA 4XH1A 4CD1A 4GY2B 2HOEA 3A5NC 2WUSA 2Q97A 5BPNA 4BRIA 2A42A 1NMDA 3CIPA 3QFPA 3FFKB 4EIAA 2NLXA 3U8XA 1T6CA 1Y64A 3VF4A 5ADXH 3IFRA 3L6QA 3O80A 4CBUA 3O1BA 3FLCO 4I6MB 3VGMA 1BA0A 1NGDA 1P8ZA 3O4WA 4H0XB 4FWQA 1RGIA 4BR0A 3EZWA 3ZX0A 4BQZA 4K43A 4O5FA 3A8YA 4E1JA 1ATNA 5EX5A 3H6EA 2E2OA 3FZFA 4H5VA 3SK3A 2QXLA 3C0BA 3ZETB 4BG8A 3U9DA 4BR7A 4FPBA 2ITMA 3O8MA 4CBXA 3MN9A 3GE1A 2HF3A 1LOTB 5AQHA 1BUPA 3ULEB 3M3ZA 3ZX3A 5AQPA 2I7PA 1ATRA 3L4IA 2HMPA 4KBOA 5AQMA 2CGJA 3KVGA 4IJNA 3AARA 4H0OA 5KPRA 1BOTO 1KXPA 3DJCA 4WQ4C 1GLDG 2A3ZA 3QMLA 4MO4A 2FF3B 2CH5A 4H5WA 2NZTA 3LL3A 2P9LB 1IG8A 3BUZB 4PKHA 4FWLA 4K25A 4FWRA 4O8KA 4EFHA 2GWJA 1BG3A 3QBWA 1ZC6A 4CZGA 4JNEA 1NM1A 3O5BA 5AZIA 3CI5A 3BF1A 1J6ZA 4IWVA 3EN9A 1SQKA 3AAQA 5BN8A 1SZ2A 3CQXA 4AM6A 3U9ZA 4CZMA 1QHAA 4HTLA 4BC2A 4A2AA 1K8KA 3VEWA 2ZWHA 3ZETA 5KQ8A 4WQ5C 4FO0A 1HKCA 3GDQA 3DXKA 1S22A 4BR5A 2P9PB 2YHWA 4A62A 3UKUB 3QB0A 5B8HA 5AQTA 2P9NB 3A5LC 3F9MA 5F2RA 4BC5A 4BRHA 2YI1A 5JMVA 3UKRB 5I9EB 2Q31A 5AQZA 5AQVA 1X3MA 3EKSA 3J8AA 2YHXA 3IMXA 1DKGD 2QWOA 3VEOA 4FWKA 5BN9A 1BWFO 4JD2B 3AY9A 5BRHA 3GBTA 1TYQA 3VESA 3AAPA 1EQYA 3R6MA 3EO3A 1WOQA 3RSEA 3A5OC 2E8AA 5E84A 2FSKA 1GLCG 4A2BA 2P9PA 2ASMA 3TPQA 3UKUA 4DQ8A 4FWSA 4RWTA 1HLUA 3CERA 4B1WB 4BRLA 4CBWA 4CJ7A 3JS6A 2CGLA 3CJBA 1CZAN 3ZEUA 3KZBA 1BU6O 3MDQA 4CZIA 5LJVA 2EWSA 2IIRA 1YUWA 2FXUA 4RCHA 4NO7A 2NRHA 3UE5A 3MN6A 2AP1A 5BREA 4JD2A 4M7YA 5EY4A 5JLHA 4DB3A 2YHYA 3CJ7A 3SMSA 2W41A 4XEIA 5AZIB 1NGGA 5FPMA 1GLFO 4H0PA 2IVNA 4H03B 2E88A 4IO8A 3VEVA 3I33A 4ISFA 1HPMA 2H3GX 2A6AA 1K8KB 4L3QA 4FWOA 1NBWA 5AQNA 2ZGZA 1NGAA 2F9WA 4HWIA 2W40A 4MO5A 1WUAA 3H1VX 1E4FT 3DXKB 1QQNA 1ZXOA 3H3NO 3DWLA 4CI6A 4FPAA 3M6GA 5AQGA 3H3OB 3TU5A 1V4TA 2Q0RA 2D4WA 2YJEA 5FPEA 3HZ6A 1ZBSA 3D2EA 4Z94A 4EAHD 1OKJA 3WQTA 2CGKA 1MDUB 2D0OA 5AQXA 4BRKA 5BR9A 4JHDA 3HM8A 3A0IX 1G99A 2IVPA 3BEXA 4WQ4A 2E1ZA 4BRCA 3LDOA 1TYQB 5AR0A 1JCGA 3SLCA 1LCUA 3JXUA 2Q0UA 1ESVA 2ASPA 4H0VB 4PKGA 4JAXA 3W0LA 3BF3A 4IXCA 5EVZA 4DHYA 1T6DA 5AQJA 4XH4A 3RSEB 3VETA 5JLFA 2GUPA 4YDUC 3VF6A 4BVPA 2A40A 2PBDA 1X3NA 1Q18A 4A61A 1NGHA 1NGJA 1NGIA 5E26A 4WQ5A 3FZKA 3ZEUB 3W3DA 1ATSA 1RFQA 2YCHA 2CH6A 3QBXA 3WXJA 3KHYA 3ZX2A 2QWMA 3IDHA 1R59O 2E1YA 4B1UB 4BRDA 5LJWA 1H1VA 2QWRA 3CQYA 3FZMA 2V7ZA 3D2FB 1HJOA 4FWNA 4BR4A 2KHOA 2P9KA 1DEJA 3OHRA 3P4IA 3WXLA 4FOIA 3WEEA 4CZHA 4J8FA 3WXIA 5AZJB 1NGCA 4BVOA 3CETA 5ELZA 3ATVA 3LDLA 1XQSC 4PL7A 1U6ZA 3GG4A 4CZEA 5AQWA 5FPDA 2GTDA 3SMPA 3S41A 4B1ZA 1HUXA 1NGEA 4BQLA 3FR0A 5BPLA 1C0GA 1Z6RA 3B8AX 4FOEA 1NGFA 1GLLO 2HF4A 5AQSA 1X9JA 4BG9A 4BROA 1BDGA 1Z05A 3VPZA 1YVNA 1HKGA 3D2EB 3U4LA 3HI0A 3FZLA 1QZ6A 2E2QA 3QDKA 2PAVA 4NB4A 5ADXA 2BUPA 4B1YB 3WXKA 2ZF5O 5F1XA 3A5MC 3D2FA 1NLVA 3LM2A 1XC3A 1XUPO 2V52B 4JHDB 4BRGA 1QQOA 2FLOA 1HKBA 2GWKA 1GLBG 5AQYA 4CZJA 1V4SA 5AZJA 3ENHA 2FF6A 2P9UA 1BO5O 2FSJA 1KAZA 3LDPA 3IUCA 2YJFA 4CD3A 4IJAA 3GL1A 4ISEA 2P9IA 2GELA 4JN4A 4B9QA 1E4GT 1TUYA 1JCEA 2A41A 1QQMA 5KPZA 2J4RA 1IJJA 3WQUA 2VCPA 1YAGA 2QWNA 4B1VA 4GNIA 3CJ1A 4PKIA 1BA1A 2F9TA 3HSCA 4AM7A 5CE3A 4WYBA 4BC4A 3EKUA 3C7NA 3MN5A 4EHTA 1TUUA 3WUHA 4BR9A 3R9PA 5TKYA 4Y0WA 2E20A 5FPNA 3D7EO 4MLHA 1KAYA 3MK6A 4BRQA 4H5TA 3G25A 2P9SA 5EXWA 3DXMA 1MWMA 3GOIA 2ASOA 5AQKA 2V51B 5AQOA 2P9KB 1S3XA 4BR2A 2Q1NA 4K41A 1MA9B 4BGBA 5KQDA 2DPNA 4CZKA 2QWQA 3WEEB 3VGLA 1GLAG 3VEXA 3FGUA 4FWMA 4I6MA 3VOVA 4C23A 1MWKA 5AQQA 3L0QA 3VENA 5AFUA 4FSVA 4M63C 5BRDA 2OANA 2D1KA 1U2VB 3ATUA 1D4XA 5AQFA 5AQUA 4BGAA 3H46O 3BP8A 3FE1A 3QICA 3CJCA 4YDUA 2GEMA 3CJAA 4RTFD 2I7NA 3EL2A 4BRNA 4DCHA 2AA4A 1SAZA 4MLEA 4M7XA 3HTVA 4QS8A 3I8BA 2Q36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AA4A 4IZ9A 4K0KK 2QKBA 4CJWA 4RW7A 3K9JA 4AQYK 5T7BA 4KPYA 3OS2A 2YV0X 1VSJA 3SUNA 4DV5K 4QS7A 3KD1E 2WOMA 4HTUA 3PX6A 3VQPA 3KIOA 4YY3K 3AO4A 2HBKA 3NH2A 1C0FA 4M41A 4OKJA 4MDAA 1N6QA 2BTFA 3T3FA 5LY3A 2X74A 3P83D 2P9IB 3CQ8A 1CZ9A 4AILC 4JKGA 4FJMA 1I39A 1HMVA 5GAGP 3LALA 1UAXA 2X6SA 3M1FA 2OYQA 3RTVA 4F9OA 3A2FA 3VF2A 3OBYA 1IKXA 2ZGYA 3SPYA 4YNQA 3MXMA 3R3LA 3BZCA 4LC9B 3UB5A 3JAMO 3OS1A 3RMCA 4FJHA 4DF8A 4QS9A 3VEZA 1TV6A 3H08A 3QEIA 2IVOA 2QW9A 1S9EA 4ISGA 3HL8A 2AJQA 3CHWA 1LW0A 3DAWA 1RT2A 5FRNA 5J2PA 1VK0A 3CD6N 4B9MA 4EIAA 2NLXA 3C65A 5HLFA 5ADXH 1Y64A 3IFRA 3L6QA 4CJLA 4ZTFA 3AV9A 4DR4K 1T05A 1YITN 3VGMA 1M90O 2PZSA 4K43A 4DTRA 4O5FA 3A8YA 4E1JA 2KTQA 1L3TA 4KV8A 4CF9A 4F8RA 4H5VA 4I9LA 2QXLA 3C0BA 3ZETB 4OJRA 4B9LA 5K14A 4DS5A 4FVMA 4CBXA 2HF3A 5JS1A 5AQPA 1Q81O 1NK7A 2HMPA 1SKSA 5AQMA 1ITGA 1C0UA 2CGJA 2D0CA 3MX5A 1CXQA 4H0OA 4IJNA 5KPRA 3PIPL 4JV5K 3NBPA 1XNRK 4LFBK 3DLEA 2A3ZA 2ZJQL 4PUOA 2RN2A 2G8IA 4RW6A 2FF3B 4DFPA 3SJJA 4CGHA 4Q0BA 2NZTA 1RNHA 4K25A 3QBWA 2P5OA 4KHYA 2B4JA 1NM1A 1L3UA 1RT4A 2UUAK 1J6ZA 3EN9A 4KO0A 4CJ5A 3K5NA 4FLWA 4DUYK 3SPZA 1EXQA 4ILJA 3TSPA 3S5TA 3VEWA 3MEGA 3ZETA 1HKCA 3GDQA 1WB9A 5GINA 1WSFA 4BR5A 1K8AO 3J7YP 1ZBFA 2YHWA 3UKUB 3QB0A 1HR0K 1RCHA 2P9NB 3F9MA 4BRHA 5JMVA 2O4GA 2Q31A 5I9EB 5AQZA 4DFMA 3L3UA 3IMXA 1W9HA 1EETA 3SUPA 1Q9XA 2NRRA 4KFBA 5BN9A 4FLXA 4C8MA 3V81A 2YKNA 5BRHA 2VQFK 1FK9A 4B3MK 1EQYA 2XHBA 3AO1A 3CPEA 4YORA 2ZJRL 1RT7A 2YKMA 3RSEA 4DR2K 3SUQA 2OPRA 4A2BA 2OPSA 3SAHA 1S72N 1XMQK 2ASMA 2QI2A 3PO4A 3UKUA 3QIPA 4FWSA 4RWTA 2JGUA 4IEEA 4B1WB 4CF8A 1QVFM 1KLNA 4AHSA 3AVMA 2JLEA 3MDQA 4DF4A 4CZIA 1BIZA 1BQMA 1YUWA 2NRHA 5KRTA 4KAZA 4DV2K 4FJXA 4DU1A 3OYNA 1U48A 3EE8A 4M7YA 2I5JA 3AVKA 4DU4A 1QSSA 1CZBA 4CJTA 3P31A 1B9FA 1KD1O 3OYIA 1L5UA 2IVNA 3AO3A 1RT3A 3Q7BA 4DTNA 1JLCA 1K8KB 4L3QA 4FWOA 1NKCA 3OYAA 2F9WA 2DFFA 4MO5A 1M1KO 3H1VX 3QIOA 3DXKB 1QQNA 4NCGA 1IH7A 1UWBA 4OPHA 2Y1JA 1RBVA 4BEBA 3H3OB 2YJEA 4CJ4A 3HJFA 5FPEA 3AGRA 4ILGB 4Z94A 1S1VA 2QA4N 3IKMA 1X9WA 1EWRA 3AVLA 4ICLA 4EAHD 5EU7A 3ZCMA 1MDUB 4CEAA 4CFCA 2BE2A 4JKCA 4Y1CA 4B08A 5HRNA 3A0IX 3NH0A 3M8RA 1WN7A 4BRCA 1S6QA 1U49A 3CPWM 4ID1A 2GX9A 4U67L 1LCUA 2Q0UA 2F4VK 2ASPA 4H0VB 1LWFA 4JAXA 4IXCA 4CVNE 1RT5A 2JWKA 5FROA 2E6MA 4GW6A 4JRPA 5MLCQ 3HPOA 1VQLN 2PBDA 4YHHK 2NRTA 4AHTA 3DI6A 4DFKA 3QEXA 2Q3SA 1SKWA 4A61A 3HM9A 3HP6A 4O8UA 1BHLA 3FZKA 4DTMA 3CG7A 4EP4A 1ATSA 4A59A 5GIOA 1S1TA 3IDHA 1NOYA 2E1YA 4B1UB 3V9ZA 2E5LK 4FVUA 2IDOA 4IDHA 3QETA 4B9SA 2V7ZA 4OKEA 2HHUA 1HJOA 1K9MO 3K5OA 2ZM6K 4B3OA 3P4IA 3WEEA 5DM6L 1KVCA 3TR8A 3CCJN 5AZJB 3QEPA 4E7JA 3LDLA 4CGGA 4CZEA 2GTDA 2FBXA 3OA9A 4RW4A 3DRPA 1N34K 4CJFA 3PLAA 1JLBA 1HUXA 1NGEA 3FR0A 5BPLA 1C0GA 3B8AX 4FOEA 3OYJA 1NGFA 2HF4A 1N36K 4I9QA 2OPQA 4BG9A 4G1QA 3K58A 3O4QA 1HKGA 4NXMK 2VWJA 3FZLA 4FCYA 3SUOA 1QZ6A 1R0AA 1O1WA 3PX4A 3R1XA 3C95A 3WXKA 2ZF5O 5F1XA 1NLVA 1A5WA 1MU2A 2V52B 3O9UA 1QQOA 2FLOA 1HKBA 5AQYA 3N4QA 3M8SA 3EZ5A 5AZJA 2P9UA 3VMFB 4IJAA 3GL1A 1CLQA 2GELA 4FLYA 4NLCA 4JRQA 1JCEA 4DR7K 1QQMA 4ELUA 2J4RA 2YX6A 1NMNA 1D9DA 2D5RA 1YAGA 2G8VA 4PKIA 5CY4A 3SZ2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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