4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
4BG8A 1NGAA 2IVPA 1R59O 2I7PA 4BVPA 3KVGA 1SZ2A 3ATVA 2YHXA 3EL2A 1QZ6A 5AQJA 2QWOA 5AFUH 1XQSC 1KXPA 3B8AX 3LL3A 4H0PA 1HPMA 3O1BA 3WEEA 1BOTO 3C7NA 1XC3A 1IJJA 2HF4A 5BPMA 4JAXA 3CQYA 1HKBA 1RFQA 1Y64A 3JS6A 4XH5A 3CJ7A 4CD3A 3C0BA 4BR0A 3QDKA 3ZX3A 1DKGD 3W0LA 1MA9B 3QFUA 4JD2A 1JCFA 1BO5O 2W41A 3H3NO 1T6DA 1GLEG 4EHUA 1E4GT 1ATNA 2P9KA 3VGMA 1U2VB 3UKRA 4WQ4C 5F2RA 1DGKN 5AQZA 2NRHA 3CETA 5AR0A 3SLCA 1J6ZA 4H0XB 4BRHA 2Q1NA 3EKSA 3L0QA 4WQ5A 3U4LA 4BR5A 4FOIA 2ASPA 3O8MA 5AQMA 3CI5A 3UKUA 1XUPO 3D7EO 3P4IA 3CERA 1BWFO 3IUCA 4CBXA 1HLUA 4M7YA 3CJ9A 1YUWA 4PKGA 4MO4A 3CJAA 4B1YB 5JICA 5CE3A 1V4TA 4H0VB 1TUUA 1NMDA 1NLVA 4B1VA 2P9NA 1K8KB 3CJBA 4PKIA 2YHWA 4FWLA 4CD1A 4CZEA 4B1UB 1ZXOA 1IG8A 3SMPA 4FPBA 4CZMA 4JD2B 2CGJA 3FGUA 3A5OC 5AZJB 3IMXA 3A0IX 2FXUA 2Q36A 4RTFD 1QQOA 3LDPA 3VETA 2IIRA 3R9PA 3HTVA 4BR2A 3M6GA 4BRMA 3WQUA 2QWQA 2YJFA 2A40A 2CGKA 2V7YA 2QM1A 2GELA 4L3QA 4CBWA 3FR0A 1DEJA 1GLCG 4DHYA 5LJVA 4FL9A 1C0FA 2E2OA 4EIAA 5BN8A 3VESA 3LM9A 2VYPA 3BF3A 1G99A 5EVZA 3ZETB 5AQXA 2A41A 2QWPA 4H0TB 3VEXA 4CZKA 1QHAA 4IWVA 1NGCA 2A5XA 3O5BA 3MN9A 3SMSA 2QXLA 1BU6O 3C7NB 4WYBA 4FWOA 2Q0UA 4WQ5C 4Y0WA 4FOEA 3DXKA 2NLXA 3CQXA 2EWSA 3QB0A 1HKGA 3DXMA 2GWJA 2ZGZA 1S3XA 4EFHA 2ZWHA 4JNEA 5FPNA 1NGHA 2FSKA 4IJNA 3D2FB 1SAZA 5EOYA 3I33A 5EX5A 4FWKA 2PAVA 5AQKA 4H5VA 5AQPA 4IO8A 3QMLA 2QWMA 2FSJA 1KAYA 1KAZA 2HMPA 1JCGA 5AQUA 3VPZA 1V4SA 3WT0A 3GOIA 5AQWA 1E4FT 4IJAA 1ESVA 2BUPA 1U6ZA 3ENHA 3A8YA 4NB4A 3WXKA 2P9IB 4B1WB 2OANA 3VF4A 5AQYA 3VENA 4Z94A 4H03B 1QQMA 1NGBA 3ENOA 4M7XA 5FPDA 4FWRA 4BC2A 2E1YA 1BG3A 3DWLA 5ADXA 2YJEA 2PBDA 3O08A 5AQVA 4A62A 1T44A 3BF1A 3DXKB 4QS7A 3VEZA 4BRCA 5LY3A 2E88A 1Z6RA 3ZX0A 4BR7A 3HM8A 4BRGA 5BPLA 3U9ZA 4BQZA 5KPZA 2ASOA 3L4IA 2HOEA 1NGEA 1YAGA 4A61A 5B8HA 5JMVA 1QQNA 3HZ6A 3HI0A 5AZIB 1NWKA 3VGLA 1RGIA 3R8EA 3EZWA 3FZMA 1ZBSA 3D2EB 2Q31A 3OHRA 4O8KA 4H5RA 3DXMB 3GE1A 3EO3A 5KPTA 1RDWX 2AP1A 1Q18A 3S41A 5F1XA 4FWPA 3GL1A 1NGGA 1GLLO 4FSVA 4BGAA 1YXQA 1EQYA 4BGBA 3WEEB 2YI1A 3VOVA 3VERA 1WOQA 4AM6A 3AAPA 4FO0A 5E26A 3RSEB 3MMVA 5EXWA 1HJOA 1NM1A 1WUAA 2V7ZA 3KHYA 4MO5A 3EN9A 1T6CA 2F9TA 1GLBG 1BA1A 3H3OB 2E2QA 2FLOA 4XH1A 3W3DA 3CJCA 2P9SB 2P9PA 2CH5A 4BVOA 4BR4A 4CZIA 4QS9A 1BA0A 4BC3A 2Q97A 3FZFA 5AQRA 1NGJA 2BTFA 3QFPA 3ZEUB 2D0PA 4B1XB 2AA4A 1TYQB 4BRLA 2VCPA 3CIPA 2IVNA 4CBUA 2HF3A 4PL7A 3H45C 4O5FA 1LOTB 3MN6A 4JHDB 1CZAN 4BQLA 2P9LB 4BRPA 1NGDA 4F9OA 2ASMA 4IXCA 3SJHA 3ZX2A 1OKJA 4YDUC 3GG4A 4KBOA 3MK6A 4XEIA 2E1ZA 3ZETA 1JCEA 2QWNA 1Z05A 4CI6A 3R6MA 1NBWA 4ISGA 4FPAA 4B1ZA 1KAXA 2J4RA 5AQLA 2P9UA 3TPQA 2CGLA 3UKRB 2VWBA 4MLEA 3ULEA 4DQ8A 3D2EA 4CJ7A 5BRFA 3LDNA 5AZIA 5F0XA 1ATSA 3LM2A 4EHTA 2E2PA 1S22A 4K25A 4A2AA 2E8AA 3A5NC 3LDLA 5AQQA 3VF2A 1HKCA 4GNIA 4IZ9A 4GY2B 5AQOA 4FWQA 1LCUA 3WXLA 2IVOA 2WUSA 4I6MA 3QBWA 4H5WA 5BPNA 1K8KA 5AQTA 3O4WA 4B9QA 4BRAA 3IFRA 3M3ZA 3VEWA 3UE5A 5BRHA 3EKUA 5FPMA 3FZLA 4FWNA 1NGIA 2QW9A 3LDQA 3VEYA 3FZHA 3FZKA 1BUPA 2CH6A 3SK3A 5I9EB 1BDGA 4XH4A 4CZLA 3A5LC 3DAWA 4K41A 4FWMA 4ISFA 1X9JA 3M1FA 5E84A 1NGFA 1MWMA 2P9UB 1C0GA 4HWIA 4J8FA 5BN9A 4H5TA 2P9KB 3I8BA 3O80A 5JLFA 3H6EA 3IDHA 5AQIA 3VGKA 3WXIA 3MN5A 1U2VA 5ADXH 5LJWA 4PL8A 3H46O 2V52B 2UYTA 3CJ1A 3HBTA 2W40A 2YCHA 3G25A 4RCHA 2A3ZA 2GTDA 1MWKA 3BUZB 2D0OA 4H0OA 3VF6A 2Q2RA 4LC9B 1D4XA 4WQ4A 4CZHA 3L6QA 3RSEA 3WXJA 2A42A 2V51B 3WQTA 1MDUB 3ZEUA 5AQFA 1GLAG 4DCHA 3FLCO 4QS8A 3BEXA 5KQDA 3U9DA 5KPRA 3CHWA 2P9PB 4RWTA 1X3MA 2P9SA 3AY9A 4BROA 3AARA 4MLHA 3VEVA 4DB3A 4BRQA 1H1VA 5JLHA 4BC4A 2FSNA 4HTLA 4CZJA 4C23A 4K43A 2KHOA 2GEMA 1TYQA 3TU5A 2I7NA 5KQ8A 1HUXA 4BC5A 2ITMA 3O6WA 3LDOA 3ATUA 3VEOA 4CZFA 3J8AA 3BP8A 4BRFA 5EY4A 1ATRA 2E2NA 4H0YB 2QWLA 4E1JA 4CZGA 2ZF5O 4BREA 2Q0RA 4YDUA 5AFUA 3O1WA 3A5MC 3H1VX 2YHYA 4BRDA 4I6MB 3FE1A 3F9MA 1HX1A 4BG9A 3JXUA 3UKUB 2GWKA 3KZBA 4BRKA 4M63C 2ZGYA 5AZJA 2D4WA 2P9NB 2P9IA 3FFKB 4FWSA 4ISEA 2QWRA 3DJCA 2A6AA 1SQKA 4EAHD 5AQSA 5AQNA 3MCPA 3AAQA 2E20A 3MN7A 4K42A 5ELZA 2FF3B 2H3GX 2F9WA 5BR9A 5AQGA 2NZTA 1P8ZA 5FPEA 4BRIA 4AM7A 2P9LA 3U8XA 2DPNA 5BREA 4NO7A 4A2BA 1YVNA 3UB5A 3ULEB 3H1QA 4H5NA 1GLDG 3GBTA 4JHDA 4JN4A 1QZ5A 5BRDA 2D1KA 3MDQA 3ID8A 5TKYA 1X3NA 2GUPA 1GLFO 3QICA 5AQHA 3GDQA 4BRNA 3QBXA 3WUHA 1TUYA 1ZC6A 1GLJO 4PKHA 3HSCA 3D2FA 2FF6A 4BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A2FA 5SZTA 3DLHA 2NRWA 1N33K 4C8MA 4DV7K 1IBLK 3VQCA 3B8AX 1VQ7N 3LL3A 1HPMA 4DTJA 3KK3A 3DLLL 2HF4A 4DV4K 1HKBA 1Y64A 4XH5A 4CD3A 4CGHA 3NH1A 2Z1GA 4B9UA 4B9SA 4OPJA 2RF2A 4IKFA 4RG8A 3QDKA 4BR0A 3ZX3A 4DR3K 1DKGD 4FVMA 2QA4N 3AGKA 2UUBK 4FM1A 1NK9A 3W0LA 1LW2A 1LWFA 3SAHA 1HYZA 4DU1A 1LWCA 3QLHA 4KHWA 1VQ5N 2VGMA 4O44A 4FJHA 4WQ4C 4B9TA 3KKRA 2XRIA 5AR0A 4XIUA 3L0QA 1L3SA 2WC9A 4A5AA 2ASPA 3O8MA 5AQMA 5M1KA 3MXMA 3J7AP 3CI5A 4I7FA 4N76A 1Z25A 1WB9A 3DLEA 5JENA 5J2QA 3ENBA 4ZHRA 1YUWA 4MO4A 5E41A 4B9NA 1VSKA 2A1SA 2XY6A 2P9NA 4PKIA 3O9RA 4CZEA 2RE2A 1ZXOA 3EY1A 4FLZA 4JD2B 3FFIA 4LF8K 4LH4A 3TSUA 2GV9A 2FXUA 5GINA 2B4JA 4RTFD 1BI4A 1QQOA 3F9KA 4KTWA 2IIRA 5K14A 5JVHL 3RWUA 3THYB 4BRMA 2F7TA 4F2SA 2A40A 2YJFA 3AA4A 1C0TA 3BGRA 1JLGA 2G8KA 5LJVA 4FL9A 2YNGA 3MEDA 1C0FA 3K59A 3VESA 3HOSA 2IGIA 3BF3A 1G99A 1MU2A 3KD1E 1N6QA 4KHQA 2P5OA 3RRGA 4N5SA 1QHAA 1QVGM 1NGCA 1M90O 4KHSA 4FZYA 3MN9A 4GVMA 2G8FA 2B6AA 3V6DA 4WYBA 3I8DA 4JS4A 3DLRA 3PSFA 1VQ9N 2BE2A 3CQXA 1W97L 1HKGA 2Z1HA 1KD1O 4KTQA 5GIOA 3KTQA 1U49A 4U7BA 5EOYA 3V9WA 3RVCA 3I33A 3G4SN 2PAVA 5AQKA 4OKJA 4M3WA 3QEPA 4FW1A 4IO8A 2NRTA 2JLEA 1UA1A 3GOIA 4CEBA 4C8NA 3NAEA 1U6ZA 3ENHA 3TSPA 4FK4A 3KK7A 2P5GA 4AHUA 4B1WB 3VQ9A 4DS4A 1VSMA 4JKAA 4ZTJA 4GKKK 1RT2A 3ZYYX 5AQYA 1WSGA 1VSFA 4M3XA 3AVGA 1WSFA 3AO4A 2IS3A 3AA5X 5FPDA 4FCYA 1Y97A 2E1YA 3J80O 3PV8A 4IBNA 2YJEA 1UAXA 5AQVA 1T44A 4Z0UA 3K5OA 1VQ6N 3J81O 3ZX0A 4Z4GA 3R3LA 1J9AA 5BPLA 1LWEA 2I5JA 5DM7L 2ASOA 1OH7A 5JMVA 3HI0A 4Q5VA 4DSKA 3EZWA 1Q9XA 4DR6K 1ZBSA 3D2EB 1X1PA 3QNOA 3OHRA 3NGYA 1NGGA 1YXQA 3M8QA 4BEBA 2YI1A 3VOVA 3HPOA 2YV0X 4NCAA 5E26A 3K57A 3RSEB 2OZSA 4K8XA 2ZJPL 3G10A 1IKWA 2VWKA 3OS0A 1WUAA 3KHYA 4IOAL 1T6CA 4PA1A 4YOUA 4R79A 3W3DA 4E1NA 3CFPA 2P9PA 1DTQA 4YFUA 4BC3A 1FK9A 3QFPA 3MWTA 4B1XB 1U47A 2AA4A 1TYQB 3H08A 3CIPA 3AO2A 4PL7A 4GW6A 4CF9A 1B92A 1LOTB 4O8UA 3SAGA 1IBKK 4DTOA 4BQLA 4BRPA 2P9LB 1VQLN 1NJZA 4DF4A 3ZETA 1QTMA 2QWNA 2QKBA 5DK5A 2B5JA 4DQRA 1VSHA 1OH5A 3OJUA 1IKVA 3TPQA 2CGLA 3UKRB 5LMUK 4DR7K 1KVBA 4DQ8A 4KPYA 4HHTA 4IFEA 5AZIA 4JS5A 3SV4A 2UUAK 1ATSA 2DFFA 1NNEA 4DUZK 2WFBA 1BQNA 3KIOA 1RDDA 1JKHA 5JVGL 3QBWA 4A5BA 3ZSQA 4PWDA 1KFDA 4B9QA 1C0MA 1TK8A 1E3MA 3F5TA 1WSEA 4DSIA 2QW9A 1NJXA 3FZHA 3SBTA 4O5BA 3E1YA 3S3NA 2HHWA 4CZLA 4K41A 2Z1IA 3S3MA 3SPYA 5HRRA 4F4KA 3CFRA 4HWIA 3T1AA 3BZCA 4H5TA 2P9KB 3O80A 2P1JA 3IDHA 3CC4N 5HROA 3VQBA 3VGKA 3WXIA 4IDKA 5J2PA 4OO1J 5LJWA 4BDYA 4QCLA 2V52B 4HUFA 3SUNA 4IG0A 3CJ1A 3HBTA 3T19A 2YCHA 4X62K 4CK1A 2UXBK 1MWKA 4H0OA 3CM5A 2HHHK 1D4XA 1GOBA 1OVYA 3CCMN 3WXJA 3HP6A 2V51B 2HVIA 3ZEUA 4BDPA 1HNWK 4E0DA 1S1VA 3P1GA 4IFVA 4NXNK 3NF7A 4DU3A 2R7YA 4NLCA 4DV6K 1KLNA 1JJ2M 5HBMA 4K43A 5HRNA 3TU5A 2I7NA 4DTNA 1YI2N 4BC5A 4JKEA 2OYQA 3S9HA 2ATQA 4DS5A 4JKGB 2QWLA 3ALYA 4CJQA 4E1JA 3L2VA 4CZGA 3K5MA 3L2WA 3PO4A 3NF8A 4CFDA 3O1WA 4ID5A 2O8EB 4BE7B 1UA0A 1HX1A 1SL0A 1BCOA 4EZ9A 4HCBA 3OS1A 4BRKA 2YNFA 4DV3K 3PO5A 4CGDA 5AZJA 3CF5L 3VQPA 3FFKB 2QWRA 3DJCA 2IAJA 4DWIA 4KHNA 3PIOL 3SI6A 2E20A 3HPHA 3HJFA 4KHPK 5HL7L 1W0HA 5A2QO 4CEEA 5CZ1A 1K73O 2P9LA 1TL1A 3ULEB 5M1FA 3SQ4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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