4PL8A

Structure of rabbit skeletal muscle actin in complex with a hybrid peptide comprising thymosin beta4 and the lysine-rich region of cordon-bleu
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
370
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein/structural protein
total genus 123
structure length 356
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl8A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl8A03
3MDQA 2E1YA 3LL3A 4ISEA 5AQUA 1ATNA 1GLLO 1J6ZA 1JCGA 5KPRA 3UKRB 4XH1A 4RTFD 5EVZA 2EWSA 4PKIA 4BRQA 3MN9A 5TKYA 3EL2A 1RFQA 3VGMA 3ATVA 2ZF5O 5EY4A 4BG9A 3C7NB 3A5MC 3LDQA 3CJ7A 2HF3A 3ZETA 4H5VA 3B8AX 3CI5A 4I6MA 1BA0A 5KQDA 1X9JA 3LM9A 2BTFA 5AQGA 3HTVA 2GWKA 2V51B 4H0OA 3O80A 5BPNA 4K25A 4KBOA 3KVGA 1MDUB 4B1XB 2ASOA 5KQ8A 4BRDA 2FSNA 3D2EA 4CBXA 4FWKA 2FSKA 3I8BA 4J8FA 3MN5A 3G25A 2P9UA 2D0PA 3R6MA 4CZEA 4H5NA 3MCPA 1X3MA 3SLCA 1NLVA 2YJEA 3VETA 4PKHA 1ZC6A 3FZHA 1GLJO 1X3NA 1Z6RA 1XC3A 3GBTA 4BQLA 1H1VA 3A5LC 3JXUA 3LDOA 5FPDA 2E2QA 4K43A 2QWOA 4MLHA 4CD3A 5AQKA 4XEIA 4BR2A 3UE5A 3VEOA 3VGLA 2YHYA 3BF1A 2E1ZA 3QBXA 3H45C 1ZBSA 2NLXA 2P9SA 2A6AA 3TU5A 2CH6A 3R8EA 4CBWA 3MN7A 2HOEA 4FOIA 2ASPA 3LDLA 5BR9A 4JAXA 2HMPA 1JCFA 4FSVA 3MMVA 4QS7A 4BRMA 3DXKA 4CZHA 1SZ2A 2GTDA 3D7EO 2GELA 2P9NA 3L0QA 4JD2B 4CZJA 2E8AA 1NGHA 2P9LA 4BRAA 2Q97A 3A8YA 2A40A 3EKUA 3I33A 1NGJA 5ADXH 1HKCA 3FZFA 1YXQA 3RSEB 1GLBG 3O6WA 4BG8A 4YDUA 3JS6A 3WXJA 4YDUC 4B9QA 5JLHA 4FWQA 1BOTO 2CGKA 4CZFA 3C7NA 2CGJA 2Q36A 3H1QA 3DWLA 1NGDA 4BC2A 1WOQA 3OHRA 4BRPA 4BRGA 1G99A 3AY9A 4IXCA 4MO5A 4B1WB 3VEYA 3VESA 5AQPA 4FWRA 3AAQA 4CZGA 3A5NC 4PL8A 3WEEB 4BRLA 1NWKA 2QWQA 5KPZA 3H46O 1U2VB 5EX5A 4FWMA 1V4TA 1V4SA 1MA9B 2Q31A 4MLEA 3VOVA 4EFHA 3GG4A 2QWPA 3H3OB 1QHAA 1HUXA 4JNEA 2NZTA 2FF3B 1DEJA 4FPBA 4BGAA 1S3XA 3ZEUB 3DAWA 5LJWA 4JHDB 3BF3A 4WYBA 4BQZA 1CZAN 3UB5A 5AQHA 2AP1A 4JN4A 5FPEA 3M6GA 5AQZA 4EIAA 4BR0A 3GE1A 3HSCA 5BN8A 4GY2B 5AQSA 5F2RA 3EZWA 2OANA 4BVPA 4DB3A 1NGAA 2F9WA 3LM2A 2Q0UA 2P9IB 4BR9A 3QFUA 1BA1A 3WUHA 3WT0A 5B8HA 4FWPA 4H0VB 4JD2A 4QS9A 4B1ZA 2UYTA 4BR7A 4IWVA 5BRHA 1TYQB 2Q0RA 3FZLA 4HWIA 4E1JA 4BRCA 4H5WA 3GDQA 2P9PA 3CETA 3VEWA 3LDPA 1U6ZA 3L4IA 3VF4A 4IO8A 2VCPA 5AQYA 4H0PA 2F9TA 2NRHA 2P9KB 3DJCA 1DKGD 1WUAA 3D2FB 3FZMA 5LY3A 3IMXA 4C23A 2QM1A 1HLUA 3H1VX 1HX1A 3ZX3A 3WXIA 3CHWA 1IJJA 1IG8A 4A62A 1ATSA 4ISGA 3FLCO 3HBTA 5BPLA 1SAZA 2V52B 2I7PA 4CZLA 1NMDA 3F9MA 2GWJA 3CIPA 3ZX0A 4A2AA 2ITMA 4DCHA 3GL1A 2QWNA 1MWKA 4WQ5A 3U9ZA 4WQ5C 2IVOA 4ISFA 3WEEA 4GNIA 3MK6A 5AQFA 1U2VA 2V7YA 3UKUB 4M7XA 5JMVA 4FL9A 5BRDA 3AAPA 2FSJA 2WUSA 5AQVA 2YI1A 3IDHA 3FE1A 2YJFA 3EO3A 4EHTA 3DXMB 3J8AA 4EHUA 1HJOA 1KXPA 2ASMA 2A3ZA 4O5FA 1GLAG 3ZEUA 4A2BA 4JHDA 3UKRA 3VF6A 1QQOA 3ZETB 3EKSA 4BVOA 3FR0A 5AQJA 1EQYA 3QDKA 2V7ZA 4O8KA 2YCHA 2KHOA 2FF6A 3VENA 1LCUA 3A0IX 5AR0A 1BU6O 4M7YA 2GEMA 2A41A 3O8MA 3IFRA 2CGLA 4L3QA 4AM7A 5AZIB 1XQSC 4CZMA 3O1WA 3WXLA 4CJ7A 2P9IA 1K8KB 1ZXOA 4FWNA 4PKGA 4BGBA 3P4IA 4H0XB 4H03B 4M63C 1BO5O 3VEVA 2H3GX 1TUYA 2A42A 2E20A 1TYQA 1KAZA 3CJBA 3L6QA 3A5OC 5AQWA 3SK3A 4XH4A 5FPMA 4BC5A 1YAGA 2W41A 2BUPA 4AM6A 2P9KA 2QWMA 3D2FA 2YHXA 2E2PA 5JLFA 2E2NA 1C0GA 2D1KA 3CQYA 3GOIA 3ULEB 1GLFO 2QWRA 2P9SB 2Q2RA 5AQLA 2VYPA 5AFUH 3BUZB 2IIRA 4IJNA 3U4LA 2D0OA 4FO0A 5AQNA 1TUUA 1E4FT 3U9DA 3W0LA 5AQRA 2FXUA 2P9LB 5AQIA 1HPMA 1SQKA 3HI0A 3ATUA 4DHYA 1BG3A 2IVPA 1BDGA 3UKUA 5E84A 3WQUA 2A5XA 3O4WA 4RWTA 4RCHA 3SJHA 4FPAA 3QBWA 2YHWA 4XH5A 1D4XA 5BRFA 3DXMA 2QWLA 3S41A 5AQXA 3EN9A 2HF4A 5FPNA 5BN9A 3VEZA 3WXKA 3SMSA 3RSEA 2FLOA 4H5TA 5F1XA 4NB4A 5JICA 1QQMA 4BRFA 1NGBA 3VPZA 1BUPA 3QFPA 1OKJA 4BREA 3M3ZA 3O5BA 4LC9B 5AZJB 5AZIA 1DGKN 3ENHA 4CD1A 5CE3A 1R59O 1Y64A 4BR5A 5BPMA 2Q1NA 5LJVA 1HKGA 2W40A 1K8KA 4K41A 4QS8A 1E4GT 1XUPO 3MN6A 1HKBA 2QXLA 4BRHA 4BC4A 2I7NA 3VERA 3ENOA 4PL7A 4NO7A 1GLEG 3H6EA 3CJAA 2QW9A 3KHYA 2CH5A 5F0XA 3HM8A 1KAXA 1RGIA 1C0FA 4MO4A 4BRNA 5AQMA 3M1FA 5EOYA 1T6DA 1T44A 3BEXA 3H3NO 4CZIA 5ELZA 3VF2A 1NM1A 1YVNA 3FFKB 4BR4A 4H0TB 1Q18A 1KAYA 1LOTB 5AQOA 1NBWA 2AA4A 3VEXA 2D4WA 4BC3A 3WQTA 2E88A 3ULEA 2J4RA 3ID8A 5AQTA 4DQ8A 4F9OA 2PBDA 1ATRA 3QMLA 4I6MB 5ADXA 4FOEA 1P8ZA 3QB0A 3BP8A 1NGCA 3CJ9A 4H0YB 3FGUA 2IVNA 4FWSA 3ZX2A 4FWOA 4BRKA 2P9PB 4B1UB 2VWBA 3O1BA 5E26A 3D2EB 5KPTA 1JCEA 1ESVA 1MWMA 1QZ6A 3CERA 3CQXA 3SMPA 1GLCG 4CZKA 1QZ5A 2P9UB 4Z94A 4FWLA 4EAHD 2GUPA 3TPQA 1NGEA 3W3DA 4BRIA 1BWFO 3C0BA 1NGIA 2ZGYA 5AQQA 4B1YB 1S22A 4Y0WA 5EXWA 3HZ6A 4K42A 3AARA 3KZBA 5I9EB 5AZJA 4IZ9A 3VGKA 4IJAA 3IUCA 1NGGA 3CJCA 4WQ4A 3QICA 4CBUA 4WQ4C 5BREA 1GLDG 2DPNA 1YUWA 4BROA 1NGFA 1T6CA 2E2OA 3DXKB 3FZKA 4H5RA 4A61A 1Z05A 2ZGZA 3LDNA 4CI6A 5AFUA 4HTLA 2P9NB 3O08A 3U8XA 3CJ1A 2ZWHA 2PAVA 3R9PA 4B1VA 1QQNA 1RDWX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENBA 5AQUA 1ATNA 4CJWA 3UKRB 4RTFD 3AVCA 3T1AA 3E01A 1NK7A 3VGMA 3IKMA 4O5BA 4WFNL 3J80O 3I56N 1S6QA 4PHTX 2XY6A 3A5MC 4JKCA 2HF3A 4H5VA 2NUBA 3AVFA 5KQDA 4FLUA 4LSNA 1S5JA 3SUPA 2HNDA 3HTVA 4M42A 4B9TA 1JXBA 4C8OA 5CYMA 4K25A 5M1KA 4ZTFA 4DTUA 1JLEA 2P51A 3D2EA 4CBXA 3ULDA 4FLVA 4HCBA 3MN5A 5GIOA 5A2QO 4CEEA 3NF8A 3MCPA 4DQPA 2XRIA 2DFEA 3QNNA 1BCMA 4HVJA 5I42A 4B3OA 2C1GA 3ZSRA 3LDOA 2W6KA 4K43A 4Z4CA 3C6AA 4BR2A 3VEOA 3EE8A 2YHYA 4FW2A 3VQQA 1RNHA 3AVLA 4CEAA 2P9SA 3C94A 4I9QA 4LD0A 2CH6A 4CBWA 4FOIA 3V81A 4JAXA 4FSVA 3C65A 4BRMA 4CZHA 3PY8A 1W97L 3L0QA 3TAPA 2RF2A 4L8RB 3AO1A 1NK8A 1VSEA 2P9LA 3DLHA 3CCMN 2I5JA 2Q97A 3NGZA 3FFIA 3MEDA 3I33A 3PX4A 1NGJA 1NK0A 3ZT1A 3FZFA 1YJNN 1Y97A 4ZTJA 2VGMA 4IDHA 4A57A 3MECA 1N8RO 2E5LK 2Z1HA 4LFAK 4JKDA 1YHQN 5C25A 3C7NA 2HHIA 3CFPA 2Q36A 4OX9K 2WBNA 4PY5A 2KKZA 2GX9A 1J9AA 1IKVA 1JLGA 4BRGA 4IXCA 1QVGM 3MEGA 1QVFM 3VESA 4NYNA 5AQPA 3WXMB 4CZGA 2E6MA 2YNFA 3A5NC 4GW6A 3T69A 3O9SA 5J2PA 1V4SA 2Q31A 4KTQA 3VOVA 1WSGA 4KAZA 1I39A 1XHZA 4JNEA 5HRNA 3K9KA 3PSIA 4JKGB 1DEJA 3K0SA 3PX0A 1T05A 1U49A 1K73O 2YHBA 5I3UA 4BE7B 4JN4A 1YJ9N 3M6GA 3V1RA 1VQON 1G15A 4CJ3A 1B9FA 3VQAA 2OANA 5DMRA 1NGAA 1L3UA 4ICLA 2Q0UA 3QFUA 1NKCA 3QEVA 5SZTA 1DT9A 3BGRA 4PUOA 2UYTA 2HBJA 3E9OA 4BR7A 4CF2A 5JENA 1TKTA 4IWVA 2G8HA 2Q0RA 4E1JA 4BRCA 4CJKA 3AO5A 2O8FA 1RTDA 4WFAL 4C8LA 5EU7A 4IO8A 2IC3A 2VQFK 3NMUA 4HCCA 4GKJK 2P9KB 2QXFA 1XNRK 3D2FB 3OYBA 3TTCA 1J53A 3ZT2A 1KSPA 4Y1CA 1U04A 3BDPA 1IJJA 4W5QA 1ATSA 4K8ZA 3HBTA 1TKDA 1CXQA 5D3GA 1HJRA 2I7PA 3RMAA 4DQQA 3J7ZO 3QETA 2GWJA 4UY8O 4DCHA 2QWNA 4WQ5A 4B9VA 1QE1A 2WC9A 4CF0A 3P1GA 4ISFA 3VQ8A 2V7YA 1N34K 1XI1A 5BRDA 3AAPA 5JVGL 3CM6A 2YJFA 3EO3A 4FLTA 1LWFA 3DXMB 1YJWN 1YIJN 3VQ4A 1HJOA 4CEDA 1EO1A 1TGOA 3TSPA 3ZEUA 1GLAG 4JHDA 3UKRA 3VF6A 4CGFA 3ZETB 4BVOA 3FR0A 3QDKA 4O8KA 3RVCA 1OH6A 5KTQA 4FLYA 3VQ6A 4DTRA 5AR0A 2GEMA 2A41A 5AZIB 4JLHA 3WXLA 4W5OA 1K8KB 1BL3A 1IV0A 1QSSA 2HNZA 4JRPA 1BO5O 4DR2K 3VEVA 2OZSA 4N76A 4FLWA 4NCGA 3ZSOA 2E20A 1TYQA 1KAZA 3Q7BA 2QKKA 3U6FA 3A5OC 1XNQK 1REVA 4DFMA 5FPMA 3P38A 1BQMA 3SV4A 1YAGA 2X6SA 2GUIA 1K9MO 2YHXA 1Z26A 2W6LA 3OYLA 1C0GA 1BI4A 1NK6A 2FBXA 3F2KA 4JI4K 1HR0K 3HPOA 5AQLA 3SUNA 5M1PA 1YTUA 3DYAA 3PSFA 3DLGA 5AFUH 1VQPN 4FJXA 2DFHA 2GV9A 4LH5A 1TUUA 3QINA 4DUYK 5SWMA 1VQ4N 5J2NA 2FXUA 5AQIA 1HPMA 5BR8K 1HPZA 1BG3A 2OPPA 1BDGA 3HRGA 3ZCMA 3WNHA 1SKRA 3DM2A 1WAJA 3O4WA 4RWTA 1NKEA 4KKOA 3SV3A 3NH2A 2YHWA 5FPNA 1SS6A 2FLOA 2YHAA 1QQMA 4CHPA 2VG6A 3SAGA 4YOTA 5C42A 1KVCA 4RG8A 4CHOA 3O5BA 3OS1A 5MLCQ 2YNGA 3K5NA 1VQ5N 2XY8A 4JI1K 1VRUA 4M3WA 4AF1A 1JLQA 2Y1IA 5DM6L 2QXLA 4BC4A 2O4IA 2KW4A 2W42A 3KHYA 3O3HA 3CJAA 5F0XA 4YOYA 1K6YA 1C0FA 3ZLJA 3BEXA 2D5RA 5CZ1A 1NM1A 1RBSA 4WE1A 3QERA 1KAYA 4JKGA 5LMUK 4F9OA 3V6DA 3QMLA 5ADXA 2OYQA 1LWEA 4M45A 4DSJA 3QB0A 4N41A 5GIPA 2ZM6K 3CFRA 2Y1JA 2YNIA 2WTUA 4ELVA 4KHQA 4DR4K 1GOCA 2IVNA 1VSLA 1A5XA 2B5JA 4U7BA 1MU2A 3D2EB 3T1YK 5KI6A 4CHYA 2DY4A 1QZ5A 3SUOA 2NRZA 3TPQA 1NGEA 3NAEA 4M3XA 2HHSA 3C0BA 4DSLA 4LH4A 3L2RA 4KHYA 4FM0A 4X65K 3AARA 4N56A 3P31A 3S3MA 1Q9XA 2HBKA 5AJ3K 1XC9A 2HHVA 5AZJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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