4POMA

Crystal structures of thioredoxin with mesna at 1.85a resolution
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
GTMVKQIESKTAFQKALKAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKKKLEATINKLV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title BNP7787 Forms Novel Covalent Adducts on Human Thioredoxin and Modulates Thioredoxin Activity
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4pomA00
2VCVA 1O7UA 4MH2A 3G7JA 3TB2A 4GTUA 4J2FA 4ZXGA 4X0XA 2RM5A 1B4QA 1O81A 1CQHA 2M72A 4LLRA 1XW5A 5F0GA 1X0RA 3FK8A 3TOTA 3US3A 2PWJA 3ME8A 1SENA 2C0EA 2A4VA 2DJKA 4I97A 3R2QA 2DMLA 4EDYA 3N5OA 1JZOA 2YWIA 1R5PA 2VOCA 1ERTA 1WOUA 2GGTA 5L71A 2LTKA 3GUSA 3DXBA 3C1RA 2H19A 1PN9A 1VF3A 2CV4A 4DEJA 4IQ1A 4N11A 5LD0A 1QXHA 2H76A 4E8HA 4MPFA 1YZXA 4RUVA 2PERA 2H0HA 2HFDA 3LYKA 3GMFA 1M2AA 2CA8A 3L9SA 4MF7A 1EGOA 4G19A 3RDWA 2RIIA 1GSDA 3G7YA 2YJ7A 1I5GA 3HXSA 4POMA 4EUYA 3FHKA 1PL2A 1SYXA 3A2VA 4HJMA 4N0ZA 1ZGNA 3IE3A 3TJFA 3VLNA 4F2IA 4AGSA 2H75A 3GHAA 4DSRA 1TKDB 3RPNA 2EIRA 2N5FA 2GSTA 11GSA 2HZEA 3TRPA 2H6YA 2CVDA 2H74A 3ZFLA 1KEBA 2NPBA 3CYNA 1XW9A 4TR0A 4N0VA 5ECIB 1GNEA 4ZBDA 4NWYA 4WF4A 1F2EA 2K8VA 3IC4A 2OA7A 2YP6A 17GSA 4GRFA 5AIVA 5JWQB 4BA7A 1E2YA 4Q5RA 3DYRA 5ENUA 4K7OA 4QL9A 1SK1A 2HXKA 2VD0A 4K7NA 4V1Ag 4YQVA 2FWHA 2I9HA 3HA9A 1OC8A 1QGVA 2R6KA 1FHEA 1X5CA 1TRUA 3ME7A 2VIMA 1TI1A 2HI7A 2VAFA 3TKRA 4L0WA 4HQSA 3KXOA 1YJ6A 2OE3A 3WYWA 2F8FA 1GSYA 1YEXA 4KCAA 2GQLA 2O7KA 3RHBA 2IJYA 1AC1A 1IYHA 3GH6A 4G9HA 4MDCA 2MBSA 3LSZA 2P5RA 4KUNA 4DSSB 3J7Yb 3DKSA 2VO4A 4ML1A 3FR3A 3KM6A 3F8UA 4TXOA 1X9WB 5KN1A 4BWSA 1R4WA 1XBSA 3U6VA 1S3CA 1PX6A 6GSTA 3IV4A 5B8BA 4TR1A 2WDUA 3BCKA 5H5RA 4DVCA 1DE2A 2ON5A 3NOFA 3TKSC 1WPIA 4XHMA 3PH9A 3TCOA 3DVWA 3IK7A 3GTUA 4V2MA 1ZYQB 1GUKA 2P5QA 4FYBA 4TXVA 4WKWA 3KCMA 5CYYA 2HSHA 3DWVA 4AF2A 1DUGA 5D73A 3CBUA 1BAYA 1GSEA 2AYTA 4YAPA 4YQMA 2C3QA 4ISDA 2V1MA 4I2TA 3U5RE 1TU7A 1T1VA 3UL3A 4HOJA 1MDIA 1XW6A 1VRSD 2OBKA 2A2RA 2BMXA 3EU4A 3EINA 1UA5A 5ECOB 3RHCA 1K0OA 2RM6A 1T4ZA 1F9MA 3E9JB 1Z3EA 3TJJA 2OACA 3IDVA 3ZITA 5LCZA 2WCIA 6GSVA 3ZIJA 5DQYA 2X99A 3F4TA 3P2AA 3TOUA 3ZTLA 5JWOB 1C72A 2EIOA 3O76A 1R5AA 4XS4A 3UEMA 2CVBA 4JEDA 2AJQB 3I43A 1V58A 3CRUA 3CXGA 1Z7PA 2YJHA 4IELA 4HUAA 1MEKA 3QPMA 5F05A 4XRDA 4EXJA 1Q98A 1U88A 4GXZA 1B8XA 2O85A 3SWLA 5ELAA 1XWCA 2MMNA 3TKQA 3EMXA 4IN0A 3LXZA 3EVIA 2DJ1A 4GQCA 5ID2A 2EIQA 1OAZA 1FG4A 5EL8A 2O8VB 4H86A 5CRGA 3D22A 3I6AA 3O6TA 4HZ2A 5IPHA 5J5NA 3KP9A 3C71A 4OMVA 3FZAA 1K3LA 3IHQA 1Q4JA 2J23A 3CRTA 3G7IA 1MDKA 2YV7A 5AN1A 1GP1A 3QCPA 1GUHA 1SD8A 2H30A 3VI5A 1X9SB 1USBA 2L6DA 5HR1A 3CSHA 2IN3A 2FLSA 1WJKA 2CX3A 2PUKC 1GSSA 4EL1A 1O6JA 2C4JA 4GSTA 4ZILA 1ON4A 5DCHA 1A8YA 3Q74A 4PXOA 3D4TA 1JZRA 2IMKA 5A4WA 3JCML 5IIZA 2Z9SA 4HEA2 6GSWA 4J56E 2CX4A 4RQXA 4HU9A 2GT5A 2E2MA 4NMUA 4EDZA 1PL1A 3P7XA 2I4AA 2GZYA 5GAPD 1SKWB 4HZ4A 2GQKA 1GULA 2B3SA 3GX8A 2VM2A 1J0FA 4KGIA 3HHVA 1Z6MA 2F3MA 2DLXA 4IGJA 3KZQA 5IMVA 1XFLA 2YOIA 4OFTA 1ERVA 2FWFA 5DVBA 3TJBA 2LS5A 5H5SA 4QL7A 1JZDA 4XTSA 2R37A 3VWVA 1YQ1A 3HDCA 4K0NA 1GTAA 5AISA 3F6DA 2EC4A 4F82A 1T8EB 3QAWA 4FH8A 1BQ7A 3IAM2 4Z7XA 5C04A 1KNGA 3QAGA 5J9BA 4WBRD 1TW9A 5DAKA 4GWRA 4MP4A 1TOFA 2CQ9A 5F07A 4ZL9A 1N8JA 3QAVA 2GSQA 2ES7A 3E0UA 3H4KA 1SKSB 5AIXA 3M0FA 2GVPA 2RLIA 2ZNMA 1B9XC 2H1BA 2H66A 1M99A 2PPTA 4WR4A 3ZVJA 1YDKA 1BX9A 4XS1A 5KEJA 4F9ZA 2O87A 3F4RA 4KDUA 1M2BA 3ZL5A 3IR4A 2ZUPA 1F3BA 4J57E 5IMDA 1OKDA 2VLVA 4GQFA 2F9SA 3DEXA 1AQXA 1GNWA 1G6YA 1I9DA 3UVTA 2HSYA 5JCWA 2DIYA 1A0RP 1YKCA 3VI7A 5DJMA 4EKZA 2G2QA 2JADA 3MDKA 3TGZA 1PGTA 3PGTA 3CSIA 1KTEA 1GLPA 2YPMA 1A8LA 3GKKA 3W8JA 2H1AA 3D6IA 4K2DA 3L9VA 2QKEA 4TR1B 4E8EA 2YWMA 1OE7A 3LQ7A 1GLQA 1OC9A 1THXA 3PINA 1ZL9A 2QSIA 2K18A 1F37A 2MMOA 3GURA 5GZZB 2MMZA 4JU5A 2HLSA 1SU9A 4RI6A 5D9TA 1URMA 3GTUB 2LJKA 1S3DA 4IS0A 3EC3A 2GT6A 4FIWA 2YZHA 1GWCA 2P31A 2C8UA 1W89A 2LNSA 1PRXA 4BL7A 3A5WA 3PR8A 4ZIJA 4TOPA 1ML6A 5INYA 3IAS2 3KP8A 5HR3A 2XPDA 2A2SA 4GLTA 4L8EA 4IW9A 3APSA 1FVKA 5DBQA 3DGQA 2YWOA 4TN8A 2HNLA 3GKMA 3KGKA 2NDOA 2B5YA 3M1GA 1K0NA 1AQVA 4MJAA 3QMXA 2WRTA 1DBYA 3EWLA 2OKAA 2AB6A 3W8SA 2F51A 2H01A 1SYRA 2OJLA 3GL3A 4WXTA 4MJCA 1HNAA 1GSUA 1A24A 3ZMLA 4BPYA 4G10A 1F3AA 2LJRA 1SL1B 4ZBBA 1TRVA 4WETA 4IHUA 2V32A 5EVOA 3LFLA 3LYPA 2DJ2A 1A0FA 3ZIVA 2R4VA 6GSUA 2H73A 3GL5A 1VGLA 2E7PA 3P90A 5LNKe 2XBIA 1A2JA 5IO0A 1J9BA 4YQUA 3F63A 3OR5A 1K0AA 1PD21 2PGTA 3RBTA 3A2WA 2VUPA 4PQIA 1EV9A 2LEGA 2GLRA 1OYJA 2V6OA 3IBHA 2V2GA 2E0QA 5IMAA 4KNDA 2JZSA 2I81A 4V2NA 3HVSA 7GSSA 1K0BA 1GTUA 2DSAA 5IMZA 1PMTA 4MH3A 3WGXA 2WGRA 1WWJA 4KH7A 2I1UA 5IO2A 5GSSA 3APOA 2B7KA 3W6GA 1BYEA 2V41A 2MMAA 1XOBA 4ACSA 5J3RA 4XRAA 4EF0A 2VLTA 4NXIA 4HS1A 3D5JA 1WE0A 4OFMA 3KMNA 1M0UA 3H1NA 3HJPA 3ZMKA 2M46A 2HT9A 2WZ9A 1V9WA 4L5OA 3ZREA 2FUG2 3C73A 4ZB6A 1GSFA 4ECCA 3GX0A 1SJIA 1B48A 2FWEA 5CREA 1G0TA 3IOSA 3F3QA 2CZ3A 3FYGA 2AV4A 3VFIA 4OO4A 2C80A 1FB6A 3VWWA 5D9VA 5G1KA 2H70A 2LNTA 2FGXA 1PQNA 3L9UA 4GSSA 1JZWA 2IMEA 3BJ5A 1NHOA 2KOKA 1LBKA 5HR2A 1TRWA 4ULXA 2DJ0A 1OVNA 1XWGA 2WS2A 3FZ9A 3QFBC 3VPQA 4L0UA 4K9ZA 2VCXA 5CRHA 2YCDA 3ERWA 1NW2A 4DSQA 4K0GA 2FA4A 5FHIA 4X43A 4JR4A 1K3OA 4GF0A 5GAND 1Z6NA 3H93A 1X5DA 1LU4A 4JBBA 3UAPA 1JHBA 1TJDA 3G9BA 13GSA 6GSXA 1J08A 4EO3A 4IP6A 3UMAA 1W4VA 4K1FA 4MZBA 1GUMA 5CO3A 2KP2A 2GSRA 3TKSE 3GYKA 2VM1A 2AUVA 4YAVA 2L59A 5ECMB 4MCUA 5GSTA 1EV4A 3EE2A 4Q5FA 1ZYEA 4KCEA 2OADA 3L4NA 5ECNB 2VLUA 5E59A 2CAQA 1SJZA 3WGDA 5CNWA 2IIYA 1E6BA 5G5FA 1Z7RA 2FA8A 1SL0B 4O32A 1YF0A 1X5EA 5AGYA 3C1SA 4KA0A 1R26A 1ZCPA 1XOAA 1M7TA 1V98A 3QDNA 2LQQA 4I8BA 4LL1B 4G2EA 4MZWA 4IVFA 2GDRA 1MD3A 1TTZA 4LL4B 2L4QA 5D9XA 3APQA 3MWHA 1HQOA 1OC9B 2HYXA 4FYUA 1UN2A 2PMTA 4POKA 1HNBA 4EC0A 2JZRA 4TR3A 3WGEA 3UARA 4AJ6A 3VURA 4D73A 1VF4A 1TRSA 3TRXA 1U6TA 3ERGA 3KMOA 3CTFA 4JR6A 1N2AA 1V40A 1ERUA 1ST9A 3ISOA 2RUFA 4IQAA 3V1WA 1OKTA 2IFQA 2XHFA 4X1UA 4ZL8A 1GTIA 3HZ8A 3N9JA 4IP1A 2E2GA 1HD2A 3M9KA 2CAIA 4TKYA 1XWKA 3HCZA 4MF6A 4IJIA 2C3TA 3ZFBA 3GH9A 4I6XA 2LRTA 4DSSA 1AW9A 2NBSA 3KEBA 3D4MA 1ZOFA 3KH7A 2CZ2A 5IPGA 1O8WA 1EOHA 1EOGA 5A4VA 5ELGA 3Q18A 2WFCA 2H6ZA 4MK3A 5G1LA 4K8MA 4V2LA 3UIWA 1TI3A 2H1GA 3L78A 2JZTA 3NZNA 6GSSA 2FWGA 2GQMA 1SKRB 2GSSA 2YNXA 2C0FA 1G7OA 4MZCA 3HJMA 2XBQA 2HZEB 4QQ7A 1T4YA 2ZCTA 3BBYA 3FZ4A 1FAAA 4O92A 2PU9C 2AAWA 4CW9A 4JZQA 4PQHA 3QR6A 3NIVA 5DALA 2H0IA 4P3YB 1EWXA 3AY8A 1WMJA 3FKFA 4ILFA 2P0GA 1O85A 4O5RA 3F3RA 1QUWA 3ED3A 2OE1A 3LORA 3ZLPA 3BCIA 3C7MA 5ABRA 2DIZA 4I2UA 2JL4A 5JWRB 1K0CA 3DD3A 3GIXA 2DBCA 2NVLA 4KB3A 4RI7A 4ML6A 1XVQA 4MJEA 5ECSA 4N10A 4HQZA 2PBJA 1XPVA 2HRNA 1PA3A 2OE0A 2J9HA 1MDJA 2MZCA 4F0CA 4CHSA 4HU7A 2LJAA 1OE8A 2LUSA 5JCGA 4LMVA 10GSA 2H6XA 1HNCA 1ILOA 4ECBA 3F0IA 2KP1A 1XVWA 5H5QA 1T7PB 4ZBAA 1PSQA 2K9FA 4GCIA 1VF1A 2H71A 1M2DA 3TJKA 3QFAC 4PUFC 4TXOB 4BVYA 4EE0A 5B6NA 5IOXA 2PN8A 3TKPA 3TKSA 2C1YA 1ERWA 2VCQA 2HE3A 3HKRA 3A3TA 5IQYA 4NV5A 3K8NA 4Q5QA 3C8EA 1EP7A 5HQPA 1Z9HA 1SK0A 2PVQA 2R2JA 3CMIA 2K8SA 8GSSA 3LJRA 3KIJA 1DE1A 4GSNA 3M9JA 4KX4A 1X9MB 2LKUA 5ECHB 4KDXA 2YV9A 2WJUA 3LG6A 4RQRA 2IMIA 1F6MC 3WT2A 3QOUA 2X64A 1NM3A 2VL3A 4ID0A 3DIEA 3M3MA 4OD7A 3FEUA 1EZKA 3LWAA 5DQSA 4POLA 3CTGA 3KTBA 2REMA 3Q19A 1CQGA 5IM9A 3TJGA 1T00A 2YANA 3DMLA 4F0BA 2G0FA 3FRCA 4OFNA 1THOA 5D8IA 2CT6A 1BEDA 1EEMA 3WT1A 1U3IA 2LRCA 3A2XA 2M80A 1A2LA 2GS3A 3IPZA 12GSA 5IMCA 3DRNA 5EY6A 3UBKA 1MD4A 5G2ZA 2C0DA 3EMPA 3GV1A 3IRAA 4K6XA 4XS4B 2RUEA 4HDEA 3ZVJD 4IJ3A 2L57A 2L6CA 3GA4A 1JLVA 3MNGA 3HD5A 1TK0B 1YF1A 3MAKA 1JLWA 2DJJA 2KHPA 1Y25A 5A4UA 2IMDA 3HVVA 3GSSA 3EURA 2JSYA 4KW6A 3F6FA 4ZB9A 1PX7A 2JU5A 2WULA 18GSA 4OWYA 4TW5A 3IA1A 5KN0A 3KJYA 3BOAA 4IKHA 1EP8A 5ID2B 2B6MA 3GKNA 2C0GA 1V2AA 1S3AA 5FT3A 2L5OA 4D73B 3HVXA 5J41A 14GSA 4OCEA 1BG5A 2OBIA 4MLYA 2R3XA 4V1Ap 5HR0A 1NSWA 4XS6A 3UJ1A 5KN2A 2VL2C 3F4SA 2WB9A 2IFQB 1O8XA 1QQ2A 3KTLA 2LQOA 1GL8A 1YKAA 4XCSA 2ALBA 2H0GA 4TRXA 1WIKA 2XPEA 5J4UA 4PNGA 5D96A 1M9BA 2TRCP 1NHYA 1XZOA 1A23A 3H8QA 3RAZA 2N5BA 1EGRA 2VL9A 1AXDA 5CP1A 5B8AA 1GRXA 1T3BA 3VK9A 3VPTA 4LMWA 4MMMA 5DDLA 4PQ1A 1MTCA 2DC5A 2FY6A 5DCGA 5HFKA 2HZFA 1A2MA 3Q6OA 4NHWA 4AJ7A 4HI7A 5D93A 1WP0A 2FHEA 5IMFA 4LA1A 2K6VA 4NHZA 1SD9A 2X8HA 1HYUA 1G6WA 1ACVA 2DJ3A 1FOVA 5COHA 2FCHA 2JACA 1H4OA 5DALB 22GSA 3FW2A 4WF5A 2VD1A 1KBNA 3S9FA 2H8LA 3WD6A 2FD3A 2LRNA 2DMMA 5F06A 1ZMAA 4AJ8A 2HRFA 2D2ZA 4MPGA 3ZRDA 5CAXA 2TRXA 2BTOT 5DAKB 2R5GA 2YWNA 3ZYWA 1BJXA 2H1DA 3GKXA 3GNJA 4JE1A 3VWXA 2JSZA 1FW1A 4F03A 2F8AA 4MF5A 4KAEA 1M9AA 4EVMA 1K0MA 1PKWA 4OCFA 4ECIA 5G31A 2MBTA 1Z5YE 2VCZA 2IMFA 5HFGA 3EU3A 3CSJA 2H72A 5A5KA 1UVZA 4WEYA 1QMVA 3O3TA 2IWTA 3QD9A 1WRYA 3TDGA 2NTOA 4MJBA 4WR5A 2C3NA 2L5LA 4POBA 4O7HA 3FR6A 3ERFA 3FZ5A 4FO5A 3ZZXA 3H79A 1GH2A 3EYTA 4NPBA 2I3YA 2GZPA 1OC3A 1XCCA 4N30A 1EEJA 1ABAA 1RK4A 2QGVA 1QFNA 3HY2A 5J9CA 3M8NA 1U3AA 5EPFA 3KD0A 3GN3A 2B1LA 1TK5B 4ZL7A 2LV3A 4TVEA 5B6MA 4KSOA 4MA9A 3HYPA 1TK8B 1XIYA 5C00A 5F8BA 2V6KA 5B7CA 1AIUA 4I5QA 5HFIA 5ECKB 5D9WA 5E4WA 1AUCA 1SL2B 4WBJA 3FY7A 2N5AA 5ECQB 4BVXA 3LGCA 5KN3A 1LJRA 5JCUA 3VWUA 3LEFA 1QK8A 1VF2A 1V57A 2FNOA 4L5LA 4PGTA 4NAXA 16GSA 5ECRB 3IK9A 3D21A 4ECJA 2YN1A 1FB0A 2KLXA 1B9YC 3P8WA 5CRDA 2KUCA 1K3YA 2IPAA 1Y6EA 1ZZYA 19GSA 3BD2A 1G7EA 1DSBA 1TU8A 3UOMA 2LSTA 9GSSA 2MYGA 5G30A 4HJ2A 3IXRA 2B5XA 1TDIA 1FVJA 6GSYA 4ZB8A 1RQMA 4OO5A 3I69A 2X8CA 5CRWA 4FYCA 1YY7A 2XC2A 4K7IA 3UBLA 3GFKA 1UC7A 1U87A 3I9V2 5G5EA 2ON7A 5FWGA 2B1KA 1RW1A 1XWAA 1PKZA 5IOWA 2O89A 4PUAA 1B4PA 1JFUA 2L4CA 5DJLA 3GSTA 3KH9A 2CVKA 4PURA 4PNFA 1TXXA 2BJXA 3J7Yk 2B5EA 4KDYA 3GRXA 4CDOA 1R7HA 4IBPA 4XIHA 2B7JA 3TRQA 3DVXA 5ECPB 4JRRA 1FO5A 2X8GA 1IYIA 4TR4A 3SBCA 2VL2A 3TUEA 4BWQA 1GSQA 4KE3A 2VCTA 4NV2A 1H75A 1SK2A 3FR9A 3HZ4A 1K0DA 2AHEA 5ECLB 2VCWA 3HJOA 2GZZA 2GTUA 3RPPA 20GSA 1SJ6A 1AAZA 1YEPA 2TIRA 3UVHA 4Q5NA 2IL3A 4KSMA 1XXUA 4PX1A 1AQWA 4MABA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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