The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
37
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
b'GTMVKQIESKTAFQKALKAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKKKLEATINKLV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Thioredoxin
|
| publication title |
BNP7787 Forms Novel Covalent
Adducts on Human Thioredoxin
and Modulates Thioredoxin
Activity
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Oxidoreductase
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| total genus |
37
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00085 | Thioredoxin | Thioredoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BAY A; 1BQ7 A; 3TJJ A; 3APO A; 5G1K A; 4BWS A; 4IEL A; 5GAN D; 2GSS A; 3L9V A; 3CSI A; 3UVT A; 3EC3 A; 4BVY A; 2AJQ B; 3LYP A; 3HY2 A; 2DIZ A; 4XS4 A; 3FR9 A; 2LJA A; 2V1M A; 5HFI A; 3ERW A; 3CBU A; 3CTG A; 4EDZ A; 1TOF A; 3LSZ A; 2QKE A; 2GT5 A; 4OO5 A; 3U6V A; 3HVV A; 1M9A A; 3FYG A; 4O7H A; 5GST A; 2OKA A; 3EE2 A; 4ZL8 A; 1HQO A; 14GS A; 2WCI A; 1NM3 A; 2M80 A; 4PQH A; 1R5A A; 3CYN A; 3GX0 A; 4KDX A; 5G31 A; 1DE2 A; 3HKR A; 5AN1 A; 3ZVJ D; 4MPF A; 1O8X A; 3HZ4 A; 1R26 A; 4PNF A; 4HS1 A; 5A5K A; 1GRX A; 3VPQ A; 2CVB A; 4IJ3 A; 3DIE A; 3Q74 A; 3UOM A; 2XHF A; 4LMW A; 1K3L A; 2QSI A; 3FY7 A; 1PRX A; 1XWB A; 2DJ1 A; 3A2V A; 4WET A; 1S3A A; 2H72 A; 2YNX A; 2H73 A; 4ISD A; 1Z9H A; 3ZIV A; 1YJ6 A; 3FEU A; 2H66 A; 1GUL A; 3TB2 A; 4JRR A; 3S9F A; 3TJB A; 2TIR A; 5DAK A; 4TW5 A; 4XRA A; 3ZTL A; 2B5X A; 2IIY A; 2DIY A; 1PX7 A; 5D73 A; 2PWJ A; 4EO3 A; 1GUK A; 3HHV A; 2B6M A; 1YY7 A; 2LS5 A; 2C0D A; 3IC4 A; 2ON5 A; 4HEA 2; 5A4U A; 5IMA A; 4D73 B; 3EWL A; 5LNK e; 3F63 A; 4Q5F A; 5CNW A; 4P3Y B; 1T7P B; 1FAA A; 4GWR A; 4ZBD A; 4AJ7 A; 1KTE A; 2YP6 A; 4POK A; 3L78 A; 1B9X C; 1XW5 A; 3F6D A; 2B7K A; 2H1D A; 3MSZ A; 2VOC A; 4TR1 B; 6GSY A; 2L57 A; 1VRS D; 1YEP A; 1IYI A; 3L9U A; 3G7Y A; 3HA9 A; 3P2A A; 2WFC A; 4MF7 A; 2F9S A; 3QCP A; 1ZZY A; 3NOF A; 3BOA A; 3TUE A; 4I2T A; 4JE1 A; 4OFT A; 3PIN A; 1URM A; 2IMF A; 3HYP A; 4RQR A; 5GSS A; 4V2M A; 3J7Y k; 2IME A; 2VD1 A; 2IWT A; 3PGT A; 1KEB A; 5A4W A; 1W4V A; 2FWH A; 4MAB A; 5G1L A; 3DVW A; 2IMD A; 2CVD A; 3HVX A; 4HUA A; 1T8E B; 4PUR A; 1PL1 A; 2O8V B; 2OBI A; 1A0R P; 1M9B A; 4V1A g; 2H6X A; 3I43 A; 1TRV A; 2HRN A; 1PKW A; 3H8Q A; 2RII A; 4EC0 A; 2CZ2 A; 1PQN A; 1XW9 A; 1JZO A; 2FNO A; 4KE3 A; 1M2B A; 4ZIL A; 3H93 A; 1PMT A; 2C3Q A; 3US3 A; 5ECM B; 2OAC A; 9GSS A; 4MZB A; 5J9B A; 4Q5R A; 3UMA A; 3F9U A; 1TJD A; 4ZB8 A; 2J9H A; 3VWU A; 1BJX A; 3HJP A; 2CVK A; 4F0B A; 2LNS A; 2MMZ A; 4TR4 A; 4N11 A; 5GAP D; 2GVP A; 2HZE A; 5COH A; 3L0H A; 4IVF A; 2MMA A; 3GN3 A; 4XTS A; 3ZLP A; 2Z9S A; 1SK1 A; 2AHE A; 5F07 A; 2H6Z A; 2VAF A; 4HQZ A; 3ZVJ A; 1VF2 A; 3GSS A; 4WR5 A; 4TR0 A; 1ZCP A; 5JWR B; 2VM1 A; 4LMV A; 3ZZX A; 3WD6 A; 4ECJ A; 3F4R A; 2X8G A; 2YWN A; 3C73 A; 5DAK B; 4K1F A; 2R4V A; 5ECR B; 1XVW A; 1X9S B; 1C72 A; 5HR3 A; 2WS2 A; 3E0U A; 3C8E A; 5KN2 A; 4HI7 A; 5J3R A; 2R3X A; 2LNT A; 3VPT A; 1T4Y A; 4K7N A; 1TXX A; 3CRU A; 1Q4J A; 4FIW A; 5G2Z A; 1Z5Y E; 4K9Z A; 5D9X A; 1J9B A; 3D21 A; 2R37 A; 1EGO A; 1XBS A; 4HDE A; 1X9M B; 2NTO A; 5D8I A; 1NW2 A; 2GZY A; 1UN2 A; 2LJR A; 2F8A A; 5IIZ A; 1U88 A; 3ERF A; 1E2Y A; 1WPI A; 1XIY A; 1T00 A; 2EIO A; 4IKH A; 3G9B A; 5CYY A; 4EUY A; 4E8H A; 3BCI A; 3D4T A; 2IL3 A; 5J5N A; 3GKN A; 4HZ4 A; 3IBH A; 1JZD A; 2VD0 A; 1F37 A; 3KXO A; 2WUL A; 5INY A; 3DGQ A; 2I81 A; 2FA8 A; 3QFB C; 1QQ2 A; 3TRX A; 1A8L A; 2OE1 A; 2P31 A; 2K6V A; 3FR3 A; 3ZL5 A; 5IM9 A; 5IOX A; 1J08 A; 3UVH A; 1MDJ A; 2JAC A; 2B1L A; 2JAD A; 2WGR A; 3H4K A; 3FZA A; 2C8U A; 3IE3 A; 1SD8 A; 1TRU A; 1FB6 A; 1A0F A; 5KN0 A; 4KDU A; 3U5R E; 6GST A; 4F2I A; 1VF3 A; 2EIQ A; 3GKX A; 1SD9 A; 3A5W A; 4PXO A; 2CQ9 A; 5DJL A; 2GGT A; 1OYJ A; 2AAW A; 3FRC A; 4NXI A; 4BVX A; 1BX9 A; 4Q5N A; 3UAR A; 5J9C A; 4GSS A; 1K0D A; 4KDY A; 1A2M A; 5D93 A; 4IQA A; 2IFQ B; 2WZ9 A; 1Z7P A; 2B5E A; 3KMN A; 2YCD A; 3EVI A; 5D9V A; 2K8V A; 4KW6 A; 5G5F A; 3GST A; 3A3T A; 3QD9 A; 1V58 A; 4OCE A; 2H1A A; 2XC2 A; 3C1S A; 3DML A; 4MJE A; 2I9H A; 4PUF C; 1TI3 A; 1SEN A; 3ME8 A; 3F8U A; 1TP9 A; 3FZ5 A; 1OAZ A; 4L0W A; 3KIJ A; 2DSA A; 4ID0 A; 3HJM A; 1U6T A; 3CSH A; 1WP0 A; 5HFG A; 5IOW A; 3GUR A; 2V2G A; 4F82 A; 5JWO B; 1OC3 A; 2C0F A; 4NPB A; 3VWW A; 3RDW A; 3H1N A; 3L9S A; 2OJL A; 2H30 A; 3UBK A; 1TRS A; 3L4N A; 4L5L A; 4I8B A; 3FHK A; 2X99 A; 4L8E A; 1TK8 B; 3GKK A; 1UA5 A; 6GSS A; 4FYU A; 3HJO A; 1SKS B; 10GS A; 3KM6 A; 5CRW A; 2HRF A; 3QPM A; 5D9W A; 2LTK A; 4ZBA A; 1GTB A; 4ZXG A; 3WT2 A; 5E4W A; 3CMI A; 4MH2 A; 5CP1 A; 3R2Q A; 2E7P A; 4FYC A; 4XS6 A; 1TRW A; 3TKS E; 1ERW A; 5ID2 A; 4ECI A; 3TDG A; 2JZS A; 4DSR A; 3IPZ A; 4NV5 A; 2H6Y A; 2E2M A; 1X5D A; 1WJK A; 3AY8 A; 2M46 A; 1B9Y C; 1AQW A; 1BYE A; 4IP6 A; 6GSX A; 2DJJ A; 2WRT A; 4K8M A; 5IMZ A; 2WJU A; 3GIX A; 4GF0 A; 3E9J B; 2AYT A; 3LFL A; 3W6G A; 3UAP A; 5DAL A; 1A2L A; 1V57 A; 4JZQ A; 4FYB A; 1Z6N A; 1V98 A; 2RUE A; 2DBC A; 1ERU A; 3Q18 A; 3SBC A; 2XPD A; 3LJR A; 2C3T A; 2L5L A; 1OC9 B; 2L5O A; 4LA1 A; 1T4Z A; 1Z6M A; 1AIU A; 3FR6 A; 4WBR D; 1PL2 A; 2CAI A; 3TCO A; 4GQC A; 1S3C A; 4K0N A; 2MBS A; 4ZL7 A; 1EP8 A; 4KSO A; 2KP2 A; 4WEY A; 4LLR A; 1PSQ A; 2X64 A; 2H01 A; 1JHB A; 4Z7X A; 4KCA A; 2C80 A; 3APS A; 8GSS A; 5JCU A; 1DBY A; 1QMV A; 1Y25 A; 3PH9 A; 3KP9 A; 3O3T A; 1X0R A; 1PKZ A; 1GNE A; 2A2S A; 5J4U A; 2TRX A; 4YQV A; 3HD5 A; 2PN8 A; 3UBL A; 4I2U A; 1MDI A; 2H1B A; 4YH2 A; 2YOI A; 1EWX A; 4FO5 A; 4IGJ A; 4F9Z A; 1HD2 A; 2K9F A; 1OKT A; 3Q6O A; 2B5Y A; 3QFA C; 1XZO A; 2H1G A; 2YN1 A; 2X8H A; 1Q98 A; 4EVM A; 5DJM A; 1T3B A; 1QXH A; 2C0G A; 4YQM A; 3ZYW A; 1JZR A; 2BTO T; 1SL0 B; 3TKS C; 3F0I A; 5B8B A; 3F4S A; 2FHE A; 1YEX A; 1PN9 A; 4J57 E; 1ERV A; 2YJH A; 1PX6 A; 1SKW B; 4EXJ A; 1GNW A; 3M9J A; 4NV2 A; 2XBI A; 2JL4 A; 3ZFL A; 3M3M A; 3JCM L; 2GSR A; 2FCH A; 4G9H A; 4RI6 A; 4RQX A; 3IAS 2; 2H71 A; 2R5G A; 1FVJ A; 3TGZ A; 4ECB A; 3LQ7 A; 1VGL A; 2DMM A; 3QDN A; 5DQY A; 1WE0 A; 1BG5 A; 4TVE A; 2WDU A; 3ERG A; 3GKM A; 4OD7 A; 1XWK A; 3SWL A; 2L4C A; 4OFN A; 4IP1 A; 2CX4 A; 1ACV A; 5ELG A; 1GSF A; 2YJ7 A; 3BD2 A; 2LKU A; 4E8E A; 1S3D A; 4XS4 B; 2FGX A; 4KX4 A; 3UIW A; 3GNJ A; 2H8L A; 2H0G A; 5D9T A; 4POL A; 2ON7 A; 2YV9 A; 4XRD A; 5AIS A; 2AV4 A; 5CRD A; 3CTF A; 1FO5 A; 1GWC A; 2O7K A; 5CAX A; 4HQS A; 3IV4 A; 4NHZ A; 3TJF A; 3MAK A; 4TXO A; 1R4W A; 4X1U A; 3P90 A; 3KEB A; 3W8J A; 3IOS A; 2G2Q A; 4ULX A; 4MH3 A; 2CX3 A; 3EMP A; 3VLN A; 4DSQ A; 1TU8 A; 2N5F A; 3GTU A; 2FUG 2; 1U3I A; 1WOU A; 2VL3 A; 7GSS A; 4WF5 A; 4TN8 A; 5D96 A; 4MDC A; 2GQL A; 1MD3 A; 2OE0 A; 3I69 A; 2VLU A; 2HSY A; 4MZW A; 1F9M A; 5G30 A; 1YF1 A; 2D2Z A; 4O32 A; 4N0V A; 1HNA A; 3IK9 A; 3KP8 A; 4K0G A; 3F4T A; 2MYG A; 4MLY A; 3RHC A; 3DYR A; 1USB A; 4IBP A; 1RW1 A; 2H19 A; 4K7O A; 1RQM A; 4RI7 A; 2N5A A; 4L0U A; 1XWC A; 1PGT A; 1O85 A; 3Q19 A; 2NVL A; 4NAX A; 3E3E A; 4GRF A; 4GTU A; 3HXS A; 1TK0 B; 2O85 A; 5F06 A; 4MMM A; 4G2E A; 3EMX A; 2DJ0 A; 4K2D A; 2LJK A; 2YAN A; 5ABR A; 5HR2 A; 4LL1 B; 2VIM A; 4OFM A; 4ECC A; 1R5P A; 1GUM A; 1O7U A; 4HZ2 A; 1EEJ A; 4XHM A; 1WRY A; 1DUG A; 3NIV A; 1XWG A; 1DE1 A; 1VF4 A; 1Y6E A; 2OAD A; 1J0F A; 5DVB A; 2L6D A; 3VUR A; 2E2G A; 3GX8 A; 2DJK A; 1NHY A; 2XBQ A; 4WKW A; 4POB A; 2B7J A; 2V32 A; 5CRG A; 2NBS A; 3GUS A; 3M8N A; 1FHE A; 3K8N A; 2V6O A; 1BED A; 2FLS A; 4DSS A; 3MNG A; 4ML6 A; 4BPY A; 19GS A; 1F2E A; 2GLR A; 2PMT A; 2RUF A; 4J2F A; 3FW2 A; 1G0T A; 5IPG A; 2GDR A; 4CDO A; 4OWY A; 1ZMA A; 4IN0 A; 3KMO A; 1EV9 A; 5H5S A; 2G0F A; 5FT3 A; 5E59 A; 3HZ8 A; 1X9W B; 5IO2 A; 2AB6 A; 3KH7 A; 1YKC A; 3IA1 A; 3IK7 A; 1K0M A; 3TKR A; 3TOU A; 1GSQ A; 2HI7 A; 3G7J A; 2X8C A; 1GSS A; 5B6N A; 1XFL A; 5FWG A; 1JFU A; 1V2A A; 3V1W A; 4F0C A; 3QMX A; 3P7X A; 1TDI A; 4LL4 B; 2VCZ A; 2GQK A; 2GZZ A; 1YKA A; 1TK5 B; 2MMO A; 5LD0 A; 2LQO A; 4GST A; 1LBK A; 11GS A; 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4HJM A; 3IXR A; 3KJY A; 4N30 A; 2VCX A; 3GH6 A; 2JSY A; 1AUC A; 2JSZ A; 2C0E A; 1ZOF A; 3MWH A; 4JR4 A; 1H4O A; 3FK8 A; 1QFN A; 1TW9 A; 3GH9 A; 5EL8 A; 4ZB9 A; 4JBB A; 4J56 E; 5B8A A; 4IS0 A; 2AUV A; 2VM2 A; 1HNC A; 1ZL9 A; 5DCH A; 3UL3 A; 3GFK A; 3IRA A; 3QAG A; 1M0U A; 5JCG A; 1SK2 A; 1IYH A; 2GST A; 4IHU A; 12GS A; 2PVO C; 1G7O A; 1ML6 A; 3M0F A; 3VWV A; 3RPN A; 3I9V 2; 4PGT A; 2GSQ A; 3TJK A; 2JZR A; 3IR4 A; 4G19 A; 4NWY A; 4DVC A; 3C7M A; 5CRH A; 3O76 A; 1R7H A; 4N0Z A; 1GH2 A; 18GS A; 4N10 A; 4I6X A; 2FD3 A; 1F3A A; 4MZC A; 13GS A; 4KB3 A; 2DC5 A; 4O92 A; 1DSB A; 3ISO A; 1PA3 A; 3F6F A; 2H74 A; 1GSE A; 2L6C A; 4POM A; 2DJ3 A; 3ED3 A; 3M1G A; 2HFD A; 1GUH A; 1WIK A; 1SU9 A; 3VI5 A; 1YF0 A; 3M9K A; 5JCW A; 1XW6 A; 1JLW A; 2C4J A; 4HU9 A; 4EE0 A; 1AXD A; 5ECH B; 1KBN A; 4RUV A; 2F3M A; 2A4V A; 1M7T A; 4V2N A; 16GS A; 5B7C A; 2PVQ A; 2VCT A; 4GLT A; 2B1K A; 1A2J A; 2PUK C; 4NHW A; 2KP1 A; 3O6T A; 2F8F A; 2N5B A; 2PER A; 2C1Y A; 5AIX A; 1AW9 A; 1GTI A; 2CZ3 A; 1QGV A; 5DDL A; 4YQU A; 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