4PPA | Genus

Total Genus 69

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	69
sequence length	264
structure length	239
Chain Sequence	SVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGPVKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Discovery and optimization of indazoles as potent and selective interleukin-2 inducible T cell kinase (ITK) inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
total genus	69
structure length	239
sequence length	264
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date	2014-02-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07714	Pkinase_Tyr	Protein tyrosine kinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	4ppaA00

3F61A 4FSUA 4L3LA 3DA6A 2WQNA 4NSTA 2E9VA 3E64A 1OITA 3RPOA 5CAUA 5DGZA 5CEMA 2WZJA 2EVAA 4DFZE 5HQ0A 4HZRA 3JY9A 5KX8A 4BN1A 3E3BX 4EH7A 2I40A 2W06A 3NUPA 5JZNA 4FTLA 3UOHA 4RWIA 3W1FA 3W8QA 2VX3A 2PSQA 4MWIA 2XBAA 5HHWA 1CMKE 4XJ0A 2C3LA 5DR9A 3IECA 4XG2A 5K4IA 3HV5A 2J2IB 4OTPA 5AV1A 3UZPA 3W33A 5BX0A 4Z9LA 4YZNA 2EB2A 4IAFA 5IISA 3BV2A 3VS4A 4HJOA 2ERZE 2QOBA 4DN5A 2PTKA 5I9YA 2R9SA 5E8UA 3G51A 2WEVA 3WBLA 1PKDA 2WOTA 4WIHA 4Z7HA 3QL8A 4E4MA 3VS6A 1PXJA 5ICPA 1BLXA 3VUKA 2UZBA 3E8DA 4IHPA 4R7IA 5C8MA 3VRYA 4MEDA 2UW6A 3LJ0A 3IK3A 2PZIA 3O2MA 3WILA 5I5ZA 2XYNA 4O2PA 3MVJA 5ANDA 3FL4A 4E5BA 3MTFA 2Y8OA 3FMKA 4GS6A 4FX3A 4AOTA 3LVPA 1Y6AA 1JQHA 1YHWA 2JIUA 2YCFA 3V5QA 4MBJA 5E8TA 2HWOA 3CBLA 2XRUA 4MXYA 4UV0A 1UWJA 5CNNA 3KN6A 5LVPA 3TT0A 3IDBA 3FV8A 5K5XA 1WZYA 4BDKA 1XBBA 2BTRA 2GS6A 3O50A 5CAVA 2XNNA 3EWHA 4KINA 4O1OA 2X7GA 5JFVA 3GUBA 4G6OA 5D1JA 1S9JA 5EH0A 3HYHA 1M7NA 2XP2A 4U43A 3CTQA 4IWOA 4WNMA 2XVDA 4W4VA 4JX7A 2QURA 2EXEA 3R63A 5EYKA 1URCA 4EOPA 3AXWA 4F99A 3C4ZA 4FTTA 5BQ0A 2WKMA 4IBMA 4ZP5A 3R7EA 3D4QA 3UNZA 1OGUA 4ZEGA 2JKMA 2WTKC 4H1MA 4C3FA 1Q8UA 4QQ5A 4XV9A 2Y0AA 3IQ7A 4S34A 2PE2A 5HTCA 3HMOA 1ZMWA 4FIGA 1QL6A 4EH5A 2C5VA 3IGOA 3NIEA 1XO2B 4QMSA 2GDOA 2HK5A 3MA3A 4L68A 2JIIA 3QWKA 4RX9A 3QQLA 4AGUA 4EHGA 3V6RA 3C4CA 5HOAA 4FTQA 3OS3A 3R1QA 3K54A 3NUYA 3RJCA 2WEIA 3PA3A 5TF9A 3SAYA 4OTFA 4GK2A 4YC6A 3GGFA 4I6FA 2BRBA 3DKGA 2JDTA 4KS7A 3HMIA 1DI9A 3IKAA 3QTIA 4FODA 4DEBA 3FMDA 4J8NA 4G16A 5L4QA 4QP3A 2OXDA 3OXZA 2OW3A 4Y72A 1XKKA 5AR2A 3VS5A 4NIFB 2X6DA 4YJUA 1H24A 3AMBA 3C4XA 3UQGA 3UO6A 4G6NA 4NJDA 3DJ5A 3DBCA 2WU7A 3QLFA 4QPAA 3RHKA 3VRZA 3A61A 2I0YA 5HIDA 1Y91A 3I1AA 3R2BA 5AV0A 5CI7A 3EN7A 3ODYX 3QX4A 2B53A 4YJNA 2W05A 2X8IA 4O27B 4XG9A 5DN3A 5AX3A 5BYZA 4CT1A 4BCQA 4FKOA 3C4FA 5FP6A 3FYKX 3DKFA 3VF9A 4JDJA 4ASXA 3WZKA 2LAVA 4BDAA 2C30A 5M55A 3GI3A 4CXAA 2FSOX 4A7CA 4RLLA 1QPDA 5HNGA 4D2TA 4FSZA 3C0IA 5JK3A 2RG6A 4KIOA 4IM2A 2PE0A 4RMZA 5T6KA 1A9UA 1PF8A 3F2NA 4EOMA 4L3PA 5DRBA 4NKSA 3O23A 3BE9A 5AIRA 2OJIA 4ZSJA 2UW4A 3CIKA 4IM3A 5FM3A 3ZFXA 4IX4A 2JFMA 2UVYA 1ZOEA 3OUNB 5D11A 4ZJJA 2PVLA 4IZ5A 4QTCA 1YRPA 5EOBA 2O64A 3C4EA 4YP8A 5BNJA 2QO9A 5TT7A 2PZPA 5AWMA 4F0FA 2BFXA 4GJ2A 2WTWA 4BI0A 3C7QA 5CF4A 4ZSLA 3SV0A 4BHZA 2R3HA 2BDJA 1QMZA 3B2WA 3QC9A 3RAKA 3D5UA 3OVVA 2XCHA 2JAVA 4O0XA 3DS6A 2EWAA 3Q96A 4YJPA 3CKXA 1E1VA 4NWMA 2BZHB 2OJJA 4FV7A 5AR8A 4D2RA 5KMKA 3AT2A 5E1SA 3TKUA 3ZZWA 4BIDA 4U40A 4CCUA 5AAGA 3EQDA 5JFWA 5K0XA 2R0IA 4GCJA 2B9HA 2BIYA 4JX3A 4YPSA 4FZAB 5E8VA 4RX5A 2IVSA 2VO6A 4PL3A 1M17A 2XK6A 2WMAA 2E9OA 1DI8A 3FPQA 1X8BA 3Q9YA 4MXOA 3L8PA 4JLCA 4X6QC 5J7BA 3PRIA 1P5EA 2OO8X 2W1EA 3OBJA 4AWIA 3FL5A 5LVNA 3R8VA 3ULIA 2GNHA 3QCXA 3QYZA 4KBCA 4Y5QA 4UWYA 5LARA 3VJNA 2ZDUA 4KKEA 2J9MA 4O0TA 5KUPA 4EZ3A 2V7AA 1T45A 2BRHA 4RFYA 5FTQA 4D2PA 5JFSA 4FV5A 3PA4A 3D5XA 4F70A 4Y73A 3VAPA 3WF7A 2G01A 2PZ5A 3O8PA 5FBOA 2IN6A 4AGDA 3VC4A 1W98A 2YAAA 5FEEA 4AF3A 5DEWA 3FQHA 4FV4A 3BBWA 4FV8A 4I4FA 2PVRA 2VWWA 3DNEA 4GIHA 3NGAA 4NCTA 4FKRA 3EH9A 4C2WA 4R7HA 5IEVA 3MW1A 3IONA 4EL9A 3QRUA 4BGGA 3D5VA 2VO3A 3Q5ZA 5IA5A 5JEBA 3E87A 1JKTA 4YHTA 3FZRA 5I9UA 3VBWA 3WZDA 5A9UA 3MB7A 4ZTNA 2WMVA 4H3PA 1ZOGA 3FLYA 5HO6A 5BMMA 3GU5A 3CTHA 3E63A 4MD9E 3D2KA 4RG0A 3F6XA 4QMTA 3BX5A 2A19B 3EIDA 3TEIA 2QU5A 1OIUA 3UGCA 1PMEA 2ZM3A 5EM5A 3RZBA 4DLIA 5M53A 3EYHA 3BZ3A 4MTAA 3T3UA 3P08A 1IEPA 4TKSA 2LGCA 5L6WL 3SC1A 4K6ZA 2WTKB 2G2IA 3BIZA 1KV1A 2YCRA 2W5HA 4FKQA 4NIFA 2OG8A 3IW5A 3UC3A 2BTSA 3GU7A 3NRMA 4MF0A 4WT6A 5ETAA 3R9DA 1ZYJA 5HVKA 1OPLA 3GCPA 4MNFA 4R8QA 4KB8A 1IRKA 4ZZMA 4E5AX 4ITIA 4G6LA 2OGVA 1JWHA 1SNXA 4AOJA 4EOIA 1XH9A 3TUCA 3LFAA 4USDA 4C33A 4XRLA 3ORNA 2ZV9A 5CT7A 4LGDA 5HORA 4YJTA 4XG8A 3HKOA 5DH3A 2DWBA 5BVWA 2IW9A 1YOLA 3ZLSA 1HOWA 3NYVA 2VNWA 4IC7A 4TTHB 2XMYA 2H34A 3F5PA 5TR6A 2NRUA 3DLZA 4GRBA 4PY1A 3KXHA 4RT7A 4L67A 4A4LA 5IUHA 4JBVA 1K9AA 1U59A 4EK3A 3ZONA 3GFWA 1Y57A 4W4WA 4B8MA 3NUXA 4L42A 1TQMA 3R28A 3V5WA 4BCIA 5DMZA 4RC3A 3RINA 3V8TA 2X4ZA 3G9NA 4BTKA 3BPRA 4IZAA 3FKOA 3O8TA 3OUKA 5B2KA 3QQJA 3V6SA 1FVRA 5FWKK 5LMAA 4GYGA 4C7TA 3NW7A 5L2SA 3FMMA 3JS2A 3ZOSA 3BEAA 4G31A 4X2KA 4BC6A 3V5JA 2ZV2A 3EOCA 4OTGA 1Q4LA 4M7IA 4A9SA 4GT4A 1M2PA 2VX0A 3TZ8A 5JRQA 4FF8A 3HZTA 1M7QA 3F5XA 4DITA 4RIYB 2UZEA 4FBXA 5ANKA 5CSPA 4OAVB 2P4IA 3GQLA 4PWNA 2C6OA 3MY5A 4IX5A 4FL3A 4QYFA 3PG1A 3R7VA 4CMTA 2SRCA 4EOQA 3BLRA 5CVFA 2V55A 3MS9A 2WAJA 3NCZA 2XNEA 3P78A 2R4BA 2ZAZA 2AYPA 3BYUA 4CMUA 5TE0A 5L6PA 4EORA 3DB6A 5FXQA 4EQUA 1OKYA 3HA8A 4IM0A 4QP2A 4W8DA 3C50A 3D83A 4YR8A 5CS6A 4D4VA 4MCVA 4QP4A 5EDQA 3I6WA 4FUXA 4RJ3A 5HEZA 3KRLA 3TNIA 4UMRA 4ZXTA 3G5DA 1OPKA 5ITAA 2YM7A 2YM5A 4H36A 5AM6A 2XKEA 4N4SA 4PTEA 1Z57A 5EI6A 4CVAA 2VGOA 4IH8A 5EKOA 1R39A 2IZUA 1YVJA 1M52A 5D12A 5FM2A 2F2UA 1HCLA 1V0PA 3D5WA 3FMLA 4K33A 2J0LA 3V01A 3NNXA 3C51A 2XNGA 3HMMA 2WMQA 3FI4A 4XX9A 4RJ8A 2QHMA 3K5VA 3M1SA 1WFCA 2CPKE 2FVDA 3DKOA 4TY1A 4UY9A 4ZTHA 2OIBA 4AZVA 3AOXA 4C4GA 5IA2A 2Y7JA 5IEYA 3ZH8A 3EQFA 3O96A 3ORKA 4FL2A 5CEQA 1OIRA 2VTJA 4JBQA 3S0OA 3NNVA 2ZM1A 4PQNA 4YZDA 5CSVA 1W83A 3UVRA 3Q52A 5M57A 1UU7A 4V04A 4C4FA 4YMJA 1ZZLA 1M2RA 1AD5A 2BRGA 4BDBA 2QVSE 4ZLZA 3MH3A 2IVUA 2GNGA 3BV3A 4JAJA 4F4PA 3SKCA 1YWRA 3Q60A 4FUYA 2Z7RA 4FKUA 4RQKA 3RAIA 5HLWA 4I23A 3KVWA 1SVHA 3GCSA 2JKKA 4UN0C 2F7XE 5JQ8A 4FSTA 4AU8A 4EQMA 1H28A 3O8UA 5CU4A 1CTPE 5CSXA 3R7UA 1SM2A 2GFSA 4M68A 4C58A 3E5AA 2HENA 4DCEA 5AAEA 1NY3A 3JVSA 3QQKA 3RK7A 2W4JA 3PJ8A 3U6HA 3QKMA 1STCE 3I0OA 4YO6A 1O6KA 2E9UA 4BDHA 2W1CA 2CN8A 2PWLA 4UMTA 4BDGA 5CEIA 3IPHA 3KULB 3DV3A 3IW7A 4NU1A 5IH4A 4F09A 4YLJA 5D41A 3ORMA 5LXMA 3HV4A 4RIOA 2YA9A 4EOLA 4J1RA 4XUFA 4LGHA 2GU8A 4W4XA 2PZYA 3F7WA 3FSKA 2I0EA 4R5SA 2WQOA 3Q4CA 4BICA 4LOPA 1Q8ZA 3ZU7A 3UJGA 4B9DA 3DFAA 3W2OA 3OP5A 3HEGA 3EHAA 2YWPA 4WG5A 1PXIA 4XG7A 3T8OA 5AADA 1CSNA 3EL7A 3H30A 3VBQA 1WAKA 2J6MA 4LV8A 1FPUA 1JPAA 2QOFA 5HG5A 4LFIA 2O63A 4BDJA 2XNPA 4AE6A 4EK6A 3DBQA 4XV3A 2JEDA 1GY3A 3ORLA 4IADA 5JFXA 4Z3VA 2XIXA 2Z7LA 2VO7A 5H9BA 1FQ1B 2HY81 3QCQA 3KRJA 1CKJA 3CQEA 3CD3A 4M13A 2FB8A 3ERKA 5GJDA 3FZ1A 5L3AA 3OTVA 3EKKA 3AC4A 5FG8A 4QT1A 5F95A 5LWNA 5E7RA 4YTFA 3KXZA 1F3MC 4RFMA 3VBXA 3QKKA 4CCBA 5DLSA 2P55A 3UVQA 4UZHA 3RALA 1NA7A 3FZOA 4RIYA 3A60A 4C61A 4C34A 4CKIA 2XCKA 4RRVA 5ANGA 3DZOA 1OL6A 5T3QA 4I0SA 4IAIA 5CANA 4O0SA 4OUCA 5CF6A 2EXCX 1GZNA 5AP3A 4K18A 1MRVA 3ALOA 4DEGA 4ZZNA 4IANA 4O1PA 4A9UA 4FZ7A 4I4EA 4LM5A 2W7XA 2VNYA 3KRRA 3L9LA 3QTZA 2QO7A 4XV2A 5CI6A 3VS3A 4KIPA 3MVHA 3COIA 5LMBA 4LG4A 2OJFE 3EN4A 3P7AA 4FGBA 4J99A 4ITHA 4OGRA 4HGSA 2W17A 4R3RA 3W10A 4FKJA 5CAQA 4IVCA 2W1DA 4O21A 2BFYA 1R0PA 3KVXA 1REJA 4WBOA 2B4SB 3R83A 2WMWA 2R3QA 3EN6A 1G3NA 2XRWA 4UBAA 1U5RA 3LXNA 3OY1A 2GNFA 4J98A 4QTDA 4N6YA 2VD5A 5GHVA 5HE2A 4HOKA 3UBDA 3VHEA 1J3HA 4Z7GA 4S33A 2HW7A 4PL5A 4RJ5A 3LXKA 4HYSA 5AP6A 4E6DA 4BYIA 2R0UA 2YIQA 3ZEPA 3HECA 3QCYA 4MNEB 3QD3A 4FTCA 1LR4A 2YDIA 4OLIA 4L7SA 4QMUA 3ALNA 2E2BA 3GT8A 5HO8A 4AFEA 2BROA 2YM4A 1UV5A 4FSRA 3RAWA 4BTFA 4FNXA 3PY0A 2UW3A 2DYLA 4PPBA 2HWPA 3U4UA 4DGNA 1H8FA 1RE8A 2ZB1A 1PXKA 4USFA 3ZRKA 5HBHA 4TWPA 4HYHA 1I44A 1ZYDA 2Q0NA 5C27A 5M4UA 3DJ6A 4KBKA 3UYTA 3W55A 4L45A 2H9VA 1JOWB 4D0XA 1CKPA 2FSLX 5KCVA 3IW4A 5A4LA 2Y4PA 3NS9A 4LRMA 2JFLA 2W5BA 2QOIA 2X2LA 3FXWA 2PVMA 4OTRA 4DH3A 4DYMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2BIK B;  4JOA A;  3W8L A;  3WF8 A;  4HVG A;  5HNB A;  4G3G A;  3PVG A;  4NTS A;  4I21 A;  4GVJ A;  2R3N A;  3NDM A;  3OCS A;  2X0G A;  4D1Z A;  3BWJ A;  3M11 A;  4W8E A;  1H4L A;  2PVN A;  4BZD A;  2PY3 A;  3U87 A;  5IME A;  4GYI A;  2W1Z A;  4I5H A;  4YJR A;  5HCX A;  4TND A;  4QYH A;  2W1F A;  5HNI X;  1UWH A;  2C0T A;  1YI4 A;  3LLT A;  4U5J A;  3V5T A;  1DAW A;  3NEW A;  2EXM A;  4QP1 A;  1RDQ E;  1PYX A;  1U46 A;  3GU8 A;  1XH4 A;  4RFZ A;  4AN2 A;  4ZLO A;  3LFF A;  5CU2 A;  2QNJ A;  3UDB A;  4MBI A;  3LJ2 A;  3DND A;  4I1Z A;  2YIS A;  3P4K A;  4QD6 A;  2F57 A;  4PP9 A;  4ANM A;  5HU9 A;  3V04 A;  3WOW A;  4ZJI A;  4HVI A;  3EQP A;  3BYM A;  4XLV A;  3RZF A;  5HG8 A;  5DA3 A;  2JD5 A;  2C6D A;  3GFE A;  3OT8 A;  2BRM A;  3QUD A;  4QQC A;  4EKL A;  3TZ7 A;  4CTC A;  1H1Q A;  1VJY A;  1U54 A;  3C1X A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PPAA

Total Genus

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Chain Sequence

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