4PQHA

Crystal structure of glutathione transferase lambda1 from populus trichocarpa
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
EVLPPVLTSNSEPPPVFDGTTRLYISYTCPYAQRVWITRNCKGLQDKIKLVPIDLQDRPAWYKEKVYPPNKVPSLEHNNEVKGESLDLIKYIDSHFDGPSLFPDDPAKKEFAEDLFSYTGSFSKANNSTFKGEADEAGAAFDYIETALSKFDDGPFFLGQFSLVDIAYAPFIERFQPALLEFKKYDITAGRPKLAAWIEEMNKVEAYNQTRHEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and enzymatic insights into Lambda glutathione transferases from Populus trichocarpa, monomeric enzymes constituting an early divergent class specific to terrestrial plants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutathione transferase lambda1
molecule tags Transferase
source organism Populus trichocarpa
total genus 79
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4pqhA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4pqhA01
4FYCA 3MNGA 2PN8A 4KUNA 3LSZA 4POLA 2XBIA 2GQMA 1SL1B 1RQMA 2H0GA 2HYXA 4RI6A 18GSA 3ERFA 1DUGA 4ZBAA 1TRVA 3UVTA 1K3LA 1YY7A 5IMFA 3FZ9A 4MJAA 3DEXA 4N10A 2WFCA 5COHA 4G0KA 3ZL5A 1XFLA 4OCFA 4FYBA 4WKWA 4CHSA 2LS5A 2WDUA 3DYRA 2N5FA 5F05A 4KB3A 5G2ZA 1BQ7A 2G0FA 1WWJA 1GRXA 1G6WA 1GSUA 3GMFA 1C72A 4KSOA 3ZYWA 2HT9A 2OE0A 3C1RA 4HZ4A 4YH2A 1X9MB 2RUFA 4JR4A 1ERVA 2H30A 3SWLA 2XBQA 1X5EA 4ZXGA 5DJLA 2IMDA 4X0XA 4KCEA 4OWYA 2XPDA 1AQWA 2HSHA 2VLTA 1V58A 1ZYEA 2PERA 2VCWA 4Q5QA 19GSA 1NW2A 2OACA 3VWXA 1PN9A 2FCHA 3BCKA 2A2SA 4XTSA 1IYIA 5C04A 2GT5A 4JEDA 2C1YA 2O89A 5JCUA 3QAGA 3IOSA 1EV9A 4KDYA 1HYUA 4XS1A 4LA1A 3ERWA 5KN1A 4I97A 1WMJA 1FOVA 3EU3A 1FO5A 1T00A 2HFDA 2LRTA 3I43A 3UIWA 4WR4A 4HQZA 14GSA 2YWMA 1ERWA 4DEJA 2GT6A 2XC2A 2I81A 4KSMA 1ERTA 3NZNA 2QSIA 2DBCA 2BMXA 4PXOA 2H74A 2AUVA 5DAKA 5HFGA 3DXBA 5DBQA 4EKZA 5IQYA 4N0VA 1G6YA 3UVHA 2FWHA 2GSSA 3GSTA 2V1MA 1O8WA 4PURA 2DJ2A 3IA1A 1ERUA 4HS1A 1YKAA 3EVIA 1QK8A 4EXJA 4OFMA 2EIQA 1VRSD 3EYTA 2C0GA 1EOHA 1T4ZA 5HR1A 5H5RA 2DC5A 1AC1A 4IGJA 4TKYA 1XCCA 1SYXA 5DAKB 2DIYA 4OD7A 4Q5RA 3U6VA 3LEFA 4LMVA 1WOUA 3QPMA 4E8HA 3D21A 2VD1A 2VM1A 1PL1A 3DMLA 1TI3A 2EIRA 1X5CA 5ECKB 4HI7A 3F4TA 2PPTA 2JZTA 3DVXA 4BVXA 2YWOA 1LU4A 3QFBC 2IJYA 3M1GA 3J7Yb 4MZWA 1TU8A 4XCSA 2R37A 3IAM2 3LYKA 4JBBA 3G7JA 2V2GA 2OBKA 3QAVA 1SK0A 2OE3A 1ZOFA 4D73A 3HVSA 5J5NA 3HCZA 7GSSA 3FKFA 4HU7A 4MA9A 2EC4A 3QDNA 4NHZA 1FB0A 4IVFA 2HSMA 1Y25A 2H1DA 5HR0A 2YJHA 2X64A 2NBSA 4MK3A 5ECPB 1H75A 1R5PA 2DIZA 3BJ5A 5DJMA 2TIRA 2PGTA 1YKCA 2LJRA 4BVXB 2MMZA 1B4QA 3QD9A 4HDEA 4IJIA 5B8BA 3Q19A 4JZQA 3DKSA 3KP9A 4KDUA 2B6MA 4LLRA 1TRWA 2RLIA 2LV3A 1JLVA 4EVMA 2HRNA 2VUPA 3L9SA 3P8WA 3RAZA 2HSYA 2V6OA 1BAYA 4O5RA 2HSMB 3RHCA 2B1KA 1YF0A 2Z9SA 2FWGA 2MMOA 2O7KA 3EU4A 5F06A 4KE3A 2YV7A 1XWGA 4TR0A 3ZZXA 5EY6A 5DCGA 2IN3A 1W4VA 5LD0A 1CQGA 4GSTA 2A4VA 4G2EA 4FYUA 5E4WA 5A5KA 5IPHA 4MF5A 1E6BA 5B6MA 2VIMA 3LWAA 4XRAA 2FY6A 3ZMLA 2GVPA 4AJ7A 2R4VA 3ZTLA 1FW1A 1TRSA 2H19A 2KP2A 3HXSA 5C00A 3CRTA 3BOAA 2H76A 2LRCA 4L8EA 2DLXA 3A3TA 1GTBA 3F4RA 4F82A 1WP0A 1BEDA 1WPIA 5KN0A 3ZVJD 2M72A 4PGTA 1X9WB 1GSEA 1F3AA 1A2JA 1TW9A 1FG4A 1AXDA 3L9UA 3D0ZA 1OKTA 5G5FA 2WULA 2YWNA 2PWJA 4X43A 5LCZA 4HEA2 2PVOC 6GSYA 2VCTA 1R26A 4TXOA 4GCIA 5D9XA 3PPUA 3W8JA 5LNKe 4G0LA 2HLSA 1T3BA 1MD3A 3MSZA 1GNWA 2AAWA 1SD8A 1BG5A 2HRFA 1EP7A 3GYKA 1UC7A 1XZOA 3SBCA 1HQOA 1B9YC 1K3OA 2GLRA 2GSTA 5G5EA 1TK8B 2L4CA 2X8HA 2VM2A 1Z5YE 1X9SB 3LJRA 1ML6A 1QGVA 10GSA 1NM3A 1F6MC 4DSQA 5B7CA 2VLVA 4EF0A 2OA7A 3GTUA 1ZL9A 4KH7A 3KEBA 20GSA 4L0WA 2X8GA 3TKQA 3KH9A 1Z6NA 2F9SA 1K0MA 2I1UA 4JU5A 2CX4A 1QQ2A 3TUEA 3KZQA 4MH2A 1VF1A 4O32A 2B5XA 3GH6A 1JZRA 3NIVA 3FK8A 3WT1A 1Z9HA 2YN1A 4HJ2A 4QQ7A 4ECBA 1PKZA 1PL2A 4K0NA 2B3SA 5CRDA 1U6TA 3Q74A 2FD3A 1BX9A 2FUG2 1U87A 3KJYA 5CAXA 4BA7A 2VAFA 2AHEA 2C3TA 5IMZA 3D4MA 5GAND 2C80A 2FA8A 5J9BA 2VL2A 3MAKA 1TP9A 6GSUA 3GTUB 4OFNA 6GSWA 3DWVA 1Z3EA 2E7PA 3TRPA 2HE3A 5HFKA 4K7IA 2X99A 1THOA 1OE7A 2L4QA 4V2MA 1FAAA 2DSAA 4TR1B 1NHYA 3F6DA 3UARA 2H6YA 4HUAA 5IMAA 4ID0A 1PSQA 1U3IA 2IPAA 3EE2A 1A24A 2L57A 4MDCA 2VCXA 3EMXA 4TXVA 4ISDA 4KF9A 5BMUA 2HQTA 2PUKC 1GTAA 1PQNA 3HJOA 3CBUA 3KCMA 4GTUA 5ID2A 2K9FA 2KP1A 4RI7A 3F3RA 5FHIA 5CNWA 4ILFA 5G31A 4FH8A 3W6GA 4AF2A 4N0ZA 1UVZA 3V1WA 1JZOA 3F3QA 1BYEA 2OJLA 3HHVA 4X1UA 1SKRB 2LSTA 4NXIA 2PBJA 2HZEB 2I4AA 5L71A 4POBA 3FR6A 2YV9A 2GS3A 3TOTA 1O7UA 2JL4A 3M8NA 4K7NA 3RBTA 5KN3A 1HD2A 4ZBDA 1M2AA 4WF5A 5ELGA 2PMTA 4IELA 1YQ1A 2FLSA 1G7OA 3F8UA 2TRXA 2RUEA 1YZXA 1XIYA 1TXXA 3D22A 2P0GA 2YWIA 2K8VA 2BJXA 5ECHB 5ID2B 2IMKA 3PINA 2WS2A 2H0IA 1JFUA 2LKUA 1SKSB 5ECQB 1TRUA 4POMA 4L5OA 2C3QA 3GA4A 2O8VB 2YP6A 3HKRA 3ZIVA 1A23A 8GSSA 1A0FA 3ME8A 3HZ4A 4ACSA 3L9VA 3HVXA 2WB9A 1O73A 2LNSA 5KEJA 4J2FA 4NHWA 4ZB9A 5A4WA 2AYTA 4ZIJA 2I9HA 3HVVA 2HRAA 1ZMAA 1ACVA 1RK4A 1B8XA 3ZFLA 2VCVA 1T7PB 3HY2A 3VLNA 1R5AA 2F8FA 1AAZA 4WBJA 1T4YA 5EL8A 2B5YA 2ES7A 1MTCA 4NWYA 4AJ8A 3DRNA 3IPZA 3APSA 1GTIA 4EC0A 4G10A 5FT3A 2P31A 2C8UA 2GGTA 3FZ4A 4MF7A 1T8EB 5JWRB 5J41A 2GTUA 4KW6A 2LTKA 4ZB8A 1XOAA 2CZ2A 3O76A 3QR6A 1ON4A 1YEXA 1GLPA 1JZDA 3H4KA 5ECLB 3TB2A 4EO3A 4IW9A 2VCZA 3TJKA 1I5GA 2DJKA 3IR4A 4TRXA 3A2VA 1KEBA 4RUVA 5HFIA 1SK1A 5IOXA 3EURA 6GSVA 3IRAA 3H93A 3VPTA 1LBKA 1SJIA 2LUSA 2CZ3A 2WZ9A 2CT6A 4MF6A 1FVJA 1Z6MA 4YAVA 2CQ9A 2F51A 2H1BA 3FHKA 1ZZYA 4V1Ag 1AW9A 5IO0A 3VWWA 3UJ1A 4GQCA 4ZL7A 1V9WA 2B5EA 4TOPA 2E2GA 4N30A 4NAXA 1GLQA 4EDYA 1Y6EA 4V2LA 4H86A 3UEMA 2JZSA 3L78A 4G0IA 3QMXA 1YEPA 2J9HA 5ECRB 5EPFA 2FHEA 3S9FA 3HDCA 4RQRA 3RPPA 3GFKA 6GSTA 3WGDA 1OKDA 4LMWA 2VL3A 3GX0A 3U5RE 1SYRA 5ENUA 2JADA 2HNLA 3UBKA 1TK0B 3BCIA 3L4NA 4L0UA 1M9AA 3TJGA 3UMAA 2YANA 1K3YA 2H75A 5IIZA 3APQA 2CAIA 3TKPA 1MEKA 1QXHA 3VWVA 1K0AA 1S3CA 3DIEA 3EMPA 4KNDA 3KH7A 1GSSA 3LG6A 3TOUA 3KTBA 2XHFA 5B8AA 4HZ2A 2H66A 2H8LA 4GF0A 5ELAA 1NSWA 5JCWA 3GX8A 3WT2A 4I8BA 1V2AA 3IBHA 3PR8A 4KGIA 1XXUA 2DJ1A 3F0IA 1BJXA 6GSSA 1M0UA 2L59A 2GSRA 3AY8A 5CP1A 3TJJA 5FWGA 2IL3A 4KCAA 4D73B 2PVQA 2LJKA 5D9TA 2NPBA 5KN2A 2N5AA 2N5BA 1AQXA 1YJ6A 3TJFA 1K0CA 5GSSA 3CRUA 2KUCA 2FWFA 2F3MA 4IQ1A 1N8JA 2QKEA 1Z7PA 2G2QA 3GKMA 3UL3A 3E9JB 4ZL8A 1R4WA 1OC9A 1URMA 2K6VA 5IM9A 3IE3A 2V6KA 1OC3A 1GUHA 5ECNB 4GWRA 2WRTA 2VL2C 4OO5A 3LYPA 4Q5NA 3FZ5A 3TGZA 2C0EA 2REMA 3LFLA 4ECCA 4IS0A 1MDIA 2OADA 4K1FA 4F2IA 3F9UA 4ZL9A 4O92A 1KNGA 2JACA 4ML6A 3R3EA 4HOJA 3K8NA 2C0FA 2J23A 1PX7A 9GSSA 1V57A 3EINA 3VPQA 4MJEA 3J7Yk 1VF3A 1J08A 1OC9B 2DJJA 2KOKA 3MDKA 3A2XA 3FEUA 2OE1A 2RM6A 4AGSA 2ZNMA 2H72A 3I9V2 3KGKA 1PD21 3MWHA 3DGQA 3H1NA 2E2MA 1XBSA 2EIOA 2R2JA 1S3DA 1WE0A 2LQOA 1HNCA 3CTFA 3ME7A 4ML1A 1GSDA 2IMEA 5HR2A 4G19A 4WEYA 3NOFA 3C1SA 1M2DA 4TVEA 2GQKA 4XS4A 4WXTA 3P2AA 1TJDA 3VURA 3DD3A 3GIXA 4WBRD 3GKXA 1TI1A 1EP8A 4HQSA 4WETA 22GSA 1CQHA 1THXA 2VL9A 2MMNA 4EUYA 6GSXA 4V2NA 5CREA 11GSA 2PU9C 3CYNA 16GSA 4PQ1A 4TXOB 1X5DA 1DE1A 2HRKA 4FIWA 4MMMA 3DVWA 4EDZA 3H8QA 2YNXA 3JCML 2WJUA 1V98A 4BPYA 1A0RP 1M9BA 3GKKA 3VFIA 4DSRA 1OE8A 3IAS2 4BVYA 1GTUA 4XS4B 1M7TA 2LNTA 3ERGA 4YQUA 3IC4A 1Q98A 2GQLA 3E0UA 3O3TA 2LRNA 3LXTA 3GL3A 1XWAA 4K9ZA 1V40A 1JZWA 3APOA 2IMIA 4MJCA 4TR4A 3I6AA 1SENA 1A2LA 3G7IA 1O81A 1XOBA 4ZBBA 3CSJA 3HZ8A 3UBLA 3KD0A 4ZILA 3GKNA 3D5JA 1GUKA 4J57E 1XPVA 5CRHA 4JR6A 1GSQA 5H5QA 1HNBA 1WJKA 4MJBA 2HRKB 3G7YA 4BWSA 4MABA 2O85A 2FGXA 1VF4A 1UA5A 1ZGNA 5GZZB 4K7OA 1ZYQB 2V32A 2H71A 2X8CA 5IPGA 3TCOA 5AIXA 4GQFA 1SL2B 4F0CA 1F9MA 4PUFC 1F37A 2M46A 1USBA 4K8MA 1FB6A 3ED3A 3OR5A 4HJMA 1KTEA 1G7EA 3TKSA 4MH3A 5IMCA 1AUCA 4IHUA 3G9BA 2IFQA 4EE0A 1YF1A 2GSQA 1QMVA 2ON5A 3ZITA 1GP1A 2GDRA 2MZCA 5G1LA 4FQUA 2NDOA 4ZB6A 3FW2A 1A2MA 3FR9A 1XW9A 3IDVA 1XW6A 2AB6A 3M3MA 2V41A 3GV1A 2R3XA 1O8XA 4YQMA 1QFNA 4I2UA 1PRXA 3GH9A 4MPGA 4K6XA 4K0GA 3BBYA 4CDOA 2VCQA 3EWLA 5DVBA 4MZBA 1MDJA 2IFQB 2FA4A 5CO3A 3TJBA 1TU7A 2C0DA 1PX6A 5HQPA 1F3BA 2FWEA 3C71A 4P3YB 4IN0A 5D9WA 3ZREA 3I69A 2H0HA 5IO2A 3GSSA 4K2DA 2JSYA 4V1Ap 4I6XA 1B9XC 3FRCA 2HXKA 2I3YA 4DVCA 1LJRA 2H1AA 3CSHA 2DJ0A 4YQVA 3FYGA 3A5WA 4NPBA 2OBIA 4AJ6A 2CAQA 2OKAA 1PKWA 4FO5A 1AIUA 3LQ7A 4G9HA 1G0TA 3HA9A 1A8YA 5AISA 5G1KA 3ZRDA 4OFTA 5D73A 1O85A 1M2BA 5A4UA 1F2EA 5ECSA 3ZMKA 3GL5A 2DJ3A 4OMVA 2YJ7A 2ALBA 2YCDA 1GNEA 2L6CA 1O6JA 3H79A 4Z7XA 2MYGA 1XWKA 1MD4A 3TKSE 3C73A 1AQVA 2VOCA 4MPFA 5ECIB 2AV4A 4GXZA 4XHMA 2C3NA 4F0BA 5CRGA 5IOWA 3TKRA 4MZCA 4KX4A 2H6XA 2RIIA 5ABRA 1XW5A 2GZZA 5IMDA 1FHEA 3ZFBA 5J3RA 2HZFA 3GURA 4JRRA 5JCGA 1SK2A 4NV5A 1S3AA 5DQYA 2UZ8A 2QC7A 2F8AA 4CW9A 2LQQA 3A2WA 4N11A 2B7JA 1SJ6A 4GLTA 1SL0B 5G30A 1TTZA 5ECMB 5DALA 1I9DA 4IKHA 1GSFA 3WD6A 5AGYA 3CSIA 4PNFA 3FR3A 3WGEA 1U3AA 1Z7RA 5F0GA 1OYJA 3N9JA 1XVWA 2E0QA 2ZCTA 1DE2A 5HR3A 3LORA 5JWOB 2AJQB 3HJPA 4POKA 4WF4A 3ISOA 3FY7A 3GUSA 1GUMA 4I5QA 1EV4A 2BTOT 2LEGA 5J4UA 5D8IA 4QL7A 2TRCP 1OC8A 1EGOA 1ABAA 4PUAA 2JSZA 3Q18A 3C8EA 3HJMA 4I2TA 3LGCA 4PTSA 5INYA 4TW5A 3W8SA 3VWUA 2LJAA 1YDKA 3P90A 1OVNA 3GRXA 5DALB 2KLXA 3RHBA 1QUWA 2HI7A 4IQAA 4MLYA 1EGRA 2XPEA 4LL4B 1WRYA 4ECIA 4BL7A 3WGXA 5JWQB 1EEMA 1PGTA 3TRXA 1PMTA 3KM6A 3F6FA 5AIVA 4J56E 4IP6A 2A2RA 1H4OA 2H73A 4Q5FA 2H1GA 2QGVA 2R6KA 3RDWA 5IMVA 1A8LA 1GH2A 1W89A 17GSA 2WGRA 3KP8A 1FVKA 1MDKA 3KTLA 2VO4A 3KIJA 3RPNA 4F03A 1SU9A 3M9KA 2IMFA 1K0OA 3IV4A 2ON7A 2YZHA 2L6DA 1OAZA 1N2AA 1ST9A 3FZAA 2M80A 1K0BA 1VF2A 2O87A 3KMNA 4PQHA 4GSSA 3F63A 3M9JA 3UAPA 3PH9A 1GULA 4BL7B 4XRDA 5GSTA 3ZLPA 2NVLA 5D9VA 2HSNB 4PNGA 2KHPA 3R2QA 1KBNA 1K0NA 4NV2A 2YOIA 3O6TA 3QCPA 4GSNA 5J9CA 1J9BA 1UN2A 1EEJA 1GSYA 3LXZA 3GNJA 2IIYA 1IYHA 3HYPA 4XIHA 4KAEA 2K18A 5F07A 1SD9A 3IXRA 4GRFA 3QFAC 1R7HA 2JZRA 4OO4A 3F4SA 1GL8A 3PGTA 1EZKA 4WR5A 2P5RA 3HD5A 4IBPA 5D96A 2NTOA 1JHBA 4QL9A 2WCIA 3TKSC 2MMAA 2D2ZA 4IJ3A 1J0FA 3IK7A 5DQSA 2L5LA 5F8BA 3QOUA 3UOMA 5DCHA 2VLUA 2JU5A 1X0RA 3M0FA 3EC3A 1PA3A 4NMUA 2CX3A 3P7XA 2CV4A 3VI7A 5B6NA 1EOGA 2L5OA 5AN1A 4LL1B 1GWCA 3IK9A 4PQIA 4ECJA 4PX1A 1VGLA 4L5LA 1Q4JA 1ZCPA 4ULXA 3IHQA 1U88A 1WIKA 2H6ZA 4EL1A 1E2YA 1EWXA 3US3A 2FNOA 13GSA 2CVKA 3CXGA 1SJZA 4O7HA 1T1VA 2DMMA 5E59A 4OCEA 1SKWB 2MBSA 4TR3A 2VD0A 2CA8A 3E3EA 1B4PA 1JLWA 3VI5A 4RQXA 2RM5A 2CVDA 3ZVJA 5D93A 2YZUA 3VK9A 5A4VA 3GN3A 1DSBA 5EVOA 4TR1A 1XWBA 1TDIA 2DMLA 3KXOA 3D6IA 4E8EA 4F9ZA 1ILOA 4DSSA 4HU9A 4MP4A 1XVQA 5H5SA 12GSA 3L0HA 2B7KA 3KMOA 1HNAA 2MBTA 4IP1A 1XWCA 4USSA 3D4TA 4MCUA 3TRQA 2GZPA 2H70A 1DBYA 2CVBA 5GAPD 3IC8A 5CYYA 3BD2A 4TN8A 1TK5B 1K0DA 2H01A 1TKDB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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