4PXXA

Crystal structure of a highly thermal stabilized variant of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPICKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSHDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPCLESVTWIVLKEPISVSSEQVSKFRKLNFNGEGEPEEPMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Crystal structure of a highly thermal stabilized variant of Human Carbonic Anhydrase II
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4pxxA00
3BETA 4Q7SA 4QY3A 4ILXA 1J9WA 2FMGA 3R16A 4DZ7A 1CNBA 1TTMA 2H4NA 3RZ0B 4Q07A 3HKNA 4MO8A 3M5EA 4CACA 1BNWA 1CRMA 2OSMA 4ETQC 5DSPA 1RZAA 5JDVB 5IPZA 4Q90A 4Y0JA 1FSNA 1THKA 5DVXA 8CA2A 1CCUA 1CAYA 4GL1X 1YO1A 1G4OA 3CA2A 3KOKA 4QJWA 3S77B 4RUXA 4C3TA 3MNIA 3SAPA 3S74B 2FOVA 3V3GB 5FL6A 3OKUA 4G7AA 5DOHA 2FOYA 3M2XA 1A42A 3JXGA 2QOAA 3M98A 4E4AA 3MWOA 4CNXA 5EKMA 5FNLA 5L3OA 5EH8A 5JESB 4BF6A 2X7SA 1CAKA 1CNGA 3RYVB 1UGGA 1HCBA 3OIKA 1CNKA 3RYJB 1ZNCA 5JG3B 3KIGA 1HVAA 1JV0A 5SZ6A 3S9TA 4QIYA 1TB0X 2VVAX 4KNNA 1CAIA 5JGTB 3JXFA 5SZ3A 3MHMA 3S75B 2AW1A 3U7CA 5JQ0A 4HEWA 1UGCA 2WEOA 3V3IB 2FOUA 1BNMA 4X5SA 2HFWA 1ZSBA 1KOPA 5DSJA 3RZ7A 3CYUA 5E2MA 5SZ1A 1XEVA 3UYQA 3QYKA 4FVNA 1CNCA 5E2RA 4L5WA 4TWLA 3P3HA 3RZ1B 2NXRA 4YWPA 4E3FA 3OKVA 4R59A 3T5UA 3LXEA 4Q7WA 5CA2A 4WW8A 3OYQA 3BL0A 1I90A 5E5UA 4CQ0A 1CCSA 3D8WA 4COQA 3DBUA 1G48A 1I9QA 4MDMA 3RLDA 5CLUA 5DSRA 4E9OX 3DCCA 4QK3A 1HEAA 3M04A 3U45X 3S72B 1BN3A 4Q8YA 5E2SA 1OKLA 5FL5A 5DSLA 5AMLA 4HT2A 4YGLA 2CBAA 4YGKA 2POVA 3MZCA 4ZWIA 4WL4A 3RZ8A 3TVNX 1G1DA 5SZ5A 4K0SA 3V2MA 1CNXA 1AVNA 4Q08A 4Q9YA 1DCBA 4QJMA 5DSMA 3OYSA 4YX4A 5JEGB 5JQTA 3DVDA 5FNMA 3RGEA 4E3GA 1I9MA 3RYZA 1TEQX 1HEBA 5BRWA 2NWZA 3M3XA 4Z1EA 3DAZA 1IF7A 4MDLA 1YO2A 4Q7VA 4MDGA 3UYNA 2NWYA 3D93A 4WUQA 4ZWZA 3FFPX 1OKNA 5JEPB 1BN1A 3W6HA 2NN1A 5HPJA 4KV0A 1FQRA 1G53A 1IF5A 4E5QA 1UGDA 3M2YA 1CA2A 1FQMA 1LUGA 4PYXA 4YHAA 4K0TA 5FLQA 1IF6A 3S76A 1G46A 3D92A 1G6VA 3MMFA 1KEQA 3DD8A 2NWPA 4HF3A 3FE4A 3EFTA 5FLRA 3IEOA 4CNVA 4XE1A 4JSWA 3TVOX 1I9LA 3P5LA 4HT0A 2FNNA 5FDCA 1I91A 4N16A 3M14A 2O4ZA 6CA2A 4HEZA 5BNLA 4QTLA 1Z97A 4YXIA 1YDDA 3F8EA 1Z9YA 5EKJA 3ML5A 1FR7A 1YDAA 1IF8A 3M5TA 1CVFA 3OY0A 3NJ9A 3MHOA 2Q38A 4TWMA 4KUYA 1I9NA 3T82A 1UGBA 4PXXA 4CNWA 1CA3A 2WD2A 1RAZA 2H15A 1URTA 3F7BA 4QIZA 2POUA 2FMZA 2VVBX 5E28A 3RG4A 4KP8A 1CAOA 1CVBA 1UGAA 2WD3A 5E5RA 5BYIA 4KNJA 4QJPA 2NN7A 4QJXA 5EH5A 1BNVA 4PQ7A 3MYQA 4L5VA 4Q6DA 1XPZA 4YVYA 1RAYA 5G01A 3RYXB 5BRUA 1I8ZA 4RFDA 4CNRA 1FSQA 4K13A 5FDIA 3S78B 1TG9A 5FNHA 3GZ0A 3V2JA 1MOOA 4Q83A 4RIUA 3RYYA 4BCWA 1CNIA 3N0NA 4R5AA 2ILIA 4MLXA 4Q87A 5AMDA 5CACA 3MNAA 2NWOA 5FL4A 3MNUA 3R17B 2ABEA 4Q0LA 1CIMA 12CAA 4KUVA 3VBDA 4KNIA 3T5ZA 5DSNA 4QSJA 3ML2A 3B4FA 4L5UA 3IBUA 3IBLA 3S97A 4ZX0A 3FW3A 5G0BA 1ZFQA 5G03A 4QJ0A 1LGDA 1CZMA 1H9QA 5EH7A 1CVHA 2CBCA 1RJ6A 2CA2A 3EFIA 3JXHC 4K0ZA 2FNKA 3MHIA 4FVOA 4QEFA 3HLJA 4WW6A 3NI5A 3T85A 3F7UA 1ZGEA 1RZDA 1ZGFA 2FOSA 2Q1QA 3Q31A 4FIKA 4JSSA 3TMJA 1RJ5A 3KONA 5DOGA 3T83A 5JGSB 5FLSA 3P5AA 1CAHA 5EHWA 4Z0QA 1CNYA 1ZSAA 1HUGA 3KWAA 4QK1A 4FU5A 5EZTX 1F2WA 5DSIA 4RN4A 4ZAOA 4ITPA 5C8IA 3IAIA 1H4NA 1IF4A 2QO8A 3B1BA 3M67A 1ZFKA 3MNJA 4PZHA 1XQ0A 2NNVA 2EU3A 3IGPA 5DSOA 1CALA 4N0XB 3M96A 4HBAA 4E3HA 4RUZA 4Q78A 9CA2A 3CZVA 2WEGA 1CILA 1CRAA 2NXTA 4ZWXA 1BICA 1LG6A 1CCTA 1TE3X 3DC3A 3T84A 4JSAA 1I9PA 1H9NA 4Q8XA 1TH9A 3M1KA 3P44A 4E49A 1BNQA 4IWZA 2F14A 5FLPA 5E2NA 3NB5A 1CAMA 3P3JA 2NNGA 1G52A 3DVCA 3M5SA 5LMDA 3DA2A 3S71B 3D9ZA 2FW4A 5FNKA 3V7XA 3DC9A 1ZH9A 2AX2A 3OIMA 1I9OA 3M2ZA 4KAPA 1CAZA 1BZMA 4JS6A 3M40A 1DCAA 4Q8ZA 1UGEA 4JSZA 1DMXA 1FQLA 1Y7WA 5FNIA 1HCAA 1KWQA 4KNMA 4RFCA 4Q06A 3N4BA 5A25A 1TG3A 1HEDA 4MTYA 1CINA 5FLOA 5SZ4A 3PO6A 5AMGA 3ZNCA 1G45A 2CBDA 4YYTA 1Z93A 4Z1JA 1LZVA 1KWRA 3KLDB 1BN4A 4G0CA 5EHVA 3U47A 4FRCA 2HL4A 1TEUX 3P58A 4WUPA 4ZWYA 2W2JA 5A6HA 3HKQA 4BF1A 2NNOA 3C7PA 3BL1A 4MLTA 3KNEA 7CA2A 1DMYA 4Q09A 4CA2A 3M1JA 4DZ9A 3D0NA 1FR4A 2GD8A 3M1WA 3DCWA 3V3JA 1YO0A 1OQ5A 4PYYA 1CVAA 2IT4A 2CABA 4QSBA 3V3FA 3V5GA 4Q81A 3OILA 1HECA 1JD0A 2NNSA 1ZE8A 3HKUA 3KOIA 4FL7A 4LHIA 4IDRX 1CAJA 3PYKA 4Z1NA 2HD6A 1V9IC 1RZEA 4YXUA 1G0FA 3M1QA 4LP6A 3K7KA 4M2RA 4Z1KA 5SZ7A 3L14A 3RZ5A 1CNWA 3K34A 5J8ZA 1YDBA 4R5BA 2QP6A 2HKKA 5CJFA 3F4XA 3DVBA 1FLJA 5EOIA 3RJ7A 1RZCA 3HS4A 5DSKA 4LU3A 4Q99A 4XIWA 4KP5A 1FQNA 3DD0A 1KOQA 2NXSA 3ZP9A 1IF9A 5EIJA 3MNKA 2EU2A 3M2NA 5EKHA 3K2FA 5BRVA 4YXOA 3IBNA 5L6KA 1G3ZA 4RUYA 5E2KA 1LG5A 1AM6A 3S8XA 2NMXA 5FNJA 4XZ5A 5JEHB 3MHCA 1MUAA 3N3JA 3MDZA 4YGNA 3P55A 3N2PA 4QJOA 3SBIA 4QK2A 2CBBA 2FNMA 1BNUA 5SZ2A 4HU1A 4KUWA 4YGFA 1CVCA 4YGJA 1BCDA 1AZMA 1CNJA 1JCZA 3W6IA 4FPTA 2ZNCA 1CANA 4QSIA 1RZBA 1UGFA 2HOCA 3SAXA 1G54A 1HUHA 2X7UA 5G0CA 2HNCA 5SZ0A 4Q6EA 3IBIA 4Q49A 3MNHA 4RH2A 1G0EA 1TBTX 4UOVA 2WEHA 3CAJA 4XIXA 1ZSCA 3U3AX 2OSFA 3HKTA 3P4VA 4HEYA 5FNGA 1CNHA 4E3DA 4K1QA 4Q7PA 2Q1BA 5DRSA 2GEHA 3SBHA 1FSRA 3V3HB 4WR7A 4QSAA 5FLTA 1BNNA 2FOQA 5EHEA 5JG5B 1G4JA 4M2WA 3DCSA 1CVEA 4RIVA 3HFPA 4ITOA 3DV7A 1BV3A 2WEJA 3MHLA 3S73B 3KS3A 5DSQA 1CVDA 4M2UA 1EOUA 3KKXA 1V9EA 1YDCA 3PJJA 1BNTA 1OKMA 2EZ7A 4ZX1A 4M2VA 4XFWA 1T9NA 3RG3A 1XEGA 2POWA 2X7TA 2CBEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3BET A;  4Q7S A;  4QY3 A;  4ILX A;  1J9W A;  2FMG A;  3R16 A;  4DZ7 A;  1CNB A;  1TTM A;  2H4N A;  3RZ0 B;  4Q07 A;  3HKN A;  4MO8 A;  3M5E A;  4CAC A;  1BNW A;  1CRM A;  2OSM A;  4ETQ C;  5DSP A;  1RZA A;  5JDV B;  5IPZ A;  4Q90 A;  4Y0J A;  1FSN A;  1THK A;  5DVX A;  8CA2 A;  1CCU A;  1CAY A;  4GL1 X;  1YO1 A;  1G4O A;  3CA2 A;  3KOK A;  4QJW A;  3S77 B;  4RUX A;  4C3T A;  3MNI A;  3SAP A;  3S74 B;  2FOV A;  3V3G B;  5FL6 A;  3OKU A;  4G7A A;  5DOH A;  2FOY A;  3M2X A;  1A42 A;  3JXG A;  2QOA A;  3M98 A;  4E4A A;  3MWO A;  4CNX A;  5EKM A;  5FNL A;  5L3O A;  5EH8 A;  5JES B;  4BF6 A;  2X7S A;  1CAK A;  1CNG A;  3RYV B;  1UGG A;  1HCB A;  3OIK A;  1CNK A;  3RYJ B;  1ZNC A;  5JG3 B;  3KIG A;  1HVA A;  1JV0 A;  5SZ6 A;  3S9T A;  4QIY A;  1TB0 X;  2VVA X;  4KNN A;  1CAI A;  5JGT B;  3JXF A;  5SZ3 A;  3MHM A;  3S75 B;  2AW1 A;  3U7C A;  5JQ0 A;  4HEW A;  1UGC A;  2WEO A;  3V3I B;  2FOU A;  1BNM A;  4X5S A;  2HFW A;  1ZSB A;  1KOP A;  5DSJ A;  3RZ7 A;  3CYU A;  5E2M A;  5SZ1 A;  1XEV A;  3UYQ A; 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