4Q0LA

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with inhibitor
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 12
publication title Discovery and characterization of novel selective inhibitors of carbonic anhydrase IX.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q0lA00
2NWOA 6CA2A 1CRMA 1HCAA 1I91A 4E3FA 3HS4A 1CNWA 4QY3A 3ZP9A 1H4NA 4IWZA 4R5AA 4KP5A 4QK3A 3KOIA 2WD2A 1HEDA 5E2NA 1H9NA 3R17B 4DZ9A 1THKA 1FQMA 4YYTA 3S73B 1YO2A 3V3IB 4QEFA 3F8EA 3EFTA 4XZ5A 4Q9YA 3BL1A 3D9ZA 2FOUA 2VVBX 2QOAA 3MNHA 1F2WA 1ZSCA 1OKMA 1CCSA 1URTA 3DD8A 2F14A 1LG5A 4CNXA 3T5ZA 1IF8A 3MZCA 4ZWZA 2GEHA 2NWYA 3N4BA 4MLTA 4BF1A 1FR7A 3ML5A 4PZHA 1BNWA 5FNKA 2Q1QA 1H9QA 5JEGB 2CA2A 3PO6A 3P4VA 3UYQA 2X7UA 4KNNA 4ETQC 3V3FA 1G52A 1CCUA 4MDGA 1ZFKA 1AM6A 4YGFA 3LXEA 3IGPA 1RZAA 4L5WA 1IF4A 1LZVA 5DSQA 3S97A 3RG4A 1FR4A 3BETA 1FLJA 3KLDB 4DZ7A 1CVCA 3V2JA 1YDCA 1TB0X 1BICA 1UGAA 5JG5B 4ILXA 5E2RA 5J8ZA 3CZVA 3IAIA 3M67A 4UOVA 4YGKA 1HCBA 4E49A 4Q7SA 3CA2A 4WUPA 5EHWA 4Q87A 1G1DA 3S74B 1CNHA 4E3HA 1CAOA 1G53A 1CNBA 3RZ8A 3TVOX 1DCAA 1OKNA 4QSIA 3GZ0A 4LP6A 3T85A 3KOKA 1ZSAA 4E3DA 4HF3A 3DC9A 5FL5A 5DSRA 2HOCA 1AZMA 3RZ1B 5FLSA 4QJ0A 5A6HA 4HEYA 1Y7WA 1RJ5A 4QK2A 3RZ5A 5DSIA 5SZ6A 4K13A 1G6VA 4Q78A 3TVNX 4R5BA 1RAYA 3CYUA 3HKNA 3V2MA 2CBEA 4WW6A 5EH5A 1TEQX 3M1WA 1I9MA 5E2SA 5L3OA 3DCSA 1CNJA 3C7PA 3MWOA 5FLOA 3K2FA 5FNMA 5CACA 1KWRA 3MHCA 4QTLA 4KV0A 5FLTA 5JG3B 3W6HA 3DVCA 4Z1KA 3OKUA 2FOSA 5G03A 1ZE8A 4RIVA 4KNMA 4QIZA 3ML2A 4Q8YA 4ZX1A 4CNWA 3RYJB 1FQNA 2NNOA 2NXRA 3U3AX 3S78B 1IF7A 1TEUX 3HKQA 4ITPA 4TWMA 2AW1A 4JSWA 1DCBA 1MUAA 4Q09A 1J9WA 4K0TA 2POVA 4G0CA 1LUGA 1HECA 1FQLA 1RAZA 1TE3X 4LU3A 5EZTX 1JD0A 3F7BA 2FMZA 5FNIA 3DC3A 3M5TA 4R59A 4YGNA 1DMYA 2OSMA 1CVBA 4QJOA 1KWQA 5DVXA 2NMXA 3S76A 4Q99A 4FU5A 4WR7A 5LMDA 4KUVA 3PJJA 1TG9A 4M2VA 3M2XA 4QJXA 1I9LA 3P58A 3FW3A 3MNJA 3MNUA 5DSJA 1CAKA 2O4ZA 4X5SA 1RJ6A 1HVAA 3M04A 2X7SA 1CANA 2POUA 3P55A 3DV7A 2OSFA 1KOPA 5FDIA 1BN1A 2VVAX 3OYSA 4Z1NA 4QSBA 3JXGA 3M3XA 3S71B 2Q38A 4HT2A 1CAMA 1CNKA 5DSKA 1HEAA 1IF9A 5CLUA 4MLXA 1BNTA 2ABEA 4Q6DA 4Q8ZA 1UGCA 4YHAA 5DSMA 5SZ7A 3M98A 5SZ1A 3OIKA 4FVOA 5CJFA 1RZDA 4YXUA 1BNNA 2QO8A 3RLDA 5EKJA 4E9OX 5FLQA 5DSPA 3M14A 1Z93A 4N0XB 1A42A 1FSRA 3U47A 3M5SA 1G4OA 1V9IC 3V3JA 3T84A 7CA2A 3D92A 4ZWYA 4QSJA 3DVDA 2NXTA 5EIJA 4XIXA 5FL4A 4CNRA 4JSZA 4FRCA 3D8WA 5JESB 1ZGFA 4IDRX 1UGGA 4Q83A 2CBAA 1BNVA 1CCTA 1CVEA 1G46A 5BRUA 4HU1A 3B4FA 3M1JA 2NN1A 12CAA 1I90A 4TWLA 2ZNCA 3IBLA 3NJ9A 5AMDA 3P44A 3RZ7A 4MDMA 4Q07A 1CALA 2GD8A 5CA2A 3FE4A 2EU2A 4ZAOA 4ZWXA 4FVNA 1CA2A 3HLJA 3R16A 4HT0A 4CNVA 4QSAA 2X7TA 2NXSA 3V5GA 4ZWIA 2POWA 1DMXA 2NWPA 4QJPA 3S72B 1Z97A 3RYVB 3N2PA 3S9TA 1TBTX 2NNSA 3M2NA 3BL0A 5BNLA 3MYQA 4Q7VA 1RZCA 1EOUA 1YDBA 2FNMA 3N3JA 1BNQA 3T83A 4E3GA 3S8XA 3M96A 1CAZA 3JXHC 2HKKA 5BRWA 5SZ4A 4MDLA 1UGBA 1CRAA 3IBIA 4Q0LA 3MDZA 5DSOA 5EH8A 3DAZA 5JGTB 5L6KA 5EOIA 4RFCA 3KS3A 4RUZA 4RUYA 3V3GB 4Z0QA 5JGSB 2Q1BA 5BYIA 2WEJA 1I8ZA 3T5UA 3S77B 4XE1A 3P5AA 5HPJA 3M5EA 5E5UA 4CACA 3VBDA 1CVDA 2IT4A 4MO8A 2NNGA 4KUYA 5JQ0A 5FNLA 4M2RA 3SAPA 4Q6EA 5G0CA 4FL7A 4WUQA 3RYYA 5EHVA 4Q7PA 4GL1X 5BRVA 4Z1JA 2CBCA 3P5LA 3U7CA 1CILA 1CNYA 3MHMA 4ITOA 4RFDA 3QYKA 2HNCA 3FFPX 2QP6A 1UGEA 3D0NA 1CINA 3TMJA 4YXIA 2NWZA 4QJWA 4FIKA 1CNXA 2H4NA 4WW8A 5FNGA 3UYNA 3K34A 3DCWA 5IPZA 3MMFA 5JEHB 3RZ0B 4QK1A 3RGEA 4YVYA 8CA2A 5FLPA 4PYYA 3KKXA 1G0FA 5FL6A 1CIMA 1AVNA 1UGDA 3B1BA 3D93A 4L5UA 1BN3A 2H15A 4RUXA 4E5QA 4YXOA 1YO0A 4FPTA 4K1QA 2WEHA 2FW4A 5G01A 5AMLA 2FOQA 2NNVA 4K0SA 2EU3A 4CQ0A 3MHLA 3M2ZA 3DD0A 1JCZA 4Q08A 1YDDA 5SZ0A 4Q49A 3M1QA 5SZ5A 3M1KA 2EZ7A 4PQ7A 2W2JA 4YGJA 4YWPA 1HUGA 3RYXB 1G48A 2FMGA 3PYKA 1ZFQA 3HKTA 1IF5A 5C8IA 4HEWA 4KNJA 5EKMA 4KNIA 1CNGA 1MOOA 2FOVA 1KEQA 1BNUA 3KONA 2CBBA 1FQRA 3OKVA 4QJMA 3DCCA 1FSNA 5DOHA 4KUWA 1CVHA 5JEPB 4LHIA 1BV3A 3RJ7A 2WEOA 2HD6A 4RIUA 1TTMA 5DSNA 1TH9A 3F4XA 3NB5A 1CA3A 5E2MA 1ZSBA 3MNKA 3KIGA 4C3TA 4BCWA 4G7AA 1G45A 3EFIA 1CZMA 3DVBA 5G0BA 3ZNCA 1G54A 3L14A 2WD3A 1BN4A 3RYZA 1CAIA 3OIMA 5E28A 5EHEA 3SBHA 3CAJA 2FNNA 3OY0A 2CABA 4PYXA 1CAYA 3V3HB 4Q90A 3W6IA 1KOQA 4HBAA 4JSAA 1CAJA 3RG3A 4L5VA 1I9NA 4ZX0A 2CBDA 5EKHA 3M40A 3T82A 4Q81A 4K0ZA 4RH2A 1YDAA 5EH7A 3F7UA 3U45X 4Z1EA 3N0NA 2FOYA 1I9PA 3SAXA 1I9OA 5JDVB 1ZH9A 4N16A 1CVFA 1CNCA 2AX2A 4MTYA 5DSLA 5FDCA 4Y0JA 1CAHA 5DOGA 1V9EA 5E2KA 5SZ2A 3SBIA 4YX4A 3OYQA 4KP8A 1Z9YA 1ZGEA 1XPZA 4PXXA 1T9NA 1CNIA 1RZEA 2HFWA 1OKLA 1YO1A 3S75B 5JQTA 1CVAA 4JSSA 4XFWA 2WEGA 3JXFA 2FNKA 1I9QA 3KNEA 1TG3A 4CA2A 3NI5A 1LG6A 1IF6A 2NN7A 4COQA 1BNMA 1G3ZA 1XEVA 3MNAA 3V7XA 4HEZA 3K7KA 3OILA 1FSQA 4WL4A 3HKUA 1RZBA 3Q31A 3MHIA 3MNIA 3P3HA 5A25A 3DBUA 1HEBA 3KWAA 1G0EA 1LGDA 3MHOA 5FNHA 1JV0A 1ZNCA 3P3JA 4Q8XA 3HFPA 3M2YA 4M2UA 4Q06A 2HL4A 2ILIA 3DA2A 5DRSA 1OQ5A 1XEGA 4XIWA 4M2WA 1G4JA 5FNJA 3IEOA 4QIYA 4Q7WA 1BZMA 1BCDA 5FLRA 1XQ0A 5SZ3A 9CA2A 1HUHA 5AMGA 5E5RA 4YGLA 4E4AA 4JS6A 1UGFA 4BF6A 3IBUA 4KAPA 3IBNA 4RN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NWO A;  6CA2 A;  1CRM A;  1HCA A;  1I91 A;  4E3F A;  3HS4 A;  1CNW A;  4QY3 A;  3ZP9 A;  1H4N A;  4IWZ A;  4R5A A;  4KP5 A;  4QK3 A;  3KOI A;  2WD2 A;  1HED A;  5E2N A;  1H9N A;  3R17 B;  4DZ9 A;  1THK A;  1FQM A;  4YYT A;  3S73 B;  1YO2 A;  3V3I B;  4QEF A;  3F8E A;  3EFT A;  4XZ5 A;  4Q9Y A;  3BL1 A;  3D9Z A;  2FOU A;  2VVB X;  2QOA A;  3MNH A;  1F2W A;  1ZSC A;  1OKM A;  1CCS A;  1URT A;  3DD8 A;  2F14 A;  1LG5 A;  4CNX A;  3T5Z A;  1IF8 A;  3MZC A;  4ZWZ A;  2GEH A;  2NWY A;  3N4B A;  4MLT A;  4BF1 A;  1FR7 A;  3ML5 A;  4PZH A;  1BNW A;  5FNK A;  2Q1Q A;  1H9Q A;  5JEG B;  2CA2 A;  3PO6 A;  3P4V A;  3UYQ A;  2X7U A;  4KNN A;  4ETQ C;  3V3F A;  1G52 A;  1CCU A;  4MDG A;  1ZFK A;  1AM6 A;  4YGF A;  3LXE A;  3IGP A;  1RZA A;  4L5W A;  1IF4 A;  1LZV A;  5DSQ A;  3S97 A;  3RG4 A;  1FR4 A;  3BET A;  1FLJ A;  3KLD B;  4DZ7 A;  1CVC A;  3V2J A;  1YDC A;  1TB0 X;  1BIC A;  1UGA A;  5JG5 B;  4ILX A;  5E2R A;  5J8Z A;  3CZV A;  3IAI A;  3M67 A;  4UOV A;  4YGK A;  1HCB A;  4E49 A;  4Q7S A;  3CA2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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