4Q49A

Room temperature neutron crystal structure of apo human carbonic anhydrase at ph 7.5
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Joint neutron crystallographic and NMR solution studies of Tyr residue ionization and hydrogen bonding: Implications for enzyme-mediated proton transfer.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q49A00
4DZ7A 4Y0JA 2ABEA 12CAA 3HLJA 5A25A 3N3JA 3PJJA 1FQLA 1YDCA 2FOYA 5FL5A 4Q9YA 4CNWA 5EKMA 1IF7A 4ZWIA 3RZ1B 2WEHA 1MOOA 3CAJA 4C3TA 1Z97A 4WR7A 1IF6A 3N4BA 4YGFA 4MO8A 4Q8ZA 4Q83A 1RJ6A 1BCDA 1TBTX 1H9QA 1I9PA 5JEPB 3RYVB 3V3IB 1Z9YA 1HVAA 5AMGA 5BRWA 1OKNA 3S78B 5G03A 5E5UA 4ZWZA 1H9NA 3MNKA 3M96A 1AZMA 1CANA 4WUQA 3TVOX 4HT2A 1ZSBA 4E5QA 3MNUA 4FL7A 4E3FA 5JESB 5EH5A 1ZNCA 2NWZA 4Z1EA 1ZFKA 5JEHB 3U45X 3M3XA 3MNHA 3M98A 1CVFA 1OKLA 4Q8XA 5CJFA 3P55A 5DSJA 2FOVA 4YGNA 5CA2A 2QO8A 3S76A 1CNHA 1ZSCA 1OKMA 1ZGFA 1G4JA 2NMXA 4L5WA 3MZCA 4BF6A 1CIMA 4X5SA 4WL4A 5AMDA 2NWYA 4KNIA 1YO0A 3KNEA 3M14A 4YYTA 2FOUA 4L5VA 2FNNA 3FE4A 5SZ1A 2W2JA 4BCWA 1TE3X 3M1QA 1FQMA 1G6VA 3N2PA 1HCBA 4XFWA 4K0ZA 3U47A 5BRVA 1ZGEA 3DA2A 5FNLA 5A6HA 5FLOA 5DSMA 3UYQA 3MHOA 1RZCA 3KKXA 1IF8A 1IF5A 1CRMA 1XPZA 3M2YA 1AM6A 4RH2A 4E49A 1LG5A 2HKKA 2CBBA 3RG4A 5FNIA 3RZ7A 1CALA 5HPJA 1CCUA 3R16A 2GD8A 3F7BA 3DVDA 1BNWA 4YGJA 1G45A 2EU2A 3MWOA 4CNVA 2OSFA 1CNXA 1I9QA 1UGEA 4CACA 3P3HA 4JSSA 1YO2A 1BN4A 1G4OA 3Q31A 2Q1BA 3RLDA 4TWMA 3OKUA 1ZH9A 5FLTA 6CA2A 3ML2A 1CA2A 3P3JA 2NN1A 4Q07A 3C7PA 5FNHA 4LHIA 4ZWXA 5DSPA 2QOAA 5C8IA 3D8WA 4N0XB 5DVXA 1KOPA 1HEAA 3T83A 4QK2A 4Q7WA 1F2WA 3K34A 4FRCA 3QYKA 1KWRA 1RZDA 3M67A 4Z0QA 1JCZA 5J8ZA 4CNRA 3JXGA 5DSLA 2FNKA 5E5RA 9CA2A 4QJPA 4QK1A 4QJWA 4CA2A 3W6IA 2CBDA 4RFCA 4ZX0A 4R5BA 4LU3A 1CILA 3K7KA 3MHLA 3MNJA 1ZSAA 4FU5A 3KS3A 4FVOA 4K13A 1FR7A 2HOCA 3V2JA 3IBIA 4Q08A 4RUYA 4RIVA 2WEGA 1BN1A 1I8ZA 3IBLA 3V3GB 2AW1A 4QSJA 4PYYA 4QJMA 1TH9A 1I9LA 1CNWA 2WD2A 3DAZA 3F4XA 3K2FA 2H15A 3DD8A 4JSAA 1G53A 5FNKA 2FNMA 2VVBX 5DSKA 1A42A 3U3AX 3SAPA 5JDVB 4XIXA 3S8XA 3ML5A 4KP5A 3KOIA 2EZ7A 4WW8A 2Q1QA 3V5GA 3DVCA 3DD0A 5EH7A 1CAMA 3V3FA 3MYQA 5EIJA 1TEUX 4K1QA 1THKA 4R5AA 1YO1A 1HCAA 5CLUA 3FW3A 3ZP9A 3D0NA 1CVHA 3MDZA 4JS6A 4KNNA 4L5UA 4YHAA 4ZAOA 4QSAA 1LG6A 5AMLA 2QP6A 5FDIA 5LMDA 4MDLA 4DZ9A 2POWA 5SZ0A 1TG9A 1RJ5A 2FMGA 4HU1A 3CA2A 4G7AA 4Z1NA 3OIMA 4HF3A 5CACA 2FMZA 2WEOA 2X7TA 3F7UA 4M2RA 4N16A 3IBUA 1HECA 4BF1A 4ITPA 4Q81A 4PXXA 1CINA 4QSIA 1CZMA 3IAIA 4HEWA 4ZWYA 3S97A 3B4FA 1RAZA 3DCWA 1CAOA 3V7XA 1EOUA 3V3JA 1CCSA 2HL4A 1BZMA 3M5SA 1UGAA 3HFPA 4HBAA 3VBDA 5SZ5A 4QEFA 4TWLA 5E2MA 4Q78A 1G1DA 2NNVA 5EHEA 2CBCA 4Q7PA 1YDDA 2H4NA 1JD0A 3M2ZA 5FDCA 5FLPA 3KOKA 4ZX1A 4E4AA 3PO6A 1TG3A 3NB5A 3MHIA 5BRUA 3DCCA 5EKJA 1CVEA 5JG5B 1CNCA 3RYYA 1CAZA 3DC9A 4XE1A 4UOVA 3M1KA 4E9OX 4CNXA 2X7SA 3T84A 5IPZA 5EZTX 1V9EA 3D93A 3JXHC 1CAJA 3HS4A 3RYZA 2WEJA 3P44A 4RN4A 1BV3A 3HKNA 3M1JA 1CAIA 3DCSA 4KP8A 1BNQA 1CVDA 1CVCA 4Q6DA 4MTYA 3S72B 1BN3A 4MDGA 2CA2A 3CYUA 4RIUA 1DMXA 4HT0A 3MMFA 3KLDB 3DC3A 8CA2A 1Z93A 2VVAX 1HUHA 5EHVA 5G0BA 4RFDA 1TTMA 5E2SA 1BNTA 2NXSA 5EHWA 2OSMA 3S75B 5DSOA 3HKQA 4Q8YA 1RAYA 4COQA 3DBUA 4MDMA 1CRAA 1XEGA 4KNMA 5E2NA 4HEZA 4KUVA 1XQ0A 3T85A 1DCAA 1LZVA 1KOQA 5SZ4A 3MNIA 2F14A 1G0FA 2HNCA 5E2RA 2CBAA 4YXUA 3S9TA 1TEQX 2NWOA 1IF9A 3HKTA 3BETA 3OYQA 1ZFQA 1CVAA 1RZEA 4IDRX 4ITOA 5EOIA 5SZ3A 3JXFA 4QJXA 1RZBA 5DSRA 4E3HA 5JQTA 1BICA 3RZ5A 1IF4A 4Q0LA 4YXOA 2HD6A 4Q6EA 1I90A 5L6KA 5FLQA 3OYSA 3UYNA 4KUWA 1Y7WA 4Q87A 1I9NA 2Q38A 3OY0A 4M2VA 3SBHA 3KONA 1G0EA 4XZ5A 4K0TA 1G54A 3FFPX 3ZNCA 4KAPA 3TVNX 4KNJA 2NWPA 1RZAA 2NNGA 1G52A 1UGDA 3M04A 3M2XA 3B1BA 4QIZA 5DOGA 4Z1KA 1LUGA 4XIWA 3IEOA 4ILXA 4PZHA 7CA2A 1URTA 4QTLA 2FW4A 3IBNA 3RYJB 3EFIA 5G0CA 3M2NA 4Z1JA 5DOHA 1G3ZA 3HKUA 3CZVA 4FPTA 5FNMA 5JEGB 2CABA 1CAKA 4PYXA 1YDAA 4Q7VA 3SBIA 1CA3A 1BNMA 2NXTA 4YGLA 4QJ0A 5DSIA 2NNSA 4KV0A 3D9ZA 5BYIA 1AVNA 4R59A 5SZ7A 1HUGA 3BL0A 4YVYA 4Q99A 1J9WA 5JQ0A 2POUA 5EH8A 1FSQA 3M40A 1CNBA 5SZ6A 1CVBA 1FSNA 3DV7A 2ZNCA 3N0NA 5BNLA 2GEHA 5JG3B 3V3HB 3DVBA 3T5ZA 2HFWA 5DSQA 2X7UA 3LXEA 3S77B 1FSRA 1H4NA 1UGGA 5FNJA 4FVNA 4YGKA 5FL4A 1DMYA 4HEYA 2WD3A 2POVA 3BL1A 4QSBA 3RYXB 4YXIA 4RUZA 3MHCA 3NI5A 3OILA 1FR4A 4IWZA 4QY3A 3RG3A 1BNVA 1MUAA 3MNAA 2O4ZA 1I9OA 1G46A 5EKHA 2CBEA 3F8EA 5E28A 5FL6A 3S74B 1FQRA 1OQ5A 2NN7A 5JGTB 1V9IC 3M1WA 2ILIA 4Q06A 3MHMA 4CQ0A 4MLTA 5FLSA 3T82A 3RZ8A 1CNGA 5JGSB 1KWQA 1UGBA 3IGPA 1UGCA 1CNIA 4QK3A 4LP6A 4YX4A 4JSZA 5SZ2A 1XEVA 3TMJA 4M2UA 4QJOA 4KUYA 1DCBA 1HEBA 4FIKA 3S73B 1FLJA 2NXRA 1CNJA 5DSNA 3RGEA 3S71B 3V2MA 1G48A 3OIKA 3OKVA 1ZE8A 1CNKA 3KWAA 3P4VA 1JV0A 3EFTA 1CNYA 5DRSA 4YWPA 5G01A 3P5AA 3R17B 4Q90A 4MLXA 4Q49A 4WUPA 1KEQA 4E3GA 2FOSA 1UGFA 3GZ0A 5E2KA 4M2WA 4Q09A 1CAYA 4RUXA 4GL1X 1BNNA 1FQNA 2IT4A 3SAXA 2NNOA 3KIGA 2FOQA 1CCTA 3P58A 1I91A 4WW6A 4K0SA 3RZ0B 3W6HA 5FLRA 1YDBA 3PYKA 4Q7SA 3RJ7A 2EU3A 2AX2A 1TB0X 4PQ7A 4QIYA 3M5TA 3M5EA 3T5UA 4JSWA 1CAHA 1BNUA 4ETQC 1T9NA 4E3DA 3P5LA 5FNGA 5L3OA 4G0CA 1HEDA 3D92A 3L14A 3NJ9A 1I9MA 3U7CA 1LGDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DZ7 A;  4Y0J A;  2ABE A;  12CA A;  3HLJ A;  5A25 A;  3N3J A;  3PJJ A;  1FQL A;  1YDC A;  2FOY A;  5FL5 A;  4Q9Y A;  4CNW A;  5EKM A;  1IF7 A;  4ZWI A;  3RZ1 B;  2WEH A;  1MOO A;  3CAJ A;  4C3T A;  1Z97 A;  4WR7 A;  1IF6 A;  3N4B A;  4YGF A;  4MO8 A;  4Q8Z A;  4Q83 A;  1RJ6 A;  1BCD A;  1TBT X;  1H9Q A;  1I9P A;  5JEP B;  3RYV B;  3V3I B;  1Z9Y A;  1HVA A;  5AMG A;  5BRW A;  1OKN A;  3S78 B;  5G03 A;  5E5U A;  4ZWZ A;  1H9N A;  3MNK A;  3M96 A;  1AZM A;  1CAN A;  4WUQ A;  3TVO X;  4HT2 A;  1ZSB A;  4E5Q A;  3MNU A;  4FL7 A;  4E3F A;  5JES B;  5EH5 A;  1ZNC A;  2NWZ A;  4Z1E A;  1ZFK A;  5JEH B;  3U45 X;  3M3X A;  3MNH A;  3M98 A;  1CVF A;  1OKL A;  4Q8X A;  5CJF A;  3P55 A;  5DSJ A;  2FOV A;  4YGN A;  5CA2 A;  2QO8 A;  3S76 A;  1CNH A;  1ZSC A;  1OKM A;  1ZGF A;  1G4J A;  2NMX A;  4L5W A;  3MZC A;  4BF6 A;  1CIM A;  4X5S A;  4WL4 A;  5AMD A;  2NWY A;  4KNI A;  1YO0 A;  3KNE A;  3M14 A;  4YYT A;  2FOU A;  4L5V A;  2FNN A;  3FE4 A;  5SZ1 A;  2W2J A;  4BCW A;  1TE3 X;  3M1Q A;  1FQM A;  1G6V A; 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