4Q5TA

Crystal structure of an atmb (putative membrane lipoprotein) from streptococcus mutans ua159 at 1.91 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
b'GQKNDKNTLTVGVMTMTDSDKERWDKIEELLKKENIKLKFKEFTDYSQPNKALKNGEIDINSFQHYNFLNNWNKENKGDLVTVAETYISPINLFSGTENGKAKYSSAKEIPNGGQIAIPNDATNESRALYVLQDAGLIKLNVSGDELATVKNIKSNPKNLDIKEVDASQTARNLASVDAAVVNNSYAVPAKIDFKTSLYKEKVNEGSKQWINIIAAQKNWKKSKKAAAIKKLIKAYHTDAVKKVIKKTAKGVDEPVWM'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of an atmB (putative membrane lipoprotein) from Streptococcus mutans UA159 at 1.91 A resolution
rcsb
molecule keywords Lipoprotein
source organism Streptococcus mutans ua159
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q5tA02
1N7XA 4KYDA 1MPCA 1MQDA 3JYRA 4ZEDA 3N26A 1UQWA 3PV0E 2DWHA 4LUBA 4LA9A 3FASA 3C31A 1BKAA 5EHMA 4F1YA 3OENA 5CI5A 3CFXA 2F35A 1LAGE 4R75A 3DELB 4YB7A 3BFTA 2I4CA 4Q0CA 3CG1A 3OO8A 2A5TB 3S9LC 1ANFA 3FVNA 2GRVA 4OVJA 3K1PA 4RPOA 2UYFA 1S7YA 4UA8A 3N6TA 3Q27A 4EF1A 3TUSA 5LOMA 3G3HA 2F6GA 4IO4A 4ELOA 2H5YA 3UGWA 4GLIA 3CG3A 1IXCA 1D9VA 4AB6A 2O51A 3QK6A 1B3HA 1RYOA 1D3KA 3B7DA 4NF8A 4F3SA 1MDQA 4ECFA 3R26A 5AA1A 2Y7RA 3BBRA 2DYXA 1J1NA 4NF4A 3TDJA 3CVGA 1LFHA 2ZYMA 1FQCA 3MPKA 1QVSA 3SEYA 4H1XA 2RC8A 2DSFA 4G77A 1LLSA 1FW0A 4U1OA 3SETA 3F11A 3U1OA 5DYHA 4OMBA 1JW4A 5DEXB 1USYE 1IQ7A 4YU0A 4QSCA 4NF8B 1MQHA 3ODBA 3C34A 1B6HA 2Y7IA 1B1XA 5CRYA 4PFYA 1DPEA 4PETA 5H8QA 2F97A 3Q26A 1WODA 1Y20A 1B3GA 2OJTA 4ZS9A 4MH5A 3OO6A 4IGRA 5L8DA 2DE3A 3ILUB 3H6WA 4DDDA 1B7HA 1JQFA 1MQIA 3M3FA 2HZLA 2NOOA 5FHMA 3D4CA 3FJGA 3PUVE 3QUFA 3LSWA 4Q30B 2O84X 2FA7A 3FZVA 1Y3PA 1XHYA 5H8HA 3SEWA 1LAFE 1O64A 5H8NA 1MQGA 4Z0IA 3K02A 3QAXA 3DP8A 5IKBA 4AB5A 2RKMA 4JB7A 3QSLA 3U72A 3G3KA 5I2NA 1OVTA 3KJTA 2Z8EA 3A09A 4R6HA 3KBRA 3E9XA 3TCFA 3E3KA 1A55A 4N07A 1FTKA 4UACA 1B05A 2RF1A 5I59B 1POTA 2ONSA 3PPOA 1XVYA 2RC9A 3M3KA 4NWDA 2OCUA 3UN6A 2D3IA 1BIYA 3ZSFA 4O3AA 1ATGA 1URGA 2DOJA 5DTBA 3ZKLA 2V3TA 5AA2B 2PYYA 5H8FA 3T96B 4LONB 4QSEA 1WDNA 3Q25A 5L9MA 3TODA 3KJ7A 1NNFA 2I0CA 3G7WA 5H8NB 3S9MC 1SD3A 4I62A 5JTYB 4U4XA 1LCTA 3HHGA 1NFTA 3O29A 5A5XA 2UYEA 2VOZA 4HCYA 3HV1A 4GVOA 2ALUA 2VHAA 4KYSA 2F7CA 1QULA 1FQAA 4IY5A 1IIWA 4RYAA 2QS2A 4LVQA 1FQEA 4QHQA 1GTKA 1H45A 1Z7NE 1MY1A 3P7IA 1TXFA 1QUIA 3O28A 3OEKA 1MXVA 3T9XB 3VE1B 4QFLA 1SW5A 1QJMA 3EF7A 3MP1A 3Q28A 3LSFB 2NVUB 2YJPA 4XKQA 5B7DA 4N13A 4ZE9A 1TT1A 3QUJA 3MQ9A 1B3FA 3FXUA 3RUMA 2DQVA 3ZS6A 3KZGA 4F3BA 1CE2A 4OESA 2ZNTA 3PPNA 1MPDA 3TELA 1B4ZA 3SESA 1LFGA 4OFLA 3IB2A 3FV2A 4JSDA 4HS7A 1MDP1 1AMFA 5DVFA 4XTCQ 3I6VA 4OETA 1DOTA 3C33A 1QUKA 2A5SA 1GV8A 2WKYA 1PBPA 2XD3A 3KN3A 3O9PA 3A3UA 2AL5A 4OYVA 1F9BA 1YCJA 4FEBA 3H6VA 2V93A 2ANJA 3IOVA 2OWTA 3L6HA 2HEUA 2XXQA 4JWXA 2Q88A 1MQJA 3CRBA 3W9WA 4YAHX 4F2QA 4OFOA 2Y7KA 4OWDA 4Z7EA 3UA8A 1B2HA 3VVEA 2I4BA 4JXIA 4OEVA 2H25A 4PE5B 4H0WA 2X26A 4GL8A 4KD5A 5BUUA 4LZ5A 4QRZA 3MW0A 5K2XA 2I0BA 2O1MA 5FTIA 1RYXA 2E0SA 3OEMA 4GOTA 1II5A 1I6AA 4H5GA 2DWAA 3A3CA 1JEUA 3EN3A 4ZEFA 2HAVA 1LAXA 4TOZA 3PUWE 1B0LA 2I58A 4RK9A 5CMMA 4NWCA 4YMBA 2KLFA 4F29A 3MAMA 3W15C 3TTKA 3RLFE 5HM4B 3RPWA 3H03A 2NWJA 2VGQA 4QFPA 1US4A 3LSXA 3K0VA 2YLNA 3OOAA 4ESWA 1QKBA 3T9UA 2UVIA 2ESNA 2OBGA 1BTJA 1P1OA 1XS5A 3PPPA 4OXVA 4DCYA 4PQJA 3RN8A 3G3GA 4IO2A 3FGSA 3GBAA 5JK4A 5KZTA 1IITA 5DVJA 3V89B 4NF5B 4LATA 4POWA 3SEUA 2Z8DA 5CMBA 2GHAA 4LQ5A 3EHTA 3OSQA 3G3JA 1LGBC 1FTOA 4Q8RA 2XXPA 1P1UA 5CMCA 2REJA 1P99A 3TMGA 4DXUA 5DEXA 5TP9A 2ZYNA 5HPQA 2DS9A 2F78A 5AA2D 1M5FA 2Q2AA 2XX7A 3KGCA 2P2AA 1BLFA 2I6EA 3UK4A 3CSGA 4WEDA 3T9VA 4GWOA 4ZECA 4QSDA 4HW8A 2LAOA 1URSA 5AE4A 1PDAA 1N3WA 1M5CA 4F1VA 4KI0E 3TZAA 3B6QA 1JW1A 3MJNA 5B70A 5I2KA 2XXIA 1MRPA 2QS1A 4JBZA 5ISUA 1A8FA 2Q8JA 3C35A 4OZ9A 5K2YA 1POY1 4RK2A 3S9NC 4XKNA 1UTBB 3LBSA 2H9BA 2X7QA 3K1NA 3PGFA 3KOSA 4LP2B 3TTNA 3VFJA 3V83A 4MLQA 1B1HA 1NL5A 3KEIA 4EQBA 4LQ2A 4ND9A 3R6UA 1MY4A 5TP9B 1MM6A 4OHNA 1R6ZA 2QSXA 4R72A 3D4GA 3MVYA 4YB5A 2O1LA 2DP8A 3TKDA 1LBBA 2DXYA 2HFBA 3PD8A 2ONRA 4EF2A 2V3UA 1WVJA 3FATA 1MXUA 5AA4A 4G4PA 2Y7PA 4H65A 3IJXB 1NKXA 1QKAA 3HPIA 2G29A 4BDQA 4EXKA 4ELRA 4U4SA 2O7UA 3DP6A 2HZKA 5I2KB 1OLAA 3WAEA 1PBQA 4F19A 4JDFA 4R2FA 1O7TA 4IO6A 3IOTA 2P1SA 5I59A 3H3GA 3V8XB 1PEBA 3IB1A 4ESXA 3THIA 4R6KA 2F8DA 3IR1A 2OZZA 2P0SA 4F22A 5ICTA 5AA2A 3TPAA 2AL4A 4H8IA 5EYFA 3VXBA 5TU0A 1B5JA 4EQ9A 1AIVA 1CB6A 1ZIUA 5KCJA 4HCWA 1PB7A 5JTYA 4DZ1A 1IXGA 5FHOA 4AQ4A 1EU8A 5AA4B 1OQHA 3JV9A 1B5IA 2OLBA 2ZYKA 3IOWA 1JEVA 4TQUQ 4R73A 1JW5A 1Q1KA 5EHSA 2PVUA 2XX8A 1Y1ZA 2DVCA 2XXVA 4L17A 2CMOA 4XKPA 1B3LA 1I6BA 4YKPA 3L6GA 4C1TA 3GBBA 2DE2A 1B3EA 1AH5A 1FQBA 3PU5A 2QMWA 1R9QA 3BKIB 3FXRA 3SKPA 2BJJX 3MZ1A 4NF6B 4FATA 4H5FA 4FE8A 4KR5A 5KCJB 2ZXTA 1NNKA 2QS3A 4RA1A 1ZMGA 3VVDA 2GH9A 3PPQA 3SEVA 1S50A 4YMAA 1MXXA 4KQPA 2OK2A 2O69A 3MZBA 3N5LA 4EDPA 3H7MA 1YPNA 3QXMA 2B3BA 4GL0A 4YICA 1SI1A 4Q5TA 4FIMA 3VDFA 1B5HA 3FUZA 4BDOA 4M1VA 1VSOA 4K3FA 1VR5A 3BFUA 1AOVA 4XXUA 2B65A 3TTRA 4DXCA 4FEDA 1Y3NA 4ZZAA 3O97A 2DE4A 4YZZA 4O3BA 2D5WA 4ZZEA 3O2AA 3H6UA 5TPAA 3HSTA 3KOTA 5L9OA 1MY2A 1SBPA 4R6YA 5F1QA 3W9VA 1GGGA 4PFWA 1LCFA 2ZYOA 3CR9A 3PMXA 3S4UA 1NNPA 3B6TA 1R9LA 4GD5A 2PMSA 2Q9TA 1MPBA 1N84A 1ZKBA 1P1QA 1SW1A 3H06B 3K6UA 1P1NA 2HAUA 1MS7A 4C0RA 3U93A 1NNTA 1OLCA 2G93A 2F5XA 2H4IA 1MG1A 1FTMA 2PX1A 1Q35A 1UTHB 3UIFA 3AXFA 1H44A 1B52A 5I84A 5TPAB 1SI0A 3IB0A 4OFJA 4F1UA 3FVOA 5F7VA 1XC1A 4YKKA 3VLWA 3TQLA 4GFRA 1N76A 4BLAA 2Y84A 1M5BA 3MVXA 2REGA 5H8SA 3LR1A 4F31B 4DLDA 3MP6A 5CMKA 2F34A 4OERA 2Z22A 1EZ9A 3IL1B 1LBCA 3IX1A 2D21A 1Y3QA 1N3XA 4DCXA 4R9GA 2X7PA 2DXRA 4PFUA 3GZGA 5I58B 3FD3A 2R71A 1MH4A 3ZKKA 4TLLB 1ZU0A 2Z23A 3C32A 4U21A 4LZ7A 3KSJA 3N94A 1BP5A 4JWYA 2F6PA 2IA4A 5ELVA 4RXLA 4MF3A 1I69A 4MFIA 4KCCA 1SYIA 5I56B 5BWJA 4M4GA 1EZOA 3IORA 4KPTA 4G8NA 3KN7A 4H8JA 4NF5A 3OO9A 5ITPA 2O7IA 4JSOA 4MLVA 4KYEA 3FVKA 1MH3A 3EHUA 2OWSA 3ILTB 5ICQA 4GRKA 3RY3A 4ZEKA 1FCKA 3PUZE 2UVJA 1IXHA 2XHDA 2R9JA 3C36A 3O6GA 4YKIA 3EPEA 3CI8A 4OQOA 2HXWA 4GXSB 2Y7WA 2V84A 2QPQA 3E13X 2I48A 4QFOA 4WXJA 1XVXA 1PC3A 2I49A 3HO7A 5J1DA 3TEPA 3N6UA 3K01A 4IB2A 4R2BA 4P11A 1A99A 4X48A 3OELA 2DWIA 1VFDA 4RY1A 2VD3A 1UIVA 3IO4A 2HCAA 1SYHA 1I6QA 4I1DA 2PT1A 4P0IA 1UTBA 3UP9A 2R6GE 3K6WA 5M2VA 5KDTA 3E4RA 4DE8A 3K6XA 4G68A 4WEPA 4FORA 1B46A 3DLNA 4ZEIA 2RCBA 2UVGA 3OMBA 4U2RA 3U94A 1ZJLA 1JETA 4F3PA 5CM6A 3S2VA 1FQDA 3PUXE 2AIXA 1VFEA 3GXAA 4F18A 1SVXB 3MUQA 5I57A 3PMVA 2H99A 4NMYA 3K00A 4X9TA 3GLBA 1IZ1A 1LAHE 3QYTA 4OENA 1T0KA 1H43A 1SQYA 3T22A 3FJ7A 2DVZA 3Q29A 2FYIA 5AA3A 1JNFA 4EXLA 3SEXA 5ITOA 2I3VA 2UXAA 5CBSA 4NTLA 2AYSA 2H98A 5KDTB 3O66A 3VXCA 1Y9UA 4BDMA 1TFDA 4F39A 2XXHA 4G68B 3T93B 3O6IA 3VLUA 2F7AA 4E0WA 2QL3A 1N7WA 3C4MA 3IAZA 2M8CA 3MVZA 1MY3A 3SERA 1Z7ME 3TYHA 2YPNA 1RKMA 1IUDA 5I57B 2QS4A 3KN8A 2NUVA 2XD2A 1ZBMA 2XX9A 3FVGA 3IJOB 1B58A 2XXRA 4G8HA 4E0XA 4NF4B 1B32A 3MP8A 3K1MA 1ZTYA 3M3LA 3OXNA 2ONKE 1B40A 4IO7A 2UVHA 1YTVA 4F2OA 1OIBA 3USDA 1GR2A 3U8QA 2W7YA 3IK6B 2CZLA 2O68A 4NF6A 1EZPA 4ELQA 4YB6A 3LSLA 4GF8A 4ZE8A 3G3FA 3UORA 3M8UA 2I3WA 1H76A 1ZLQA 3TCHA 5JEIA 4ZEBA 2E1SA 1A40A 3G3IA 4C1UA 2ZMBA 4THIA 4JWOA 2XXYA 1JVXA 3H6TA 1QW0A 3RT6B 1XOCA 2QMXA 2B3FA 3OSRA 5FTHA 4H6DA 3PD9A 3RT8A 1DSNA 4DIGA 5H8QB 4P0GA 4U1ZA 4FJPA 4O3CA 3CFLA 1A8EA 1SW2A 3DP4A 3VVFA 5CBRA 5L9SA 2XXWA 4BDLA 1AL3A 1UIUA 3CFZA 3K2DA 3QIMA 4X1DA 2IEEA 1OMPA 1FTJA 4H67A 4XKRA 1IXIA 1B7UA 1D4NA 4PP0A 3T9HB 4R74A 1N04A 4G8MA 3EHSA 3TQWA 3C9HA 1EH3A 3HHFA 4TLMB 4KHZE 3O6HA 2THIA 4ZDMA 4LZ8A 3TFLA 3RGYA 1R1NA 5DVIA 5HBCA 1OQGA 1ELJA 1YAEA 1S9TA 1PB8A 1URDA 3WAFA 5H8HB 1JVYA 4QF9A 3DM0A 2Z8FA 3EQ1A 1VE4A 4PFTA 3PPRA 4I8CA 2RINA 2ZNSA 2O6AA 1P1WA 2GFEA 1TFAA 4I9DA 4FECA 4NEDA 3T66A 5I2NB 3OD7A 1Y1MA 1L5TA 4IGTA 1DMBA 2FNCA 1NH8A 4RPNA 3LC8A 3MPLA 5FHNA 2VD2A 4QFKA 2RCAA 3U92A 4ISUA 3CSBA 2Q2CA 1B51A 4OTEA 3MZ9A 2GHBA 1B4HA 3HCQA 1UTHA 3MBPA 1NH7A 3HN0A 2PBWA 1M5EA 1B9JA 3FXQA 2NXOA 4X1BA 5H8FB 1US5A 1IEJA 3SDFA 4POXA 1HSEA 4ONYA 1MXWA 3IOUA 3CIJA 3VLVA 4EQ7A 1USYH 2HQ0A 1SW4A 1MXYA 3RNNA 2RC7A 1HSLA 5A5XB 1LB8A 1LSTA 3FIRA 4WKMA 1MXZA 3K6VA 1SDXA 1D9YA 2ABHA 5I58A 4XIGQ 2F7BA 1N0TA 3S9EA 4U23A 3FJMA 1Y4TA 4F3GA 2QJEA 1TWYA 4YKJA 3ECRA 4QFNA 1MM7A 1B7ZA 3KFMA 1DPPA 3PUYE 3JZJA 1GVCA 5I56A 4KCDA 4GQOA 5CC2A 1H3DA 4N6PA 1DTZA 1PB9A 3MC2A 2V3QA 1MY0A 4FAJA 1LB9A 4R9FA 2V25A 4KFQA 4OEUA 4G2ZA 3ONMA 2Q89A 4DXBA 4U22A 1B0HA 4GIZA 3V5AA 3MVWA 4MBPA 4G68C 1KWHA 1LFIA 2F36A 3K4UA 1A7LA 4IY6A 3KG2A 3MWBA 5IAIA 3TAJA 4IO5A 2ZNUA 1M5DA 3RTFB 4BDNA 1Y4CA 3OO7A 3KSXA 4RJZA 1DTGA 3H4ZA 4GXAA 4EUOA 2DWJA 4ELPA 3IO6A 2XXUA 3VV5A 1A54A 1XT8A 3TTMA 2A5TA 1OVBA 2VP1A 2QRYA 1FQFA 3RQTA 2PT2A 4HTGA 3TCGA 3LUYA 4RNSA 1O63A 3I3VA 1HSJA 2XXXA 4BDRA 1QUJA 1NMUA 1FTLA 4NE4A 5DT6A 3R7XA 2XXTA 3B6WA 3TTLA 3I5OA 4IO3A 3FV1A 3RTWB 3PMWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MAGA 1N7XA 4KYDA 1MPCA 1MQDA 3JYRA 2WYPA 2Y5KA 4ZEDA 3N26A 1UQWA 3PV0E 2DWHA 4H46A 4LUBA 4LA9A 3FASA 5EQ9A 3C31A 1BKAA 5EHMA 5I7IA 4F1YA 3OENA 1FPGA 5CI5A 3CFXA 2F35A 4PFIA 1LAGE 4OVPA 4R75A 3DELB 4YB7A 3BFTA 2I4CA 4Q0CA 1NV4A 3CG1A 3OO8A 2A5TB 3S9LC 1ANFA 3FVNA 2GRVA 4OVJA 3K1PA 4RPOA 2UYFA 1S7YA 4UA8A 3N6TA 2CZHA 3Q27A 4EF1A 5ET6A 3TUSA 5LOMA 1NV1A 3G3HA 2F6GA 2R8TA 4IO4A 4ELOA 2H5YA 3UGWA 1LEVA 4GLIA 3CG3A 1IXCA 1D9VA 4AB6A 4OANA 2O51A 1FSAA 3QK6A 1B3HA 1NV2A 1RYOA 4P1EA 1D3KA 3B7DA 4NF8A 4F3SA 1MDQA 4ECFA 3R26A 5AA1A 2HXRA 5LTCA 2Y7RA 3BBRA 2DYXA 1J1NA 4NF4A 3TDJA 4NQ8A 1NI9A 3CVGA 1LFHA 2JJKA 5T3JA 4OA4A 2ZYMA 1IMCA 2Q74A 4QXDA 1FQCA 3MPKA 1QVSA 3SEYA 4H1XA 2RC8A 2DSFA 4G77A 1LLSA 1FW0A 1K9YA 2FBPA 4U1OA 3SETA 3F11A 3U1OA 5DYHA 1IMDA 4OMBA 1JW4A 5DEXB 1USYE 1IQ7A 1K9ZA 4YU0A 4QSCA 4NF8B 1MQHA 1YXIA 4PGNA 3ODBA 3LV0A 4MCOA 3C34A 1B6HA 4N17A 2Y7IA 1B1XA 5CRYA 4PFYA 1DPEA 4PETA 5H8QA 2F97A 3Q26A 1WODA 1Y20A 1B3GA 2OJTA 4ZS9A 4MH5A 3OO6A 4IGRA 5L8DA 2DE3A 3ILUB 3H6WA 4DDDA 5EQAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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