4Q5TA

Crystal structure of an atmb (putative membrane lipoprotein) from streptococcus mutans ua159 at 1.91 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GQKNDKNTLTVGVMTMTDSDKERWDKIEELLKKENIKLKFKEFTDYSQPNKALKNGEIDINSFQHYNFLNNWNKENKGDLVTVAETYISPINLFSGTENGKAKYSSAKEIPNGGQIAIPNDATNESRALYVLQDAGLIKLNVSGDELATVKNIKSNPKNLDIKEVDASQTARNLASVDAAVVNNSYAVPAKIDFKTSLYKEKVNEGSKQWINIIAAQKNWKKSKKAAAIKKLIKAYHTDAVKKVIKKTAKGVDEPVWM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of an atmB (putative membrane lipoprotein) from Streptococcus mutans UA159 at 1.91 A resolution
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus mutans ua159
molecule keywords Lipoprotein
total genus 85
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q5tA02
4F29A 4XTCQ 1MPCA 3DELB 2VD3A 4DZ1A 1WVJA 4GXSB 4G77A 4H8IA 3U8QA 4R6HA 1DPPA 4KYEA 4OQOA 2A5TA 4JXIA 4JWOA 5I56A 4MLQA 3UK4A 4FEDA 1IZ1A 1SVXB 3EHTA 2DYXA 3TYHA 5TP9A 1D3KA 1MXXA 3RT6B 1MS7A 3TTNA 1NMUA 4ELRA 1GR2A 1TXFA 2P0SA 3CFZA 3MZBA 1FQAA 4ZZEA 1MY3A 3OEKA 3U93A 4ELPA 1BLFA 4R6YA 1A99A 4LZ7A 4F2OA 4F31B 1NL5A 2XXUA 5KDTB 2Q8JA 4LP2B 1XVYA 1EU8A 3VFJA 5EHSA 4HS7A 2P2AA 2DSFA 1JVXA 2VOZA 2X7PA 1RYXA 4OFLA 3QYTA 2XXHA 1XT8A 1FTKA 3K6WA 1AL3A 1B0LA 1LLSA 3ZS6A 2XXPA 4U2RA 4BLAA 1IITA 4DCXA 1FW0A 3MC2A 3MPKA 2YPNA 4FATA 3HV1A 4Q30B 1XOCA 4KQPA 4IO2A 4PFUA 3TODA 1QUIA 4NF4A 3TCGA 4I1DA 3MP1A 2YLNA 3KN3A 4KYDA 4FECA 1H3DA 5H8HB 3T96B 3PPOA 1SW2A 4PFWA 5I58B 1LAGE 2W7YA 2Y7IA 1VR5A 3C31A 3CG3A 3SKPA 1B32A 2I4CA 4OENA 4BDQA 4RPNA 3TEPA 1URSA 4FE8A 1BKAA 1EZ9A 5ITOA 3OD7A 3HN0A 4H5FA 1CE2A 2NWJA 4NWCA 3H6VA 4OHNA 1GTKA 2XXWA 3N94A 3BBRA 2G93A 4HCYA 3VXBA 3RTWB 1MY1A 2NXOA 2DWHA 3LSLA 3O2AA 1JW1A 3C4MA 2GRVA 1GVCA 4FORA 2DVZA 3MP8A 4ND9A 3K2DA 2H25A 2I3VA 3BFUA 3C9HA 1NH8A 1KWHA 2NVUB 3UORA 1Z7ME 2DWAA 4XKQA 4ZEBA 1DSNA 2ZNTA 1QJMA 2A5TB 5I56B 4GF8A 3RPWA 3W9VA 3RGYA 3TZAA 2XXTA 3C34A 4GRKA 4F39A 2XD3A 2H98A 5B70A 2XXIA 5CRYA 5TP9B 3Q25A 1B46A 3Q26A 5I2NA 4QFLA 1Y4CA 4UACA 1B3FA 1TFDA 1OQGA 2IEEA 5H8NA 5EYFA 1JEUA 4AB5A 4HTGA 3KJTA 3MUQA 3IB2A 1HSLA 4R74A 1DMBA 1MDQA 2O7IA 4N13A 1DTGA 1MXVA 1R1NA 1LFHA 3LSFB 3FXQA 1NFTA 3PUWE 1LAXA 4ELQA 2OLBA 1LB9A 4PFTA 1F9BA 4IO3A 2Z8EA 3E3KA 3M3KA 3OO8A 3K1MA 5DEXA 2OWTA 3BKIB 1M5CA 5FHOA 3VDFA 3VVFA 1LAFE 4FJPA 5DT6A 2DOJA 4GXAA 3OO6A 2F97A 4H67A 3GBAA 3IB0A 4TOZA 2I49A 2NUVA 3N6TA 3Q29A 4I62A 1Y3QA 4NF4B 2H4IA 1B1HA 1FQBA 5AA3A 3U94A 4QHQA 4RK9A 1MXZA 3VE1B 5J1DA 3FV2A 1B4HA 3T9VA 4RJZA 2OZZA 1QUJA 3ILUB 3K6UA 3USDA 4RK2A 3ZSFA 4OYVA 1IEJA 1MXUA 3OOAA 5I57B 1VFEA 3IOTA 2I4BA 4OESA 3T9HB 1DPEA 1P1WA 5I84A 2M8CA 4ZDMA 1I69A 3GBBA 3PPPA 1Y3PA 4LA9A 2V25A 5ISUA 3PMWA 3N26A 4FIMA 5BWJA 1SI1A 5AA2D 3PUXE 4PFYA 4X9TA 4F18A 1OLCA 1UIUA 4QRZA 4JBZA 4YKKA 1B3HA 4F19A 3MVXA 2QS1A 3PUYE 1P1NA 3MP6A 3ONMA 4ZS9A 2GHAA 1P1UA 3AXFA 1FTJA 2F7BA 1VSOA 2Y84A 5KCJA 5JEIA 1BTJA 2R9JA 4L17A 3LSXA 4YKJA 4OZ9A 3VXCA 3F11A 1IXHA 3MJNA 1USYE 3EPEA 1B7UA 1ZIUA 3ECRA 4G8MA 4QFOA 3U92A 1IXCA 1M5EA 3R6UA 4EUOA 4H6DA 2RCAA 4C1UA 1YPNA 1JW4A 5I2NB 4JSDA 2XXYA 3T9UA 4IO7A 4YB7A 3CR9A 5L9MA 3SEWA 1MM6A 2DE2A 3IR1A 2D5WA 4EQBA 3RQTA 1PDAA 2O1MA 4YU0A 3RLFE 3FASA 1POTA 4Z7EA 2Y7PA 2REJA 5FTIA 3IJOB 4NF6A 4LUBA 3FUZA 4BDRA 4PQJA 3C33A 4C1TA 1ZMGA 1PB8A 1SYHA 4GIZA 5DEXB 4F3GA 3PUZE 3TFLA 3E13X 1A7LA 2PVUA 3SETA 2RINA 4BDMA 4H5GA 2OCUA 1AMFA 4R72A 2ABHA 3I3VA 2UVIA 4IO5A 5AE4A 5JTYB 3N5LA 1AOVA 1MQGA 2HZKA 5CBSA 1IQ7A 5FHNA 2F35A 1B6HA 3KSJA 4H65A 4KHZE 3SEXA 4DXUA 1IUDA 2GHBA 1ANFA 2VD2A 2F36A 3RT8A 1PEBA 2F78A 3K0VA 3SDFA 1SDXA 1SD3A 3H4ZA 1QULA 2QPQA 2AL5A 4QFNA 2XX9A 2G29A 5DVJA 1BP5A 3JYRA 2DXYA 3OSQA 3N6UA 5H8FA 4EXKA 3CFLA 4FEBA 1MY4A 2DWIA 2ZYMA 4X1DA 4NWDA 1WODA 4NF8A 1B2HA 3KN8A 2PMSA 2CMOA 1FTMA 5CI5A 3CVGA 3Q28A 2HXWA 3G3FA 3IX1A 4AQ4A 5KCJB 4POWA 4OFJA 3FIRA 3TQLA 4YMBA 4GL8A 5FTHA 3EHUA 4RY1A 2WKYA 5I2KA 1M5BA 1Y20A 1SYIA 1Q1KA 1R6ZA 1MPBA 2HFBA 1LBBA 2QMXA 4G4PA 3QUFA 4ZEIA 2XHDA 5HPQA 3FATA 3S9MC 2XX8A 3E4RA 4G8HA 2QSXA 2RF1A 4HCWA 3HCQA 4EDPA 3MWBA 2F34A 4KYSA 3U72A 4M4GA 2O51A 2UVJA 1MH3A 3CRBA 4Q5TA 3KOSA 2HAUA 3TPAA 3VV5A 1HSJA 3HO7A 1XC1A 3KSXA 4M1VA 1N04A 2X7QA 4X48A 3MAMA 1ZJLA 4QSCA 4P0IA 2R6GE 4THIA 4U1ZA 4RXLA 2Y7KA 4YKPA 5HM4B 5DVIA 3L6HA 1B4ZA 1NNTA 1USYH 3IOVA 5A5XB 5EHMA 3ODBA 4F3BA 1S50A 1Q35A 3CG1A 2RCBA 1B5HA 1P99A 1N7XA 3G3GA 4Q8RA 4Z0IA 4GLIA 5CM6A 2QL3A 3GLBA 1DOTA 3B6WA 3K01A 3FJMA 3MVWA 3V89B 3D4CA 3EHSA 3KGCA 1N3WA 3KEIA 1EZOA 2DXRA 3DP8A 4EF2A 3O6IA 3KZGA 1AIVA 4R75A 1UTBA 3IOWA 1QW0A 3ZKKA 1IXGA 2PT2A 2XXQA 1YAEA 3H6TA 4OWDA 4YMAA 4NMYA 2ZYNA 4F2QA 4R6KA 1RYOA 1ZBMA 4AB6A 4F3PA 2I6EA 1MPDA 4RNSA 4NTLA 3TTMA 1SW1A 5I59A 2UYFA 3W9WA 3QK6A 2Q89A 4GFRA 2Q9TA 4R9GA 4YICA 4FAJA 5H8FB 3V8XB 1P1QA 2XD2A 1N76A 2F7CA 5KZTA 1LAHE 2OJTA 4LQ5A 1B58A 4NF5A 5IKBA 4NF8B 3I5OA 3FVOA 3IK6B 2B3BA 2RKMA 3PV0E 4QSEA 1Y1MA 4JDFA 4F1YA 1B3EA 3OENA 3IJXB 1MY0A 3PD9A 4BDNA 5DVFA 3FZVA 4KFQA 1TFAA 3G3KA 1QVSA 1PBPA 3DM0A 1US4A 2IA4A 3UIFA 1CB6A 4IY5A 1VFDA 5I2KB 2A5SA 4O3AA 4F22A 2O68A 3GZGA 3TTKA 3CI8A 1B05A 1A8EA 4OFOA 2PX1A 3UN6A 3TTRA 1UIVA 3JV9A 4OETA 5ICTA 4TLLB 1GGGA 3P7IA 4G68C 1LFGA 3VLVA 5FHMA 3FJ7A 3TAJA 2UYEA 4XKRA 4GVOA 4KCDA 4ZEFA 1I6AA 4PETA 2ONSA 3PPNA 1H43A 4OERA 4R2BA 4DXBA 4P0GA 4JWXA 1SW5A 2Z22A 4U4XA 3OMBA 1SQYA 1B40A 5B7DA 5HBCA 1MY2A 1MQIA 1II5A 2PT1A 3S2VA 4O3BA 1FTOA 1LSTA 1DTZA 4IO6A 4DE8A 4UA8A 4KR5A 4C0RA 3JZJA 3MZ1A 4U23A 4TQUQ 5BUUA 2AYSA 5IAIA 3O28A 1PBQA 4OEVA 3M3FA 3PPQA 1A55A 3QUJA 1PC3A 4G68A 4OVJA 1ATGA 1B3LA 2UVGA 4ELOA 3C36A 4Q0CA 3O6GA 4RYAA 2H9BA 3H03A 3S9EA 3BFTA 1VE4A 4DCYA 3LBSA 2DQVA 4ESWA 1MQJA 3S9LC 4U22A 2E1SA 4ESXA 4PE5B 5I59B 2XXRA 5TU0A 2P1SA 1OIBA 5ITPA 2HEUA 2R71A 3TELA 5H8NB 1QKBA 3TCFA 3MVZA 4ZE9A 1Y1ZA 1B5IA 1I6QA 4I8CA 3FVKA 2HAVA 4IGRA 3HHGA 3KJ7A 4NF5B 4K3FA 4E0XA 1POY1 1D9VA 1JW5A 1MQDA 3VLWA 2LAOA 2RC7A 1ZLQA 2Z8DA 5TPAA 4GL0A 1N3XA 2Z23A 1HSEA 4KCCA 4GWOA 3IOUA 4ISUA 1NH7A 3G3JA 2REGA 2ZNUA 3IB1A 5CBRA 1NNPA 4R9FA 4XIGQ 5AA2A 4YB5A 1MRPA 4WEDA 3SEUA 4WEPA 1OVTA 2QRYA 2F7AA 3MW0A 2V84A 2O69A 3K6XA 2VP1A 4KPTA 1B9JA 3G7WA 1EZPA 4U1OA 4ZECA 5CC2A 2ZXTA 3V5AA 3I6VA 1LBCA 4XXUA 4WKMA 4RPOA 1R9LA 3PGFA 4QF9A 5L9SA 1TWYA 3PUVE 3RUMA 1FCKA 4LZ5A 1MG1A 1SW4A 3KOTA 1B3GA 2AL4A 4U4SA 4ZE8A 3V83A 1H76A 5H8SA 5ICQA 3UGWA 2E0SA 2RC8A 2YJPA 1RKMA 1NKXA 2QJEA 4EQ7A 4N6PA 3EN3A 4ECFA 5DYHA 4DLDA 4OMBA 4WXJA 3PD8A 1FQEA 3OXNA 4MH5A 3SERA 3TTLA 3TDJA 1XS5A 1LGBC 2H5YA 2I48A 2BJJX 2I58A 1OVBA 3MPLA 1O64A 2I0CA 3O9PA 1AH5A 3MZ9A 3PMVA 3QXMA 4GD5A 3LSWA 1FQFA 4G68B 3W15C 1MXYA 1OMPA 2D3IA 3LUYA 4R73A 4MLVA 1US5A 4U21A 4OEUA 4LATA 4TLMB 4HW8A 3S9NC 1B0HA 1T0KA 2HCAA 3OSRA 2THIA 4EXLA 1O7TA 1URDA 3H3GA 2F8DA 5CMKA 3DP4A 5AA4A 3IL1B 3FXRA 2ZYOA 4H0WA 4F1VA 3A3UA 4XKNA 4LVQA 1D4NA 1URGA 3B7DA 4NEDA 4ONYA 3T93B 3E9XA 1O63A 4OXVA 4NF6B 5TPAB 2Q2AA 3LR1A 3VLUA 3T66A 5I57A 5H8QA 2B3FA 5CMMA 2ONKE 1FQCA 1M5FA 2O1LA 5AA2B 3UP9A 3RNNA 3FVGA 1B5JA 2QS2A 1LFIA 1JEVA 3C32A 2Y7WA 1OQHA 2DS9A 3HHFA 2O7UA 1ZTYA 4ZEKA 2H99A 4XKPA 4JSOA 4ZEDA 2HQ0A 3UA8A 2OWSA 4RA1A 1S7YA 1MDP1 4LZ8A 3K6VA 3FGSA 2GFEA 3SEYA 1B7ZA 2B65A 1B1XA 1B7HA 3M3LA 1JNFA 3H7MA 4N07A 1MQHA 4PP0A 2QMWA 1TT1A 2DE4A 3LC8A 1A8FA 1PB9A 3PPRA 4KI0E 1N0TA 3K4UA 1Y9UA 3TUSA 2PBWA 3G3HA 2PYYA 1NNKA 2DWJA 2VHAA 2QS3A 1FQDA 1OLAA 4OTEA 3K02A 5CMBA 1M5DA 3MQ9A 2DVCA 2F5XA 3RY3A 1MM7A 5LOMA 3KN7A 3ILTB 4GQOA 2XXXA 1A40A 4GOTA 2DE3A 3KBRA 3QIMA 2HZLA 5AA1A 3IORA 4YZZA 2O84X 3SEVA 3QAXA 2CZLA 1N7WA 3K1PA 3A3CA 4F1UA 3A09A 1IXIA 2FYIA 4YAHX 1MXWA 1YTVA 2OBGA 1ELJA 5F7VA 3PU5A 2ALUA 1SBPA 1LCTA 5L9OA 2XXVA 4IB2A 2F6GA 4EF1A 1WDNA 5CMCA 4LONB 2Y7RA 1XVXA 1JETA 2F6PA 3KFMA 1I6BA 4E0WA 5AA4B 4O3CA 1UTHA 5DTBA 1L5TA 3VVDA 5JTYA 3T22A 4I9DA 4MF3A 4BDOA 1MH4A 1IIWA 3QSLA 3FJGA 4QFPA 1EH3A 2ZMBA 3IAZA 2XX7A 5M2VA 2AIXA 3MBPA 3B6QA 4KD5A 3OELA 3GXAA 4EQ9A 2DP8A 2ONRA 1B51A 3DP6A 5L8DA 1Z7NE 2ZYKA 5H8QB 3M8UA 2V3QA 4G8NA 3H6UA 3FXUA 3PMXA 4DXCA 1LB8A 2UXAA 3O97A 3WAFA 4H1XA 4QFKA 3T9XB 4IY6A 4MBPA 3CFXA 3FVNA 4P11A 4DIGA 1JQFA 4YB6A 5KDTA 3Q27A 3SESA 3THIA 3WAEA 1A54A 2FA7A 3CSGA 5K2YA 1JVYA 3G3IA 2V93A 1S9TA 4X1BA 1YCJA 3HSTA 1QUKA 2I0BA 2D21A 4JWYA 2OK2A 3R26A 1UTBB 3DLNA 3EF7A 1GV8A 1UQWA 4R2FA 1QKAA 4MFIA 3RTFB 3HPIA 3L6GA 4ZZAA 1NNFA 2V3TA 3D4GA 3K00A 1FTLA 4H8JA 1D9YA 2ESNA 1H45A 3B6TA 2O6AA 4F3SA 1R9QA 3VVEA 5ELVA 2ANJA 5H8HA 1BIYA 3TCHA 1Y4TA 2ZNSA 3CIJA 4POXA 5I58A 2KLFA 3K1NA 1B52A 3IO6A 4IGTA 3KG2A 4IO4A 1Y3NA 3RN8A 4JB7A 4QSDA 1LCFA 3EQ1A 4BDLA 3O66A 3TKDA 4LQ2A 3O6HA 2QS4A 2V3UA 3OEMA 1PB7A 2RC9A 2FNCA 3R7XA 3TQWA 3ZKLA 3OO7A 2NOOA 3H06B 3U1OA 4DDDA 3FV1A 2VGQA 5A5XA 3S4UA 1J1NA 1ZKBA 2Q88A 3C35A 3MVYA 1XHYA 1H44A 1P1OA 2Q2CA 3IO4A 3TMGA 3CSBA 2Z8FA 3OO9A 3FD3A 5JK4A 3O29A 2GH9A 2X26A 4NE4A 5F1QA 1SI0A 4G2ZA 4YKIA 1N84A 5K2XA 3H6WA 2I3WA 1ZU0A 2UVHA 1UTHB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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