4Q5TA

Crystal structure of an atmb (putative membrane lipoprotein) from streptococcus mutans ua159 at 1.91 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GQKNDKNTLTVGVMTMTDSDKERWDKIEELLKKENIKLKFKEFTDYSQPNKALKNGEIDINSFQHYNFLNNWNKENKGDLVTVAETYISPINLFSGTENGKAKYSSAKEIPNGGQIAIPNDATNESRALYVLQDAGLIKLNVSGDELATVKNIKSNPKNLDIKEVDASQTARNLASVDAAVVNNSYAVPAKIDFKTSLYKEKVNEGSKQWINIIAAQKNWKKSKKAAAIKKLIKAYHTDAVKKVIKKTAKGVDEPVWM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of an atmB (putative membrane lipoprotein) from Streptococcus mutans UA159 at 1.91 A resolution
rcsb
molecule keywords Lipoprotein
molecule tags Transport protein
source organism Streptococcus mutans ua159
total genus 85
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4q5tA02
4ZEBA 2XXPA 3FXRA 1XVYA 5H8QA 3UP9A 1USYE 1H3DA 3O6IA 4C1UA 4BDNA 4G8MA 2OWTA 1LAHE 3PU5A 1B40A 2B3BA 1FQEA 1ANFA 4NWDA 2G29A 1UTHB 1I69A 4QRZA 2QMWA 3IOVA 1R6ZA 1SW4A 1MXUA 4P0IA 4IO3A 1R9LA 2Q2AA 4X1BA 1POY1 3MAMA 5TPAA 4XKPA 1DSNA 4RJZA 4LZ8A 2Q8JA 1OVBA 3EPEA 3MJNA 3T9UA 1PC3A 4YKPA 3H6TA 3ODBA 2DE2A 4BDQA 4QSCA 1QKBA 3SERA 1P1QA 2DE4A 2QSXA 3G3FA 3K4UA 3U94A 2V93A 4E0XA 1NH8A 3S9LC 4IO7A 1PB8A 4I8CA 3OD7A 4HCWA 3IK6B 4GQOA 1GVCA 3MZ1A 3MPLA 1NKXA 4R6YA 5AA3A 3RQTA 1FQAA 2Z8FA 3CG1A 1HSEA 4JSDA 3C9HA 1UTBB 2O84X 2X26A 2REJA 3O6GA 4QF9A 4OETA 1EZPA 4LZ7A 4THIA 1HSJA 2ZYOA 1JVXA 5JEIA 5IKBA 1N3WA 3LBSA 1QUKA 3FXQA 2THIA 3QSLA 2HZLA 1MDQA 5CI5A 2QS2A 1A54A 4ISUA 1ELJA 2O51A 4L17A 1LB9A 2NXOA 1BKAA 3RGYA 4DCYA 4GL8A 3ONMA 5DVJA 1N3XA 2F8DA 1Y4CA 3TODA 2QJEA 1SI0A 1FTJA 4OYVA 1WODA 3O2AA 3UA8A 2R6GE 2ONKE 4G68B 3PUYE 2F7CA 1QW0A 3FJGA 4ELRA 3QAXA 3N6UA 2QPQA 3PGFA 4GF8A 3SEWA 4YMAA 5FTIA 3Q29A 4RK2A 1PB9A 4R6KA 5I57A 2H4IA 4ELPA 1PDAA 4PE5B 4YKIA 5L9MA 1MS7A 3IL1B 5ISUA 1D4NA 1B2HA 3G3KA 5KCJA 4GD5A 1VSOA 4RY1A 3MBPA 4R75A 2GHAA 1IXIA 4ZEDA 1A7LA 5CBSA 3W9VA 3QUFA 4KQPA 1JW1A 2Z8DA 4F1YA 4H0WA 3PPRA 4XIGQ 3ZS6A 5CM6A 3N94A 3PD9A 3N6TA 3RNNA 1NNPA 2A5TB 3GZGA 4GVOA 4U4SA 4PFWA 4Q8RA 1YAEA 1SYIA 4Q5TA 5DEXB 3UK4A 1DPPA 3K2DA 5AA4B 2F5XA 3QUJA 2I6EA 1S9TA 2YJPA 2ONSA 1T0KA 3FD3A 3QXMA 4OMBA 3V8XB 1PBQA 1MY4A 3OO8A 1ZBMA 1Z7ME 2ABHA 3RUMA 1H44A 4P0GA 3KSXA 1FQCA 3Q25A 4LZ5A 3DM0A 1P1WA 5A5XB 1IXCA 1OLAA 3HV1A 3IOUA 3Q27A 4IO6A 4G4PA 4KI0E 3EF7A 3MWBA 2XXXA 3PMVA 4DDDA 1TWYA 5TU0A 3MW0A 4KR5A 4I1DA 5I59B 1ZIUA 2H98A 3RT6B 4YAHX 3IR1A 4ONYA 2DS9A 1US5A 4O3BA 3K02A 4U4XA 4QFPA 1UTHA 4GL0A 2ZMBA 3DP4A 3H3GA 1LFIA 4JDFA 5H8HB 5I58B 3N26A 4GOTA 3CG3A 3FVGA 2Y7PA 4RPNA 4H8JA 1MPDA 1AMFA 1HSLA 4BLAA 1QKAA 1Y4TA 3EHUA 3JV9A 4YB5A 2OCUA 2DVZA 5CMCA 1LFHA 2XX8A 1P1UA 1URGA 2Y7KA 3FZVA 1MXXA 1B3LA 3DP8A 3T93B 4GRKA 3MVWA 1AL3A 2D3IA 4OHNA 1P1NA 3W9WA 2Q89A 1USYH 4R2FA 1UTBA 4JXIA 3G7WA 1NNKA 2QMXA 2O68A 2Q2CA 3FV1A 1CB6A 3QYTA 1MXWA 4U23A 4LUBA 2BJJX 1EZ9A 3UN6A 3K6VA 3E4RA 3TQLA 3SEYA 4LQ2A 3MVYA 4F3PA 3O66A 5JK4A 2O1MA 4IY5A 4PQJA 4HW8A 1LSTA 1D9YA 4NF4B 5CC2A 5KDTB 2O7UA 2HZKA 4YKKA 1GR2A 2O6AA 1B7HA 5F1QA 1FTMA 3AXFA 3K0VA 1GV8A 2IA4A 4G68A 1MG1A 1ZTYA 1JW5A 2ZNUA 4M1VA 3TAJA 3PPPA 3IB2A 1DTZA 4G77A 2DWJA 3VLWA 1JETA 5B70A 4H6DA 4G8NA 4EF2A 3KFMA 2ZYMA 4OFLA 2V3UA 4ZDMA 4OFOA 2W7YA 1B9JA 1POTA 5H8NB 4R72A 1XHYA 5JTYB 4ESXA 4FATA 2H9BA 2PT1A 1PEBA 2CZLA 4U2RA 2VGQA 1EU8A 1DTGA 1LLSA 4MLVA 1MRPA 3A3CA 2IEEA 1YPNA 3PUXE 3TPAA 4MLQA 1TFDA 3RT8A 2ZYNA 3K6WA 3A09A 2UVJA 3C4MA 3H06B 3TCFA 4FEBA 3MVXA 2F6GA 2A5TA 1JVYA 3O28A 4BDLA 1DOTA 4LQ5A 4N6PA 2DXYA 4F39A 5FHOA 2AL4A 4KFQA 5DEXA 2I58A 3FJMA 3CFZA 5L8DA 4KYEA 5EHSA 5AA4A 1IUDA 4OFJA 1B0LA 1IXGA 1B05A 3FASA 3UGWA 4YICA 5CMMA 3HPIA 3KGCA 1B5HA 1RYXA 1PBPA 3EN3A 2AYSA 4OQOA 2PX1A 1GTKA 5A5XA 4LATA 3O9PA 4JWOA 1NNFA 3V89B 4OZ9A 4AB5A 2OZZA 3I6VA 5L9OA 2ZXTA 3KEIA 1ZKBA 1LAXA 2WKYA 4DXCA 1A55A 1ZMGA 4AB6A 4F19A 3KSJA 1FQBA 5I59A 1FTLA 4QFLA 1OQHA 3PD8A 3G3JA 4EXKA 1VFEA 3IX1A 1URSA 5ICQA 4EQBA 1I6AA 1QJMA 4OESA 3A3UA 4WKMA 4FEDA 2DQVA 3PUVE 4U1ZA 3OEKA 3CIJA 4DIGA 5H8HA 5I58A 3D4GA 3IAZA 1A8EA 3C36A 1TT1A 2HAUA 3PPNA 3S4UA 4DE8A 3OO6A 3L6HA 3R26A 1ZU0A 1B32A 1ATGA 2XXIA 4C1TA 4NF8B 4GLIA 3KOTA 3BKIB 4FAJA 4GXSB 2F6PA 4NE4A 1I6QA 1XC1A 3S9EA 3MC2A 3D4CA 4KYSA 3CVGA 3L6GA 1NNTA 4JWYA 4ZS9A 4X48A 3FATA 3BBRA 3C33A 1B3GA 2VP1A 1TXFA 3E3KA 2HQ0A 1AOVA 4RK9A 1A99A 1SD3A 2XXVA 5AA2B 1B1XA 2P1SA 3F11A 2I0CA 3MP6A 3KG2A 2DSFA 2X7PA 5F7VA 1SYHA 4U1OA 3EHSA 1DPEA 5H8FB 1N7WA 2QL3A 3DP6A 2PMSA 1EZOA 2H99A 3FIRA 4Z7EA 4NEDA 3PUZE 1WDNA 1OIBA 2GFEA 4POXA 2OBGA 1LFGA 3T9HB 2NVUB 3RY3A 3GBBA 3B6QA 3KBRA 3TCGA 3ZKLA 3U1OA 3TTKA 1MPBA 1MH3A 2I48A 2HFBA 4F1UA 2OLBA 3OO9A 4OWDA 4ZZEA 4IGTA 3T9XB 2RC8A 1UQWA 4NF4A 1SW2A 5KDTA 3SKPA 4XKNA 2GHBA 1B7ZA 2OJTA 1LAGE 3IJOB 2REGA 2FYIA 3TTRA 5FHMA 4H1XA 5I56B 3U72A 2Q9TA 1NH7A 5K2YA 4NF6B 1BIYA 3IB1A 5ITOA 1MY3A 2XXYA 4LVQA 3C34A 3S9MC 3FVOA 2UVIA 1JNFA 2DOJA 2ANJA 5BWJA 1Z7NE 2ZNSA 3VXBA 3LSWA 1B3EA 2H5YA 3JYRA 3TTLA 4PFYA 3SESA 3TZAA 3FVKA 5H8NA 5JTYA 1P1OA 3OELA 1N76A 1B46A 1URDA 4DXBA 2DWIA 1M5CA 2YLNA 3MVZA 1IEJA 1M5EA 4RNSA 2NOOA 1Q35A 3M3LA 2VD3A 4UACA 3C31A 3HCQA 2CMOA 1B51A 2HCAA 1IQ7A 4WXJA 4F1VA 4NTLA 3TDJA 1B6HA 3TUSA 4PFUA 2P2AA 3LSLA 5I84A 3KN7A 2AL5A 2DVCA 4G8HA 1Y1MA 5EYFA 4ND9A 1NFTA 3G3IA 3PPQA 3WAFA 1FTKA 1MY0A 5BUUA 3VVFA 3H7MA 3B7DA 1O64A 2V25A 1LAFE 4ESWA 1Y3PA 3MP1A 5LOMA 3N5LA 2R9JA 3KN8A 4R9GA 2RCAA 3RPWA 5ICTA 3IO6A 3OMBA 1I6BA 2RC9A 3KZGA 3BFTA 2A5SA 2RCBA 2D5WA 3H6UA 3VVEA 4EQ7A 1AH5A 4GFRA 1SQYA 3VV5A 2YPNA 3LUYA 3TKDA 4JB7A 4EDPA 2QS4A 4XKRA 2F35A 3LSFB 4R6HA 5B7DA 1MPCA 3VDFA 3W15C 3VLVA 1B5IA 1LCTA 3U8QA 2HXWA 4F2QA 4I9DA 1VE4A 4ZECA 1PB7A 1MQJA 4F3BA 3VLUA 3T66A 4XXUA 2ZNTA 3SEVA 3V5AA 1S50A 2ONRA 3M3FA 5HBCA 4TLMB 4RPOA 1IZ1A 5FTHA 4AQ4A 3ZKKA 1QUJA 3TTMA 4IGRA 3PPOA 3I5OA 1R1NA 3TCHA 4G68C 1MQGA 2F34A 2M8CA 4XKQA 3TELA 1XS5A 4BDOA 3E9XA 4MBPA 3O6HA 4NF8A 4IB2A 4MF3A 3MUQA 3IOTA 3USDA 4FIMA 4R9FA 3IO4A 3K01A 3PMWA 3IORA 3RLFE 1FTOA 3T22A 3HN0A 1YTVA 3RTFB 3OSQA 5DTBA 1QUIA 4EXLA 4IO2A 4R74A 2NWJA 1JEUA 2E1SA 5J1DA 3M8UA 3K00A 2OWSA 1J1NA 1SDXA 3CRBA 2I3VA 3OXNA 5AA2A 3H03A 1O63A 4NF5B 1Q1KA 1BLFA 4DCXA 2UVHA 5I2NB 1MXZA 3ILUB 2XXTA 5H8FA 1LGBC 1MXVA 1DMBA 2R71A 4ZEIA 2PT2A 4TLLB 4OEUA 4TOZA 3OO7A 1A40A 2Y7WA 1B58A 3CSGA 4O3CA 3B6WA 4OERA 2Y7IA 5ITPA 4F2OA 1EH3A 1VFDA 5CBRA 5CMKA 4F29A 3CFXA 3G3GA 3O97A 4N13A 3PV0E 4FECA 1H45A 1IXHA 4R2BA 2UYFA 1FW0A 1US4A 4F31B 2O7IA 2XD2A 3KJTA 4IO5A 4C0RA 1L5TA 1VR5A 3EQ1A 4XTCQ 2AIXA 2F7AA 4DXUA 4EUOA 5I56A 4QFOA 3VE1B 1SW1A 1LBBA 4NF6A 4QFNA 1UIUA 3U93A 3KJ7A 5DT6A 4PP0A 1B4HA 4Q30B 3GBAA 2ALUA 1SBPA 5M2VA 5TP9B 4H5FA 1MH4A 3WAEA 2I4CA 2F36A 1B0HA 3UORA 1MY1A 4PETA 3SEXA 4QHQA 3B6TA 2G93A 2XHDA 3H6WA 1Y3NA 4K3FA 4DLDA 3LR1A 3VVDA 1D9VA 3H6VA 1RKMA 4ZE8A 2XXHA 3OSRA 3K1PA 1M5DA 4KHZE 3G3HA 4RXLA 3SEUA 4JWXA 3VXCA 2B65A 3O29A 4F3SA 1JW4A 1Y9UA 3MPKA 3BFUA 2DXRA 1MXYA 4UA8A 2F7BA 5DVFA 2F97A 2PBWA 4R73A 2P0SA 1H76A 3E13X 1JEVA 2V3TA 4Q0CA 4BDMA 4JBZA 5ELVA 4LA9A 2UXAA 3DELB 2XXWA 3FJ7A 4POWA 5I2KB 4OENA 2VOZA 5FHNA 1RYOA 1LB8A 3HSTA 3U92A 1N04A 3GLBA 4WEDA 3THIA 1UIVA 2QRYA 1B52A 1LBCA 3EHTA 1XVXA 3TYHA 1SW5A 3SDFA 2GH9A 1Y20A 1Y3QA 4KCCA 2RKMA 4JSOA 4H67A 4H5GA 1OQGA 2Z23A 2V3QA 1B1HA 1MQHA 3KN3A 3TEPA 4NMYA 3JZJA 4YB6A 1F9BA 5H8QB 3QIMA 3Q26A 4YKJA 3PUWE 4KPTA 1XOCA 1IITA 2XD3A 2O69A 5AE4A 2E0SA 4YMBA 3S9NC 3CFLA 1M5BA 3P7IA 3KOSA 1OMPA 2RF1A 3ECRA 3IB0A 4ELOA 1N7XA 3HHFA 2KLFA 4X9TA 2DP8A 3K6UA 3FXUA 1ZJLA 5TPAB 2H25A 2X7QA 3FV2A 1N84A 4KCDA 4X1DA 2Z22A 1MDP1 2F78A 3CSBA 2Y84A 4ZEKA 5HPQA 4QSDA 5AA2D 2FA7A 4LP2B 1MQIA 5L9SA 3V83A 3K1NA 3OEMA 1N0TA 3VFJA 4HTGA 3DLNA 5K2XA 3RTWB 1B7UA 5IAIA 2PVUA 4IY6A 4O3AA 4U22A 1QULA 1B4ZA 4NF5A 4G2ZA 3TTNA 3LSXA 4OVJA 5I2NA 3MZBA 1D3KA 3IJXB 2Z8EA 1BP5A 3TMGA 4BDRA 2FNCA 2I49A 3ZSFA 1FQDA 5DYHA 3MQ9A 1MY2A 4HS7A 5CMBA 2RC7A 4F3GA 4E0WA 3CI8A 2GRVA 1R9QA 3OENA 1MQDA 3FGSA 3K1MA 4RYAA 3RN8A 3IOWA 4FORA 1H43A 3CR9A 2DE3A 1II5A 3GXAA 2DWAA 1FQFA 5AA1A 2DWHA 3UIFA 2QS3A 3OOAA 1WVJA 4EF1A 1P99A 4GXAA 1S7YA 4OXVA 4OTEA 4YZZA 3T96B 4MFIA 5DVIA 1O7TA 4ELQA 2UVGA 2XXUA 2O1LA 2DYXA 1ZLQA 1QVSA 4ZEFA 2XXQA 1OLCA 1CE2A 1A8FA 2B3FA 1NMUA 1MM7A 3MP8A 3TQWA 2QS1A 2I0BA 2XXRA 5H8SA 3R6UA 4IO4A 1KWHA 4FJPA 2D21A 2UYEA 5TP9A 1B3FA 4HCYA 1B3HA 1NL5A 4YU0A 1MM6A 2HEUA 3ILTB 4I62A 2HAVA 3R7XA 5I57B 4MH5A 4ECFA 1BTJA 1TFAA 4QSEA 1JQFA 4KD5A 2ESNA 4OEVA 1Y1ZA 5KCJB 4ZE9A 3PMXA 4KYDA 4F22A 3S2VA 1M5FA 1YCJA 4EQ9A 1XT8A 4U21A 3C35A 4NWCA 3M3KA 2XX7A 4YB7A 4DZ1A 4FE8A 2VHAA 2OK2A 5CRYA 2NUVA 4ZZAA 5EHMA 3SETA 1SVXB 4TQUQ 4RA1A 3TFLA 3FUZA 1SI1A 4Z0IA 4PFTA 5KZTA 3I3VA 2Q88A 4WEPA 3T9VA 4GWOA 5I2KA 2XX9A 3MZ9A 3FVNA 3Q28A 1B5JA 4N07A 2LAOA 2I3WA 2RINA 3QK6A 3HHGA 4H8IA 1GGGA 5HM4B 4P11A 2PYYA 4M4GA 2I4BA 4F18A 4GIZA 3HO7A 1AIVA 3H4ZA 2Y7RA 1OVTA 4QFKA 4LONB 1IIWA 3LC8A 4H65A 1LCFA 3K6XA 2V84A 1FCKA 2ZYKA 3C32A 2VD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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