4Q87A

Crystal structure of 1-hydroxy-4-(trifluoromethyl)pyridine-2(1h)-thione bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q87A00
4FRCA 3U7CA 1KOQA 1BICA 1XPZA 2NNSA 4XZ5A 5BYIA 8CA2A 3T5ZA 3HFPA 5DSKA 3DCWA 4Q99A 3RZ0B 3T85A 5DSJA 1H4NA 3MNUA 3DV7A 4QIZA 4YGFA 4QK2A 3IBIA 4Q87A 1CANA 1YDCA 4PQ7A 3F8EA 3R17B 3DBUA 3BETA 5SZ2A 2CBAA 1UGBA 3MHIA 2FW4A 4L5VA 4YVYA 5FLQA 1G0FA 3U3AX 4BCWA 4E3HA 1CA2A 5DSMA 3RG4A 3R16A 3KLDB 1FQRA 1JV0A 3M1QA 1CAHA 2POUA 3S9TA 1CCTA 2QOAA 1FSNA 2Q1QA 5JG3B 4K13A 4IWZA 5SZ6A 1TH9A 3KONA 4GL1X 1LGDA 1V9EA 4YGKA 5G0CA 5FLSA 4KP8A 4KP5A 3D93A 4QJMA 4Q90A 3RZ7A 4RIUA 4KAPA 1BNMA 1I9MA 1CALA 1UGEA 3OKUA 1IF7A 2NN1A 4PYYA 3OIKA 2WEJA 1CNKA 3KNEA 3FFPX 1A42A 3P3JA 4QJ0A 1CNCA 3K2FA 6CA2A 5A6HA 3OIMA 2CBEA 4RUYA 3KOIA 2WEOA 1CVBA 3M3XA 4Q08A 1OKNA 1CNGA 4PXXA 5G0BA 5G01A 1G3ZA 3RZ5A 1JCZA 1YDBA 3HLJA 5FNHA 1CVAA 5IPZA 5JDVB 1CRMA 1G54A 1H9QA 2GD8A 5FL5A 3V2JA 3DCCA 3D92A 4ETQC 3DVDA 1MUAA 4YXIA 1CAIA 4KUYA 3SBIA 4FVNA 3T84A 3EFTA 5SZ1A 3MNHA 4Q7WA 1FLJA 2FNNA 4G7AA 3T82A 4TWLA 1ZSCA 3RZ8A 2GEHA 3MYQA 3RYXB 4KNIA 3D8WA 1CRAA 3F7UA 1XQ0A 2FNKA 4JSWA 4Q78A 3HKQA 1Z9YA 2X7SA 1HUGA 3M2YA 1CNIA 3TMJA 3HKNA 1I9NA 4R59A 2FNMA 2NWZA 5SZ0A 1HECA 5FLTA 3KIGA 4K0ZA 5EKMA 1CCSA 2ILIA 1CAYA 4N0XB 5FLRA 1G6VA 1UGGA 1HCAA 5E2KA 4Z1EA 3CAJA 1G1DA 3OKVA 4HT2A 5HPJA 1CVFA 4HEWA 4Q83A 5FNKA 1G0EA 4Z1KA 4RUXA 5CACA 2NWYA 1Z93A 1ZFKA 2VVBX 3DAZA 3ML2A 5EH7A 1YO0A 3V3JA 4DZ7A 4ITPA 5FNIA 1HEAA 3V3FA 3K34A 1MOOA 4LU3A 4KUVA 1HCBA 1XEGA 1TEUX 1G45A 5FDIA 4KUWA 3RYVB 4QK1A 1BNUA 2OSMA 3M1KA 4E3FA 4CNWA 1KWQA 2HKKA 5JEPB 3M98A 4LHIA 3RJ7A 5JQ0A 2HFWA 4M2RA 4FVOA 4ZWXA 2X7TA 4PZHA 3T5UA 5SZ4A 3P44A 3UYQA 3HKUA 3V3IB 5EH5A 4HBAA 5DOHA 4QY3A 5A25A 1FQNA 1CAKA 1IF5A 2QP6A 3B1BA 3PYKA 1G48A 4RN4A 1BCDA 5DRSA 4ZX1A 4XE1A 4WL4A 4YYTA 1OQ5A 3CYUA 4FPTA 3VBDA 5FNJA 4CQ0A 1BNVA 4RIVA 1RZBA 4ZWYA 3Q31A 1TG9A 1G52A 3M96A 4ZWZA 3N3JA 2W2JA 3EFIA 3W6HA 3D9ZA 5AMDA 4Q0LA 1J9WA 3F7BA 1CVCA 4RH2A 3CZVA 4MTYA 1JD0A 2O4ZA 1CNBA 4Q7SA 4YGNA 3IBNA 3MNKA 4Q8XA 3V7XA 4R5BA 5C8IA 4TWMA 3MNJA 1XEVA 2CBBA 3HS4A 1ZGFA 4WUQA 4XFWA 1KOPA 1RJ5A 1Y7WA 2NWOA 3MHCA 3NB5A 4QSIA 3F4XA 2CA2A 4KNMA 3M40A 5EKJA 5JG5B 3DC3A 4QJPA 5E2NA 3RGEA 5AMLA 1DMXA 2FOVA 2HL4A 3IBUA 1TG3A 4FL7A 1RZEA 4L5UA 5FDCA 1CNXA 4G0CA 1FSQA 2NWPA 4Q6DA 4QJWA 1CILA 3M04A 2CABA 1FSRA 2HD6A 2FOYA 1BNTA 1LG5A 4Q49A 4Q6EA 3DD8A 3KWAA 3P58A 4Q8YA 3TVOX 3TVNX 4R5AA 2ZNCA 3S77B 1IF9A 4E9OX 5EHEA 3B4FA 2X7UA 4Z0QA 1I9LA 3T83A 4YGLA 3M2NA 5DSQA 3P3HA 4QTLA 3KS3A 4XIWA 4M2UA 3U45X 3PJJA 3GZ0A 1RAYA 5DSRA 3RZ1B 4CNXA 2F14A 1CNYA 2WEGA 1F2WA 4PYXA 4FU5A 2EU2A 4YWPA 4FIKA 3DVBA 4K0SA 5BRUA 4Q09A 5FL6A 2POVA 1ZSAA 3U47A 2FOQA 3IBLA 2AX2A 5JQTA 3IEOA 4QJXA 9CA2A 5AMGA 3V2MA 1TTMA 2NN7A 4ZX0A 1TB0X 2IT4A 1CVHA 3V3GB 1I8ZA 4Q9YA 3SAPA 3P4VA 1TEQX 3JXGA 5EIJA 4Q81A 3LXEA 4MDLA 5JGTB 2Q1BA 5EOIA 3S75B 1G53A 3DCSA 1KWRA 4CNRA 3M2ZA 1ZGEA 1TE3X 1HEBA 4ZAOA 2NNVA 1UGAA 3S74B 4N16A 4YXOA 4UOVA 1FQLA 3KKXA 3P55A 3PO6A 1CCUA 5EZTX 3P5LA 7CA2A 1RZAA 1ZNCA 3RLDA 1CZMA 4K0TA 4QSAA 3M5EA 4E3DA 3JXFA 1RAZA 4Q06A 3OILA 4HU1A 1RJ6A 1BN1A 4COQA 1DCBA 1IF4A 4IDRX 2Q38A 1LZVA 2CBCA 3M67A 4Z1JA 3IAIA 2FMZA 2EZ7A 1LG6A 2NXTA 2POWA 4KNJA 1HVAA 4CA2A 1BV3A 1HUHA 3S97A 4QK3A 1TBTX 3W6IA 5SZ3A 1BZMA 2VVAX 2NXRA 5SZ7A 3M2XA 1CAJA 3S72B 4E3GA 3BL1A 4HEYA 5DSLA 1I9QA 1IF6A 1FR4A 2AW1A 3N4BA 2NNGA 2FMGA 5CJFA 4E49A 3L14A 3D0NA 1UGDA 5DSPA 4MDGA 5E5UA 2WD2A 5JGSB 5EHWA 4ILXA 4QIYA 4QSBA 3V5GA 1YDAA 5DOGA 4JSZA 3SBHA 4WW6A 4Q07A 1CNWA 4QJOA 3RYYA 3DC9A 5BNLA 5FL4A 4HF3A 4Y0JA 4QEFA 5SZ5A 3DD0A 4RUZA 1CAZA 3MZCA 1FR7A 4YGJA 3S73B 3NI5A 1THKA 5CA2A 2NMXA 2ABEA 1BNQA 4BF6A 4CNVA 1ZE8A 1G4JA 1ZFQA 4CACA 1OKLA 4LP6A 4Q7VA 4E4AA 3RYJB 3HKTA 3M5SA 4L5WA 5EKHA 5E2SA 5BRVA 1CVDA 3RYZA 1CAMA 1CNJA 3S78B 1Z97A 3UYNA 1KEQA 3QYKA 2CBDA 1CAOA 3DA2A 5FLOA 1DCAA 4KV0A 3S71B 3MMFA 4MLXA 2HOCA 1AM6A 4YHAA 5E5RA 2OSFA 1EOUA 12CAA 3MNAA 5G03A 3FE4A 4MLTA 3DVCA 3V3HB 4ZWIA 5BRWA 4WUPA 3KOKA 2H15A 3N2PA 5E2MA 4MO8A 4ITOA 1I90A 4RFCA 4DZ9A 4JSSA 4JS6A 5L6KA 3M1JA 3MHOA 4K1QA 4HT0A 1YO1A 4YXUA 3MWOA 5LMDA 4QSJA 1I9OA 1CA3A 4BF1A 1AVNA 3BL0A 2NNOA 1BN3A 1YDDA 4Q8ZA 2FOUA 4RFDA 5E28A 2NXSA 1IF8A 5J8ZA 1V9IC 1I9PA 1RZDA 1CINA 3N0NA 3FW3A 1CNHA 1RZCA 1CIMA 3MNIA 1CVEA 4WW8A 3P5AA 5E2RA 4C3TA 1YO2A 2HNCA 5JEGB 3K7KA 1HEDA 5EH8A 3MDZA 3M14A 3MHLA 3JXHC 3M1WA 3ZP9A 4WR7A 3C7PA 1BNNA 1FQMA 1H9NA 2WD3A 5EHVA 2FOSA 1URTA 3ML5A 4KNNA 3SAXA 5L3OA 1AZMA 2H4NA 4M2VA 4Q7PA 5FNGA 5DSOA 5FNLA 4E5QA 1UGCA 4JSAA 1OKMA 1BNWA 4M2WA 5FLPA 1T9NA 2QO8A 5DSNA 2EU3A 4X5SA 3RG3A 3ZNCA 1G4OA 1UGFA 5JEHB 3M5TA 4YX4A 1DMYA 5FNMA 4XIXA 1BN4A 5CLUA 3OYSA 1G46A 4HEZA 4Z1NA 3S8XA 1I91A 2WEHA 1ZSBA 3MHMA 3OYQA 5DSIA 3CA2A 5JESB 3NJ9A 1ZH9A 3S76A 3IGPA 3OY0A 4MDMA 5DVXA 1LUGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FRC A;  3U7C A;  1KOQ A;  1BIC A;  1XPZ A;  2NNS A;  4XZ5 A;  5BYI A;  8CA2 A;  3T5Z A;  3HFP A;  5DSK A;  3DCW A;  4Q99 A;  3RZ0 B;  3T85 A;  5DSJ A;  1H4N A;  3MNU A;  3DV7 A;  4QIZ A;  4YGF A;  4QK2 A;  3IBI A;  4Q87 A;  1CAN A;  1YDC A;  4PQ7 A;  3F8E A;  3R17 B;  3DBU A;  3BET A;  5SZ2 A;  2CBA A;  1UGB A;  3MHI A;  2FW4 A;  4L5V A;  4YVY A;  5FLQ A;  1G0F A;  3U3A X;  4BCW A;  4E3H A;  1CA2 A;  5DSM A;  3RG4 A;  3R16 A;  3KLD B;  1FQR A;  1JV0 A;  3M1Q A;  1CAH A;  2POU A;  3S9T A;  1CCT A;  2QOA A;  1FSN A;  2Q1Q A;  5JG3 B;  4K13 A;  4IWZ A;  5SZ6 A;  1TH9 A;  3KON A;  4GL1 X;  1LGD A;  1V9E A;  4YGK A;  5G0C A;  5FLS A;  4KP8 A;  4KP5 A;  3D93 A;  4QJM A;  4Q90 A;  3RZ7 A;  4RIU A;  4KAP A;  1BNM A;  1I9M A;  1CAL A;  1UGE A;  3OKU A;  1IF7 A;  2NN1 A;  4PYY A;  3OIK A;  2WEJ A;  1CNK A;  3KNE A;  3FFP X;  1A42 A;  3P3J A;  4QJ0 A;  1CNC A;  3K2F A;  6CA2 A;  5A6H A;  3OIM A;  2CBE A;  4RUY A;  3KOI A;  2WEO A;  1CVB A;  3M3X A;  4Q08 A;  1OKN A;  1CNG A;  4PXX A;  5G0B A;  5G01 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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