4Q90A

Crystal structure of 4-methylpyridine-2(1h)-thione bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q90A00
4ITOA 3MYQA 1RJ5A 3M3XA 4R5BA 1CVAA 3P55A 4Q78A 3W6HA 3M5EA 2QOAA 3Q31A 3CA2A 3DV7A 3RYXB 3P3JA 1G53A 3UYQA 3MHIA 1JV0A 4ZWXA 4XZ5A 4Q08A 1I8ZA 3RZ0B 1DCBA 1G4JA 3RYZA 4MLTA 1G54A 5HPJA 5JGSB 1TEQX 4Q83A 3JXFA 3KLDB 1ZGFA 2Q1BA 5AMLA 4Q8XA 1UGAA 5DRSA 3TVOX 2AW1A 4Q7SA 4Q6DA 4PXXA 5DSMA 1CALA 1UGGA 3DVBA 1Z9YA 4JS6A 1F2WA 5JG5B 5FDCA 5CLUA 3M2NA 4QSJA 3DA2A 4MDMA 3ZP9A 4YGJA 4L5UA 2POUA 1CAOA 4QJWA 4QIZA 4HT0A 4WUQA 3MNAA 3RJ7A 3V5GA 3RGEA 1DMXA 4MDGA 1UGFA 2POWA 5C8IA 1CNCA 5JDVB 3EFIA 4RIUA 4KUYA 4ZWYA 1I9OA 1CA3A 4K0SA 4MTYA 5FLRA 3R17B 1DCAA 4M2VA 5SZ6A 1I90A 1IF7A 2EU3A 3ML2A 1H9QA 2QP6A 3M1WA 4QJOA 4YGLA 3MHMA 3F8EA 5DSLA 3GZ0A 2NWOA 1CNKA 3KWAA 4M2UA 1H4NA 4E4AA 4M2WA 3HS4A 4Y0JA 1CCTA 3JXHC 5BNLA 1I9PA 1CANA 1CILA 5E2KA 4Z1JA 3M14A 5DSJA 2NNOA 3IBIA 3MHOA 3MDZA 1FSNA 4QSIA 3MNUA 4KUWA 4YGNA 5DSKA 5JESB 1ZGEA 4QTLA 1BZMA 2FOSA 1OKLA 4X5SA 4Q90A 4ZAOA 3S9TA 3N2PA 5L3OA 4FU5A 3RG4A 4QY3A 1LG6A 2OSFA 3M2YA 4KNNA 4CACA 4CNWA 3KS3A 5JEHB 3PO6A 1CVFA 4QSAA 3N4BA 2Q1QA 4K1QA 1KOQA 4PYXA 3D9ZA 4QIYA 3EFTA 1G52A 4RH2A 5DSPA 1ZSAA 1BNQA 1CNIA 1CRAA 4WL4A 4R5AA 1CINA 1FQMA 2EZ7A 4E9OX 2WEGA 1JCZA 2GEHA 2H4NA 1BNVA 1CIMA 1HUHA 1A42A 4HEWA 4KUVA 3D92A 2FNKA 3RZ1B 3P5LA 1CAKA 5EH8A 1UGDA 4FPTA 4WW8A 3TVNX 3IBNA 4TWMA 5EOIA 3L14A 1YO2A 4K13A 2WEJA 1MUAA 1BN4A 5AMGA 3V3GB 4XFWA 5E5UA 4DZ9A 1IF4A 3U47A 3MHLA 4Q0LA 1H9NA 2VVAX 1HEAA 3RZ8A 4ETQC 1RZEA 4E3GA 2NN7A 2NMXA 2NWZA 1TTMA 1IF9A 5SZ5A 1CNYA 3N0NA 2OSMA 4ZX1A 3R16A 3JXGA 5FNIA 1MOOA 2CBDA 5G01A 2AX2A 4C3TA 3U3AX 2CBAA 5FLOA 3IBUA 3KNEA 3MWOA 1BNNA 2CBBA 2W2JA 2NN1A 3MMFA 5E5RA 1FQLA 5DSQA 3DCCA 5FLPA 2NNSA 1BN3A 3DVCA 4HF3A 4HEZA 1CNXA 4E3HA 5AMDA 3D8WA 5FNMA 3ZNCA 4R59A 3CYUA 3MNIA 3OILA 3HKNA 1T9NA 2HD6A 3M96A 5SZ2A 2HL4A 5SZ4A 3IEOA 1BN1A 3OIMA 2HNCA 1XQ0A 2NXSA 1TEUX 1UGEA 5E2MA 1I91A 4MDLA 1BNTA 2QO8A 3OYSA 3ML5A 4PYYA 1CAMA 1TG9A 1LUGA 4CNXA 1HCAA 4E5QA 1OKNA 4Q7VA 4GL1X 4LU3A 3HFPA 1CVEA 1FQRA 4KP5A 3M2XA 1YDBA 3TMJA 2X7UA 1CCUA 1THKA 3S75B 4CQ0A 3CZVA 2WD2A 1JD0A 3F4XA 3KOIA 4QK2A 4E49A 1YDAA 1V9IC 3S71B 5FL6A 1TH9A 3K2FA 1RZAA 3MNJA 4Z1EA 2GD8A 3K34A 4E3FA 5JG3B 3S76A 1G4OA 4FIKA 2X7TA 4ZWZA 5EZTX 4RFCA 3D93A 5IPZA 8CA2A 3DCSA 3K7KA 4KNIA 1CNJA 1ZH9A 3DCWA 1CNHA 3M40A 4YGKA 2NNGA 1HVAA 3OY0A 1RJ6A 4KP8A 2ABEA 2FW4A 1AVNA 1BICA 4QSBA 5FNKA 4HT2A 1URTA 1TB0X 2FOVA 4MLXA 4TWLA 3F7BA 3S8XA 4ZX0A 4UOVA 2ILIA 1RAYA 2FOUA 3MHCA 4L5VA 5CA2A 4KNMA 3M1KA 4RUZA 4FL7A 2FOQA 1XPZA 5E28A 5JEGB 3P5AA 1YDDA 2CABA 1RZDA 1OKMA 5G0BA 1IF8A 4QJMA 2FOYA 3HKTA 4QJ0A 1CAJA 3P58A 1CZMA 3RYJB 3SBIA 1G6VA 3PYKA 4Q8ZA 4WW6A 5FLSA 4CA2A 2FNMA 3CAJA 4IDRX 3SAXA 1CVHA 1LZVA 2FNNA 4XIWA 4Z1KA 5DOHA 1G45A 3VBDA 4Q99A 4N0XB 1AM6A 3HKQA 4YXUA 3FE4A 1FQNA 4YWPA 5BRVA 1KWQA 4Q81A 2HFWA 1ZSCA 1CCSA 4LHIA 3BL0A 2FMZA 4Q9YA 1CVCA 1HEBA 4RN4A 1I9LA 1CA2A 3DD0A 3M98A 4ILXA 2CBCA 5BRUA 1Z93A 3OYQA 3V3IB 4YHAA 3P4VA 3LXEA 4HBAA 4Q7WA 1CVDA 1G3ZA 1FLJA 1ZFKA 3B4FA 1IF6A 2WEHA 5EKHA 4YGFA 5FDIA 3M1QA 5EKJA 1RZCA 1Z97A 5E2SA 12CAA 5A25A 2EU2A 3RYVB 2X7SA 3RG3A 4MO8A 4Z1NA 1ZFQA 1RAZA 1UGCA 1ZSBA 3FFPX 4JSAA 1CVBA 5FNHA 3RZ5A 4XIXA 5CJFA 5E2NA 1FR7A 1TE3X 5DSRA 4WR7A 4PZHA 4HEYA 4YXIA 1V9EA 4QK3A 3HLJA 2NWYA 4XE1A 4HU1A 4JSSA 2Q38A 1I9MA 5EH7A 3KKXA 3N3JA 6CA2A 3V2MA 3OIKA 1BNMA 3MNKA 3BL1A 4K0TA 4E3DA 4CNRA 1J9WA 4YVYA 1XEVA 2FMGA 4RFDA 2H15A 5G0CA 2WD3A 4BCWA 3HKUA 2NWPA 4RIVA 3T5ZA 5J8ZA 4YYTA 1Y7WA 1EOUA 3RLDA 1KEQA 4KNJA 2NNVA 2HOCA 5JQ0A 3V3FA 3C7PA 3SBHA 5DVXA 3T85A 1HUGA 4BF1A 4ZWIA 5FNGA 3M5SA 1RZBA 3DD8A 4Q8YA 5FLTA 3B1BA 3FW3A 3T84A 1BNWA 5EHEA 3NB5A 1HEDA 4FVOA 5FLQA 5L6KA 3MZCA 3DVDA 3T5UA 1XEGA 3M1JA 4KV0A 5DSIA 1G0FA 5BYIA 4FVNA 4L5WA 5EKMA 1G1DA 1OQ5A 4Q09A 1DMYA 5SZ1A 3KONA 4CNVA 3M2ZA 3BETA 4QJPA 3IGPA 3MNHA 4KAPA 1BCDA 1CNBA 1LGDA 3P3HA 4K0ZA 4QEFA 1HECA 1TBTX 3QYKA 4LP6A 2POVA 1FR4A 2WEOA 2NXRA 4Q49A 3PJJA 2CA2A 4G0CA 7CA2A 1ZE8A 4FRCA 4Q87A 5BRWA 3D0NA 4JSZA 3F7UA 5EHWA 4RUYA 4Q07A 4RUXA 4M2RA 1HCBA 4Z0QA 5LMDA 4BF6A 3U7CA 2NXTA 1I9NA 3RYYA 5SZ0A 3DBUA 3S74B 1FSQA 1KWRA 3V2JA 1G0EA 2CBEA 4ITPA 1CRMA 1BV3A 3U45X 5SZ3A 4Q7PA 4WUPA 1FSRA 2HKKA 5SZ7A 3DAZA 2ZNCA 1CAYA 3V3HB 5A6HA 1CAZA 3KIGA 5G03A 3KOKA 3T82A 1CNWA 3NJ9A 1TG3A 4G7AA 3UYNA 3W6IA 3S97A 3S72B 1BNUA 3DC3A 3M04A 2VVBX 3S78B 3IAIA 4COQA 4YXOA 5DSOA 5E2RA 5DOGA 5EIJA 1UGBA 4JSWA 3V7XA 5FL5A 1CAHA 4YX4A 2F14A 2IT4A 1CAIA 3OKUA 5CACA 1YO1A 1G48A 1IF5A 4Q06A 4PQ7A 3S77B 2O4ZA 5DSNA 3V3JA 4QJXA 3SAPA 3RZ7A 5JGTB 1KOPA 3IBLA 3T83A 3P44A 4DZ7A 5FL4A 5JEPB 4QK1A 1I9QA 3NI5A 1ZNCA 4Q6EA 5JQTA 9CA2A 4N16A 5EHVA 5FNJA 1AZMA 4IWZA 3DC9A 5FNLA 3M5TA 3OKVA 1YO0A 1YDCA 1LG5A 3M67A 5EH5A 1G46A 1CNGA 3S73B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ITO A;  3MYQ A;  1RJ5 A;  3M3X A;  4R5B A;  1CVA A;  3P55 A;  4Q78 A;  3W6H A;  3M5E A;  2QOA A;  3Q31 A;  3CA2 A;  3DV7 A;  3RYX B;  3P3J A;  1G53 A;  3UYQ A;  3MHI A;  1JV0 A;  4ZWX A;  4XZ5 A;  4Q08 A;  1I8Z A;  3RZ0 B;  1DCB A;  1G4J A;  3RYZ A;  4MLT A;  1G54 A;  5HPJ A;  5JGS B;  1TEQ X;  4Q83 A;  3JXF A;  3KLD B;  1ZGF A;  2Q1B A;  5AML A;  4Q8X A;  1UGA A;  5DRS A;  3TVO X;  2AW1 A;  4Q7S A;  4Q6D A;  4PXX A;  5DSM A;  1CAL A;  1UGG A;  3DVB A;  1Z9Y A;  4JS6 A;  1F2W A;  5JG5 B;  5FDC A;  5CLU A;  3M2N A;  4QSJ A;  3DA2 A;  4MDM A;  3ZP9 A;  4YGJ A;  4L5U A;  2POU A;  1CAO A;  4QJW A;  4QIZ A;  4HT0 A;  4WUQ A;  3MNA A;  3RJ7 A;  3V5G A;  3RGE A;  1DMX A;  4MDG A;  1UGF A;  2POW A;  5C8I A;  1CNC A;  5JDV B;  3EFI A;  4RIU A;  4KUY A;  4ZWY A;  1I9O A;  1CA3 A;  4K0S A;  4MTY A;  5FLR A;  3R17 B;  1DCA A;  4M2V A;  5SZ6 A;  1I90 A;  1IF7 A;  2EU3 A;  3ML2 A;  1H9Q A;  2QP6 A;  3M1W A;  4QJO A;  4YGL A;  3MHM A;  3F8E A;  5DSL A;  3GZ0 A;  2NWO A;  1CNK A;  3KWA A;  4M2U A;  1H4N A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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