The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKYDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
A Novel Tyrosine-Heme C-O Covalent Linkage in F43Y Myoglobin: A New Post-translational Modification of Heme Proteins
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
61
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-05-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BOM A; 5HU6 B; 110M A; 3QM9 A; 2MYE A; 1MGN A; 3MKB A; 1YE2 A; 1PBX B; 2R80 B; 1HDS B; 2DN3 A; 3D7O B; 1BIJ A; 4F69 A; 1U7R A; 3AG0 A; 1YEO A; 5CNG A; 2Z8A A; 2QMB B; 2MBW A; 3ZJO A; 1YEV A; 3AQ9 A; 1RQ4 B; 3BJ1 B; 1A3O A; 1DUK A; 1O1L B; 2AUO A; 2SPN A; 4ESA A; 4AVD A; 4G51 B; 2O5S X; 1DO3 A; 1YH9 A; 4SDH A; 2FRF A; 2XYK A; 1UFJ A; 3S65 A; 2ZSX A; 3P5Q B; 1V4X A; 1A01 A; 1Y7Z A; 1CH4 A; 1DXT B; 2QLS B; 1YOH A; 1CH2 A; 1T1N B; 1BZZ B; 1CP0 A; 3VHB A; 1XZ4 A; 1ECD A; 1HGB A; 1C7C B; 3QM7 A; 1DLW A; 2GDM A; 4XS0 B; 1JW8 A; 1HAB B; 1JP9 A; 2QSS A; 3UH3 A; 2H8D A; 1QXD B; 1Y4R B; 3W4U B; 5EYS A; 5CND A; 1Y0D B; 3K8B B; 3H57 A; 1CH9 A; 2W72 B; 3M3B A; 5CNE A; 1ECN A; 1J3Z B; 1YFF A; 4JAC A; 1MOH A; 1Y5K B; 3GQP A; 1Y4V A; 4N7N A; 4N7P A; 2Z6T A; 1HGA A; 2IG3 A; 3HYU B; 1LFV B; 5CNB A; 3ZJR A; 2RI4 A; 4HRT A; 1RQ3 B; 1ECA A; 3OZU A; 1YEQ A; 2WY4 A; 3G4V A; 3ECL A; 3H58 A; 3QQR A; 103M A; 5M3S A; 1LFQ A; 1M9P A; 3A9M A; 5E29 B; 2HBF A; 1HV4 A; 2LH1 A; 1Y4F A; 1NS6 A; 3S66 B; 3UHN A; 1DKE A; 1FAW B; 2GRH A; 3AQ6 A; 1BZ0 B; 1J40 B; 4M4B B; 3HF4 B; 1O1J A; 3HHB B; 3MJP B; 1YHU C; 2MGC A; 1IRC A; 1MBC A; 4H0B A; 1VXA A; 1IWH B; 3HC9 A; 1S5Y A; 1GDK A; 4UUR A; 1KD2 A; 1JL7 A; 1VXF A; 1J7Y B; 3ONZ B; 1PMB A; 1QSI A; 1GBV A; 3EOK A; 4MXK A; 1LH3 A; 2B7H A; 1GDL A; 5HLU A; 1YHE B; 1Y4B B; 1N9H A; 3QQQ A; 2HZ1 A; 4YU3 A; 1G0A B; 3U3E A; 1DLY A; 4FWY A; 3WHM A; 1NWI A; 3BA2 A; 3GKT A; 3WI8 A; 1HCO B; 4XDI A; 5HLQ A; 4F6F A; 1C7D A; 4NK2 A; 1ABY A; 3A59 B; 1VWT B; 1YDZ B; 1XXT A; 3CIU B; 5CN7 A; 2H35 A; 3CY5 A; 1A4F A; 1HBS A; 1BZ1 B; 4N7O A; 4PQ6 A; 2HBG A; 1MYF A; 2G0X A; 2MYD A; 2G10 A; 4IRO B; 1XQ5 A; 4KN3 A; 1LFL A; 5E6E B; 1X9F B; 2D2M B; 1D8U A; 1YGF B; 4TYX A; 5HU6 A; 3WTG B; 2ZST A; 2MYB A; 1PBX A; 2R80 A; 1HDS A; 5D5R A; 3D7O A; 2Z85 A; 3LHB A; 3AQ7 A; 3GQG B; 3G4Y A; 2MGM A; 3UHU A; 2QMB A; 3WFW A; 3A0G B; 3LB3 A; 1AZI A; 1RQ4 A; 3BJ1 A; 1YCA A; 2HBC B; 1O1L A; 2D2N D; 2MGI A; 4G51 A; 4FC3 B; 2O5M X; 3P5Q A; 5C6E B; 1UVY A; 1A0Z B; 1DXT A; 4GZG A; 2QLS A; 1NWN A; 1T1N A; 1BZZ A; 3EDB A; 1THB B; 1DXC A; 2QFK A; 1LJW B; 4IT8 A; 4VHB A; 4XS0 A; 3WCT B; 1HAB A; 5JDO E; 1EMY A; 1QXD A; 1Y4R A; 3W4U A; 1Y0D A; 2RAO B; 3K8B A; 5KDQ B; 4C0N A; 2V1F A; 3ZJM A; 2W72 A; 3ECZ A; 3UHH A; 1FDH G; 1J3Z A; 101M A; 3G53 A; 4KJT A; 1DUO A; 1OUT B; 1Y5K A; 3IA3 B; 2O5B X; 1UC3 A; 1Z8U B; 1EW6 A; 2VYY A; 2HCO B; 3UHB A; 2HHB B; 3TM9 A; 2DN1 B; 3WCU C; 1Y0C B; 1MNJ A; 3HYU A; 1LFV A; 3UHC A; 5CHQ A; 5IKS A; 2LHB A; 2ZFO D; 3GOU B; 2QRW A; 5B85 A; 4QAU A; 4NZI A; 1RQ3 A; 1BAB B; 2ZSP A; 1CBL A; 1CH7 A; 1HAC B; 1VRF A; 3NG6 B; 2ZSZ A; 1XZ2 A; 1DO7 A; 1Y0W B; 1MLF A; 2MGG A; 4PNJ A; 3SDN A; 2R50 A; 4NS2 A; 1YOG A; 5E29 A; 1BZ6 A; 1Y46 B; 5EE4 D; 4PQC A; 1CBM A; 3S66 A; 5B84 A; 1FAW A; 1CH5 A; 1BZ0 A; 1J40 A; 4M4B A; 1DO1 A; 3HF4 A; 3HHB A; 1YVQ B; 3QJD B; 1Y31 A; 3MJP A; 2MGB A; 4X0L B; 1V75 B; 1J41 B; 1XYE B; 1MOB A; 1IWH A; 3WCV B; 2ZT0 A; 2GTL C; 1OUU B; 1LFT B; 3RJ6 A; 1J7Y A; 3ONZ A; 3ZJN A; 1AJH A; 2MGE A; 1NPG A; 1YHE A; 1Y4B A; 2R4X A; 1HLM A; 2FRI X; 4H2L B; 3UHR A; 2O5O X; 1CG5 B; 3UHZ A; 1G0A A; 4O35 A; 2SPL A; 1BVD A; 1CPW A; 1Y4Q B; 5F2A A; 2E2Y A; 5AZR A; 1EWA A; 2SPO A; 1MLR A; 1HCO A; 3PI9 B; 3A59 A; 3R5I B; 4FWX A; 1VWT A; 1YDZ A; 2G0R A; 3CIU A; 3HEP A; 1X9F D; 1HDB B; 1BZ1 A; 3DR9 A; 1SI4 B; 1EBT A; 111M A; 4IRO A; 4PQB A; 4NK1 A; 2V1G A; 1ABW B; 4WJG A; 5E6E A; 1X9F A; 1URV A; 1XZU B; 1DXD A; 2D2N C; 2D2M A; 1YGF A; 1FHJ B; 4UZV A; 3WTG A; 3GQR B; 3ODQ B; 1IDR A; 4U8U B; 5JDO D; 1FSX B; 1VXB A; 3O89 A; 3BJ3 B; 3UHW A; 5EET A; 3GQG A; 3A0G A; 1OR4 A; 2HBC A; 1O1I B; 1A6G A; 1GDJ A; 3M38 A; 1M6M A; 2NRL A; 5JOM A; 2W6Y A; 2MYC A; 4FC3 A; 5EUI B; 3V2V A; 5C6E A; 1A0Z A; 1THB A; 1JF4 A; 1GCW B; 1S5Y B; 1LJW A; 3ECX A; 1Y01 B; 3WCT A; 2HZ2 A; 2ZFO C; 1S61 A; 2EB9 A; 2GKN A; 1VHB A; 2RAO A; 5KDQ A; 4MQC B; 1CO9 A; 2R4W A; 3LR9 A; 1HGC B; 1NPF A; 1OUT A; 1Y8W B; 3D1A B; 3PIA B; 5EE4 C; 2HCO A; 2HHB A; 1A6N A; 4F6J A; 2DN1 A; 4M4A B; 1Y0C A; 3SZK B; 1JF3 A; 3LR7 A; 2SPM A; 3GOU A; 2HZ3 A; 3WR1 B; 2WTG A; 1BAB A; 1HAC A; 3QM6 A; 1TES A; 1MOC A; 3ORD A; 2MGF A; 3NG6 A; 1Y0W A; 2HHD B; 2BLI A; 4MAX A; 1MBA A; 5F0B A; 1Y46 A; 2ZS1 B; 4OF9 A; 1NIH B; 3QJC B; 2VRY A; 5HY8 A; 1UT0 A; 1HBB B; 1DTM A; 1S5X B; 1BIN A; 1MYI A; 1YVQ A; 3QJD A; 1XZ7 B; 4O2G A; 4X0L A; 1V75 A; 3PI2 A; 1J41 A; 1XYE A; 3MYN A; 3A2G A; 2GRZ A; 4HSX A; 1HRM A; 3WCV A; 2WTH A; 4ROL B; 1OUU A; 2OH8 A; 1SDK B; 1LFT A; 1JPB A; 1O1K B; 2PEG B; 2BWH A; 1IT2 A; 2NX0 A; 1VXD A; 4O1T A; 1Y22 B; 4H2L A; 1CG5 A; 5EYJ A; 1LH1 A; 3E5I A; 1Y4Q A; 1DWS A; 1NAZ A; 2ZS0 B; 5JDO C; 1HBR B; 1LTW A; 1YEN B; 3ZJJ A; 3WCW B; 3PI9 A; 3R5I A; 3B75 B; 2EKU A; 5MBA A; 1Y85 B; 2QFN A; 1V4U B; 4F6D A; 4MQG B; 1HDB A; 4N8T B; 3AT6 B; 1Q1F A; 1YHR B; 1V5H A; 1SI4 A; 1FDH A; 2Z6S A; 4ROM B; 4U8U D; 2AV3 A; 5EQM A; 1S6A A; 2DN2 B; 2YRS B; 1ABW A; 3UHS A; 1XZU A; 1FHJ A; 1Y83 B; 1ECO A; 3GQR A; 1CO8 A; 3ODQ A; 1N9X A; 4U8U A; 1FCS A; 1A00 B; 1G0B B; 3WFX A; 1FSX A; 1JP8 A; 3BJ3 A; 1QSH A; 1K1K B; 1XZ2 B; 4FWZ A; 3PEL B; 4AVE A; 1CQ2 A; 1DO4 A; 2ZLU B; 1A9W E; 1O1I A; 5HBI A; 5ILE A; 3GDJ B; 1YGD B; 2G0V A; 1NS9 B; 1DM1 A; 3FH9 B; 4UIQ A; 5EUI A; 3S48 C; 4ILZ A; 1MLN A; 3D1K B; 1Y31 B; 1MYH A; 1C40 B; 1W92 A; 4FH7 A; 1FLP A; 3E4N A; 3D4X B; 3UH6 A; 1GCW A; 2DHB B; 1WVP A; 1Y8H B; 1SWM A; 4H07 A; 3K3U A; 1HLB A; 1HBI A; 5ILP A; 1Y2Z B; 1U7S A; 2ZLW B; 3EU1 B; 4MQC A; 5D1V A; 1JP6 A; 4L7Y B; 1XZ5 B; 1HGC A; 106M A; 4O4T A; 2BW9 M; 4KMV A; 1Y8W A; 3D1A A; 3PIA A; 1MLH A; 1ABS A; 1NZ4 A; 4M4A A; 3SZK A; 3GYS B; 1S0H B; 1Y7D B; 3GLN A; 1G08 B; 5EV5 A; 2AV0 A; 3WR1 A; 3ZOL A; 1DWT A; 2H8F B; 3E5O A; 3RJN B; 1MYG A; 3MOU A; 3M3A A; 1MCY A; 3QJE B; 2HHD A; 4TWV A; 1BJE A; 4ZVA A; 4ZVB A; 104M A; 2AUQ A; 1MDN A; 1NXF A; 2ZS1 A; 2EF2 A; 1OFJ A; 1NIH A; 3QJC A; 1IT3 A; 2R4Y A; 1HBB A; 2NSR A; 1S5X A; 3ZHW A; 1MTI A; 1HBH B; 1A0U B; 5CNC A; 1XY0 B; 1XZ7 A; 2ZFB B; 4NXC A; 3ARL A; 4ROL A; 2R1H B; 1SDK A; 2BKM A; 1O1K A; 2PEG A; 1Y22 A; 3VAU A; 2ZLV B; 1MLL A; 3VRF B; 1MLO A; 1HSY A; 2O58 X; 1UX9 A; 2ZSR A; 1NZ2 A; 3G4W A; 2ZS0 A; 2AUP A; 1HBR A; 1MWB A; 1YEN A; 2AA1 B; 3WCW A; 2OH9 A; 3DUT B; 3B75 A; 1Y85 A; 1V4U A; 4MXL A; 4NI1 B; 4MQG A; 5C6Y A; 4N8T A; 1H97 A; 3AT6 A; 2ZT4 A; 1YHR A; 4ROM A; 1S56 A; 1A9W A; 2O5L X; 1FN3 B; 3KMF A; 2DN2 A; 1R1X A; 2YRS A; 4O4Z A; 3ZJS A; 3OJ1 A; 1Y83 A; 1GVH A; 1S69 A; 3MVC A; 3PI8 B; 3PT7 B; 1A00 A; 1G0B A; 2MYA A; 1Y09 B; 1OJ6 A; 2MGK A; 1LH7 A; 1K1K A; 1NGK A; 1I3D A; 2FRK X; 2HBD B; 3O7N A; 1MZ0 A; 1SPE A; 5HLX A; 4DC8 A; 3UHY A; 1YHU B; 3PEL A; 2ZLU A; 1MYZ A; 1AJ9 B; 3GDJ A; 4F6B A; 3R0G A; 1YGD A; 4MU5 A; 5HY8 B; 1NS9 A; 1CP5 A; 3FH9 A; 3UBC A; 5CMV A; 2EVP A; 4OOD A; 3D1K A; 1C40 A; 1MNO A; 1MLK A; 1YOI A; 2ZSN A; 3D4X A; 2DHB A; 1Y8H A; 1MNK A; 1MLG A; 1MLJ A; 1VRE A; 3QJB B; 4DWT A; 2MGD A; 3ED9 A; 2ZWJ A; 1Y2Z A; 2EB8 A; 2LH3 A; 2ZLW A; 3KUN A; 3EU1 A; 1MLM A; 1CG8 B; 1Y4P B; 2BLH A; 3ZJQ A; 5MBN A; 4L7Y A; 1XZ5 A; 3DHT B; 3OO4 B; 1JY7 B; 1B0B A; 1QXE B; 3UHV A; 2D5Z B; 3GYS A; 1S0H A; 2D2M D; 1LHT A; 1Y7D A; 3LQD B; 2DXM B; 1G08 A; 1A6K A; 5JDO F; 2H8F A; 2ZSY A; 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1MOA A; 1UFP A; 1F65 A; 1SDL B; 1Y5J B; 1JZM A; 1X9F C; 2D2M C; 2MHB B; 3HEO A; 2O5T X; 3QJB A; 2ZT1 A; 2G3H A; 2FRJ X; 3E55 A; 1RVW B; 3KUO A; 3NFE B; 3UH5 A; 1CG8 A; 1MYM A; 1Y4P A; 1LFZ B; 2OLP A; 2HHE B; 1YVT B; 2VEB A; 3DHT A; 5HAV A; 1ASH A; 1KFR A; 3OO4 A; 1WMU B; 1HHO B; 3GKV B; 1YE0 B; 2GLN A; 1JY7 A; 1YIE B; 2D2N B; 1QXE A; 1DTI A; 2VEE A; 3PI3 A; 2D5Z A; 3PI1 A; 3LQD A; 2DXM A; 1MWC A; 3HRW A; 3TLD A; 5CHR A; 3LB2 A; 3ZOM A; 1IRD B; 1COH A; 1R1X B; 3UHQ A; 1O16 A; 1MKO B; 1G09 A; 1BBB A; 4MQJ A; 3UBV A; 5KER B; 2HBS B; 4MQK B; 3UHD A; 1UX8 A; 2MGL A; 3VRE A; 1B86 B; 3QMA A; 3WCT C; 1Y5F A; 3ZJI A; 5CN9 A; 1O1P B; 1DXU B; 1MLU A; 1M6C A; 3M39 A; 3UI0 A; 1Y8K A; 1K0Y B; 3G4U A; 2VLX A; 112M A; 1Y0T A; 3IXF A; 3OZV A; 1IBE B; 2ZLT B; 2Z6N A; 1BZP A; 1J7W A; 1V4W A; 1NZ3 A; 1Y45 B; 1RQA A; 1RTE A; 1YEU B; 2ZFO B; 3HXN A; 4ODC B; 5EOH A; 1Y0A A; 3DHR B; 1GBU B; 4F4O A; 2LH7 A; 1J7S B; 1MWD A; 1X3K A; 7HBI A; 1QI8 A; 3BCQ A; 3IC0 B; 1Y7G A; 3WCU D; 4YU4 B; 2V1K A; 2XKG A; 5JGG B; 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