The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
PATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ionic interactions of Ba2+ blockades in the MthK K+ channel
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel MthK
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| total genus |
32
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-05-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DYR C; 4QE9 A; 1KKD A; 2WLI A; 4X89 A; 4OXS A; 1V55 C; 2Q6A A; 2ITC C; 2NLJ C; 3UM7 A; 4MVM A; 4EKW A; 3FB7 C; 2DWD C; 5CBF A; 2Q68 A; 4XDJ A; 5EC2 C; 5B1B C; 2WLL B; 3K0G A; 4MVR A; 3SYA A; 1OCR C; 3SPI A; 3SJQ C; 4CBC A; 1P7B A; 2EIJ C; 2EIN C; 4PDM A; 4I9W A; 2WLI B; 3SPJ A; 1ZWI C; 2X6B A; 2WLJ A; 3ASO C; 3RBZ A; 2ZD9 A; 2WLN A; 4XDL A; 1BL8 A; 2W0F C; 2HFE C; 4HYO A; 4MVQ A; 4GX0 A; 3SYC A; 2EIM C; 4TWK A; 5B3S C; 4MS2 A; 3SYP A; 2WLH A; 2Q69 A; 2AHZ A; 3T4Z A; 2ATK C; 1M57 C; 4PDV A; 3OGC C; 2KB1 A; 4LP8 A; 3FB8 C; 4WFH A; 3UKM A; 5BZB A; 3LNM B; 4JTA B; 1R3I C; 3BEH A; 4H37 A; 3SYQ A; 4MVS A; 5KUK A; 4P9P A; 2A0L A; 2A9H A; 3F5W C; 4X88 A; 4QNH B; 2JK5 C; 4H33 A; 4P30 A; 1JVM A; 2BOC C; 1G4Y B; 4R7C A; 4X8A A; 4LCU C; 4PA3 A; 3STZ C; 4QE7 A; 2Y69 C; 4J9Y B; 3AG3 C; 2DWE C; 4RAI A; 4MTF A; 1J95 A; 2IH3 C; 4RUE A; 1R3K C; 2HVK C; 3RVY A; 3LDC A; 3LDD A; 3T4D A; 3E8B A; 5CBG A; 1LNQ A; 3GB7 C; 3SPC A; 2R9R B; 2EIK C; 2HVJ C; 4MVO A; 4WFE A; 1ORQ C; 1V54 C; 4RUF A; 3TCU A; 5B1A C; 3RVZ A; 3IGA C; 3AG4 C; 4RO2 A; 2ZXW C; 2EIL C; 3JYC A; 4MSW C; 4JTD B; 3SPG A; 3HPL C; 3ABL C; 2A79 B; 3LUT B; 2IH1 C; 4R50 A; 3PJS K; 3E89 A; 3KG2 A; 5EBM C; 3ZJZ A; 2AHY A; 3K0D A; 3TET A; 3LDE A; 3VOU A; 1QLE C; 2YEV A; 3EFF K; 5KUM A; 1K4D C; 4MTG A; 4PDR A; 3AG2 C; 4MVU A; 4PA7 A; 4DXW A; 1S5H C; 3STL C; 4KFM A; 2HG5 C; 2Q67 A; 1R3J C; 5EBL C; 5J9P C; 1M56 C; 4PA4 A; 3SPH A; 4UUJ C; 3ABK C; 3AG1 C; 3IFX A; 3K03 A; 4G28 B; 4R6Z A; 3F7V C; 3K08 A; 4MW8 A; 5EBW C; 4P9O A; 4R8C A; 4JTC B; 4XDK A; 2ITD C; 1OCC C; 3OUS A; 4MW3 A; 4ZBM A; 4GX2 A; 4HZ3 A; 5E1A C; 3OR7 C; 2HJF C; 3K06 A; 4P2Z A; 2WLM A; 5EK0 A; 4F4L A; 1OCZ C; 1K4C C; 4PDL A; 3E8F A; 2H8P C; 2BOB C; 4GX1 A; 4J9Z B; 5IY5 C; 3WG7 C; 3E8G A; 3T1C A; 3R65 A; 1OCO C; 4PA6 A; 3RW0 A; 4G27 B; 3FB6 C; 3T2M A; 4PA9 A; 3FB5 C; 3SYO A; 4MTO A; 3F7Y C; 3X2Q C; 1XL4 A; 3ZRS A; 2QTO A; 4WFG A; 5CBH A; 2X6C A; 3OR6 C; 2QKS A; 2P7T C; 2X6A A; 2DYS C; 3E83 A; 3K04 A; 4LBE C; 4MVZ A; 1R3L C; 3ASN C; 5EC1 C; 3OUF A; 3E8H A; 2K1E A; 3E86 A; 2WLK A; 3ABM C; 2WLL A; 4GX5 A; 4WFF A; 1XL6 A; 2OCC C; 4BW5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2UXB B; 1V55 C; 2NLJ C; 2OTL V; 1V9P A; 3K5M A; 5BR8 O; 1SER A; 4U3J A; 4RQF A; 3CCE V; 4GUN A; 3UO3 A; 4I9W A; 4O4L B; 1NT2 B; 3L73 H; 1EN6 A; 4QPJ A; 5CBH A; 3SYC A; 2ZDI A; 4AI8 A; 3ABU A; 2UUB B; 2V7Q G; 2AHZ A; 1M57 C; 3U10 A; 1F23 A; 2DYR B; 3LNM B; 2B1G A; 3DGE A; 1PM9 A; 2GHY A; 2A0L A; 4BWA A; 5BR8 B; 2PYL A; 3AK2 A; 3RVY A; 3ASO B; 1MNG A; 1WB8 A; 1RPO A; 1ORQ C; 2EIM B; 5L3B A; 2OIE A; 4LF5 O; 4B3M O; 5L3C A; 2XUM A; 1XNR O; 3W7S A; 3VOU A; 3G6E V; 1WA8 A; 2YDE A; 1QLE C; 5KA5 A; 1B04 A; 4O4H A; 1I7F A; 1ROP A; 2PUS A; 5FLX N; 4I55 A; 2BCC H; 1GM7 A; 4Z2W A; 2QWR B; 4Q20 A; 3CCR V; 1SQB H; 3BHP A; 5H2F Z; 1M9N A; 2QKC A; 3WFV A; 1QCE A; 2E74 B; 2X0L A; 4B3M B; 2HKO A; 3E8G A; 3CRR A; 1WP7 A; 2UXD O; 1XNR B; 1VF7 A; 4H0L B; 1ZAU A; 4MTO A; 3ZRS A; 5JQG A; 2IJI A; 3CE2 A; 1ZSP A; 1BCC H; 3ZHT A; 2P6J A; 1AI7 A; 4RQE A; 1GM9 A; 4JI0 O; 4JI2 B; 1KKC A; 1NVP B; 1BHA A; 1ENV A; 3SDL A; 1AP6 A; 1VF6 C; 2UXD B; 2L35 A; 1IXB A; 3SPJ A; 3RBZ A; 1SET A; 2G38 A; 4EEQ A; 4BIU A; 4XDL A; 2W0F C; 3NXS A; 3DSQ A; 1YXB A; 4DR4 O; 3DC6 A; 3SYP A; 4ASU G; 5LBQ A; 1EZJ A; 4JPR A; 4K35 A; 2FB5 A; 3ZMS A; 3OTF A; 4MVS A; 5KUK A; 4J11 A; 4CH5 A; 2JK5 C; 4JI0 B; 1EBO A; 3CXH F; 1JR9 A; 4WFA V; 3C90 A; 3D3Q A; 3LDD A; 5GON A; 1MSW D; 1KU9 A; 2M6Y A; 5J2T A; 4FLT A; 2XOK G; 4JV5 O; 4X1K A; 2QR4 A; 1XIL A; 4RO2 A; 3J80 N; 4GKK O; 3PJS K; 4LC1 A; 1QLN A; 5H6Q A; 1YVW A; 3TET A; 3FAV B; 1ARO P; 4I50 A; 1JOY A; 2E76 B; 3CME V; 1KUQ A; 4UB6 Z; 1A32 A; 4CH3 A; 2QA4 V; 1TUE B; 2XHB A; 2XAG A; 5J2U B; 4K3A A; 1PNM A; 1Q81 W; 1K5S A; 2F4V O; 1S5J A; 4ZOL B; 4GX2 A; 4CC6 A; 4J7Z A; 3K06 A; 3TXQ A; 1F51 A; 2P4V A; 4DK1 A; 1GTO A; 3RYH B; 2DOS A; 2V4D A; 3M7M X; 2ZNJ A; 2O57 A; 1FXK C; 1TVK A; 2ZM6 B; 4ZI7 B; 2KQX A; 1XL4 A; 3G71 V; 2Q9L A; 4JI3 O; 2LFR A; 4FLZ A; 3K04 A; 1Y67 A; 2YSU B; 3KZI Z; 4K0K O; 2FML A; 2HHH O; 1THZ A; 4XBF A; 3FX7 A; 4GX5 A; 1FFT B; 2F4V B; 1NR7 A; 4LF4 O; 4CZZ A; 1Z5V A; 1FFX B; 3H01 A; 2OCH A; 1D5A A; 5B1B C; 2YS8 A; 4JAV A; 1Q86 W; 3MHH C; 4TQD A; 1Y4M A; 2E75 B; 3W7T A; 4WBN B; 4LF6 B; 4MVQ A; 2YI8 A; 4TWK A; 4JI3 B; 3CD6 V; 1N34 B; 3JAM N; 1EN4 A; 4K0K B; 2HHH B; 3QO5 A; 3L72 H; 3AG1 B; 5CA0 A; 2CE4 A; 3HR0 A; 2AW9 A; 4JI8 O; 1IUR A; 4LNU A; 2OTJ V; 4O4J A; 4YJ3 A; 1AP5 A; 1JPX A; 2XAQ A; 3JAL A; 1O9H A; 3CCJ V; 4WCE V; 2HVJ C; 3AG4 C; 3B09 A; 2DJV A; 5B1O A; 1DLB A; 1HNZ O; 1G6U A; 2Y4T A; 4JI6 O; 3R66 A; 3U0Z A; 3UQ8 A; 2LFS A; 4PDR A; 4X20 A; 3AG2 C; 2HG5 C; 1YJW V; 5JVD A; 2P06 A; 3OAA G; 2Q7G A; 1YIJ V; 2CTQ A; 3CEI A; 2QKA A; 2CTP A; 2WLM A; 3HB3 B; 4FM0 A; 5LYJ B; 5IY5 C; 4GX1 A; 2BOB C; 4FFB B; 4X65 O; 1HNZ B; 1OCO C; 4JI6 B; 4MT8 A; 4LFC O; 5GW7 A; 3UO2 A; 2L6L A; 3JAR A; 1XQ8 A; 4KL1 A; 1R73 A; 2CGN A; 1GRJ A; 3QTC A; 2HR3 A; 3BAA A; 5FNV A; 1SKV A; 4X89 A; 2DW4 A; 3OM3 B; 2EBO A; 3HKB B; 5IYZ A; 2DWD C; 1AJP A; 2Q68 A; 4O2A A; 1Q6U A; 2F43 G; 2WAM A; 3A0B Z; 3SJQ C; 5BY1 A; 1P7B A; 5EYP A; 2YIB A; 4LFC B; 1FS0 G; 2B1I A; 2ADP A; 2HLD G; 4NB5 A; 3SJB C; 2AZ0 A; 4TT3 G; 1F4N A; 3P3N A; 2EUL A; 5IDJ A; 2BSK A; 4H37 A; 4WFB V; 3JAK B; 4PD4 F; 3F5W C; 1H8E G; 4H33 A; 3BFR A; 5LA6 A; 1MMM A; 4R7C A; 4LF8 O; 2QE7 G; 4IIJ B; 3ZED A; 5D5Q A; 5LHG A; 4LFB O; 5KHG A; 4LWS A; 2B5U A; 1W0J G; 4YJ2 B; 2RQ6 A; 1IBM B; 3IJ4 A; 1HDJ A; 1XHZ A; 4KXR A; 1N8R W; 1K4D C; 1GN6 A; 2IJK A; 4MVU A; 3Q4H A; 4DXW A; 4OX9 B; 4LF8 B; 5J9P C; 4UUJ C; 1ZL8 B; 4J7K A; 4FM1 A; 1RSO A; 3BRC A; 1NTM H; 1QNM A; 1LUW A; 5B66 Z; 3H1H H; 1WN7 A; 4LFB B; 1RFY A; 5KHI A; 3EHB B; 3R65 A; 1AI6 A; 4DW1 A; 5LXT A; 4IYH A; 5KMG A; 1COW G; 5JCO C; 1TUB A; 5EIB D; 2DYS C; 2E3C A; 3UT5 A; 1OCC B; 2YEV A; 3QO8 A; 1N32 B; 4K8Z A; 4DV0 O; 3N2K B; 2VS0 A; 4JI4 O; 2Q0O C; 2RN9 A; 2Q73 A; 1GM8 A; 2UXN A; 1VQ6 V; 4EKW A; 3FYE B; 4UFZ A; 3VQW A; 1IZ3 A; 4B3R O; 4CS2 A; 1SQF A; 3K0G A; 3CCM V; 4U3F H; 2WPD G; 2WA4 A; 1Q90 D; 3ETE A; 4CS4 A; 3JSL A; 4FFK A; 2ZD9 A; 5B3S C; 3ASN B; 1KP3 A; 3RYF A; 4PDV A; 3OGC C; 4QGP A; 1L1F A; 2P4K A; 3OE7 G; 1OCZ B; 1R3I C; 4DV0 B; 1YI2 V; 4JI4 B; 3I5D A; 4X88 A; 3TJT A; 2YXY A; 1OHH G; 5DED A; 1HNW O; 2P67 A; 1Q5O A; 2DWE C; 4RUE A; 1VQL V; 5F2V O; 2KG7 B; 3P30 A; 4PI0 A; 1RM1 B; 3SPC A; 2IM9 A; 2EIK C; 2GSM B; 1V54 C; 2CH7 B; 1QBZ A; 3RWR D; 4JTD B; 2QJ1 A; 1HWY A; 2XAS A; 3T1H O; 3M99 B; 4BIO A; 4ZHQ B; 5D5P A; 3CJH A; 1JFF A; 2IW5 A; 1HNW B; 3ZHQ A; 3K03 A; 1W2B U; 2P22 C; 2D3O W; 1QVF U; 4W4K A; 5KHJ A; 4X1Y A; 1J5E B; 1OCZ C; 3ABL B; 4I0X A; 1H2N A; 5C8Y A; 1YIT V; 1S76 D; 2Y4U A; 2RNB A; 3T1H B; 5K1P A; 3FD9 A; 3JD3 A; 1NI8 A; 4JZ2 A; 1DGS A; 1Y6X A; 5EC1 C; 4LF7 O; 4GT1 A; 1KYO F; 3E8H A; 3CCQ V; 4HAM A; 2WLK A; 3F5T A; 3ABM C; 4U3J B; 3ZHS A; 3ZN0 A; 1Q6I A; 4EFE A; 3D36 C; 3VBB A; 5B1A B; 2DQ3 A; 1I5X A; 5CBF A; 5BXZ A; 1VQM V; 4UVA A; 3SYA A; 2UU9 O; 1XMQ O; 2ZT9 B; 3AG7 A; 1K97 A; 4OPA A; 1JJO A; 4K8X A; 4MS2 A; 3QG5 A; 2Q0A A; 2ZE6 A; 3CB2 A; 4QJF B; 4LF7 B; 2Z5U A; 1S5L Z; 1WPX A; 3UKM A; 3CPW U; 5KHK A; 2GTA A; 1AJQ A; 1P84 F; 2N05 A; 4L87 A; 3FYI B; 1R6K A; 4DV2 B; 1K3E A; 3ZMU A; 1SQP H; 2LJ2 A; 2EIN B; 2Y69 C; 4LFA B; 2E5L O; 2UU9 B; 2HVK C; 1WA8 B; 1XMQ B; 1LNQ A; 4FK5 C; 4O4H B; 1YCI A; 2PYJ A; 2LO1 A; 2ZE7 A; 5B1A C; 5H5N A; 1UFI A; 2OWO A; 1GAX A; 4MSW C; 2OT5 A; 2JIZ G; 4I55 B; 2UXC O; 3HPL C; 4R50 A; 1XUQ A; 5FPR A; 3LDE A; 5CB4 A; 4YIP A; 3L70 H; 4J80 A; 1U97 A; 3EXA A; 2IJH A; 4TQF A; 3SPH A; 4G28 B; 4IGG A; 5JH7 A; 3K08 A; 1SRY A; 1URF A; 4DV1 O; 3S3X A; 4FMT A; 4BR6 A; 3ICX A; 5JQG B; 5EK0 A; 4NXN O; 3APO A; 4PDL A; 2UXC B; 4NVP A; 3S3W A; 4ABM A; 1TAE A; 4H13 B; 5DN6 G; 5IJ0 A; 1Z5W A; 3IC7 A; 4DUZ O; 1YTF B; 1JX9 A; 3FKS G; 1VF5 B; 2ZQM A; 3SR2 C; 2GTS A; 1HR0 O; 4AIL C; 1MAB G; 1GK9 A; 3CCS V; 3RFR A; 1Z2G A; 4TV8 A; 1JJ2 U; 1KP2 A; 1US6 A; 4DV1 B; 3CS5 A; 3L71 H; 2DYR C; 1VIB A; 2CAZ C; 2ITC C; 3AK3 A; 3UM7 A; 2ARH A; 4MVM A; 1M90 W; 4LF5 B; 4NXN B; 2R9I A; 4XDJ A; 5EC2 C; 1N33 O; 3C3S A; 4JYC A; 4B08 A; 1NTK H; 3K9A A; 1VQK V; 4I5S A; 2RCV A; 4TUY A; 2WLI B; 3QO7 A; 3X2Q B; 4DUZ B; 3ASO C; 5FL7 G; 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3KCY A; 2N74 A; 4JTA B; 4FPP A; 4JF3 A; 5L3F A; 5KLV H; 5IE9 A; 1I94 O; 5LHI A; 4YY3 O; 1UJW B; 4X20 B; 3C3T A; 3BY6 A; 1XDC A; 2R72 A; 4JI1 O; 5JVD B; 4X1I A; 1R6N A; 3ZBH A; 5EZY A; 1D5N A; 1ZLZ A; 2VWJ A; 1S72 V; 3K5O A; 5KUM A; 3JAS A; 4LF4 B; 4ICG A; 3AG3 B; 3IFX A; 4IL6 Z; 1I94 B; 4FLV A; 3CMA V; 1BQ0 A; 2JRI A; 3SGI A; 5CN0 A; 1H8H G; 3JAR B; 1OZ0 A; 4JI1 B; 3ZMZ A; 4LF9 O; 1K5Q A; 1HW7 A; 2CUG A; 5FNV B; 1N4C A; 4JI8 B; 1VAR A; 4F6R A; 2X6C A; 5IYZ B; 4O2A B; 1GO3 F; 4Z1M G; 3LSS A; 5EYP B; 3AG1 C; 1L0N H; 5LP6 B; 3K5N A; 1VQ5 V; 1L8D A; 4WBN A; 1QR9 A; 4I4T A; 4Z1V A; 2ZCE A; 2HEP A; 4DR5 O; 3ZHV A; 1Q8I A; 1SQX H; 2JGD A; 3JCU Z; 4L8J A; 4LF9 B; 3CRM A; 2FL4 A; 1UPG A; 2BSK B; 5LA6 B; 5TIS Z; 3T1Y O; 2Q7H A; 2ATK C; 1MA1 A; 3L75 H; 5CMU A; 4LWS B; 3K5L A; 4JAA A; 4X65 B; 1K8A W; 4PA3 A; 4DR5 B; 2XAJ A; 1FXH A; 3VQV A; 3ML0 A; 1NR1 A; 3Q4H B; 4MVO A; 5LP6 C; 3G80 A; 1NH2 B; 4U7N A; 4UCU A; 3E22 B; 5HFL A; 3T1Y B; 2AHY A; 3K0D A; 1VEW A; 1RSO B; 5IJ9 A; 4UCT A; 1F7Y A; 3OT7 A; 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