The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
b'PATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ionic interactions of Ba2+ blockades in the MthK K+ channel
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel MthK
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| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
|
| molecule tags |
Transport protein
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| total genus |
32
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-05-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HVK C; 3K0D A; 5BZB A; 3IFX A; 4MSW C; 3LDC A; 3T4D A; 5EK0 A; 2OCC C; 3GB7 C; 3K0G A; 5EBL C; 4R8C A; 2WLL B; 2EIJ C; 4TWK A; 4XDL A; 4LCU C; 2Q69 A; 3PJS K; 4XDJ A; 4I9W A; 5EC2 C; 3E8G A; 4MVZ A; 2X6A A; 2WLM A; 1M57 C; 5CBG A; 3RVY A; 4RAI A; 2WLK A; 2WLI B; 4RUE A; 4QE9 A; 3ZRS A; 3RVZ A; 5E1A C; 1V54 C; 2ITD C; 3OGC C; 5CBF A; 2HFE C; 2IH3 C; 4HYO A; 4PA3 A; 3AG2 C; 2EIL C; 5IY5 C; 5KUK A; 2AHZ A; 1XL4 A; 1OCC C; 1J95 A; 1XL6 A; 4RO2 A; 2A79 B; 4UUJ C; 3ABL C; 3E8B A; 4X88 A; 5KUM A; 3STL C; 1QLE C; 3AG4 C; 2YEV A; 4J9Y B; 5CBH A; 3RBZ A; 2A9H A; 2IH1 C; 3R65 A; 1LNQ A; 3LDE A; 3E8F A; 3TET A; 2HG5 C; 2HVJ C; 4PDV A; 4MTO A; 1K4D C; 2H8P C; 4LBE C; 3SPI A; 4F4L A; 1R3J C; 4BW5 A; 3WG7 C; 5EBW C; 2X6B A; 2QTO A; 3IGA C; 4XDK A; 4MW3 A; 4QE7 A; 4WFF A; 3BEH A; 4MS2 A; 2WLL A; 4G28 B; 3EFF K; 3UM7 A; 2W0F C; 3X2Q C; 2EIK C; 4WFE A; 5J9P C; 3ABK C; 4J9Z B; 1M56 C; 2AHY A; 4R50 A; 4RUF A; 2DWE C; 3ZJZ A; 2JK5 C; 4H37 A; 3RW0 A; 4MVM A; 3T1C A; 1K4C C; 1BL8 A; 4MW8 A; 2DWD C; 3F7V C; 4P30 A; 3K03 A; 4PDR A; 3LDD A; 3T2M A; 2Q6A A; 4JTD B; 4PA7 A; 3SYO A; 4PA4 A; 2Y69 C; 1ORQ C; 4G27 B; 5EC1 C; 3STZ C; 4MVS A; 2ZD9 A; 3OR6 C; 3FB5 C; 3K08 A; 4MVU A; 4MTG A; 2WLH A; 2WLJ A; 1V55 C; 4MVO A; 4PDL A; 3OUS A; 4R7C A; 4QNH B; 3ASN C; 1OCZ C; 4WFH A; 2EIN C; 4LP8 A; 4PDM A; 3KG2 A; 3OR7 C; 4P9O A; 4KFM A; 1JVM A; 2DYR C; 3SPH A; 3LUT B; 3AG3 C; 3JYC A; 3SYA A; 2HJF C; 2QKS A; 2ZXW C; 4P2Z A; 3SPJ A; 1KKD A; 2R9R B; 4MVQ A; 1R3I C; 2EIM C; 3SYQ A; 4MVR A; 1OCO C; 3SPC A; 3E8H A; 4OXS A; 3K06 A; 2BOC C; 4X89 A; 4X8A A; 4CBC A; 2WLI A; 2X6C A; 4JTA B; 2ITC C; 3F7Y C; 3VOU A; 1S5H C; 3FB8 C; 1P7B A; 4GX2 A; 3E86 A; 2DYS C; 2BOB C; 2P7T C; 3SYC A; 3AG1 C; 4EKW A; 4WFG A; 5B3S C; 3ASO C; 3HPL C; 3K04 A; 1ZWI C; 4P9P A; 1OCR C; 3LNM B; 4JTC B; 4GX5 A; 3OUF A; 1G4Y B; 3FB6 C; 4HZ3 A; 3FB7 C; 3UKM A; 4PA6 A; 2KB1 A; 2Q67 A; 5B1A C; 3SJQ C; 4R6Z A; 4PA9 A; 3E83 A; 2WLN A; 5EBM C; 3F5W C; 5B1B C; 3E89 A; 4H33 A; 4ZBM A; 3SPG A; 1R3K C; 2A0L A; 2Q68 A; 4MTF A; 3SYP A; 3T4Z A; 3TCU A; 1R3L C; 2ATK C; 4DXW A; 3ABM C; 2K1E A; 2NLJ C; 4GX0 A; 4GX1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MNG A; 1NT2 B; 1QVG U; 1V9P A; 4DRX B; 3ABT A; 5ITZ B; 4TV9 A; 3K0G A; 1EN5 A; 1D2D A; 4B08 A; 3ASO B; 2F4V O; 5IJ0 A; 5EC2 C; 4I9W A; 2Y48 A; 4X1Y B; 3ZHQ A; 3TK1 A; 4UCS A; 1L1F A; 1DLB A; 2CE4 A; 3P32 A; 5KLV H; 4UVC A; 2RMK B; 2VRZ A; 1K9M W; 3WU2 Z; 4IIJ B; 2A9H A; 1FJG O; 3R66 A; 5CA1 A; 1GN4 A; 1N32 O; 3JAT B; 5DN6 G; 2GBO A; 4WFE A; 2E3C A; 1M56 C; 1SRY A; 4DK1 A; 5A2Q N; 4JYA B; 1K4C C; 5CB4 A; 1WPX A; 1ORQ C; 4CH6 A; 2DMX A; 1VF6 C; 2XTA A; 3B40 A; 3H1J H; 1F4M A; 2ILM A; 1KMI Z; 3X2Q B; 3LUT B; 2V7Q G; 3JYC A; 4YIP A; 3CHX A; 1EZJ A; 4K0K O; 2R9R B; 4L8J A; 3OGI B; 5C8Y B; 4OX9 B; 3E8H A; 3K06 A; 3I56 V; 2IJK A; 4X89 A; 5L3C A; 4CBC A; 3T1Y B; 3BPZ A; 4JTA B; 4JF3 A; 3QO5 A; 4PJ0 Z; 4FPP A; 3ASO C; 1H2K A; 3JSN A; 2HR3 A; 3K79 A; 4NXN B; 3CYO A; 2AZ2 A; 1K5S A; 5BY1 A; 1P7G A; 1VF5 B; 4X65 B; 1VQ6 V; 1NBM G; 3FAV A; 3IFX A; 1SKV A; 3RGB A; 4UB6 Z; 4DV4 B; 2WLL B; 5JJN B; 1S5J A; 4I55 A; 4XDL A; 4LF4 B; 4NXM O; 4DR5 B; 1MZE A; 4JI5 O; 1PKX A; 2LFS A; 3CCM V; 3CCU V; 4BIO A; 2DYR B; 5IWA B; 5KA5 A; 5IYZ B; 4JI7 O; 4TQD A; 3IC9 A; 4CC5 A; 4B7K A; 3N2G A; 2OCC B; 5CBH A; 2VS0 A; 1M4U A; 2CDY A; 4JI0 B; 1X59 A; 4LF6 O; 3SPI A; 5BMV A; 1R3J C; 4MW3 A; 2HHH B; 5LHH A; 3CCL V; 5B1A B; 5LGN A; 2CH7 A; 4ZI7 A; 3X2Q C; 4JAA A; 4B3S B; 2ETN A; 2DWE C; 3JSL A; 4LC1 A; 2CTR A; 2DWD C; 1YTF D; 4NB5 A; 3AG7 A; 5H9C A; 1Y4M A; 1NR1 A; 3OUS A; 5TIS Z; 4WFH A; 4KHP O; 4UVA A; 3RYI B; 3ZHS A; 3W7T A; 2EJ7 A; 4P9O A; 3SPH A; 4YJ2 A; 2IJJ A; 3DC5 A; 4YJ3 B; 1GN6 A; 3CCJ V; 1XMQ B; 3ZMV A; 2JEX A; 1BQ0 A; 3W7U A; 3K9S A; 2DE0 X; 1ZL8 B; 3JAS B; 1P7B A; 3UCS C; 3SYC A; 4JZ2 A; 1N36 O; 2RN9 A; 3FKS G; 3HPL C; 4NKG B; 5DED A; 3WG7 B; 2RQ6 A; 1FJG B; 5E79 Z; 2H3O A; 1F4N A; 3ZMU A; 2E5L B; 2IJI A; 3I55 V; 1YSC A; 1R3L C; 5D5Q A; 5KHK A; 1K3E A; 4ZOL B; 1GAX A; 2JIZ G; 3T4D A; 2OCC C; 5GON B; 5EBL C; 2DYS B; 4X1K B; 4DR7 O; 1XIL A; 2Q69 A; 3PJS K; 5K1X A; 4MVZ A; 2B5U A; 1Q7Y W; 1SQP H; 3D3Q A; 2WAM A; 1WA8 B; 4U3J B; 4D6T H; 4K0K B; 2EBO A; 4HBN A; 2A79 B; 5H6R A; 1P4R A; 3AG4 C; 2CGN A; 5KHJ A; 3BCC H; 3S3X A; 3HB3 B; 4J42 A; 1JOY A; 4TV8 B; 2PI4 A; 4FK5 C; 4K35 A; 3CCV V; 1FAF A; 1KKC A; 5C93 A; 3BEH A; 2DQ0 A; 2B1I A; 3K58 A; 4H13 B; 1QBZ A; 3AG2 B; 2EIL B; 3CCR V; 1THZ A; 2P6J A; 4YY3 B; 3T1C A; 1W59 A; 1JMK C; 4TUY A; 4P30 A; 3JD4 A; 5EYP B; 1XNQ O; 3BAA A; 3ZRW B; 4FZ0 A; 3ASN C; 3HR0 A; 1ARO P; 5LMU O; 4I9Q A; 4O4J A; 1F23 A; 3ZMZ A; 4MT8 A; 5JJE B; 3RT3 C; 1ENV A; 4KL1 A; 4J11 A; 1O9G A; 1XQ8 A; 1TUE B; 4JI7 B; 3K9A A; 4X66 O; 4ASU G; 1GN3 A; 4FVM A; 3ETD A; 1KD1 W; 3AK2 A; 1DF5 A; 2DYS C; 2XT9 A; 4Z2W A; 4A5U B; 1JPX A; 4LF6 B; 1TUB A; 1SZT A; 1ZWI C; 4ZKI A; 2ZE5 A; 5LYJ B; 4JAU A; 1XMO O; 3F5W C; 1XEQ A; 3T4Z A; 1K73 W; 4B3T O; 1AI6 A; 1EN6 A; 1GRJ A; 2QWO B; 4HAM A; 3LDC A; 1MG1 A; 4UFZ A; 1Q6H A; 3NXS A; 5B3S B; 1NTM H; 3E22 B; 3QO8 A; 1EN4 A; 3W7W A; 1TVK A; 1N33 O; 1ZLZ A; 3D36 C; 2HP8 A; 4YIO A; 5LP6 B; 3JAM N; 4LNU B; 4FLW A; 2IH3 C; 4IYI A; 1YIT V; 2QTS A; 3AG2 C; 2EIL C; 2H94 A; 5L3G A; 1SA0 A; 3E8B A; 5IE9 A; 3FYE B; 2EZP A; 1R6T A; 4FLZ A; 1PL0 A; 2YI9 A; 3OEE G; 1YTF B; 1N36 B; 1IBL O; 2LFR A; 4DRX A; 1GM9 A; 4CH4 A; 1ZSP A; 3K57 A; 1AJP A; 3CME V; 2QDO A; 3BVO A; 1HNW O; 4EFB A; 4X62 B; 2LGQ A; 4LF8 O; 2AHY A; 3LSS A; 3RW0 A; 1E1Q G; 2Y4U A; 2NR5 A; 4B3R B; 1P84 F; 4PDR A; 1WB7 A; 1K92 A; 2Q6A A; 4PA4 A; 5H2F Z; 3QG5 A; 4RWU A; 1NVP D; 4RQE A; 4Z1M G; 1GM8 A; 3UT5 B; 3SYA A; 1FFX B; 3ABK B; 2WWW A; 1CPY A; 4MVR A; 4DUY B; 4HNA B; 3ABL B; 3SR2 C; 1NQT A; 2PUS A; 3G71 V; 5KHH A; 1V55 B; 2V4D A; 3CRR A; 3E86 A; 5B3S C; 1LUV A; 4WF9 V; 4JI6 O; 1N4C A; 3FB7 C; 4PA6 A; 5J2U A; 2YI8 A; 5LP6 C; 3E89 A; 1K33 A; 2Q9L A; 1VQ7 V; 3L72 H; 2RJZ A; 3DSQ A; 2P5O A; 2X0L A; 4WFA V; 4AIL C; 5FPR A; 2OTJ V; 1XHX A; 1SC5 B; 2EUL A; 5LMU B; 2CTP A; 2RCV A; 3OFN G; 3D3I A; 5E1A C; 2EIM B; 2Q5Z A; 1BT8 A; 3JAR B; 4JYA O; 2YC0 A; 4QIW F; 3MDS A; 1L0L H; 4CS3 A; 2R72 A; 1ZTE A; 3OT7 A; 5D5P A; 2WA3 A; 3UQ8 A; 2X6B A; 2QTO A; 3N2K B; 4MS2 A; 2WLL A; 5JH7 B; 3ABK C; 4J9Z B; 4XBF A; 4OX9 O; 4MVM A; 4B3T B; 3Q4H A; 4I50 B; 1QLE B; 1NI8 A; 4PA7 A; 3SYO A; 1U96 A; 2JGD A; 3EHB B; 4DR2 B; 2WLJ A; 5LXT A; 1UJW B; 1V55 C; 1PNL A; 4PDL A; 1BE3 H; 4EB6 A; 4OPA A; 2PGG A; 1R6K A; 1BHB A; 3G6E V; 3OD4 A; 3A0H Z; 5EIB D; 1WJZ A; 4LH6 A; 2CTQ A; 2PY5 A; 4DV6 O; 2CK3 G; 4DV4 O; 1HWY A; 1TGO A; 2P22 C; 4LF4 O; 4H0L B; 4DR3 B; 4DV7 B; 2HJD A; 4NR1 A; 1KP3 A; 2YIC A; 3P3P A; 5IWA O; 1P49 A; 1M56 B; 1EFR G; 1LUW A; 4ZBM A; 1R3K C; 2QR4 A; 3JD2 A; 4DXW A; 1EM1 A; 3RYI A; 2K1E A; 2QGN A; 1NZ6 A; 4MSW C; 5JJJ B; 4R8C A; 4LCU C; 1H8H G; 2UXC O; 3E8G A; 5KAF Z; 5JVD B; 5CBG A; 1ZL8 A; 4QE9 A; 4B3S O; 3RVZ A; 4E4E A; 1Q82 W; 1IZ3 A; 4YHH O; 3GVM A; 4ZHQ B; 4BIU A; 4KP4 A; 3HKE B; 3B77 A; 3ZED A; 5KUM A; 3WB2 A; 1QLE C; 2E74 B; 1W2B U; 1MZF A; 4I7Z B; 2HVJ C; 4ZOL A; 5CA0 B; 3MHS C; 2YIA A; 3RYF A; 1JJO A; 1K34 A; 1BGY H; 1OHH G; 5AG2 A; 1VIB A; 4JI6 B; 4G28 B; 4ZIB A; 1NVP B; 4X1K A; 1SQQ H; 1XMQ O; 4FLV A; 4UXN A; 1Y76 B; 4O2B B; 5GTH Z; 2P90 A; 3OR6 C; 4MTG A; 3PN1 A; 4JI1 O; 4MVO A; 1GTO A; 1SQB H; 3ZRV A; 1JJ2 U; 1AI5 A; 2ZE6 A; 3APO A; 3TJT A; 3AG3 C; 4I0X B; 2E5L O; 2HJF C; 3RN4 A; 1B04 A; 4K8X A; 1VQO V; 3HKC B; 1KYO F; 3CP1 A; 1VQ8 V; 4UCV A; 4W4L A; 1LR1 A; 3C90 A; 3FB8 C; 1H8E G; 3A0R A; 1GH6 A; 4GX2 A; 4OGQ B; 2A06 H; 4FJC C; 4LF7 O; 4X9Q A; 4P9P A; 1HNZ O; 3ZHR A; 2JEU A; 3ZRW A; 2AZ0 A; 2WLN A; 1OCO B; 3JAW B; 4WBN B; 1I08 A; 2UXB O; 3K0D A; 5JQG B; 3OTF A; 2R9I A; 3N27 A; 5FNV B; 3ML0 A; 2ZR3 A; 5EZY B; 3O65 A; 3OMI B; 3ZMT A; 4E2L A; 1HR0 O; 1XNR B; 3BA8 A; 1Q6I A; 3S3W A; 1KP2 A; 5IDJ A; 3SJB C; 1MSD A; 3SDL A; 4YY3 O; 5LYJ A; 4AQY B; 3ZX6 A; 1XL4 A; 4RO2 A; 1QLN A; 1IXM A; 2D3O W; 1IUR A; 4FFB B; 1FFT B; 4KUM A; 3J80 N; 4DV6 B; 3FFQ A; 4PDV A; 2Q4P A; 2LP7 A; 1PM9 A; 3CE2 A; 1F7Y A; 1W0K G; 2PI5 A; 1QR9 A; 2LW1 A; 3E22 A; 3WFV A; 2Q7E A; 3TXQ A; 3ZBH A; 1ROP A; 5IY5 B; 4IHJ A; 1MA1 A; 4Z1V A; 1OV9 A; 4JTD B; 2KG7 B; 3STZ C; 3B09 A; 1ZUQ A; 4OPH A; 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5FLX N; 4FLT A; 1KU9 A; 3OAA G; 5FL7 G; 5CN0 A; 5IJ0 B; 2UXB B; 1UPG A; 2KQX A; 2XOK G; 1SQG A; 2K9P A; 1KEC A; 1FXH A; 4GCZ A; 3DXR A; 2EIN C; 3JD3 A; 1HR0 B; 1HDJ A; 5LHI A; 2C2A A; 1KKD A; 3CCQ V; 4MVQ A; 1BQZ A; 3ABU A; 3N2K A; 2Y0P A; 3ZMS A; 2WLI A; 5JH7 A; 1FXK A; 5CA1 B; 2FB5 A; 3K5O A; 3DGE A; 3WB1 A; 5DEC A; 2QM8 A; 4FFK A; 2P4K A; 2BSK B; 3K04 A; 4G2K A; 1YXB A; 3ZN1 A; 5CB4 B; 3SJQ C; 2CUG A; 2JJ2 G; 2QSA A; 4YXW G; 2A0L A; 3JD1 A; 2XAF A; 2AGA A; 2E75 B; 2NLJ C; 3RWR D; 1VQM V; 4O2A A; 1DF4 A; 5A9G A; 2F66 C; 4LH7 A; 2UUB O; 1SZX A; 3GB7 C; 5LOV A; 1SET A; 2RDC A; 2ODM A; 4UCU A; 5BR8 B; 2OYQ A; 2YSU B; 2LO1 A; 2WSS G; 2IJH A; 4U7N A; 1NKD A; 1SQV H; 1FS0 G; 4TT3 G; 4HYO A; 4D7S A; 1KBH A; 1BSM A; 3T1H B; 1AI7 A; 2KKW A; 4DR2 O; 2GTA A; 3K59 A; 3E8F A; 4BW5 A; 3B4S A; 2YUA A; 1VF6 A; 4WFF A; 2EIK C; 4LF5 B; 4R50 A; 2Q8V A; 4I55 B; 5JVD A; 4GLX A; 2ZM6 B; 1A32 A; 1H2L A; 1GMG A; 2Y69 C; 4MVS A; 5HFM A; 3CPW U; 4DR3 O; 2P67 A; 4DV7 O; 4R7C A; 2GDS A; 2OCH A; 1PL4 A; 5ITZ A; 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