4QF9A

Structure of gluk1 ligand-binding domain (s1s2) in complex with (s)-2-amino-4-(2,3-dioxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-6-yl)butanoic acid at 2.28 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
b'TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Binding Mode of an alpha-Amino Acid-Linked Quinoxaline-2,3-dione Analogue at Glutamate Receptor Subtype GluK1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 76
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qf9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qf9A02
3QIMA 1D3KA 1FW0A 3RT6B 5JTYA 4GD5A 1M5DA 5I2NB 4G2ZA 4DZ1A 1Y4TA 1IQ7A 1MXXA 1B58A 3TAJA 2DXYA 2PBWA 4R74A 3OXNA 2HZKA 1GTKA 1JVXA 3I5OA 3OSRA 1B7UA 1OMPA 3OMBA 4XKPA 1URGA 4H0WA 5LOMA 4FATA 3CG1A 3WAFA 3A09A 3KN8A 2AIXA 2Y84A 4R9GA 1FQBA 4LA9A 2A5TA 2HQ0A 5ITOA 1A8FA 2UYEA 3BFTA 1ANFA 2I48A 4H65A 4YKKA 1Y1MA 5ITPA 1B7HA 4U1OA 4WEDA 1YTVA 1R1NA 3HV1A 4M4GA 1SYIA 1MY3A 1LFIA 1QKAA 1MXVA 4QSDA 1QW0A 3E4RA 1TFDA 2G93A 3Q25A 1FTOA 5ICTA 1LAHE 5ISUA 3C9HA 3N26A 4KYEA 1IITA 5CMKA 4FECA 2ABHA 2PYYA 2FA7A 3FVNA 3TQWA 1XVXA 1BIYA 3G3HA 1XOCA 2XX7A 1J1NA 2O84X 1DPEA 3SESA 3FXQA 3PUVE 2F7CA 4P11A 3OO8A 2O7IA 2V25A 2I0BA 3E13X 4RY1A 4ZDMA 1YPNA 3FVOA 2D21A 3SDFA 1FQFA 2OLBA 5CM6A 2XXXA 4MH5A 2DWHA 3I3VA 4GFRA 1PBPA 2QSXA 3T9XB 4ZZEA 4FE8A 4YB5A 3KZGA 1Y20A 4F39A 2OBGA 4ZZAA 4ZS9A 5I56A 4H67A 1B3HA 2I6EA 4IY5A 4K3FA 1FQEA 4IGTA 1NNPA 1B6HA 4FEBA 3KJ7A 1FQDA 1MPCA 4P0IA 1B9JA 4FEDA 3SEXA 3MUQA 5BUUA 3MP6A 3O9PA 3ZKLA 4AB5A 3C31A 2Y7PA 5L9OA 5H8FA 3B6TA 5AA2B 1MQIA 3MBPA 2NOOA 2AYSA 1SD3A 4JXIA 1PDAA 2M8CA 1BLFA 3VV5A 4F2QA 3H4ZA 3ODBA 2F97A 1SVXB 2XXWA 3H03A 2GRVA 4TLMB 2O69A 4ND9A 2GH9A 1A54A 3ECRA 4BDOA 1UTHA 2NUVA 3MQ9A 3K1PA 1LB9A 1P1NA 3KG2A 3VE1B 2Q9TA 2OWTA 1N76A 4JB7A 1N3XA 1H76A 5ICQA 3M3LA 3PPNA 3BBRA 2UVJA 1MQJA 4R9FA 2V84A 2HZLA 3TTMA 4PFUA 4ELOA 4GIZA 4ZEIA 4C1UA 2DVZA 3TTNA 1B40A 3ONMA 1M5BA 5B70A 2Y7IA 5I2KB 2ZYNA 2D5WA 3S2VA 1M5FA 1B5IA 2B65A 1MM6A 5H8SA 4F19A 4C1TA 4I62A 4MBPA 2RC8A 4U4XA 3EHTA 2UXAA 3MAMA 5CI5A 1N04A 5H8HA 1HSEA 5DTBA 3SETA 2H5YA 3MVWA 2XX9A 1JNFA 2P1SA 3FVKA 2DWIA 3S9MC 3TCFA 3UK4A 1Z7ME 1P1UA 3FUZA 4RA1A 3MPKA 1QULA 2ZMBA 5DVIA 3W15C 1B3FA 2DS9A 2H9BA 4OFLA 3IJXB 4TQUQ 3MWBA 3G7WA 4Q8RA 3H06B 4OEVA 1XT8A 3TQLA 4YKIA 1P1WA 3W9WA 3ZS6A 4RK9A 3U8QA 2DOJA 4ZEFA 2ZXTA 2PMSA 3L6GA 4IO3A 4IO5A 1Y3PA 4M1VA 3FJ7A 1PB8A 4G68C 3Q27A 4IO6A 4QSCA 3ILTB 3U94A 1PBQA 2F36A 4R2FA 4FORA 3KBRA 4LP2B 3GBAA 4LQ5A 2QMXA 4X48A 1UIVA 3H6VA 4H1XA 3MVXA 5CRYA 4G68A 3MW0A 5HPQA 3CFZA 3TPAA 4MLQA 1VFDA 3KN7A 2XXHA 1VR5A 5K2YA 3OO7A 2YPNA 3SEWA 3TKDA 3PPPA 5AA4A 3THIA 4U22A 4NTLA 2NVUB 5JEIA 4XIGQ 2V3QA 3CG3A 4Q5TA 1B52A 2LAOA 4NF5B 4NF8A 2O7UA 5I84A 3VFJA 4C0RA 3UORA 4DCXA 4YAHX 1Y3NA 3OSQA 1JW1A 3VXCA 3T66A 1MS7A 2GHAA 3TFLA 1OVTA 3AXFA 2F34A 3PPQA 1USYH 1IXHA 1S9TA 1Q35A 2B3BA 1ZMGA 4WKMA 1MQGA 1LAXA 3O28A 2OK2A 4KFQA 4NF6B 1B1HA 4U1ZA 2I58A 1Y3QA 5A5XA 2FNCA 4BDMA 1H43A 4OENA 1OVBA 1H3DA 2RKMA 4ZE9A 4MF3A 3K4UA 4ONYA 3CVGA 1S7YA 3MP8A 3RN8A 2ZYOA 2DE4A 4IO7A 4GLIA 5EHMA 2FYIA 4F3BA 3QK6A 3N5LA 2Q8JA 2KLFA 3O6HA 4IO4A 1I6QA 3O6GA 1MH4A 4OHNA 4H8IA 4F3GA 4NF4B 1UTBB 2Y7RA 1Y1ZA 4KHZE 2VP1A 4POXA 3K00A 3H3GA 2NXOA 4OWDA 4TLLB 4F1YA 5I58A 2O1MA 2G29A 5KCJA 2XXVA 1SDXA 1FCKA 1P99A 3IOWA 1S50A 1B32A 3K6WA 2I0CA 4RNSA 3C36A 4YU0A 3GZGA 1N7XA 5EYFA 2ZYMA 4DXUA 2ONRA 2QMWA 4RPNA 1Y9UA 3FD3A 2NWJA 2Y7KA 1MPBA 1F9BA 3IK6B 4RXLA 2V3TA 5CBRA 4KR5A 4JSOA 2I49A 3HCQA 4BDQA 4NWCA 3E3KA 3PMVA 3R6UA 2VD3A 2R9JA 3EPEA 2CMOA 3PUXE 1LBBA 1US4A 3T22A 2DXRA 2ANJA 1II5A 3SEVA 1ZKBA 3HN0A 3PGFA 4EUOA 1MPDA 2ONSA 1FTJA 1O64A 1Y4CA 2H25A 4Q0CA 5H8NA 3SKPA 2CZLA 4G8NA 5TPAB 1A7LA 3TDJA 1B3LA 3RUMA 3IR1A 5L9SA 3D4CA 4RJZA 3EN3A 1POY1 5I59B 4EF1A 2I3WA 1DOTA 4PFYA 4QFKA 3PMXA 3PPOA 2Z8EA 4NF8B 3KGCA 1NFTA 1PEBA 4ECFA 5KDTA 2Q2AA 3QUJA 2IEEA 1O63A 5I57B 4I8CA 2Z8FA 1B05A 3V83A 1BKAA 1PB9A 1LCFA 1B5JA 1LAFE 2VOZA 4JSDA 1MQHA 2F5XA 4F22A 1D4NA 1H44A 1IXGA 2P2AA 1Z7NE 3WAEA 1A55A 1KWHA 2Z8DA 1B3GA 5DVJA 5AA2D 3LBSA 4DE8A 3U93A 2XXUA 1N84A 1SI0A 3ZSFA 5DEXA 4JWOA 1VSOA 3VLUA 4G8HA 1LFHA 3IOTA 1CB6A 2A5SA 4IGRA 2XXYA 3MZBA 1B3EA 1ZJLA 2HFBA 4H5GA 4R6YA 5JK4A 2GFEA 4HW8A 3IAZA 1LAGE 3IX1A 3PV0E 2RINA 4GOTA 3IB1A 4HCYA 3FZVA 3OEMA 2XXRA 4OVJA 1N7WA 3OOAA 4XTCQ 3PD9A 3RPWA 3FASA 2F7AA 1AL3A 5HM4B 5TU0A 2VHAA 4BDNA 2XXIA 3PUWE 1AIVA 5TP9B 1AH5A 2Q88A 4QFLA 3KOTA 2Q2CA 5JTYB 4OETA 2Q89A 2DSFA 3V89B 4EF2A 3QAXA 2I4BA 3RGYA 4XKQA 5CMCA 4GXSB 1MRPA 3KN3A 4QFNA 2H4IA 3T9HB 3C32A 3U72A 3DLNA 4N13A 4OYVA 3RTFB 3K01A 2OZZA 2DYXA 1FQCA 5AE4A 3IO6A 3OO9A 1ZU0A 4RYAA 1NH7A 4QSEA 2A5TB 1PC3A 1B0LA 3TTRA 3GXAA 2OJTA 1IXCA 2PT1A 3CFLA 5FHOA 1HSJA 3EHUA 4KCDA 3PUZE 4GL0A 3G3JA 3IJOB 3BKIB 3TTKA 4THIA 4R6HA 1PB7A 3USDA 2F6GA 3IB2A 3H6TA 4PFTA 3UP9A 4GVOA 2GHBA 4YKJA 2Z22A 3D4GA 3K6UA 1BTJA 2DP8A 4EXKA 1NMUA 1D9VA 2DE2A 4P0GA 2DVCA 3RNNA 4Q30B 2ALUA 2OWSA 3S9LC 1SW4A 4O3CA 4DXBA 1NL5A 5BWJA 4PQJA 1SQYA 4R75A 3N94A 5AA1A 3TELA 4H6DA 1SW1A 3CRBA 2XXQA 2D3IA 4F3SA 5HBCA 2O51A 4QRZA 4UA8A 5CBSA 3RT8A 5I2NA 1BP5A 2ESNA 5DEXB 4OZ9A 5I56B 4OEUA 3C4MA 1ZBMA 1QUIA 1NNTA 4O3BA 4KPTA 4O3AA 3QXMA 1I69A 4R72A 5L9MA 4PP0A 4XXUA 4R6KA 4XKRA 3OD7A 5DT6A 1JW5A 1SW5A 2DWJA 1OLCA 4ELQA 1B0HA 3K6XA 5H8FB 3K1NA 1CE2A 5H8QA 4G77A 2P0SA 1MQDA 4QFPA 3FV2A 1TXFA 1R9LA 1DTGA 2HCAA 1MY1A 1IXIA 3VVDA 4LONB 4N07A 3FATA 1UTHB 1NNFA 3VVEA 4ESXA 3RTWB 5FTHA 3N6UA 3K02A 1QJMA 4X1BA 3ILUB 3LR1A 5DYHA 4LQ2A 2AL4A 3EF7A 3T93B 3S4UA 3K2DA 1JEVA 3H6UA 3G3IA 1ZLQA 1RYXA 4GRKA 5M2VA 3VLVA 2HAUA 1VFEA 1MXWA 4FJPA 4U2RA 5FHMA 3Q28A 2X7QA 4RPOA 5J1DA 3KOSA 1LGBC 3EHSA 1A99A 1P1OA 4KD5A 3PD8A 3T9VA 4HS7A 4R73A 1JVYA 4KQPA 4KYDA 4LZ8A 1SBPA 4YZZA 2F35A 4ZE8A 5ELVA 4IY6A 5H8HB 3JYRA 1FQAA 5CMMA 3V5AA 4ZECA 2UVHA 3HSTA 3FJMA 4XKNA 4LZ5A 1URDA 1RKMA 3R7XA 4HTGA 5IAIA 2H99A 4WEPA 2W7YA 1MDP1 3MPLA 4X9TA 1DTZA 5AA2A 4OESA 3L6HA 3IOVA 1SI1A 1DPPA 2PT2A 1MG1A 3MC2A 3KFMA 4H8JA 2H98A 4H5FA 4DLDA 3GBBA 3K1MA 3TODA 4HCWA 3LUYA 1MH3A 3JV9A 2PX1A 1DSNA 3FGSA 3A3CA 2QRYA 1L5TA 1EU8A 2REGA 3M3KA 1B1XA 3B6QA 3TZAA 3FV1A 3HHFA 4G68B 4OMBA 3JZJA 4OQOA 2I4CA 2WKYA 2O68A 3T96B 4OFOA 5I2KA 4LZ7A 3G3KA 4YB6A 5FHNA 1NH8A 3IO4A 5AA4B 1OQHA 2YJPA 4GF8A 2RCBA 3Q26A 1OLAA 3VVFA 3FXUA 4JWYA 3TMGA 4E0WA 2AL5A 2E0SA 3E9XA 3O66A 2QS4A 3TYHA 1POTA 2O1LA 5H8QB 3BFUA 3I6VA 4ISUA 2UVGA 2XXPA 1AOVA 4BDRA 3PMWA 3PPRA 2HAVA 1XS5A 1B7ZA 1USYE 5F1QA 4Z0IA 4JBZA 3M3FA 2QS2A 2E1SA 3CFXA 4ZEBA 4OFJA 5A5XB 1UQWA 2QS1A 2R71A 3C34A 2ZNUA 3PUYE 1MY2A 4UACA 1M5EA 1LLSA 4EQ7A 1TFAA 3QUFA 1B5HA 3PU5A 1IEJA 4ZEKA 4ELRA 1A40A 5EHSA 4YMBA 1LFGA 2XX8A 1EH3A 5AA3A 3HO7A 1QVSA 2F7BA 3V8XB 4F29A 4YMAA 3DP8A 5DVFA 4BDLA 1MXZA 1EZPA 1AMFA 4LUBA 3DELB 3QSLA 1DMBA 3K6VA 2QS3A 5I58B 3B7DA 2RC9A 5KCJB 1R9QA 4POWA 3B6WA 1SYHA 1I6AA 4NF5A 2Y7WA 4KI0E 2B3FA 1OQGA 1JW4A 3VXBA 1GVCA 4Z7EA 3S9NC 3UGWA 3CSGA 3U92A 3MVZA 1ATGA 4DCYA 5K2XA 2RCAA 4NMYA 3MJNA 5CMBA 3O2AA 4NE4A 1XC1A 4NF6A 3CIJA 4PFWA 1QUKA 3C33A 3O97A 2QL3A 4YB7A 1M5CA 1ZTYA 5L8DA 3KEIA 4NWDA 2F8DA 1B2HA 5H8NB 3G3GA 2F6PA 4G8MA 3VLWA 4F2OA 3C35A 2ZNSA 1YCJA 1OIBA 3IORA 3SEYA 3RQTA 4KYSA 4MFIA 3OEKA 3CR9A 4DDDA 4E0XA 1SW2A 3T9UA 1EZOA 3FJGA 3H6WA 1XHYA 4NF4A 1UTBA 3F11A 4U21A 3OO6A 4OERA 3VDFA 3LSWA 1MDQA 4FAJA 4BLAA 3OENA 3HHGA 3GLBA 3DP4A 3IL1B 1JETA 5KDTB 2ZYKA 1P1QA 3LSXA 1B4ZA 1JEUA 4ELPA 4YKPA 2I3VA 4DIGA 2XXTA 3G3FA 4MLVA 3LSFB 1D9YA 1ELJA 1WODA 3SEUA 3U1OA 1EZ9A 1QKBA 4GL8A 1FTKA 3K0VA 5CC2A 4YICA 4QHQA 2F78A 4F31B 1US5A 2VGQA 3UA8A 2X7PA 2XD2A 1O7TA 4KCCA 1MM7A 3MVYA 2DE3A 2UVIA 1URSA 3IB0A 1IIWA 2Z23A 2RC7A 4PE5B 3A3UA 4DXCA 1VE4A 1QUJA 4TOZA 2V93A 1B4HA 2XD3A 3R26A 1LBCA 3MZ1A 3S9EA 1MY4A 4GXAA 4R2BA 4ESWA 3UN6A 1LB8A 2YLNA 5TPAA 4LVQA 4F1VA 1T0KA 2X26A 2REJA 3MZ9A 3TCHA 2DWAA 3Q29A 1NNKA 3FVGA 2QJEA 3TEPA 5I59A 4G4PA 3IOUA 1LCTA 1UIUA 2UYFA 2PVUA 1XVYA 3RLFE 1GV8A 4IB2A 4PETA 1MXUA 3KJTA 5FTIA 1GR2A 5I57A 2THIA 3KSXA 4N6PA 2V3UA 3TCGA 2VD2A 4U4SA 2ZNTA 4AB6A 3RY3A 4EQBA 2O6AA 1TWYA 4FIMA 1IZ1A 3UIFA 4EDPA 4I9DA 4QFOA 2BJJX 3LSLA 3CSBA 1B51A 1A8EA 4F18A 1N0TA 4OXVA 1H45A 3TUSA 5F7VA 5B7DA 3M8UA 3DP6A 2HEUA 4QF9A 4X1DA 4JWXA 4LATA 2OCUA 3FIRA 4IO2A 4RK2A 1TT1A 3H7MA 4EXLA 4L17A 1FTMA 1LSTA 3O29A 4EQ9A 4OTEA 2DQVA 1R6ZA 3P7IA 3W9VA 2IA4A 4I1DA 3N6TA 2HXWA 4ZEDA 2RF1A 3HPIA 2R6GE 3CI8A 1N3WA 3MP1A 1WDNA 4NEDA 3LC8A 5KZTA 4GWOA 1IUDA 1HSLA 1YAEA 4AQ4A 1MXYA 4WXJA 4JDFA 1RYOA 1I6BA 4U23A 1NKXA 3TTLA 3SERA 1ZIUA 3O6IA 3ZKKA 4GQOA 1WVJA 4F3PA 1MY0A 5IKBA 2XHDA 3KSJA 4F1UA 3DM0A 1GGGA 3QYTA 3OELA 1FTLA 1B46A 3FXRA 2QPQA 1Q1KA 5TP9A 1JQFA 3EQ1A 2ONKE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QIMA 1D3KA 1FW0A 3RT6B 5JTYA 4PFIA 4GD5A 1M5DA 5I2NB 4G2ZA 4DZ1A 1Y4TA 1IQ7A 2MKZA 1MXXA 1B58A 3TAJA 2DXYA 2PBWA 3ISPA 4R74A 3OXNA 2HZKA 2XXKA 1GTKA 1JVXA 3I5OA 3OSRA 1B7UA 1OMPA 3OMBA 4XKPA 1URGA 4H0WA 5LOMA 4FATA 2P3NA 3CG1A 3WAFA 3A09A 3KN8A 2AIXA 2Y84A 4R9GA 1FQBA 1FSAA 4LA9A 2A5TA 2HQ0A 5ITOA 1A8FA 2UYEA 3BFTA 1ANFA 2I48A 4H65A 4YKKA 1Y1MA 4N6KA 5ITPA 1B7HA 4U1OA 5IZ3B 4WEDA 1YTVA 3PTYA 1R1NA 3HV1A 4M4GA 1SYIA 1MY3A 1LFIA 1QKAA 1MXVA 2WYKA 4QSDA 1QW0A 3E4RA 1TFDA 2G93A 3Q25A 1FTOA 5ICTA 1LAHE 5ISUA 3C9HA 3N26A 4KYEA 1IITA 5CMKA 4FECA 4LN5A 1BK4A 4OVPA 2ABHA 2PYYA 2FA7A 3FVNA 4PGNA 3TQWA 5I7IA 1XVXA 1BIYA 3G3HA 1XOCA 2XX7A 1NV7A 1J1NA 2O84X 1DPEA 3SESA 3FXQA 3PUVE 2F7CA 4P11A 3OO8A 5J16A 2O7IA 2V25A 4PAKA 2I0BA 3E13X 4RY1A 4NQ8A 4ZDMA 1YPNA 3FVOA 3T0JA 2D21A 3SDFA 1DBZA 1FQFA 2OLBA 5CM6A 2XXXA 4O7IA 4MH5A 4P47A 4N81A 2DWHA 3I3VA 4GFRA 1PBPA 2QSXA 3T9XB 4ZZEA 4FE8A 4YB5A 1FPKA 4P56A 3KZGA 1Y20A 4F39A 4MJOA 2OBGA 4ZZAA 4ZS9A 1NUZA 4H67A 5I56A 1B3HA 2WX9A 2I6EA 4IY5A 4K3FA 1FQEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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