4QF9A

Structure of gluk1 ligand-binding domain (s1s2) in complex with (s)-2-amino-4-(2,3-dioxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-6-yl)butanoic acid at 2.28 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
b'TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 1
publication title Binding Mode of an alpha-Amino Acid-Linked Quinoxaline-2,3-dione Analogue at Glutamate Receptor Subtype GluK1.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 76
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qf9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qf9A02
5J1DA 4OERA 3W9VA 3AXFA 4N6PA 5I56B 1A55A 4F29A 3RTWB 2ONKE 1Y3QA 1VE4A 1VSOA 4JWOA 2DWAA 3N6UA 1MXYA 5I2NB 5I58B 4JBZA 4JWYA 2XXHA 5AE4A 3T96B 1GGGA 1VFEA 3OEKA 4KFQA 2DXRA 2HCAA 1DSNA 1AMFA 1LBBA 2RCBA 4RY1A 1PC3A 1H44A 4POXA 5ICQA 2F78A 2R9JA 2YPNA 3DP8A 5H8FA 4X48A 5H8HB 4YMAA 3IJXB 4F1UA 2VOZA 1ZTYA 1MDQA 4EUOA 1OVTA 4ONYA 3HCQA 2UVIA 3B6QA 4JSOA 4H8JA 3K02A 2PX1A 1I6QA 2RCAA 3OEMA 3Q28A 1XS5A 1N7XA 3C34A 1SW4A 3RT6B 1FTMA 3C35A 4G8HA 2RC8A 2I48A 5H8SA 1IXGA 1P1WA 3PMVA 3K6WA 3H03A 4OESA 2DVCA 3CFXA 1LB9A 2QMWA 4XTCQ 3U8QA 5ITPA 1JEUA 3OELA 2ABHA 5DT6A 3S9LC 4JDFA 2ZYKA 1S50A 4EF1A 4ELRA 4FEBA 3VLWA 2RKMA 5FHOA 1NH7A 1OVBA 1SQYA 4FEDA 3ONMA 3KN3A 4JWXA 4ZZAA 2A5TB 1Z7NE 3FVNA 2HAUA 2P0SA 1Q35A 1LCTA 1NH8A 1MY3A 1WDNA 5EHMA 5B7DA 1NL5A 1TFDA 5H8QA 3MVWA 2B65A 5JTYA 1Y3PA 4IB2A 4R2FA 1URSA 4HS7A 3MW0A 4LUBA 4DIGA 2XX8A 3C9HA 1JETA 5IAIA 1MY2A 4IO7A 4I9DA 2XXXA 4TQUQ 3MZ9A 2O7IA 2XXVA 1B4HA 1CB6A 2PT2A 4BDQA 2XXTA 4YB7A 3HV1A 4FAJA 5CRYA 4PQJA 4QF9A 4WXJA 1ZIUA 4IO6A 4FJPA 1NKXA 4YMBA 3MPLA 1OMPA 3HO7A 3BFUA 1QKBA 3TTNA 4C1UA 1Z7ME 3T9UA 4X1BA 4Q0CA 1VR5A 4POWA 3VV5A 3MVYA 3OSQA 5AA3A 5B70A 3EN3A 5LOMA 1IXIA 2I3WA 3O66A 1DMBA 1NNKA 5FHNA 4DLDA 4MH5A 4AB5A 3LUYA 2V3QA 3TZAA 4GD5A 4XKNA 1MQJA 1B0HA 1NNFA 3H6WA 5FHMA 5L9MA 5BWJA 3MAMA 2V25A 3FXQA 4GWOA 4LQ5A 1EZ9A 4DE8A 1N0TA 4GL0A 1PEBA 4R75A 1US5A 1DPPA 4R2BA 3PPOA 4NF5B 4U22A 3B7DA 3CSGA 2Z8DA 3BKIB 1H3DA 3C36A 1UTBA 3QIMA 3SESA 3IOVA 2PBWA 1XVYA 3A3CA 3UA8A 3UIFA 1P1OA 2I4CA 2G93A 4F2OA 1VFDA 2Q89A 1B7HA 3R26A 2XXYA 3KJTA 1LGBC 3FVOA 2XHDA 1MY1A 3MUQA 3VE1B 2DWIA 3UP9A 1PDAA 2XXIA 1MY4A 1JVXA 3C33A 4OETA 4U1OA 1JW5A 4OFLA 1SI0A 2I3VA 4LONB 2VP1A 3GBBA 4F1YA 2NWJA 2F7BA 3CI8A 1UTHA 5TPAA 4OFJA 2ANJA 3E4RA 1YTVA 2BJJX 1B05A 1SYHA 4IY5A 3IOWA 2F35A 1T0KA 1B9JA 2F6PA 3EPEA 2H99A 1DTGA 5ISUA 3IAZA 3TCHA 3ILUB 3QK6A 3TELA 2Y84A 1BLFA 3U94A 4H8IA 5A5XA 3O28A 2QS4A 3RUMA 4NF8A 3H3GA 1B58A 3S2VA 4R6YA 4KPTA 1LFHA 1B52A 1FTKA 3W15C 4YKIA 5I2KA 4ZS9A 4LZ5A 3FIRA 5JK4A 1B7ZA 1Y4TA 4GIZA 4GXAA 4I1DA 5HM4B 4F3SA 3SDFA 2PT1A 4YAHX 4R73A 3K0VA 1USYH 3MZBA 1EU8A 2QPQA 3H4ZA 4EQBA 1B3HA 5DTBA 1URGA 2B3BA 1LAHE 3TTRA 4P0GA 1UQWA 1B1HA 3MPKA 3Q27A 4R72A 4LQ2A 4YICA 1N3WA 2HQ0A 3FD3A 1TFAA 2AYSA 3Q25A 4WEDA 1URDA 1AH5A 1QUIA 2QRYA 2KLFA 2F7CA 3K01A 3K1NA 3TTLA 4KYEA 3EHUA 2V3TA 3JYRA 1P1QA 3DLNA 4R6HA 4OHNA 1H76A 3K6VA 3U92A 2PVUA 3A3UA 1L5TA 4LVQA 1SW1A 1PB7A 4OEVA 2AL5A 2R6GE 1BTJA 4EF2A 1AOVA 2P2AA 2M8CA 5K2XA 2DSFA 1M5EA 3G3FA 3MZ1A 3UGWA 4I62A 3IL1B 3G3KA 4M1VA 1Y1ZA 3MC2A 3PPPA 4G68B 2H98A 3OMBA 1R9LA 4G68C 5CI5A 2H25A 4YKKA 3KFMA 1F9BA 1IQ7A 1QVSA 3WAEA 4WKMA 2DQVA 3IJOB 5L8DA 1M5CA 1NFTA 1IXHA 5CMCA 3RT8A 4R9GA 2I58A 1XHYA 2XXUA 3EHSA 1B0LA 4MBPA 2A5SA 3MP8A 4BDMA 3ZKLA 2X7PA 1SVXB 2UYFA 3H6TA 1N7WA 1BKAA 2QS3A 2V3UA 3IB1A 3ZSFA 1B40A 4OVJA 4PFYA 4IO5A 5CC2A 1MM7A 3UN6A 1OLCA 3TTKA 3CG1A 2XXPA 4YKPA 4FIMA 4KHZE 3TPAA 4GQOA 2I0BA 2IEEA 1Y1MA 3TUSA 1GR2A 4NTLA 4H6DA 1A99A 1MQIA 4Q8RA 2O69A 1MQHA 4H5GA 3E13X 1MXZA 3FUZA 1UIUA 4EXLA 3DM0A 5KDTB 3RPWA 4PFUA 1LAFE 1MRPA 4OEUA 3VVDA 3IO6A 3UK4A 3L6GA 4XKRA 4YKJA 1MH4A 4RA1A 1EZPA 5CMMA 3VFJA 1MM6A 3QYTA 3T66A 5CMKA 1LAXA 4F3PA 5KCJA 1LAGE 3T22A 2FNCA 3U93A 5JEIA 5BUUA 1D4NA 4PE5B 3MJNA 1FQEA 2ONSA 5I2KB 4R74A 4EXKA 2Z23A 4NWDA 1II5A 3Q26A 3DP6A 1ZJLA 4WEPA 1MQGA 3K00A 3OO7A 3FVGA 3O6HA 4AB6A 3SETA 4O3BA 4G2ZA 5KZTA 1O63A 2QMXA 1XT8A 4H67A 3G3GA 4KYSA 4BLAA 4OTEA 3FATA 1YPNA 3KN8A 2W7YA 4G4PA 2DVZA 1LLSA 5I59B 3QAXA 3RLFE 4ND9A 3MWBA 3EHTA 5I84A 1LB8A 3E9XA 2Q9TA 1HSJA 3O97A 1GVCA 2VD2A 4EDPA 2OCUA 4N07A 3B6TA 2REJA 3PUWE 1NNPA 5F1QA 3TQLA 1B3FA 3O6GA 2NUVA 2Y7RA 5TP9A 4ZEIA 4KR5A 4DDDA 4Z0IA 1J1NA 3EF7A 3UORA 2O7UA 1POY1 4OXVA 4RPOA 4ZZEA 5AA4A 2Z8EA 1Y4CA 2DE4A 5H8NB 4U2RA 1IEJA 3FVKA 2P1SA 3PUYE 4IO4A 4IO2A 4RNSA 3RNNA 2D21A 3OOAA 3SEUA 4H5FA 3M3LA 4NF6A 3LSXA 1R6ZA 1XC1A 1A40A 3VXBA 3DP4A 4FORA 3TKDA 4NF4A 4ISUA 3PPQA 3N26A 5AA2A 5EHSA 1FTLA 3KOSA 1P99A 2O1MA 4MLQA 2DP8A 3E3KA 3P7IA 3V5AA 5AA1A 4QSDA 4RJZA 3K2DA 3PPRA 5I56A 3TDJA 2WKYA 1R1NA 3N6TA 5H8FB 2Q2AA 3B6WA 1RYXA 5CM6A 1QUKA 1B2HA 5I2NA 5I58A 4P0IA 5DVJA 1IITA 2Q2CA 1TXFA 2F6GA 3RTFB 2O6AA 1SDXA 4QFPA 4QRZA 3MVZA 1B5IA 1ZMGA 4RK2A 3PGFA 1LBCA 3FGSA 3GZGA 3TMGA 4IY6A 4ESXA 5HBCA 1MPCA 4Q30B 4KI0E 4YU0A 1OLAA 4EQ9A 1QJMA 3OSRA 5H8HA 1A8EA 3VVEA 4DXUA 2PMSA 3TAJA 4YB6A 3L6HA 4FE8A 3KGCA 5EYFA 3PV0E 1B5JA 2PYYA 2LAOA 3DELB 2UVGA 3RY3A 4QFLA 4E0WA 3TCGA 4UACA 2OLBA 4G8MA 5I57A 3U72A 3KJ7A 1R9QA 2ESNA 3THIA 5L9SA 3TEPA 3KBRA 3M8UA 4X1DA 3FXRA 2HEUA 1POTA 5H8QB 4GLIA 2X26A 4Z7EA 5JTYB 1JW4A 1BIYA 4HW8A 3T9VA 3VLUA 1B32A 1XOCA 4ZDMA 4Q5TA 2DXYA 3R7XA 2A5TA 3CVGA 2GH9A 1WODA 4N13A 3MP1A 2CZLA 3G3IA 2O84X 3ZS6A 2FYIA 2AIXA 2DOJA 4DCXA 3CFLA 4BDLA 3LC8A 2F36A 4U4SA 3D4GA 1ZLQA 4GFRA 3C4MA 2Q8JA 4ZE9A 1M5BA 1ANFA 3KZGA 2ZXTA 1PBQA 3OO8A 3M3KA 4GL8A 1UIVA 3H6UA 4ESWA 1MDP1 1Q1KA 1H45A 1B5HA 2ZNUA 1LFGA 3QUJA 2OWTA 3O29A 4OFOA 1PBPA 1ZBMA 4MFIA 2AL4A 2IA4A 3VLVA 4NMYA 4FATA 4XKQA 3IOUA 2YJPA 3OO6A 1YCJA 3PUXE 3OXNA 4H65A 4NE4A 4LZ7A 4XIGQ 1EH3A 2VGQA 3G3JA 4KCDA 5CBRA 1H43A 4G8NA 5DYHA 2GFEA 1JQFA 4RXLA 4PP0A 4E0XA 2O51A 4NWCA 1DTZA 1OQHA 3TCFA 1A7LA 1O64A 4F39A 2I0CA 3G7WA 3JV9A 5ELVA 3IO4A 2ZYOA 3IK6B 5F7VA 2HFBA 1Y3NA 1JVYA 5DVIA 4XKPA 3RGYA 3T9HB 3EQ1A 1UTBB 2THIA 4GRKA 4OYVA 3H06B 3FZVA 2RC9A 3IORA 1B51A 2VHAA 4DXCA 4QSCA 1I6BA 1N76A 3QXMA 3U1OA 4NF5A 3PD9A 3FXUA 4PFTA 1ELJA 1I6AA 1QUJA 4U21A 4JXIA 4HTGA 1MQDA 4ELQA 4ECFA 3I6VA 2ZNSA 3D4CA 4KYDA 3RQTA 4MF3A 2Z22A 3KEIA 5CBSA 3O6IA 4OQOA 1SW2A 5L9OA 3LR1A 1UTHB 2R71A 5TPAB 3C31A 2F34A 2Y7WA 3FJMA 4YZZA 1AIVA 1RKMA 4AQ4A 3O2AA 5K2YA 2O1LA 3VXCA 4F22A 4DXBA 2E0SA 3TODA 1SW5A 2QSXA 1ATGA 3SKPA 2OK2A 3CSBA 1B3EA 3I3VA 4ELPA 1JW1A 2H4IA 4U4XA 3BFTA 4JB7A 5A5XB 5I57B 4C1TA 4NF8B 2QS1A 4QHQA 1GV8A 1PB8A 4QFKA 1I69A 3K6UA 3PD8A 2OBGA 3V89B 2OZZA 3CG3A 2ALUA 3C32A 3PU5A 2UYEA 5IKBA 4GVOA 3S9MC 1YAEA 2UVJA 1N3XA 4ZEDA 1FTOA 1HSLA 2I6EA 1MXVA 5AA2D 4QFNA 2I49A 4H1XA 4TLMB 3G3HA 2E1SA 1B1XA 1MS7A 5DEXA 3OO9A 3QUFA 1PB9A 2NXOA 5ICTA 1MXWA 4TLLB 3LSLA 1FQDA 2OJTA 3MVXA 3JZJA 1AL3A 2I4BA 4LA9A 1XVXA 1US4A 2Z8FA 4XXUA 3O9PA 2XX9A 4UA8A 4LATA 3H6VA 3PUZE 3S9EA 3Q29A 4THIA 3IR1A 1MY0A 1OQGA 1P1UA 3K1MA 2V93A 1RYOA 4HCYA 2DS9A 1LSTA 3IX1A 4OZ9A 4O3AA 3IOTA 2FA7A 3M3FA 3FASA 4R6KA 3N5LA 3LSWA 1Y9UA 1HSEA 3OENA 4ZEFA 3GBAA 5M2VA 3HSTA 4M4GA 2DE3A 4F3GA 1B7UA 1IXCA 1KWHA 2F97A 3TFLA 3K4UA 4F3BA 4F2QA 1GTKA 3TQWA 4PETA 2DYXA 4TOZA 1N04A 1D3KA 3ILTB 1SD3A 3V8XB 3ODBA 2QJEA 1SI1A 1QKAA 1OIBA 2ZYMA 1LCFA 1MXUA 1SYIA 2ZMBA 4NEDA 2NVUB 1MH3A 3BBRA 4KQPA 4EQ7A 1NMUA 3SEYA 3PUVE 4YB5A 2CMOA 3QSLA 3IB2A 3GLBA 2ZYNA 4U1ZA 1B4ZA 3MQ9A 4L17A 4G68A 2YLNA 3HN0A 3CIJA 1P1NA 3FJ7A 1ZU0A 1BP5A 2DWHA 2XD2A 4F19A 2QL3A 1EZOA 3IB0A 3FV1A 4DZ1A 3T9XB 4U23A 1Y20A 2D3IA 2GRVA 1M5DA 2NOOA 2HXWA 4JSDA 3K6XA 3MBPA 3WAFA 3PMXA 2RC7A 3LBSA 2GHAA 2RINA 4QFOA 1B6HA 2D5WA 1WVJA 1B46A 3MP6A 4PFWA 2Y7PA 2H5YA 1FQCA 4KD5A 1MG1A 1FQFA 4RPNA 4I8CA 2REGA 2X7QA 5TU0A 2DE2A 1IZ1A 1B3LA 1FQBA 1JEVA 1A54A 1LFIA 3SEWA 2XXWA 3LSFB 4KCCA 3KSJA 2ONRA 3F11A 5KCJB 4OMBA 3W9WA 1S7YA 1TWYA 3CRBA 2F7AA 2F8DA 5KDTA 3HHFA 4G77A 4H0WA 4IO3A 1TT1A 5HPQA 2XXQA 4ZECA 1USYE 2ZNTA 2RF1A 1DOTA 1B3GA 1FTJA 4HCWA 2OWSA 2DWJA 3ZKKA 2Y7KA 1M5FA 3H7MA 1QULA 2UXAA 1IUDA 3PMWA 4MLVA 3K1PA 1MPBA 3USDA 1QW0A 3S9NC 4ELOA 3V83A 2Y7IA 3ECRA 3VDFA 1IIWA 3CFZA 4RYAA 3KG2A 1DPEA 2G29A 3KN7A 2H9BA 3KSXA 3S4UA 4ZEBA 2VD3A 5DEXB 5ITOA 4F18A 4OWDA 2HAVA 3TYHA 5CMBA 4BDRA 4QSEA 4LZ8A 4BDNA 2O68A 3CR9A 3I5OA 3SERA 5FTHA 4O3CA 3KOTA 4C0RA 3FV2A 3N94A 2HZKA 1S9TA 3R6UA 1FCKA 3FJGA 2GHBA 5TP9B 3VVFA 4F31B 5I59A 4P11A 4X9TA 1ZKBA 1D9VA 1FW0A 2F5XA 4DCYA 4IGRA 5AA4B 3OD7A 2QS2A 4IGTA 2XXRA 4ZE8A 4ZEKA 2V84A 3GXAA 3A09A 4K3FA 1MXXA 2HZLA 1N84A 1FQAA 4LP2B 4GXSB 3TTMA 1JNFA 3RN8A 4GF8A 2XD3A 2UVHA 4F1VA 1O7TA 4FECA 4R9FA 2B3FA 3HPIA 3HHGA 4NF6B 3SEXA 3PPNA 1CE2A 1MPDA 4OENA 4RK9A 5DVFA 5H8NA 2XX7A 4BDOA 1A8FA 2Q88A 3SEVA 4NF4B 3T93B 4GOTA 1D9YA 5AA2B 1SBPA 5FTIA 1NNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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