4QNEA

Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from vibrio cholerae, deletion mutant, in complex with nad and imp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
358
structure length
342
Chain Sequence
RIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKISGGLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEVILYQGRSYKAYRGMGSLGAMSLVPEGIEGRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGAGMKESHVHDVQITKEAPNYRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
publication title Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from Vibrio cholerae, deletion mutant, in complex with NAD and IMP
rcsb
source organism Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus 105
structure length 342
sequence length 358
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4qneA00
5I3HA 3CQ0A 4JTLA 3LCLA 1P0KA 2X1SA 4LT9A 4H4IA 4O1DA 2ISWA 4IWWA 1K8XA 3LHWA 5KZEA 1LOQA 2Y88A 3EWBX 1A53A 2Y70A 3L67A 4GWEA 1F6PA 3KXQA 4DPPA 3GIYA 1JCJA 3ANYA 4ORIA 4GC4A 4YLWA 3JS3A 2UV8G 3N73A 3FLUA 3TDFA 1KFEA 4RR4A 3STEA 2A0NA 3PSVA 5I3IA 1XI3A 3CIXA 4ADSA 4A29A 3BVJA 3HGOA 2WKJA 1N8FA 4Z1AA 3MMTA 2YW4A 4DF2A 4XBKA 2ZRWA 4JTGA 3EXRA 3OEXA 3HG3A 1TPC1 5E1QA 3T78A 5D2VA 3NZRA 4MVAA 3LRMA 1LROA 2WO5A 3THAA 3N3MA 5C54A 3KVMA 3E9AA 2ZRUA 3MI6A 5F4SA 1MEWA 4OV9A 2QEZA 3PBUA 5J5DA 1OF6A 4RJEA 3M1ZA 3HPZA 3UNDA 4XZ9A 4N6EA 1QMLA 4JTHA 5E93A 5LGXA 2ZRVA 2WNNA 2NWSA 4K36A 2Z0IA 3LXCA 4M6VA 1K7FA 5L9FA 3FOKA 4RV8A 5CPNA 3WJWA 5AC7A 5DLCA 4AHQA 3WFAA 3QMTA 3BO9A 4JYEA 1PS9A 4HN4A 3M5ZA 2V81A 3IRDA 4XUGA 3NQMA 3NOEA 3LI1A 1YTEA 3M9YA 3O15A 4HT3A 4JR5A 4IMCA 1TSIA 2ZCGA 1H1YA 4LS1A 3B8DA 1RPXA 1VLWA 5G4WA 3LCIA 3PVFA 4C1KA 1G7UA 5HJLA 2V5BA 2Z2UA 3GX9A 4UTUA 1LTDA 1PL9A 3GNDA 1YYAA 3LRLA 4DO6A 1XDLA 4HNTA 2QCDB 1TO3A 3W70A 1ZHAA 3TQVA 1YDNA 1K03A 3GR7A 5K9DA 1PIIA 3U2OA 2QCMA 1GVFA 3NM3A 3LTYA 3VE9A 3P8JA 2GVLA 5CZJA 4QAIA 3W84A 1PE1A 1OX4B 2YDAA 1WYIA 1I4NA 3W7DA 3NVTA 4ZQPA 1I2NA 4WXZA 3WJYA 2NXIA 2Y85A 4B5NA 2WSQA 5AFDA 3W1AA 2ATMA 1ICQA 5DCBA 2E6FA 4MIMA 1RQEA 1OFDA 2DORA 3QSRA 1H7WA 3I7RA 4CNOA 3PBWA 4LV4A 4OV4A 5FEXA 1LBFA 3YPIA 4GUGA 1KM4A 1LDCA 3C3NA 3NAVA 3OVRA 4WY0A 1TTQA 2R14A 4EVZA 5IBXC 2CLFA 1OABA 4JX6A 3EEGA 3TNOA 3M41A 3R5EA 5HNRA 2BWGA 1IIGA 1QDSA 5ABTA 5HR7A 3LHZA 3QF0A 1OG0A 2C0AA 5AHMA 1GVRA 3N9SA 4BF9A 3QPZA 2VKZG 2P10A 1AL7A 2ABBA 1BKSA 3KRZA 4X2RA 1ONRA 2JKPA 4O15A 3UY8A 1WAUA 1W56A 4BR1A 1D3HA 3W7HA 1WXJA 3TROA 5LNWA 1T8XA 4ZZ9A 1G4PA 2VOMA 3JRKA 3NM1A 4YL2A 1M6JA 3GXNA 3O16A 1XFBA 5KMYA 5K7JA 3F4NA 2W79A 1UUMA 3PUOA 1NSJA 3H54A 5CPMA 4PTNA 1JCXA 5I3KA 3PF3A 2WV8A 3TSMA 2RDTA 1SFJA 1X8FA 1TV8A 1FCBA 3ZFHA 3QH2A 4AHPA 1SW3A 3SW6A 1EA0A 4NJGA 4FF7A 3FJLA 3EX3A 1TPWA 5DY3A 5D05A 1KW1A 1B9BA 1CW2A 3FA5A 3PULA 2QUVA 2R91A 5AYZA 3ZWSA 4OWGA 2E6YA 2VFFA 4P61A 1IXNA 1NFBA 4HPXA 3TIMA 5J5RA 5HWMA 5C55A 3RLUA 5L6UA 3PM6A 2JGQA 4LOCA 5K4XA 1HUVA 4GJ1A 4R33A 1VYPX 4MY8A 1YXDA 3NQDA 3G1FA 3USBA 1AK5A 3MYOA 3EX1A 3W1RA 4MYAA 4UFJA 3LTPA 2GQ8A 2CLLA 4N9EA 4XKYA 2F7FA 3IIOA 4ZQNA 4JYDA 1AW5A 3TE9A 1Q6QA 4O1AA 2ZRZA 1A5BA 1DKWA 1LYXA 3EXSA 3N19B 3SR7A 3O05A 1OFQA 4N4PA 2HTMA 2A85A 5CPOA 5KZDA 4NNAA 3BW2A 3TMQA 3G18A 1YDVA 1SO6A 1TIMA 1G7VA 2QF7A 3SFKA 4WY0F 3GR8A 3UWVA 5LSMA 3A5FA 1EWEA 1M7PA 3OIXA 1JVNA 3G1SA 1ZJIA 2CWNA 2Y62A 1SO3A 3HGSA 3S5ZA 1W37A 2YGYA 3W71A 3VI2A 1XL9A 3W2NA 5I3JA 2A4AA 4K8EA 1VCGA 4AB4A 3W07A 4NJIA 3NQVA 5D2XA 3W7CA 4BK9A 5LNSA 4AF0B 3ELFA 3PS7A 5F1UA 3N2MA 3TAOA 3HMJG 3BG5A 2BXVA 2A6LA 3CPRA 3BGGA 2JGYA 5FESA 3W87A 4O54A 3FYPA 3OA3A 2EAWA 3LM7A 5U7SA 1WOAA 2QUUA 4AXKA 1O4UA 3QJAA 2J88A 1QFEA 1SR9A 3IV3A 2C16A 3IEBA 3RK8A 2X16A 4NQ1A 4TO8A 1HFBA 1K3UA 1OX5A 1ZAIA 1ZNNA 3PSWA 4GRSA 2V2DA 3TW7A 2Q3OA 4ZVJA 1VLIA 1ME7A 4ZQCA 3W7IA 2NXGA 2GUUA 3M44A 2X1UA 3DKLA 4LUIA 4Q32A 4OGZA 1IIHA 5K4ZA 1W8SA 1S5TA 1PCWA 1VYRA 1KTNA 2XN0A 1ZFJA 3NEVA 1G4TA 2PC4A 2J9YA 2C3ZA 5G5IA 2H90A 3HBLA 4IXXA 3STFA 3I6RA 2ZQ0A 3FEMA 2YYUA 4ADTA 3W88A 1X7FA 5HUOA 3I7SA 1VRDA 4OHQA 4AAJA 5H2ZA 1VCFA 1H50A 2FTPA 1GVSA 2NV2A 2GVGA 3TSDA 3FKKA 1H5YA 1EP1A 3L5AA 4I7VA 4JDYA 3C61A 5LKYA 1ZY9A 4M6QA 5EL1A 2YX0A 3WJSA 1UBSA 1I2QA 4ICNA 2PE4A 3HPXA 1U5JA 3RF9A 4IPJA 1OHLA 1RV8A 3N9RA 1LOLA 4ALDA 2DZVA 3R89A 1JQVA 2CZFA 2WJZA 1RQBA 3ZR4A 3U6WA 4JTIA 2W0UA 2CLHA 1FDZA 1YXCA 3DZ1A 4FEZA 1YTDA 2NWRA 4K6AA 3EWUA 1I2OA 2A7RA 3I65A 2NX9A 4M5PA 2HS8A 4PL2A 2PRHA 5LGZA 2CZEA 1OYBA 5TQLA 2RKXA 4UC5A 4JNMA 3NL6A 5AHFA 1X1OA 3O1NA 4Q33A 5CPLA 5HMSA 1G69A 1KM1A 4N9DA 3CHVA 3PBYA 2QJIA 4O0KA 1LP6A 3THQA 2YZRA 3QMSA 2NUWA 4DPQA 4QISA 1B4EA 5FEPA 4DXVA 4LNYA 5G1TA 2FB2A 4GE8A 2X1TA 4X3ZA 4TMCA 1GJPA 4UIOA 3QM3A 4O0ZA 4JTTA 1WX0A 2RH9A 1SZGA 4FX8A 3W72A 3DFTA 1KFBA 3QYQA 3PUDA 1KA9F 3VCRA 2ISVA 1VZWA 4E2BA 2CLIA 4MOZA 1VPXA 3SGZA 4RZ5A 3DBPA 3IIPA 4ZQMA 1T0OA 2PRMA 3U8GA 2VEPA 4WZHA 2BTMA 1P0NA 3KVKA 3S1VA 3HPSA 1Q6RA 3GXTA 1L9WA 3TMLA 2PRLA 5K3VA 1JQXA 1RVGA 1GVQA 4UTTC 3OVQA 1EP2A 4PCFA 3QQ0A 3S0CA 2E1DA 3DFNA 3EKZA 1P5BA 1SZNA 5DBTA 3B0UX 5KZMA 2ZTKA 2LLEA 2X2GA 3KVJA 4I7WA 5HUPA 3EX6A 1W5MA 1DJQA 4EWND 4LWWA 3QC3A 1XDMA 4ORMA 4O10A 3W7GA 2WPBA 2TSYA 3CC1A 2C15A 3QW4B 3P62A 1OJXA 3EKLA 1JCMP 3V1PA 1VCVA 1TJPA 4IGHA 4FNRA 4MY1A 3W86A 1DQWA 3NXFA 1W3TA 4O18A 3TA6A 1JUKA 3G0SA 3W6YA 1VHNA 1KFCA 2ZA2A 3Q94A 2VFGA 3PUEA 3NL2A 4K7VA 1F73A 3R2GA 3B04A 3EX4A 3UPWA 4O52A 1NF7A 1VC4A 1GPWA 1KV8A 2BSLA 3PC0A 4X22A 2V8ZA 1SFLA 1G6CA 2KZHA 3O63A 3NL5A 4NZFA 1HG3A 3W7NA 3W83A 1TV7A 4AMAA 1L2UA 3LI0A 3K30A 1XBVA 4LVFA 4J9JA 3LERA 4UTMA 2TRSA 3CTLA 3M47A 3DFSA 2NUYA 5FF0A 3TAKA 4Y90A 1L6SA 1WQ5A 3O07A 4PODA 2DJXA 4HPJA 4Q4KA 2QCFA 3CEUA 2C14A 3UXDA 2E5DA 6TIMA 3JR2A 5KTLA 2ZRYA 5G2WA 3DH7A 5CSSA 3BW4A 3O6CA 3R12A 3L5MA 1VHCA 3MP4A 3MHGA 5HWNA 4ZQRA 3H53A 3RNDA 3HGJA 1KFKA 4TU1A 2AGKA 3DENA 2ZZ4A 3LGEA 2YFNA 2FIQA 1W5NA 2BX7A 3MP3A 4CQ9A 1WBHA 2D73A 4LW7A 4CNNA 5SWUA 1OF8A 3NO5A 5LNVA 3P84A 4XKYB 1MSSA 4BI6A 2E68A 3TKFA 4UTJA 2Y6ZA 3EWYA 3B0VC 2YCEA 3F03K 4PA8A 2RFGA 4NNCA 4O14A 4O16A 4UTTA 4GFSA 4UFLA 3UWUA 5I3GA 4AH7A 2ZBTA 3FKRA 1SQ7A 1QPRA 3TX9A 4UMAA 4HSOA 4UTHA 4IJBA 1FQ0A 3M6YA 2OMAA 3E12A 4Z0SA 4JTSA 3BLEA 4EOUA 3IVUA 3UZJA 3S1XA 4RZ6A 1W5PA 1BWLA 3MYPA 3ABSA 4DBDA 5C6MA 2XN1A 4IX0A 3L0NA 3GDMA 4DO5A 3L0KA 1WBJA 2GPTA 4MZ8A 2ZFAA 4M19A 2TMDA 2PURA 4LTSA 3L21A 3P82A 3UWWA 4GXMA 2QR6A 3MW7A 1TV5A 2QKFA 3P7YA 1JUEA 4P2VA 3CEPA 5F1VA 2OT0A 1P4CA 1Q45A 2C6QA 5AB3A 3MBFA 3GDRA 3C2FA 2FB3A 2AAMA 3VKJA 4QSHA 4NX5A 1Y0EA 2EHHA 1T99A 2GJLA 2WSYA 1W5QA 4DQWA 3S42A 5GVJA 4TIMA 4ZMGA 1FWSA 3LXAA 4MFDA 4IQLA 3G3MA 5F4WA 4KWVA 3IGXA 3OBKA 4NUWA 2AQWA 2HS6A 2VEIA 3HGRA 2QDGA 2DZSA 4WJEA 4O1CA 2NX1A 1LRQA 4A21A 3MP5A 3A22A 1ICPA 3LOTA 2GVJA 3G0XA 4NXSA 3HG2A 3M5YA 1M7OA 4JTEA 2IQTA 1PHWA 5DCEA 5H91A 3QPYA 2YFOA 4CCDA 1EUAA 1MEHA 1C8VA 4JGDA 5DY2A 4CQ8A 3UQNA 1J5TA 3S5NA 1MO0A 1A5AA 4O13A 4MJMA 2C13A 2YYTA 1P1XA 5DN1A 1FY6A 4XQ6A 3LTSA 4O11A 4N02A 1R47A 2GQAA 3TFCA 3BLFA 1H7NA 3HG4A 1IXOA 4NXKA 3MI2A 2P0OA 2ZZ6A 3D0CA 4OE7A 5D2YA 2NX3A 4GUIA 5FI8A 4U4MA 3MI3A 1B4KA 4UR7A 5C5YA 1TPFA 3BGJA 3NPVA 3BK0A 3IIVA 3ZWTA 4EIVA 3TXVA 2OT1A 3S5OA 3L68A 2O7SA 4JTJA 3NQCA 4ADUA 4KFPA 4M7TA 1OFAA 4DBEA 3LCXA 4MYXA 1SSDA 4ZL1A 2P1FA 4YCOA 2J9ZA 4CLMA 3NPXA 5TIMA 1SZFA 4K37A 4E0CA 5D38A 3PG8A 3T55A 3V75A 1NVMA 1OK4A 2VFIA 2EKCA 3KFTA 3EWWA 2DP3A 4O50A 3P80A 1JUBA 3LRKA 2FDSA 4U28A 1GT8A 1Z42A 1A50A 2QJGA 2A7PA 4HHPA 1W5OA 1OFEA 4UTKA 2CLKA 3W7PA 4E38A 3CM4A 4NJHA 4FNPA 2H8XA 1G67A 3Q2DA 5FEWA 3IVSA 1TRDA 2VXNA 3R8RA 4LC8A 2DZWA 4QM1A 2HMCA 4N4QA 1XCFA 2C18A 3TC6A 3W9ZA 2CLEA 1OX6A 3BG3A 4G1KA 1MEIA 5LHFA 1R2RA 4M7SA 4OQVA 5E0KA 3TCEA 2GQ9A 3UPBA 2ZZ2A 4PC8A 7TIMA 3HG5A 4RX0A 2V30A 1TPDA 2QUTA 5LHEA 4TR9A 1Z48A 1KTBA 4L4MA 5I3FA 1YLVA 4PFMA 5IBXA 3W85A 4O12A 3SZ8A 3A21A 3O6YX 4UFHA 3GXPA 3G8RA 3EX2A 5BRBA 3GZ3A 1WA3A 1BTMA 1E51A 3RFAA 2ZZ1A 2CFFA 4DEFA 4UNLA 1EP3A 3SSJA 1UASA 3IGUA 4NJKA 3NQ8A 2ZRXA 1DBTA 5EA9A 3CU2A 3ABQA 3TJXA 3ABOA 4ONVA 5DELA 3KAOA 1ZAHA 3W7LA 4D2JA 3I68A 4YWIA 2YW3A 3PY2A 2ZZ3A 3G1XA 4BI5A 1WOBA 5LNUA 4L4LA 2QCDA 4JS3A 2DZXA 1ZAJA 4XTIA 4K38A 2Z6JA 5D30A 3L9CA 4XBSA 4S1FA 3NDOA 1SW7A 1Z41A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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