4QR3A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 44
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr3A01
4QSQA 4ZW1A 4E96A 5HFRA 3U5KA 5EWDA 5I40A 5E0RA 4KCXA 5DFDA 3MQMA 4ZQLA 5FH8A 5FE6A 4NYXA 2I7KA 3SVGA 5DW1A 3LQIA 3HMHA 5F63A 4IORA 4C67A 4YABA 2DATA 3U5MA 4QC1A 5A81A 5KTXA 4Z1QA 5FB0A 2F6NA 3UV4A 2RFJA 5D0CA 5F1HA 4Z1SA 4YYHA 2L84A 2R0SA 5JWMA 4GPJA 4QBMA 2E3KA 5L8TA 3U5OA 2R10A 2YYNA 2H60A 4ALGA 4KV1A 5DLXA 5EPBA 4Z93A 2RI7A 5HFQA 4N3WA 4IR6A 5F3AA 4IR4A 3MXFA 5CUGA 4PKLA 3JVJA 4TS8A 5I89A 5F1LA 4UYEA 5HJCA 5C85A 3G0LA 4A9OA 5HQ7A 5K29A 5KO4A 1N72A 3HMEA 4XUAA 4IR5A 4UYFA 3Q2FA 2OSSA 4NR9A 5CQ4A 4UYFB 5ENEA 5C7NA 3U5JA 5FE9A 5CQTA 2YELA 5DKHA 5ENFA 5L98A 3ONIA 4Y03A 5ENIA 4LZSA 2G4AA 5EP7A 5IGKA 4QSVA 5D3SA 4IOOA 5F5ZA 3O34A 4QSRA 2OUOA 3IU6A 5CRZA 4O7FA 4YBSA 4YADA 5KTWA 3AADA 4UIXA 5FE1A 5E9VA 4IR3A 4NXJA 4N4FA 3LXJA 5C4QA 5ENJA 4C66A 3LJWA 4HXSA 4UYGA 4XUBA 5DX4A 5D3RA 4O7EA 5EQ1A 3U5NA 2N9GA 1E6IA 4NR7A 4Z6HA 2RO1A 5CS8A 5TCMA 3UVYA 4HBWA 4MR6A 4NUDA 4MR5A 4LZ2A 4DONA 5H1TA 5CFWA 4O7BA 5CQ3A 4HBXA 4LC2A 5FE8A 3RCWA 5FG4A 4TZ8A 2L85A 2DVSA 2DKWA 3TLPA 5KTUA 5FH7A 3P1DA 3QZSA 2E7OA 5DYUA 1WUGA 5FFYA 5TB6A 5IG6A 5ENCA 5HCLA 5LKXA 5EA1A 3K2JA 5G4SA 3UVWA 4TTEA 5EK9A 3S92A 4BHWA 4CUSA 4TYLA 5CY9A 5ETDA 4MR3A 4MEQA 2OO1A 4QSSA 5HQ5A 3D7CA 2E7NA 3P1CA 4BW1A 5A5SA 4WIVA 5DY7A 5E7DA 4CUTA 5A5RA 5HRVA 3I3JA 4MENA 3UW9A 2DWWA 4YK0A 2WP2A 5CUBA 4PCIA 4PS5A 5DKDA 4A9KA 5I1QA 4WHUA 5IGNA 5ENBA 3JVMA 5E9MA 5F25A 4HXKA 3LQJA 4ALHA 4HBVA 5HLSA 4YYJA 2DVRA 3O36A 4UIZA 5FFVA 4J0RA 3UVXA 4TT2A 4NRCA 5HENA 4YYIA 3NXBA 3G0JA 5L97A 5A5OA 4NR6A 4NYWA 5CQAA 4QUTA 5E74A 5FB1A 4YYGA 4RVRA 2RS9B 4CUQA 2R0VA 5BT3A 5EPSA 5LKUA 4HXOA 5CZGA 5DKCA 3FKMX 4QNSA 4YAXA 4J3IA 5IBNA 4NR5A 3U5LA 4UIVA 4O78A 4QR4A 2NXBA 3SVHA 5A5QA 5J0DA 4A9MA 5HM0A 5DYCA 4TQNA 5CRMA 4CLBA 4BW4A 3HMFA 4UIUA 3DAIA 3O35A 5AD3A 4CURA 5ACYA 4TU6A 2YW5A 4A9LA 5EM3A 5G4RA 5LVQA 4A9IA 5D3LA 3QZTA 4CUUA 2KTBB 4HXMA 5EU1A 2DVQA 5LJ1A 5E73A 5EICA 2GRCA 5EWCA 5HQ6A 4O77A 4LYSA 4NUCA 5E9LA 5D3PA 4NUEA 4NQMA 4BJXA 3MB4A 5A83A 2RNWA 5CUAA 4YH3A 4QY4A 4XYAA 4LDFA 4QSPA 4PY6A 5A82A 4FLPA 3S91A 4BW3A 4CUPA 5AMEA 5I86A 4QZSA 4OGIA 1F68A 3P1EA 4QSTA 5CUCA 5FG6A 3UVDA 5DFBA 4NR8A 4MR4A 3MULA 5H1VA 3AQAA 3O33A 3JVLA 4A9FA 5H85A 5F61A 2YEKA 4HXPA 5D3JA 2RNXA 5DW2A 5I29A 5F62A 4QYDA 4O75A 5D3NA 4F3IA 5I7YA 2RNYA 5EWVA 5CGPA 5FE7A 3U5PA 2F6JA 3P5OA 3UV5A 5CQ7A 5EPRA 4NR4A 5EI4A 4QEWA 5HRWA 4TT4A 3SVFA 5CUEA 4QUUA 4MEOA 2FSAA 4HXLA 4O7AA 4NS5A 4QR3A 4O70A 4PCEA 4AKNA 4WHWA 3O37A 2LSPB 4YYNA 4J1PA 4Z6IA 5I83A 3MUKA 4LYIA 5FH6A 4KV4A 5I80A 5D3TA 5ETBA 4QEVA 1ZS5A 5FG5A 5H1UA 5II2A 4UYHA 4NQNA 2R0YA 2D9EA 5F60A 4A9JA 5LKTA 3JVKA 5IGMA 3Q2EA 4N4IA 4YYMA 4HXNA 5E9KA 4YATA 4YY6A 4QSUA 5F2PA 5AMFA 5DFCA 3P1FA 5ENGA 5E3DA 2YDWA 4O71A 4YY4A 4QYLA 5FBXA 5FDZA 4O74A 4YBTA 5CUDA 5DYAA 4CFLA 4QEUA 5AD2A 5II1A 5L8UA 5CP5A 4MEPA 5D3HA 4A9EA 5DBMA 4LZRA 2I8NA 2YEMA 5CQ8A 5HEMA 1X0JA 4X2IA 5EVAA 4QSXA 4LR6A 4YYDA 2D82A 4NRAA 5FE2A 2MJVB 4Q0OA 5D7XA 5LUUA 4TU4A 4PTBA 5FFWA 4N4GA 5BT5A 4CFKA 4UITA 5D24A 4J0SA 4HXRA 4UYDA 4CL9A 4QC3A 5LKZA 5EISA 3QZVA 4UIYA 5F36A 5A85A 1JM4B 1WUMA 5E9IA 5E9YA 4A9HA 5KU3A 4O72A 5ENHA 5E3GA 4YBMA 4YC9A 3DWYA 5CQ6A 5EV9A 4YYKA 3GG3A 5LJ2A 5EWHA 5CQ5A 5A5NA 4N4HA 3LQHA 5COIA 5IGLA 4QSWA 4OUFA 5D26A 5DYXA 5C87A 2WP1A 4LRGA 4TZ2A 4XY9A 5CPEA 4OGJA 2L5EA 4HBYA 4QR5A 4ZC9A 5BT4A 5FE0A 3UV2A 5FE3A 5IIDA 5FE5A 5LJ0A 4UIWA 5DLZA 5FE4A 2DVVA 4O76A 5HRXA 5JI8A 5I88A 4A9NA 1JSPB 4BW2A 4XY8A 5A7CA 5C89A 4NYVA 4TT6A 5D25A 5EGUA 3MB3A 5C8GA 4LYWA 4O7CA 5KHMA 5I7XA 5LVRA 4YH4A 4NRBA 5HELA 5CU8A 4QB3A 5EWWA 2YQDA 5L96A 3ZYUA 3IU5A 5A5PA 5L99A 5CTLA 4IOQA 4Q0NA 1EQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSQA 4ZW1A 4E96A 5HFRA 3U5KA 5EWDA 5I40A 5E0RA 4KCXA 5DFDA 3MQMA 4ZQLA 5FH8A 5FE6A 4NYXA 2I7KA 3SVGA 4AI6A 5DW1A 3LQIA 3HMHA 5F63A 4IORA 4C67A 4YABA 2DATA 3U5MA 4QC1A 5A81A 5KTXA 4Z1QA 5FB0A 2F6NA 3UV4A 2RFJA 5D0CA 5F1HA 4Z1SA 4YYHA 2L84A 2R0SA 5JWMA 4GPJA 4QBMA 2E3KA 5L8TA 3U5OA 2R10A 2YYNA 2H60A 4ALGA 4KV1A 3ERRA 5DLXA 4AKGA 5EPBA 4Z93A 2RI7A 5HFQA 4N3WA 4IR6A 5F3AA 4IR4A 3MXFA 5CUGA 4PKLA 3JVJA 4TS8A 5I89A 5F1LA 4UYEA 5HJCA 5C85A 3G0LA 4A9OA 5HQ7A 5K29A 5KO4A 1N72A 3HMEA 4XUAA 4IR5A 4UYFA 3Q2FA 2OSSA 4NR9A 5CQ4A 4UYFB 5ENEA 5C7NA 3U5JA 5FE9A 5CQTA 2YELA 5DKHA 5ENFA 5L98A 3ONIA 4Y03A 5ENIA 4LZSA 2G4AA 5EP7A 5IGKA 4QSVA 5D3SA 4IOOA 5F5ZA 3O34A 4QSRA 2OUOA 3IU6A 5CRZA 4O7FA 4YBSA 4YADA 5KTWA 3AADA 4UIXA 5FE1A 5E9VA 4IR3A 4NXJA 4N4FA 3LXJA 5C4QA 5ENJA 4C66A 3LJWA 4HXSA 4UYGA 4XUBA 5DX4A 5D3RA 4O7EA 5EQ1A 3U5NA 2N9GA 1E6IA 4NR7A 4Z6HA 2RO1A 5CS8A 5TCMA 3UVYA 4HBWA 4MR6A 4NUDA 4MR5A 4LZ2A 4DONA 5H1TA 5CFWA 4O7BA 5CQ3A 4HBXA 4LC2A 5FE8A 3RCWA 5FG4A 4TZ8A 2L85A 2DVSA 2DKWA 3TLPA 5KTUA 5FH7A 3P1DA 3QZSA 2E7OA 5DYUA 1WUGA 5FFYA 5TB6A 5IG6A 5ENCA 5HCLA 5LKXA 5EA1A 3K2JA 5G4SA 3UVWA 4TTEA 5EK9A 3S92A 4BHWA 4CUSA 4TYLA 5CY9A 5ETDA 4MR3A 4MEQA 2OO1A 4QSSA 5HQ5A 3D7CA 2E7NA 3P1CA 4BW1A 5A5SA 4WIVA 5DY7A 5E7DA 4CUTA 5A5RA 5HRVA 3I3JA 4MENA 3UW9A 2DWWA 4YK0A 2WP2A 5CUBA 4PCIA 4PS5A 5DKDA 4A9KA 5I1QA 4WHUA 5IGNA 5ENBA 3JVMA 5E9MA 5F25A 4HXKA 3LQJA 4ALHA 4HBVA 5HLSA 4YYJA 2DVRA 3O36A 4UIZA 5FFVA 4J0RA 3UVXA 4TT2A 4NRCA 5HENA 4YYIA 3NXBA 3G0JA 5L97A 5A5OA 4NR6A 4NYWA 5CQAA 4QUTA 5E74A 5FB1A 4YYGA 1PUOA 4RVRA 2RS9B 4CUQA 2R0VA 5BT3A 5EPSA 5LKUA 4HXOA 5CZGA 5DKCA 3FKMX 4QNSA 4YAXA 3VKHA 4J3IA 5IBNA 4NR5A 3U5LA 4UIVA 4O78A 4QR4A 2NXBA 3SVHA 5A5QA 5J0DA 4A9MA 5HM0A 2EJNA 5DYCA 4TQNA 5CRMA 4CLBA 4BW4A 3HMFA 4UIUA 3DAIA 3O35A 5AD3A 4CURA 5ACYA 4TU6A 2YW5A 4A9LA 5EM3A 5G4RA 5LVQA 4A9IA 5D3LA 3QZTA 4CUUA 2KTBB 4HXMA 5EU1A 2DVQA 5LJ1A 5E73A 5EICA 2GRCA 5EWCA 5HQ6A 4O77A 4LYSA 4NUCA 5E9LA 5D3PA 4NUEA 4NQMA 4BJXA 3MB4A 5A83A 2RNWA 5CUAA 4YH3A 4QY4A 4XYAA 4LDFA 4QSPA 4PY6A 5A82A 4FLPA 3S91A 4BW3A 4CUPA 5AMEA 5I86A 4QZSA 4OGIA 1F68A 3P1EA 4QSTA 5CUCA 5FG6A 3UVDA 5DFBA 4NR8A 4MR4A 3MULA 5H1VA 4AKHA 3AQAA 3O33A 3JVLA 4A9FA 5H85A 5F61A 2YEKA 4HXPA 5D3JA 2RNXA 4AKIA 1ZKRA 5DW2A 5I29A 5F62A 4QYDA 4O75A 5D3NA 4F3IA 5I7YA 2RNYA 5EWVA 5CGPA 5FE7A 3U5PA 2F6JA 3P5OA 3UV5A 5CQ7A 5EPRA 4NR4A 5EI4A 4QEWA 5HRWA 4TT4A 3SVFA 5CUEA 4QUUA 4MEOA 2FSAA 4HXLA 4O7AA 4NS5A 4QR3A 4O70A 4PCEA 4AKNA 4WHWA 3O37A 2LSPB 4YYNA 4J1PA 4Z6IA 5I83A 3MUKA 4LYIA 5FH6A 4KV4A 5I80A 5D3TA 5ETBA 4QEVA 1ZS5A 5FG5A 5H1UA 5II2A 4UYHA 4NQNA 2R0YA 2D9EA 5F60A 4A9JA 5LKTA 3JVKA 5IGMA 3Q2EA 4N4IA 4YYMA 4HXNA 5E9KA 4YATA 4YY6A 4QSUA 5F2PA 5AMFA 5DFCA 3P1FA 5ENGA 5E3DA 2YDWA 4O71A 4YY4A 4QYLA 5FBXA 5FDZA 4O74A 4YBTA 5CUDA 5DYAA 4CFLA 4QEUA 5AD2A 5II1A 3VKGA 5L8UA 5CP5A 4MEPA 5D3HA 4A9EA 5DBMA 4LZRA 2I8NA 2YEMA 5CQ8A 5HEMA 1X0JA 4X2IA 5EVAA 4QSXA 4LR6A 4YYDA 2D82A 4NRAA 3D1DA 5FE2A 2MJVB 4Q0OA 3D1BA 5D7XA 5LUUA 4TU4A 4PTBA 5FFWA 4N4GA 5BT5A 4CFKA 4UITA 5D24A 4J0SA 4HXRA 4UYDA 4CL9A 4QC3A 5LKZA 5EISA 3QZVA 4UIYA 5F36A 5A85A 1JM4B 1WUMA 5E9IA 5E9YA 4A9HA 5KU3A 4O72A 5ENHA 5E3GA 4YBMA 4YC9A 3DWYA 5CQ6A 5EV9A 4YYKA 3GG3A 5LJ2A 5EWHA 5CQ5A 5A5NA 4N4HA 3LQHA 5COIA 5IGLA 4QSWA 4OUFA 5D26A 5DYXA 5C87A 2WP1A 4LRGA 4TZ2A 4XY9A 5CPEA 4OGJA 2L5EA 4HBYA 4QR5A 4ZC9A 5BT4A 5FE0A 3UV2A 5FE3A 5IIDA 5FE5A 5LJ0A 4UIWA 5DLZA 5FE4A 2DVVA 4O76A 5HRXA 5JI8A 5I88A 4A9NA 1JSPB 4BW2A 4XY8A 5A7CA 5C89A 4NYVA 4TT6A 5D25A 5EGUA 3MB3A 5C8GA 4LYWA 4O7CA 5KHMA 5I7XA 5LVRA 4YH4A 4NRBA 5HELA 5CU8A 4QB3A 5EWWA 2YQDA 5L96A 3ZYUA 3IU5A 5A5PA 5L99A 5CTLA 4IOQA 4Q0NA 1EQFA
chains in the Genus database with same CATH topology
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