4QR3A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 44
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr3A01
4NQMA 2RO1A 5JI8A 4J3IA 5LJ2A 2LSPB 5C89A 4NUCA 3O34A 3UVDA 5A81A 4QEUA 5II1A 4MR6A 4NR9A 4NRCA 4QSPA 5CUEA 2L84A 4QUTA 5IGKA 5BT3A 4IR3A 4QB3A 5E9IA 2RNYA 5L96A 5CQ3A 5CZGA 3P1EA 4LZSA 5CQ5A 4LRGA 5D3NA 5EGUA 5HFRA 5I40A 2I8NA 5EQ1A 5D3TA 5CQTA 5H1TA 5ENCA 5EWVA 5EWHA 5KO4A 5L8UA 2YEMA 4IOQA 1ZS5A 5H85A 4QBMA 5F36A 4TU4A 5EICA 5A83A 2YW5A 5DBMA 2N9GA 5DY7A 1E6IA 4NR8A 5L97A 5CUBA 3AQAA 5I7YA 5I89A 3I3JA 5FE7A 2YDWA 4TZ8A 3UV4A 2KTBB 5LVQA 5E3DA 2OSSA 2H60A 4A9MA 5EK9A 5E74A 5HQ7A 5AMEA 3LXJA 4Q0OA 3UVWA 4A9HA 5DX4A 4YY6A 4QR3A 4CFKA 4KV1A 4QSXA 5CPEA 5II2A 5FE2A 4QZSA 5F63A 5LJ1A 4NR7A 3P1CA 4DONA 4CL9A 5KTXA 4A9FA 4C67A 5ENJA 5D24A 4CUSA 5IG6A 4NUDA 3LJWA 2DATA 4TZ2A 3LQIA 5FB0A 5FDZA 2F6JA 2I7KA 4YK0A 4QSUA 5FFYA 4TT2A 4A9OA 5E9KA 5CY9A 4Z1SA 4IR4A 4YYMA 4UIUA 4YYJA 4XUBA 4HXMA 4CUUA 3U5OA 4HBWA 5ENIA 3HMEA 2WP2A 3LQJA 4Y03A 4YC9A 4NR5A 3JVLA 5AD2A 2OUOA 5C4QA 1JSPB 5D3HA 4UYFB 5A5PA 5C8GA 5F61A 5C87A 5I83A 5A5RA 4NR4A 5CUDA 3ONIA 5HJCA 5KHMA 4HBXA 4TQNA 4PCEA 2R0VA 3GG3A 4N4IA 4Z93A 2YEKA 1X0JA 5ENGA 4YATA 5DYXA 5E9MA 5TB6A 5I7XA 4LDFA 4NXJA 4LZ2A 3U5MA 4BW2A 4QC3A 5F2PA 4YBTA 3U5LA 5AD3A 4O7FA 5LKZA 3Q2EA 2E7OA 5E9YA 4QY4A 4LC2A 5CS8A 2L5EA 5DYUA 4QEVA 5F62A 5A82A 5D0CA 5DYAA 4BJXA 4O7AA 3UVYA 4PKLA 2D82A 4MEPA 4J0SA 5CP5A 5KTWA 2RI7A 4NYWA 4QSWA 4YH4A 4HXRA 2L85A 4UIYA 5DKHA 3SVHA 4HXNA 4IOOA 5ENEA 5H1VA 4YYHA 5E9VA 4HXPA 4UIZA 4PCIA 5LKTA 4XUAA 3P1FA 3DWYA 3ZYUA 2R0SA 4Z6HA 5G4SA 4RVRA 5CFWA 4TT6A 5J0DA 4O71A 5HLSA 4YADA 4J0RA 5A5NA 5C7NA 2E3KA 4N3WA 2WP1A 5DFBA 4CUPA 5CGPA 4YY4A 5L8TA 4BHWA 5FE3A 4Z6IA 5ENFA 2G4AA 4ZW1A 4MEQA 4O72A 5DYCA 4BW3A 5D7XA 4KCXA 4YABA 3QZVA 3QZTA 3S91A 5D3PA 5D26A 3O33A 4O78A 4F3IA 5DW2A 3MULA 5D25A 4MENA 5CRZA 3AADA 1EQFA 5CQ8A 5FE9A 4TS8A 5A5QA 4YH3A 4HBYA 1JM4B 2R10A 3HMHA 4J1PA 4CLBA 3RCWA 4CUQA 5F5ZA 3U5NA 5A85A 5A5SA 5CUAA 4BW4A 3MQMA 5DW1A 4CURA 4HXKA 3TLPA 3JVJA 5CTLA 5EWWA 5FE4A 4TU6A 3JVKA 2DVRA 4IR6A 5ENBA 5E0RA 3DAIA 4WHWA 5E9LA 5F60A 4O76A 5COIA 4OUFA 4MR4A 4UITA 4HBVA 5IGNA 5DLXA 2DKWA 4NRAA 4A9EA 4KV4A 5KU3A 4QSTA 3P5OA 5CU8A 5G4RA 2DVVA 4WHUA 5FG6A 2OO1A 4QSVA 5HENA 4HXSA 3G0LA 4HXLA 5I88A 5EPBA 4QR5A 2D9EA 4UYEA 4ZC9A 5EPRA 4UIWA 5LJ0A 3O37A 4LYSA 2MJVB 3O36A 4OGIA 5CQ4A 4XY8A 4XYAA 4NYVA 3D7CA 4O7BA 4QEWA 4LZRA 4O7EA 5DLZA 4QNSA 4NYXA 4YYKA 2FSAA 4AKNA 4A9IA 4ALGA 4IR5A 4LYWA 5IGLA 5EM3A 5E3GA 5EISA 4PS5A 4E96A 4N4GA 5DKDA 2DVSA 4QSRA 4YYGA 4O70A 4YBSA 5FFWA 2F6NA 4MEOA 4UYDA 4PY6A 3MUKA 2R0YA 5EV9A 5LUUA 5FG4A 5FBXA 4LYIA 5ETBA 5HCLA 4NUEA 3Q2FA 5CQ6A 5HRXA 4Q0NA 5ETDA 5F3AA 4A9JA 5D3RA 5HFQA 5E73A 5F1LA 3UV5A 3SVGA 3SVFA 4TT4A 5HM0A 3UVXA 5FE6A 5AMFA 3LQHA 4MR5A 5DFDA 4XY9A 5CUGA 5IIDA 3JVMA 5F25A 5JWMA 5FE1A 5L98A 4MR3A 5IGMA 4HXOA 5A7CA 4QSSA 4YAXA 4O77A 2YELA 5CRMA 2GRCA 2RNXA 5IBNA 1WUMA 5EWDA 4QC1A 5HEMA 3UV2A 5EP7A 4NQNA 4YBMA 5FG5A 5LVRA 4TYLA 4PTBA 4FLPA 5KTUA 5CUCA 4UIVA 5DKCA 5I80A 5EA1A 3G0JA 4UYGA 5F1HA 4LR6A 5EVAA 5ACYA 5LKUA 2YYNA 5C85A 4O74A 5FE5A 5FE8A 4A9NA 4N4HA 5EPSA 3U5JA 5FE0A 5I86A 4YYDA 5CQ7A 5D3JA 4QUUA 2RS9B 4N4FA 5L99A 4NR6A 5FH6A 5EI4A 4ALHA 4O75A 4GPJA 5CQAA 4ZQLA 5E7DA 5K29A 4UIXA 5HQ5A 5BT5A 3FKMX 2NXBA 4QYLA 4QR4A 3IU6A 5HQ6A 5D3LA 4BW1A 4C66A 2RNWA 3P1DA 5BT4A 2YQDA 4OGJA 4UYFA 5HRVA 5EWCA 5FFVA 4IORA 2RFJA 4WIVA 5D3SA 4X2IA 2DVQA 2DWWA 5DFCA 4NS5A 5I1QA 3U5KA 3MB3A 1WUGA 3UW9A 4UYHA 4QSQA 1F68A 4A9LA 1N72A 3HMFA 3S92A 5TCMA 3O35A 3MXFA 4NRBA 3IU5A 5I29A 4YYIA 4TTEA 5EU1A 5ENHA 4CFLA 5FH7A 5HELA 5FB1A 4YYNA 3MB4A 4CUTA 4QYDA 4A9KA 3K2JA 3QZSA 4O7CA 5HRWA 3U5PA 5H1UA 5FH8A 4Z1QA 5A5OA 3NXBA 2E7NA 5LKXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NQMA 2RO1A 5JI8A 4J3IA 5LJ2A 2LSPB 5C89A 4NUCA 3O34A 3UVDA 5A81A 4QEUA 5II1A 4MR6A 4NR9A 4NRCA 4QSPA 3D1BA 5CUEA 2L84A 4QUTA 5IGKA 5BT3A 4IR3A 4QB3A 5E9IA 2RNYA 5L96A 5CQ3A 5CZGA 3P1EA 4LZSA 5CQ5A 4LRGA 5D3NA 5EGUA 5HFRA 5I40A 2I8NA 5EQ1A 5D3TA 5CQTA 5H1TA 5ENCA 5EWVA 5EWHA 5KO4A 5L8UA 2YEMA 4IOQA 1ZS5A 5H85A 4QBMA 5F36A 4TU4A 5EICA 5A83A 2YW5A 5DBMA 2N9GA 5DY7A 1E6IA 4NR8A 5L97A 5CUBA 3AQAA 5I7YA 5I89A 3I3JA 5FE7A 2YDWA 4AKGA 4TZ8A 3UV4A 2KTBB 5LVQA 5E3DA 2OSSA 3VKGA 2H60A 4A9MA 5EK9A 3ERRA 5E74A 5HQ7A 5AMEA 3LXJA 4Q0OA 3UVWA 4A9HA 5DX4A 4YY6A 4QR3A 4CFKA 4KV1A 4QSXA 5CPEA 5II2A 5FE2A 4QZSA 5F63A 5LJ1A 4NR7A 3P1CA 4DONA 4CL9A 5KTXA 4A9FA 4C67A 5ENJA 5D24A 4CUSA 5IG6A 4NUDA 3LJWA 2DATA 4TZ2A 3LQIA 5FB0A 5FDZA 2F6JA 2I7KA 4YK0A 4QSUA 5FFYA 4TT2A 4A9OA 5E9KA 5CY9A 4Z1SA 4IR4A 4YYMA 4UIUA 4YYJA 4XUBA 4HXMA 4CUUA 3U5OA 4HBWA 5ENIA 3HMEA 2WP2A 3LQJA 3VKHA 4Y03A 4YC9A 4NR5A 3JVLA 5AD2A 2OUOA 5C4QA 1JSPB 5D3HA 4UYFB 5A5PA 5C8GA 5F61A 5C87A 5I83A 5A5RA 4NR4A 5CUDA 3ONIA 5HJCA 5KHMA 4HBXA 4TQNA 4PCEA 2R0VA 3GG3A 4N4IA 4Z93A 2YEKA 1X0JA 5ENGA 4YATA 5DYXA 5E9MA 5TB6A 5I7XA 4LDFA 4NXJA 4LZ2A 3U5MA 4BW2A 4QC3A 4AKHA 5F2PA 4YBTA 3U5LA 5AD3A 4O7FA 5LKZA 3Q2EA 2E7OA 5E9YA 4QY4A 4LC2A 5CS8A 2L5EA 5DYUA 4QEVA 5F62A 5A82A 5D0CA 5DYAA 4BJXA 4O7AA 3UVYA 4PKLA 2D82A 4MEPA 4J0SA 5CP5A 5KTWA 2RI7A 4NYWA 4QSWA 4AI6A 4YH4A 4HXRA 2L85A 4UIYA 5DKHA 3SVHA 4HXNA 4IOOA 5ENEA 5H1VA 4YYHA 5E9VA 4HXPA 4UIZA 4PCIA 5LKTA 4XUAA 3P1FA 3DWYA 3ZYUA 2R0SA 4Z6HA 5G4SA 4RVRA 5CFWA 4TT6A 5J0DA 4O71A 5HLSA 4YADA 3D1DA 4J0RA 5A5NA 5C7NA 2E3KA 4N3WA 2WP1A 5DFBA 4CUPA 5CGPA 4YY4A 5L8TA 4BHWA 5FE3A 4Z6IA 5ENFA 2G4AA 4ZW1A 4MEQA 4O72A 5DYCA 4BW3A 5D7XA 4KCXA 4YABA 3QZVA 3QZTA 3S91A 5D3PA 5D26A 3O33A 4O78A 4F3IA 5DW2A 3MULA 5D25A 4MENA 5CRZA 3AADA 1EQFA 5CQ8A 5FE9A 4TS8A 5A5QA 4YH3A 4HBYA 1JM4B 2R10A 3HMHA 4J1PA 4CLBA 3RCWA 4CUQA 5F5ZA 3U5NA 5A85A 5A5SA 5CUAA 4BW4A 3MQMA 5DW1A 4CURA 4HXKA 3TLPA 3JVJA 5CTLA 5EWWA 5FE4A 4TU6A 3JVKA 2DVRA 4IR6A 5ENBA 5E0RA 3DAIA 4WHWA 5E9LA 5F60A 4O76A 5COIA 4OUFA 4MR4A 4UITA 4HBVA 5IGNA 5DLXA 2DKWA 4NRAA 4A9EA 4KV4A 5KU3A 4QSTA 3P5OA 5CU8A 5G4RA 2DVVA 4WHUA 5FG6A 2OO1A 4QSVA 5HENA 4HXSA 3G0LA 4HXLA 5I88A 5EPBA 4QR5A 2D9EA 4UYEA 4ZC9A 5EPRA 4UIWA 5LJ0A 3O37A 4LYSA 2MJVB 3O36A 4OGIA 5CQ4A 4XY8A 4XYAA 4NYVA 3D7CA 4O7BA 4QEWA 4LZRA 4O7EA 5DLZA 4QNSA 4NYXA 4YYKA 2FSAA 4AKNA 4A9IA 4ALGA 4IR5A 4LYWA 5IGLA 5EM3A 5E3GA 5EISA 4PS5A 4E96A 4N4GA 5DKDA 2DVSA 4QSRA 4YYGA 4O70A 4YBSA 5FFWA 2F6NA 4MEOA 4UYDA 4PY6A 3MUKA 2R0YA 5EV9A 5LUUA 5FG4A 5FBXA 4LYIA 5ETBA 5HCLA 4NUEA 3Q2FA 5CQ6A 5HRXA 4Q0NA 5ETDA 5F3AA 4A9JA 5D3RA 5HFQA 5E73A 5F1LA 3UV5A 3SVGA 3SVFA 4TT4A 5HM0A 3UVXA 5FE6A 5AMFA 3LQHA 4MR5A 5DFDA 4XY9A 5CUGA 5IIDA 3JVMA 5F25A 5JWMA 5FE1A 5L98A 4MR3A 5IGMA 4HXOA 5A7CA 4QSSA 4YAXA 4O77A 2YELA 5CRMA 2GRCA 2RNXA 5IBNA 1WUMA 5EWDA 4QC1A 1PUOA 1ZKRA 5HEMA 3UV2A 5EP7A 4NQNA 4YBMA 5FG5A 5LVRA 4TYLA 4PTBA 4FLPA 5KTUA 5CUCA 4UIVA 5DKCA 5I80A 5EA1A 3G0JA 4UYGA 5F1HA 4LR6A 5EVAA 5ACYA 5LKUA 2YYNA 5C85A 4O74A 5FE5A 5FE8A 4A9NA 4N4HA 2EJNA 5EPSA 3U5JA 5FE0A 5I86A 4YYDA 5CQ7A 5D3JA 4QUUA 2RS9B 4N4FA 5L99A 4NR6A 5FH6A 5EI4A 4ALHA 4O75A 4GPJA 5CQAA 4ZQLA 5E7DA 5K29A 4UIXA 5HQ5A 5BT5A 3FKMX 2NXBA 4QYLA 4QR4A 3IU6A 5HQ6A 5D3LA 4BW1A 4C66A 2RNWA 3P1DA 5BT4A 2YQDA 4OGJA 4UYFA 5HRVA 5EWCA 5FFVA 4IORA 2RFJA 4WIVA 5D3SA 4X2IA 2DVQA 2DWWA 5DFCA 4NS5A 5I1QA 3U5KA 3MB3A 1WUGA 3UW9A 4UYHA 4QSQA 1F68A 4A9LA 1N72A 3HMFA 3S92A 5TCMA 3O35A 3MXFA 4NRBA 3IU5A 5I29A 4YYIA 4TTEA 4AKIA 5EU1A 5ENHA 4CFLA 5FH7A 5HELA 5FB1A 4YYNA 3MB4A 4CUTA 4QYDA 4A9KA 3K2JA 3QZSA 4O7CA 5HRWA 3U5PA 5H1UA 5FH8A 4Z1QA 5A5OA 3NXBA 2E7NA 5LKXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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