4QR5A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr5A01
1EQFA 4TZ8A 4UIWA 4CLBA 5EVAA 3IU6A 5AD3A 5EQ1A 4BW4A 3UVWA 5DBMA 3U5MA 4YYDA 5CRMA 4QBMA 5F1LA 5DX4A 5I40A 4YYMA 3U5OA 5CUBA 4Q0OA 3D7CA 3NXBA 5LJ2A 4Z1QA 4BHWA 4UYDA 4KV4A 5CQ7A 3ONIA 4ALHA 5ENCA 5DYUA 5CFWA 5E3DA 3TLPA 3LQJA 5CRZA 5FH8A 5DFCA 5D3SA 3MQMA 2E7OA 4NR4A 4O7FA 5DYAA 5EP7A 2RS9B 5FDZA 5HRVA 2H60A 2R0SA 2RI7A 4C67A 5E3GA 2L5EA 5E0RA 4NXJA 4NR6A 4LC2A 2E7NA 4TT6A 5E9KA 2YW5A 5D3PA 2L85A 5BT3A 5LKTA 4N4FA 3UVYA 4QYLA 4NUCA 3MULA 3JVLA 5E9MA 4XYAA 4UIVA 4N3WA 4LYSA 5FE8A 4MEQA 4IR4A 5A5NA 4UIXA 3G0LA 5EM3A 4UYFA 4QR5A 4Z6IA 3DWYA 4QEVA 5IBNA 2I8NA 4WHUA 5HJCA 4QSWA 4CUQA 5E74A 4PTBA 4MR4A 4HXOA 4YYKA 3U5KA 4HBXA 2RO1A 3Q2EA 4O7EA 5CUEA 5KO4A 5DFDA 4ALGA 5E73A 4FLPA 1JM4B 2G4AA 4Z6HA 4PCEA 1E6IA 2I7KA 2N9GA 4A9OA 4MENA 4LRGA 5CQ8A 2YEMA 5F63A 5CP5A 5BT5A 4O77A 4QSUA 2DKWA 4GPJA 4BW1A 4QSQA 3AQAA 4F3IA 5E9VA 4Y03A 3QZSA 5EWVA 2R0VA 4O7BA 4ZQLA 4YY6A 3IU5A 4TT4A 5KTXA 3U5PA 1N72A 5I89A 4NUEA 5H1UA 2D9EA 3HMEA 4QSPA 3JVMA 5CPEA 4PY6A 2DATA 5F5ZA 5EPBA 4NQMA 5AMEA 5A5OA 3MB4A 4HXPA 5JI8A 2NXBA 5F3AA 4PCIA 4CUPA 3K2JA 4A9MA 5CU8A 3MUKA 5EU1A 4TU6A 4HXMA 4A9IA 3LJWA 2R0YA 4NUDA 5HM0A 4QC1A 2YDWA 5KU3A 2YEKA 4J0SA 5A7CA 4C66A 4UYEA 5HLSA 4J0RA 5CQ6A 5F62A 3MB3A 5I7XA 5ACYA 3O35A 3U5LA 4LZSA 5IGKA 5HFQA 4HBVA 2OO1A 1F68A 5D3TA 4HXSA 2GRCA 4Q0NA 5BT4A 5J0DA 4O75A 5HEMA 4NRCA 4YADA 4UIUA 5L8UA 3FKMX 4TS8A 4QSTA 4O72A 5FE7A 4HBWA 4O71A 5D24A 4CUSA 3SVGA 4YYGA 2YQDA 4LDFA 5CQAA 4TQNA 4YYJA 3QZVA 4QR4A 5DW1A 5ENFA 5LUUA 4DONA 5I88A 3UV4A 3G0JA 4A9FA 5EWDA 4QC3A 5D3RA 5HQ7A 5AMFA 5E9IA 5LVQA 4NR8A 4E96A 5FBXA 3AADA 5A83A 2MJVB 5D25A 5I1QA 5ETBA 5EWCA 4IR5A 4CUUA 5KTUA 4NR7A 4QZSA 5CQ3A 5I80A 5HFRA 5FG5A 4QR3A 5FH7A 4YABA 4QYDA 1X0JA 5ENIA 5TCMA 5FFYA 5DLXA 2RNYA 5C85A 5FB1A 3U5JA 2L84A 5CS8A 4MEPA 5DYXA 4HXNA 4YAXA 5C7NA 4UYHA 5DW2A 5ENBA 4O7AA 5G4RA 2RNWA 4XY9A 5FE9A 5L99A 4OGIA 5FE6A 5FE1A 5ENGA 5ENEA 4ZC9A 4NS5A 5DY7A 4QEUA 4KV1A 5EPSA 5FH6A 2WP2A 3HMFA 4YBSA 4TZ2A 2F6JA 3ZYUA 5A85A 3LQHA 3O37A 4UITA 4YC9A 4YYNA 4CFLA 5EV9A 4CURA 5K29A 2DVVA 3JVJA 2RNXA 4LZRA 5D3HA 5II2A 2OUOA 4UYGA 4HXKA 4QUTA 4PS5A 5H85A 2R10A 2YYNA 3UV5A 4ZW1A 4WIVA 5F60A 3LXJA 4HXLA 5I29A 5CY9A 4BW3A 5DYCA 1WUMA 4CUTA 5E9YA 5LVRA 5LJ0A 5DKCA 2KTBB 4WHWA 5G4SA 3HMHA 3O33A 4NRBA 5H1VA 5LKZA 5EI4A 5ENHA 4MR5A 5L8TA 5CQTA 4CFKA 4OGJA 4J1PA 5D3JA 5FFWA 4YBTA 5I7YA 4QEWA 5A5PA 5F61A 4QSVA 4YH4A 4O70A 4YATA 4N4IA 4NQNA 3Q2FA 1WUGA 5FFVA 4AKNA 5AD2A 5EISA 4HXRA 3MXFA 5HRXA 3GG3A 3UV2A 5CQ5A 4LYIA 4RVRA 4HBYA 4BW2A 3P5OA 5A5QA 5IGMA 5HENA 5EICA 4UIZA 4LZ2A 4UYFB 4N4GA 5ENJA 5L97A 5I83A 2DVSA 5I86A 5IIDA 5KTWA 5EWWA 4IORA 4NYVA 3S92A 4N4HA 2OSSA 3QZTA 2RFJA 4KCXA 5EA1A 5D3NA 5HQ6A 5EWHA 4J3IA 5CUGA 4QSRA 4NR9A 3UW9A 3UVDA 3S91A 4TU4A 5D26A 5A5SA 5F25A 4LR6A 4A9LA 3RCWA 5FE5A 4YY4A 5II1A 4A9KA 4A9JA 5F2PA 5DKHA 5CUCA 5A82A 4Z1SA 5D0CA 4PKLA 4QNSA 4OUFA 4CL9A 5CTLA 4QSXA 5COIA 4IR6A 2DVRA 1ZS5A 5CZGA 3SVHA 5HRWA 4YH3A 4IR3A 4O78A 4NR5A 4O7CA 4BJXA 5FE0A 5IGLA 2D82A 3P1CA 4IOOA 4O76A 5D7XA 2F6NA 4XUAA 4LYWA 5FG4A 4A9EA 5LJ1A 2DVQA 5CUDA 5ETDA 3P1EA 4TTEA 5F1HA 4XUBA 2YELA 5DFBA 4QUUA 4UIYA 5E9LA 5H1TA 5IG6A 4A9HA 5A5RA 5C89A 2LSPB 4YYIA 4XY8A 5EK9A 4X2IA 5E7DA 5IGNA 4NYXA 3UVXA 5C4QA 4O74A 5DKDA 5C87A 4NYWA 5LKXA 1JSPB 5JWMA 3JVKA 3O36A 2E3KA 5FE4A 5HCLA 4IOQA 5CQ4A 4MR3A 4NRAA 5DLZA 5LKUA 5FG6A 5A81A 5L96A 4A9NA 2WP1A 5C8GA 4TYLA 4QY4A 4QSSA 4MR6A 5FB0A 5HQ5A 5KHMA 3U5NA 2FSAA 3LQIA 5L98A 3P1DA 5HELA 4TT2A 5CUAA 3SVFA 3DAIA 4MEOA 5TB6A 4YYHA 5EGUA 4Z93A 4QB3A 5EPRA 5FE3A 4YK0A 4YBMA 5FE2A 2DWWA 3I3JA 5CGPA 3P1FA 3O34A 5D3LA 5F36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EQFA 4TZ8A 4UIWA 4CLBA 5EVAA 3IU6A 5AD3A 5EQ1A 4BW4A 3UVWA 5DBMA 2EJNA 3U5MA 5CRMA 4QBMA 4YYDA 5F1LA 5DX4A 5I40A 4YYMA 3U5OA 5CUBA 4Q0OA 3D7CA 3NXBA 5LJ2A 4Z1QA 4BHWA 4UYDA 4KV4A 5CQ7A 3ONIA 4ALHA 5ENCA 5DYUA 5CFWA 5E3DA 3TLPA 3LQJA 5CRZA 5FH8A 4AI6A 5DFCA 5D3SA 3MQMA 2E7OA 4NR4A 4O7FA 5DYAA 5EP7A 2RS9B 5FDZA 5HRVA 2H60A 2R0SA 2RI7A 4C67A 5E3GA 2L5EA 5E0RA 4NXJA 4NR6A 4LC2A 2E7NA 4TT6A 5E9KA 2YW5A 5D3PA 2L85A 5BT3A 5LKTA 4N4FA 3UVYA 4QYLA 4NUCA 3MULA 3JVLA 5E9MA 4XYAA 4UIVA 4N3WA 4LYSA 5FE8A 4MEQA 4IR4A 5A5NA 4UIXA 3G0LA 5EM3A 4UYFA 4QR5A 4Z6IA 3DWYA 4QEVA 5IBNA 2I8NA 4WHUA 5HJCA 4QSWA 4CUQA 5E74A 4PTBA 4MR4A 4HXOA 4YYKA 3U5KA 4HBXA 2RO1A 3Q2EA 4O7EA 5CUEA 5KO4A 5DFDA 4ALGA 5E73A 4FLPA 1JM4B 2G4AA 4Z6HA 4PCEA 1E6IA 2I7KA 2N9GA 4A9OA 4MENA 4LRGA 5CQ8A 2YEMA 5F63A 5CP5A 5BT5A 4O77A 4QSUA 2DKWA 4GPJA 4BW1A 4QSQA 3AQAA 4F3IA 5E9VA 4Y03A 3QZSA 5EWVA 2R0VA 4O7BA 4ZQLA 4YY6A 3IU5A 4TT4A 5KTXA 3U5PA 1N72A 5I89A 4NUEA 5H1UA 2D9EA 3HMEA 4QSPA 3JVMA 5CPEA 3ERRA 4PY6A 2DATA 5F5ZA 5EPBA 4NQMA 5AMEA 5A5OA 3MB4A 4HXPA 3D1BA 5JI8A 2NXBA 5F3AA 4PCIA 4CUPA 3K2JA 4A9MA 5CU8A 3MUKA 5EU1A 4TU6A 4HXMA 4A9IA 3LJWA 2R0YA 4NUDA 5HM0A 4QC1A 2YDWA 5KU3A 2YEKA 4J0SA 5A7CA 4C66A 4UYEA 5HLSA 4J0RA 5CQ6A 5F62A 3MB3A 5I7XA 5ACYA 3O35A 3U5LA 4LZSA 5IGKA 5HFQA 4HBVA 2OO1A 1F68A 5D3TA 4HXSA 2GRCA 4Q0NA 5BT4A 5J0DA 4O75A 5HEMA 4NRCA 4YADA 4UIUA 5L8UA 3FKMX 4TS8A 4AKGA 4QSTA 4O72A 5FE7A 4HBWA 4O71A 5D24A 4CUSA 3SVGA 4YYGA 2YQDA 4LDFA 5CQAA 4TQNA 4YYJA 3QZVA 4QR4A 5DW1A 5ENFA 5LUUA 4DONA 5I88A 3UV4A 3G0JA 4A9FA 5EWDA 4QC3A 5D3RA 5HQ7A 5AMFA 5E9IA 5LVQA 4NR8A 4E96A 5FBXA 3AADA 5A83A 2MJVB 5D25A 5I1QA 5ETBA 5EWCA 4IR5A 4CUUA 5KTUA 4NR7A 4QZSA 5CQ3A 5I80A 5HFRA 5FG5A 4QR3A 5FH7A 4YABA 4QYDA 1X0JA 5ENIA 5TCMA 5FFYA 5DLXA 2RNYA 5C85A 5FB1A 3U5JA 2L84A 5CS8A 4MEPA 5DYXA 4HXNA 4YAXA 5C7NA 4UYHA 5DW2A 5ENBA 4O7AA 5G4RA 2RNWA 4XY9A 5FE9A 5L99A 4OGIA 5FE6A 5FE1A 5ENGA 5ENEA 4ZC9A 4NS5A 5DY7A 4QEUA 4KV1A 5EPSA 5FH6A 2WP2A 3HMFA 4YBSA 4TZ2A 1ZKRA 4AKIA 2F6JA 3ZYUA 5A85A 3LQHA 3O37A 4UITA 4YC9A 4YYNA 4CFLA 5EV9A 4CURA 5K29A 2DVVA 3JVJA 2RNXA 4LZRA 5D3HA 5II2A 2OUOA 4UYGA 4HXKA 4QUTA 4PS5A 5H85A 2R10A 2YYNA 3UV5A 4ZW1A 4WIVA 5F60A 3LXJA 4HXLA 5I29A 5CY9A 4BW3A 5DYCA 1WUMA 4CUTA 5E9YA 5LVRA 5LJ0A 5DKCA 2KTBB 4WHWA 5G4SA 3HMHA 3O33A 4AKHA 4NRBA 5H1VA 5LKZA 5EI4A 5ENHA 4MR5A 5L8TA 5CQTA 4CFKA 4OGJA 4J1PA 5D3JA 5FFWA 4YBTA 5I7YA 4QEWA 5A5PA 5F61A 4QSVA 4YH4A 4O70A 4YATA 4N4IA 4NQNA 3Q2FA 1WUGA 5FFVA 4AKNA 5AD2A 5EISA 4HXRA 3MXFA 5HRXA 3GG3A 3UV2A 5CQ5A 4LYIA 4RVRA 4HBYA 4BW2A 3P5OA 5A5QA 5IGMA 5HENA 5EICA 4UIZA 4LZ2A 4UYFB 4N4GA 5ENJA 5L97A 5I83A 2DVSA 5I86A 5IIDA 5KTWA 5EWWA 4IORA 4NYVA 3S92A 4N4HA 2OSSA 3QZTA 2RFJA 4KCXA 5EA1A 5D3NA 5HQ6A 5EWHA 4J3IA 5CUGA 4QSRA 4NR9A 3D1DA 3UW9A 3UVDA 3S91A 4TU4A 5D26A 5A5SA 5F25A 4LR6A 4A9LA 3RCWA 5FE5A 4YY4A 5II1A 4A9KA 4A9JA 5F2PA 5DKHA 5CUCA 5A82A 4Z1SA 5D0CA 4PKLA 4QNSA 4OUFA 4CL9A 5CTLA 4QSXA 5COIA 4IR6A 2DVRA 1ZS5A 5CZGA 3SVHA 5HRWA 4YH3A 4IR3A 4O78A 4NR5A 4O7CA 4BJXA 5FE0A 5IGLA 2D82A 3P1CA 4IOOA 4O76A 5D7XA 2F6NA 4XUAA 4LYWA 5FG4A 4A9EA 5LJ1A 2DVQA 5CUDA 5ETDA 1PUOA 3P1EA 4TTEA 5F1HA 4XUBA 2YELA 5DFBA 4QUUA 4UIYA 5E9LA 5H1TA 5IG6A 4A9HA 5A5RA 5C89A 3VKGA 2LSPB 4YYIA 4XY8A 5EK9A 4X2IA 5E7DA 5IGNA 4NYXA 3UVXA 5C4QA 4O74A 5DKDA 5C87A 4NYWA 5LKXA 1JSPB 5JWMA 3JVKA 3O36A 2E3KA 5FE4A 5HCLA 4IOQA 3VKHA 5CQ4A 4MR3A 4NRAA 5DLZA 5LKUA 5FG6A 5A81A 5L96A 4A9NA 2WP1A 5C8GA 4TYLA 4QY4A 4QSSA 4MR6A 5FB0A 5HQ5A 5KHMA 3U5NA 2FSAA 3LQIA 5L98A 3P1DA 5HELA 4TT2A 5CUAA 3SVFA 3DAIA 4MEOA 5TB6A 4YYHA 5EGUA 4Z93A 4QB3A 5EPRA 5FE3A 4YK0A 4YBMA 5FE2A 2DWWA 3I3JA 5CGPA 3P1FA 3O34A 5D3LA 5F36A
chains in the Genus database with same CATH topology
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