4QR5A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/transcription inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr5A01
2OO1A 2L84A 4YBMA 4O7EA 4Q0OA 2D9EA 4QUUA 4PTBA 4YAXA 3SVGA 5KO4A 3Q2FA 5H85A 4NRBA 4N4FA 4A9MA 5DFDA 5H1TA 4QR3A 5CQTA 4NR8A 5CQ3A 5H1VA 2F6JA 4BW3A 5EISA 5CQ5A 4QSTA 2RO1A 5DYXA 5HRWA 5EU1A 1EQFA 4E96A 4BJXA 3U5MA 5CUCA 5LVRA 2R0SA 5ENBA 4CUPA 4TTEA 4MR4A 4NRCA 4QC1A 5A5QA 2G4AA 1F68A 4NR5A 1JSPB 4O70A 4MR6A 3UV4A 2FSAA 4MENA 4N4IA 5E74A 4NYXA 1N72A 5EPSA 5DFCA 4N4GA 5TCMA 5CUGA 2E7OA 4LYIA 2YW5A 3NXBA 4WHWA 3IU6A 5II2A 1E6IA 2NXBA 4Y03A 5LUUA 5E3DA 4NQMA 2WP1A 5HM0A 3P1CA 4A9IA 4A9HA 5IGLA 5KTXA 4TT4A 5FFYA 4J0SA 4A9EA 5EWVA 2WP2A 4WHUA 5EQ1A 2RNYA 4UYEA 4BHWA 3JVLA 5H1UA 5C85A 5LKUA 3JVMA 4A9NA 1ZS5A 2RNWA 3LXJA 2KTBB 3S91A 4N4HA 5D3NA 5D0CA 4QSWA 5KU3A 4CURA 4QUTA 5FG6A 5I89A 4C66A 5EV9A 5KTUA 4XY8A 2R0YA 3S92A 4PKLA 4CUQA 5CY9A 2DVRA 4IR5A 4YYMA 5FE6A 5KTWA 5E9IA 4UITA 5I86A 4YYIA 5CQAA 5FE2A 4N3WA 5FE3A 5E9VA 5F25A 5I88A 3LQIA 4QBMA 4QB3A 5FB1A 4O78A 5ENCA 3UVYA 4UIUA 3G0JA 5ENFA 5A82A 5FH7A 4YYDA 5K29A 4UIZA 3FKMX 3QZSA 2N9GA 5I83A 3QZVA 3U5KA 4LYSA 2L85A 5ETBA 4IR4A 3AADA 3U5OA 3O35A 5EK9A 5E9YA 4NR9A 5CRMA 4KV4A 5HJCA 5FE0A 5EI4A 5E0RA 2YELA 4J0RA 4O72A 4Z93A 3P5OA 4YYGA 5CFWA 5HFQA 5DYCA 2R0VA 4O75A 5IGMA 5CUEA 4LDFA 5D25A 2H60A 4YBSA 4LZRA 5DFBA 3MULA 5LKTA 5ENHA 5CRZA 4TZ8A 4TU4A 5HQ7A 4PS5A 5F61A 5LKXA 5A83A 5ACYA 3GG3A 4X2IA 5EA1A 5II1A 4FLPA 5DYUA 5A5NA 2L5EA 3D7CA 4QSQA 3AQAA 3DWYA 4NR4A 5G4SA 5HCLA 4NQNA 5A7CA 5HENA 4OGJA 4QZSA 5A85A 4CFLA 2MJVB 3G0LA 3JVKA 4MEQA 5DYAA 2RFJA 3MXFA 2YDWA 4XUBA 5CQ7A 5EVAA 4GPJA 5DW2A 5ENGA 2I8NA 4HXSA 5COIA 4TYLA 3MB4A 4PY6A 5HQ5A 4QEWA 5EPRA 4QSPA 3P1FA 5JI8A 5EICA 4CL9A 5LJ0A 5C4QA 4Z1SA 4J3IA 5HLSA 3UVXA 4NYWA 4QSUA 3P1EA 4CUSA 5F60A 4ALGA 5LKZA 3O34A 5F62A 5BT4A 5D3SA 4IOOA 2RNXA 5DLZA 5FFVA 4A9KA 5C87A 5D3TA 3O37A 4UIVA 4HXNA 3HMHA 5L98A 5F5ZA 4HBWA 4Q0NA 1WUMA 3SVFA 5G4RA 5L99A 5DBMA 5D3RA 4QEUA 5IIDA 5ENEA 5C89A 3LQHA 4UYFB 3U5PA 4LC2A 4LYWA 4YH3A 4YK0A 4IORA 4NUDA 3MB3A 2RI7A 4UIXA 3HMFA 4HXKA 4QSXA 5I80A 4YY4A 5A5SA 5IG6A 4XUAA 4ZW1A 5LJ1A 5CTLA 4LRGA 4WIVA 2OSSA 4YH4A 2YYNA 5FG5A 3QZTA 4YYNA 3RCWA 4TT2A 5EWDA 5D3PA 5EWCA 5A5PA 4NR7A 4UIYA 3DAIA 4BW4A 4HBVA 5F2PA 5LJ2A 5EM3A 4DONA 2YEKA 3O33A 4QYLA 5FB0A 5I7YA 5HFRA 5HEMA 3TLPA 2DVQA 4LZ2A 4XYAA 3U5JA 4RVRA 4ZQLA 5CQ8A 5AD3A 4IR3A 4TU6A 5FH6A 4HXPA 4QYDA 5D7XA 4PCEA 5E3GA 5FDZA 4YYKA 5IGNA 3UVWA 4UYGA 4J1PA 5DX4A 4LZSA 5EP7A 3ZYUA 4CFKA 5HQ6A 5HELA 5AMFA 4NUEA 4O74A 5E9KA 5A81A 5EPBA 5EWHA 4Z1QA 4QEVA 5L8TA 4MR5A 4O7CA 5TB6A 5D26A 5D24A 4A9LA 4IR6A 4TQNA 5FG4A 3LQJA 4HXOA 4TS8A 3MQMA 1JM4B 5EGUA 4TZ2A 4LR6A 5HRXA 4NS5A 4HXMA 4F3IA 4ZC9A 4BW2A 5I29A 5L8UA 3O36A 5BT5A 4TT6A 5CQ4A 5CUBA 5I7XA 4A9FA 4QY4A 2DKWA 4OUFA 4QR4A 4A9JA 4QNSA 5J0DA 4HBXA 5D3JA 5DKDA 3UV2A 3SVHA 5F36A 4O77A 5EWWA 5I1QA 2DWWA 4O7BA 5FE8A 4NYVA 5DLXA 3U5LA 5LVQA 5CZGA 4YADA 5E73A 2YQDA 3UVDA 4CLBA 2LSPB 4HBYA 3P1DA 4OGIA 2DVSA 5C8GA 4QR5A 4O76A 5CP5A 4UIWA 4YABA 4YC9A 4QSSA 2DVVA 4O7FA 4KV1A 5CGPA 2E3KA 4Z6IA 5CQ6A 3Q2EA 4CUUA 5DW1A 3UW9A 5A5OA 4YBTA 5F63A 3HMEA 5AMEA 1X0JA 4QSVA 2GRCA 4BW1A 4NXJA 4XY9A 5L96A 4HXRA 5F1HA 3UV5A 2E7NA 5IGKA 4YYJA 3LJWA 5D3HA 5HRVA 2DATA 5I40A 4PCIA 2OUOA 5ENIA 3IU5A 4HXLA 4MEOA 4NUCA 2D82A 5JWMA 5FE1A 2I7KA 5A5RA 5FFWA 5F3AA 5AD2A 5FE5A 5FH8A 4MR3A 4UYHA 1WUGA 4KCXA 2R10A 4QC3A 4NR6A 5C7NA 5FE7A 4MEPA 4NRAA 5DKCA 5CUAA 5FE4A 4Z6HA 5ENJA 5E9MA 4O71A 4QSRA 2F6NA 5D3LA 5ETDA 2RS9B 3K2JA 3ONIA 5L97A 3I3JA 4YATA 4YYHA 5CU8A 4ALHA 5FE9A 4YY6A 5CUDA 3MUKA 4UYFA 2YEMA 4CUTA 3JVJA 5CS8A 4AKNA 5IBNA 5FBXA 4IOQA 5E7DA 4O7AA 5E9LA 3U5NA 5CPEA 5DKHA 5DY7A 5KHMA 5BT3A 5F1LA 4C67A 4UYDA 4A9OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OO1A 2L84A 4YBMA 4O7EA 4Q0OA 2D9EA 4QUUA 4PTBA 4YAXA 3SVGA 5KO4A 3Q2FA 5H85A 4NRBA 4N4FA 4A9MA 5DFDA 5H1TA 3D1DA 4QR3A 5CQTA 4NR8A 5CQ3A 5H1VA 2F6JA 4BW3A 5EISA 5CQ5A 4QSTA 2RO1A 5DYXA 5HRWA 5EU1A 1EQFA 4E96A 4BJXA 3U5MA 5CUCA 5LVRA 2R0SA 5ENBA 4CUPA 4TTEA 4MR4A 4NRCA 4QC1A 5A5QA 2G4AA 1F68A 4NR5A 1JSPB 3VKHA 4O70A 4MR6A 3UV4A 2FSAA 4MENA 4N4IA 5E74A 4NYXA 1N72A 5EPSA 5DFCA 4N4GA 5TCMA 5CUGA 2E7OA 4LYIA 2YW5A 3NXBA 4WHWA 3IU6A 5II2A 1E6IA 2NXBA 4Y03A 5LUUA 5E3DA 4NQMA 2WP1A 5HM0A 3P1CA 4A9IA 4A9HA 5IGLA 5KTXA 4TT4A 5FFYA 4J0SA 4A9EA 5EWVA 2WP2A 4WHUA 5EQ1A 2RNYA 4UYEA 4BHWA 3JVLA 5H1UA 5C85A 5LKUA 3JVMA 4A9NA 1ZS5A 2RNWA 3LXJA 2KTBB 3S91A 4N4HA 5D3NA 5D0CA 4QSWA 5KU3A 4CURA 4QUTA 5FG6A 5I89A 4C66A 5EV9A 5KTUA 4XY8A 2R0YA 3S92A 4PKLA 4CUQA 5CY9A 2DVRA 4IR5A 4YYMA 5FE6A 5KTWA 5E9IA 4UITA 5I86A 4YYIA 5CQAA 5FE2A 4N3WA 5FE3A 5E9VA 5F25A 5I88A 3LQIA 4QBMA 4QB3A 5FB1A 4O78A 5ENCA 3UVYA 4UIUA 3G0JA 5ENFA 5A82A 5FH7A 4YYDA 5K29A 4UIZA 3FKMX 3QZSA 2N9GA 5I83A 3QZVA 3U5KA 4LYSA 2L85A 5ETBA 4IR4A 3AADA 3U5OA 3O35A 5EK9A 5E9YA 4NR9A 3VKGA 5CRMA 4KV4A 5HJCA 5FE0A 5EI4A 5E0RA 2YELA 4J0RA 4O72A 4Z93A 3P5OA 4YYGA 5CFWA 5HFQA 5DYCA 2R0VA 4O75A 5IGMA 5CUEA 4LDFA 5D25A 2H60A 4YBSA 4LZRA 5DFBA 3MULA 5LKTA 5ENHA 5CRZA 4TZ8A 4TU4A 5HQ7A 4PS5A 5F61A 5LKXA 5A83A 5ACYA 3GG3A 4X2IA 5EA1A 5II1A 4FLPA 5DYUA 5A5NA 2L5EA 3D7CA 4QSQA 3AQAA 3DWYA 4NR4A 5G4SA 4AKHA 5HCLA 4NQNA 5A7CA 5HENA 4OGJA 4QZSA 5A85A 4CFLA 2MJVB 3G0LA 1ZKRA 3JVKA 4MEQA 5DYAA 2RFJA 3MXFA 2YDWA 4XUBA 5CQ7A 5EVAA 4GPJA 5DW2A 5ENGA 2I8NA 4HXSA 5COIA 4TYLA 3MB4A 4PY6A 5HQ5A 4QEWA 5EPRA 4QSPA 3P1FA 5JI8A 5EICA 4CL9A 5LJ0A 5C4QA 4Z1SA 4J3IA 5HLSA 3UVXA 4NYWA 4QSUA 3P1EA 2EJNA 4CUSA 5F60A 4ALGA 5LKZA 3O34A 5F62A 5BT4A 5D3SA 4IOOA 2RNXA 5DLZA 5FFVA 4A9KA 5C87A 5D3TA 3O37A 4UIVA 4HXNA 3HMHA 5L98A 5F5ZA 4HBWA 4Q0NA 1WUMA 3SVFA 5G4RA 5L99A 5DBMA 5D3RA 4QEUA 5IIDA 5ENEA 5C89A 3LQHA 4UYFB 3U5PA 4LC2A 4LYWA 4YH3A 4YK0A 4IORA 4NUDA 3MB3A 2RI7A 4UIXA 3HMFA 4HXKA 4QSXA 5I80A 4YY4A 5A5SA 5IG6A 4XUAA 4ZW1A 5LJ1A 5CTLA 4LRGA 4WIVA 2OSSA 4YH4A 2YYNA 5FG5A 3QZTA 4YYNA 3RCWA 4TT2A 5EWDA 5D3PA 5EWCA 5A5PA 4NR7A 4UIYA 3DAIA 4BW4A 4HBVA 5F2PA 5LJ2A 5EM3A 4DONA 2YEKA 3O33A 4QYLA 5FB0A 5I7YA 5HFRA 5HEMA 3TLPA 2DVQA 4LZ2A 4XYAA 3U5JA 4RVRA 4ZQLA 5CQ8A 5AD3A 4IR3A 4TU6A 5FH6A 4HXPA 4QYDA 5D7XA 4PCEA 5E3GA 5FDZA 4YYKA 5IGNA 3UVWA 4UYGA 4J1PA 5DX4A 4LZSA 5EP7A 3ZYUA 4CFKA 5HQ6A 5HELA 1PUOA 5AMFA 4NUEA 4O74A 5E9KA 5A81A 5EPBA 5EWHA 4Z1QA 4QEVA 5L8TA 4MR5A 4O7CA 5TB6A 5D26A 5D24A 4A9LA 4IR6A 4TQNA 5FG4A 3LQJA 4HXOA 3D1BA 4TS8A 3MQMA 1JM4B 5EGUA 4TZ2A 4LR6A 5HRXA 4NS5A 4HXMA 4F3IA 4ZC9A 4BW2A 5I29A 5L8UA 3O36A 5BT5A 4TT6A 5CQ4A 5CUBA 5I7XA 4A9FA 4QY4A 2DKWA 4OUFA 4QR4A 4A9JA 4QNSA 5J0DA 4HBXA 5D3JA 5DKDA 3UV2A 3SVHA 5F36A 4O77A 5EWWA 5I1QA 2DWWA 4O7BA 5FE8A 4NYVA 5DLXA 3U5LA 5LVQA 5CZGA 4YADA 5E73A 4AKGA 2YQDA 3UVDA 4CLBA 2LSPB 4HBYA 3P1DA 4OGIA 2DVSA 5C8GA 4QR5A 4O76A 5CP5A 4UIWA 4AKIA 4YABA 4YC9A 3ERRA 4QSSA 2DVVA 4O7FA 4KV1A 5CGPA 2E3KA 4Z6IA 5CQ6A 3Q2EA 4CUUA 5DW1A 3UW9A 5A5OA 4YBTA 5F63A 3HMEA 5AMEA 1X0JA 4QSVA 2GRCA 4BW1A 4NXJA 4XY9A 5L96A 4HXRA 5F1HA 3UV5A 2E7NA 5IGKA 4YYJA 3LJWA 5D3HA 5HRVA 2DATA 5I40A 4PCIA 2OUOA 5ENIA 3IU5A 4HXLA 4MEOA 4NUCA 2D82A 5JWMA 5FE1A 2I7KA 5A5RA 5FFWA 5F3AA 5AD2A 5FE5A 5FH8A 4MR3A 4UYHA 1WUGA 4KCXA 2R10A 4QC3A 4NR6A 5C7NA 5FE7A 4MEPA 4NRAA 5DKCA 5CUAA 5FE4A 4Z6HA 5ENJA 4AI6A 5E9MA 4O71A 4QSRA 2F6NA 5D3LA 5ETDA 2RS9B 3K2JA 3ONIA 5L97A 3I3JA 4YATA 4YYHA 5CU8A 4ALHA 5FE9A 4YY6A 5CUDA 3MUKA 4UYFA 2YEMA 4CUTA 3JVJA 5CS8A 4AKNA 5IBNA 5FBXA 4IOQA 5E7DA 4O7AA 5E9LA 3U5NA 5CPEA 5DKHA 5DY7A 5KHMA 5BT3A 5F1LA 4C67A 4UYDA 4A9OA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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