4QR5A

Brd4 bromodomain 1 complex with its novel inhibitors
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-based drug discovery of 2-thiazolidinones as BRD4 inhibitors: 2. Structure-based optimization
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
total genus 45
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qr5A01
4QSUA 5II1A 4XUBA 3HMHA 4QY4A 5D25A 5EPBA 5HEMA 5KO4A 2E7NA 5FH8A 4CUUA 4UYFA 5FDZA 5AD3A 5HQ7A 3HMEA 5D3HA 4IR5A 5I80A 5HRXA 4PCEA 1E6IA 4A9NA 4Z1SA 4FLPA 4UIUA 2N9GA 4NXJA 4NRBA 5CQ7A 5LJ1A 4HXLA 5DYAA 5A5QA 5L97A 5FE9A 5J0DA 5D3SA 5DFCA 3G0LA 4QYLA 3RCWA 5I88A 4YK0A 4TT2A 4HXSA 5H1VA 4HXPA 3O33A 5HFQA 5EQ1A 5ENFA 5A81A 2DVRA 5FG4A 5CZGA 5DW2A 5F36A 5EICA 4XY8A 2E3KA 3U5MA 5LJ0A 4YYMA 4A9HA 4QSPA 2L84A 2YEKA 4Z93A 2RI7A 5TCMA 4X2IA 5FH6A 2WP1A 4WHUA 5ENGA 4Z6IA 4UIZA 4IR4A 3GG3A 3QZTA 4WIVA 3Q2FA 4MEOA 5C8GA 4NR6A 5CPEA 3U5KA 4A9LA 4LZSA 4KCXA 4UYGA 5H1UA 1JM4B 4CFKA 5A7CA 5KTUA 2RS9B 5CUAA 2OUOA 4TTEA 4YADA 5FH7A 4TU6A 5I1QA 1X0JA 4A9MA 2DVVA 4Y03A 4HBYA 1WUGA 2R0VA 3DWYA 5JI8A 4F3IA 5LJ2A 4QNSA 5E3DA 3P1DA 3S91A 5FFVA 2D9EA 4OGJA 5DFBA 5E3GA 4LYIA 5IBNA 5E0RA 5I89A 5I86A 4A9OA 4NQMA 4TQNA 5EA1A 3UVYA 4A9EA 4QSQA 4O7AA 4BW3A 3LQJA 5LKUA 3LJWA 3P5OA 5FE2A 5EISA 3SVHA 4LR6A 3LQIA 5LVRA 2E7OA 4NRAA 2DKWA 5I40A 4UIYA 2R10A 3AADA 4YBTA 5EGUA 2MJVB 4IORA 5CP5A 5BT5A 3MB3A 5HRWA 5EVAA 1WUMA 3SVFA 2RO1A 1ZS5A 5E73A 4NR7A 5DKCA 4YYNA 5FE0A 4LDFA 3SVGA 4CLBA 4QC1A 4O7BA 5LKZA 4J3IA 3ONIA 5HJCA 5FG6A 5IGMA 2YQDA 5F25A 3DAIA 5FBXA 5L99A 3P1FA 2RNWA 5LKXA 3LXJA 4YYKA 5LKTA 4UYEA 4MEQA 4OGIA 4BW2A 5AMFA 4CURA 4QB3A 5DLZA 5L96A 5D3PA 4TZ2A 5F3AA 3S92A 3O36A 5D7XA 5DX4A 4UIXA 3IU6A 4QSSA 5D0CA 5AMEA 4WHWA 5H85A 5C87A 5I83A 5A85A 2NXBA 3O35A 5A5PA 4HXNA 3D7CA 3U5JA 5E9LA 5DYXA 2R0SA 5ENBA 5BT3A 2YW5A 4XY9A 5DBMA 5CQ8A 5L8UA 4N4IA 4CUPA 3IU5A 3U5OA 5CUDA 4N3WA 5ENIA 5K29A 2FSAA 5G4SA 5C89A 4UYFB 5A5OA 2D82A 3UW9A 3MULA 4QSRA 4O74A 4IR3A 4NR5A 5HM0A 5CUBA 5E74A 5CTLA 4HXKA 5CFWA 5CUCA 2R0YA 3MB4A 5G4RA 4O7EA 4NR4A 5ETDA 4Q0OA 5EWVA 5E9IA 4O75A 5E9YA 4MR5A 4LC2A 3MQMA 4QUUA 4E96A 5EK9A 5F62A 2DVSA 3JVJA 5I29A 5D24A 4NYXA 4MEPA 4HXOA 5BT4A 4YYHA 5E9VA 4CL9A 4J0RA 5IG6A 5CS8A 4UYHA 4YABA 5LUUA 4QR3A 3G0JA 4N4HA 4PY6A 4QBMA 5HQ5A 4O7CA 4NS5A 4YYDA 4IOOA 5DYUA 4YH3A 3QZSA 1EQFA 2LSPB 5FFWA 4TZ8A 2DATA 4TT6A 4MR4A 5ENJA 4YYIA 5F5ZA 5A83A 5C85A 4O72A 3O34A 4NQNA 4XYAA 4YBMA 4NR8A 3AQAA 3P1CA 5DLXA 5A5SA 5TB6A 3UV2A 4J0SA 4YYJA 2F6JA 4KV4A 2OSSA 2L5EA 3UV5A 4YBSA 5CQTA 5DW1A 5CUGA 5CQ3A 4XUAA 4QC3A 4QUTA 5EU1A 4O71A 4PTBA 4CUTA 3UVXA 5EWWA 4ALGA 3QZVA 2RNXA 3U5PA 4TT4A 1JSPB 2DWWA 4TU4A 1F68A 4HXMA 3MUKA 3FKMX 4BHWA 1N72A 4TYLA 4NYVA 5II2A 3LQHA 4MR6A 4IR6A 4MENA 5CU8A 5CY9A 4J1PA 4QR5A 5FE1A 5DKDA 4A9FA 5IIDA 4O70A 2YYNA 5I7YA 3O37A 3UV4A 2F6NA 4N4GA 4PKLA 4QR4A 5CQ6A 4QEVA 5CQAA 5E9MA 5CRZA 5ENCA 4Z6HA 5KU3A 5L8TA 2DVQA 3HMFA 5ACYA 5FE5A 4ALHA 4A9IA 5IGNA 3UVDA 5DYCA 5EP7A 4LZRA 5H1TA 2YEMA 3MXFA 5JWMA 2YELA 3K2JA 2KTBB 5D3JA 4QYDA 5F1HA 5DFDA 4Q0NA 4YYGA 4LZ2A 4BJXA 4QSTA 5EWCA 2L85A 4QSWA 5C4QA 5F60A 4N4FA 5IGLA 5EM3A 4PCIA 5FE4A 3Q2EA 5ENEA 4BW1A 4MR3A 4DONA 4TS8A 4O76A 5FFYA 4YC9A 2I7KA 5I7XA 2GRCA 5HCLA 5FE8A 4NYWA 4HBWA 5CQ5A 5FE6A 5EWDA 3NXBA 4BW4A 5EV9A 5D26A 4HBXA 4QEUA 4C66A 5D3TA 4A9KA 3JVLA 5D3LA 3P1EA 5DKHA 5EI4A 5HENA 5D3RA 4GPJA 5EPRA 4YH4A 5ETBA 4ZC9A 4UYDA 4UITA 5ENHA 5HRVA 5EPSA 4UIVA 5CGPA 5FE3A 4QSVA 5DY7A 5A5RA 5F2PA 5HFRA 3JVKA 2RNYA 2RFJA 5A5NA 4QSXA 4CUQA 5AD2A 2OO1A 5KTXA 4QEWA 5L98A 4CFLA 5A82A 4RVRA 4NR9A 5CQ4A 5FB1A 5FE7A 4Z1QA 2WP2A 4NUCA 3I3JA 5F61A 4YY4A 4IOQA 5E9KA 5CRMA 5C7NA 5FB0A 4CUSA 4C67A 5EWHA 4LRGA 5HLSA 4OUFA 2I8NA 3UVWA 2H60A 5HQ6A 5E7DA 5D3NA 5HELA 4YATA 4KV1A 4PS5A 5COIA 4AKNA 5IGKA 4O7FA 4NUDA 5F63A 3TLPA 4A9JA 4ZW1A 3ZYUA 5LVQA 2YDWA 4HXRA 4UIWA 3U5NA 5CUEA 4NRCA 4ZQLA 4O77A 2G4AA 4QZSA 4YAXA 5FG5A 4NUEA 4LYSA 3U5LA 5KTWA 5KHMA 4YY6A 3JVMA 4HBVA 4LYWA 5F1LA 4O78A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSUA 5II1A 4XUBA 3HMHA 4QY4A 5D25A 5EPBA 5HEMA 5KO4A 2E7NA 5FH8A 4CUUA 4UYFA 5FDZA 5AD3A 5HQ7A 3HMEA 5D3HA 4IR5A 5I80A 5HRXA 4PCEA 1E6IA 4A9NA 4Z1SA 4FLPA 4UIUA 2N9GA 4NXJA 4NRBA 5CQ7A 5LJ1A 4HXLA 5DYAA 5A5QA 2EJNA 5L97A 5FE9A 5J0DA 5D3SA 5DFCA 3G0LA 4QYLA 3RCWA 5I88A 4YK0A 4TT2A 4HXSA 5H1VA 4HXPA 3O33A 5HFQA 5EQ1A 5ENFA 5A81A 2DVRA 5FG4A 5CZGA 5DW2A 5F36A 5EICA 4XY8A 2E3KA 3U5MA 5LJ0A 4YYMA 4A9HA 4QSPA 2L84A 2YEKA 4Z93A 2RI7A 5TCMA 4X2IA 5FH6A 2WP1A 4WHUA 5ENGA 4Z6IA 4UIZA 4IR4A 3GG3A 3QZTA 4WIVA 3Q2FA 4MEOA 5C8GA 4NR6A 5CPEA 3U5KA 4A9LA 4LZSA 4KCXA 4UYGA 5H1UA 1JM4B 4CFKA 5A7CA 5KTUA 4AKGA 2RS9B 5CUAA 2OUOA 4TTEA 4YADA 5FH7A 4TU6A 5I1QA 1X0JA 4A9MA 2DVVA 4Y03A 4HBYA 1WUGA 2R0VA 3DWYA 5JI8A 4F3IA 5LJ2A 4QNSA 3D1DA 5E3DA 4AKHA 3P1DA 3S91A 5FFVA 2D9EA 4OGJA 5DFBA 5E3GA 4LYIA 5IBNA 5E0RA 5I89A 5I86A 4A9OA 4NQMA 4TQNA 5EA1A 3UVYA 4A9EA 4QSQA 4O7AA 4BW3A 3LQJA 5LKUA 3LJWA 3P5OA 5FE2A 5EISA 3SVHA 4LR6A 3LQIA 5LVRA 2E7OA 4NRAA 2DKWA 5I40A 4UIYA 2R10A 3AADA 4YBTA 5EGUA 2MJVB 4IORA 5CP5A 5BT5A 3MB3A 5HRWA 5EVAA 1WUMA 3SVFA 2RO1A 1ZS5A 5E73A 4NR7A 5DKCA 4YYNA 5FE0A 4LDFA 3SVGA 4CLBA 3VKHA 4QC1A 3VKGA 4O7BA 5LKZA 4J3IA 3ONIA 5HJCA 5FG6A 5IGMA 2YQDA 5F25A 3DAIA 5FBXA 5L99A 3P1FA 2RNWA 5LKXA 3LXJA 4YYKA 5LKTA 4UYEA 4MEQA 4OGIA 4BW2A 5AMFA 4CURA 4QB3A 5DLZA 5L96A 5D3PA 4TZ2A 5F3AA 3S92A 3O36A 5D7XA 5DX4A 4UIXA 3IU6A 4QSSA 5D0CA 5AMEA 4WHWA 5H85A 5C87A 5I83A 5A85A 2NXBA 3O35A 5A5PA 4HXNA 3D7CA 3U5JA 5E9LA 5DYXA 2R0SA 5ENBA 5BT3A 2YW5A 4XY9A 5DBMA 5CQ8A 5L8UA 4N4IA 4CUPA 3IU5A 3U5OA 5CUDA 4N3WA 5ENIA 5K29A 2FSAA 5G4SA 5C89A 4UYFB 5A5OA 2D82A 3UW9A 3MULA 4QSRA 4O74A 4IR3A 4NR5A 4AI6A 5HM0A 5CUBA 5E74A 5CTLA 4HXKA 5CFWA 5CUCA 2R0YA 3MB4A 5G4RA 4O7EA 4NR4A 5ETDA 4Q0OA 5EWVA 5E9IA 4O75A 5E9YA 4MR5A 4LC2A 3MQMA 4QUUA 4E96A 5EK9A 5F62A 2DVSA 3JVJA 5I29A 5D24A 4NYXA 4MEPA 4HXOA 5BT4A 4YYHA 5E9VA 4CL9A 4J0RA 5IG6A 5CS8A 4UYHA 4YABA 5LUUA 4QR3A 3G0JA 4N4HA 4PY6A 4QBMA 5HQ5A 4O7CA 4NS5A 4YYDA 4IOOA 5DYUA 4YH3A 3QZSA 4AKIA 1EQFA 2LSPB 5FFWA 4TZ8A 2DATA 4TT6A 4MR4A 5ENJA 4YYIA 5F5ZA 5A83A 5C85A 4O72A 3O34A 4NQNA 4XYAA 4YBMA 4NR8A 1ZKRA 3AQAA 3P1CA 5DLXA 5A5SA 5TB6A 3UV2A 4J0SA 4YYJA 2F6JA 4KV4A 2OSSA 2L5EA 3UV5A 4YBSA 5CQTA 5DW1A 5CUGA 5CQ3A 4XUAA 4QC3A 4QUTA 5EU1A 4O71A 4PTBA 4CUTA 3UVXA 5EWWA 4ALGA 3QZVA 2RNXA 3U5PA 4TT4A 1JSPB 2DWWA 4TU4A 3D1BA 1F68A 4HXMA 3MUKA 3FKMX 4BHWA 1N72A 4TYLA 4NYVA 5II2A 3LQHA 4MR6A 4IR6A 4MENA 5CU8A 5CY9A 4J1PA 4QR5A 5FE1A 5DKDA 4A9FA 5IIDA 4O70A 2YYNA 5I7YA 3O37A 3UV4A 2F6NA 4N4GA 1PUOA 4PKLA 4QR4A 5CQ6A 4QEVA 5CQAA 5E9MA 5CRZA 5ENCA 4Z6HA 5KU3A 5L8TA 2DVQA 3HMFA 5ACYA 5FE5A 4ALHA 4A9IA 5IGNA 3UVDA 5DYCA 5EP7A 4LZRA 5H1TA 2YEMA 3MXFA 5JWMA 3ERRA 2YELA 3K2JA 2KTBB 5D3JA 4QYDA 5F1HA 5DFDA 4Q0NA 4YYGA 4LZ2A 4BJXA 4QSTA 5EWCA 2L85A 4QSWA 5C4QA 5F60A 4N4FA 5IGLA 5EM3A 4PCIA 5FE4A 3Q2EA 5ENEA 4BW1A 4MR3A 4DONA 4TS8A 4O76A 5FFYA 4YC9A 2I7KA 5I7XA 2GRCA 5HCLA 5FE8A 4NYWA 4HBWA 5CQ5A 5FE6A 5EWDA 3NXBA 4BW4A 5EV9A 5D26A 4HBXA 4QEUA 4C66A 5D3TA 4A9KA 3JVLA 5D3LA 3P1EA 5DKHA 5EI4A 5HENA 5D3RA 4GPJA 5EPRA 4YH4A 5ETBA 4ZC9A 4UYDA 4UITA 5ENHA 5HRVA 5EPSA 4UIVA 5CGPA 5FE3A 4QSVA 5DY7A 5A5RA 5F2PA 5HFRA 3JVKA 2RNYA 2RFJA 5A5NA 4QSXA 4CUQA 5AD2A 2OO1A 5KTXA 4QEWA 5L98A 4CFLA 5A82A 4RVRA 4NR9A 5CQ4A 5FB1A 5FE7A 4Z1QA 2WP2A 4NUCA 3I3JA 5F61A 4YY4A 4IOQA 5E9KA 5CRMA 5C7NA 5FB0A 4CUSA 4C67A 5EWHA 4LRGA 5HLSA 4OUFA 2I8NA 3UVWA 2H60A 5HQ6A 5E7DA 5D3NA 5HELA 4YATA 4KV1A 4PS5A 5COIA 4AKNA 5IGKA 4O7FA 4NUDA 5F63A 3TLPA 4A9JA 4ZW1A 3ZYUA 5LVQA 2YDWA 4HXRA 4UIWA 3U5NA 5CUEA 4NRCA 4ZQLA 4O77A 2G4AA 4QZSA 4YAXA 5FG5A 4NUEA 4LYSA 3U5LA 5KTWA 5KHMA 4YY6A 3JVMA 4HBVA 4LYWA 5F1LA 4O78A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QSU A;  5II1 A;  4XUB A;  3HMH A;  4QY4 A;  5D25 A;  5EPB A;  5HEM A;  5KO4 A;  2E7N A;  5FH8 A;  4CUU A;  4UYF A;  5FDZ A;  5AD3 A;  5HQ7 A;  3HME A;  5D3H A;  4IR5 A;  5I80 A;  5HRX A;  4PCE A;  1E6I A;  4A9N A;  4Z1S A;  4FLP A;  4UIU A;  2N9G A;  4NXJ A;  4NRB A;  5CQ7 A;  5LJ1 A;  4HXL A;  5DYA A;  5A5Q A;  5L97 A;  5FE9 A;  5J0D A;  5D3S A;  5DFC A;  3G0L A;  4QYL A;  3RCW A;  5I88 A;  4YK0 A;  4TT2 A;  4HXS A;  5H1V A;  4HXP A;  3O33 A;  5HFQ A;  5EQ1 A;  5ENF A;  5A81 A;  2DVR A;  5FG4 A;  5CZG A;  5DW2 A;  5F36 A;  5EIC A;  4XY8 A;  2E3K A;  3U5M A;  5LJ0 A;  4YYM A;  4A9H A;  4QSP A;  2L84 A;  2YEK A;  4Z93 A;  2RI7 A;  5TCM A;  4X2I A;  5FH6 A;  2WP1 A;  4WHU A;  5ENG A;  4Z6I A;  4UIZ A;  4IR4 A;  3GG3 A;  3QZT A;  4WIV A;  3Q2F A;  4MEO A;  5C8G A;  4NR6 A;  5CPE A;  3U5K A;  4A9L A;  4LZS A;  4KCX A;  4UYG A;  5H1U A;  1JM4 B;  4CFK A;  5A7C A;  5KTU A;  2RS9 B;  5CUA A;  2OUO A;  4TTE A;  4YAD A;  5FH7 A;  4TU6 A;  5I1Q A;  1X0J A;  4A9M A;  2DVV A;  4Y03 A;  4HBY A;  1WUG A; 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