4QSDA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound sucrose
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter Atu4361 from Agrobacterium Fabrum, Target Efi-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 137
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qsdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qsdA02
1VFEA 4OEUA 1LLSA 3LC8A 2RC8A 1A7LA 1MRPA 3RQTA 4RXLA 3RGYA 3GBBA 2NWJA 4U21A 4ESWA 2V3UA 4QFPA 4GRKA 1LAXA 3IK6B 5CI5A 3EPEA 2CZLA 4QRZA 3T9UA 4YAHX 3SETA 4IB2A 2H9BA 3C33A 4K3FA 1P1QA 4X48A 4ZZEA 4IO4A 5A5XB 3FVNA 2F97A 3T9HB 3O66A 2IA4A 4TOZA 5DTBA 5FHNA 5IKBA 1YCJA 3KOSA 1VR5A 5AA4B 3B6TA 5DVJA 3JZJA 4EXKA 4GXSB 3B6WA 3EQ1A 5JK4A 3M3LA 3ZKLA 3CFLA 3FJ7A 4H8IA 1Y9UA 5I84A 1OIBA 1B5HA 2ZXTA 3FIRA 2FA7A 4GVOA 1XT8A 1TT1A 3T9VA 2PVUA 2THIA 1NH7A 4JWXA 4O3CA 3P7IA 3W9WA 2NVUB 3KEIA 5L8DA 2RKMA 3MPKA 1PBPA 4FEBA 3HO7A 3RUMA 1R6ZA 3ONMA 2I3WA 3SEXA 2X7PA 1L5TA 3EN3A 3PPQA 4JBZA 3Q28A 1I69A 3Q27A 1JEVA 1I6AA 5B7DA 2PT2A 3H6UA 3CIJA 4ZE8A 3T9XB 4F22A 5DEXA 3MJNA 3Q25A 2F7AA 5CC2A 1QKAA 1MDQA 2XXQA 3VLUA 2P1SA 4EDPA 1SD3A 3K00A 5CBSA 1B7UA 1MDP1 2XX9A 3MVYA 2QRYA 2XX8A 1QVSA 1M5EA 4H5FA 3SESA 1OVBA 2XXUA 4F19A 3TAJA 3IB2A 2IEEA 1SBPA 4N13A 3VLWA 4ZS9A 2BJJX 3H7MA 1LBBA 2RC7A 1US4A 3K1PA 3U92A 1M5CA 1JVYA 5EYFA 1FQFA 5DEXB 1NL5A 1XS5A 3KN3A 2Z8DA 3G3JA 3G7WA 3E13X 4G68A 2FYIA 5AA2D 4F29A 3FVKA 4LZ5A 4NF5A 5HM4B 3PMXA 5I2KA 3FJGA 4ISUA 3FD3A 3PU5A 3MVXA 1TFDA 1N0TA 3S9LC 1CB6A 2A5TA 2DSFA 4G8HA 2QL3A 4P0GA 3QXMA 2HEUA 3PD8A 3C9HA 4EQBA 1XC1A 1MXZA 2VGQA 4G68B 2QS4A 3M3FA 1MS7A 4THIA 4KYSA 4NF5B 2ESNA 1S7YA 4R2FA 5I2KB 2HCAA 3O6HA 3EHTA 3H03A 4Q5TA 4IO5A 1DSNA 3O9PA 3I3VA 4MH5A 5H8SA 3UP9A 5I58A 1SW2A 3H4ZA 2A5TB 3TTRA 3FGSA 3R6UA 3PPOA 4NF8A 1B40A 1P1NA 1TWYA 1AIVA 3IO4A 3LSXA 1NKXA 3TEPA 1DPPA 4R6HA 2RCAA 1D9YA 4LA9A 1GGGA 2V3QA 3H3GA 3GLBA 4BDRA 1GV8A 5CM6A 3G3KA 1MG1A 1P1UA 3TMGA 4NF6A 1MM6A 2PT1A 4O3BA 4YKPA 4X1BA 4ELQA 2NUVA 4XKQA 1N7XA 4YB7A 4U1OA 2FNCA 4LVQA 1WVJA 3RT6B 3I6VA 4BDNA 2V93A 3G3GA 2Y7PA 4NF8B 3VE1B 5I2NA 1B3FA 3TQLA 2O84X 4F39A 2DS9A 2Z22A 3VLVA 2ZNSA 4BDOA 1A40A 3FVGA 1WODA 1LCFA 4GOTA 5CMCA 2H25A 4H6DA 4YKIA 4ONYA 4NF6B 4MLQA 1PDAA 4DDDA 4RK9A 1O7TA 3TCGA 2ONKE 3D4CA 3G3FA 4G8MA 4G68C 4GL8A 2B3FA 2E0SA 4XTCQ 2NXOA 3O2AA 1FQEA 5FHMA 3HHFA 2GHAA 1LAGE 1OVTA 1H76A 5I2NB 3N5LA 3C35A 4OFJA 3KFMA 4FJPA 3JYRA 5CMKA 3CFZA 3TELA 1URSA 2I49A 3K02A 4N07A 4I62A 2UVGA 1Y4CA 4PP0A 4OWDA 2P0SA 1H44A 1B1XA 1TXFA 4ZEKA 3K01A 1ZMGA 4JWYA 3UIFA 4Q0CA 2OK2A 3R26A 2D5WA 3MC2A 5LOMA 4QFOA 1RYOA 5L9SA 3OD7A 2XXWA 4RJZA 3TKDA 1EU8A 5H8QA 4XKPA 2QS1A 5AA1A 4G2ZA 4F31B 3MZ1A 4OXVA 1HSJA 3MUQA 4POWA 1NNKA 4PFYA 1NNFA 3OSRA 1POTA 5EHMA 3IL1B 1DTZA 1MQIA 3DP8A 3MZBA 1SW1A 3PMVA 5FHOA 1SI1A 1N84A 4LP2B 1JW4A 1B58A 2Q89A 5KZTA 3OEMA 2X7QA 4POXA 1Y3NA 4P11A 5H8QB 1O63A 5ELVA 1BTJA 3HV1A 1ZKBA 4XKNA 2XXYA 2DQVA 4Z0IA 3A3CA 4GD5A 3FVOA 2VD3A 1CE2A 4PFUA 2ZYOA 4PQJA 4BDQA 4I1DA 3Q29A 4IO3A 1T0KA 1PB9A 1B7ZA 5TP9A 1M5DA 1MY3A 3VVEA 3GZGA 5IAIA 1USYE 3H6WA 1BP5A 3OO8A 3RNNA 3PUWE 1SW5A 4JXIA 2DWAA 1BLFA 2QS3A 1IQ7A 1HSLA 1EH3A 3UK4A 3N6TA 2H98A 3C34A 1B3EA 1Z7NE 3PPRA 3AXFA 3RN8A 1PC3A 3KJTA 1MY2A 2ALUA 4UACA 5L9MA 3MZ9A 3TQWA 2DWIA 1DPEA 2DXRA 4DCXA 5TP9B 2GFEA 2ONSA 3RY3A 1D3KA 1QKBA 3DM0A 1JW1A 2F6GA 2XD2A 2AIXA 3RLFE 4ZDMA 3KSXA 2QSXA 4NMYA 3U8QA 3V5AA 3JV9A 3LR1A 3FASA 2DE2A 1B0HA 1OLCA 2B65A 1II5A 3H6VA 2F5XA 2O51A 2REGA 1MH3A 5ISUA 2XXIA 3LBSA 3R7XA 3OOAA 1LAFE 2E1SA 4RNSA 2OWTA 4Z7EA 3KG2A 4FAJA 2DVZA 4R6KA 2XHDA 3UGWA 2F6PA 4XXUA 1MXYA 3E3KA 3KJ7A 3K0VA 1MXVA 4EUOA 4PETA 2O6AA 3W15C 1LSTA 3PUXE 3DELB 4GQOA 1LFIA 1H43A 3A09A 1A99A 3ZS6A 4IY5A 3FATA 1Y3PA 3TZAA 1MQHA 2YJPA 3PGFA 2VD2A 4X1DA 3V89B 3C31A 4AB6A 4PE5B 3BKIB 1YAEA 5FTIA 1PB7A 2M8CA 4WXJA 4QSCA 2DE3A 4M1VA 3M3KA 1ZU0A 2Y84A 2HAUA 2F36A 3K6XA 4GFRA 1N3WA 2I48A 3PUYE 4LZ8A 2VOZA 4QFNA 1OMPA 2ZNTA 1LGBC 3QK6A 3O28A 4KD5A 1B4ZA 1XVXA 3VFJA 1FTMA 3T93B 4GLIA 4YZZA 3ODBA 2Q2CA 1B0LA 4MLVA 5KCJA 3EF7A 3TPAA 1PB8A 3K6VA 1B5IA 1SVXB 3CG1A 2Q8JA 5J1DA 2OWSA 3D4GA 3FXUA 3KZGA 1MY4A 3HPIA 3OELA 5K2XA 4F1VA 4AB5A 4R75A 4FATA 4JB7A 3L6HA 1F9BA 3K4UA 1B51A 1B7HA 4OESA 2AL5A 4I8CA 1JW5A 1SDXA 5DYHA 1Q35A 3CSGA 4QSEA 3PUVE 3O6GA 5KCJB 3TTLA 1MQGA 1GTKA 3ZSFA 2RCBA 2F34A 2Z23A 4PFTA 1S50A 1JNFA 4ECFA 3IR1A 4OYVA 4QFLA 2DP8A 1MQDA 4KI0E 4KYDA 2XXPA 3FV1A 4RPOA 4U2RA 3MP8A 3BBRA 5HPQA 4EXLA 1O64A 5ICTA 1SYHA 2O7UA 2F35A 3O6IA 4H1XA 3FXRA 4GL0A 1B1HA 5BWJA 1AOVA 2AL4A 2HZKA 2I0CA 5I59A 2F7BA 1ANFA 5I58B 4ESXA 1B3GA 1BIYA 1LCTA 3H06B 2O1MA 5CBRA 3VXCA 4DE8A 5ITPA 1LB8A 4C0RA 4ZE9A 1PBQA 3QSLA 2XXHA 3OO9A 4EQ7A 4BDMA 4EF1A 2Y7RA 4C1UA 2Q88A 2Z8FA 2UVIA 2PBWA 2V25A 3IX1A 1GVCA 3S4UA 4F2QA 3C32A 1EZOA 1MM7A 1IXCA 1R9LA 2DWHA 4F3SA 5TU0A 2X26A 1OQGA 2XXXA 4H0WA 5I59B 2I4CA 3VVDA 3U72A 3TTMA 1D9VA 4FE8A 3U93A 1IITA 5ICQA 3MBPA 3HCQA 3IORA 4R72A 3OO7A 2G93A 2I4BA 3LUYA 1OLAA 4YICA 4L17A 2O68A 3VXBA 1ELJA 2CMOA 4GIZA 2A5SA 5CRYA 1ZJLA 3SKPA 1NNPA 4ELPA 3K6UA 3UORA 3PV0E 1Y20A 2KLFA 3QYTA 1JEUA 1B3LA 1B32A 4F18A 4U4SA 1B52A 3CG3A 1IUDA 1ZTYA 3MWBA 4IGRA 3HSTA 2Z8EA 2ZYNA 4KFQA 3WAFA 1IXGA 4DCYA 3ILUB 4Q30B 3OO6A 4YB6A 2UVJA 3LSFB 4YMAA 1IZ1A 3KBRA 1N3XA 3QUFA 1XHYA 4QF9A 1QUIA 3SEYA 2Y7WA 4ZECA 2DOJA 4YB5A 3QIMA 4NWDA 1GR2A 4G77A 1JVXA 1B46A 1XOCA 4GF8A 1MXUA 4TLMB 4OQOA 4F1YA 1AL3A 4QSDA 3OEKA 1D4NA 5H8HA 3OXNA 4IO2A 4HTGA 1Y4TA 3FJMA 1VSOA 4U1ZA 2O69A 2HQ0A 2OZZA 4BDLA 4ELOA 4HCYA 5TPAA 2I6EA 4G8NA 2F7CA 2W7YA 5HBCA 1YPNA 3E9XA 4HS7A 2WKYA 2GRVA 4OHNA 2F8DA 1DMBA 4UA8A 2ZNUA 4ZEIA 3FV2A 4OVJA 3U94A 3MQ9A 3L6GA 1MY1A 5H8HB 3SEUA 2H4IA 2UXAA 1URGA 1QUKA 1ZBMA 4TQUQ 4FIMA 4H67A 4HW8A 3MVZA 4MFIA 3PUZE 1MY0A 1DTGA 2REJA 3S9MC 2XXRA 5TPAB 1R9QA 4YU0A 4P0IA 3K1MA 4EQ9A 2OCUA 5AA3A 1VE4A 2DYXA 4NEDA 4F2OA 1FQCA 1UQWA 3T22A 3FZVA 1MH4A 4LQ5A 2QMXA 3C36A 3IOVA 1N7WA 3OENA 3UN6A 3MAMA 1HSEA 1I6QA 2DXYA 1LB9A 1H3DA 5JTYA 3RTFB 2HFBA 3W9VA 4ZEDA 4WEPA 3TYHA 1UIVA 1B2HA 4GXAA 4LZ7A 4OTEA 2PMSA 3SDFA 4RK2A 3EHSA 1S9TA 4FECA 2OBGA 4JSDA 2AYSA 3VVFA 4NF4A 3THIA 3CSBA 1ATGA 1US5A 1IIWA 5K2YA 2YLNA 3IOWA 4RPNA 4NWCA 1ZIUA 3N94A 2QMWA 5DVFA 1LFHA 1UTBA 3TTNA 1MPDA 3V83A 5M2VA 3TFLA 3KOTA 1TFAA 1M5BA 4ZZAA 3VV5A 2F78A 5I56A 2XXTA 5JTYB 2B3BA 4HCWA 1I6BA 4FORA 4DXBA 1Y1ZA 2NOOA 3SEVA 1NFTA 1AH5A 1P1WA 4IGTA 2Q9TA 3OSQA 4NF4B 4NE4A 4F3BA 4IO7A 5I57A 4F3GA 1QUJA 3DLNA 3RT8A 1UTBB 3G3HA 1KWHA 4DXUA 4OFOA 3USDA 1ZLQA 1MXWA 1Y1MA 2V84A 1M5FA 4RA1A 3O29A 1B6HA 2LAOA 4F1UA 3IB1A 1B9JA 4KCDA 3ILTB 3KSJA 4FEDA 5I56B 3O97A 4QFKA 3SERA 3WAEA 1A54A 5DVIA 1QW0A 4R74A 4AQ4A 4R9FA 2VP1A 1FQAA 2XD3A 3T96B 1FTLA 1EZPA 4JSOA 1IEJA 4E0WA 3QAXA 1PEBA 2OJTA 4M4GA 3RPWA 4IY6A 2ZMBA 3TDJA 5I57B 2ANJA 1FQBA 3S9NC 5BUUA 3MP6A 5KDTA 1J1NA 3IAZA 3GXAA 3FXQA 3B6QA 1MPCA 3PPNA 3HN0A 5FTHA 4OENA 4IO6A 4U22A 3I5OA 4EF2A 2GHBA 1B5JA 1MXXA 4R9GA 1A8EA 5F7VA 3C4MA 1FTJA 2OLBA 1VFDA 1NH8A 3S2VA 4MF3A 3PMWA 4PFWA 4KPTA 4YKKA 3U1OA 4XIGQ 4KQPA 5KDTB 4R73A 5H8FA 1SQYA 2D3IA 4TLLB 4OFLA 2O7IA 1XVYA 2RC9A 2XXVA 3GBAA 1P1OA 1JETA 1EZ9A 2HAVA 4E0XA 1R1NA 3B7DA 2RF1A 4I9DA 3V8XB 3SEWA 3TTKA 4U23A 2Y7IA 3MP1A 1DOTA 5ITOA 2H99A 2O1LA 5DT6A 3N6UA 4NTLA 4GWOA 3E4RA 3LSWA 4LATA 3F11A 2ZYMA 5H8FB 4ZEFA 1AMFA 3K6WA 3IO6A 3IJOB 5CMBA 2UVHA 4KHZE 4ZEBA 4OERA 1A8FA 3IOTA 2PX1A 1UTHA 4MBPA 4N6PA 4ND9A 4OMBA 4OETA 3MW0A 1SI0A 5F1QA 1RYXA 4LUBA 5AE4A 2XX7A 3IB0A 5CMMA 3LSLA 2UYEA 1LFGA 3PPPA 3MPLA 2VHAA 4U4XA 3T66A 4RYAA 4BLAA 1P99A 1QJMA 3VDFA 2ABHA 1A55A 3Q26A 2HZLA 1POY1 3QUJA 3CI8A 2DWJA 1N04A 2I3VA 4YKJA 3RTWB 3MVWA 2QJEA 4Q8RA 3ECRA 2V3TA 4R2BA 1UTHB 4G4PA 3M8UA 1IXHA 4WKMA 3OMBA 1FW0A 3CRBA 3TCFA 4LQ2A 3CFXA 5H8NA 1N76A 2G29A 2DVCA 2RINA 4R6YA 4H5GA 4OZ9A 2HXWA 1QULA 2D21A 1Z7ME 4F3PA 1B3HA 1SYIA 4C1TA 2R9JA 5AA2A 3DP4A 3HHGA 4WEDA 1NMUA 1B05A 2H5YA 3CVGA 3PD9A 1Q1KA 3N26A 4JDFA 2R71A 1FTOA 5B70A 4ELRA 1RKMA 3ZKKA 3K2DA 3BFTA 4YMBA 2Y7KA 2ZYKA 3IJXB 4DXCA 3TODA 3EHUA 4H65A 5H8NB 1FCKA 2ONRA 3KN8A 3CR9A 3DP6A 4QHQA 1FQDA 1WDNA 4KCCA 3IOUA 1LBCA 5JEIA 1MQJA 2Q2AA 3TCHA 4DLDA 4DZ1A 4DIGA 5AA2B 2YPNA 1USYH 5L9OA 2GH9A 1MPBA 1LAHE 2I0BA 2QS2A 4O3AA 3BFUA 3H6TA 3K1NA 1UIUA 5EHSA 2UYFA 4RY1A 3S9EA 2PYYA 3UA8A 1SW4A 1FTKA 1OQHA 3KN7A 1H45A 2I58A 1B4HA 4X9TA 2R6GE 1URDA 4KYEA 4H8JA 2QPQA 1IXIA 3G3IA 1JQFA 1Y3QA 2DE4A 3FUZA 3TUSA 4LONB 1BKAA 3KGCA 5A5XA 2P2AA 4JWOA 4OEVA 1NNTA 3A3UA 4KR5A 5AA4A 1YTVA 4XKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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