4QSDA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound sucrose
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter Atu4361 from Agrobacterium Fabrum, Target Efi-510558
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
total genus 137
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qsdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qsdA02
2P2AA 4MBPA 4G68C 1FQFA 2V3QA 1FTLA 2G29A 1FQCA 3SEVA 3KN7A 2RCBA 4PFTA 3WAFA 2O7UA 4FE8A 3TFLA 1N76A 2Y7RA 2NVUB 1QW0A 3FD3A 4OEVA 4QRZA 2HFBA 1DOTA 2I3WA 3RT8A 3RLFE 2Y7WA 3OEMA 3I3VA 1VFDA 3K4UA 4OHNA 2ZYNA 1B6HA 1XVYA 2QSXA 2I49A 2ONRA 4KYSA 3HCQA 1LAHE 1B3HA 1JW5A 1Y4CA 2F6GA 5DVFA 5ITPA 3MP1A 3PMXA 2HAVA 1GGGA 3U93A 1MXWA 4P11A 2Y7PA 4Q8RA 4GF8A 1XOCA 4RK9A 3PD8A 2R71A 3CR9A 1POY1 4JSDA 3V8XB 1B32A 4O3CA 3UIFA 3VV5A 5TU0A 2DXRA 2HXWA 3DP8A 3F11A 3G3JA 3R6UA 4NF5B 3K01A 5HBCA 2RKMA 1IXGA 4P0IA 4G68B 2GRVA 1MY2A 4OMBA 4DXUA 2D5WA 2FA7A 4XKPA 1R9QA 3B7DA 4ZEKA 4KFQA 3VXBA 4XKQA 4BLAA 2DQVA 3FJ7A 1SDXA 1MQHA 4QSCA 3O2AA 3OMBA 5I58B 1A99A 1JW4A 3FXQA 1TFDA 4WEDA 4GL0A 3IO4A 1MQJA 3W9VA 1MM6A 3H4ZA 4U1OA 1LBCA 1TXFA 3UN6A 3SESA 5ICQA 3IO6A 3Q26A 4AB5A 3H3GA 4F18A 5TPAA 3PUXE 2O84X 4THIA 2ZYMA 3OO8A 4NF8A 4QFOA 1YTVA 5LOMA 4OVJA 1XT8A 1MRPA 4QSDA 2O1MA 4F1VA 3CFXA 3VXCA 4JB7A 4WKMA 1OMPA 2OWSA 3OO7A 5IKBA 1SQYA 2O7IA 4BDQA 4RPOA 1LFGA 2H25A 1UIVA 3H6UA 2DP8A 4R6KA 3E3KA 3TTRA 1B4ZA 5H8HA 2VOZA 2WKYA 1US5A 5JTYB 2Q8JA 3HV1A 1WDNA 2XXRA 1UQWA 1M5BA 1UIUA 2ZYOA 4OXVA 1Z7NE 1B3EA 4KR5A 1FTKA 2IA4A 4NF4B 1SYHA 1PBQA 2DVZA 1CE2A 5L8DA 3KJTA 4Z0IA 5I2NB 3T9XB 4NWCA 1H44A 3LSFB 3S9NC 4HS7A 2X26A 4F3SA 4YKKA 5H8QA 3OENA 1UTHB 1IXIA 4ISUA 3O28A 4GRKA 1YCJA 2PT2A 5I2KB 2DYXA 2REJA 1WVJA 2XXUA 2M8CA 3C34A 4ZEFA 1MQGA 2BJJX 1FW0A 4YU0A 2V25A 5CC2A 1PEBA 1D9VA 4UA8A 3DP4A 4XTCQ 3IAZA 3ZKLA 3ZKKA 1ZMGA 3H6TA 3MVWA 1H3DA 3I5OA 4U4XA 4EQBA 1MXUA 4X1DA 3M8UA 1POTA 1PB7A 1GTKA 4RJZA 1DPPA 1SI0A 3IORA 3K6WA 2HAUA 2B3FA 3LUYA 4ONYA 4Q30B 3Q27A 1VE4A 4IO4A 1DPEA 1P99A 1B4HA 3CRBA 3MJNA 2Y7KA 3TUSA 2AIXA 5ELVA 4PETA 4JWYA 5FTIA 4EXKA 2THIA 3LC8A 1Q35A 2YPNA 4DXBA 1MXVA 5FHNA 1ELJA 1MXZA 1VFEA 4PP0A 4E0WA 1FQEA 4LATA 3MP6A 2VHAA 4RNSA 4L17A 1MXXA 3PUZE 1IEJA 2ZXTA 1GV8A 4ZE8A 2E1SA 3MW0A 1JVXA 1B1XA 2I0BA 1P1WA 2DOJA 3FVNA 3QUFA 2XD3A 3RUMA 3EF7A 3OD7A 3H6WA 4YMAA 2DSFA 4YICA 3FVOA 3SEUA 3SEYA 3BKIB 5H8FA 3RNNA 1URSA 1OQHA 4NMYA 5H8NA 1IUDA 2QRYA 4OERA 2OCUA 3UP9A 3V89B 5H8SA 4F39A 3TEPA 3C33A 4KI0E 5TPAB 5CMCA 3K6UA 4N13A 4RK2A 3FASA 2PT1A 4NF8B 2ANJA 1NFTA 3IB2A 4G4PA 3T9UA 5ISUA 2OBGA 5AA1A 4U23A 1VSOA 3FV1A 3OOAA 3G3GA 1DMBA 3LBSA 3O6HA 3RQTA 1RYXA 1B46A 4EF2A 1LFHA 4F22A 2ZNSA 5H8HB 2AL4A 5L9SA 3RGYA 1HSEA 5L9MA 4BDLA 2RC9A 4E0XA 3WAEA 1SW1A 2F34A 3ILTB 2LAOA 1B0HA 5ITOA 5FTHA 3PPOA 3SETA 4JWOA 4DE8A 5BUUA 3ILUB 2VD3A 1AMFA 3RN8A 5I59A 3KFMA 5HM4B 2DWAA 3USDA 4UACA 3QUJA 3CI8A 3H7MA 3M3LA 3T93B 1Y20A 1MDQA 4IO3A 1KWHA 2VD2A 3IB1A 5H8QB 1B2HA 3K0VA 2P0SA 3U92A 5M2VA 3VFJA 1FQBA 4ESXA 5AA2D 1OQGA 1H76A 1SI1A 4GWOA 3IJXB 3TMGA 3MC2A 1R9LA 4LUBA 1N0TA 1ANFA 1EZOA 2DS9A 3S9EA 2QJEA 1B7HA 3IR1A 2NUVA 4G8MA 5DTBA 2X7PA 1QUJA 1MM7A 3IOTA 1H45A 4NEDA 4JXIA 1OIBA 3HO7A 3RPWA 3B6QA 4PQJA 3IL1B 5DVIA 1D4NA 3C31A 2PBWA 2XXXA 1LCFA 3TPAA 3O6GA 2O68A 1FCKA 4BDMA 3QSLA 3PMVA 3I6VA 3PPNA 1PB9A 4OETA 4LVQA 3CSGA 1MDP1 2XX7A 1R1NA 1ZJLA 4RYAA 4ELRA 3S2VA 4YZZA 1WODA 3MQ9A 2QS1A 4ZDMA 2DWHA 2DWIA 1S50A 4IY5A 2ZNUA 1B58A 3GLBA 3TTNA 2GHAA 2PMSA 4LA9A 4BDRA 4P0GA 5L9OA 1MY0A 2YLNA 2A5SA 3PV0E 4PFWA 3Q29A 1A40A 4HW8A 4IB2A 4RXLA 1SW5A 2UXAA 4GXAA 2XXIA 3KBRA 4OZ9A 2V3UA 4EQ7A 2GH9A 1FQAA 4MH5A 4H6DA 1UTBA 4JSOA 1MY1A 1FTJA 2DVCA 4ZECA 1IXCA 2QS3A 1JQFA 5CMMA 4KQPA 3K00A 3MVXA 3MWBA 1Y1ZA 2I4CA 1TT1A 4G8NA 3K2DA 5AA3A 3HPIA 3PUWE 4G77A 4FAJA 2F8DA 1OVBA 3FXRA 2I4BA 1A7LA 2XXYA 4IGTA 5H8FB 4F19A 1NL5A 3EHUA 3CSBA 5H8NB 1BIYA 4F3GA 4YKJA 4XKNA 2XXVA 2O6AA 4F2OA 3G7WA 4OWDA 4POWA 4GIZA 5K2XA 3QYTA 2Z23A 3N5LA 4KHZE 1Y3NA 1MH4A 1P1UA 2W7YA 3G3KA 4C1UA 3IK6B 2F35A 3PPPA 1LFIA 4ZE9A 3KGCA 3U1OA 4MLVA 3UORA 1EH3A 2A5TA 3T9HB 2ONSA 4X1BA 4ZZEA 1N3WA 3RY3A 3IB0A 3ZS6A 3VLUA 5DVJA 4U21A 4JWXA 3KN3A 3IOUA 1AOVA 2CMOA 4O3AA 2IEEA 3TDJA 4IO2A 3FIRA 1DTGA 3TODA 4H0WA 4NWDA 3ECRA 2H5YA 4IO7A 3PPQA 4I9DA 4KCDA 4POXA 1USYH 3L6GA 4RA1A 1NH7A 4KYDA 1MH3A 1H43A 4NE4A 3K6VA 3JV9A 1USYE 1N3XA 3N94A 1II5A 1LAGE 5I59B 3VLWA 3HHGA 5DT6A 3VE1B 2KLFA 1PDAA 2R6GE 3PD9A 2VP1A 3TYHA 4K3FA 1M5FA 3TCGA 4G8HA 1LAXA 3SERA 1A55A 4BDNA 1JW1A 3W9WA 5ICTA 2UVHA 2ABHA 3K6XA 1LGBC 1NH8A 4JBZA 1AL3A 4EDPA 3O97A 2R9JA 4GD5A 4C0RA 3G3IA 2YJPA 2F7AA 2D21A 4XXUA 4NF6A 4R2BA 1URGA 1N84A 1M5EA 1JEVA 3RTWB 4OEUA 3VDFA 3EHTA 4EXLA 1SVXB 4NF5A 1HSLA 1LAFE 1ZU0A 1QUKA 4O3BA 4DIGA 4F3BA 1NNKA 1GVCA 1PBPA 5JK4A 2I6EA 3Q28A 4KPTA 3U8QA 5J1DA 2FYIA 1B05A 3TCFA 5A5XA 3SKPA 4WXJA 1B5IA 1EZ9A 2I48A 1PB8A 4Z7EA 1B1HA 1B3GA 1B0LA 4ZEBA 1MPBA 2Z22A 3K02A 3N6TA 3OSQA 3O6IA 3UGWA 3JYRA 2RF1A 2F78A 1M5DA 3PMWA 1I69A 4F31B 2F6PA 1IQ7A 3MZ9A 4GL8A 3OO6A 3OEKA 2O51A 5FHMA 4DDDA 5KZTA 1OVTA 3O66A 4LZ7A 4N6PA 1MXYA 4R6YA 2OWTA 3R26A 1JNFA 3PGFA 1FTMA 2ZNTA 1SW2A 4R2FA 3K1MA 1IZ1A 4FEDA 1IIWA 3C36A 2PX1A 4IGRA 2RC8A 2I3VA 4QHQA 2AL5A 1I6AA 2H9BA 3TZAA 2F7CA 3LR1A 1MQDA 4HCYA 2QL3A 4H5GA 2CZLA 5KDTA 1N7WA 3C32A 2Y7IA 4U22A 1Y1MA 1QULA 1OLAA 4ELOA 1MY3A 4OENA 1SBPA 1NNPA 4IO6A 2V3TA 3UK4A 4NF4A 3BFUA 3C35A 4C1TA 4EUOA 5AA2A 1BLFA 2XX8A 4R74A 1MPCA 3E13X 4XKRA 3MVZA 2A5TB 3FUZA 3V83A 3L6HA 1S9TA 1SD3A 4OFJA 3SEXA 4U2RA 3FJMA 3IOVA 3E4RA 4ELPA 4OQOA 1VR5A 2X7QA 4H5FA 3S9MC 2RC7A 2V93A 2XD2A 4LQ5A 2OLBA 2H99A 4H1XA 1US4A 2G93A 4DZ1A 3LSWA 4ZZAA 1IXHA 2O1LA 1P1NA 3TQLA 2QMWA 5IAIA 4QSEA 1MS7A 4MF3A 4GVOA 3T9VA 5DEXA 5K2YA 4OTEA 3M3FA 4ECFA 4JDFA 1PC3A 5BWJA 5CBRA 1Y4TA 5CBSA 3TAJA 4HTGA 3A3UA 1LLSA 4GFRA 1N04A 3OO9A 3OSRA 3MAMA 4AQ4A 3KEIA 1O7TA 2Z8DA 3JZJA 1BTJA 1T0KA 1ATGA 3TKDA 3IJOB 4H65A 2D3IA 3EHSA 4KCCA 3BFTA 2Z8EA 4HCWA 3CFLA 5JEIA 4GQOA 2GFEA 1I6QA 2XXWA 3U94A 3UA8A 1XS5A 5CRYA 4LZ5A 4OYVA 2DE4A 1QUIA 4DLDA 1MG1A 2HZKA 3D4CA 1S7YA 2ALUA 3FVKA 3M3KA 3ODBA 2F36A 4NF6B 1NMUA 3P7IA 3S9LC 2PVUA 3QAXA 1XHYA 2ESNA 4YAHX 1L5TA 3Q25A 2AYSA 4MFIA 2I0CA 1B3LA 2QS2A 4FJPA 2F97A 4IO5A 3MVYA 1Y3QA 3DLNA 1NKXA 1D3KA 3C4MA 1B9JA 2Q88A 3K1NA 3LSLA 1P1OA 3KSJA 3FVGA 2Y84A 3H06B 3KOTA 5CMBA 4R6HA 1A8EA 3QK6A 4LP2B 4TQUQ 5A5XB 1B5JA 1Q1KA 2XX9A 4FIMA 5I56A 4H8JA 2UVIA 5EHMA 2HEUA 1JVYA 5EYFA 2RCAA 3GBAA 5KCJA 1A54A 3B6TA 3VVEA 2QMXA 3SDFA 3KN8A 2E0SA 4Q5TA 3MZBA 1F9BA 2NOOA 4TLMB 1O63A 4WEPA 3TCHA 1YPNA 4KD5A 5CI5A 4OESA 4GOTA 3MUQA 3T22A 3DM0A 3KOSA 1OLCA 2Q2CA 4R73A 2UVGA 3KJ7A 3C9HA 4LZ8A 3VVDA 4R9GA 1XVXA 1AH5A 3A3CA 3QXMA 3SEWA 3FJGA 3KSXA 3HHFA 2ONKE 3VLVA 2V84A 3T96B 3U72A 3FXUA 4Q0CA 1R6ZA 4YKIA 5KDTB 3VVFA 2UYFA 5AA4A 4F2QA 5FHOA 5I57A 5TP9A 3S4UA 5HPQA 4AB6A 2F5XA 4GLIA 4FATA 1B52A 5CM6A 2NWJA 4LQ2A 4F1YA 1B5HA 1B7UA 5DYHA 1O64A 1N7XA 4OFLA 5AA2B 1B7ZA 4IY6A 1Y9UA 4YKPA 2NXOA 4G2ZA 2HCAA 3G3FA 3MBPA 5F7VA 4EF1A 4I8CA 1Z7ME 3CG3A 3TTLA 3E9XA 2UVJA 1QVSA 1MQIA 4R72A 3V5AA 4LONB 4DCXA 1FQDA 3O29A 3B6WA 3A09A 1ZKBA 2HZLA 3MP8A 1NNTA 3EQ1A 2QS4A 2H4IA 1NNFA 1B51A 2XHDA 1ZTYA 4GXSB 5DEXB 3N6UA 3H6VA 1QKBA 3DP6A 1CB6A 4ZEDA 1SYIA 3R7XA 4YMBA 4F29A 4TLLB 3CFZA 4YB5A 5B7DA 1J1NA 1MY4A 2DWJA 4QF9A 4DXCA 3PUYE 3K1PA 4QFPA 3TTMA 5EHSA 2XXTA 3FATA 3FGSA 4MLQA 4G68A 4R9FA 1AIVA 2B3BA 4PFYA 3PUVE 4ND9A 3IX1A 3LSXA 4YB6A 2GHBA 3GXAA 2I58A 4RY1A 2O69A 3GBBA 3CVGA 3IOWA 3G3HA 5CMKA 1YAEA 4EQ9A 4XIGQ 1TWYA 1RYOA 4ZS9A 3O9PA 1DSNA 3ONMA 2DE2A 4TOZA 4PE5B 5I58A 1SW4A 3TTKA 1TFAA 3RTFB 2UYEA 5B70A 4PFUA 1FTOA 4BDOA 1ZLQA 3CG1A 3OELA 2FNCA 2Q9TA 3KZGA 2VGQA 1Y3PA 1BKAA 3FV2A 1RKMA 1B3FA 3D4GA 4QFNA 4QFLA 1BP5A 1HSJA 4I1DA 4YB7A 3MZ1A 3TQWA 3RT6B 2XXPA 4DCYA 4ZEIA 4QFKA 4M1VA 2REGA 1EZPA 1QKAA 3PU5A 1M5CA 2Z8FA 3T66A 3ZSFA 1EU8A 2H98A 2RINA 3AXFA 1UTBB 2DXYA 2Q89A 5I56B 1LB9A 1LCTA 4FORA 2XXHA 3PPRA 4R75A 1LSTA 2ZMBA 3EN3A 5KCJB 3EPEA 5AE4A 3TELA 3THIA 1JEUA 4U4SA 4F3PA 1LBBA 1LB8A 4F1UA 4ESWA 3OXNA 3GZGA 5F1QA 1JETA 2F7BA 3N26A 1ZIUA 4ELQA 3W15C 5JTYA 3KG2A 4I62A 2OZZA 2OJTA 2PYYA 3H03A 4X48A 1GR2A 3MPLA 2HQ0A 1D9YA 1DTZA 1I6BA 1QJMA 4KYEA 3HN0A 2XXQA 3QIMA 5I2NA 4OFOA 1B40A 4FEBA 2P1SA 1MPDA 3BBRA 4RPNA 2Q2AA 3MPKA 4H8IA 4NTLA 4FECA 1ZBMA 1URDA 2DE3A 4M4GA 2ZYKA 3FZVA 4U1ZA 3CIJA 5AA4B 4X9TA 1A8FA 5I57B 1XC1A 5TP9B 2OK2A 2B65A 4N07A 1IITA 5I84A 1UTHA 2QPQA 3DELB 3HSTA 5I2KA 4H67A 1P1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P2AA 4MBPA 4G68C 1FQFA 2V3QA 1FTLA 2G29A 1FQCA 3SEVA 3KN7A 2RCBA 4PFTA 3WAFA 2O7UA 4FE8A 3TFLA 1N76A 2Y7RA 2NVUB 1QW0A 3FD3A 4OEVA 4QRZA 2P3NA 2HFBA 1DOTA 2I3WA 3RT8A 3RLFE 2Y7WA 3OEMA 3I3VA 1VFDA 1IMDA 3K4UA 4OHNA 2ZYNA 1B6HA 1XVYA 2QSXA 2I49A 3PTYA 2ONRA 3KC1A 4KYSA 3HCQA 1LAHE 1B3HA 1JW5A 1Y4CA 3ROJA 2F6GA 2BJIA 5DVFA 5ITPA 3D1RA 3MP1A 3MSTA 3PMXA 2HAVA 1GGGA 3U93A 1MXWA 4P11A 2Y7PA 4Q8RA 4GF8A 1XOCA 4RK9A 3PD8A 2R71A 3CR9A 1POY1 4JSDA 3V8XB 1B32A 4O3CA 3UIFA 3VV5A 5TU0A 1JP4A 2DXRA 2HXWA 3DP8A 3F11A 3G3JA 3R6UA 2V4CA 4NF5B 3K01A 2ZZVA 3LUZA 5HBCA 2RKMA 1IXGA 4P0IA 4G68B 2GRVA 1MY2A 4OMBA 4DXUA 1IMBA 1NUZA 5IZ3A 2D5WA 2FA7A 4XKPA 1R9QA 3B7DA 4ZEKA 1LBZA 4KFQA 3VXBA 4XKQA 4BLAA 2DQVA 3FJ7A 1SDXA 1MQHA 4QSCA 3O2AA 3OMBA 5I58B 1A99A 1JW4A 4NX1A 3FXQA 1TFDA 4WEDA 4N15A 4GL0A 3IO4A 4P8BA 1MQJA 2WBDA 3W9VA 5IGAA 1MM6A 3H4ZA 4U1OA 1LBCA 1TXFA 1FPLA 3UN6A 3SESA 5ICQA 3IO6A 3Q26A 4AB5A 3H3GA 4F18A 5TPAA 3PUXE 2O84X 4THIA 2ZYMA 3OO8A 4NF8A 4QFOA 1YTVA 5LOMA 4OVJA 1XT8A 1MRPA 4QSDA 2O1MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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