4QSDA

Crystal structure of atu4361 sugar transporter from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound sucrose
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter Atu4361 from Agrobacterium Fabrum, Target Efi-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 137
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qsdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qsdA02
4ECFA 4DXBA 3IO6A 1MQGA 5K2YA 3O9PA 3VV5A 3W9WA 4JXIA 4RPNA 3SEYA 2DXRA 3G3FA 2DOJA 2WKYA 4Z7EA 3ZKLA 5CC2A 1LGBC 4GWOA 4GRKA 3QUJA 4WXJA 3FJMA 3N6TA 4JWXA 1ANFA 3PPNA 3H6TA 3Q26A 4POWA 1I6AA 3OOAA 1P1QA 3I5OA 3D4CA 1B58A 3KSJA 4R9GA 1YAEA 4QFOA 4BDRA 4OWDA 2F7BA 3UA8A 1US5A 4F2QA 3RY3A 2ONKE 2HQ0A 3VVFA 4R6YA 5AA2A 5FTIA 4RYAA 2QS2A 3WAFA 5I2NB 1MPDA 1XS5A 5A5XA 1A8EA 5KZTA 2E0SA 3KG2A 4ND9A 4RXLA 4G4PA 4KFQA 1FQFA 3PU5A 1HSEA 4ELPA 5L9OA 1QULA 2F7CA 3S9MC 5CM6A 1QUKA 2XX7A 3DP4A 3FV1A 1B4ZA 1LB8A 2I58A 1PB7A 4IB2A 3SEXA 3TTKA 1UTHA 2ANJA 2QSXA 1M5EA 2OWTA 4WKMA 3PV0E 4RJZA 4AB6A 1MY3A 3QUFA 5IKBA 4JWOA 2RF1A 2H5YA 1US4A 3TTLA 3VVDA 3DLNA 4ZECA 2XXWA 1LAXA 3C4MA 2UVJA 1Y1ZA 3HSTA 5BWJA 3E4RA 4RK9A 3FVGA 2Y84A 1R9QA 4EQ7A 4MLQA 3FXUA 3QAXA 1B3EA 3SERA 1CE2A 2GFEA 5H8FA 3H6UA 1B5JA 4OETA 3LSXA 4OEUA 4FAJA 4OFOA 2ZNTA 2XX8A 1POY1 4HCYA 2F34A 1LAGE 3D4GA 3LSFB 2GRVA 3Q28A 4QSDA 1TWYA 4ZDMA 3MWBA 3FXQA 4NF8B 4NWCA 2W7YA 2F7AA 3RT8A 2RINA 1ZJLA 3IL1B 3TELA 1B7ZA 4EUOA 2RCAA 3SEWA 2O7IA 1B4HA 1IEJA 4I1DA 1PDAA 5L9SA 3M3KA 4R6HA 3K4UA 4GLIA 4KYDA 3TCFA 4DE8A 2XD2A 2HAVA 4AB5A 3ZSFA 5CBSA 3U94A 3T9HB 5I2KA 4H1XA 5H8NB 3Q27A 4NE4A 2PT2A 3C32A 1MPBA 4YB5A 2D21A 3PUZE 3VFJA 3PPRA 4LQ2A 3VVEA 3VLWA 4H5GA 1M5CA 3A09A 3U93A 3HCQA 1SI0A 4XKPA 1JETA 2PBWA 3MVZA 3U72A 1BKAA 1NH8A 3OEKA 4XKQA 2VP1A 1ZBMA 4F31B 3K01A 1B3FA 1S50A 1VSOA 5FTHA 3MUQA 3N5LA 4ISUA 4Q5TA 4FE8A 4KYSA 1B05A 2Y7RA 1MH4A 1GVCA 2R71A 2A5TB 3IO4A 4H0WA 1QW0A 1Y3QA 4GQOA 4NF6A 4YKPA 3KOTA 2A5SA 4BDLA 4UA8A 1N84A 5FHOA 1RYXA 1YTVA 1JEVA 1ZU0A 3KJTA 3MP8A 3TCGA 2B3BA 5ELVA 1R9LA 5EHMA 1XVXA 3TTRA 2XD3A 1MG1A 1P1NA 2QS3A 1DTGA 3OENA 3HV1A 2ZYOA 1P1OA 5J1DA 3ZS6A 2QMWA 3TTNA 1FW0A 1QUIA 3SEVA 4GIZA 1PB9A 5AA4B 4F3GA 2VD3A 1FTMA 5L8DA 3KZGA 4FECA 4GL0A 5ICQA 1PB8A 4QSCA 1NKXA 2YLNA 3JV9A 5F1QA 3C35A 3S4UA 2NWJA 3SDFA 3IOWA 3DELB 1B3HA 1EU8A 4QSEA 2D5WA 1Y9UA 3T9UA 5JEIA 4F1UA 4H6DA 4M1VA 3MBPA 3ONMA 4QFKA 3CFZA 4OFJA 2PT1A 3IOTA 3C31A 1D9YA 3MJNA 4G8NA 2UVGA 1GTKA 5I58B 4NEDA 3RGYA 1B46A 4OTEA 3E9XA 3A3CA 2ALUA 3PD8A 2ZMBA 3CFXA 5I59A 1UIUA 5M2VA 1MXXA 3EHTA 1QKBA 3I6VA 2QL3A 3K2DA 1FTKA 3MVWA 4IO4A 1R1NA 4P0GA 3KN7A 1SW4A 1A40A 3PPQA 4FJPA 4F3BA 5DVFA 5TPAB 4THIA 4LZ8A 4XKRA 1Y3PA 4G68C 5AA2B 1EZOA 2Z8EA 3G7WA 1N7WA 3QK6A 1URDA 1MDP1 4IY5A 3PGFA 4IO5A 5A5XB 3ILUB 5FHNA 2XXUA 1DTZA 3OELA 4XIGQ 4OFLA 1N0TA 3L6GA 1Y3NA 5HM4B 1LSTA 4R2BA 3OO7A 2KLFA 1SVXB 2O84X 2AIXA 2BJJX 2CMOA 1LBBA 4P11A 3V8XB 1UTHB 1B7HA 4EF1A 5HPQA 3H7MA 2UYEA 3LUYA 1UIVA 1MS7A 4EQBA 1MQJA 3Q29A 1IXIA 2DE3A 2IA4A 1A54A 2AL4A 2XXRA 4U4SA 4OERA 1FQEA 3MQ9A 4YMBA 4DDDA 4BLAA 2Q88A 1DOTA 1N76A 4QFNA 5H8FB 5TP9A 4HS7A 3GBAA 4DXUA 1SW2A 2DQVA 4ZS9A 3TUSA 3H6WA 3RNNA 5JTYA 1A7LA 2F97A 4G77A 1MQHA 3QIMA 3C9HA 2NOOA 4R72A 1TFDA 1MH3A 4X9TA 2Y7KA 1SDXA 2I3WA 3FZVA 3RQTA 4FEBA 4RPOA 4ZZAA 4F3PA 3P7IA 1EZPA 2DS9A 3S2VA 3FJGA 5H8HA 1MQIA 2XXYA 5KCJB 1MXWA 4MBPA 2XXHA 1URGA 4KCDA 2Y7WA 1H3DA 4F2OA 2ZXTA 2V84A 3PUWE 3O6GA 4X1BA 1LCFA 4ZEIA 4IO7A 3PPPA 3FGSA 2I3VA 3T66A 1S7YA 1SW5A 2O51A 2Z23A 3BFTA 3FVNA 3CSGA 1J1NA 2VD2A 1URSA 3R6UA 3IK6B 5IAIA 3N94A 5LOMA 2OBGA 4YKKA 3IB0A 4PFUA 1NH7A 4F19A 3BBRA 5K2XA 4BDNA 2D3IA 4FEDA 2THIA 2DWIA 5CMMA 1JVYA 3PD9A 1GGGA 3K6UA 3FVOA 3OO9A 4ZZEA 4H67A 2VGQA 3M8UA 3K0VA 3CR9A 5CMKA 2OLBA 1QJMA 2UVIA 1R6ZA 4YMAA 2I48A 3V89B 4RY1A 3UK4A 3PMWA 3MVYA 3TZAA 4IGRA 1USYE 3TDJA 2V25A 3CRBA 4X48A 5CRYA 2OWSA 3I3VA 3R26A 1AL3A 1EZ9A 2Q89A 4NF4A 4F1VA 5I2NA 3B7DA 3RTFB 2HZLA 3HN0A 4XKNA 1Y4TA 2NXOA 3E13X 1JVXA 3O6HA 4Q8RA 4GL8A 3FD3A 3Q25A 1PEBA 2O1LA 3F11A 4NF5B 4RNSA 3E3KA 3K1PA 3IR1A 4K3FA 3FJ7A 1FQBA 5F7VA 1SQYA 3VLUA 2FA7A 4BDMA 3SKPA 1ZTYA 2HEUA 5JK4A 3KSXA 1MDQA 3TYHA 3ECRA 1H45A 1ZLQA 1ELJA 2RKMA 4DCXA 3M3FA 1B9JA 1P1WA 4OZ9A 3EPEA 1N7XA 3DP6A 1II5A 2PX1A 4I9DA 4BDQA 2RC8A 4YB6A 3KN8A 4KHZE 3MC2A 3HPIA 3VLVA 3QYTA 2HFBA 3UGWA 3GZGA 4H65A 5CMBA 4IO3A 2F78A 4U21A 1OVTA 4U22A 5B70A 3UORA 3GXAA 1JW4A 3ODBA 2ABHA 2QS4A 4JB7A 4KQPA 1IZ1A 2ZYMA 1IQ7A 1NNFA 4LZ5A 3VE1B 3W9VA 1VFEA 2O7UA 5H8QB 4ELQA 4YB7A 1WDNA 3U8QA 1EH3A 2XXTA 3MAMA 3GLBA 1MPCA 3DP8A 3H06B 3U92A 4DZ1A 3G3JA 3UIFA 4U4XA 4H5FA 3A3UA 4AQ4A 3IOUA 4C1TA 1OMPA 2DWAA 3FIRA 3UN6A 4LUBA 3HHFA 5AA1A 1SI1A 1HSLA 4JSOA 2DWJA 1IIWA 1B7UA 1B6HA 3FXRA 4ZE8A 3IX1A 4TLLB 1M5DA 4OENA 3O29A 3B6WA 4IO6A 1XOCA 2QPQA 2XXVA 3EHSA 2R9JA 3K02A 4N6PA 2I0BA 5H8NA 4ZEDA 4GVOA 1OIBA 5ITPA 3S9EA 1FTOA 5DEXA 2I6EA 4LZ7A 4DLDA 3CVGA 4Z0IA 2UXAA 2AL5A 4QHQA 5I57A 2PVUA 1ZIUA 1OLAA 1P1UA 1O63A 1XC1A 5DYHA 4YAHX 3KGCA 3TEPA 1B52A 3SESA 3O66A 1RKMA 1Z7ME 5I56A 3JZJA 3LSWA 4ONYA 1UQWA 4IY6A 1NNPA 5L9MA 2UVHA 1O64A 3OSRA 1B2HA 4G68A 2HCAA 1VE4A 3JYRA 1B40A 5CBRA 1IXHA 3RTWB 3T96B 1TFAA 1I6QA 3AXFA 3C36A 4TLMB 4OQOA 5FHMA 3CFLA 3TAJA 2OCUA 3KJ7A 4KCCA 5AA2D 3N26A 3MZBA 2H9BA 4M4GA 4U1ZA 4QRZA 2ONRA 1OQGA 5BUUA 2QRYA 5JTYB 4DCYA 2Q9TA 3DM0A 1M5BA 4OMBA 3LSLA 3KEIA 1B1HA 1CB6A 3LR1A 5EYFA 2QJEA 4O3BA 2P0SA 2HXWA 5AA4A 1ATGA 1H43A 2QS1A 2ONSA 1Z7NE 3C34A 3S9LC 4O3CA 4PETA 4TQUQ 4KD5A 1JNFA 4JBZA 3VDFA 4GXAA 4POXA 1PBPA 1B51A 4OVJA 4KI0E 1PBQA 4LONB 1YCJA 1UTBA 1O7TA 4FORA 3MVXA 1JQFA 2OK2A 3OO8A 3K6XA 4PFWA 1FQCA 4BDOA 3IB1A 2DWHA 4ELOA 3G3KA 5AA3A 4R74A 1TXFA 4MLVA 4F22A 3TQWA 1F9BA 5H8SA 5CI5A 3VXCA 1N3XA 2REGA 2NUVA 3MZ9A 5AE4A 4X1DA 5I58A 4YU0A 4O3AA 5KDTA 1MM7A 4DXCA 1T0KA 1BTJA 4G8HA 2H25A 2OJTA 1TT1A 3EQ1A 4U23A 2X7QA 4QFLA 1S9TA 3TTMA 1OQHA 1AOVA 4N13A 1MY4A 4H8JA 2P1SA 5DVIA 5TU0A 3PUVE 1VR5A 2IEEA 4RK2A 3THIA 1GR2A 1LAHE 2DVZA 3PUYE 1SD3A 2XHDA 5TPAA 1P99A 2PYYA 4F29A 4YZZA 1MY2A 2Y7PA 3O97A 3V83A 1I6BA 2Z22A 1DSNA 1IXGA 4HTGA 4NF4B 2ZNUA 1XT8A 2G93A 4LVQA 1XHYA 3O28A 4F1YA 3OSQA 1Q1KA 1B1XA 3IJOB 2I4BA 2P2AA 4L17A 2VHAA 5B7DA 4E0XA 2DSFA 3T93B 1BLFA 1AIVA 3GBBA 1IUDA 3KBRA 3O2AA 1MY0A 4OXVA 4ZEFA 3CI8A 1SYIA 2X7PA 5I2KB 2XXXA 4JSDA 1MY1A 1LCTA 1HSJA 1MM6A 1B0HA 1RYOA 1BP5A 3FV2A 4GF8A 1OVBA 4Q0CA 5HBCA 3K1NA 3CG1A 2CZLA 3OD7A 4NMYA 4NTLA 5CMCA 2XXIA 4R75A 3M3LA 3CSBA 1MXYA 4QFPA 3LC8A 3TODA 1NNTA 2DE4A 5DVJA 4ZEKA 3N6UA 4U2RA 2Z8DA 4OHNA 4PFTA 1PC3A 1IXCA 2VOZA 3OXNA 2R6GE 1MRPA 1B5IA 3MPKA 1MXVA 3W15C 1QKAA 3MP6A 1JEUA 3BFUA 2FNCA 3ILTB 4ZE9A 4GXSB 1FQDA 4ESXA 4NF6B 3OO6A 3T22A 4LA9A 1H76A 3UP9A 3IORA 2Q2CA 4G2ZA 3ZKKA 4EXKA 4E0WA 2OZZA 1DPPA 3G3IA 2QMXA 4PP0A 2GHAA 4OESA 3IOVA 2H99A 2ZYKA 2H4IA 2YPNA 3KOSA 4QF9A 5EHSA 1DMBA 4F39A 3EHUA 2F35A 4EDPA 4EXLA 2ZNSA 3RLFE 2RC9A 1SYHA 1A99A 1LB9A 3FATA 5KCJA 2PMSA 2B65A 1FCKA 3FVKA 3TMGA 4XXUA 4MFIA 3TCHA 2I0CA 4PE5B 1POTA 2V3QA 5DEXB 3USDA 1FTLA 2F8DA 3OEMA 1D4NA 2Q8JA 2I49A 2H98A 5I57B 1H44A 3SEUA 1GV8A 1M5FA 3T9XB 2M8CA 3MP1A 4C1UA 1LFGA 4IO2A 1NL5A 4I62A 2GHBA 4JDFA 4YKJA 5I56B 3O6IA 4PFYA 4OYVA 3MW0A 4FIMA 4R2FA 3V5AA 4LATA 3TPAA 2X26A 3CG3A 3RPWA 3PUXE 5I59B 2REJA 4NF8A 2V3TA 1N3WA 4DIGA 4UACA 1KWHA 4G68B 3PMXA 3SETA 1JW5A 1NFTA 4GFRA 2NVUB 3T9VA 3K00A 1LFHA 3KN3A 2I4CA 3MPLA 5DT6A 2O69A 1VFDA 1I69A 4P0IA 1LBCA 2Y7IA 3PMVA 3S9NC 5ISUA 4WEDA 3OMBA 3RN8A 5ICTA 2LAOA 4R9FA 1ZKBA 3TQLA 1FTJA 4WEPA 1IITA 3TKDA 4KR5A 3FUZA 4NF5A 1SW1A 4KYEA 4F3SA 1WODA 1Y20A 2ZYNA 5I84A 1NNKA 2ESNA 1JW1A 3FASA 3HHGA 4F18A 1DPEA 3VXBA 3K6VA 1MXZA 1USYH 3B6TA 3EF7A 4R6KA 2XX9A 4PQJA 1XVYA 3EN3A 1Q35A 4H8IA 1UTBB 3PPOA 3RUMA 5ITOA 1N04A 3BKIB 4KPTA 4LP2B 4R73A 1YPNA 2XXQA 2F36A 1L5TA 1A8FA 2V3UA 2UYFA 2F6PA 4MF3A 2DYXA 4FATA 2G29A 1B5HA 1ZMGA 1A55A 2F5XA 2RCBA 2DE2A 2AYSA 3R7XA 3LBSA 1BIYA 4ESWA 5KDTB 2A5TA 1B3LA 4I8CA 3IAZA 2HZKA 2RC7A 4MH5A 4YICA 3MZ1A 3K6WA 5TP9B 3CIJA 2O68A 4XTCQ 4ELRA 4N07A 2F6GA 3KFMA 3H4ZA 5H8QA 1LFIA 2O1MA 1LAFE 2E1SA 2Q2AA 4JWYA 4OEVA 3HO7A 2XXPA 1Y1MA 1FQAA 3G3HA 4Q30B 4YKIA 4GOTA 2DXYA 4LQ5A 1AH5A 4HW8A 2DP8A 1B32A 1MQDA 3H6VA 1NMUA 4IGTA 3C33A 2GH9A 1QVSA 3G3GA 2HAUA 1LLSA 5H8HB 3K1MA 3QSLA 2YJPA 1MXUA 4RA1A 3IB2A 1B0LA 4GD5A 4C0RA 1AMFA 1Y4CA 3QXMA 4HCWA 1B3GA 2V93A 4G8MA 1D9VA 3L6HA 2O6AA 4TOZA 5DTBA 4EQ9A 1QUJA 2B3FA 3U1OA 3TFLA 1OLCA 3H3GA 2Z8FA 2FYIA 3WAEA 3H03A 3IJXB 4EF2A 1WVJA 4U1OA 4ZEBA 2DVCA 1D3KA 1SBPA 3B6QA 3RT6B 4NWDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ECFA 4DXBA 3IO6A 1MQGA 5K2YA 4I40A 3O9PA 3VV5A 3W9WA 4JXIA 4RPNA 4NAPA 3SEYA 2DXRA 3G3FA 2DOJA 2WKYA 4Z7EA 3ZKLA 5CC2A 1LGBC 4GWOA 4GRKA 3QUJA 4WXJA 3FJMA 3N6TA 4JWXA 1ANFA 3PPNA 4PDHA 3H6TA 3Q26A 5I3SA 4POWA 4GX6A 1I6AA 4NHBA 3KC1A 3OOAA 2KR0A 1P1QA 3I5OA 3D4CA 5IGAA 1B58A 3KSJA 4R9GA 1YAEA 4QFOA 4BDRA 4OWDA 2F7BA 3UA8A 1FPBA 1US5A 4F2QA 2Q74A 3RY3A 2ONKE 2HQ0A 3VVFA 4R6YA 2VPNA 5AA2A 5FTIA 4RYAA 2QS2A 3NOHA 3WAFA 5I2NB 1MPDA 1XS5A 5A5XA 1A8EA 5KZTA 2E0SA 1LBYA 3KG2A 4ND9A 4RXLA 4G4PA 4KFQA 1FQFA 3PU5A 1HSEA 4ELPA 5L9OA 1QULA 2F7CA 4JVIA 3S9MC 1NUZA 5CM6A 1QUKA 2XX7A 3U65A 3DP4A 3FV1A 1B4ZA 4IR8A 1LB8A 2I58A 1PB7A 4IB2A 3SEXA 3TTKA 1UTHA 2ANJA 2QSXA 1M5EA 2OWTA 4WKMA 3PV0E 4RJZA 4AB6A 1MY3A 1FPIA 3QUFA 5IKBA 4JWOA 2RF1A 2H5YA 1US4A 3TTLA 3VVDA 5EQ7A 3DLNA 4ZECA 2XXWA 1LAXA 3C4MA 2UVJA 1Y1ZA 3HSTA 3EKIA 4MCOA 5BWJA 3E4RA 4RK9A 3FVGA 4AS5A 1NUXA 2Y84A 4N15A 1R9QA 1IMDA 2B4MA 1JP4A 4EQ7A 4MLQA 3FXUA 2ZZVA 3QAXA 4H46A 2CZKA 1B3EA 3SERA 1CE2A 2GFEA 5H8FA 3H6UA 1B5JA 4OETA 4NG7A 3LSXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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