4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule tags Signaling protein
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
2YK2A 3E4OA 3H7WA 2PR5A 5CTWA 4HYMA 4P8OA 4XCJA 4MPEA 3OLOA 4HP4A 4RQ9A 1XJ3A 3SW1A 2B02A 1WA9A 2L1MA 4HZ5A 5DJUA 1Z5AA 4DUHA 4XC0A 2XX5A 2XK2A 3B33A 2BTZA 2BASA 2BU5A 1KOUA 5F3KA 4ZKIA 2YKEA 4LRXC 3CWFA 2YEEA 1MZUA 4LPZA 3A0TA 4CE1A 5IU1A 4EQ1A 3LIBA 3E4QA 3H82A 1YC3A 4YKZA 2H28A 2YEIA 5TBMA 2WKQA 4WN5A 4WLAA 3GIEA 2IWXA 4EEPA 1T1CA 3MXQA 5F5YA 4EEHA 5D6PA 4BIUA 4GS9A 4MBCA 3B28A 3F1PB 3OW6A 1TBWA 2XDKA 5G4ZA 1ID0A 4YKRA 3VHCA 4AWPA 4H6JA 1OJGA 2JJCA 4MN6A 3ZXQA 1UYLA 1YESA 3EKRA 3CLOA 2YI7A 1S14A 3TZ2A 4MP7A 1UWPX 1YT1A 2VCJA 3Q5KA 4O04A 1UYDA 3K60A 3QTFA 5DKLA 4CWNA 3NMQA 2XDUA 1TILA 2VEAA 1AH6A 3CWVA 4LWFA 3D36A 3C0EA 3H80A 3HYYA 5HWWA 2YE3A 1LL8A 2YEFA 3INXA 5HWTA 1DRMA 1EA6A 2PNRA 2WI6A 3HJKA 4KQVA 4CWRA 2VCIA 4NH8A 1EI1A 3U67A 4EGIA 2JHEA 4HI4A 3EEHA 3HZ1A 3NOPC 4HH2A 4NXBA 3HZ5A 3DGEA 1TIDA 2QJ7A 1AH8A 2XX2A 5CTXA 3FG8A 3HJIA 2PHYA 2YE5A 1UY8A 4EM7A 5HD3A 2YEBA 3EHGA 4LWGA 4WUCA 4CWOA 3F1OB 1QYEA 4R70A 2ZOIA 3VE4A 4KP4A 3H9WA 3R4MA 4XE2A 1U0ZA 1GSVA 4KTNA 3WQ9A 1THNA 4URNA 3EHJA 1DP6A 2IOQA 4E04A 2YGAA 4LWIA 1UY9A 2ZOHA 4EESA 2YJXA 2XDLA 4MPNA 2YEGA 2A24B 1I5DA 4HY6A 2UWDA 1P0ZA 1NWZA 3F1PA 1MX0A 3PEHA 4BBVA 4CWSA 5AVFA 1KZNA 4BBUA 2V0UA 2YKFA 1LT0A 5DKKA 2L4RA 1B3QA 4FCQA 2YGFA 5IDMA 4KFGA 2H8MA 2EXLA 2W0NA 4HIAA 2YEAA 4XIQA 1BYWA 1XJ2A 5HDCA 2WI7A 3KE6A 1JM6A 4BQGA 2Q8GA 2FWZA 1UWNX 3GDIA 3UMDA 3UB8A 1TC0A 3K97A 1LSVA 1UYMA 2CCSA 3HEKA 4BXIA 3H82B 4WUDA 5CTYA 4EGKA 4MN5A 5TBMB 3EWKA 1Y4UA 2XDXA 2ZBBA 4XKOA 1TS8A 4R38A 4NH9A 4LLOB 1UYHA 3OPDA 3R4PA 3NJAA 4U7OA 5AVEA 3G7EA 3F1OA 2WEPA 4DZYA 3WHAA 4H6JB 4GEEA 2K5BA 3C2WA 4B9OA 3ZKDA 5M4HA 1R62A 4ASBA 2VW5A 2O1VA 4KSGA 1N9NA 4L94A 3T10A 3A0VA 2CGFA 3K99A 2A24A 4GQTA 4URMA 5J71A 2YKCA 4R1FA 5HDSA 1KIJA 2YKBA 2IOPA 3A0XA 4Q20A 4JASA 5M4KA 5C93A 2BU8A 2YI5A 2OWJA 3RH8B 3Q5LA 4E02A 5J3WA 2BYIA 1I5BA 1GSXA 2OWHA 4HHDA 4R3AA 2BU2A 2O1WA 4LWHA 3G6OA 3LIAA 4MPCA 4XIRA 1I59A 2GQPA 2E0AA 3MQOA 4L9EA 3VHDA 4O0BA 2XJJA 5HWVA 1UYCA 2YI6A 4L91A 3TZ5A 3A0ZA 3FT5A 2INWA 4YKWA 1BKNA 4YWZA 3T0HA 1XFQA 2PD8A 4PL9A 4MB9A 4W7TA 3IBRA 1ODVA 1YT0A 5D6QA 3U2DA 3QDDA 2V0WA 1GSWA 1YS3A 1Y28A 1YC1A 5IN9A 3F1NB 1OSFA 3O0IA 3TUHA 1X0OA 4PRVA 2YE4A 1B62A 3CRLA 2VV7A 4JQLA 1D7EA 1GKXA 2QJ5A 4U93A 4GFNA 5D7RA 1AMWA 4KSHA 2K7SA 3ZKBA 1XJ4A 3K3CA 1PVGA 4PKYA 1Y8OA 2XABA 3T0ZA 2GJ3A 3E4PA 4WL9A 1F98A 5J7EA 3D2RA 1GJVA 4HY8A 3ICYA 2OOLA 5CF0A 4B6CA 1NHHA 5F68A 5FWKA 4GHIB 1ZXNA 4AWQA 2BU7A 4L9FA 4ASFA 3OWBA 2IORA 1NHIA 2V1BA 4JGOA 2YI0A 4LP0A 4LRYC 1OT6A 1DP8A 3SL2A 1YC4A 4HY1A 3KX0X 4YKQA 2BZ5A 4LWEA 5D7DA 5FNCA 4I38A 5HZHA 4XT2B 4EW7A 4XIPA 3UB7A 4L90A 2XHXA 3NOUC 1UYIA 1BGQA 3D72A 5I5LA 4HP9A 2D01A 2YE2A 3GECA 3HYZA 4NH7A 4F3LB 5M4NA 2CCTA 3LUQA 3LPSA 3F1NA 2YK9A 2XHTA 4BIZA 3R4OA 1L0OA 1ZWHA 2IWSA 5J6AA 2EA9A 5FNFA 3VHAA 5DJTA 5J4EA 4HXWA 1T1BA 1QZRA 2AKPA 1BYQA 1TC6A 5L3JA 2WI5A 2VV6A 2XCMA 3VE3A 2QG2A 5F6AA 3BM9A 2XJXA 1H7UA 1S1ZA 1I5CA 4JAUA 4QPJA 1UYEA 3PHYA 4XCLA 5HSQA 2YE8A 4GHIA 2YEHA 4L9GA 2WKPA 4M4XA 1UY6A 4GCZA 2YE7A 2WI3A 2V1AA 1Z5CA 1LSXA 1F9IA 1G28A 2W27A 2CMNA 2VV8A 5IS1A 2HKJA 2Q2EB 2XJGA 4KQDA 1T1AA 2PYRA 3LYXA 4EXOA 1AJ6A 4AWOA 5M4PA 1OT9A 5A8BA 3EHFA 3C8CA 4QPKA 1MU5A 4UROA 3B24A 2V9AA 4HH3A 4XT2A 2FYPA 3RTYA 4E01A 2YKIA 4CE3A 4DJ3A 4HQAA 2Z6DA 1OTDA 5F5RA 4HJ6A 4EMVA 3MR0A 1P97A 2QG0A 2YEJA 4E00A 5M4EA 3BY9A 4F3LA 2BSMA 2BYHA 5CPHA 1B63A 3BMYA 2HV1A 1H7SA 2BRCA 4O09A 5HDDA 2Q8FA 1I5AA 3ZXOA 3R92A 4CE2A 2ZKJA 4FCRA 4GW9A 1NHJA 4X9LA 2JN7A 4I3AA 1EW0A 1TH8A 3G75A 1DP9A 4CWPA 4HJ3A 3UMEA 3JZ3A 3RKZA 3K98A 2I9VA 4I5SA 3Q5JA 4K08A 2PYPA 2HG1A 4H81A 1YETA 2GFDA 2BREA 1TS0A 4JGPA 2YECA 4ASGA 4O07A 5BODA 2ZDYA 1T19A 4YKXA 2Q8IA 2O1UA 3B27A 1I58A 4CWQA 5IDJA 4ZVIA 4PKYG 2XX4A 2CCUA 1YSRA 3UB9A 1YT2A 3R4NA 2D02A 1Z59A 3T1KA 3HHUA 3FV5A 3LNUA 4HJ4A 3FC7A 1AM1A 1US7A 3H4LA 3CGYA 1S4SA 3U2KA 2KDKA 2WEQA 3MQQA 4HNBA 2CG9A 4MOTA 1UYGA 2Q8HA 1GKZA 1ZW9A 4CWTA 3LICA 5F69A 3TTZA 4XKKA 1UGUA 3OMUA 4GT8A 2YKHA 3TZ4A 1S16A 4FPPA 1YERA 4B7PA 3LI9A 3RLRA 4CWFA 3CAXA 2QFOA 4P7AA 5FNDA 2C2AA 4I3HA 3P7NA 5HD5A 2FWYA 2YE9A 3MNRP 2XHRA 3ULFA 3A0YA 3IS2B 4U7NA 2YKJA 1T18A 4EEUA 4O05A 1VB6A 3BY8A 4ASAA 2QHKA 4I3JA 4H7QA 2PD7A 4I39A 2CH4A 1V9YA 1Y4SA 4XTJA 2VLGA 3LIEA 4HYPA 4EFUA 1TS7A 2KX6A 2M1CA 4URLA 3MJQA 1JNUA 4XDMA 4NXEA 3LIDA 3ZM7A 3MFXA 5CTUA 4BBTA 2HCHA 3CGZA 3G7BA 3D0BA 1OTAA 2IWUA 4WUBA 3UB6A 2WI2A 4XITA 4BQJA 4LRZE 1V9ZA 4H85A 1UYKA 4YKYA 4L93A 2Z6CA 2VWCA 1BXDA 4KUOA 1U2OA 3BWLA 3LI8A 3NOTC 4WUJA 4DJ2A 2PR6A 1A4HA 1TS6A 2L0WA 2QF6A 1N9LA 4R3MA 5D7CA 3R91A 1S1YA 3NHQA 3IEDA 3A0RA 2ZDXA 3PEJA 1QY8A 2YJWA 3INWA 4EGHA 3EKOA 3LIFA 3EHHA 4PRXA 4NXGA 5M4MA 1ZXMA 2ZBKB 4BAEA 1D06A 2PDRA 2YEDA 3GIGB 4XD8A 4FMTA 3T50A 4PU9A 2WKRA 4NXFA 2J80A 4EFTA 1OTBA 4V25A 4HZ0A 2QWSA 3CRKA 3RLQA 3IS2A 1OTEA 4V26A 4EERA 1S66L 1OJ5A 3H7WB 1Y8PA 2WI1A 2H55A 3A0WA 4HXZA 4K4OA 3ZQ5A 3PYPA 2WI4A 2XD6A 1XFNA 4L8ZA 3VOLA 2XDSA 2JKIA 3C11A 3RLPA 1XJ6A 4EETB 4WF0A 3OWDA 4AS9A 5GGZA 4FCPA 1UYFA 3O6OA 4YKTA 1UY7A 1S4RA 1OTIA 1S67L 2P7JA 2QKPA 5EFWA 2R78A 2YE6A 4YKUA 3GIFA 5BOCA 1N9OA 5KIZA 4JGQA 1YSZA 2YGEA 3TZ0A 3VADA 3O2FA 3K3DA 4XKAA 4GGLA 4I3IA 1Z5BA 4JAVA 2BU6A 4LPBA 3T2SA 3FT8A 4GS9B 4JGRA 2ESAA 2BT0A 4HOIA 3B26A 3A0SA 4KUKA 3GIGA 5G4YA 3UE6A 1LSWA 3B25A 4MP2A 1Y8NA 4R6LA 2WERA 2FXSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V3RA 3TW8A 4O0PA 4BD1A 1E3UD 2PR5A 3SZTA 3K2NA 5CTWA 4P8OA 4S2NC 5F82A 3WRTA 4EUVA 1HZOA 4RQ9A 3PAEA 3MXRA 4QHCA 3SH8A 2E8JA 4HZ5A 1SKFA 1E4DA 2BASA 3IF6C 3MS6A 3O87A 1PWGA 3G31A 2EWVA 1F2KA 5F3KA 4ZKIA 3CWFA 4OH0A 1MZUA 3GRJA 5IU1A 4EQ1A 3EEAA 4OOMA 4IEDA 4YKZA 1CF0A 3NDEA 5TBMA 1HVBA 2EFUA 4R3BA 1VEUB 4QWOA 4BIUA 5CRFA 5CGWA 3B28A 4DDSA 4K0XA 5G4ZA 4MBKA 4YKRA 4AWPA 4H6JA 1OJGA 5FDHA 4MN6A 1UYLA 1CI8A 1S14A 3TZ2A 4MP7A 3D4FA 2ZQCA 5FQQA 1YLYA 3K60A 4CWNA 1YSPA 1YMXA 5TGFA 3WS5A 3C4PA 3C0EA 1P9RA 1LL8A 1DRMA 4KQVA 2ZMVA 4NH8A 3LR4A 4NG2A 2QJ7A 1AH8A 3LY3A 2XX2A 5CGXA 3FG8A 3HJIA 2PHYA 2YE5A 2ZC4B 4G3VA 3ZNTA 4KP4A 4Q0IA 4XE2A 3O3VA 3DWKA 2PT7A 1FR6A 1THNA 4S2MA 2X01A 4P87A 1UY9A 4EESA 4GDBA 2RCXA 3NECA 2YEGA 2XD1A 3R7WB 2UWDA 3LEZA 1VETA 1NWZA 3F1PA 3S22A 2O9AA 1MX0A 4BBUA 5DKKA 1B3QA 1YLZA 3HLEA 1ALQA 4NKPA 4DE1A 2Y2JA 2W0NA 4E3MA 3V5MA 3ZG0A 4AFIA 4O7DA 2V1ZA 3QP4A 3ZDJA 3PBSA 3K97A 2GDNA 3CITA 5M18A 1UYMA 3HEKA 3HLGA 4X55A 4EGKA 4MN5A 5TBMB 1Y4UA 4KG5A 1TS8A 4R38A 4KQOA 1STZA 2ZQDA 4RX3A 4X6TA 1FR1A 4DZYA 4H6JB 4C75A 3ZKDA 3C2WA 3NBLA 4B9OA 1TDLA 5J8XA 4ASBA 4LV2A 2O1VA 1N9BA 3A0VA 2CGFA 5J71A 4Y13A 1BLSA 4Q20A 5M4KA 4EU0A 2YI5A 3BFGA 4JKTA 3EGDC 2BYIA 1I5BA 4HHDA 1JTDA 3LIAA 5EVIA 3OZHA 5CEBA 4MMNA 3UO9A 2GQPA 4FUWA 4L9EA 3VHDA 5HWVA 4JLFA 1UYCA 2YI6A 2OLUA 4YKWA 2P9VB 4MLLA 3AGFA 3EGXC 1JWVA 2JC7A 4MB9A 1ODVA 1YT0A 2Y91A 4X56A 1YC1A 2PU2A 3IF6B 1X0OA 1XGIA 2XDMA 2YE4A 5DF7A 4PRVA 4Y0UA 2VV7A 1D7EA 4OLDA 3NY4A 4OPRA 1AMWA 2W1TA 3PTEA 3ZKBA 5F83A 3Q7VA 4ZDXA 2WKHA 5CXWA 3D2RA 1MY8A 3ICYA 2HF6A 4JXSA 2QZ6A 3PBTA 3T4LA 4CQHA 2ZM0A 4EBNA 2K2NA 1NHIA 4HY1A 1GHMA 1W63M 1CK3A 2BZ5A 5EOOA 4LWEA 2XA7M 4E3LA 1KVMA 4P6BA 5HZHA 2J3TD 2ZQ7A 2XHXA 1MWUA 1UYIA 1KVLA 1NRJA 1IKIA 5TFQA 3HYZA 2XHTA 2Y79A 5FNFA 4C3QA 3VHAA 5J4EA 4HXWA 3HUMA 3LCEA 1FQGA 2XCMA 1MPLA 1K54C 1I5CA 2Y2MA 1MC0A 3PHYA 1JWZA 4OOYA 3U4LP 3N8LA 1UY6A 4GCZA 2HDUA 5IS1A 2XJGA 5AQAA 4UQIM 2PYRA 4DMZA 1K0KA 4Y2FA 2HPBA 1OT9A 3EHFA 4QPKA 3C8CA 3VOZA 4UROA 4EV4A 3A3IA 2WGWA 4XT2A 1SZVA 2FYPA 5E2GA 4E01A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1Y4S A;  4XTJ A;  2VLG A;  3LIE A;  4HYP A;  4EFU A;  1TS7 A;  2KX6 A;  2M1C A;  4URL A;  3MJQ A;  1JNU A;  4XDM A;  4NXE A;  3LID A;  3ZM7 A;  3MFX A;  5CTU A;  4BBT A;  2HCH A;  3CGZ A;  3G7B A;  3D0B A;  1OTA A;  2IWU A;  4WUB A;  3UB6 A;  2WI2 A;  4XIT A;  4BQJ A;  4LRZ E;  1V9Z A;  4H85 A;  1UYK A;  4YKY A;  4L93 A;  2Z6C A;  2VWC A;  1BXD A;  4KUO A;  1U2O A;  3BWL A;  3LI8 A;  3NOT C;  4WUJ A;  4DJ2 A;  2PR6 A;  1A4H A;  1TS6 A;  2L0W A;  2QF6 A;  1N9L A;  4R3M A;  5D7C A;  3R91 A;  1S1Y A;  3NHQ A;  3IED A;  3A0R A;  2ZDX A;  3PEJ A;  1QY8 A;  2YJW A;  3INW A;  4EGH A;  3EKO A;  3LIF A;  3EHH A;  4PRX A;  4NXG A;  5M4M A;  1ZXM A;  2ZBK B;  4BAE A;  1D06 A;  2PDR A;  2YED A;  3GIG B;  4XD8 A;  4FMT A;  3T50 A;  4PU9 A;  2WKR A;  4NXF A;  2J80 A;  4EFT A;  1OTB A;  4V25 A;  4HZ0 A;  2QWS A;  3CRK A;  3RLQ A;  3IS2 A;  1OTE A;  4V26 A;  4EER A;  1S66 L;  1OJ5 A;  3H7W B;  1Y8P A;  2WI1 A;  2H55 A;  3A0W A;  4HXZ A;  4K4O A;  3ZQ5 A;  3PYP A;  2WI4 A;  2XD6 A;  1XFN A;  4L8Z A;  3VOL A;  2XDS A;  2JKI A;  3C11 A;  3RLP A;  1XJ6 A;  4EET B;  4WF0 A;  3OWD A;  4AS9 A;  5GGZ A;  4FCP A;  1UYF A;  3O6O A;  4YKT A;  1UY7 A;  1S4R A;  1OTI A;  1S67 L;  2P7J A;  2QKP A;  5EFW A;  2R78 A;  2YE6 A;  4YKU A;  3GIF A;  5BOC A;  1N9O A;  5KIZ A;  4JGQ A;  1YSZ A;  2YGE A;  3TZ0 A;  3VAD A;  3O2F A;  3K3D A;  4XKA A;  4GGL A;  4I3I A;  1Z5B A;  4JAV A;  2BU6 A;  4LPB A;  3T2S A;  3FT8 A;  4GS9 B;  4JGR A;  2ESA A;  2BT0 A;  4HOI A;  3B26 A;  3A0S A;  4KUK A;  3GIG A;  5G4Y A;  3UE6 A;  1LSW A;  3B25 A;  4MP2 A;  1Y8N A;  4R6L A;  2WER A;  2FXS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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