4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
4E04A 3ULFA 4URMA 4JAVA 5HD5A 3UB7A 2V9AA 1GSVA 2CCTA 4FMTA 4X9LA 2BZ5A 1U0ZA 4ASGA 4NH9A 2IWXA 4MN5A 3HYYA 5FWKA 5HDCA 4EETB 3IS2A 1XJ4A 3D36A 4H81A 3RTYA 2YKJA 5D6QA 4LPZA 1JM6A 5F3KA 5DJTA 5F69A 3B27A 3VHAA 1ID0A 3K97A 3RLQA 2PD7A 1I5BA 3GIGB 3MQOA 1ZXNA 2EXLA 2Z6CA 1X0OA 4KUOA 5HWTA 4WUDA 4M4XA 4YKYA 3LIFA 3IS2B 5M4NA 4WUBA 4I3IA 4YKWA 5A8BA 1D7EA 2K5BA 3PEJA 2BU6A 3QTFA 1BXDA 5J7EA 5IDJA 1U2OA 4GFNA 3Q5KA 1JNUA 4L9FA 2EA9A 4XIPA 3B24A 3T0ZA 2O1WA 4ZKIA 3DGEA 3HJKA 4JAUA 4MB9A 4YKQA 1UY7A 3ZKDA 3BMYA 1I5AA 2UWDA 4DZYA 2ZDXA 1OSFA 4BQGA 1OTAA 4LP0A 1UY9A 1YC3A 3ZXOA 2I9VA 4CWRA 3U67A 5F6AA 1S16A 4EFUA 2YK9A 1DP6A 4EGIA 2D02A 3K3DA 1S4SA 2H8MA 3LI9A 5I5LA 4XKKA 4V25A 2PR6A 4CWTA 4CE2A 4HOIA 2VV6A 1B62A 5D7CA 1BKNA 4EGHA 1XFQA 4EQ1A 1S4RA 5G4YA 4I3HA 4LWHA 3TZ4A 4CWNA 5HSQA 1TS6A 1P0ZA 4BBTA 1H7SA 4DJ2A 4FPPA 4YKXA 5M4EA 3EHGA 3T1KA 4EEHA 4LRZE 3ZM7A 1QY8A 2YE6A 5HZHA 3MNRP 1QYEA 3A0SA 2OOLA 2YGEA 4H6JA 2VV8A 3D0BA 3R4PA 1YSZA 1B3QA 2FWZA 3OWDA 4QPJA 4B6CA 3UMDA 2M1CA 1UYMA 2WI6A 3RKZA 3BY8A 3TZ5A 3H9WA 3ZXQA 1XFNA 2L4RA 2XHRA 4L93A 5DKKA 3NJAA 1S14A 2O1VA 5CTUA 4JGOA 3A0VA 4FCQA 5M4MA 5AVEA 2WEPA 4LRYC 1TC0A 1GKZA 3H4LA 2W27A 3FG8A 4HJ6A 2WI3A 1I5CA 1R62A 2CGFA 4HXWA 2YEBA 1UYHA 3Q5JA 5M4HA 3IBRA 4H6JB 3FT8A 4HYMA 3VADA 2XDKA 2J80A 3CWFA 3CGYA 3OPDA 4H85A 2Q8FA 1UYDA 2YE7A 3LI8A 2BSMA 2WI7A 3OMUA 3PEHA 2KDKA 5DKLA 3B28A 5C93A 5FNDA 4BQJA 3LIDA 3G6OA 1TIDA 2WEQA 2YE2A 3CRLA 5IS1A 3F1NA 2VV7A 2YEHA 1LSVA 4BIUA 4KUKA 1UYIA 2AKPA 3NOPC 2XK2A 2YKBA 1YS3A 2XX5A 2YEJA 5F5RA 4XIQA 4UROA 3EHHA 1I58A 2CH4A 4L91A 3QDDA 4LWEA 2B02A 3PHYA 2ZKJA 3P7NA 3R91A 4B7PA 4EMVA 2PYRA 2PYPA 5BODA 1V9ZA 1TBWA 3A0ZA 3U2DA 4NXBA 1XJ3A 4AWOA 4HYPA 1S1ZA 5IDMA 2Q2EB 2YEFA 3K3CA 4I39A 3D72A 3A0WA 3D2RA 3LICA 4K08A 4XIRA 5CTYA 3F1PB 4CE1A 1EW0A 2BU7A 1T1CA 4EW7A 4NXGA 3EHFA 2CCSA 2QFOA 3HEKA 3T2SA 4FCRA 2FWYA 4MPNA 2IOPA 2K7SA 1TS7A 2VWCA 4U7OA 1KZNA 4O09A 2VCJA 4KQVA 4E00A 5EFWA 1UYKA 4U93A 4MBCA 3TUHA 4I3JA 4MP2A 2YK2A 3Q5LA 2GQPA 1UYGA 2BYHA 4YKTA 1UGUA 4MPEA 3F1PA 3C2WA 4WN5A 3U2KA 4P8OA 5KIZA 2YE5A 4GGLA 4DUHA 2V1AA 3A0RA 2XABA 2PR5A 2OWJA 3LIEA 1XJ6A 4KQDA 1UYEA 1Z5AA 1I59A 4CE3A 2A24B 4XC0A 3F1NB 4JQLA 2QJ5A 1OJ5A 3FC7A 4QPKA 2V1BA 2HCHA 2JKIA 4WUJA 5AVFA 4F3LB 2YEAA 1T1AA 4HIAA 1AM1A 1ZWHA 2HG1A 1YT0A 4KTNA 3CGZA 4HP4A 1Y8PA 1NHHA 3K99A 5HWWA 5HDDA 1N9OA 5TBMB 4EFTA 2KX6A 3VOLA 1Y4UA 5BOCA 3SW1A 2YE8A 4R1FA 5M4KA 1F9IA 4E01A 2VW5A 2A24A 3VE3A 2YI5A 3O2FA 3B33A 4EEUA 1LSXA 5F68A 4F3LA 4PKYG 3CWVA 4L94A 2YKIA 3T10A 4HH2A 1UYLA 4HJ3A 4MP7A 4O04A 1OTIA 4I38A 1V9YA 3RH8B 2YI7A 2YGFA 3O6OA 2XX2A 4GQTA 5TBMA 3UB9A 3FV5A 4ASAA 4EGKA 4BIZA 3EKRA 1GSXA 4HHDA 3IEDA 3UMEA 2YKHA 2W0NA 1TS8A 4R38A 1UWNX 2YE9A 3PYPA 2ZOHA 1AH6A 1WA9A 1BGQA 3CAXA 4YWZA 2WKPA 3F1OB 3R4OA 3KX0X 2VCIA 3H82A 4R70A 3MQQA 1NHJA 2YECA 4YKUA 4CWFA 4EEPA 5J6AA 2JN7A 3LIBA 2CCUA 1YETA 1OTEA 2Z6DA 4LWFA 2HV1A 3GIEA 2OWHA 4W7TA 2PHYA 1YSRA 1GJVA 4XITA 4NXEA 3VHDA 4EM7A 2YI6A 4HJ4A 3JZ3A 2Q8IA 4JGQA 4GHIA 4JGRA 4XT2B 4H7QA 5HD3A 5M4PA 2JJCA 2YEEA 4BBUA 4BAEA 4URLA 3H82B 1NWZA 2QHKA 3EKOA 1TS0A 3BY9A 4GW9A 1YESA 2YJXA 2V0UA 4P7AA 5IN9A 4KSGA 4XDMA 3VE4A 2FXSA 4HZ0A 1BYQA 4LWIA 2Q8GA 1T19A 2WERA 2QKPA 1THNA 4L90A 2BU2A 1H7UA 2IOQA 2QG2A 4JGPA 2ZBBA 1S1YA 2R78A 1OT6A 5HWVA 4LPBA 4XT2A 1PVGA 5CPHA 2XX4A 2IORA 1UY6A 4BXIA 5F5YA 5J3WA 1UWPX 3H80A 4K4OA 2XDSA 5CTXA 1MU5A 3BM9A 2WKRA 2YEIA 4NXFA 3NMQA 1DP9A 1GSWA 3MR0A 2PD8A 4DJ3A 2H55A 3LYXA 1B63A 1YC4A 3C8CA 2YKFA 1OTBA 5J4EA 2BYIA 4XKAA 3G75A 3TZ0A 3F1OA 4R3AA 2YEDA 3R92A 4U7NA 4PRXA 4HP9A 1NHIA 1YERA 3UB6A 3O0IA 2P7JA 1Y4SA 3NOTC 3OWBA 3MXQA 4B9OA 4WLAA 4Q20A 4JASA 3E4PA 3HJIA 1ODVA 5DJUA 2WI4A 4XCLA 3ZQ5A 5GGZA 1A4HA 2FYPA 1T18A 4GHIB 1OJGA 2QWSA 2XJJA 5CF0A 1BYWA 3LNUA 2JHEA 4BBVA 4V26A 3RLPA 2INWA 1OTDA 4RQ9A 3C11A 3KE6A 2BU5A 2ZOIA 3UB8A 2WI5A 4EXOA 3NHQA 2WKQA 4XE2A 2YKCA 2BREA 4GT8A 2PDRA 2O1UA 3R4MA 3E4OA 1TC6A 1Z5CA 1UYFA 2XDUA 4HNBA 3EEHA 5D7RA 5CTWA 4WL9A 4O07A 4YKZA 2YKEA 4HY8A 2ZBKB 1VB6A 2VLGA 1MZUA 3GECA 4NH8A 4R3MA 1S66L 2IWSA 4LRXC 1AH8A 5G4ZA 2QG0A 3LPSA 3OLOA 4PL9A 2L0WA 1TH8A 2WI2A 1ZXMA 3HZ5A 4WF0A 3B25A 4HXZA 3VHCA 4AWQA 4CWSA 3E4QA 5D6PA 1LT0A 3K98A 2YI0A 4HY6A 4FCPA 5J71A 3ICYA 4XD8A 2XJXA 4L9GA 3R4NA 3INWA 2XDLA 4AS9A 4HI4A 5FNCA 3MJQA 2XD6A 4GS9A 3H7WB 4EESA 4HY1A 4R6LA 2BRCA 4EERA 3GDIA 3INXA 4L8ZA 2BASA 2GJ3A 4KSHA 2V0WA 1QZRA 3NOUC 1EI1A 2YE3A 4CWOA 1EA6A 1ZW9A 1XJ2A 3SL2A 3HHUA 2YEGA 4URNA 2BTZA 3CRKA 4WUCA 3EWKA 1UY8A 4E02A 1N9NA 2CG9A 4HZ5A 2XCMA 2XDXA 4XCJA 1S67L 2YGAA 3ZKBA 2VEAA 1D06A 2XHTA 4GS9B 2C2AA 3EHJA 1DRMA 4YKRA 2E0AA 3A0YA 4O05A 4I5SA 4XKOA 4XTJA 4GEEA 2ESAA 4MN6A 3HYZA 1Y8NA 5L3JA 1YT2A 4NH7A 2CMNA 4AWPA 1I5DA 3HZ1A 3G7BA 2QF6A 2WI1A 5HDSA 1OT9A 1T1BA 2XJGA 1P97A 3TZ2A 4ASFA 1KOUA 3LUQA 4PKYA 1F98A 1KIJA 3C0EA 3A0TA 3CLOA 4HH3A 3T0HA 1LSWA 1MX0A 1Z5BA 4MOTA 1N9LA 3FT5A 1DP8A 2GFDA 4LWGA 3MFXA 4HQAA 3GIGA 5IU1A 2H28A 2L1MA 3T50A 1Y8OA 2BU8A 1AMWA 1YC1A 3WQ9A 3A0XA 4O0BA 2D01A 1LL8A 1US7A 2PNRA 3RLRA 4CWPA 3BWLA 3UE6A 4GCZA 1UYCA 3GIFA 5FNFA 3LIAA 4ZVIA 3H7WA 4I3AA 3WHAA 4ASBA 2QJ7A 1AJ6A 4L9EA 4LLOB 4PU9A 2YJWA 3G7EA 4KFGA 4PRVA 4KP4A 1TILA 3TTZA 1G28A 1GKXA 1YT1A 2XHXA 3OW6A 2YE4A 1Y28A 1Z59A 3B26A 4MPCA 2Q8HA 2BT0A 2HKJA 2ZDYA 3K60A 4CWQA 1L0OA 5D7DA 2IWUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IWIA 1P9RA 3TJZC 1XA7A 1GSVA 4FMTA 1U0ZA 1N4OA 5FWKA 3IS2A 1XJ4A 4H81A 3RTYA 2YKJA 1YAXA 4MBHA 3PBSA 2Z2LB 3HLCA 5AQ7A 5F69A 3B27A 3RLQA 1XGIA 4YKYA 2Y79A 4WUBA 4I3IA 1BT5A 5A8BA 1IKGA 3QTFA 4UA9A 5J7EA 3W4QA 2Y8HA 3IXHA 4E3MA 1J9MA 4L9FA 4ZKIA 4PM5A 2O1WA 2UWDA 4DZYA 3OPPA 1OSFA 3R7WA 4LP0A 1NRFA 1YC3A 3IHBA 3SH9A 4BLMA 4EGIA 2D02A 5I5LA 4JF6A 3DWZA 5D7CA 1YQSA 2KLIA 4YFMA 4I3HA 3C30A 1K0KA 2O9CA 3CUEA 4KZ9A 5HW3A 4LRZE 2H0YA 3KYEA 2Y2PA 3A0SA 4ETXA 3D0BA 4B6CA 1YSZA 1B3QA 3OWDA 2M1CA 1UYMA 1H8YA 3GQZA 3W4OA 1XFNA 4M3KA 2L4RA 4L93A 3NJAA 5F83A 2PBDP 1TF1A 3QHYA 4JGOA 3A0VA 3PR6A 4FCQA 2VGJA 5CHUA 3WS1A 1IELA 4WZ5A 2WI3A 1I5CA 2CGFA 4JXGA 1YMXA 2WZXA 4GB7A 3CWFA 3OPDA 4H85A 3HLBA 1MWTA 2YE7A 4Y13A 3L9KA 2BSMA 5HAQA 5FNDA 3ZG8B 3LIDA 4KZ8A 3CRLA 4PM8A 2XA7S 2RL3A 3T1QB 4BIUA 1JTDA 4Y17A 5FAOA 2YKBA 4C75A 1YS3A 3MF0A 4UROA 3EHHA 4ZAMA 3BEBA 3N7WA 2B02A 3R91A 2PYRA 3DTKA 1PW1A 3U2DA 4OPZA 1IYPA 1S1ZA 1H8MA 2Y2NA 2Q9MA 4GD6A 3PTEA 3K3CA 1NRJA 3LICA 4K08A 3BQ8A 4XIRA 1EW0A 5DFXA 4NXGA 2CCSA 2CC1A 2DMWA 3A3IA 4DE3A 2IOPA 1K56A 1TS7A 4O09A 2VCJA 4WZ4A 3ZG9B 5E2GA 4R4SA 1IYQA 2WADA 2ZMFA 5M18A 4MP2A 3Q5LA 1KGEA 3DW0A 4DN0A 1UYGA 4YKTA 3C2WA 2BLSA 3U2KA 4BWIA 2P9VA 4P8OA 4DUHA 2V1AA 2XFTA 3PAEA 4OOYA 4FSFA 1XJ6A 3KO6A 3HCYA 4EU0A 4XC0A 1K57A 2DCFA 5CEBA 4WEKA 2WGWB 2HCHA 2JKIA 4F3LB 3ZVTA 3O3VA 1T1AA 2ZL1B 4CLCD 3VFFA 3G34A 1L0DA 5HDDA 5BOCA 3N6IA 5CGSA 2A24A 1MY8A 4EEUA 2M7UA 5F68A 2XD1A 4PKYG 4F3LA 3CWVA 4L94A 1NYYA 2NUPC 5KMWA 5IT5A 1ESUA 3OPLA 4KQOA 4L0LA 2YGFA 3O6OA 2XX2A 4GQTA 4KZ4A 3QP8A 3CI6A 4QU3A 1XA1A 3LR3A 1TS8A 3QP1A 1LL5A 2YE9A 2XDMA 3CAXA 2XR0A 2WKPA 4YWZA 4X1LA 4X25A 4MBKA 4S2PA 1NHJA 2P9VB 3MQQA 4YKUA 2JN7A 2CCUA 3MZDA 4LWFA 2HV1A 5DTKA 3M6HA 2WKHA 4W7TA 2G2WA 2PHYA 5DF9A 4XITA 4KQRA 4JGRA 4QB8A 2ZQ8A 3O87A 4XT2B 4E3IA 5HD3A 1TDGA 2YEEA 4URLA 1JWPA 4PM6A 3VMAA 2VK3A 1SKOA 3VOYA 5GLAA 1BYQA 1Q2PA 4LWIA 4OOLA 3GMWA 1KE4A 4G3VA 4PMAA 3PXPA 2QG2A 5AQBA 2ZBBA 2O9AA 4YNRA 1STZA 5L07A 2IORA 1UWPX 5KSCA 2XDSA 3BM9A 2WKRA 2YEIA 3NMQA 4K91A 5EUAA 4R1GA 1AWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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