4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
4W7TA 5HWVA 1S14A 3LNUA 4JAUA 4XIQA 5C93A 1UYMA 1GSWA 4MOTA 3C11A 4CWRA 2IORA 2WI6A 4EGKA 2XJJA 1Z59A 4GGLA 3UB7A 3UB8A 2XX2A 4YKTA 2O1WA 3MJQA 5D6PA 1KIJA 2QJ7A 3Q5KA 3BY8A 2M1CA 3U2KA 2PYPA 5F5YA 3LYXA 4XT2A 3A0XA 4B9OA 3Q5JA 3INWA 2PNRA 4LPBA 4FCRA 1TS6A 3IBRA 3PYPA 1T1CA 2BASA 2EXLA 3HHUA 4EEHA 3ZQ5A 1US7A 1Z5CA 1MX0A 5M4HA 3SW1A 2CCTA 4R6LA 3G7EA 2YE5A 4HI4A 4YKUA 2Q8HA 2J80A 4GHIB 1TIDA 2Z6DA 2XHTA 2YEGA 3C0EA 2YEAA 1GJVA 3KE6A 1GSVA 3ICYA 2A24A 1ODVA 3VOLA 1AH6A 4PKYA 3CRKA 4XD8A 5CTWA 3CRLA 2CH4A 2YJXA 3INXA 1T19A 5HZHA 2XABA 2YEDA 4KFGA 2YGAA 3PEHA 4HY8A 1T1BA 2YE2A 5M4EA 2ZDXA 3EHFA 4AWQA 5J4EA 3T0ZA 4LRXC 4ASGA 4H81A 4WN5A 4B6CA 4KUOA 1UY6A 4JQLA 4F3LA 3A0WA 2KDKA 2E0AA 3R92A 3OPDA 2YK9A 2L0WA 2YGEA 4L90A 1F9IA 4PRVA 4DJ3A 1S4SA 5FWKA 4GW9A 1H7SA 1OTIA 4LPZA 3NHQA 4O09A 1JNUA 5IDMA 2H55A 4URLA 2Z6CA 2VV7A 4HJ4A 5FNDA 2WI5A 1Y8OA 4EMVA 1EW0A 4PKYG 1BGQA 2XHRA 1I5CA 3OWBA 3H80A 1ZWHA 3LIBA 4Q20A 3GIGB 4R3MA 1GKXA 2YEEA 3JZ3A 4I39A 4LWEA 1OJ5A 4YWZA 1TS7A 1B63A 4ZVIA 1Y28A 1T1AA 2YEHA 2XDXA 4LRYC 3VHCA 2IWXA 4MP7A 1DP6A 3PHYA 3RH8B 1V9YA 2CMNA 4H6JA 4L93A 3CGZA 3G75A 5CTUA 4HOIA 2YJWA 3Q5LA 1S1YA 2BU2A 2WEQA 2YKJA 4BAEA 1P97A 3H82B 4BIUA 3U67A 4CWPA 5I5LA 4WF0A 2YE6A 3BMYA 1NHIA 1Y4UA 1Z5BA 5HDSA 1ID0A 1XJ6A 4GHIA 1H7UA 2FYPA 4GFNA 4K4OA 4WUJA 3T2SA 3MXQA 3CWFA 3EEHA 5DKKA 4U7OA 5M4MA 2BU8A 2UWDA 2C2AA 1OT6A 3NOPC 3GDIA 2FWYA 3K3CA 4KQVA 5GGZA 4ASFA 4LRZE 3LI8A 1XFNA 2QKPA 1GSXA 2L1MA 2BYHA 3CGYA 4I38A 4I3IA 2XDKA 4XKKA 4HNBA 2XDLA 2XJXA 5FNCA 4EESA 3OWDA 2WKPA 3H4LA 2WKQA 4I3AA 4NH8A 2YK2A 2PD8A 3H7WA 5HDCA 4HY6A 3IEDA 3R4OA 4H85A 3NMQA 3RLPA 3P7NA 1BXDA 2D01A 2JKIA 2XK2A 3CWVA 2YE3A 3R4MA 2VEAA 1D7EA 3K98A 2YEBA 1OTEA 4NXBA 5AVFA 3R4NA 1N9LA 4QPJA 3TTZA 2OOLA 3GIGA 3SL2A 1XJ3A 3VE3A 3ZXQA 1UY8A 1I5BA 2XDSA 2HCHA 2XX4A 3DGEA 4EEUA 4XTJA 1QYEA 4PL9A 2GQPA 4EW7A 3UMDA 3D72A 5A8BA 4BBUA 3B24A 1MZUA 4MPNA 2B02A 4BBTA 4X9LA 4H6JB 4BBVA 4EETB 5J6AA 3EHHA 5M4KA 1JM6A 3A0ZA 3QDDA 5IN9A 3H82A 1WA9A 4XKAA 4CWFA 3B25A 5M4PA 2W0NA 3ZM7A 1U2OA 4DJ2A 4PRXA 2YKFA 5M4NA 4JGOA 5IS1A 2QWSA 3O6OA 4EM7A 3UE6A 4FCQA 4XIRA 4LWGA 3D36A 3HJKA 3C8CA 1UY9A 1LSWA 1NHJA 1B62A 1YETA 4KSHA 4GCZA 4CE1A 4ASAA 5L3JA 1EI1A 4HIAA 4FPPA 4O05A 1XJ4A 1KOUA 3MQQA 3E4QA 2BU6A 1S4RA 2QF6A 2YE9A 3FG8A 4EFTA 1GKZA 2XX5A 1ZW9A 3B26A 4HH3A 4R70A 4HXZA 1UY7A 3E4PA 4L8ZA 2V1BA 4PU9A 2PR6A 3FC7A 2YI5A 4GQTA 1YESA 4R3AA 4XCLA 1R62A 4KSGA 1TC6A 4E01A 3G7BA 4FMTA 1X0OA 2BSMA 1OT9A 4AWOA 1Z5AA 3H7WB 3LPSA 5CF0A 3HZ1A 4YKXA 2PD7A 3O0IA 4HJ6A 4HYPA 4XDMA 5F69A 5TBMB 1NWZA 3LIEA 5HWTA 4QPKA 4LLOB 2BRCA 5HD5A 4YKQA 4CWTA 1OTBA 3D2RA 4JGQA 4EXOA 1I59A 4P7AA 1I5AA 3K3DA 3R4PA 4MPCA 1Y4SA 2Q8IA 4JAVA 4MBCA 3B27A 3F1NB 4L9FA 3FT8A 2VLGA 4GT8A 4CE2A 4KTNA 3OMUA 5F6AA 1QZRA 2WI7A 4HYMA 4L9GA 2I9VA 5BODA 1A4HA 3OW6A 3T1KA 3LIAA 2ZBKB 4NXGA 1Y8NA 2INWA 1P0ZA 2AKPA 4XC0A 2PYRA 1OSFA 2YI0A 2YKBA 5J7EA 2XJGA 4CWOA 5CTYA 2V1AA 3MFXA 5HWWA 5G4YA 2FWZA 3A0VA 5HD3A 1ZXNA 4HZ0A 3U2DA 3VE4A 3VHAA 3TZ0A 4CWNA 4MN6A 4HH2A 1TBWA 4R38A 2VV6A 4XIPA 4URMA 4I3JA 3RLRA 2V0WA 1KZNA 3LIDA 2V9AA 3EKRA 1BKNA 4U7NA 1TILA 3K97A 3F1PB 4DZYA 1T18A 3ZXOA 4L94A 4B7PA 3MR0A 3C2WA 3WHAA 3IS2B 4URNA 4KP4A 2BU7A 2FXSA 5D7CA 3T10A 2JN7A 4HQAA 4O0BA 4NH9A 2K5BA 2CGFA 5EFWA 3HEKA 1D06A 2BREA 3K60A 4BQJA 1UYEA 5TBMA 4JASA 4R1FA 3HZ5A 2OWJA 1B3QA 4EEPA 4V25A 4AWPA 4MB9A 1YT0A 2BZ5A 5HSQA 1QY8A 2XHXA 2VW5A 3A0SA 4UROA 3QTFA 4HXWA 3UMEA 2BTZA 2CCSA 2VCIA 5DJTA 1VB6A 1UWPX 5G4ZA 4EGIA 5BOCA 1UYLA 3BY9A 3F1NA 1UYHA 3UB9A 4MN5A 1AMWA 2O1VA 4WUDA 1UYCA 2WI4A 1XFQA 5F3KA 1TS8A 2D02A 4WL9A 3D0BA 1OTAA 4YKRA 2YE7A 2GJ3A 3GECA 4DUHA 1S66L 1DP8A 4WLAA 2YEJA 3RKZA 4CE3A 1I5DA 3GIEA 3OLOA 4P8OA 1DRMA 4U93A 4NXEA 2IOPA 3FT5A 3BM9A 5IU1A 5FNFA 1UYFA 2BU5A 2ZOHA 1AJ6A 2BYIA 2GFDA 4YKZA 3ULFA 2YI6A 4AS9A 3NOUC 3LIFA 4V26A 4JGPA 1EA6A 5F5RA 4K08A 3F1OB 4EGHA 2QFOA 4I3HA 3F1PA 4XE2A 4HP4A 2XDUA 2WKRA 2R78A 2VWCA 3IS2A 2K7SA 2YKEA 4NXFA 2OWHA 1DP9A 2EA9A 2P7JA 2H8MA 3NJAA 4RQ9A 3EHGA 1S1ZA 1XJ2A 3T50A 2PR5A 1UYIA 3FV5A 5D7DA 2WI3A 2IWSA 2YGFA 3O2FA 3PEJA 4O04A 2CG9A 3HYZA 4WUCA 2Q8GA 3ZKDA 4GS9B 1YERA 2WI1A 3ZKBA 4MP2A 2PDRA 3G6OA 4E02A 4EFUA 1LSXA 5HDDA 4JGRA 1G28A 3K99A 4NH7A 2O1UA 2WERA 4CWSA 1V9ZA 2ZDYA 3R91A 3A0TA 1YT1A 3TZ2A 5KIZA 1I58A 2IWUA 4XITA 4KQDA 2WI2A 4LWIA 4L9EA 4ZKIA 4MPEA 4EQ1A 2IOQA 1S16A 1YT2A 1YC3A 3CAXA 1UYDA 3H9WA 3VHDA 1YSRA 5F68A 2KX6A 4GEEA 4ASBA 3LICA 2CCUA 5D7RA 2ESAA 2XCMA 1F98A 1S67L 2H28A 1BYWA 4L91A 4YKWA 3KX0X 2Q8FA 3LI9A 1TH8A 2Q2EB 4LWHA 2HV1A 3NOTC 1OJGA 1YS3A 4H7QA 4HJ3A 5IDJA 4I5SA 1Y8PA 4BXIA 3MQOA 1LL8A 1BYQA 4WUBA 1PVGA 3MNRP 1UYKA 4XKOA 1THNA 1OTDA 3F1OA 1U0ZA 3TZ5A 2VV8A 2W27A 4E04A 1LSVA 4LWFA 5DJUA 4XT2B 2JJCA 4KUKA 3B28A 3EKOA 4YKYA 2JHEA 1N9NA 2ZOIA 3A0RA 5D6QA 2YECA 1YC4A 2YE4A 3GIFA 3T0HA 2HKJA 4BIZA 2VCJA 1AH8A 3RTYA 1N9OA 1UYGA 3CLOA 3RLQA 3VADA 4HZ5A 4LP0A 2XD6A 3E4OA 2YEIA 2YEFA 2A24B 5J71A 4GS9A 4BQGA 4HY1A 2HG1A 1TC0A 1YC1A 2YKCA 1UGUA 2PHYA 2WEPA 3TZ4A 4M4XA 1L0OA 3BWLA 3LUQA 3B33A 2L4RA 2YKIA 4FCPA 2ZBBA 3TUHA 3EHJA 1LT0A 4HP9A 1UWNX 4HHDA 2YE8A 5CTXA 1AM1A 3HYYA 4EERA 1NHHA 1ZXMA 3WQ9A 2V0UA 1YSZA 3EWKA 4F3LB 2YKHA 4O07A 5J3WA 5AVEA 2QG0A 2QJ5A 1TS0A 1MU5A 2QHKA 2YI7A 3A0YA 5CPHA 5DKLA 2ZKJA 4E00A 2BT0A 3HJIA 2QG2A 4XCJA 4CWQA 3UB6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IBXA 5CXWA 4MOTA 5HPFA 2QPNA 1Z59A 3HLGA 1I2SA 2M1CA 5LBRA 3U2KA 3S7NA 3VFHA 1E4DA 3LYXA 4XT2A 3N6IA 2WGWA 3INWA 1MKMA 2PU4A 3UDIA 4FCRA 2XLNA 2BASA 4BD0A 1WYCA 2EXLA 4EEHA 3MSHA 2XD5A 3ZQ5A 2ZJ9A 1US7A 2W3FA 4WMCD 4ZJ2A 1YQSA 2YEAA 1GJVA 2HP6A 5A91A 2XK1A 1IYQA 2CH4A 2XABA 5A92A 3ZG9B 4YNRA 3UO9A 5J4EA 2HPBA 1UY6A 2NUPC 4F3LA 3S1YA 2KDKA 2E8JA 3O5YA 4DJ3A 3O87A 2XH9A 2H55A 3NY4A 1L0GA 3KSFA 4MNRA 1ZWHA 5KSCA 4Q20A 5AJGA 2YEEA 5E2GA 4KG6A 1BLCA 4FTXA 4YOFA 1B63A 1T1AA 2VA0A 4S2NA 2XDXA 1CJFA 2O0YA 1JWVA 1RGYA 1V9YA 2XR0A 2JCHA 3RXWA 4HOIA 2B95A 2NUTC 3Q5LA 5DTTA 2YKJA 5MC7A 1P97A 4BIUA 4CWPA 4E72A 1MPLA 2ZMFA 1NHIA 4UQIS 1Y4UA 4QWOA 1H5XA 2VKSA 3MXQA 3CWFA 1YMSA 2BU8A 2UWDA 4WEKA 1MC0A 3K3CA 2OAP1 3HLWA 1CI8A 4OPZA 5FI2A 3P98A 1ERMA 4N9KA 5G18A 3CGYA 4I3IA 3WS4A 2XDKA 3IH9A 2WKPA 2WKQA 2WUQA 2J8YA 2XEPA 4KZ4A 4WZ5A 2IA2A 3H7WA 4P0MA 4R1GA 1BLPA 2D01A 3WRZA 3M6BA 4NXBA 3R4NA 1ONHA 2ZC7A 2OOLA 3NCKA 5DF8A 3ZXQA 3IBJA 1KE3A 2HCHA 1K56A 2O99A 5EVEA 3IXBA 2GDNA 3T4JA 4ARZB 4BBUA 1MZUA 4UEYA 1G5UA 3WS1A 5CGSA 4EETB 5J6AA 1XPBA 4Q0JA 3QDDA 2V1ZA 5HARA 4BJPA 4XKAA 1BT5A 3G32A 4XUZA 4PMAA 5DVAA 1U2OA 4Q8IA 1K6SA 4JGOA 1TVFA 5IS1A 2QWSA 2ZC6B 4EM7A 4FCQA 3D36A 3CPTA 3HJKA 1PZOA 5GLBA 1NHJA 1B62A 2Y4AA 4MMNA 3JYIA 2BU6A 2VJWA 4EFTA 3OBFA 1GKZA 2XX5A 1L0FA 4HH3A 3B26A 4L8ZA 2V1BA 1STZA 5FAQA 3ZG7B 3S4XA 4E01A 5IHVA 1ALQA 4KZAA 3CZDA 1OT9A 1HLUP 4AWOA 3FKWA 1Z5AA 3LPSA 5CF0A 2ZQ7A 1NWZA 5HWTA 4S2LA 3LY3A 5HD5A 4CWTA 1OTBA 3ZHHA 3DWZA 4Q0HA 4O0PA 4EXOA 3LGOA 1W8YA 3SH7A 2H0TA 4BLMA 3OPPA 4U0TA 3C30A 4KQOA 4JAVA 4MBCA 4Y3IA 3F1NB 4N1XA 2VLGA 5FDSA 1QZRA 2WI7A 3ITBA 1NRFA 1YPRA 2JKGA 3FV7A 1Y8NA 3KO6A 5J7EA 5F82A 2V1AA 3MFXA 5HWWA 1ZXNA 4HZ0A 3TZ0A 2ZM8A 1G6AA 3JVUA 4K0WA 3T12B 3A3EA 4URMA 4HBUA 4FCFA 2J9PA 2C1IA 3F1PB 1T18A 1K25A 4OPRA 2P9VA 4L94A 3MR0A 3C2WA 1GA9A 1K55C 2FXSA 4IVKA 3T10A 4X68A 4NH9A 2J3TD 2CGFA 4DF6A 5AQ7A 1ZC2A 1NXYA 4R1FA 2HDUA 5FSRA 1XA7A 2OWJA 3UE0A 1K54A 4EEPA 2BZ5A 1QY8A 3G34A 3LMMA 3Q7VB 2J3TC 3BM6A 3UMEA 2CCSA 4S2PA 4EGIA 1UYLA 3BY9A 1K56D 4NKPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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