4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
1DP8A 1S14A 3LI8A 4R38A 4EQ1A 2QWSA 1BYQA 3U67A 4JAVA 2KX6A 2XX2A 2VCIA 2XDUA 4JQLA 3RLPA 5M4KA 4HOIA 5CTYA 1UYDA 4MBCA 4WUJA 2BT0A 5HWWA 3TZ0A 4O07A 1XFQA 2BZ5A 3CAXA 1UYLA 5CTWA 1T1AA 3INWA 1ZXNA 3F1NA 2M1CA 4XC0A 4JGOA 2GFDA 4AWPA 5D6QA 4XITA 4LPBA 3QDDA 3EWKA 1DRMA 4M4XA 3GIGA 4E01A 3MFXA 2ZOHA 1N9NA 2WI2A 1TILA 3TTZA 5F69A 4L9FA 5I5LA 3R91A 4EGIA 2K7SA 1YETA 2CG9A 2BASA 4XKKA 1UYCA 2J80A 2I9VA 3LYXA 4HP9A 1GKXA 4MOTA 4XDMA 2YK9A 4EGHA 4HP4A 3OWBA 4XKAA 2VLGA 2Z6DA 4XIRA 1AH8A 4HZ5A 2YE6A 1NHHA 1AH6A 5CF0A 2XK2A 1OTAA 3EHJA 4YKQA 5D7RA 1T1CA 5HZHA 1TBWA 2QG2A 1UYMA 1TC0A 4WLAA 3HHUA 5CTUA 4L93A 4E04A 5M4PA 3T0ZA 4HY8A 2WEQA 1MX0A 2IOPA 4MPNA 1YT1A 4MPEA 3OMUA 1OTDA 1EW0A 4BBTA 1PVGA 4B7PA 2PD8A 3A0YA 4Q20A 4XT2A 4WL9A 3LICA 1OTEA 2YE8A 1TS6A 2IWXA 1I5DA 2WI5A 3O6OA 4NXBA 3UB7A 2YK2A 1ZW9A 4JGRA 2GJ3A 3GDIA 2WKQA 3EHFA 4H6JB 1UWPX 1Z5AA 3T10A 2BU2A 2PR6A 3CRKA 3CWVA 1X0OA 4XCLA 4PU9A 5FWKA 5D7DA 2Q8HA 3HJIA 2ZOIA 2L4RA 1UY9A 4KSGA 2Z6CA 4NH9A 4UROA 2YEAA 2Q2EB 4E02A 1THNA 2O1UA 2YKHA 4HH2A 4KFGA 1ZXMA 2OWHA 3T1KA 2BSMA 3D72A 3FG8A 1Y8OA 4XIPA 1XJ4A 4CWPA 3F1OA 4KTNA 1TS7A 1Y4SA 4B6CA 1YERA 2XJJA 4EMVA 2V1BA 4LWIA 4L9GA 2C2AA 5F5RA 2BYIA 1L0OA 4U93A 4AS9A 3T50A 2PDRA 4H6JA 1WA9A 5HDCA 4LRXC 3FT5A 2V0UA 4O09A 3O0IA 5FNCA 3TZ5A 5M4EA 5M4HA 3H82A 3ZXQA 4EEUA 1A4HA 1H7UA 2FWYA 4WUCA 2E0AA 4MB9A 3EHHA 4KUOA 3IS2A 4JAUA 2ZBKB 4I5SA 5DJTA 3GIGB 2PYPA 3EHGA 2YJXA 2YI0A 2KDKA 3G7BA 4LWEA 1S1ZA 3WHAA 1XJ6A 1V9YA 1AJ6A 1NHJA 4MPCA 4P7AA 2XX5A 2HKJA 4I3IA 5D6PA 3NHQA 4V26A 3Q5JA 3VHDA 3ICYA 4CWNA 4HJ6A 4FCQA 4GT8A 4I38A 1YSRA 1NHIA 2Q8GA 3TZ4A 4CE2A 3HEKA 2YEHA 1OT9A 3C11A 4EFUA 2UWDA 3MQOA 5C93A 3LPSA 4R6LA 4V25A 2YE4A 4R3AA 4ASBA 3RLQA 4LRYC 1I5AA 1I59A 1UY8A 2VV7A 4P8OA 4U7NA 1Y28A 3K98A 3P7NA 4YWZA 4L91A 4RQ9A 4YKUA 4AWQA 5GGZA 2AKPA 1GSWA 2YKFA 2CCUA 4GGLA 2HV1A 4R1FA 3A0VA 1GKZA 4GS9A 1S4SA 3B28A 2K5BA 4XT2B 4HZ0A 4HY1A 4XCJA 2FXSA 4YKYA 4CE3A 3OLOA 1JNUA 3OWDA 4E00A 1T19A 2A24B 1YS3A 2YKJA 3VHCA 2JHEA 5HD5A 1AMWA 2CH4A 2R78A 4XIQA 4HXZA 3U2DA 3H4LA 4DZYA 2VWCA 4GQTA 4GW9A 2WI6A 1Z5CA 5FNDA 1QYEA 5M4NA 2ZKJA 2YKBA 2WI4A 1EA6A 4PRVA 3GIEA 5F68A 3ZKBA 5J7EA 3A0WA 3PEJA 3GECA 5L3JA 3INXA 4R70A 5G4ZA 3LIDA 5F5YA 1I5CA 1N9OA 3GIFA 2BREA 4HXWA 1OJ5A 4O04A 1B3QA 2L1MA 5IN9A 3CLOA 3H7WA 3TUHA 3MR0A 1QZRA 5TBMB 4FCRA 3UMEA 1S67L 2ZDYA 1GSVA 3VOLA 3QTFA 3H9WA 1JM6A 1ID0A 1YC3A 1R62A 2VW5A 3CGYA 4R3MA 2XABA 2H55A 3UB9A 4YKZA 1G28A 3NOPC 4BQGA 2IWSA 5IDMA 3K3CA 1Y4UA 2PD7A 2WEPA 1B63A 2JJCA 5HSQA 1US7A 1F98A 3LIAA 1LL8A 3LIBA 5KIZA 2BU6A 5J6AA 3A0TA 3G7EA 3R4OA 1LSVA 4XKOA 1XJ2A 4QPKA 1UGUA 3H7WB 1ZWHA 4LP0A 3MJQA 2OOLA 3LIFA 1LSWA 1P97A 3EKOA 2W0NA 1S1YA 4HJ4A 4XE2A 2ESAA 3TZ2A 5BOCA 4BBUA 4PRXA 3BY9A 3E4PA 2WI7A 2XCMA 4LWHA 3WQ9A 4EETB 5HDDA 5A8BA 4GHIA 2YKIA 3T0HA 3LI9A 3E4OA 4WF0A 1YESA 2YEFA 4NH7A 1D7EA 5FNFA 2BTZA 1OT6A 2QJ5A 2BU8A 1YT0A 2XJXA 3DGEA 3A0XA 2A24A 3RLRA 4KQDA 1S4RA 2YKCA 4HH3A 4H81A 3UB8A 3G6OA 1TIDA 1DP6A 3K97A 3F1OB 2IOQA 4GHIB 2PNRA 4MP7A 2OWJA 5TBMA 4CWFA 3OPDA 2VV8A 3FT8A 2WKPA 4BBVA 2VCJA 4YKTA 3VADA 2YE2A 1TS8A 4CWSA 4ZKIA 2YE7A 1VB6A 3HYZA 4H7QA 5J3WA 3RKZA 1H7SA 1I58A 1P0ZA 1U2OA 5CTXA 4HJ3A 5DKKA 3UB6A 5J4EA 4GCZA 1U0ZA 3VHAA 1XFNA 4B9OA 2XX4A 4KUKA 5HWTA 3OW6A 3LNUA 2CMNA 5AVEA 1Y8NA 4BIUA 2YE3A 3R4PA 1XJ3A 2D02A 5EFWA 5IU1A 1TS0A 3VE3A 5HWVA 5HD3A 1UYHA 2YEEA 3FV5A 1KOUA 1T1BA 3D36A 3BWLA 2IWUA 2YEJA 5DKLA 1TH8A 4QPJA 4KQVA 4CWTA 3HJKA 2EXLA 1DP9A 2XHRA 2WI1A 3PEHA 3ZM7A 1EI1A 1Y8PA 2IORA 1S66L 3F1NB 3Q5LA 2XHXA 4LWGA 3BY8A 3O2FA 1UYKA 1BXDA 2CCTA 1T18A 2WI3A 2VV6A 3H82B 5M4MA 2V1AA 5BODA 4EXOA 4DJ2A 2HCHA 3K3DA 4URMA 2P7JA 2BU5A 1QY8A 1ODVA 2JKIA 2YEGA 4EW7A 2QFOA 3EEHA 2XDXA 4L94A 4CWRA 2PYRA 3IBRA 4H85A 2VEAA 1F9IA 3ZQ5A 2HG1A 4EM7A 4DUHA 3E4QA 3R92A 3MQQA 2YE5A 1V9ZA 2EA9A 2FWZA 4KSHA 5CPHA 3ZXOA 4URNA 3KE6A 4JASA 1OJGA 5F3KA 3A0SA 3FC7A 1UYFA 4BAEA 3K99A 1GSXA 4MN6A 4JGQA 2YE9A 4HHDA 4HYPA 1BKNA 1I5BA 3HZ5A 5J71A 2QF6A 4FMTA 3C8CA 3NMQA 3B25A 1UWNX 1OTBA 3B33A 1GJVA 2YKEA 3A0ZA 4K4OA 4WUDA 5F6AA 2PHYA 3C0EA 3NJAA 1NWZA 3RTYA 4JGPA 1UY7A 2CGFA 2XDKA 2YI5A 4URLA 4LPZA 2CCSA 3VE4A 3NOUC 1OTIA 1YC1A 2Q8FA 1LT0A 4BXIA 1OSFA 3A0RA 3C2WA 1YC4A 3G75A 1Z5BA 2XHTA 2QHKA 2YEBA 4K08A 5IDJA 3T2SA 3H80A 1UYGA 2BRCA 4HY6A 5DJUA 1KZNA 3UE6A 2D01A 1N9LA 4I3AA 3UMDA 3BMYA 2H8MA 3ZKDA 4LLOB 4HNBA 4CE1A 3MNRP 1LSXA 5G4YA 4DJ3A 3B26A 3PYPA 3K60A 2YEIA 4L8ZA 4ASGA 2B02A 3Q5KA 4KP4A 2BU7A 4BQJA 2ZDXA 4YKWA 4NXFA 4CWQA 3KX0X 2O1VA 4HIAA 2QKPA 4EEHA 4HI4A 1Z59A 2ZBBA 2YGEA 2WERA 1S16A 4EGKA 2O1WA 3ULFA 1YT2A 4O05A 2XDLA 3U2KA 4YKXA 4GFNA 4EFTA 3D0BA 4I3HA 3R4NA 4WUBA 4L9EA 4NXGA 2QG0A 3HYYA 2YI7A 3R4MA 4O0BA 3LUQA 4EEPA 1MU5A 3RH8B 2YECA 3IS2B 2GQPA 5D7CA 3F1PA 2FYPA 5AVFA 3HZ1A 2PR5A 4NXEA 1AM1A 2YJWA 2BYHA 4CWOA 4ASAA 4EERA 4AWOA 4I39A 4HYMA 4GEEA 1B62A 3EKRA 2INWA 4F3LB 2XDSA 2YGFA 5HDSA 4PL9A 1D06A 4HQAA 1MZUA 1UYIA 3IEDA 4X9LA 4BIZA 4XTJA 1BGQA 3CWFA 1YSZA 3B27A 2YEDA 4FPPA 4NH8A 4YKRA 4XD8A 4ZVIA 2V0WA 3MXQA 4FCPA 2W27A 2YI6A 2XJGA 4W7TA 3LIEA 4WN5A 4EESA 2JN7A 2Q8IA 2V9AA 3CGZA 4L90A 3NOTC 4F3LA 3CRLA 3JZ3A 4GS9B 3D2RA 5IS1A 4PKYA 2QJ7A 4MN5A 3PHYA 2WKRA 4I3JA 4MP2A 3SW1A 2XD6A 1UYEA 4ASFA 3BM9A 1UY6A 3F1PB 1BYWA 1KIJA 2L0WA 4PKYG 4LWFA 3B24A 4LRZE 4U7OA 2H28A 1TC6A 3SL2A 2YGAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ARZB 2XDMA 3LI8A 4EQ1A 1BTLA 1BYQA 3U67A 2J8YA 2XX2A 2XDUA 5CTYA 4OP5A 3S7NA 3D9YA 2ZQCA 5GLBA 4O07A 4Y0OA 2WK0A 3CAXA 3HLGA 3QP5A 2XK1A 3INWA 2M1CA 2GFDA 4X1MA 5HW3A 1OPXA 3QDDA 1DRMA 2Y2LA 3E2LA 1TEMA 4E01A 3MFXA 3EEAA 5F83A 2Y91A 1K4FA 3TOIA 1TILA 4ZDXA 3R4KA 5HL1A 2CG9A 2BASA 1UYCA 1BT5A 3SH8A 3NC8A 4HP9A 3PBRA 4NEED 3G2ZA 4HP4A 4QHCA 3C5AA 4YINA 1L0GA 5L8MA 2YE6A 1Y54A 5CF0A 1OTAA 2EWVA 3A3EA 5DF7A 3KSFA 1KGEA 2HJEA 2IWCA 2VK3A 1T1CA 3PBNA 4KZ4A 1VQQA 3DTIA 5M4PA 4EBLA 3QP8A 5EV0A 4B7PA 4MCWA 2H5SA 4JXSA 4BWIA 3A0YA 4WL9A 2YE8A 1TS6A 4EU0A 2WI5A 4CQHA 3O6OA 4WZ5C 5A90A 4R4SA 1N4OA 2E8IA 4KQOA 2YK2A 3IXBA 2Q9NA 1Z6FA 2WKQA 4H6JB 5E2EA 3T10A 1YLZA 3K2NA 2L4RA 4KSGA 2Z6CA 4BD0A 3HBRA 2YEAA 2O1UA 2WZZA 4HH2A 4KFGA 4S2OA 3VFFA 2BSMA 3FG8A 3C7UA 1JVJA 4Y7PA 4B6CA 4EMVA 4LWIA 2BYIA 4AS9A 2EX2A 1WA9A 3ZNYA 2J9OA 4PM5A 3EGXC 5M4HA 3H82A 1H7UA 5EVEA 2FWYA 1H5XA 2E0AA 3EHHA 4OLGA 4BENA 5DJTA 3EHGA 1I5QA 3MZFA 2HP5A 3G35A 1XXMA 1JWPA 1XJ6A 5M18A 1V9YA 3FYZA 4R3JA 1H0MA 2EX8A 5DTSA 3AGDA 1MPLA 2B95A 3HLFA 4GT8A 5FQQA 4I38A 1YAXA 4ZJ1A 3W4PA 3MQOA 1YLTA 3LPSA 4V25A 2YE4A 3C4OA 3U4LP 4LRYC 5TFQA 2HJ9C 1I59A 2XSSA 1Y28A 1XGIA 4P87A 4L91A 4RQ9A 2AKPA 3HUOA 3LY4A 3CG5A 2YKFA 3C30A 4PM6A 5EM1A 4GN2A 2Z2LB 4GS9A 3UPOA 5FEFA 2Q0OA 2K5BA 5EM0A 2Y2PA 5HARA 3IF6C 4YKYA 4B4ZA 5IT5A 3OLOA 3OWDA 4E00A 2A24B 3GQZA 3VHCA 2JHEA 2ZC4B 5HD5A 3IHBA 1A0KA 4HXZA 4RVAA 3V67A 1E25A 5FNDA 5M4NA 1ESUA 1VETA 4FUWA 2WI4A 3GIEA 1FQGA 3MSHA 2WGWA 5G4ZA 2HF6A 1I5CA 3AGEA 1PZPA 4HXWA 1OJ5A 1B3QA 3A3FA 3O86A 3TUHA 4F94A 1GSVA 2EWWA 1RGYA 5EPHA 3SS3A 3VFHA 1JM6A 2P9VB 4R3MA 3IF6A 2XABA 4BL3A 4YKZA 4ID4A 3ZCZA 4LCMA 2WKHA 4OLDA 4ZBEA 1S6RA 3UE1A 1F98A 4HEFA 2PAVP 4A5RA 2BU6A 5L10A 3A0TA 3G7EA 4XKOA 4ESPA 1ZTUA 2ZM8A 4S2JA 3H7WB 1ZWHA 3NCKA 5I94A 3GV9A 3Q7ZA 1DJAA 3LIFA 1LSWA 1P97A 5FI2A 2W0NA 1S1YA 4HJ4A 3TZ2A 2ESAA 3BY9A 2XCMA 4FSFA 1PW1A 3GSGA 4LWHA 1Z09A 4B93A 2ZL1A 3HL9A 3IT9A 2YKIA 2VZWA 4ME4A 4Y13A 4JKTA 3DGEA 3A0XA 3RLRA 2PU4A 4KQDA 1E3UD 3UB8A 3EOIA 3K97A 2XH9A 2OWJA 5TBMA 1TVFA 5FL3A 4P85A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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