4R3AA

Erythrobacter litoralis el346 blue-light activated histidine kinase
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
331
structure length
318
Chain Sequence
HDKEAWGRLPFSLTIADISQDDEPLIYVNRAFEQMTGYSRSSVVGRNCRFLQGEKTDPGAVERLAKAIRNCEEVEETIYNYRADGEGFWNHLLMGPLEDQDEKCRYFVGIQVDMGQSERATELDRQLAEVQHRVKNHLAMIVSMIRIQSAGGVGSQFDSLSRRVEALQLLYQEMDIKIIPLGAYLGRIASAINHIDGRGAIKVNVQADTVDVPVETAGRIGLLVSEVLTNALQHAFSDRASGVVQLRSSVMSGEQLRVTVEDDGRGIPEDCDWPNEGNLGSRIVRQLVQGLGAELNVTRGGTGTIVNIDIPLSQQKTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Blue-light-activated histidine kinase 2
publication title Full-length structure of a monomeric histidine kinase reveals basis for sensory regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Erythrobacter litoralis htcc2594
molecule tags Signaling protein
total genus 99
structure length 318
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2014-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07568 HisKA_2 Histidine kinase
A PF13426 PAS_9 PAS domain
A PF13581 HATPase_c_2 Histidine kinase-like ATPase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.450.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta-Lactamase Beta-Lactamase 4r3aA01
3.30.565.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Heat Shock Protein 90 Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain 4r3aA02
4XIQA 5F69A 1MX0A 4R3AA 1I5CA 1OTAA 3FT8A 2QJ5A 3GECA 2XX2A 5CPHA 4R6LA 4CE3A 4JASA 2I9VA 5HD3A 1TS8A 2VW5A 4PKYG 4DJ2A 2OOLA 4PU9A 1UGUA 3A0TA 2GJ3A 4HZ0A 1XFQA 4E00A 1YETA 2YEIA 2XJJA 3VHDA 1OJGA 3INXA 4GS9B 2BYIA 4ASAA 2YEHA 5HDCA 2IWXA 3CWFA 1U2OA 1US7A 3RKZA 4KQDA 3T2SA 4KUOA 4H6JA 3WHAA 4B9OA 2ZKJA 4LRYC 4KSGA 1GSWA 5D6PA 4MN6A 3K99A 2YEDA 3UE6A 1S4SA 4R70A 3VHAA 3SL2A 3F1NA 3K3DA 4HJ4A 2XD6A 1TILA 4JQLA 2H8MA 2WEPA 4L90A 4NH8A 1GJVA 4JGOA 4X9LA 2PNRA 2JKIA 3F1PA 2VLGA 5M4KA 1ZWHA 3H80A 2YEEA 4CWFA 2HV1A 2Q2EB 1D06A 2IOPA 3B24A 4AWPA 2M1CA 2XDKA 4NXBA 1V9ZA 1A4HA 3LUQA 4EQ1A 1UYFA 4KFGA 4FMTA 4HP4A 1AMWA 3E4QA 3PEJA 2A24B 1OT9A 2O1VA 2INWA 4H85A 2YE5A 3IS2A 2CMNA 1H7SA 3LICA 2Q8HA 3G75A 3K60A 2WI5A 4KQVA 5IN9A 2Z6CA 4RQ9A 2YKCA 1XJ6A 4CWQA 1TIDA 4XKOA 3R4PA 2QWSA 1JM6A 2FWYA 4MPEA 1N9OA 4BBVA 1B62A 2YKBA 2WI6A 3KE6A 4PRVA 1UYCA 2GQPA 2YJXA 2YEFA 3LIFA 3OLOA 3LI8A 3RLPA 2L4RA 2BREA 3T0ZA 2XX4A 3EKRA 3ULFA 4EERA 2YE2A 3O6OA 3U67A 4R1FA 2ZBBA 2BSMA 1UYMA 2CGFA 1PVGA 2YI6A 1I5BA 3EHHA 3NMQA 4HY6A 1UYDA 5J71A 5DKLA 1YERA 3CGZA 3O2FA 3GIGB 3NJAA 4GEEA 2Q8GA 1GSVA 2XDLA 2QJ7A 1VB6A 3CLOA 4BBTA 4QPKA 2FXSA 3HJKA 2YE3A 1DP8A 2O1UA 2YE8A 3MQQA 5HWWA 3LIDA 4KUKA 2B02A 3SW1A 1UY8A 2IWSA 5BOCA 3BM9A 1LSVA 3ICYA 3EEHA 4O04A 2CCUA 3QDDA 2WKRA 1AH8A 2XX5A 4EGKA 4HI4A 4MPNA 1DP6A 5D7DA 2L1MA 3PYPA 5IDMA 1S67L 4CWSA 2YEAA 4KP4A 1Y4UA 2YK9A 3EHJA 4Q20A 5J4EA 4PRXA 5TBMA 3LYXA 3LI9A 1GKXA 1NHIA 1UYLA 2YE6A 4XIRA 4R3MA 5F5RA 3Q5LA 2Z6DA 2XJXA 2PHYA 3WQ9A 1OTDA 2VCJA 4HOIA 1U0ZA 1I59A 1T1CA 1N9NA 4WL9A 1BGQA 2CCSA 4F3LB 4AS9A 2VEAA 2YI7A 4W7TA 2ZOHA 3B27A 1H7UA 3INWA 2XK2A 5CTUA 1UY9A 4XCJA 2YJWA 1BKNA 4EFUA 3HYZA 2OWHA 4YKUA 1ZXMA 3BY8A 4O09A 3NOUC 3R4OA 3VHCA 2WKPA 1YC4A 3A0WA 2D02A 1KOUA 3H9WA 1L0OA 4FPPA 4WUCA 2A24A 4LWIA 2XDSA 2YI0A 4O0BA 1Y8NA 1DRMA 4CWTA 2L0WA 4XITA 3K3CA 1YESA 2QG2A 3TTZA 2KX6A 4MBCA 1Y8PA 3C11A 3MJQA 4GW9A 4FCRA 4LWFA 2YKIA 1OTBA 2PDRA 4HH3A 4FCPA 2YKHA 4EEHA 3MXQA 3K97A 1KIJA 1TS0A 1QY8A 5HDSA 2R78A 3F1OA 2BU8A 2FWZA 4L93A 4BXIA 4MP7A 3H7WB 1Z5BA 1T18A 2BASA 1S4RA 2PR5A 2BU5A 2J80A 1TC0A 2YGAA 3BY9A 1TH8A 4YKQA 3T0HA 2AKPA 2CCTA 2PYPA 4CWRA 2WEQA 2YE4A 4LWEA 3R92A 3TZ5A 4HXZA 2Q8IA 1I58A 2PR6A 3RTYA 4H7QA 4XC0A 5D7CA 3CAXA 2VV8A 3A0YA 1YSZA 5DJTA 5HWVA 1XJ3A 2YKJA 1S66L 3H82B 4JGPA 1XFNA 2CG9A 3EKOA 3TZ2A 1AM1A 1Z59A 4HH2A 4HHDA 5BODA 4YKWA 1EI1A 2BU2A 2K7SA 2HKJA 3D36A 3HZ1A 1V9YA 2BT0A 2H28A 2BU6A 1S1ZA 3VOLA 3JZ3A 3LIAA 5HZHA 4U7NA 4GHIA 3A0VA 1TBWA 4HP9A 5M4HA 4BQJA 3D2RA 3B26A 1X0OA 3K98A 4XT2A 2QFOA 2WI3A 1Z5AA 2XHTA 4GT8A 3QTFA 1XJ2A 1T19A 4U7OA 3HYYA 1B63A 1S1YA 4EGIA 2YE9A 2PD7A 1YT1A 4BBUA 4I38A 4YKXA 3EHFA 1ID0A 5CF0A 5G4ZA 2WKQA 4PKYA 3C2WA 4F3LA 4WLAA 3UMEA 4EEPA 2E0AA 2YEGA 3TZ4A 1TS7A 3P7NA 4EFTA 4ASGA 3VE3A 3KX0X 1P0ZA 3CRKA 3TUHA 2WI7A 4LP0A 3NOPC 4NH7A 4U93A 3A0RA 3Q5KA 4P8OA 4HXWA 1OSFA 4BAEA 4EW7A 3Q5JA 2WI1A 2BTZA 4HJ3A 4JAVA 4B7PA 4UROA 5M4PA 4BIUA 4GS9A 1BYQA 2YKFA 4I3AA 4JAUA 4L8ZA 3F1PB 4WUJA 4ASBA 4YKTA 3G7EA 4URLA 1S14A 3A0ZA 5G4YA 4URMA 4XIPA 2VCIA 3BMYA 3ZKDA 5F68A 2D01A 4HZ5A 3NHQA 1Y4SA 1UYGA 5AVFA 3UB9A 1AH6A 4O07A 3UB6A 2YGFA 4L91A 4EESA 3UB8A 4NXGA 2QG0A 1NHJA 3E4OA 3RLQA 3R4NA 1UYEA 2WI2A 5I5LA 4I3JA 5KIZA 3VE4A 4I39A 4K08A 3CRLA 4AWQA 4L9GA 2ZDXA 4EMVA 1YS3A 3OWDA 1YSRA 5DJUA 1EA6A 3BWLA 2ESAA 3HHUA 4YKZA 2PYRA 2V0UA 3C8CA 2C2AA 4HIAA 2QHKA 4XCLA 4JGQA 4WF0A 3FC7A 5L3JA 1N9LA 3UB7A 1AJ6A 1BYWA 3D0BA 3MR0A 3HZ5A 4M4XA 5CTXA 3TZ0A 2V0WA 4GCZA 2XCMA 4WUDA 4V25A 3H82A 5FNDA 5FWKA 4BIZA 1ZXNA 3C0EA 2XHRA 4DUHA 3HJIA 4HQAA 4I5SA 1MU5A 3HEKA 1YT2A 2W27A 3A0XA 4LRXC 2OWJA 3PEHA 1QYEA 3MFXA 2O1WA 3CGYA 4E04A 4L94A 3T1KA 1I5DA 1XJ4A 4NH9A 1YT0A 4DZYA 3PHYA 4CWOA 3LNUA 4GQTA 4LWHA 5HSQA 4LPZA 1Z5CA 1GSXA 4CE2A 5AVEA 4MPCA 4XKAA 3EHGA 3T50A 1UY6A 4WUBA 3T10A 5CTYA 4R38A 4YKYA 1T1AA 4LRZE 5CTWA 4K4OA 3U2KA 5IS1A 4CE1A 4YWZA 3R91A 4EGHA 2P7JA 3R4MA 4HJ6A 4QPJA 3IBRA 5J6AA 5HDDA 3RH8B 3GIGA 3MNRP 2XHXA 4XTJA 5TBMB 5F5YA 1S16A 4MB9A 2XDXA 3FV5A 4FCQA 3B33A 1WA9A 4EXOA 4XDMA 1UWPX 4CWNA 1MZUA 5D7RA 3VADA 2YK2A 4AWOA 4I3IA 4I3HA 3A0SA 4YKRA 3FG8A 3GIEA 2GFDA 2YEJA 2ZDYA 3GIFA 5A8BA 3LIEA 2ZBKB 3G7BA 2XJGA 3ZM7A 1TS6A 4GFNA 4BQGA 2EXLA 2HCHA 2K5BA 1B3QA 4HY1A 1OJ5A 1GKZA 3LIBA 4E02A 2BZ5A 3ZXOA 2UWDA 4P7AA 3ZQ5A 4PL9A 5DKKA 3OWBA 2ZOIA 1LT0A 4L9EA 2XDUA 1ODVA 1T1BA 4EEUA 4MN5A 1F98A 3ZXQA 3H4LA 4HY8A 2BRCA 3FT5A 3UMDA 4XE2A 2KDKA 3EWKA 3DGEA 1LL8A 4MOTA 4H6JB 4HYMA 1DP9A 3G6OA 3D72A 1THNA 1NHHA 2YECA 2BU7A 5F3KA 5F6AA 4H81A 2WERA 3CWVA 3F1OB 5M4MA 4L9FA 1UYHA 4LWGA 5IU1A 2PD8A 1UY7A 3U2DA 4EM7A 1OTIA 3F1NB 2VV6A 2HG1A 2WI4A 2JJCA 1OT6A 4ZVIA 1LSWA 5HWTA 2YEBA 3IEDA 1P97A 1UYKA 5J3WA 3NOTC 2YI5A 1EW0A 1I5AA 4E01A 3LPSA 3B25A 3B28A 3GDIA 2BYHA 1D7EA 4NXEA 2QF6A 1QZRA 1UWNX 2IWUA 1BXDA 4WN5A 1YC1A 2CH4A 3O0IA 4KTNA 4URNA 5IDJA 3E4PA 4KSHA 5C93A 2YKEA 5M4NA 2JN7A 1F9IA 5HD5A 3IS2B 5FNCA 1ZW9A 1G28A 4XKKA 4JGRA 1Y28A 3H7WA 3OW6A 3RLRA 2VV7A 2FYPA 1JNUA 2H55A 3MQOA 4NXFA 4HYPA 5M4EA 2IORA 4LPBA 4GHIB 4MP2A 2EA9A 4HNBA 1LSXA 4XT2B 3ZKBA 4ASFA 4DJ3A 2YE7A 4ZKIA 3OMUA 1R62A 2W0NA 4LLOB 5GGZA 2Q8FA 2V1BA 2V9AA 4V26A 4O05A 5EFWA 1Y8OA 2V1AA 1UYIA 3OPDA 5D6QA 2VWCA 4CWPA 4B6CA 2YGEA 2QKPA 4XD8A 1YC3A 1TC6A 5J7EA 4EETB 1OTEA 1NWZA 2IOQA 1KZNA 2XABA 4GGLA 5FNFA 2JHEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DE2A 4GD8A 3FT8A 3GECA 4P6ZM 2VGKA 2Q9MA 2VW5A 2GJ3A 3O3VA 2ZMVA 3DTMA 3ISGA 3UDIA 4FOFA 1MKMA 4KZ9A 2W3GA 2WGWB 3IF6C 4GS9B 5A90A 2BYIA 4EBLA 4X53A 2YEHA 4G3KA 1U2OA 4E3JA 1US7A 2JCHA 4DE3A 3BFGA 3T2SA 4YINA 2ZKJA 3WHAA 2Y2JA 2RL3A 1GSWA 1OPXA 5M1AA 5D6PA 4MN6A 1MY8A 3P09A 5CERA 2XROA 5TJJA 3T12B 5FL3A 2XD6A 1TILA 4Y3IA 4JGOA 3F1PA 4UEYA 4CWFA 2HV1A 1D06A 4NXBA 4D2OA 1SHVA 4HESA 4FMTA 2DRWA 4UQIM 1OT9A 4BL3A 4C6YA 5A92A 2PAVP 1PWDA 3G75A 1L0EA 5IN9A 2J9PA 2J7VA 1XJ6A 1TIDA 2QWSA 4MPEA 1F51A 4BBVA 2W3FA 4PAUA 1H0MA 2Y2LA 2YEFA 3KSHA 3OLOA 5HAPA 2XX4A 4DMZA 4PM6A 1GA9A 1ERQA 1RGZA 2ZBBA 4P85A 1YAXA 4ETXA 3O2FA 2QJ7A 3WS4A 1VB6A 3UNWA 2FXSA 3E2KA 4E6WA 2O1UA 3LIDA 3KYEA 2B02A 2Y2MA 4KUKA 4KZAA 1LSVA 1SCWA 4L0LA 1IELA 4EGKA 5FAOA 2FTKA 2WGWA 1DP6A 1HTZA 4CWSA 2YEAA 2YK9A 2V8CA 4PRXA 3LYXA 4WZ4A 5HW3A 4R3MA 2Z6DA 3M6BA 2XJXA 4K0WA 2UWXA 1N9NA 2CCSA 2VEAA 5E2FA 5FQIA 2YI7A 2ZOHA 1H7UA 1UY9A 4EUVA 4R1GA 4GD6A 2VX8A 5E2HA 1ZXMA 1ES3A 4E3KA 4OOMA 3QNBA 1PZOA 2D02A 3A0WA 4HBTA 1NZOA 4Q0JA 4FSFA 2OV5A 3IH9A 4KZ6A 4ZJ3A 4MCWA 4CWTA 1QMEA 4RX2A 1E4DA 2XFTA 3TTZA 3EQUA 4IBRA 1ACFA 5DTKA 2YKIA 1F2KA 4QD4A 2HJEA 4Z1WA 4Q0HA 2K2NA 3K97A 3E98A 3IF6B 1KIJA 3FPVA 2R78A 4BXIA 3T1XA 5F82A 2BU5A 2IWBA 4QB8A 3S7OA 3WRZA 2PYPA 3SZTA 4BD0A 1H8MA 2WEQA 1MXOA 3TZ5A 2VZWA 4HXZA 3MQ0A 2PR6A 1SZVA 4X68A 5D7CA 4PM7A 5CEBA 4IVIA 5DJTA 1YSZA 1TEMA 3ZHHA 2YKJA 2CG9A 2JKFA 1AM1A 4R0QA 5AQAA 4B4ZA 2K7SA 5M18A 4ZJ1A 2BT0A 2H28A 2GX5A 2WAFA 3G31A 2W3DA 3LIAA 1TBWA 4R3BA 4S2PA 2HDUA 4U0TA 5DF8A 3D2RA 3B26A 2XF3A 2XHTA 4GT8A 3EEAA 3OCLA 4Y15A 3HYYA 1B63A 1S1YA 4EGIA 1L0GA 2YE9A 4BBUA 2JKRI 4I38A 2CC1A 1YT4A 1ID0A 2WKQA 1ZKJA 3P7NA 2WK0A 3KX0X 3RJUA 3CRKA 3TUHA 4DN0A 4NH7A 2Y2QA 1BULA 4P8OA 3Q5JA 1FR6A 1YLTA 2LB5A 4WEJA 5L07A 4JAVA 1J3WA 4BIUA 1L3LA 4O8GA 4WUJA 4MEZA 4YKTA 3A0ZA 2FZ0A 4JF4A 2VCIA 2ACGA 3UB9A 1AH6A 4MBKA 1YMXA 4BL2A 1UYEA 2OLVA 4JXVA 4E6XA 3VE4A 3KYZA 4AWQA 4EMVA 2ZLYA 3QP4A 3NC8A 3BWLA 2V0UA 1FIKA 4HIAA 4KZ8A 3UB7A 4FH4A 3MR0A 3PTEA 1TDLA 4WUDA 3IX3A 5FNDA 4U0XA 5JENA 4GNUA 3B47A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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