4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
4FSVA 4BR9A 4CZIA 1U2VA 3F9MA 3SLCA 3S41A 3WXJA 3HTVA 4O5FA 5AQIA 1RGIA 2FSJA 3UE5A 4BR4A 3VF2A 5AZJB 3W3DA 1GLBG 3WXKA 5KPZA 4BVOA 5F2RA 3LDPA 1X3MA 3WEEA 1GLDG 4FOIA 5BREA 2A5XA 4XH5A 1NGCA 4HTLA 1HX1A 3FR0A 3VF4A 3JXUA 4B1WB 2DPNA 4BROA 1E4FT 3RSEB 4WYBA 3DWLA 3FLCO 1G99A 4FO0A 3R9PA 2YHWA 4QS7A 3VEOA 2E2OA 1WOQA 4BRLA 4AM7A 3BEXA 4BQLA 5BR9A 2EWSA 3M3ZA 3P4IA 1ATNA 3O6WA 2V52B 3CHWA 2HF3A 4AM6A 2CGJA 3EN9A 5JLHA 4BG9A 1BUPA 3L4IA 3U8XA 4BRMA 1BU6O 1YUWA 1T6CA 4BC4A 3MN7A 4BRDA 3QDKA 4BVPA 5LY3A 3UKUB 1HJOA 4B1UB 4RWTA 1XUPO 2Q97A 2CGKA 4CZGA 3EL2A 1J6ZA 2VWBA 5AQWA 1XQSC 3VETA 3VEVA 1GLFO 1KAZA 5FPDA 4K25A 4BRNA 5JICA 1DKGD 3L0QA 2Q0UA 4FWMA 1DGKN 3ULEB 3A0IX 2FF6A 4QS9A 4RCHA 3CJBA 2P9UB 2ITMA 3H1QA 1MWKA 5AQGA 3H1VX 4WQ5A 1K8KA 1TUYA 5AQJA 2QXLA 4EAHD 2E2PA 4MLEA 3A5OC 4CZKA 3GL1A 1QHAA 1X3NA 3BF3A 4BGBA 3QICA 1ZBSA 3A5LC 5I9EB 4FWSA 4ISGA 5LJVA 3HI0A 2ASMA 4H5VA 4JAXA 4H5TA 3UKRB 1YXQA 4B1YB 4JHDB 3R6MA 1NLVA 1NWKA 2A6AA 2P9IA 3FFKB 4JN4A 4Y0WA 3H45C 2ZF5O 1NGIA 2A40A 3LDLA 4CBWA 3CERA 5EX5A 1RFQA 2QW9A 3VGLA 5JMVA 4BR0A 4CJ7A 5AQQA 3U9DA 4FWNA 2D0PA 3LDOA 1BOTO 5AQHA 2CGLA 3TU5A 2VYPA 3H6EA 2ZGZA 4PL8A 3ZEUA 4A2AA 4WQ4A 5EOYA 1BA0A 2NLXA 3D2FB 5AFUA 4BRIA 4LC9B 2BTFA 1BWFO 1X9JA 2E20A 3C7NB 3O08A 1KAYA 2ASPA 3QMLA 3MDQA 2E2QA 4O8KA 3D7EO 3CETA 5LJWA 2CH6A 3O8MA 3DXKA 5AQUA 3VEZA 4E1JA 3MN6A 2W40A 3VGKA 2AP1A 2I7NA 3D2EB 3LM9A 2E88A 3OHRA 2QWRA 4XH4A 4BGAA 3SJHA 3MN5A 5KQ8A 5FPEA 3QFUA 4CZHA 1S3XA 1YVNA 4FPBA 4H5WA 2HMPA 5FPMA 3GDQA 2NRHA 3D2FA 5AQTA 3JS6A 4CZJA 2OANA 3H46O 3SK3A 4Z94A 1IJJA 3CJ1A 1NBWA 4BRKA 5BN8A 4H0OA 3BUZB 3MMVA 1R59O 5AR0A 1Q18A 4PKHA 3VENA 5BRFA 1WUAA 4BQZA 1NGHA 1MWMA 3VEWA 2Q31A 2IVPA 5ADXH 3R8EA 3U4LA 3ZETB 4IJAA 4WQ4C 3QBWA 2ZWHA 2Q1NA 3CIPA 5AQSA 4J8FA 1P8ZA 3DXMA 1NGEA 3BF1A 4BG8A 1QQNA 3CQYA 3ZEUB 4CZEA 2BUPA 2D1KA 1GLLO 5AZIA 1U6ZA 2Q2RA 2E1YA 1HKCA 2GWJA 3VPZA 2P9NA 5AFUH 1HKBA 2H3GX 1KXPA 1GLAG 1NMDA 2PAVA 3IUCA 4M7XA 3UKUA 3IDHA 3VERA 4B1XB 4ISFA 2IVOA 5EVZA 3CJ7A 1SQKA 3ATUA 1T6DA 5BPLA 3ID8A 5AQYA 5KQDA 3AAPA 4IWVA 1NGBA 5BRHA 3LDQA 1LOTB 3HSCA 3WQTA 3M6GA 4BC3A 3DXMB 1H1VA 3MCPA 1KAXA 4F9OA 2QWQA 4H0TB 5AQVA 5KPTA 3CQXA 3GBTA 3HZ6A 3FZLA 1JCEA 5TKYA 4FWPA 1ESVA 4CZMA 2W41A 4H5RA 3KHYA 3VF6A 3C7NA 4CBUA 1ZXOA 3BP8A 2FSNA 2GTDA 4L3QA 3SMSA 3WUHA 4BR5A 1QZ6A 1QZ5A 4H03B 4H0PA 4M63C 5AQZA 1CZAN 4C23A 2IVNA 5E84A 4H0VB 4A2BA 4K42A 4BC2A 2P9LB 4IZ9A 4BC5A 3J8AA 4EHTA 5F0XA 1QQMA 4BRFA 2YI1A 3GOIA 2HF4A 1DEJA 4XH1A 1Y64A 2AA4A 5ADXA 4NO7A 3O80A 3O4WA 3DXKB 1ZC6A 3EZWA 1TUUA 4FPAA 5AQNA 5AQPA 3A8YA 3O1WA 2QWNA 3SMPA 3TPQA 2GELA 4EHUA 4BR7A 4BR2A 3FZMA 3VEYA 4PKIA 1YAGA 3QFPA 4PKGA 2F9WA 2I7PA 2YHXA 3O5BA 3GE1A 1Z05A 3I33A 4YDUC 5AZJA 2GWKA 1MA9B 4BRGA 5EY4A 2P9LA 3W0LA 1C0FA 1ATSA 2V51B 5EXWA 4KBOA 2A41A 3EKSA 4BRHA 1TYQA 4EFHA 4FWLA 4DCHA 3QB0A 4K41A 4A62A 3WXLA 4CBXA 3FZFA 5E26A 4GY2B 4H0YB 1BDGA 4JHDA 3KZBA 2A42A 4WQ5C 1IG8A 3QBXA 3UKRA 2QM1A 4FOEA 2FSKA 3DAWA 4RTFD 3VESA 1JCGA 2FXUA 1U2VB 3A5NC 2VCPA 2QWLA 2Q0RA 3UB5A 2P9KB 3ZETA 1MDUB 4FWKA 1NGJA 1K8KB 4BREA 3GG4A 3AY9A 4B1VA 4JD2A 4H0XB 4EIAA 1XC3A 3ZX3A 1NGGA 2D4WA 4MLHA 3FZHA 1BO5O 4DB3A 2YJEA 3I8BA 1SAZA 4MO5A 3WQUA 1TYQB 3HM8A 3FGUA 3IFRA 3ZX0A 2QWOA 3ATVA 4PL7A 3U9ZA 2V7ZA 3WEEB 2P9SA 3FE1A 1QQOA 4YDUA 2P9PB 1BA1A 1NGFA 4JNEA 3G25A 1GLEG 2P9IB 3D2EA 1NGDA 2E2NA 2QWPA 5F1XA 3MK6A 1GLCG 1ATRA 3EO3A 1NM1A 2CH5A 4NB4A 4FWRA 4IO8A 3O1BA 1RDWX 2YJFA 3M1FA 2HOEA 3CJAA 1GLJO 2IIRA 3EKUA 5AQMA 3H3OB 5BN9A 4FL9A 3L6QA 5JLFA 5AQFA 3ZX2A 4XEIA 5CE3A 2P9PA 2P9SB 5B8HA 3IMXA 1BG3A 4CI6A 4BRAA 4BRCA 1NGAA 5AQRA 2P9NB 2QWMA 4I6MA 4I6MB 2E1ZA 1S22A 1Z6RA 4CD1A 3FZKA 5AQLA 2YHYA 3LDNA 4A61A 2F9TA 4DQ8A 3AAQA 3C0BA 4DHYA 1V4SA 1OKJA 4GNIA 1JCFA 1E4GT 1LCUA 4M7YA 2ASOA 5AZIB 5ELZA 4H5NA 2FF3B 2ZGYA 5AQXA 4FWQA 4K43A 3B8AX 3CI5A 2Q36A 4BRQA 4FWOA 4CD3A 2D0OA 5AQKA 3VGMA 4B9QA 4B1ZA 1D4XA 3DJCA 3HBTA 2P9KA 4IJNA 2NZTA 3LL3A 5FPNA 2V7YA 3LM2A 1HKGA 4IXCA 3H3NO 4CZLA 2GUPA 3VEXA 2P9UA 4BRPA 2GEMA 3KVGA 3CJCA 2WUSA 1HLUA 5BPNA 1HPMA 4JD2B 2A3ZA 3WXIA 4QS8A 3ENOA 3AARA 4MO4A 5BPMA 1EQYA 1C0GA 2PBDA 4CZFA 2FLOA 2YCHA 2KHOA 2UYTA 5BRDA 1V4TA 3CJ9A 5AQOA 1HUXA 4ISEA 3VOVA 3A5MC 1T44A 2J4RA 3MN9A 3WT0A 5KPRA 2E8AA 1SZ2A 4HWIA 3ULEA 3RSEA 3ENHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V1OA 5A2QO 1TK5A 3F9MA 2OPPA 3S41A 5GINA 1NK8A 2FSJA 2VWJA 1W7AA 3LAKA 4GKJK 3T19A 3LDPA 1GLDG 2VQEK 4CK1A 2A5XA 4XH5A 3ULDA 2HHXA 1XHZA 1HX1A 1WAFA 2QXFA 4NYNA 3FR0A 3ASMA 1VQ4N 3JXUA 4FXDA 2O8FB 2ITGA 4CK3A 3R9PA 3G6EN 4M3UA 4Z4GA 1UAXA 5JS1A 3OW2M 3MEGA 3ZYYX 4DV2K 2E2OA 4DSJA 3K9JA 2D0BA 4PY5A 3M3ZA 3DLGA 3O6WA 2HW3A 4Z4FA 1EXQA 2CGJA 4CJUA 3M8RA 4KHSA 1KVCA 3I0SA 4BG9A 5JLHA 1BUPA 3U8XA 4BRMA 1BU6O 4C8MA 4BC4A 3MN7A 3UKUB 4BDZA 1XUPO 2Q97A 2CGKA 3T7ZA 4FK0A 1VSMA 1O1WA 1WSGA 1VRTA 3M8SA 4AHSA 4CJFA 5M1KA 4M3WA 1JL2A 4N5SA 1VSFA 4B9SA 4CHYA 4GMJB 1WB9A 4FJ5A 5HP1A 3A0IX 3TTCA 4RCHA 1YIJN 3U6FA 1MWKA 4WQ5A 2QXLA 4F8RA 1HNXK 5DM6L 4KI6A 4B9VA 3QICA 3A5LC 1E3MA 3MCAB 4ISGA 2P1JA 5LJVA 3HI0A 1UA1A 1TKZA 1C0UA 3UKRB 3M8PA 1YXQA 4B1YB 1NLVA 4FJNA 1YHQN 4KH6A 2P9IA 4AHCA 1VQ6N 2OA8A 3H45C 4OLBA 3M8QA 3OS0A 2QW9A 3VGLA 4CJLA 3B6OA 4X64K 2D0PA 1LWEA 2Q3SA 1Q7YO 3EEQA 3OYIA 3H6EA 3V6DA 4PL8A 4A2AA 3CM5A 3MXMA 4WQ4A 4CHQA 2UUBK 2BTFA 1BWFO 4G1QA 1KAYA 3QMLA 5HRSA 3MDQA 3THXB 1LWCA 3CETA 1KLNA 3VEZA 3DXKA 5AQUA 3ZSYA 3TSUA 3LANA 1J54A 2W40A 3VGKA 2I7NA 2Y1JA 3D2EB 2O8DA 4DV5K 2VGNA 3MEEA 2QWRA 3OHRA 3L2QA 5KQ8A 3PIPL 3GDQA 4DTOA 4KH4A 3T1HK 4IEEA 3RMDA 1NBWA 5J2QA 3VQEA 4CEEA 1HYVA 1R59O 4CGFA 5AR0A 5C2FA 1N36K 2O8CA 1Q18A 5C0YA 3AVNA 4CEAA 5KRSA 4LH4A 3ZSRA 3L2WA 1IG9A 4M3YA 3RR7A 3ZETB 3CM6A 4IJAA 4DF8A 5HRNA 1BCMA 3OYMA 1VSLA 3OS1A 3CIPA 4CCHA 1BIUA 4YORA 4BG8A 1QQNA 3ZSVA 1K8AO 4E0DA 4F4KA 4WFAL 2D1KA 4DS5A 4IO9L 1U6ZA 3NHGA 5DM7L 4CE9A 1HKCA 1WSJA 3LPTA 4DTSA 4E3SA 1HKBA 2H3GX 2G8VA 1KXPA 4Q5VA 4KPYA 2E6LA 1NMDA 2PAVA 3IUCA 4CHOA 3VERA 4B1XB 2IVOA 1BL3A 4CGGA 1TAQA 1N34K 1T6DA 5DMRA 2BANA 3TWHA 5KQDA 1JLBA 3TAFA 3S3NA 4Z4CA 1YITN 4FZXC 1VSIA 4CF9A 3DXMB 3L4QA 4LFBK 2KKZA 1RBRA 2QWQA 4KTQA 5AQVA 5KPTA 3NFAA 3CQXA 1RCHA 3CCVN 4RW7A 1ESVA 4OLAA 3KHYA 4I2QA 3OJUA 4CBUA 2O8BA 1IBKK 1NOZA 4L3QA 2UUAK 2O8EB 2WBNA 5C12A 2UUCK 4H03B 3NF6A 3OVNA 4FLXA 4KHQA 1CZAN 3PUFA 4K42A 1L3VA 4K8ZA 3HOTA 3O3FA 3AVBA 4CFDA 2PZSA 1QQMA 2YI1A 5GIPA 4JI8K 3R3LA 1DEJA 4NO7A 3HVRA 3O80A 3AA3A 3DXKB 4FM2A 1ZC6A 3IAYA 2YNFA 5AQNA 3OYBA 2RF2A 4EP4A 1BI4B 4FM1A 2VGMA 4BR2A 3ZT3A 3E66A 5CZ2A 3FZMA 3QFPA 4PKGA 4JKBA 2YHXA 4JKAA 1HJRA 4LH5A 3I33A 1A5VA 5KGXA 3KTQA 1ZYQA 3THWB 1MA9B 1YVUA 1C1BA 4DSFA 2X74A 4KBOA 3SNNA 2UU9K 2KZZA 4IOAL 1HPZA 1KTQA 4A62A 3WXLA 3SUOA 2XY8A 4CBXA 5IWAK 4GV6A 1BIZA 1ZBIA 2A42A 3M5RA 1HNVA 3JAMO 3UKRA 2QM1A 4FOEA 4CF2A 1Y97A 1T8EA 2VCPA 1F21A 2I5JA 4DFPA 1YF5L 3ZETA 3PX0A 4Q0BA 4KV8A 1FXXA 3CCMN 1QVGM 4FK2A 2YNHA 3K9KA 5CYQA 3AO1A 4MLHA 3FZHA 5T7BA 2YJEA 3P5JA 3HM8A 1B9DA 4KRFA 4FVMA 3K59A 1ASVA 1RTJA 3P31A 4PL7A 4JI2K 3WEEB 3DRPA 3FE1A 1FK9A 4DTXA 4O55A 4FLYA 1GLEG 1RT1A 2E2NA 5M1FA 1TL1A 5F1XA 3MK6A 2G8WA 3EO3A 2W42A 1NNEA 3TAGA 3LALA 4IO8A 2HBKA 2Z1HA 3VQQA 1NK0A 3VN5A 4O0JA 4FLZA 1VQNN 1GLJO 3SV4A 2R7YA 3L6QA 4K8XA 1DLOA 5CE3A 2O8FA 2NRWA 3AVAA 4CIFA 3O9SA 4QAGA 3NE6A 1NGAA 4DFJA 2QWMA 2O4GA 4DSKA 4I6MB 1NJYA 1UA0A 3FZKA 1DT9A 2FC0A 3RRHA 3TAMA 3C0BA 1LCUA 3V9WA 1LW2A 4WFNL 2ASOA 1VQ7N 1IKXA 2RKIA 5AZIB 4H5NA 3NH1A 4CEOA 2XO7A 1QSSA 1HRHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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