4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
3AAPA 3HM8A 4MLHA 3LM9A 3AY9A 4FWMA 3VERA 1U6ZA 2NRHA 5FPMA 4BR9A 1GLCG 2CH6A 3EKSA 4AM6A 1HJOA 5JMVA 3CJ7A 5AQYA 3IDHA 4H5WA 3WT0A 2VCPA 4B1ZA 1Z05A 4WQ5C 2A6AA 2PBDA 1QZ6A 1BU6O 3U9ZA 3DXMB 2F9WA 1U2VB 3FGUA 1YXQA 4PL7A 4H0OA 4C23A 5BPNA 3QDKA 3VGMA 5KPRA 5AQOA 3BEXA 3FZKA 3H46O 2Q0RA 5JLFA 4IJAA 3CQXA 5AR0A 3R6MA 4FO0A 4BRAA 3H3OB 3L0QA 4L3QA 1SQKA 4CZHA 2P9IB 2GTDA 3EZWA 4DB3A 3M6GA 2E2PA 2IVPA 3EKUA 3MDQA 4QS7A 2QWPA 5EX5A 3SJHA 1HX1A 3LM2A 2E8AA 1NWKA 4DHYA 5AQJA 1JCGA 2KHOA 4B1WB 3GG4A 3ULEB 1E4FT 4A61A 2HF3A 2W41A 2HF4A 3O4WA 4FWNA 1XUPO 4H5RA 5AQNA 3U9DA 4IXCA 3U8XA 3HZ6A 2YHWA 2GEMA 4KBOA 3SK3A 3MN9A 2CGKA 3GOIA 5AQIA 2YJFA 3IMXA 3WQTA 3BF3A 1YVNA 2A40A 4FL9A 3M1FA 1SZ2A 3ZEUB 4H0YB 3MCPA 3VEOA 4IZ9A 3OHRA 5F2RA 1TUUA 4BRMA 1CZAN 5LJWA 1R59O 3M3ZA 4RCHA 5BR9A 3WXLA 2E20A 2Q36A 2P9IA 3ENOA 4NB4A 4BREA 3QB0A 3L4IA 1RFQA 4GY2B 1YUWA 4H03B 3RSEA 5BN9A 4GNIA 5AQHA 4EHTA 2FF3B 3FE1A 4EFHA 3WEEB 1T6CA 2Q2RA 4CBWA 2AA4A 1NGFA 2UYTA 3O6WA 1MA9B 3H1QA 1S3XA 4H5NA 4BQZA 2ITMA 2E88A 1HUXA 5AQRA 1DEJA 3ZX2A 4BRFA 1ATNA 2P9UA 3A5OC 3GE1A 1GLFO 2E1ZA 3J8AA 2YHYA 3HI0A 1NBWA 3GDQA 4BRHA 3SMSA 3C0BA 3LDPA 4I6MB 3TU5A 4EIAA 3I33A 1NGGA 2QWMA 1MWMA 2E2OA 3ATUA 2FF6A 1ATSA 2ZF5O 2VWBA 3FZLA 3FZMA 3VEXA 1DKGD 2A41A 2ASMA 5AQXA 1X3NA 2AP1A 3L6QA 4MO4A 1GLEG 1YAGA 4QS9A 2CGLA 4JHDA 1HPMA 2W40A 5EY4A 4FWLA 2BTFA 5AQQA 4WQ4C 4BC5A 3DAWA 3R9PA 1WOQA 4RTFD 3U4LA 2VYPA 5LY3A 3G25A 3MK6A 5EXWA 4Y0WA 3LL3A 4FWQA 5KQDA 4CZKA 3LDOA 2E2QA 4AM7A 2FSKA 4JNEA 2FSJA 1NM1A 3VEVA 4F9OA 4I6MA 3CI5A 2YCHA 5AQPA 2YJEA 5EOYA 2IIRA 3QFPA 1C0GA 4BGAA 3GBTA 1GLJO 4Z94A 2QWRA 4H0VB 5KQ8A 5BPLA 2P9PB 5EVZA 2GWKA 3HTVA 5AQUA 1KAXA 4BR0A 4BC2A 5ADXA 3O8MA 1JCEA 4PKGA 3A5MC 1XQSC 4HTLA 1GLDG 1BA0A 4H5TA 2D4WA 3UKUB 4CZIA 4BG8A 2F9TA 3P4IA 1K8KB 4BRQA 2QW9A 2V7ZA 3QICA 1KXPA 2A3ZA 1G99A 5FPNA 3DXMA 3WQUA 5FPDA 1U2VA 3D2EB 3ZX0A 3DXKB 4M63C 1H1VA 2Q0UA 3D7EO 4CD1A 2H3GX 5KPTA 2E2NA 3IFRA 4BRPA 3UE5A 1GLAG 2NZTA 1TYQB 2FXUA 4DQ8A 4CZEA 2V52B 5BN8A 1NGEA 4FWPA 1HKGA 2P9NB 5F0XA 2FLOA 1SAZA 1NGJA 3KZBA 3EN9A 3VEYA 3H3NO 3LDNA 2P9SB 1RGIA 2V51B 3O08A 4FWKA 4XH1A 1BO5O 3O5BA 5E84A 3SMPA 1MDUB 5F1XA 4J8FA 4YDUA 1T44A 3WXKA 3O1BA 4XH5A 2P9PA 2J4RA 3ULEA 1NGHA 3CJ9A 2Q31A 3FZHA 3CERA 3ID8A 4EAHD 1JCFA 4IJNA 1C0FA 5AFUH 3VENA 3O80A 3UKUA 1P8ZA 1ZC6A 1K8KA 5AQTA 4E1JA 1GLBG 2OANA 3VGKA 5ADXH 2QM1A 2Q97A 2QXLA 3A0IX 4K41A 3ZEUA 1E4GT 3EO3A 4JN4A 1QHAA 3LDLA 3VGLA 3LDQA 2YHXA 3DXKA 4O5FA 3A5NC 1KAZA 2NLXA 3CHWA 1Y64A 3CJCA 3VEZA 4CJ7A 4WQ5A 1S22A 2I7PA 4K43A 1T6DA 4ISFA 3R8EA 2D0PA 1TYQA 3ZX3A 3FFKB 4CI6A 2P9NA 3VF2A 5AQWA 3A5LC 3DWLA 2IVOA 4FPAA 5AQZA 3VOVA 5FPEA 3FLCO 3JXUA 1D4XA 5AZJB 4PL8A 4CD3A 1LCUA 1HKBA 4MO5A 3UKRB 4BRNA 4FWOA 4JAXA 3WEEA 4B1YB 3VETA 2P9LB 5JICA 4BR7A 1IJJA 1NGDA 2A42A 4FOEA 4BRIA 2ZGYA 5E26A 4K25A 4A62A 5JLHA 1BOTO 3QMLA 1HLUA 3TPQA 2V7YA 4CZFA 4FPBA 2GUPA 3H1VX 2HOEA 3QBXA 4H0PA 3I8BA 1OKJA 1V4SA 1NLVA 2CGJA 3QFUA 1NGCA 3H45C 4BROA 4CZLA 1QQMA 1QQOA 4FWRA 3VEWA 1WUAA 3BF1A 3CETA 4BQLA 3WUHA 3MN7A 4BRGA 1NGIA 3VF4A 3IUCA 1TUYA 2P9KB 4B1VA 1ATRA 2ZGZA 1V4TA 1NGBA 5AFUA 2GELA 1ZBSA 4BR4A 3A8YA 3C7NB 3FZFA 4BC3A 1XC3A 1NMDA 1DGKN 5AZJA 4WYBA 1ZXOA 2PAVA 4MLEA 3UKRA 1Q18A 4BGBA 3FR0A 2CH5A 3BP8A 2Q1NA 3HSCA 5BRHA 2EWSA 2P9LA 3CQYA 3VF6A 1NGAA 3MMVA 3VESA 4BC4A 4FSVA 4BVOA 4BRDA 2ASOA 5AZIB 3D2FB 4ISGA 1GLLO 5AQVA 3QBWA 4CZMA 4IWVA 4XH4A 3MN6A 3RSEB 5AQLA 4BG9A 4CZJA 5B8HA 1MWKA 1RDWX 2ASPA 4HWIA 3DJCA 3CJBA 1Z6RA 4DCHA 4JD2B 1BWFO 4A2BA 5AQSA 5LJVA 4O8KA 2FSNA 5AQGA 2A5XA 2QWOA 3W3DA 2QWLA 4A2AA 2P9KA 2D0OA 3KVGA 4H5VA 4BRLA 5BPMA 2P9UB 4FOIA 3W0LA 2E1YA 3C7NA 5TKYA 5CE3A 4LC9B 3SLCA 4K42A 3GL1A 4IO8A 3H6EA 2I7NA 4FWSA 5AQMA 2QWNA 3EL2A 2D1KA 3HBTA 3S41A 3BUZB 1BG3A 2DPNA 4QS8A 3ZETB 1BA1A 4XEIA 4CBXA 2YI1A 5AZIA 4BR5A 3D2FA 3AAQA 1HKCA 1KAYA 1IG8A 4BVPA 3MN5A 3B8AX 3D2EA 1BUPA 4BR2A 4M7YA 4EHUA 2ZWHA 3ATVA 5AQKA 3CIPA 5I9EB 4WQ4A 4B1XB 3VPZA 3AARA 4JD2A 4JHDB 1X3MA 1QZ5A 1ESVA 5AQFA 1X9JA 2GWJA 4ISEA 2P9SA 4CZGA 1LOTB 3CJ1A 4BRCA 5BREA 5BRFA 2IVNA 3WXIA 2WUSA 4H0XB 4B1UB 4PKHA 2HMPA 4BRKA 4PKIA 5BRDA 4M7XA 3CJAA 3KHYA 1BDGA 4YDUC 4RWTA 3O1WA 4B9QA 3JS6A 4H0TB 4NO7A 1QQNA 5ELZA 1EQYA 2QWQA 3UB5A 3WXJA 3F9MA 3ZETA 1J6ZA 5KPZA 2BUPA 3ENHA 4CBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MLHA 3KK2A 1BISA 3LM9A 2OTLN 2F96A 2HW3A 1NK5A 1KVCA 3CC2N 4FJ8A 4BR9A 3EKSA 3TTCA 5JMVA 4K0KK 3CG7A 3CJ7A 5AQYA 3DOLA 5J2MA 4FLYA 4B1ZA 1Z05A 1B92A 1L3VA 1QZ6A 4MDAA 3U9ZA 1RT1A 2F9WA 4DR5K 5JVHL 1U2VB 4LFAK 4H0OA 4DSIA 4C23A 5AQOA 4C8LA 1BI4A 1WSJA 4QAGA 3IRXA 2Q0RA 3SPYA 1VQKN 4IJAA 3CQXA 4JKAA 4CGGA 4CJPA 4FO0A 1HNXK 4FLXA 1I39A 3SV3A 4KHQA 5HBMA 2GTDA 2WONA 3LDSA 3KK1A 1FJGK 4FJIA 1B9DA 3SJHA 1HX1A 3LM2A 2HBJA 4J2EA 1U48A 3PSFA 1E4FT 2KFZA 2HF3A 3SUNA 5JS1A 3M8PA 4CJRA 4FWNA 2YNFA 3MX2A 3T1HK 3SBGA 3IAYA 2QKBA 4CFAA 1XHZA 3SK3A 1EP4A 3TANA 2ZQBA 2A40A 3MCPA 1JLCA 3ZYYX 3TAQA 1RDCA 4IZ9A 5KRSA 4X64K 3OHRA 5F2RA 1Q9YA 4CJ5A 1C1CA 1U49A 1TUUA 4BRMA 4CGIA 2HHTA 1R59O 4RCHA 5IT9O 3E9OA 3M5RA 3RVCA 3WXLA 2O4IA 2P9IA 3ENOA 4NB4A 2O8EB 2YHAA 3NVKA 4CEQA 1QS4A 3QINA 4V19S 4H03B 3DLBA 5C24A 5BN9A 4NCGA 4X62K 5IWAK 4GNIA 4E7LA 4DSJA 1N8RO 4NLCA 1CXUA 1BCMA 1T6CA 5J2QA 1HYVA 3THWB 3OA9A 4KTQA 3WNFA 3O6WA 1S3XA 1U47A 1NJXA 5DK5A 4DQRA 1VRUA 2E88A 1HUXA 1TKXA 2IS3A 1DEJA 3ZX2A 4O4GA 3HXMA 4FW2A 3L4QA 3U3GA 5J1EA 2OYQA 3GDQA 5A2QO 1XNQK 3IKMA 1EETA 3SMSA 3C0BA 3O9SA 1UWBA 4I6MB 5KI6A 4O0IA 1NGGA 2XRIA 5M1FA 1ATSA 3FZLA 1T03A 3TABA 1DKGD 3CCUN 1OH7A 3SPZA 4O55A 1VSEA 1EWRA 4AHRA 4QS9A 3TTFA 2CGLA 2W40A 2BTFA 2ZE2A 4A5AA 5AQQA 4BC5A 3ZSRA 3FFIA 4QCLA 3O9TA 2YKNA 3E9PA 3MK6A 1WBDA 2E6MA 4Y0WA 3MXMA 3LL3A 3NFAA 5K14A 4YOWA 4W5OA 4WFAL 4DLEA 4NXNK 1KVBA 2FSJA 1VQPN 3KLHA 4I2QA 4DTPA 4CJKA 3HPGA 2YCHA 5AQPA 4H4OA 4BGAA 1J5OA 1GLJO 2PFUA 2Q3SA 2QWRA 4GKJK 5JS2A 4CF2A 2B4JA 4CK1A 4BR0A 1Q81O 2XY7A 4DU3A 3O8MA 4PKGA 4CJ3A 4CZIA 2D4WA 5FRNA 1JLFA 3ALYA 3P4IA 4Z4GA 4BRQA 2QW9A 3OYGA 1N6QA 3QICA 4E3SA 3G0ZA 4B9NA 4M3XA 3WQUA 1U2VA 3D2EB 1NK6A 4NXMK 3DXKB 5EU7A 1SKRA 4M63C 3ZSZA 2VGNA 2H3GX 4DR1K 3IFRA 4DTNA 2NZTA 3L8BA 3NF6A 2FXUA 4DQ8A 1HKGA 1WSFA 1SAZA 2DFFA 3KZBA 4N76A 1C0MA 1RTJA 4NYNA 1MDUB 4YDUA 2P9PA 2J4RA 3VA0A 3TSUA 2FC0A 2XHBA 3CJ9A 4JKFA 1N34K 3BZCA 1RT2A 4DV4K 3O80A 4U7BA 2RF2A 4YNQA 1HYZA 4M41A 1K8KA 4A57A 2OANA 1IKYA 5ADXH 2NRRA 1GOCA 1TAUA 4JKDA 4I9QA 5GAGP 4FLWA 1QHAA 3LDQA 3PV8A 4AILC 3KWIA 4K43A 3LP2A 2EX3A 3OJSA 4Z4CA 3VF2A 4Y1CA 1ASUA 1RDUA 3A5LC 4CGFA 2O8EA 3DWLA 2O4GA 1EX4A 2IGIA 4OPHA 2QXFA 3JXUA 1D4XA 4CD3A 1LCUA 3ULDA 4KHYA 3G4SN 2GV9A 3UKRB 4FJXA 1DT9A 1VHXA 1LWCA 3S3NA 4KHWA 3VETA 5JICA 1D9FA 3P1GA 4Z0UA 3AVJA 4JI1K 3KJVA 5AJ3K 3THWA 1LAVA 4FOEA 1TK0A 2ZGYA 3CPEA 5C2DA 5E26A 3I55N 3KKSA 3MWTA 3G71N 3THXB 4ZTFA 2V7YA 3EY1A 1JL2A 1NK7A 4FPBA 5HROA 3OBWA 2HOEA 3N4QA 3QFUA 1NGCA 2QI2A 4RW9A 5GIPA 3NF9A 2PY5A 3PX0A 1TGOA 3KLFA 3CETA 2P5GA 3J80O 2P9KB 1ATRA 4CEAA 2ZGZA 2QEXN 3OYCA 1NGBA 3ZSYA 3A8YA 3FZFA 3VN5A 1NMDA 3L2RA 4MLEA 3KIOA 4BGBA 4KREA 1K8AO 2EWSA 4RW4A 4BC4A 4CERA 4FSVA 3PX6A 2ASOA 4ISGA 5AQVA 1U4BA 3F5TA 4IWVA 5AQLA 4CZJA 3F9KA 2OTJN 4KH4A 4GV6A 3DJCA 4I7FA 3CJBA 3TAGA 1Z6RA 2G8KA 4YOXA 4FZZA 4YY3K 1CZ9A 1KSPA 5AQSA 5LJVA 1NK9A 3I8DA 3TAMA 3R1XA 5AQGA 4M3UA 4KH6A 2A5XA 4N56A 3OYLA 3SAGA 3KVGA 3AVCA 1QSYA 4DFMA 4DFPA 2P9UB 4ELVA 1VSFA 4OGCA 4OJRA 1VSIA 2I7NA 1HNVA 2QWNA 4M3WA 4CFCA 3OVNA 4HUFA 4BWMA 2WBNA 3ZETB 5AZIA 1HKCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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