4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
4O5FA 3FLCO 5TKYA 3MN5A 2QWOA 2ASOA 3WQTA 1JCFA 4H0XB 4FOEA 3H45C 3UKRB 5E26A 2QWNA 2IVPA 3VGMA 5BPLA 3H46O 2EWSA 3FZMA 3GL1A 5AQKA 4BRAA 3A0IX 2CGJA 4FL9A 4CD3A 3EO3A 5EVZA 1CZAN 1SQKA 2ASPA 1Y64A 4H5RA 1TUUA 1IG8A 1HKBA 3H1QA 4MO4A 4FWRA 1S3XA 3QICA 4A62A 4B1WB 3R6MA 3BF3A 3ATUA 4K41A 4FWNA 1G99A 4H03B 3H1VX 3O8MA 4BRFA 2AP1A 1NLVA 1NWKA 1MA9B 1NGDA 2CH6A 3DWLA 2PBDA 1YAGA 4H5WA 3A5MC 3FZFA 3QFPA 1NGJA 3CI5A 1QHAA 4H0OA 4CD1A 3LDPA 2Q31A 3TPQA 1BUPA 3O80A 3ATVA 3ZX0A 4BR2A 1U6ZA 4AM6A 1BG3A 2YHXA 4DCHA 1C0FA 3C0BA 3G25A 1MWMA 5AQLA 4C23A 1V4TA 1JCGA 2ZGZA 5AR0A 3HBTA 4IXCA 3D2FB 3VENA 5EXWA 1OKJA 2FF3B 3IMXA 2QWMA 3ZEUB 4FWKA 1NGBA 5AQNA 2ZF5O 4IO8A 4BRHA 2HOEA 4K25A 1DEJA 1GLDG 3BUZB 3D2FA 3SMSA 4DHYA 1T44A 2CGKA 5F2RA 1RFQA 2YJEA 4JAXA 3FZLA 2J4RA 3GE1A 2P9IB 2Q0UA 2FLOA 2P9UB 1NGHA 3CERA 1DGKN 4MLEA 3SJHA 4BC4A 3CJAA 2BTFA 4E1JA 4CZFA 1SAZA 1MDUB 3BEXA 4FWLA 2NLXA 1DKGD 4FO0A 4BGAA 1ZXOA 3C7NA 1BO5O 1ATSA 4YDUC 1ESVA 2P9SA 3VEZA 2D0OA 5AZJA 3MCPA 4H5TA 3O4WA 3QBXA 1LOTB 4BQLA 1GLEG 3QBWA 1YXQA 4HTLA 4ISFA 3J8AA 2GUPA 3MMVA 2A5XA 5JLFA 3VOVA 1MWKA 3I33A 5KQDA 3HSCA 1NGCA 3FR0A 4BG9A 3C7NB 3MN6A 4O8KA 1XUPO 2F9WA 2A3ZA 3VEOA 3LL3A 3KVGA 5EOYA 4EHTA 2P9PA 2P9LA 2QW9A 3L4IA 3QFUA 1QQNA 4IJAA 3IDHA 1X3MA 5AQFA 2P9NA 4F9OA 2P9PB 4BC3A 4IZ9A 2A40A 3EKUA 3EZWA 4JNEA 4CI6A 4K43A 4QS8A 4WYBA 1RGIA 5AFUH 3OHRA 5FPNA 3CETA 4EAHD 4PL7A 4MO5A 3F9MA 3H3NO 1X3NA 1NGIA 2QWPA 2ZWHA 3MDQA 3H6EA 4FWOA 4CBWA 1V4SA 3R8EA 3WXKA 2YJFA 1NBWA 2A6AA 3SLCA 3CJ1A 5BPMA 2UYTA 2E20A 3BP8A 1P8ZA 4WQ5C 1YUWA 3ENOA 1HLUA 3L0QA 3WEEA 2V51B 4BVOA 5AQYA 5AQTA 5FPMA 5AQUA 2ITMA 3AAPA 4BC2A 2VYPA 4EFHA 3DJCA 3ID8A 4BRKA 3LM2A 3ZX3A 2QWQA 3ULEA 3VEYA 3DAWA 3ULEB 3VESA 1R59O 5AQMA 3VF2A 3UKUA 3DXKA 2E1ZA 1BU6O 2H3GX 5AQSA 2YHYA 4FPAA 2BUPA 4KBOA 5AQOA 4FWSA 3VF4A 4A2BA 4DQ8A 3A5OC 2HF3A 3QB0A 1T6DA 4RTFD 1Q18A 4M63C 3MK6A 4PKIA 1ATRA 2YHWA 2GEMA 3RSEB 1HX1A 1HKGA 3U4LA 4XH5A 3QDKA 4H5NA 1XC3A 4BRQA 1WOQA 5KPZA 3R9PA 3WXIA 4CJ7A 5JLHA 1HUXA 1KAZA 1XQSC 2HF4A 3M6GA 3EL2A 4CZKA 2YCHA 2GTDA 5CE3A 1X9JA 4WQ4C 5AQHA 4JN4A 3UE5A 3UKUB 1LCUA 2NRHA 2CH5A 2V7YA 3O6WA 3CJBA 1SZ2A 4GY2B 4BR5A 4BRMA 2IVNA 1WUAA 4PKGA 4HWIA 2QM1A 4Y0WA 2P9UA 4YDUA 1ZC6A 2GELA 5ADXA 3VF6A 2E2PA 3HZ6A 1K8KA 4JHDB 2E2NA 5EY4A 4CBUA 3DXMB 4CZMA 4FOIA 3D2EA 5BREA 3JXUA 4WQ5A 5KPTA 5EX5A 5ELZA 4BR9A 2FSNA 3WXJA 4CZGA 2VWBA 4AM7A 3VPZA 5BN9A 1GLCG 4B1YB 5AFUA 3QMLA 2FSJA 2GWJA 3VERA 4B9QA 5AQVA 2Q97A 3UB5A 4NB4A 4H0VB 4BC5A 5FPDA 3IUCA 3LDLA 3SK3A 1TYQA 1NMDA 4I6MA 3WUHA 5AZIB 4FPBA 4L3QA 5AQZA 2NZTA 2W40A 1KAXA 2KHOA 2D0PA 4B1VA 1E4FT 1J6ZA 4DB3A 3DXMA 1QQMA 5F1XA 5AQPA 2YI1A 4PL8A 2E8AA 5E84A 5AQXA 1U2VB 4B1ZA 3FE1A 3AY9A 2FXUA 4BRPA 3EKSA 1ZBSA 1GLAG 4K42A 4CZIA 1RDWX 3W3DA 5ADXH 3P4IA 3ZEUA 4NO7A 3L6QA 4CZJA 2E88A 3O1BA 2A42A 4IJNA 4QS7A 4RCHA 1GLLO 4QS9A 2E1YA 1YVNA 2V52B 3M1FA 4JHDA 4BR0A 1BA1A 4BRGA 3U9DA 1NGFA 2W41A 1HPMA 3CQYA 2Q2RA 3UKRA 3A5LC 1S22A 5FPEA 2Q0RA 3BF1A 3WXLA 2QWLA 3I8BA 1Z05A 4A2AA 3GOIA 2F9TA 5AQIA 1E4GT 2E2QA 3GDQA 4BRIA 4Z94A 3CHWA 3WT0A 3WEEB 2OANA 4FSVA 3HM8A 3FFKB 3O08A 2V7ZA 2I7NA 4FWMA 3D2EB 1BA0A 4BG8A 3ZX2A 3GBTA 1GLJO 1K8KB 5KQ8A 5LJVA 4BRLA 3FZHA 3AAQA 4XH4A 1KAYA 5AQGA 5BPNA 1T6CA 1GLFO 1HKCA 1NM1A 5F0XA 5AQWA 1NGAA 3TU5A 4M7XA 2I7PA 1C0GA 3KZBA 4BQZA 4A61A 2IVOA 3LM9A 3VETA 2DPNA 5AQJA 4JD2A 3H3OB 4EHUA 4FWPA 3ZETA 1GLBG 3CQXA 2P9LB 2PAVA 3AARA 3VGKA 4BRNA 4H0TB 4B1UB 1ATNA 4BREA 3VEXA 5BR9A 4CZHA 4M7YA 3FGUA 2FF6A 1U2VA 3KHYA 1QQOA 2Q36A 4J8FA 2E2OA 4BVPA 3GG4A 4BRDA 5BN8A 3CJ7A 3MN7A 3IFRA 5BRDA 2HMPA 2ASMA 2P9KB 3B8AX 2AA4A 2P9NB 1QZ5A 4PKHA 3LDQA 3A8YA 2WUSA 5JMVA 4ISEA 1TUYA 4I6MB 4BR4A 5AZJB 1HJOA 2P9SB 3W0LA 4CZEA 1QZ6A 2D4WA 3DXKB 1H1VA 3VGLA 2CGLA 3S41A 4MLHA 3M3ZA 5BRFA 3ENHA 3LDNA 2P9IA 5KPRA 4EIAA 4JD2B 3CIPA 2D1KA 2P9KA 4BROA 1IJJA 3EN9A 4LC9B 5JICA 5LJWA 2QXLA 3U9ZA 3U8XA 3HI0A 1BWFO 3O5BA 5AQQA 1Z6RA 4IWVA 3D7EO 3MN9A 3VEVA 1NGGA 5BRHA 3RSEA 4CBXA 4H0YB 4ISGA 3LDOA 5I9EB 1BOTO 5LY3A 3WQUA 4GNIA 3FZKA 1D4XA 4B1XB 3HTVA 4CZLA 3CJCA 1KXPA 4XEIA 4H5VA 2VCPA 2IIRA 3JS6A 4XH1A 5B8HA 4RWTA 1JCEA 3A5NC 2FSKA 2ZGYA 4WQ4A 4H0PA 3SMPA 3VEWA 3ZETB 4FWQA 2GWKA 2QWRA 2Q1NA 5AQRA 3O1WA 4BRCA 5AZIA 2A41A 4BGBA 1NGEA 1EQYA 1TYQB 3CJ9A 1BDGA 4BR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AVIA 3VQ9A 3RWUA 3L2UA 4EP4A 3WQTA 3RVCA 5IT9O 3UKRB 1L5UA 2IVPA 1LWEA 1WAFA 1F21A 3H46O 3VN5A 1IBLK 4A57A 4X66K 4DLGA 2CGJA 4CD3A 1EWQA 2ASPA 4CFDA 1EXQA 3ZSZA 5DM7L 4MO4A 4DWIA 1RDUA 4A62A 3SUPA 3VQEA 5FRMA 3B6OA 4K41A 4JKEA 1WB9A 3AVGA 4O44A 4NCAA 4Z4FA 1VQ8N 1NWKA 1NJZA 3THYA 1SL2A 1KQSM 4H5WA 4Z4HA 3L3UA 3CI5A 3ZSOA 1HYVA 1ILYA 3L8BA 1YITN 3ATVA 3ZX0A 4CIGA 2BE2A 1Q8IA 5T7BA 2FC0A 1BG3A 1U45A 3C0BA 2OYQA 4DU3A 1MWMA 5AQLA 4C23A 2ZGZA 3V6DA 5I42A 3AA2A 2FF3B 3IMXA 3ZEUB 4IOAL 1HQEA 3K0SA 5AQNA 4BRHA 4CIFA 4E19A 3TAPA 1W7AA 1GLDG 4RW8A 3RRGA 3NGZA 3OBYA 2DTUA 1YIJN 1RFQA 2YJEA 3PV8A 4JAXA 4KHQA 1C0TA 4DTRA 1JLFA 2J4RA 4CJQA 4IO9L 4GV3A 4DQSA 1NGHA 3CERA 3OY9A 4E1JA 4CZFA 1MDUB 3WXMB 1DKGD 4FO0A 1NJXA 4BGAA 1S1VA 1ZXOA 5M1QA 1YTAA 5M1KA 1VSFA 2HSTA 3H08A 4CJKA 4YOWA 2D0OA 5AZJA 4GMJB 4OPKA 3QBXA 4M3XA 3EY1A 1LOTB 2X74A 3LALA 1BQMA 4F4KA 1D5AA 4U67L 1A5VA 3ENBA 1MWKA 4I9LA 3VOVA 3I33A 5KQDA 3HSCA 1NGCA 4CW7B 1N34K 5IWAK 1YI2N 1CLQA 4E7IA 1W2BM 4FCYA 3LL3A 1BQNA 4EHTA 2P9LA 2QW9A 3VQ4A 4AHCA 1DT9A 5J2MA 3M8SA 1QQNA 4IJAA 5CYQA 3QEVA 3N4PA 3NVKA 1WLJA 2A40A 4A5BA 1QE1A 4DTSA 4FJJA 3KD1E 4W5TA 4QS8A 2D0AA 2A1SA 3OHRA 4E7HA 1RNHA 5CZ2A 2HBKA 5J1EA 4FWOA 3H6EA 3HK2A 2B5JA 3HOSA 1Y97A 3WXKA 3KD5E 1XMOK 3PLAA 1VRTA 2YJFA 5M1FA 3PO5A 4F2SA 2A6AA 3SLCA 3VQ7A 3S3OA 1RBUA 3KTQA 2OPPA 1P8ZA 4E0DA 4FZYA 3KK2A 4WQ5C 4M3ZA 3ENOA 3DLLL 5JVGL 1HLUA 3AVJA 3L0QA 2V51B 2O8EB 4CJRA 5AQTA 5AQUA 2Y1JA 4BC2A 3TARA 2VYPA 1GOBA 3HRGA 3E9PA 3CPWM 4BRKA 3ULDA 2QWQA 3ULEA 3ZT1A 1VSKA 1W97L 2OPSA 1R59O 3VF2A 1JJ2M 3VQ5A 4OJRA 3UKUA 2KTQA 3CCUN 4FJ9A 4HTUA 4KH6A 1JLQA 3B6PA 3VTIA 4JRPA 3O9RA 2HHTA 1S9EA 1U47A 4KPYA 4FWSA 5KRSA 3TABA 3ZT3A 2E5LK 4X64K 3J7ZO 2O8CA 4QCLA 3BZCA 3MK6A 2YHWA 3KLEA 5HRSA 3VA3A 4H5NA 4NXMK 5C2DA 4CJ3A 2PYLA 3J81O 1Z25A 3THWB 5JLHA 4FJXA 3CQ8A 1KD1O 3EL2A 2YCHA 3OYAA 4CJEA 2GTDA 5CE3A 5LMNK 1X9JA 1ASWA 4DV1K 2P51A 1RBRA 4M45A 1JLBA 4CJ5A 2V7YA 4JI7K 3MWPA 4KAZA 1XHXA 4DTXA 3K57A 5DMRA 4FK0A 2RPIA 4DV2K 4HWIA 4B3RK 3I0SA 4Y0WA 2O8BA 4YDUA 4LFCK 1IO2A 1KFSA 3AVMA 4JK8A 3P31A 2E2NA 4IG3A 4GKKK 1RT4A 3AO5A 3DXMB 4HVJA 3TAGA 3D2EA 5BREA 1TAQA 3PIOL 2NRVA 4WQ5A 4CJFA 1T8EA 2FSNA 2VWBA 3QMLA 2F7TA 1X9MA 4ILGB 2OTLN 1KFDA 3VERA 3KIOA 5AQVA 4NB4A 2HHSA 1EKEA 3OYGA 1A5XA 4AILC 3SK3A 1TYQA 3O9QA 4L3QA 3EEQA 5EU7A 1KAXA 3TSUA 1BI4B 1N5YA 1J6ZA 2ZD1A 4DB3A 5F1XA 1NK7A 4PL8A 5E84A 1QSSA 4W5NA 1U2VB 4AHVA 3AY9A 2FXUA 3LAMA 1RDWX 3W3DA 3P4IA 2QI2A 1SL1A 1CZ9A 3K9JA 4QS9A 1YVNA 4WCEL 3M1FA 4JHDA 2FBTA 4R5PA 4FJKA 4FVMA 3WNFA 4FJHA 1NGFA 1VQ9N 3UKRA 4QOZB 5FPEA 3OS1A 1RT5A 3I8BA 1YT3A 4I9QA 3JYTA 3OW2M 5J2QA 2OANA 1B9FA 4OLAA 1TK5A 3FFKB 3O08A 1IKWA 4FWMA 5HRPA 4BG8A 4YOUA 3GBTA 3BGRA 1LWFA 3RMCA 3MXMA 3FZHA 4Z4GA 1JXBA 1C6VA 5BPNA 2QKKA 2P5GA 3AVHA 3HVTA 3VQQA 3RRHA 1NM1A 5HLFA 3M5RA 5AQWA 2OPRA 3VQBA 3VQCA 4E1NA 1NKEA 3KZBA 1KVAA 2HNYA 2IVOA 3AVFA 2DPNA 3MX5A 4CF1A 1S1TA 4FWPA 1BISA 3ZETA 3M8QA 3CQXA 4HHTA 4HUGA 3THYB 2P9LB 5GADP 4FW2A 4H0TB 4JKAA 1TVRA 4CZHA 1VRUA 4CJPA 4ELUA 4A5AA 1Q86O 4RW7A 4KHUA 1ZBHA 1U2VA 2Q36A 4WFAL 2E2OA 3DLKA 1TKTA 4B08A 2YHBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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