4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
1BWFO 5EOYA 3VF4A 3TU5A 4EHTA 1ESVA 1K8KA 3H6EA 1BUPA 4K42A 5AQYA 1NGDA 2NRHA 1X9JA 4FPAA 2Q31A 3GOIA 2E1YA 3BEXA 2FSJA 4FWOA 4FWNA 3U9DA 5EXWA 2BTFA 3KVGA 4BRFA 4I6MB 3CJCA 2QWOA 3UKUB 3LDQA 3HM8A 1J6ZA 1Z05A 3LDLA 4PL7A 3DXKB 3MN5A 3VEYA 2YI1A 4BREA 4IJAA 5TKYA 2NZTA 2ZWHA 3RSEA 4ISEA 2Q2RA 2PAVA 2W40A 4WQ4C 4B1XB 4CD3A 4DB3A 1NGHA 4JD2A 4MLEA 4EAHD 2D1KA 2E8AA 1BA1A 1Q18A 5BRHA 4FPBA 1TYQA 1ZXOA 3MDQA 3O80A 3C7NB 4B1YB 4FWRA 4AM7A 3LDNA 5AQGA 1U6ZA 3MMVA 3WQUA 1NGBA 3SMPA 2IVNA 3D2EA 4BGBA 1HKCA 2QM1A 3CJAA 2HF4A 4FOIA 2ZF5O 4H0TB 3WXKA 5KPZA 3AARA 1DEJA 3M6GA 3BUZB 2J4RA 1GLDG 2YHYA 3UKUA 1ATSA 3IMXA 3DWLA 2P9IB 3CJBA 5AQHA 4CZJA 4BRQA 3CJ9A 2GWJA 3IFRA 5E26A 1RFQA 2E2NA 2PBDA 4FWQA 5BN9A 3G25A 2QWQA 4BC3A 1YXQA 1NGJA 1QHAA 5AQJA 3HZ6A 4MLHA 3I33A 3EZWA 1QZ5A 3O8MA 4ISGA 3ZETB 2E20A 4NB4A 3W3DA 2P9UB 2QWNA 3BF3A 3GE1A 3GBTA 2NLXA 4FSVA 3VERA 3MCPA 3ENHA 3C7NA 3ENOA 3AAPA 3P4IA 3QDKA 1HKBA 3HSCA 4DHYA 1GLEG 3TPQA 2ASMA 3JXUA 5E84A 3KHYA 1R59O 4BRCA 5AQNA 4BRHA 2BUPA 4H5RA 1KAYA 4K25A 4QS8A 1S22A 3WXIA 5AQLA 3O08A 3BP8A 2FLOA 3MK6A 4JHDA 5AQUA 3CJ1A 4A2BA 2FXUA 4CBWA 4BRNA 3O6WA 4FWPA 3VGMA 5FPMA 1BA0A 4GY2B 4FWKA 4M63C 3R9PA 1HJOA 2P9KA 5BRDA 4BQZA 4QS7A 1ZBSA 1JCEA 2YHWA 3KZBA 4BG8A 5JICA 2CH6A 1YVNA 1U2VA 2Q97A 4JNEA 4BC2A 1XQSC 2CGLA 1TYQB 3M1FA 5EX5A 1BO5O 4QS9A 3U4LA 4BR2A 4WQ4A 2V51B 3FZHA 5JMVA 1S3XA 4BVPA 4CZMA 3VF6A 4BRKA 3EKSA 2IIRA 4J8FA 3F9MA 3D2EB 3SLCA 4JAXA 3WT0A 3L6QA 4AM6A 4CZFA 4H0YB 5B8HA 1KAXA 4BRPA 2A41A 3VPZA 3MN6A 3ATVA 4Y0WA 3CI5A 1V4TA 2UYTA 2P9LB 1IJJA 3GDQA 2HF3A 4GNIA 4B1WB 2P9PA 1NGEA 1EQYA 3CJ7A 3EL2A 1T6CA 4FWSA 4B1UB 4FWLA 5EVZA 1RDWX 2A40A 4FWMA 4XH4A 3ZX2A 2VCPA 3B8AX 3QICA 5FPEA 1H1VA 3S41A 5BPNA 4XH1A 4BROA 5AQWA 1WUAA 3IDHA 2ASPA 2VYPA 1RGIA 3H1QA 2H3GX 2QWLA 4L3QA 1JCGA 5AQQA 2FF6A 2GUPA 2QXLA 2D0OA 5AQRA 3DAWA 4CZLA 2V7ZA 2Q0RA 4JN4A 4BR5A 1YAGA 1OKJA 3WXJA 2F9WA 3LM2A 1NGGA 1HPMA 4A2AA 2A42A 4JHDB 3A8YA 3LL3A 1XUPO 4H03B 5KPTA 3VF2A 4BRGA 3D7EO 1GLCG 2YHXA 3W0LA 2P9LA 3R6MA 3C0BA 2GWKA 1NGAA 4RTFD 2P9KB 3VENA 5ADXA 4CBUA 3A5NC 3DXMA 1GLFO 2F9TA 3ZX0A 2E88A 3QBXA 2E1ZA 1U2VB 4IO8A 4WQ5C 3ZX3A 5CE3A 3WEEA 4PKHA 1NGFA 4B1ZA 2DPNA 4B1VA 5AQFA 2FSKA 3D2FA 3EO3A 3MN7A 3VGKA 4BRDA 3QMLA 2OANA 1SAZA 1KAZA 2I7PA 4FOEA 3A0IX 2ZGZA 4HTLA 3UKRB 3FZLA 2A5XA 1Z6RA 3VOVA 1ATNA 1DKGD 1NGCA 5AQVA 5AR0A 4F9OA 1GLLO 5EY4A 3GG4A 1TUUA 4BC5A 1NGIA 5JLHA 4H0XB 3OHRA 3FZFA 2QWMA 5KPRA 1QQMA 1LOTB 4CZEA 3WUHA 5KQDA 4FL9A 5LY3A 1E4GT 1V4SA 2P9PB 5AQMA 3VESA 4C23A 4LC9B 4O5FA 2E2QA 2FF3B 2YJFA 4CD1A 3MN9A 4CZIA 3H3OB 3FZMA 3UE5A 1QQNA 3QFPA 4EHUA 2QWPA 2CGKA 1TUYA 5AQTA 5F0XA 4IWVA 4CZHA 1Y64A 2ZGYA 1T6DA 4H5TA 5ADXH 1ATRA 4DCHA 4BRLA 5AZJA 3VETA 1GLJO 4EFHA 3I8BA 3JS6A 3UKRA 3FR0A 4BRIA 3VEZA 2Q0UA 3A5LC 4KBOA 2P9NA 3H45C 4EIAA 2ASOA 3FZKA 2ITMA 4CZGA 5BPMA 3CETA 5ELZA 3SMSA 4HWIA 1NBWA 5BR9A 2GTDA 4IJNA 4K43A 2EWSA 1IG8A 3ID8A 2E2PA 2E2OA 5AZIB 4YDUC 3IUCA 1BU6O 1NMDA 3A5MC 2WUSA 1CZAN 4Z94A 3ZEUA 3DXMB 1ZC6A 4O8KA 5AQZA 2Q1NA 4BR0A 5AQIA 2V52B 4MO4A 3R8EA 5FPNA 2FSNA 4BR4A 2Q36A 3WEEB 1KXPA 2D4WA 4M7XA 3QBWA 5AFUA 4H0OA 4XEIA 3ULEA 1MDUB 3CHWA 3HI0A 3LDOA 1GLBG 5AQSA 3FGUA 3H1VX 3D2FB 4WQ5A 1G99A 1MA9B 3HBTA 5AQKA 4H0PA 4CZKA 5AQXA 4BRMA 5LJWA 3QB0A 1JCFA 1HKGA 1XC3A 2GEMA 3HTVA 4PL8A 2A3ZA 1HLUA 2HOEA 3SK3A 5BREA 3VEOA 3A5OC 3BF1A 4IXCA 3O1WA 1BOTO 4H0VB 4BRAA 1LCUA 4BQLA 3VGLA 4NO7A 4A61A 1YUWA 5AZIA 5LJVA 4B9QA 5JLFA 3J8AA 1QZ6A 4BVOA 3GL1A 3O1BA 2D0PA 4RWTA 5FPDA 4M7YA 4CJ7A 3VEXA 2AP1A 2QWRA 5BN8A 4BGAA 4XH5A 3FFKB 4I6MA 5KQ8A 2IVPA 4H5NA 1X3NA 1P8ZA 2CH5A 3VEVA 3UB5A 5AZJB 1BG3A 3DXKA 1DGKN 1GLAG 2P9SB 3CQYA 2HMPA 3DJCA 4MO5A 4DQ8A 5F1XA 1T44A 4H5VA 3LM9A 3WXLA 4BG9A 5I9EB 2YJEA 2P9NB 4CBXA 2IVOA 5AFUH 2QW9A 3O4WA 3FE1A 1QQOA 2A6AA 2YCHA 3L4IA 3CQXA 2V7YA 3AY9A 3EN9A 3VEWA 4RCHA 4BR7A 4IZ9A 3CERA 4A62A 2CGJA 1X3MA 4WYBA 1K8KB 1SQKA 2I7NA 3ZEUB 1MWKA 3LDPA 1NLVA 4H5WA 4K41A 5BPLA 3AAQA 2AA4A 3M3ZA 4YDUA 2VWBA 5F2RA 2KHOA 1C0GA 3QFUA 1BDGA 3ATUA 3ULEB 3FLCO 4FO0A 4ISFA 3SJHA 2P9IA 1MWMA 4BR9A 3WQTA 2P9SA 1HUXA 3EKUA 4BC4A 1NM1A 3CIPA 3H3NO 1C0FA 4PKIA 3RSEB 1HX1A 4E1JA 5AQPA 4CI6A 3U9ZA 4PKGA 5BRFA 1D4XA 2W41A 4JD2B 1E4FT 1SZ2A 3U8XA 1WOQA 3ZETA 3H46O 3L0QA 2P9UA 5AQOA 2GELA 1NWKA 3O5BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BWFO 1IKYA 1ESVA 3N4QA 5K14A 3OTOK 1N34K 2YV0X 5AQYA 4AILC 3SPYA 3C6AA 3QIOA 4ELTA 1Q86O 2D0AA 4IEIA 4I6MB 2HBMA 3CYMA 1X9SA 1VQON 1Z05A 1QQCA 2UXCK 2UXDK 5FDLA 2QI2A 3AGKA 3M5RA 4PL7A 3AVGA 2YI1A 4JKCA 3I8DA 3CFPA 1W7AA 1VQMN 5TKYA 2WONA 3THXB 4ISEA 2Q2RA 4B1XB 3TABA 2OTJN 1NGHA 2KW4A 4MLEA 1WAFA 1BA1A 4YOTA 1MU2A 3G0ZA 1VSEA 4H8KA 4B1YB 4FWRA 3V9UA 3LDNA 2D0BA 3WQUA 1NGBA 1WAJA 4LH4A 3ZT4A 1K8AO 1WNSA 4KFBA 3SMPA 4O4GA 4DU1A 1QSLA 4ID1A 3DLLL 4B08A 2ZF5O 3K57A 4LFCK 3WXKA 4IDKA 4E7KA 3V4IA 2YHYA 4KHUA 3AA5X 2WFBA 1VQ4N 3CJBA 4CJFA 3ISNC 2Z1JA 3NVKA 4Z0UA 1RFQA 3T1YK 1RDAA 2RF2A 4CHPA 4GV3A 1GOBA 4KHWA 1JXBA 1QHTA 4GKKK 4MLHA 4ISGA 1U48A 2QWNA 4FSVA 3SUQA 3P4IA 4DTMA 1HKBA 3HSCA 3JSMA 4FLTA 3TPQA 1OH8A 3VN5A 2ASMA 4CF9A 4DSLA 2NRWA 4CEOA 2O8DB 4NXNK 2BUPA 5FLXO 3NCIA 4K25A 4QS8A 4Z4CA 3DMJA 5AQLA 3TTFA 1L3SA 3BP8A 3CMEN 5DK5A 4JHDA 5AQUA 4A2BA 4CBWA 1YF5L 4BRNA 4FWPA 3DI6A 1JLQA 4JS4A 2P9KA 3BGRA 5BRDA 4MQ3A 3SBGA 3ZSWA 5JICA 1YVNA 2IS3A 1RBSA 1C1CA 1XQSC 3ID6A 4LFBK 3VQ9A 4QAGA 4QS9A 2V51B 2ZD1A 2UUBK 5JMVA 4CZMA 3OS0A 1OH7A 3CPEA 4W5RA 5GIOA 4BRKA 1ZBUA 3D2EB 4JAXA 3L6QA 4AM6A 4DV3K 3AO1A 3L2VA 5DM7L 2A41A 4A5BA 2B4JA 3VA3A 2BANA 3CI5A 2UYTA 3NFAA 1NOZA 4YFUA 1KFDA 1WSHA 2P9PA 1S6PA 4UQGA 1VSLA 3ZSRA 4JK8A 4JI7K 3EL2A 3WNGA 1T6CA 4FWSA 4WFBL 2OPRA 4FWMA 4KHSA 5FPEA 1H1VA 5HRRA 1WUAA 2VYPA 2QWLA 3HPHA 4L3QA 4O0IA 3LALA 4CEDA 5AQQA 2D0OA 3C95A 4F3TA 5AQRA 1IO2A 3DAWA 4CZLA 2EX3A 2V7ZA 2DFEA 4FJJA 1RDCA 1WSIA 3VQ4A 2F9WA 2OPQA 3N4PA 4JLHA 4KH4A 1ZBFA 3S3MA 4LD0A 3A8YA 3KWIA 4H03B 5KPTA 4J2DA 1VQNN 3D7EO 1GLCG 3LAKA 4CEZA 2GWKA 4CK3A 4RTFD 4ZHRA 3AVLA 1GLFO 3HP9A 3ZX0A 3LP0A 3MXJA 2E88A 2F8SA 4E3SA 3PX4A 2RE2A 1IBKK 4NCAA 3RR7A 1U2VB 1NJIO 4WQ5C 3RVCA 2DY4A 3SBTA 3OYNA 5HLFA 1HYSA 3PX6A 1EP4A 4M3RA 1XMOK 1EETA 3ZSYA 3DRSA 4FM1A 3EO3A 2NRXA 3O9SA 3UKRB 3F73A 4HTLA 2I7PA 4FOEA 3QETA 3J7YP 1ATNA 2XY8A 4F9OA 3SQ1A 1SKWA 2O8EB 1LWFA 4HCBA 1J5EK 4M3UA 4JI4K 4BC5A 1NGIA 1Z26A 3O3GA 3OHRA 3DLEA 2XY5A 2G8IA 5GIPA 3CG7A 1LOTB 2O8BB 1ZBLA 4CZEA 3KK1A 4FJIA 2W6LA 4O55A 1KTQA 3IAYA 3ZSVA 1SKRA 2YHBA 4HVJA 3P38A 4HUGA 4LC9B 2HHSA 3MN9A 5FRMA 3F5TA 4O44A 1YIJN 4X62K 3LZIA 4E0DA 2CGKA 5AQTA 4CFAA 4FW1A 2ZGYA 4H5TA 2YKMA 1NKCA 1J54A 3I8BA 2UUCK 3JS6A 1XHXA 4Y1DA 3FR0A 5CZ2A 4R79A 2Q0UA 4O0JA 4KBOA 2P9NA 3CCJN 4CEFA 3AVMA 2YNGA 5M1OA 4CZGA 5KTQA 5HRPA 2ZJQL 5J2MA 4FZXC 1T8EA 5SWMA 1NBWA 3AGRA 1KCFA 2GBZA 3V9SA 4OX9K 4E1NA 5AZIB 4E19A 2QK9A 4YDUC 3IUCA 5C2FA 3TAPA 3SQ4A 3DXMB 1ZC6A 4FM2A 1RT7A 2Q1NA 1TK8A 3L2QA 2RPIA 3ZT2A 1VSKA 1NKBA 1WSFA 1BQNA 1HNWK 3EEQA 1KXPA 4E7HA 3SUOA 3L2RA 5AFUA 4XEIA 3RRGA 3AVAA 4FVMA 2G8KA 4BE1A 5AQSA 3H1VX 3RMAA 2AJQA 3KD1E 4H0PA 4CZKA 4FYDA 1I94K 3K58A 4DLEA 1JCFA 1HKGA 2GEMA 3AVJA 4PL8A 2A3ZA 1RDBA 3BF1A 3O1WA 4BQLA 1TKTA 3AA4A 3LP1A 1Q81O 1NK6A 2P5GA 4UY8O 4NCGA 4TSXA 3NH2A 4FJKA 2D0PA 4RWTA 1HNZK 2O8CA 4CJ7A 4L8RB 3AO4A 5C15A 3VQAA 3VEXA 2JGUA 2Z1HA 2AP1A 1Z25A 4I6MA 1WN7A 1BGXT 2HVIA 3P31A 4JI2K 3E01A 5AZJB 4ELUA 2KZZA 1L3VA 2YKNA 1GOAA 5CYQA 2EHGA 1DGKN 2P9SB 4DTUA 4E7LA 4DTOA 3LM9A 3U3YA 4BG9A 5I9EB 3THXA 1CXQA 3ITHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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