4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
2GELA 5AQVA 5F1XA 3EKUA 3VEZA 5JLFA 1QHAA 3QMLA 2I7NA 2V7YA 2P9IB 3BF3A 3EKSA 1NMDA 3D2EB 4H5RA 3R6MA 2AP1A 2P9SB 4BRIA 1HLUA 2QWPA 4YDUC 3VEXA 3BP8A 1TUUA 3CQYA 3W0LA 2ZGYA 4BROA 3RSEB 3O1WA 3ZX3A 2A6AA 4A2AA 2QWLA 2V52B 3CJ9A 2I7PA 1XC3A 3QB0A 3WEEB 2YHYA 4CI6A 4MLHA 1K8KA 3F9MA 2IVOA 2P9KA 3SJHA 4NB4A 2CGJA 1JCGA 1GLAG 3CERA 4EAHD 4BVPA 2P9UA 4RCHA 3D2FA 1CZAN 3ZEUB 2OANA 3MMVA 3DXKB 3GBTA 3H1VX 4K43A 5AQHA 4A61A 1T6CA 1NGFA 3VENA 2GWKA 5KPTA 5EXWA 5FPNA 3VF4A 3VGLA 1E4FT 2CGKA 5AQIA 5I9EB 3J8AA 3QBWA 4BQLA 4BREA 2D0PA 3KHYA 5JLHA 1GLJO 3M3ZA 4FO0A 2E20A 1BG3A 1BWFO 3FZKA 2ZGZA 4ISGA 1XUPO 2UYTA 4MO5A 5AQPA 3EN9A 3WXIA 3FLCO 4B9QA 4K42A 5AZIB 2YHWA 1S22A 5BRDA 1P8ZA 2V51B 3LDLA 3BF1A 3EZWA 3CQXA 1OKJA 1TUYA 4CJ7A 2FSJA 1IG8A 4XH1A 3SMSA 2YI1A 1HKBA 4Z94A 1NBWA 2HF4A 1V4TA 3JS6A 4BGAA 4IO8A 4GNIA 1MDUB 5TKYA 3TU5A 4JHDA 4PKHA 2Q1NA 4JN4A 1ZXOA 4A62A 1DEJA 3CETA 3L6QA 4A2BA 2F9WA 4PKIA 3UB5A 1NGEA 2NLXA 2PBDA 4H5NA 3I33A 1WUAA 3MK6A 2D1KA 2HMPA 3GE1A 3MN6A 3UKRB 2W41A 3L4IA 4GY2B 5AZIA 4CBXA 4BC2A 1KAZA 4BR7A 3BEXA 4O5FA 3O5BA 3HI0A 2QXLA 1NGGA 4FWQA 2P9PA 2A41A 3FE1A 1QQNA 4IJAA 4CZHA 1GLLO 2Q97A 5ELZA 3DWLA 3LDNA 2BUPA 3H3NO 3P4IA 2V7ZA 1ZBSA 4WYBA 2P9LB 3HM8A 3ZETA 2CH5A 4BQZA 3AAQA 4FSVA 5FPMA 3FZHA 4JD2A 4AM7A 5EVZA 2NRHA 1BA0A 3C7NA 3CJAA 5F0XA 1BU6O 3VEOA 3VERA 3HBTA 3A5LC 3ID8A 3VEWA 4DB3A 5AQKA 4K41A 5AQNA 4BRNA 5AQWA 1U2VB 3ULEA 1RDWX 4DHYA 3D7EO 1MA9B 2FSKA 4I6MB 3U8XA 1SQKA 4BG8A 2A40A 1NWKA 5B8HA 2E88A 4FOIA 5BREA 3AY9A 3HSCA 2PAVA 3H6EA 4MLEA 4CZJA 4FWKA 1ATSA 1YVNA 3MN5A 4FWSA 3DXMB 4H5WA 5AQSA 1H1VA 4H5VA 3UKUB 3CIPA 2P9NB 3WUHA 3FZFA 4IXCA 1TYQA 4FPAA 4H5TA 5AQGA 2HOEA 2Q2RA 1QQOA 2E1YA 3U9DA 2E2OA 2ASMA 4PL8A 4K25A 4YDUA 3HZ6A 3ZX2A 1GLBG 3MN7A 4BC5A 4CD1A 1X3MA 3B8AX 3AARA 1KAXA 5AQYA 4J8FA 3CJ7A 3GOIA 3ENHA 2BTFA 3QDKA 3QICA 2P9IA 4L3QA 4RTFD 1JCFA 1T6DA 4BRPA 3D2EA 3GL1A 4BR9A 5E84A 3IFRA 2P9SA 3VESA 4FL9A 1NGDA 3GG4A 4BRGA 2GUPA 1YXQA 3A5MC 4BG9A 3RSEA 3IDHA 3H45C 2P9NA 1NLVA 1Z6RA 5JICA 3U9ZA 3WEEA 2QWNA 1KAYA 2QM1A 4B1UB 2E2NA 3C0BA 5AQTA 2QWQA 1BOTO 1HUXA 3WXJA 4BR5A 4H0OA 1T44A 1HPMA 4DCHA 2Q31A 4H0XB 1SAZA 3M1FA 3ZEUA 1D4XA 3DXKA 3SMPA 3ZX0A 5AQUA 2FLOA 2NZTA 4CBUA 2J4RA 1QQMA 3I8BA 2FSNA 4EIAA 4M7YA 4WQ5C 4E1JA 5ADXA 1DGKN 2Q0UA 3EO3A 1YAGA 3VPZA 1IJJA 3ATUA 3O8MA 3A8YA 5E26A 4IZ9A 4FWPA 1WOQA 4EFHA 3GDQA 4CBWA 3LL3A 3OHRA 5AZJB 2A42A 3QFUA 1HJOA 4HTLA 5AQZA 2QWMA 4ISEA 4B1WB 1J6ZA 1XQSC 4FWRA 3CI5A 3S41A 3QFPA 4CZGA 2E8AA 4BR0A 1GLFO 2QWOA 4B1ZA 4BRHA 4BRMA 1NGHA 4O8KA 2GTDA 4FWMA 2QW9A 4H0TB 1C0FA 4MO4A 3WQTA 4H0VB 1RGIA 4B1XB 4BRDA 5AR0A 3VGMA 5AQFA 2WUSA 4M63C 2HF3A 1DKGD 3DJCA 4IJNA 2VCPA 4H03B 3A5NC 3WT0A 2IIRA 1C0GA 2E2PA 4CZMA 1Y64A 2D4WA 4BC4A 3LM2A 2VYPA 3LM9A 4KBOA 3UKRA 4ISFA 4H0PA 5AQJA 4BRFA 3O1BA 5KQDA 5LJWA 3H46O 1BUPA 3MCPA 4WQ4C 5AQMA 4HWIA 4LC9B 4EHTA 3LDQA 2EWSA 4PKGA 2QWRA 3A0IX 3QBXA 2FXUA 1BO5O 3WXKA 2FF6A 1K8KB 2P9KB 4H0YB 4CZLA 4IWVA 1HKGA 2P9UB 4BGBA 5EY4A 3D2FB 2IVNA 5F2RA 5LY3A 2P9LA 4WQ4A 5LJVA 5EOYA 5BR9A 5BN8A 3IMXA 5AQRA 3VF2A 3VGKA 1SZ2A 4JAXA 2FF3B 1QZ6A 3FR0A 1ZC6A 4BRQA 3FGUA 3VEYA 1QZ5A 3L0QA 1HX1A 2KHOA 4B1VA 3O4WA 5BRFA 4B1YB 1U2VA 3CJBA 2ASPA 3VETA 4BRLA 1E4GT 4I6MA 1MWMA 5BPLA 5AQXA 2E1ZA 2ZWHA 2W40A 3IUCA 3FZLA 3O08A 1U6ZA 5FPDA 4CD3A 2A5XA 1ATNA 1Z05A 3H3OB 4EHUA 2H3GX 2IVPA 4FWNA 3DXMA 1NGJA 2ASOA 3ATVA 2D0OA 3UKUA 1GLEG 3FFKB 3G25A 3UE5A 4CZIA 4JHDB 1G99A 4FPBA 2ITMA 1NGAA 4Y0WA 3WXLA 1YUWA 3FZMA 5KPZA 4NO7A 4CZFA 1NGBA 1LOTB 2YJEA 3CHWA 4FWLA 4BRKA 4DQ8A 1S3XA 4BVOA 2CH6A 4QS8A 5KPRA 4XH4A 3ENOA 3VF6A 4CZEA 3EL2A 3M6GA 4XH5A 5AQLA 4BRAA 1ESVA 2GWJA 3JXUA 5EX5A 1V4SA 1BDGA 1GLCG 2CGLA 3AAPA 3LDOA 4CZKA 1Q18A 5ADXH 3HTVA 2GEMA 4RWTA 1KXPA 4BR2A 3BUZB 4F9OA 5BPNA 5KQ8A 2E2QA 3CJCA 3KVGA 2P9PB 1X3NA 3H1QA 3U4LA 3TPQA 4BC3A 1NGIA 4AM6A 4WQ5A 4PL7A 1GLDG 3ZETB 5BN9A 3VOVA 2VWBA 1ATRA 1R59O 1X9JA 5FPEA 3O80A 3MDQA 4BR4A 1JCEA 4JD2B 1MWKA 4M7XA 3A5OC 4QS9A 2Q0RA 3C7NB 3SK3A 1EQYA 4C23A 1RFQA 1BA1A 5JMVA 2ZF5O 5BPMA 5AFUA 2YCHA 2YJFA 4FOEA 2A3ZA 4QS7A 5AFUH 3R9PA 4FWOA 3ULEB 3SLCA 1NM1A 4XEIA 2AA4A 3KZBA 3CJ1A 3WQUA 5BRHA 5AZJA 5AQQA 2F9TA 3O6WA 5AQOA 3MN9A 3LDPA 2Q36A 3DAWA 2DPNA 2YHXA 1LCUA 3R8EA 4BRCA 1TYQB 1HKCA 3VEVA 3W3DA 1NGCA 5CE3A 4JNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RILA 5AQVA 3OVNA 1NJWA 5FRNA 4LFAK 5LL6Z 4AILC 1IKWA 4C1NK 4YNQA 2I7NA 3OYFA 3RMDA 1W9HA 3ZSVA 1IG9A 1U45A 3R6MA 3KKSA 4B3RK 1HNIA 3VQEA 1XMQK 4RW6A 3CQYA 3RSEB 2GBZA 4LY7A 4DV4K 3ZSZA 1XC3A 4M3XA 3LAMA 2OZMA 3F9MA 2D0AA 3SJHA 1GLAG 4EAHD 4BVPA 4DLEA 3L4QA 4RCHA 2DFEA 3D2FA 3ZEUB 2OANA 3V4IA 2E6LA 5KPTA 1KRPA 3VGLA 2CGKA 5AQIA 3QBWA 4DF8A 4BREA 1KFSA 4K8XA 3G10A 4JEPA 3CF5L 1WAJA 5JLHA 2RF2A 4FO0A 3CCMN 1BWFO 3FZKA 4MO5A 1XUPO 2UYTA 4ID1A 3VQQA 4KAZA 3WXIA 1JXEA 2P51A 4IEIA 2D5RA 3DLGA 1SUQA 3ZLJA 1S22A 3E1YA 4KI6A 3BF1A 4A59A 3KK2A 2ITGA 1BIZA 3CQXA 4E7IA 2FSJA 2HHQA 1U04A 3SMSA 3SCXA 1NBWA 4AF1A 4B08A 2O8CA 3HOSA 1MDUB 3TU5A 1U4BA 4JHDA 4X62K 3AA4A 1DEJA 2BDPA 3IRXA 3UIQA 4FXDA 4HUGA 4H5NA 5CYMA 3MK6A 2D1KA 2UUBK 2WOMA 3E9PA 4CCHA 2W41A 4YFUA 3L4IA 3RMAA 4FJGA 2W6LA 1KFDA 4CBXA 2G8HA 3BEXA 3E01A 2YKMA 3AVNA 3TAMA 2NNWA 2O8FA 1X9MA 3Q7CA 4CEFA 3HP6A 2A41A 3AVCA 4IJAA 1VQ4N 3QO9A 4LF4K 1GLLO 3DWLA 4KHWA 2E5LK 2V7ZA 3LP3A 3HM8A 3ZETA 2FBXA 4BQZA 4B3MK 4FSVA 1ZYQA 4O55A 4PQUA 3RRGA 1SKSA 1Y97A 2DFFA 1BA0A 5KRSA 3VQDA 3VERA 3HBTA 4BE0A 3F2KA 4BRNA 5AQWA 1RDWX 4WE1A 2F8TA 2RHKA 3G6EN 4LF8K 2E88A 3CCJN 3CMAN 4MLEA 3V9SA 1EWQA 2ZJQL 1RDBA 4DWIA 4JV5K 1RT7A 4LF9K 1H1VA 1LWFA 2P9NB 3CIPA 3K0SA 4NCBA 4F2SA 4FPAA 5GIPA 4H5TA 5AQGA 4K8ZA 2F8SA 3VTIA 2JWLA 4X66K 3THWA 2E2OA 3LP2A 2IOCA 3M8PA 4N41A 1ZBLA 3QESA 2ZQBA 1KAXA 3CPEA 4J8FA 3ZCMA 4O8UA 3N4QA 4CEDA 1N8RO 2BTFA 3J7ZO 5GADP 3QICA 2P9IA 4BRPA 4DR3K 4GKJK 4E19A 1TKXA 3C6HA 1BCOA 3AV9A 1ZBIA 5HP1A 4FL9A 5GIOA 2P5GA 4O0IA 3NE6A 4DFJA 4BRGA 3F5TA 4KH6A 3A5MC 3NF8A 4A57A 4WF9L 3IDHA 3RRHA 1WN7A 3MEDA 1HYZA 1TVRA 5JICA 2LSNA 4E7JA 3A2FA 3I55N 2QWQA 1BOTO 1IBMK 1JLCA 4BR5A 1T44A 3K5LA 1BQMA 3RR7A 1QSSA 1SAZA 4DTNA 4FW2A 3SMPA 1ZBUA 1VSKA 2FLOA 1VQ6N 5KTQA 2RE2A 3LPUA 1DGKN 3EO3A 1YAGA 3OYHA 2WONA 4FJHA 3NH0A 2JWKA 1VRTA 4Z4CA 1JLBA 3PUFA 1WOQA 3GDQA 4A5AA 3LL3A 2A42A 1HJOA 1EXQA 3OYEA 4Y1CA 1ASWA 4FW1A 3S9HA 3V9ZA 4B1WB 3HOTA 3TWHA 3CI5A 3QIPA 4JI2K 2QWOA 4B1ZA 4CF0A 4DFKA 1VQ5N 1GOCA 4Q5VA 1NGHA 4FWMA 5M1OA 4H0TB 2EX3A 3KD5E 4H0VB 4HTUA 4B1XB 3VGMA 3VQBA 1XHXA 2WUSA 1Q9YA 3NGYA 2HF3A 4CJRA 4I2PA 1LAVA 4CK3A 3A5NC 4AHSA 2XRIA 2KFNA 1RT5A 1HJRA 1Y64A 2D4WA 1QE1A 3L3UA 3LM9A 4KBOA 1RTJA 3P31A 5KQDA 3J7YP 3CPWM 1U47A 4BWJA 4CJEA 3LAKA 5AQMA 4CERA 3D0PA 4FLZA 2OTJN 4KI4A 3WXKA 1RBTA 1TKTA 3AO1A 3AA2A 4BGBA 2QKBA 4IO9L 2OPPA 3D2FB 2IVNA 3U3YA 2F96A 5BN8A 3IMXA 1C1BA 4KV8A 3O4QA 5T7BA 2ZD1A 4LFCK 1QVGM 3THVA 4M45A 3OW2M 5TKWA 3VEYA 4JI5K 1HX1A 4ZTJA 4DTMA 5BRFA 3CJBA 3VETA 4DU1A 5MLCQ 2Y1IA 2IC3A 2OZSA 5BPLA 2HSTA 5AQXA 4GKKK 2W40A 3C6TA 3FZLA 3OBWA 4CD3A 1X9SA 3C65A 3T7ZA 4CJLA 1HNXK 2H3GX 4ZTFA 2ASOA 2O8CB 3UKUA 2O4GA 3FFKB 4CZIA 3UE5A 4ILHA 3I0RA 5M1NA 4IOXA 4JHDB 2ITMA 1FKOA 3FZMA 1LOTB 2YJEA 3CHWA 4HCCA 4CESA 1FKPA 3PSFA 5KPRA 1SS6A 4BE1A 3MXMA 1LV5A 3VF6A 5EU7A 3EL2A 3M6GA 4OGEA 4B3OA 1ZBFA 4FJ8A 1NJZA 2BE2A 1VSLA 2HW3A 1B9FA 3NAEA 3CC4N 1ITGA 1EX4A 1TGOA 3OJSA 5CHIA 2O8FB 1WSEA 3L3VA 2G8VA 1U48A 3U4LA 4OKEA 1T3VA 3TPQA 3HM9A 4DTUA 4C1NI 4YY3K 3ZETB 4PWDA 4CJFA 3V9WA 3O80A 2YNHA 4BR4A 3CC7N 1JCEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3OS1 A;  3ENO A;  4CZE A;  1KD1 O;  3THY B;  4IFV A;  4E7K A;  4BRA A;  1ESV A;  1JLE A;  3ZT4 A;  1F21 A;  4B8A B;  2ZM6 K;  1GLC G;  3DRS A;  4JKB A;  4CHZ A;  3SI6 A;  3QLH A;  4CZK A;  4JKE A;  4W5N A;  1Q18 A;  4FCY A;  4RWT A;  1YI2 N;  4NYN A;  3BUZ B;  2E2Q A;  4M3Z A;  1X3N A;  3SQ2 A;  3ENB A;  1RT6 A;  3K59 A;  4FYD A;  5KGX A;  3OTO K;  2ATQ A;  1ASU A;  3SNN A;  2VWB A;  1ATR A;  1YF5 L;  5SZT A;  5FPE A;  5D3G A;  1P90 A;  1VSM A;  4FK4 A;  3QET A;  3C7N B;  1SL0 A;  3HVR A;  5BPM A;  3SAF A;  3NGZ A;  4FOE A;  3ULE B;  4OX9 K;  1M90 O;  3SBG A;  3OBY A;  3ZT1 A;  3I8D A;  3K9K A;  3KLH A;  5J2P A;  1IV0 A;  4XEI A;  1JKH A;  4TSX A;  4IOA L;  3BZK A;  3WQU A;  2YX6 A;  1XMO K;  2W6K A;  2F9T A;  3O6W A;  4CW7 B;  3LDP A;  2Q36 A;  2YHX A;  4BRC A;  3PO5 A;  1HKC A;  4CEO A;  3T1A A;  3IAY A;  1NGC A;  2NRT A;  3DOK A;  3PO4 A;  4LF6 K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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