4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
b'TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
3CJ7A 4H5VA 4B1ZA 3LDOA 4BR4A 4CZEA 3CJ9A 5B8HA 5BPNA 5AQLA 4I6MA 3IFRA 4XEIA 2VWBA 3UKRB 1R59O 1TUYA 4BRLA 1GLCG 4FWQA 1Z6RA 5LJWA 1HUXA 1NGEA 3D2EA 3D2FB 3R9PA 4BVPA 2YJFA 3WEEB 3O4WA 1TYQA 2UYTA 5AQJA 3VEVA 4H0VB 3GL1A 4JHDB 3HM8A 3O80A 3CQXA 1TYQB 4CZIA 5F2RA 3VOVA 5ELZA 2VYPA 3HSCA 4H5TA 5EX5A 2E2NA 4BR7A 3H46O 2YHYA 1XQSC 4BRNA 4DB3A 4E1JA 2QWPA 3CJAA 3I33A 1U2VA 2P9SA 2E2OA 3EKUA 4BRGA 2GWJA 2Q97A 3GOIA 4HTLA 3WUHA 3WXJA 2P9KA 2FXUA 4B9QA 2A3ZA 2CH6A 2Q1NA 1SZ2A 1NGDA 2E20A 2P9KB 2ZGYA 5AQYA 4QS8A 4H5WA 1ZXOA 3ZX2A 4JNEA 5BN8A 3VF4A 2P9UB 3MK6A 3M1FA 2P9IA 3UB5A 5F0XA 3O5BA 5E84A 3VF6A 1SAZA 2QXLA 3IUCA 1KXPA 4O8KA 3HBTA 5BR9A 3A5MC 3L0QA 4CZJA 2E1ZA 2FSJA 3B8AX 3QICA 3G25A 4WQ4C 3UE5A 4F9OA 3C0BA 3VETA 1BOTO 1GLDG 1BG3A 1HX1A 3BP8A 3F9MA 3BEXA 1DGKN 4B1XB 4O5FA 4K25A 2ZWHA 5BRHA 1C0GA 2D1KA 2GELA 1HJOA 1RDWX 3DWLA 5AZIA 3EKSA 4BVOA 1JCFA 2P9PA 5AQWA 4H5NA 3ATUA 3O1BA 1YUWA 4MO4A 3WEEA 1MDUB 4BR5A 5FPEA 1V4TA 4BG9A 4BROA 1MWMA 2IVPA 5JMVA 4B1UB 2ZGZA 4A2BA 3A5LC 4BC2A 4DCHA 3LL3A 3BF1A 4PKHA 1HPMA 2HOEA 5ADXA 5BRFA 4DQ8A 4BRMA 4JHDA 3EO3A 5AFUA 2I7NA 3SJHA 1U2VB 4FPBA 3R8EA 5EOYA 3VGMA 2CH5A 4BGAA 3GE1A 1XUPO 2AA4A 4HWIA 3VPZA 4IWVA 4K43A 5FPNA 4QS7A 3D2EB 5JLFA 2ASOA 4CJ7A 4XH1A 3VEWA 4FWKA 1X9JA 4MLEA 4FWNA 3VEOA 5AQIA 2W41A 4CZLA 1ESVA 3UKUA 2P9NB 4B1VA 3HTVA 3L4IA 4QS9A 3FE1A 4CBXA 1NGHA 2OANA 1JCGA 2YHWA 3SK3A 1X3NA 3U9DA 3FZMA 2V52B 4MO5A 4H0YB 3M3ZA 4IXCA 2V7ZA 2Q0UA 4JN4A 1BO5O 3D7EO 3QB0A 3A5NC 3FZKA 2IVOA 1NM1A 3U8XA 5AQVA 3QFPA 5AFUH 5BRDA 4EHUA 3O08A 2J4RA 2BTFA 5AQQA 3HI0A 1QHAA 2E1YA 3QDKA 3BUZB 4WQ4A 2ZF5O 5EVZA 3QBWA 4PL8A 1C0FA 5LY3A 3ZETA 3RSEB 1XC3A 3CJCA 2A41A 1QZ6A 3C7NB 2PAVA 4RTFD 3ZETB 1QQMA 4AM6A 3FZLA 3AARA 3FLCO 3GBTA 4PKGA 2GWKA 3H45C 3CIPA 3HZ6A 3SLCA 4CZGA 1KAZA 3ULEB 2I7PA 1ATRA 1BUPA 4H0XB 3FZFA 1X3MA 4ISEA 5JLHA 2H3GX 3LDLA 5EXWA 5AR0A 3H3NO 4YDUA 1GLJO 4Z94A 1ZBSA 3H3OB 5AQPA 1BA0A 1QQOA 4KBOA 2A5XA 3DXKB 1IG8A 3DAWA 4NO7A 4EAHD 3FZHA 3W0LA 3CERA 2E2PA 3LDQA 3VGLA 2QWNA 3D2FA 3CJ1A 4IJAA 5AQKA 3KHYA 2QWLA 4BRHA 5AZJA 4J8FA 3VERA 1GLFO 2GTDA 2E88A 3JS6A 1RFQA 2FSNA 3MCPA 4BRFA 3R6MA 3KZBA 5TKYA 2IIRA 4BR2A 3TU5A 3CETA 4WQ5C 3DJCA 4L3QA 2ITMA 3WT0A 4BC4A 1YAGA 2FF6A 2YI1A 2P9LA 5AQOA 3LM2A 1QQNA 3SMPA 5FPMA 1GLLO 3EN9A 4CZMA 3ENOA 4JAXA 2QW9A 1D4XA 4FO0A 1Y64A 4FOEA 3A8YA 3H6EA 3MN7A 1NGAA 2FF3B 5KQDA 4H0TB 5LJVA 3O1WA 1Z05A 4PL7A 4FWRA 1NWKA 4FSVA 3QBXA 4BQLA 3DXMA 1DEJA 2A42A 1MWKA 2P9UA 3ATVA 4CZFA 1NGCA 2P9PB 2PBDA 3ENHA 4BGBA 4K42A 3RSEA 3WQTA 5BN9A 2D0PA 2W40A 3ZX3A 4FWLA 3EL2A 5CE3A 2Q0RA 3EZWA 1HKGA 4JD2B 1J6ZA 4IZ9A 5F1XA 1K8KA 4MLHA 5I9EB 1Q18A 4GNIA 4B1WB 4WYBA 4EIAA 3W3DA 3A5OC 2ASPA 2F9WA 4NB4A 2NLXA 1NGBA 3U4LA 1E4FT 1S22A 5KPRA 5EY4A 5AQTA 1TUUA 1GLBG 5AQSA 1WOQA 1ATSA 5AQRA 4BRDA 2IVNA 4CZHA 2FLOA 1LCUA 3SMSA 3UKRA 4A62A 3MN6A 3MN5A 1YVNA 2QWMA 1BU6O 3FR0A 5AQHA 5KQ8A 2QWQA 3VEXA 2YCHA 2E8AA 1SQKA 3ZEUB 4Y0WA 5BREA 4A61A 3UKUB 4B1YB 2HF4A 2GEMA 4BC5A 3ZEUA 4CZKA 4IO8A 4CI6A 5ADXH 4WQ5A 4H5RA 3H1VX 3WXKA 3J8AA 4YDUC 4BRQA 1P8ZA 1G99A 4FWPA 3TPQA 2AP1A 1H1VA 3DXKA 3GDQA 2CGKA 2VCPA 3QFUA 4LC9B 4H0PA 4CBWA 5BPMA 4CBUA 1ZC6A 4CD1A 1BWFO 4M63C 4BREA 5AQGA 1HLUA 1KAYA 4FPAA 1NGIA 1BA1A 3MDQA 2Q31A 3U9ZA 3C7NA 2ASMA 1LOTB 2DPNA 4BQZA 2Q36A 3DXMB 3P4IA 3VEYA 1RGIA 4M7XA 5AQNA 1NMDA 4BRIA 1EQYA 2YJEA 2Q2RA 4AM7A 2EWSA 3M6GA 3ULEA 2YHXA 3O6WA 3O8MA 5AQMA 5E26A 3A0IX 4DHYA 1S3XA 4GY2B 4FL9A 4BRKA 2D0OA 3CHWA 4K41A 4XH4A 1T44A 1K8KB 4RCHA 2A40A 4EFHA 2NRHA 3IDHA 4PKIA 3H1QA 2WUSA 3S41A 1NGJA 3AY9A 2V7YA 1GLAG 4BG8A 1JCEA 3LM9A 3VESA 2CGJA 4M7YA 1IJJA 3GG4A 5AZIB 1YXQA 4I6MB 5JICA 3MMVA 2HMPA 4FWSA 4XH5A 4H03B 2D4WA 1HKCA 3CQYA 3OHRA 3BF3A 1U6ZA 3L6QA 3JXUA 2QM1A 2P9NA 3QMLA 3KVGA 1ATNA 3ID8A 2CGLA 3CJBA 4A2AA 1DKGD 4C23A 1E4GT 2F9TA 1HKBA 2HF3A 1NGGA 1WUAA 2V51B 3VENA 4RWTA 3VEZA 2P9LB 5BPLA 1MA9B 3AAQA 3MN9A 1KAXA 3FFKB 3VGKA 2KHOA 5AQZA 1QZ5A 4BC3A 1T6CA 2P9SB 2QWRA 3CI5A 4BRCA 2FSKA 1BDGA 2GUPA 5AZJB 5KPZA 2A6AA 1NGFA 1GLEG 3FGUA 3LDPA 4FWOA 4ISFA 5AQUA 4BRAA 4FWMA 4CD3A 5FPDA 3LDNA 1NBWA 4BRPA 5KPTA 1V4SA 5AQFA 4FOIA 4EHTA 3VF2A 5AQXA 2P9IB 2BUPA 3WXIA 4ISGA 1OKJA 3IMXA 2NZTA 4JD2A 3I8BA 3ZX0A 3AAPA 2E2QA 3WQUA 3WXLA 4BR0A 4IJNA 1CZAN 1NLVA 4H0OA 4BR9A 1T6DA 2QWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DLRA 3AO1A 3CMEN 4OGEA 4H5VA 3OYBA 4M3ZA 3N4QA 4CZEA 1KQSM 5HRRA 3PO4A 3IFRA 2VWBA 1RT6A 1WAFA 3HP9A 4KFBA 4IFEA 4KTWA 4C8NA 4H8KA 4N5SA 1HUXA 3CMAN 3D2FB 3V1OA 4BE1A 1T03A 3RMBA 3L3UA 3LZJA 1C1AA 3M8PA 5AQJA 4H0VB 4JHDB 1NNEA 2HBLA 4CFCA 3E1YA 1B9DA 1Q7YO 2VYPA 4W5OA 4R79A 2E2NA 3MX2A 1C0MA 4E1JA 3PV8A 3O9SA 2NRWA 3AVKA 3OYAA 4IBNA 3PX4A 3AO5A 2UU9K 4FJ7A 4B9QA 2KZMA 3DI6A 5FDLA 2A3ZA 2CH6A 4W5QA 2Q1NA 3O9QA 5J2MA 4F3TA 2P9KB 4QS8A 4H5WA 1ZXOA 3ZX2A 3LP1A 4B9MA 3M8SA 1L5UA 1RTDA 4NCAA 4JI7K 1IH7A 3O4QA 4F4KA 2F96A 1GOBA 4ID5A 5CZ2A 3C6AA 4AH9A 5E84A 4DQPA 3WXMB 1HPZA 2QXLA 2HBMA 5FRNA 3A5MC 1NJIO 1ZYQA 2G8WA 2RN2A 4B9VA 3VETA 3SUPA 1RTIA 4KI6A 5I42A 4CIEA 2GBZA 1B9FA 4CJ3A 1DGKN 3T1HK 4K25A 3DLHA 1C0GA 1HJOA 4BVOA 4FYDA 1HJRA 4HUEA 3WEEA 4AHVA 5FPEA 4PUOA 1BGXT 4KTZA 2IVPA 1JXBA 4B1UB 2ZGZA 4A2BA 4B9SA 4B8AB 4HHTA 4DCHA 3QETA 3BF1A 2PYJA 1HPMA 1RBTA 4CK1A 3SV3A 5ADXA 1B92A 3TARA 4BRMA 4B3SK 3EO3A 3NF9A 4KHUA 3SJHA 5A2QO 3GE1A 1XUPO 4N41A 2AA4A 3F9KA 4IWVA 4QS7A 3D2EB 4FWKA 1XMOK 3VEOA 2X6NA 3BZCA 4CZLA 1BISA 3SAFA 4FW1A 4HUFA 1NK5A 3SK3A 4NYFA 3FZMA 4RW7A 5TKWA 1U45A 2V7ZA 3B6PA 4JN4A 1ASUA 3DLEA 5CHIA 4E0DA 3AVAA 3QFPA 4QCLA 1BQMA 4CCHA 3CCRN 2J4RA 3V9WA 4FK2A 4WQ4A 1HQEA 2HW3A 3QBWA 3LWMA 3AVNA 4RW4A 4CE9A 1XC3A 5C10A 2IAJA 3KD1E 4Z4FA 1VSLA 3C7NB 2PAVA 4RTFD 1I39A 1U4BA 4CIGA 2ZJRL 4AM6A 2LSNA 5LMUK 3EY1A 4CEZA 2EX3A 3BZKA 3K9JA 4Z4EA 4B3TK 3CIPA 3SLCA 1KAZA 2Z1JA 4B9LA 4O0JA 5JVHL 2I7PA 4H0XB 3FZFA 4KHYA 1X3MA 4FZYA 3QO9A 1REVA 1RDCA 2YNIA 3LDLA 5H1SQ 3L2UA 4A57A 1GLJO 4RW9A 4CJTA 1QQOA 3J7ZO 4KPYA 3DXKB 3QIOA 3UIQA 2HHHK 4XIUA 3DAWA 4NO7A 4EAHD 1M1KO 1TL1A 3W0LA 4AHCA 2KQ2A 3LDQA 3RMAA 4CJQA 2QWNA 2O8CA 5AQKA 3EEQA 2RKIA 1ZBHA 4E89A 1I3AA 4YOTA 1X9WA 4FK4A 2E88A 2JLEA 3DOLA 4OLAA 4BRFA 1JL1A 3AO3A 3R6MA 4DMNA 2W42A 1KC8O 2IIRA 2QEXN 4WQ5C 3WT0A 4BC4A 4DSKA 3OYFA 2P9LA 3P1GA 4CHOA 3WNGA 2QW9A 4JKGA 2P5OA 3MXMA 4DQRA 3KLEA 3NH1A 3O1WA 3LWLA 3OJUA 2XY6A 4FVMA 3QBXA 4GW6A 3ZSOA 3F73A 1JLAA 4JLHA 4I2PA 2P9UA 4CZFA 2PBDA 4BGBA 3ENHA 4CGJA 5LL6Z 2W40A 5M1KA 4JS5A 5M1OA 1FK9A 4DR6K 4ILJA 3EZWA 3AA2A 4YOVA 1J6ZA 4IZ9A 4OPAA 4CGIA 3CQ8A 2OZSA 2KFZA 2P5GA 3OVNA 3K2PA 4WYBA 4C8MA 3W3DA 4B3MK 2ASPA 3ENBA 4FW2A 3DLBA 3LP2A 1F21A 5KPRA 4LF6K 1WOQA 1L3UA 1ASWA 1HYZA 3MN6A 3MN5A 2QWMA 5AQHA 2XY5A 5KQ8A 3KIOA 4Q5VA 3VEXA 2Z1IA 3SAGA 3PY8A 1SS6A 3Q7BA 4IOXA 4JI1K 1X1PA 4IO8A 5ADXH 3SQ0A 4H5RA 1J5EK 3THYA 4F3OA 4YOYA 4DR4K 3KLGA 3MAQA 1VSDA 3OYLA 4FWPA 1CXQA 4CEFA 3P38A 5DMRA 4DLEA 2CGKA 1D8YA 3TAQA 2HBJA 1RBSA 1BWFO 4I9QA 1HRHA 1KAYA 4FPAA 3L4QA 3MDQA 4DSLA 4ZTFA 1NJYA 1LOTB 1VQKN 4GV3A 2DPNA 1ZBFA 4BQZA 4FZZA 3P4IA 3VEYA 4C1NK 1C1CA 3P39A 1KVCA 1FKOA 4M7XA 1NMDA 4BRIA 4K8XA 1TAUA 2YJEA 4DFMA 1VQ5N 1CZ9A 4AM7A 4CEQA 3M6GA 4BE0A 4N76A 1NK9A 3QNNA 3TAGA 4Z4CA 3O9RA 4DFJA 3PX0A 5C24A 3CHWA 4K41A 1T44A 1K8KB 2DFFA 4EFHA 4DSJA 4DTRA 3LZIA 1TV6A 3CM5A 4MDAA 1JL2A 3VESA 3C6TA 4Z4IA 4CESA 5SWMA 2CGJA 1KVBA 1IJJA 3GG4A 5AZIB 4I6MB 1D5AA 5D3GA 2HHTA 4FWSA 4DV2K 3ZSQA 1JLFA 4NXMK 1LW2A 4XH5A 4H03B 2D4WA 4CECA 4K8ZA 1S9GA 1RCHA 3F5TA 3I55N 4CJRA 5KRSA 2QM1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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