4RCHA

Discovery of 2-pyridyl ureas as glucokinase activators
Total Genus 170
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
170
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of 2-pyridylureas as glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 170
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2014-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4rchA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4rchA01
3UKRA 3BP8A 3GG4A 4HTLA 4MO5A 2PAVA 4BQLA 4JAXA 5AQXA 3VESA 2GEMA 3ZETA 3VF4A 4WQ4A 2IVPA 2Q97A 4AM7A 1BDGA 3O6WA 1BU6O 4PL7A 2ITMA 4CBUA 4BG8A 1GLDG 3ATVA 4FL9A 3DXMA 3U9ZA 2A5XA 2W40A 1BG3A 3CJCA 2A3ZA 4RCHA 5F0XA 4BRIA 3GOIA 4XH4A 5AQTA 4M7XA 4BGAA 4Z94A 2OANA 3H3NO 3KVGA 4IZ9A 4H0VB 3L6QA 1T6DA 2A40A 3W0LA 5AQKA 1NLVA 4O5FA 4A2AA 2ZWHA 5BPNA 4DB3A 1NGAA 1X9JA 1NGHA 1NBWA 2CH5A 5B8HA 2CGKA 3DXMB 1HPMA 3GDQA 5FPDA 2HOEA 3OHRA 3ID8A 4H5TA 4K25A 1RFQA 2HF3A 4B9QA 4NB4A 1HKCA 3UE5A 1G99A 1ESVA 4BREA 2DPNA 4BRAA 1LOTB 3QMLA 2P9UA 4FWMA 4BRDA 4H0YB 3AY9A 1OKJA 3J8AA 4B1XB 3ZX3A 5JMVA 3WEEA 1Z05A 2AA4A 3SMSA 2VYPA 2FF6A 3TU5A 1IJJA 5E26A 4B1YB 4BRLA 3RSEA 3LM9A 2A41A 1GLLO 3FZMA 3CQXA 4KBOA 4JD2A 2IVNA 2E2QA 2CGJA 1T44A 2Q36A 2YHXA 3IMXA 3U9DA 1HJOA 3O08A 3GBTA 1LCUA 4K42A 3SLCA 1HX1A 3B8AX 2P9UB 1QZ6A 3EN9A 5AQFA 4BC5A 3BEXA 3EKSA 5JLFA 2P9LA 1Y64A 2Q2RA 1Q18A 2P9SA 1GLCG 2P9KA 5AZJA 3VEWA 4BG9A 3A8YA 2KHOA 3FFKB 4FWKA 4JD2B 3U4LA 3LL3A 3UB5A 2FSJA 4IO8A 3HBTA 4H0OA 4WYBA 3EZWA 4XH1A 1TUYA 2Q0UA 3H3OB 2Q0RA 2Q1NA 3QB0A 3VENA 3JXUA 4BQZA 4CZGA 3A5NC 4EHTA 2V52B 4JHDB 2YHYA 4H5WA 4BRMA 5BN8A 1BWFO 5AFUA 5LJVA 3VEOA 3R9PA 3C7NB 3QFPA 4GY2B 2GWJA 2P9KB 4IXCA 4CBXA 4FWPA 5EXWA 3HSCA 2VWBA 5AQIA 4MLHA 3DWLA 1JCFA 2ZGZA 1NWKA 4JNEA 1NGBA 4C23A 4BRGA 4E1JA 4BRKA 3A5LC 4FPBA 3MN7A 1T6CA 3ZX0A 4BRNA 5AQWA 3IUCA 2P9IA 5BR9A 1NM1A 2D0PA 4DCHA 1E4FT 4EAHD 2QWQA 4CD3A 3DJCA 1KAZA 2BTFA 2PBDA 5AQVA 3WQTA 4M63C 1X3MA 1SZ2A 4L3QA 3FR0A 3WXJA 5F2RA 1U2VA 2FSNA 3DXKB 3MDQA 4CI6A 4BR7A 4J8FA 2D1KA 2ASMA 3D2FA 3CJAA 3FZKA 2FSKA 4ISGA 3L0QA 4B1UB 1TUUA 3A5MC 1BA1A 2FF3B 5KPTA 2P9PA 3UKRB 5BPLA 3UKUA 2UYTA 1YVNA 1NMDA 3VGKA 1P8ZA 3D2EA 1JCEA 1S22A 4BRFA 3A0IX 1Z6RA 3ZETB 4MO4A 3VPZA 3S41A 4QS7A 2D0OA 1EQYA 1YUWA 3FZHA 3ZX2A 3R6MA 4EIAA 3H1VX 3GE1A 5FPMA 2GELA 3TPQA 4CJ7A 4BRCA 3D2FB 1NGGA 3EO3A 4CZJA 1NGEA 5CE3A 1NGIA 5LY3A 4CBWA 2P9PB 3FE1A 5ADXA 2E2PA 5AQPA 4CZIA 4FWLA 4ISFA 1MA9B 4BR4A 3D2EB 2QXLA 3O80A 4A62A 3L4IA 1WUAA 4BVPA 3VEVA 4FWSA 2A6AA 2ZGYA 5AQZA 3M6GA 3VEXA 4Y0WA 3LDOA 4CZMA 4PKHA 1QHAA 5AQQA 2E2NA 4IJNA 2VCPA 3KZBA 2YJFA 4BROA 2V7YA 5AQYA 4EFHA 4FWOA 1QQOA 1BUPA 3ENOA 3FZFA 3H6EA 1YXQA 2YJEA 4M7YA 1H1VA 4H5RA 1E4GT 1NGFA 5BN9A 4I6MA 4XH5A 1XUPO 1V4TA 4AM6A 2E1ZA 2IIRA 3F9MA 1RDWX 1D4XA 2D4WA 3WEEB 1HLUA 4ISEA 3WXLA 4H5VA 3CI5A 3RSEB 1GLJO 4CD1A 2EWSA 1U6ZA 5EY4A 2NZTA 1ZC6A 4FO0A 4BR5A 3QFUA 1CZAN 4FWQA 4H0PA 3MCPA 2E88A 1X3NA 4K43A 4BGBA 3CJ9A 4BR9A 3MMVA 5AQUA 3O4WA 3IDHA 3VETA 1BA0A 3LDPA 2P9LB 1ZXOA 5BRDA 1NGJA 2P9SB 3H1QA 2BUPA 3MN5A 3HZ6A 5AZJB 5KQ8A 1QQMA 3A5OC 2QWLA 1XC3A 1V4SA 1KXPA 2E8AA 3HM8A 4FPAA 3LM2A 3CJBA 3U8XA 4FWNA 3AARA 3HI0A 3BUZB 2V51B 5BRFA 4O8KA 5AQOA 3AAPA 4WQ5C 4BR0A 3O1BA 2E1YA 1MWKA 3WQUA 5AQHA 4BC2A 3W3DA 2F9WA 4DHYA 5AQNA 1NGCA 1GLAG 3EKUA 5KQDA 2I7NA 4A61A 1SAZA 2GTDA 2E20A 2QWMA 1JCGA 1DGKN 2E2OA 2QWOA 5EX5A 3VOVA 1ATRA 4H0XB 4QS9A 4YDUC 3BF1A 3VGLA 4RTFD 5FPNA 1C0FA 5BRHA 5F1XA 3ULEA 3LDQA 5AQMA 4CZLA 1HUXA 5JICA 5ELZA 4GNIA 2QWNA 3MN9A 2GUPA 3IFRA 3WXIA 2ASOA 3VEZA 5AQJA 3MK6A 3CETA 4WQ4C 2P9IB 1K8KA 2Q31A 4BVOA 3CJ1A 3CHWA 3KHYA 4CZEA 5TKYA 1ATSA 1R59O 2W41A 1DKGD 3VF2A 4H5NA 4XEIA 1U2VB 2IVOA 4B1ZA 3QBXA 3QDKA 3ULEB 1KAYA 3I33A 3FGUA 1SQKA 3VGMA 3C0BA 1GLFO 2WUSA 3WUHA 3UKUB 3H45C 3JS6A 4H03B 3SMPA 3O5BA 1S3XA 5KPRA 1K8KB 2YCHA 4IJAA 2AP1A 3LDNA 5FPEA 3CQYA 4FOEA 5AFUH 1BO5O 1QZ5A 1DEJA 3GL1A 2HMPA 4BC4A 4FSVA 3CERA 3ATUA 5AZIA 4PL8A 1RGIA 3QICA 2CH6A 5JLHA 5AQLA 4CZKA 2A42A 5BREA 2J4RA 1GLEG 2NRHA 2YI1A 4HWIA 1YAGA 2P9NA 2YHWA 3I8BA 3ENHA 1HKBA 4PKGA 4IWVA 4JN4A 3HTVA 4BR2A 1GLBG 3WXKA 2NLXA 3VF6A 4CZFA 1XQSC 3M1FA 4FOIA 3VEYA 1NGDA 5AZIB 4BC3A 4EHUA 4MLEA 4PKIA 3ZEUA 1MDUB 3MN6A 4F9OA 3VERA 2QM1A 3O8MA 4QS8A 4BRQA 2HF4A 3AAQA 3D7EO 3FZLA 5KPZA 4I6MB 2P9NB 1IG8A 2ZF5O 3EL2A 2FXUA 3CIPA 4JHDA 5AR0A 3C7NA 1TYQA 4BRPA 5LJWA 3G25A 3SJHA 4B1WB 4CZHA 3CJ7A 4B1VA 3QBWA 1BOTO 4FWRA 3LDLA 1QQNA 4BRHA 3ZEUB 3FLCO 5AQSA 1MWMA 2I7PA 1WOQA 2QWRA 2CGLA 5E84A 1ATNA 4A2BA 3R8EA 4LC9B 5ADXH 5EOYA 1KAXA 4RWTA 4WQ5A 3DAWA 4NO7A 1C0GA 3O1WA 2V7ZA 3SK3A 5EVZA 2GWKA 3WT0A 3BF3A 4K41A 1TYQB 3H46O 2ASPA 2F9TA 5AQGA 5BPMA 2QW9A 1ZBSA 3DXKA 2H3GX 1J6ZA 3P4IA 5AQRA 4YDUA 1HKGA 2FLOA 2QWPA 4H0TB 3M3ZA 4DQ8A 5I9EB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKDA 2D0CA 3GG4A 4HTLA 3VESA 1RNHA 3AO5A 4LH5A 2UUAK 4DU1A 2VWKA 3AO2A 1RBSA 3KLIA 4B9TA 4YNQA 1N34K 1WSEA 4AM7A 3LAKA 4J2BA 4V19S 4KHQA 4E1NA 1TGOA 2W40A 1EKEA 2O4GA 2A3ZA 3CJCA 3CCLN 4LSLA 4XH4A 5AQTA 4KB0A 4Z94A 3T1HK 2UXBK 1S72N 4IZ9A 4H0VB 5GADP 4A2AA 2Q3SA 4DB3A 1NGHA 2RKIA 3AVKA 2CGKA 5FPDA 3AVLA 1W9HA 4O0IA 3M8RA 4NB4A 1VRUA 5CYMA 1G99A 1ESVA 3AVHA 1NK5A 1C0TA 3K5NA 3F73A 2B5JA 4DFPA 2YNIA 1S6PA 4BRDA 4H0YB 3J8AA 4FK2A 1OVQA 4U67L 4B1XB 3KK1A 1KQSM 4B3SK 2QXFA 2AA4A 3TU5A 5E26A 4BRLA 3JAMO 3NDKA 3T1AA 2A41A 2OZMA 4JS5A 3IKMA 3I56N 1S9EA 2IVNA 2VQFK 1TAQA 1WSJA 3E1YA 3PX6A 4LF8K 4WF9L 3EN9A 4W5QA 3V9WA 5M1OA 3TAFA 4DFKA 1Y64A 4KHNA 3KKRA 3KLGA 2P9SA 2P9KA 3F2KA 5AZJA 4J2DA 3C6UA 2O8BB 2KHOA 3FFKB 4JD2B 4AHCA 2NRXA 3OTOK 1HYVA 1IKVA 4IOXA 4H0OA 3WNEA 3T1YK 4XH1A 1TUYA 4CGHA 1VQNN 3SQ4A 3LZJA 3VENA 1WSGA 3JXUA 4CEBA 5BN8A 5AFUA 3TAEA 4M3UA 4GY2B 4PA1A 4YFUA 4E3SA 4ILHA 4W5OA 2WONA 3SUOA 3T3FA 3OYIA 3SV3A 3OS1A 4FWPA 5EXWA 2O8DA 4FZZA 4FJ8A 4GW6A 1T8EA 3ZSXA 1NWKA 1IKWA 5JS2A 1QVFM 4BRKA 4RW7A 2GV9A 3I55N 3P31A 4BRNA 1QE1A 4LFCK 3IUCA 2P9IA 5BR9A 2D0PA 4DCHA 2ZJQL 4E19A 2QWQA 4DR6K 5KGXA 4CFBA 3K9JA 1X3MA 3FR0A 1D5AA 5F2RA 3SAFA 1B9FA 5GIOA 4DLEA 3DXKB 1K8AO 3J81O 2NUBA 4Z0UA 3CJAA 2FSKA 3L0QA 4B1UB 1TUUA 3A5MC 1YJ9N 1BA1A 5KPTA 4JI0K 1P8ZA 4DSIA 5GAGP 4BRFA 5CY4A 2Y1JA 1EP4A 2RF2A 3H08A 3VPZA 4QS7A 2D0OA 4JI7K 1T3VA 3ZX2A 3LPTA 4ZTFA 3G0ZA 3L2RA 4FM0A 3H1VX 4LSNA 5CZ2A 3TPQA 4CJ7A 4IDKA 4CJFA 5HOOA 3R1XA 4KH4A 3SZ2A 1NGIA 1RT6A 4KB1A 3KLFA 1XHZA 2E2PA 3HXMA 4BR4A 4CF2A 3K5OA 2HBKA 5TKWA 2QXLA 2PZSA 1NK8A 2KW4A 4C8OA 3M8PA 3SQ0A 3VEVA 5KRTA 2ZGYA 3E9LA 1REVA 1Q81O 2PFUA 3KIOA 3VTHA 3LDOA 4CZMA 4F2RA 1VQKN 5AQQA 4FJLA 2VCPA 3KZBA 2OPPA 3O4NA 2XO7A 4CHQA 4WFBL 4EFHA 4FWOA 4WFNL 3ENOA 1C1BA 1YXQA 4W5TA 4K8ZA 4QAGA 3WNHA 5I3UA 4GV3A 1ASVA 4I9QA 1XUPO 3NCIA 2KTQA 3D6RA 3F9MA 4F3OA 1D4XA 3F5TA 2UXCK 3V9UA 4B8CA 1NK4A 1DTTA 3K59A 2KQ2A 4E7HA 4H5VA 1GLJO 4FO0A 4BR5A 1QS4A 1A5VA 3IS9A 3Q7CA 2JGUA 3E66A 1X3NA 1EO1A 3CJ9A 4BR9A 4DTXA 4JI3K 4TSXA 3IDHA 4CEDA 3VETA 4DSKA 1NGJA 1I39A 2VQEK 2P9SB 3AVNA 2BUPA 1FW6A 5AZJB 1RT7A 2BH1A 4FJ7A 3LM2A 5D3GA 1VQ8N 3BUZB 3AO4A 4BC2A 5I42A 3W3DA 1S1XA 4DHYA 5AQNA 4OGEA 4CF9A 1VAZA 3CD6N 4H4MA 1SAZA 3A2FA 2GTDA 2QWMA 3O4QA 1N33K 3ENBA 4HHTA 1JXEA 1RCHA 1HPZA 4OPJA 4MQ3A 4B08A 3VGLA 1LAWA 3L2WA 3HPGA 3QEXA 3ULEA 3LDQA 4IFVA 4CZLA 2QTDA 3F9KA 2ASOA 3VEZA 1YVUA 3MK6A 2P9IB 1K8KA 3NFAA 2OA8A 1CLQA 4BVOA 4CJEA 1ATSA 5HRNA 4Y1DA 3VF2A 1NK0A 1U47A 4RG8A 1Q8IA 5HRSA 4DTSA 3ZT1A 3O3FA 2IDOA 1GLFO 5BR8K 4ELTA 1YITN 1O1WA 2VG6A 1M1KO 3O5BA 3ZYYX 4H4OA 2YCHA 4IJAA 5M1QA 5T7BA 4QOZB 2HW3A 4CHOA 3NF6A 3O9QA 1R0AA 4CHNA 4CEZA 2P5GA 4DF8A 3LAMA 2X6NA 1BO5O 1QZ5A 3T7ZA 3DLLL 1DEJA 3TTFA 2R7YA 1RTHA 1G15A 4IFEA 1ILYA 1RBRA 3OYAA 4PL8A 4M3WA 2VWJA 1VQ9N 5JLHA 5AQLA 5CHIA 4LFBK 3I8DA 3BZCA 2G8IA 2YI1A 3CFPA 2ZJRL 3OA9A 1CXUA 4A5AA 2YHWA 2P9NA 4PKGA 4B9LA 3CCRN 3U6FA 2A1RA 3L8BA 3MWPA 1ITGA 3NGIA 3K5MA 2NLXA 3AA2A 1XQSC 3M1FA 4IOCL 5FRNA 3ID6A 3ZEUA 1MDUB 5DM7L 2QA4N 1Z25A 1BCOA 3VERA 4RW6A 1EXQA 2G8HA 1S1UA 2YNGA 3QERA 1JLFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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