4RQRA

Crystal structure of human glutaredoxin with mesna
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'GTAQEFVNCKIQPGKVVVFIKPTCPYCRRAQEILSQLPIKQGLLEFVDITATNHTNEIQDYLQQLTGARTVPRVFIGKDCIGGCSDLVSLQQSGELLTRLKQIGALQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cysteine Specific Targeting of the Functionally Distinct Peroxiredoxin and Glutaredoxin Proteins by the Investigational Disulfide BNP7787.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
source organism Homo sapiens
molecule tags Electron transport
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4rqrA00
1YQ1A 2H6YA 5G5EA 3KTBA 4MK3A 1SL2B 4AF2A 1OC3A 2GT6A 2VL2A 16GSA 2WZ9A 4D73B 2I81A 4JBBA 1GSUA 1WMJA 2QC7A 1W4VA 5D93A 3APSA 1R7HA 1X9SB 4ECCA 1DUGA 2YN1A 1X5DA 1YDKA 3D0ZA 4EXJA 1NW2A 4V2MA 1GSYA 4O92A 3UARA 1Z3EA 2OBKA 3HDCA 2C0GA 3ZMLA 2JZTA 3QFBC 4PQIA 4IW9A 5IMDA 4JEDA 1ML6A 5DQSA 1MTCA 2H73A 2VL9A 5G1KA 3EMXA 4WXTA 1MDJA 5A5KA 3QAGA 3MNGA 5ELAA 2H1BA 4ZBAA 2V41A 5JWRB 2GLRA 3VWVA 1EOGA 3GA4A 2C4JA 3E3EA 2PPTA 1WE0A 4XS6A 4EDZA 3CRUA 1OC9B 2H1GA 4NV5A 1FB6A 2LJKA 4GF0A 5B6MA 2GGTA 4HS1A 4XTSA 3PH9A 2YP6A 3L9SA 3TJJA 6GSXA 2CVDA 4N11A 1SK0A 4HU9A 1VF1A 1E6BA 1EWXA 1SU9A 1MEKA 1XWBA 2IMIA 3L9UA 3CRTA 4TR1A 17GSA 5CAXA 2HZFA 2GTUA 1N8JA 3F8UA 2HZEA 4F03A 4ZL8A 3GKNA 3ERGA 1NSWA 4KE3A 1XVWA 2AV4A 3A3TA 1O8WA 1K0OA 3GKMA 2G2QA 2OA7A 4G10A 4JR6A 1JZRA 2DLXA 2FWEA 5F05A 2HI7A 4EF0A 2CX3A 1U3IA 1XW5A 2L57A 4F0CA 4FIWA 4LA1A 4DEJA 1HNCA 1SKSB 1EEMA 4I97A 4EVMA 4GQFA 4G9HA 3FW2A 5CRHA 3GKKA 3H4KA 2YCDA 1V40A 3EE2A 3ZRDA 4ML1A 3D22A 3S9FA 1M2BA 2WGRA 2VLTA 1XOBA 4AJ7A 3QAWA 4OCEA 3MSZA 5KN1A 3IOSA 4WF5A 4XS4A 2B3SA 3IHQA 2YOIA 4OD7A 4EE0A 1ON4A 3GX8A 3VFIA 2B5EA 5IQYA 2F9SA 4KA0A 1OE8A 1ILOA 4ZILA 1GRXA 3DVWA 5IPGA 5LCZA 2DJ2A 4I2UA 4HU7A 1QUWA 3HJOA 2VCVA 4KX4A 3ZLPA 1O8XA 2B1KA 1DE2A 3WGXA 2GQLA 3RPNA 4WBJA 4TW5A 1XWCA 3LORA 3LXZA 2DMMA 3CBUA 4O5RA 1I5GA 6GSTA 4MJCA 3VK9A 3L78A 1ERUA 3VLNA 1ERWA 2QKEA 5IPHA 1PQNA 2J9HA 4XS1A 3EWLA 4BWQA 4OMVA 3UVHA 4PUAA 2HE3A 3P8WA 3GL3A 5GAND 2GQMA 4RUVA 4HOJA 3W8SA 5DALA 1AQWA 3GIXA 2H66A 4MJEA 1ZYQB 1XVQA 1B4PA 2AYTA 1GULA 4MJBA 1TU7A 4MH3A 3MWHA 2LNTA 4CDOA 2VO4A 1PGTA 1Q4JA 2E7PA 1UN2A 3Q74A 3A2VA 2YNXA 3M1GA 1RK4A 2PVQA 4WETA 3ZTLA 3JCML 2ON7A 3N9JA 4HUAA 3VPQA 1OAZA 2VOCA 4IELA 2VCTA 5ECLB 2XBIA 2HSYA 5D9XA 4TOPA 2XHFA 2OADA 3GKXA 2RM6A 2H1DA 4ACSA 2M46A 3IC4A 4ZB9A 2DJ1A 4NMUA 5LNKe 4I5QA 3FZ9A 2VCQA 1TKDB 3KIJA 3RAZA 1K0NA 2XC2A 1K0AA 1DBYA 5ECMB 3CYNA 1K3YA 3GUSA 4IN0A 2JSZA 2AUVA 2B7JA 5KN0A 3ERWA 1GLQA 3KH9A 4KSMA 4PQ1A 3IK7A 3O6TA 1B9XC 1VRSD 4MABA 4ID0A 2QSIA 4AJ6A 3ZL5A 2L59A 4GWRA 2WS2A 2K8VA 2CZ2A 2FWFA 6GSVA 2HLSA 2BMXA 2WCIA 2VCZA 3GTUB 4MF7A 1YF0A 4HJ2A 5B7CA 2AHEA 2YV9A 5GAPD 1NHOA 2OBIA 4P3YB 4RI6A 2LRNA 4IQAA 2E2GA 4MP4A 3TKSC 3QOUA 3M3MA 1KNGA 3MAKA 4I6XA 4QL9A 3E0UA 1M9AA 5FWGA 2DJ3A 4GSTA 4ZL9A 5J41A 4KDYA 1X9WB 2HNLA 1AC1A 1FB0A 4POKA 5IMZA 3KEBA 1WPIA 3D5JA 5DAKB 1PMTA 5G30A 5G31A 5A4WA 1TXXA 4J2FA 2P5RA 3IRAA 4PURA 1PX6A 5D9VA 3TKPA 1SYXA 5AGYA 3C8EA 3FZ4A 1YKAA 4IHUA 3BJ5A 4YAPA 3APOA 5L71A 5DBQA 1WP0A 1A8YA 2C3QA 1GTAA 3LJRA 5CP1A 5ID2B 3ME8A 3VPTA 1YY7A 1GH2A 1O6JA 1GP1A 1FHEA 2DJKA 4GQCA 3E9JB 1UC7A 3I9V2 3KMNA 3ZVJD 6GSSA 3G7YA 1T8EB 1K3OA 2FA4A 1T7PB 4ILFA 3VWWA 2CX4A 1A2MA 1GNEA 2DJJA 1H75A 1TJDA 3KCMA 2PMTA 4ECJA 2NTOA 5DVBA 4N0ZA 3LGCA 1M0UA 3C73A 3D6IA 1A0FA 3EURA 2DJ0A 2H19A 4K7OA 2R37A 2FNOA 3FK8A 5F07A 3KH7A 3RBTA 3WGEA 4V2NA 2CA8A 5IOXA 1G7EA 2LV3A 3EYTA 3WYWA 5E59A 5INYA 3GH9A 2LJRA 1VF2A 3L9VA 4TR0A 2VL2C 1TK5B 3IDVA 5B8BA 1CQHA 1FW1A 4NXIA 2GQKA 2WDUA 5DCHA 4OCFA 2FY6A 19GSA 4ZIJA 5IMCA 2C3NA 3O76A 1H4OA 2VCWA 4Q5FA 2ALBA 2I1UA 1KBNA 4KCEA 3TUEA 2MMAA 4IVFA 1QK8A 4K8MA 4EC0A 3HZ4A 1M9BA 1O85A 4PQHA 3ZYWA 1SD8A 6GSYA 1U6TA 3PINA 3ZZXA 4KH7A 2FCHA 1B8XA 3ZVJA 1TI1A 5GZZB 5H5QA 1IYHA 4GLTA 5ECNB 3BCKA 3G7JA 1MD4A 3HJPA 4KUNA 1K0BA 3UVTA 4I2TA 4HI7A 1WRYA 1GWCA 1AAZA 1EZKA 2RUEA 1VGLA 1F3BA 1FOVA 5CYYA 5J9CA 1TOFA 5HFKA 3A5WA 3UL3A 4BA7A 1V2AA 4J57E 1SYRA 3F3QA 1THXA 1WOUA 1AXDA 2B1LA 3LYKA 5D96A 4K9ZA 5JWQB 3LFLA 1TRUA 5AISA 4TXOB 4PNFA 1YKCA 4QL7A 1G7OA 3KD0A 4V1Ag 2DSAA 4N10A 1SENA 1S3DA 5J4UA 1A8LA 1A0RP 2LS5A 1PD21 2V32A 2V1MA 3TRQA 3BCIA 1ABAA 5D9WA 3F9UA 4H86A 2C1YA 1TRVA 3CSJA 2H0IA 4XRAA 5COHA 3ZITA 2H1AA 3FZAA 4ULXA 2KUCA 5FT3A 4MZCA 2B6MA 4HQZA 2PGTA 2BJXA 2FD3A 5ECHB 2X8GA 5IO0A 1N2AA 1T1VA 3BOAA 2HYXA 3D21A 2FLSA 1X5CA 2WFCA 5JWOB 3LQ7A 2GSRA 5C04A 4WR5A 5LD0A 1PKWA 4LL1B 2IFQA 2LRCA 3UAPA 1JLVA 3K8NA 4MH2A 1LBKA 2ES7A 1U87A 3ZFBA 3FR3A 4KW6A 2YWMA 5F8BA 1TRWA 2FHEA 4PX1A 2QGVA 2HRNA 1OKTA 3FR9A 2YWOA 3R2QA 4X43A 1GSDA 2JSYA 3C1SA 3C71A 3IA1A 4DSSA 4XRDA 2IMKA 1J0FA 2XPEA 2HT9A 2H72A 2X8HA 5ENUA 2YV7A 1ZMAA 3HCZA 2REMA 1Y6EA 2GZZA 5KN3A 1QGVA 2NBSA 1EEJA 2JZSA 3TCOA 1RQMA 2A4VA 3H93A 3H79A 3EU3A 4NWYA 5ECKB 4MLYA 4ZB8A 2P5QA 2OE1A 3GH6A 3WGDA 1T4ZA 2PWJA 2IIYA 1SJZA 2EC4A 2LSTA 5G5FA 2LUSA 3LWAA 2VD0A 4N30A 1BJXA 13GSA 4KGIA 4YAVA 1Q98A 2L5LA 3KTLA 4FO5A 3UBLA 3QFAC 2C0EA 4XCSA 3M9KA 3IK9A 2DBCA 3U6VA 4X1UA 3NIVA 2MBTA 2VM2A 2LTKA 3G9BA 2YWIA 1T4YA 2K9FA 3RHCA 1WIKA 4NPBA 1M99A 4O7HA 2FWGA 3IBHA 2X64A 4O32A 3LXTA 3GSSA 4K6XA 1JHBA 4F82A 1IYIA 4GRFA 2CZ3A 1K3LA 1M7TA 5DCGA 2K6VA 2CVKA 2EIRA 3KZQA 1JFUA 2LKUA 2CVBA 3ERFA 3F63A 1EGRA 2C0DA 4MZBA 1T3BA 5EVOA 4E8HA 2JZRA 4JE1A 4XIHA 2FA8A 4IS0A 2IL3A 1O81A 2IMEA 2R6KA 2PN8A 2DC5A 3GMFA 4YQUA 2AB6A 2XBQA 5H5SA 4JU5A 1YF1A 1OKDA 2VAFA 3FZ5A 2CAQA 1Z5YE 4HZ4A 1GSEA 4GTUA 1BYEA 3O3TA 3APQA 4TR1B 3P2AA 4ECIA 1XOAA 1G6WA 1QXHA 1JLWA 2GSTA 4KCAA 2HZEB 1SKWB 2P31A 5CRWA 3ZREA 5D9TA 2OACA 1O7UA 2RUFA 1AW9A 1CQGA 1F37A 2KOKA 3DVXA 4HDEA 1NHYA 3VWUA 1YZXA 2I4AA 1LJRA 4KDUA 5ECIB 5HFIA 1K0DA 4N0VA 1F9MA 3H8QA 4MA9A 3EINA 1QMVA 3WD6A 4F2IA 2IMFA 1ZGNA 3QD9A 3GL5A 3I69A 1BX9A 1PN9A 3SBCA 1E2YA 4GSSA 1GTIA 5C00A 4OO4A 14GSA 5IMFA 3QR6A 2AJQB 4JRRA 5JCWA 5CNWA 1OE7A 3EU4A 4JR4A 2YJHA 1EGOA 2HRFA 1WJKA 5IOWA 2YANA 2H76A 1ZCPA 4ZBBA 1TK8B 3PGTA 4XS4B 5J9BA 4ZXGA 1XW9A 3DKSA 3CSHA 3GHAA 4YQVA 2GZPA 4MPFA 1SD9A 5J3RA 3UEMA 5G1LA 4ML6A 3HXSA 2M72A 3CTFA 1EV4A 2JACA 2YZHA 2XPDA 5DDLA 5HR0A 1GL8A 3FEUA 3Q19A 5HR1A 4ZB6A 2B5XA 2FWHA 1DE1A 4MPGA 3IV4A 1Z7RA 3RHBA 3KM6A 4Q5RA 3TJBA 1HD2A 2I9HA 3L4NA 4TN8A 3TOUA 2ON5A 3A2XA 3FRCA 1BQ7A 3IAM2 1OYJA 2LQOA 3EC3A 8GSSA 1FG4A 4MDCA 4V1Ap 5ELGA 1URMA 4D73A 2WRTA 2CV4A 1X5EA 1EV9A 2N5FA 5DALB 2RM5A 4QQ7A 4GXZA 5JCUA 3MDKA 20GSA 2PU9C 4TR3A 1TU8A 4HQSA 4FYUA 5EY6A 1K0MA 1SL0B 3TJGA 3Q6OA 4RQRA 2B7KA 3ZFLA 3QCPA 2PERA 3QDNA 4F9ZA 3U5RE 3IR4A 4E8EA 4IKHA 2MMOA 3CXGA 1GNWA 3IAS2 2VUPA 1ZYEA 2B5YA 4PXOA 3W8JA 4J56E 4K7NA 3IXRA 3ME7A 5D8IA 3I43A 2HXKA 3LEFA 5ABRA 1TW9A 1XZOA 5FHIA 4BVXA 3FYGA 1PKZA 4FH8A 3IPZA 1VF3A 4ECBA 1OC9A 1ZL9A 6GSWA 5DJMA 4OFMA 1PL1A 2H6ZA 3FR6A 5HFGA 4OFTA 3F4SA 1BAYA 3CMIA 3W6GA 1U3AA 2WULA 4DSQA 3TKSE 3P90A 4HZ2A 4EKZA 2LNSA 3KJYA 12GSA 5GSTA 3M0FA 1MDKA 2GSSA 4MMMA 3TB2A 4Q5NA 2CAIA 4HEA2 4F0BA 2JU5A 3DMLA 2R4VA 2O85A 1W89A 1S3AA 5HR3A 2R3XA 1A23A 4IJIA 2V6OA 4Q5QA 2O7KA 2TIRA 2MYGA 1USBA 4CHSA 3UBKA 3GX0A 1AQXA 1V9WA 5CREA 3FKFA 2FUG2 2WJUA 3A2WA 1XWAA 4V2LA 1SK2A 2ZUPA 3NZNA 4NV2A 5ECPB 4ZL7A 1TTZA 2KP2A 2R5GA 3HD5A 1ZOFA 3BD2A 5CRDA 4AGSA 3F0IA 3PR8A 1XXUA 1HYUA 2YWNA 2KLXA 1BG5A 1X0RA 5CO3A 3H1NA 3SWLA 1TDIA 4NHZA 5KEJA 5ECOB 3HYPA 4KAEA 1B4QA 3US3A 1V98A 1BEDA 1K0CA 3KP8A 2MZCA 5A4UA 4EDYA 3AY8A 2H75A 2EIQA 1FO5A 2KP1A 5B8AA 1A24A 2HFDA 5JCGA 5IIZA 2YZUA 4KB3A 3KGKA 10GSA 1YEXA 4KSOA 5IM9A 1RW1A 2YPMA 1TK0B 3Q18A 5ECRB 3LYPA 5EL8A 1PRXA 2HSHA 2I3YA 9GSSA 1R26A 1ZZYA 1R4WA 1THOA 5ECSA 2LRTA 5GSSA 4L5OA 4KNDA 2GSQA 4YQMA 3NOFA 1HNAA 4DSRA 1EP7A 1ST9A 2VM1A 5J5NA 1OVNA 4L8EA 4POBA 4IJ3A 4TXVA 2H0HA 1FVJA 1XIYA 5F06A 2K8SA 5AIVA 1WWJA 4AJ8A 4NAXA 2LEGA 3GRXA 1FVKA 3DD3A 3DWVA 2FGXA 3EMPA 1UVZA 5H5RA 2EIOA 2J23A 2OE0A 2RLIA 3BBYA 2DIYA 2H74A 1YEPA 2VCXA 1DSBA 2KHPA 1LU4A 1PL2A 3P7XA 1ERTA 1O73A 2ZNMA 3DYRA 2NVLA 1YJ6A 4BVYA 4TVEA 3GN3A 4BPYA 1SJ6A 4TR4A 5CRGA 2H70A 3WT1A 2P0GA 2N5AA 6GSUA 3DXBA 3FHKA 4DVCA 3DGQA 2OJLA 2H71A 4L0WA 2LQQA 7GSSA 1B9YC 3QAVA 4LL4B 1Y25A 1KTEA 2IMDA 3TGZA 4PNGA 1Z7PA 5HR2A 1XWGA 2F3MA 3ZIVA 4XHMA 3GV1A 3HVVA 2LJAA 4PUFC 1GUKA 1SKRB 3TJFA 4EO3A 1GTUA 5DJLA 2A2RA 3TRPA 1EP8A 4IBPA 4YH2A 5AN1A 2L6DA 5IMAA 1MD3A 2M80A 4TKYA 3VI7A 1GUHA 1M2AA 4NHWA 3ZMKA 1F3AA 2D2ZA 1V57A 4OFNA 3LSZA 3J7Yk 18GSA 3HJMA 1Z9HA 1V58A 1TRSA 1U88A 2OE3A 3GTUA 1F2EA 2GT5A 4EUYA 1AIUA 3ED3A 5IMVA 1J9BA 1SL1B 1S3CA 2GDRA 3KXOA 4LLRA 2O89A 2A2SA 2IFQB 4OO5A 3HZ8A 3N5OA 1FAAA 2L4QA 5B6NA 5EPFA 3F6DA 1AUCA 3IE3A 2MMZA 4WR4A 1JZWA 3KP9A 2BTOT 1G6YA 3HVSA 4L0UA 3FY7A 1OC8A 3F4TA 4HJMA 4DSSB 3EVIA 5DAKA 1HNBA 1Z6MA 4JZQA 1GLPA 3DIEA 5G2ZA 4K2DA 3TOTA 5HQPA 1A2JA 2IJYA 2L6CA 3F6FA 4MZWA 2PVOC 3OR5A 2NPBA 4ISDA 4OWYA 1TP9A 1PSQA 4Z7XA 3HA9A 2JADA 5ID2A 3I6AA 3M9JA 4IQ1A 4KDXA 2RIIA 5ECQB 2C8UA 1PA3A 1UA5A 1XFLA 1J08A 4K0GA 3D4TA 4ZBDA 2N5BA 3UJ1A 1KEBA 2WB9A 4MJAA 3KMOA 4MF6A 2IN3A 2VD1A 4G2EA 4GSNA 2E2MA 1GSFA 2IWTA 1HQOA 5F0GA 4POLA 3L0HA 2E0QA 3UOMA 4LMWA 4RQXA 4WBRD 2ZCTA 1F6MC 4K1FA 3GURA 3HY2A 4K7IA 3J7Yb 3GYKA 3UMAA 2DIZA 1A2LA 2C0FA 1GUMA 2TRCP 2PUKC 4G19A 2H0GA 2H8LA 2C80A 1GSQA 4IP1A 3HVXA 3F3RA 3TKRA 1X9MB 1JZDA 5KN2A 3TRXA 3G7IA 4MCUA 1MDIA 2C3TA 1ACVA 2F51A 1G0TA 5DQYA 2VIMA 2IPAA 4L5LA 1AQVA 4TRXA 2V6KA 5AIXA 3ZIJA 1GSSA 2F8FA 3LG6A 1XBSA 4K0NA 5A4VA 2TRXA 1QQ2A 1SK1A 4IGJA 2CT6A 4BL7A 2YJ7A 1I9DA 1PX7A 1Z6NA 3TDGA 3QMXA 3RDWA 2MBSA 2VL3A 3WT2A 2Z9SA 2V2GA 4TXOA 3C1RA 3DEXA 2F8AA 4RI7A 1EOHA 1VF4A 2GVPA 11GSA 1R5AA 3F4RA 2OKAA 3QPMA 1XWKA 1R5PA 2NDOA 3HKRA 4POMA 3TKSA 4BWSA 1XPVA 3GNJA 2PBJA 4CW9A 2K18A 2O87A 1SJIA 2JL4A 2O8VB 3VWXA 1NM3A 2R2JA 2H6XA 1QFNA 3D4MA 1TI3A 1B48A 3DRNA 3C7MA 2X99A 3GSTA 2G0FA 1C72A 1GTBA 1ERVA 5D73A 3UIWA 5E4WA 4X0XA 2X8CA 2H01A 3TJKA 1XW6A 2GZYA 1XCCA 2L5OA 1JZOA 5IO2A 2AAWA 3V1WA 3RPPA 4LMVA 2VLUA 3VI5A 4EL1A 3HHVA 4WF4A 2MMNA 1M2DA 2H30A 3ISOA 2L4CA 2CQ9A 3M8NA 4GCIA 4WEYA 3CSIA 4I8BA 3CTGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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