4S2CA

Covalent complex of e. coli transaldolase talb with fructose-6-phosphate
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
TDKLTSLRQYTTVVADTGDIAAMKLYQPQDATTNPSLILNAAQIPEYRKLIDDAVAWAKQQSNDRAQQIVDATDKLAVNIGLEILKLVPGRISTQVDARLSYDTEASIAKAKRLIKLYNDAGISNDRILIKLASTWQGIRAAEQLEKEGINCNLTLLFSFAQARACAEAGVFLISPFVGRILDWYKANTDKKEYAPAEDPGVVSVSEIYQYYKEHGYETVVMGASFRNIGEILELAGCDRLTIAPTLLKELAESEGAIERKLSYTGEVKARPARITESEFLWQHNQDPMAVDKLAEGIRKFAIDQEKLEKMIGDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel mode of inhibition by D-tagatose 6-phosphate through a Heyns rearrangement in the active site of transaldolase B variants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Transaldolase B
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli k-12
total genus 135
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2015-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4s2cA00
1LRTA 1QCWA 1S5TA 1LBMA 1K02A 1K03A 3W1LA 3LV5A 5FI8A 1OYAA 1R2SA 3S1WA 1TCDA 3DZ1A 4JN6A 1NAL1 2FPVA 1X8FA 3W2LA 3PULA 3M5YA 5CGQA 1LROA 5HWNA 1ZALA 1AK5A 5FEZA 1WAUA 1WV2A 3C56A 2WSQA 3SZ8A 4PL2A 1YDOA 3I6RA 1H50A 2VFHA 3CEPA 1W56A 2VFDA 3UY8A 5AOUA 4JX5A 3LX9A 2W79A 4HSNA 3MO7A 1AW2A 3WJXA 2PCQA 1XUUA 1KFEA 1JUKA 3M41A 1GEQA 5IM51 2NXHA 1P0KA 3LCFA 2G95A 1TPDA 3HG4A 2QKFA 5AHLA 2GQ9A 4MIMA 3C2VA 2NLIA 3NQAA 3UWZA 5AC7A 3BPWA 3W72A 2E09A 3NPVA 2Q8ZA 2J9ZA 5IBXA 3LTSA 1ONRA 4FNRA 3HG2A 5I3HA 5CZTA 1YLVA 4TMBA 1WBJA 4OGZA 2A21A 2GOUA 3E96A 4NNCA 3P62A 4JIPA 5AC6A 3THQA 5LGZA 1F6PA 3N9SA 5G2IA 1TV7A 2QCNA 1DBTA 3C6CA 5EL1A 3QC3A 3BGJA 3CT7A 5AYXA 5KZMA 3W2NA 5BNKA 3G1YA 3KAOA 5LZLA 4PCFA 4UTWA 3DAQA 4N9EA 5DY3A 4JXCA 3QMSA 3H55A 4M7TA 2F84A 3LXCA 1R2TA 1EWDA 1YTDA 4FIQA 1S5WA 3IGSA 1IXPA 3LHZA 3W73A 2DZWA 4UNLA 1FWTA 1DJQA 3W7DA 4A2SA 5EMUA 4LVAA 3RFAA 4TO8A 4NJGA 1ZHAA 4K8EA 3TU9A 3DHDA 5F1VA 1G7VA 1VHCA 4KFPA 1Y0EA 3NOEA 2V82A 3DH7A 4JDYA 4LV9A 3A23A 4E38A 2CLEA 3TDFA 1DORA 3KVKA 3QFEA 5C6MA 1U5JA 4JTJA 1KM4A 2NV1A 3STFA 2H6RA 4LVDA 5HWMA 3R12A 4JICA 1K8YA 4AWUA 1D9EA 3G0UA 3W75A 5DCDA 2D73A 2FB2A 3H53A 2ZRZA 3TKFA 4YXGA 4DEFA 2F7FA 1VS1A 2YW4A 3F4NA 4NJKA 1Q6RA 5D04C 5G4EA 1TO3A 3QMTA 1TTPA 5AFDA 1OFAA 3L9CA 3UXDA 1K8XA 2V9DA 1X6UA 3DKJA 4O1DA 3TSDA 2QCHA 1VCVA 2ZTJA 1PS9A 1IXQA 4M5PA 2WO5A 2ISVA 4EF8A 1NEYA 1LOQA 2GPTA 4XWUA 2DZUA 2Y63A 1MEWA 3WJZA 2BTMA 4IPJA 1LRQA 1R47A 3RLUA 3ZFHA 1H7XA 3INPA 4AXKA 3NL3A 4HSOA 3QSRA 4O54A 1WOAA 3VKJA 1UUOA 1I2NA 3UPBA 4UTJA 2RH9A 1L6YA 1H7RA 2ZTKA 2JKEA 3C8FA 2JGQA 3O6YX 1U83A 4WQ6A 4A3UA 4W9TA 3FEMA 3S9YA 1H1YA 1IGSA 1MZHA 4O8RA 3NL6A 1PHWA 1VRDA 1HO4A 2CLHA 3S8HA 2XN0A 2WPBA 2H8ZA 1SFLA 2YYTA 2GJLA 3LDVA 5EKYA 2TPSA 2NWRA 2ZRXA 2NX1A 1FQ0A 4PA8A 2I1OA 2R8WA 1GYLA 4FO4A 1JRBA 5KZDA 1RQEA 4R33A 4BWLA 4DELA 5CPOA 3C61A 2ZRWA 4NJHA 3HG3A 1YXDA 3WK1A 4WUIA 4DXVA 4N9CA 1TPH1 3S5OA 3S0CA 1N55A 1O94A 5HR7A 5HULA 1FDYA 1QPRA 1K7XA 4GJ1A 4WOZA 4R34A 3HG5A 3KRUA 3CB8A 4LOCA 4CNNA 4N02A 3PBVA 4XZ9A 3CPRA 1LLZA 2DP3A 1SUXA 3PAJA 3N34A 4RCXA 3W1RA 3BG5A 3PY2A 2QJGA 4RKAA 1JVNA 5CSRA 1PHQA 3P84A 4YL2A 2BWGA 3W86A 2NXIA 2J27A 1KFCA 3NQVA 3UZ5A 4PTNA 1KFBA 2CLOA 4M6VA 5G2HA 4AHQA 4O53A 1DV7A 1ZAHA 5LNUA 1OFBA 4JTGA 4KFNA 1X1OA 3R89A 4QIUA 5LNWA 4Z08A 3F4WA 3OVPA 4O12A 1BEUA 3CEUA 3F03K 3SGZA 4CQAA 5AB3A 1TJPA 1KBJA 1ME7A 2LLEA 3ZR4A 3A9IA 4R7JA 3QH2A 3W83A 3N9RA 3O8AA 4I7WA 5FEWA 2A7RA 3E0IA 3PBYA 3MJYA 3LHVA 5CKSA 2NZLA 2A6LA 4Y6GA 1JCLA 5D03A 4NUWA 2A2IA 3G1AA 4M19A 1Q6QA 3W7HA 1ME9A 1EIXA 1W5NA 2BX7A 2QAFA 3HPZA 2I14A 4EF9A 2ZQ0A 1TQJA 1F05A 1KTCA 4XKYA 3GYEA 1WYIA 3FFSA 3NAVA 2X1SA 4HHPA 3W23A 2HTMA 1XBXA 5F2MA 3GKAA 2VOMA 4CLMA 3G1DA 4N6EA 1W3NA 3LI1A 4LC6A 3W2JA 3TA6A 1K3UA 3CWOX 1QNVA 3W87A 4UTKA 1GG1A 3AO0A 3WK0A 4WOQA 2YFNA 4Y9AA 3QJAA 1H7OA 1JULA 8TIMA 4MJMA 1H63A 5H2ZA 3W76A 1K8ZA 4CNPA 3PB2A 1XC4A 1QPNA 3DFSA 1F5ZA 4YCOA 1VYPX 1DQWA 1ICSA 1A5CA 4FNSA 1GVOA 4RLIA 5AYYA 1ML1A 1MXSA 3TC6A 2V30A 2C15A 4LU0A 1LBFA 5G2WA 1TPWA 1OFPA 1RD5A 1UCWA 3TW7A 2NUYA 1VYSX 2AAMA 1W54A 1GYNA 3AJXA 4HNVA 3TJXA 1Z48A 4DO5A 2B7NA 3C0JA 5MHBA 5HWJA 4D2JA 4I7UA 1SZGA 3LXAA 1M6JA 1LLWA 2ZYFA 4IMCA 3LCWA 1K7FA 2RKXA 1OYCA 4IMGA 3BARA 1BWKA 1KFKA 3FKRA 4CCEA 2AQWA 4HN4A 3S1VA 4LS1A 3OG3A 3MWAA 1VH7A 3FYPA 3FJLA 5D2XA 5D30A 4O13A 2Y6ZA 1OHLA 1FCBA 5CZSA 2CLIA 4S2BA 1TTQA 4GUFA 2VKZG 4ZQRA 3W74A 3O15A 2GVJA 4FNQA 4M7SA 4JNMA 4O52A 3P82A 5KMYA 4MFEA 4OV4A 1H51A 1VHNA 2QCMA 3KRSA 1OYBA 2R94A 3M47A 5AHIA 4BR1A 1VR6A 4DBDA 4FF7A 1YYAA 2R14A 3O16A 1WA3A 4P61A 4XBKA 3LCIA 3ABSA 2VFGA 4CCCA 4NNBA 2ZZ3A 3TXVA 5H91A 3HPSA 4PODA 2CWNA 5D38A 4X22A 2E6AA 4O11A 1AG1O 4A21A 4JY9A 1YDVA 1Q3NA 3UNDA 2ZZ1A 3M0ZA 2I9EA 2DU2A 4FNTA 4UCGA 2H3BA 1M7PA 4JTKA 5E93A 3B05A 1LRNA 3VE9A 5F2IA 5AHMA 3VFLA 3DFOA 1E51A 1M7OA 4LUIA 4JTEA 3GB6A 2CFFA 1EB3A 3GXTA 4TMCA 4WY0A 1TB3A 4K38A 1JQXA 2V2DA 3P81A 1THFD 3GDLA 3NPWA 4HIBA 1K7EA 3PB0A 2JK2A 3V1PA 3MHUA 1OX5A 2YPIA 5CSSA 3W3OA 1DQXA 4O18A 3HMJG 3PSWA 3G3MA 4IMEA 4NX0A 3W1AA 2VENA 2E5DA 3P7YA 2Y61A 2O7QA 1H7WA 1YXCA 5I3JA 3N3MA 4MOZA 2OX1A 3SI9A 1HO1A 2VC6A 5BW6A 2Z2UA 3W1MA 1UUMA 3TIMA 5FEXA 5FF7A 2KZHA 1PVNA 4E2BA 1TTJA 5SWUA 5EBUA 2X1TA 3NPXA 3SJ3A 1NF0A 1DOSA 4MY8A 2YR1A 3TV8A 1H7PA 1WDWA 5AC8A 2ZZ5A 3M16A 4Z1BA 3W07A 3G1FA 2GQAA 4UTUA 5BRBA 3HIJA 1JUBA 3EWZA 3EX1A 1SW0A 2WV8A 3O05A 4MZYA 3IIXA 3G1XA 2ISWA 1YPFA 3N73A 2QCFA 3CIXA 4HNTA 3UQNA 3EX6A 1W8SA 5LKYA 2FJKA 5FF4A 4NU7A 1XL9A 1MEHA 4MKNA 1KM1A 1GVQA 3I68A 5K3VA 1KFLA 3W1PA 2C13A 2A1YA 1RPXA 3TX9A 2B7QA 3LI0A 4FX6M 5FF0A 3UPWA 1I2QA 3QW3A 3B8DA 2QJHA 4UTHA 4XBSA 3BW2A 2QJIA 1QPOA 4RV8A 4GUHA 1QR7A 1H5YA 3TQKA 5F4WA 1QO2A 1JR1A 4ZL1A 3QPYA 2ZRVA 2ZA2A 5CZ0A 4IMDA 3LBCA 3LV6A 2FPYA 2QDGA 3G0XA 4CCDA 1SSGA 4JS3A 2C6QA 4Z1CA 1R46A 3BG3A 1T8XA 1YDNA 3CC1A 5DELA 3S1UA 3WJWA 4UC5A 3UWWA 3I65A 1G67A 1JQVA 4MYXA 1H62A 5C55A 2CLKA 1C29A 2TMDA 3W7QA 3P5ZA 5D2WA 1IXNA 3A21A 1KW1A 2C19A 3B0UX 3GXPA 1J4EA 1KM6A 3W22A 3BK0A 1LCOA 2FDSA 3STEA 4HNUA 4JTLA 4MZ8A 1UASA 3EKZA 1CW2A 4GFSA 2RDTA 1WOBA 4GC4A 4BF9A 3S5ZA 5DBUA 3GDRA 4O0KA 4AWSA 1W1ZA 2H90A 1ZNNA 1SW3A 3UD6A 5AHEA 1BTMA 3QPZA 1ZY9A 1T99A 3TXZA 3W7NA 4BFAA 2VEKA 4JTHA 2Y88A 3HPXA 4ZQNA 2PURA 3W84A 1OFEA 1C9DA 3W7GA 1LORA 1VQTA 4WXYA 3WJYA 1VLWA 2DZXA 3W71A 3NZ1A 1KFJA 1FDZA 4O0ZA 3CQ0A 3DI0A 4UXDA 1SO5A 1OFQA 5AN7A 3EWXA 1KM3A 5EPDA 3LCLA 2JKAA 1KV5A 4FNPA 3PS7A 1O5XA 2X2GA 1TPFA 1F74A 3W1NA 3B06A 3THAA 3WJSA 3UYCA 5G1TA 1W5OA 2DZPA 2YDAA 3G18A 2J9XA 4L4MA 5KSWA 4ONVA 3NA8A 3T40A 2EAWA 4CQ8A 3NQ8A 3L5MA 1XCFA 3NXFA 1IIHA 3TMQA 1NSJA 4LNYA 2VXNA 3W70A 4Y8FA 2GQ8A 4O28A 3TFCA 2C0AA 1EUNA 4NQ1A 1OK4A 1RZMA 2WKJA 3P8JA 2QCDA 3STGA 5K4XA 1P1XA 2QR6A 2B7PA 1PCKA 3NEVA 4H4IA 1Q6LA 3BW4A 2FFCA 5D2TA 5TBOA 1IXOA 5F1UA 2EPHA 3L0NA 2CZEA 4RK8A 3SY5A 1F73A 1DKWA 2NX3A 1DHPA 2WJZA 3WK2A 2YCEA 1R30A 4QITA 4NNAA 3E12A 5I3KA 4NZFA 5FF3A 1QOQA 2Z1BA 3HBLA 3BLEA 1RQHA 4K7YA 3YPIA 5F2GA 4FEZA 3FOKA 1KM0A 2BZNA 7TIMA 1JJKA 2WOQA 1XKYA 2X16A 4Q33A 3LM7A 3PUEA 5K2ZA 1KV8A 4RXFA 1I8JA 1P5BA 4KWWA 3HO8A 3RNDA 3W7MA 1SQ7A 4ALDA 4O1BA 3M44A 3W6YA 5I3GA 2ZDRA 2NUXA 4LT9A 1XUZA 1XBYA 1VLIA 4C1LA 4G1KA 3TC7A 4UMCA 1QOPA 2RFGA 1MO0A 1Z41A 1SZEA 4WJEA 2QCGA 3UWQA 4S2CA 3M5ZA 3W2UA 2C16A 1LDCA 3O07A 3R13A 2J9YA 3MHGA 1ZCOA 5LNVA 1YPIA 4IQLA 4FX8A 4QJ1A 3NQ2A 4JGDA 3PG9A 1GG0A 3JS3A 4AWTA 4NJIA 5CZJA 3IV3A 4UTTC 3NQEA 4GXMA 1X7FA 1LM1A 3M43A 3L2IA 5I3FA 3LHUA 1QFEA 5CPLA 4AVFA 4IGHA 2R91A 1O4UA 1RQBA 3MYPA 5D09A 3T44A 5KITA 3M5XA 3TAKA 2ZZ7A 4EVZA 4J9JA 4KFOA 1F6KA 3W2KA 3A5FA 2DJLA 3DGRA 2HS6A 2EF9A 1OK6A 3QM3A 3NQDA 4BI5A 2FB3A 1HUVA 2HSAA 4NZJA 3KVLA 1XDMA 5K9XA 3W7EA 5LHFA 4JTUA 2FIQA 1W3TA 1TPB1 3C2OA 4JEQA 2ZZ2A 4UIOA 3DFPA 3LHTA 4X9SA 4FNUA 4GUGA 3PR2A 3LLFA 3DI1A 2G96A 4TR9A 5LNRA 3R2GA 4CNOA 3H54A 3EEGA 3FYOA 4B5NA 2YW3A 3W7PA 4ZQPA 2P1FA 2H8XA 2V2HA 3BO9A 3O63A 4I7VA 3MUXA 3OVRA 1FXPA 2Z0IA 1OVDA 3C2FA 4WZHA 5D32A 2E6YA 1KA9F 2RHGA 4IUOA 1FCVA 2RDUA 3TR2A 5DCEA 3IGUA 3NM3A 5D33A 1TPC1 4O14A 1SFJA 2QCLA 3SGUA 4N6FA 1BKSA 2ZZ4A 3STCA 2FQIA 1FWRA 1OF8A 3HJZA 2FPTA 2PE4A 1XBZA 2DZTA 1L9WA 2YSWA 3NVTA 4E2DA 4IWWA 1GVSA 6TIMA 4DQWA 3O6CA 2J6XA 3LTPA 4Q4KA 3ATYA 4Z1DA 2E6DA 3ZS4A 1M5WA 5EYWA 2NWSA 3L66A 1WBHA 1A5BA 1W5PA 5GVJA 3TJLA 3I7RA 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 1FWS A;  1TTI A;  2WNZ A;  4FXS A;  3DBP A;  2CW6 A;  4QNE A;  2G5W A;  1OFD A;  4TX9 A;  1L6W A;  1Z44 A;  5C54 A;  4XUG A;  4GE8 A;  1GVF A;  1VZW A;  4K7V A;  1FCQ A;  3QST A;  3VCR A;  4Z1A A;  4UFM A;  2QCE A;  4JDB A;  1WXJ A;  3KRZ A;  4A29 A;  3N2X A;  3TW6 A;  1JCX A;  4LS2 A;  1WQ5 A;  3TNO A;  1GPW A;  4MFD A;  1SPQ A;  1KLY A;  1HG3 A;  2Y7F A;  3E49 A;  4IX0 A;  2Q3O A;  5K4Z A;  4M6P A;  4XKY B;  2VFI A;  3LRL A;  3NDO A;  1RVG A;  2GUU A;  4JYD A;  5E0K A;  1QDS A;  3IEB A;  1GTE A;  1UJP A;  3C4U A;  2V5B A;  1GWJ A;  3M5V A;  4PEK A;  3P61 A;  4N9D A;  1G4P A;  3GNN A;  4WY0 F;  5FES A;  1SO6 A;  1OF6 A;  1I45 A;  1VGA A;  2Y70 A;  3L0G A;  3CU2 A;  3NPU A;  5AHF A;  5LNS A;  4MJZ A;  5D05 A;  4K39 A;  4O17 A;  4DO6 A;  2QUT A;  1IF2 A;  1AW5 A;  3MP5 A;  1SU5 A;  5TQL A;  3T4C A;  4JR5 A;  2CZF A;  3BVJ A;  4DPP A;  2HMC A;  4K37 A;  1OAB A;  3SEC A;  2BLE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WUE A;  1AH3 A;  3W1L A;  1K02 A;  3LV5 A;  2FZN A;  1R2S A;  5FI8 A;  3S1W A;  1GNX A;  3DZ1 A;  1J93 A;  2FPV A;  4M56 A;  2G4F A;  2FZ9 A;  3W2L A;  4I8D A;  3AAM A;  2XGB A;  1EDQ A;  5ECV A;  4RV3 A;  3P3B A;  3USZ A;  3C56 A;  3SZ8 A;  1PO9 A;  3VII A;  4G8T A;  4PL2 A;  4J2M A;  3I6R A;  3IUI A;  2VFH A;  3CEP A;  3GVQ A;  3VUS A;  4U5I A;  3CMF A;  3SDO A;  1Q2S A;  4HSN A;  2Y0F A;  2D24 A;  3KLK A;  4Q8U A;  1BPL B;  3OQ8 A;  1JUK A;  5FJP A;  5LA2 A;  4AD5 A;  3LCF A;  3A4W A;  1TV4 A;  3E74 A;  2WPG A;  4GAB A;  5DFA A;  3NQA A;  1QNO A;  3BPW A;  2E09 A;  2WVV A;  4EWJ A;  5IBX A;  1P6W A;  3LTS A;  4GIA A;  1ONR A;  3XIN A;  2Z2A A;  1VKF A;  3R4I A;  1LT7 A;  4XO7 A;  1CWY A;  3FV9 A;  4NNC A;  1ZTV A;  4JIP A;  3THQ A;  1RK5 A;  3BCD A;  3WUG A;  3TWA A;  4PTV A;  5FJI A;  4KER A;  5EL1 A;  2PGE A;  1HVQ A;  3A3X A;  3W53 A;  2UY4 A;  3BGJ A;  2G3I A;  1PBG A;  2PSN A;  3VUP A;  4UTW A;  5DY3 A;  3QMS A;  3RPT A;  3H55 A;  1XFC A;  5CCZ A;  3AS0 A;  3E0V A;  1S5W A;  1QHO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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