4SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2-propenyl-neu5ac, an inactive substrate analogue
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Enzyme
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Macrobdella decora
total genus 186
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 4sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 4sliA02
4AGGA 3A0NA 1DIMA 4UW6A 1DQ1A 4WVWA 3D6EA 4MJVA 1F8CA 1L7HA 1FV2A 4ZXKA 4M3CA 1AF9A 3GVLA 3AX4A 4FQZA 5IUQA 1HDKA 2RHPA 1N3OA 1NCCN 1W20A 3H71A 4FOQA 5FREA 3AYDA 3RSJA 4MWJA 1SLTA 3INBA 1BKZA 2JDZA 3O12A 5DUUA 4P9WA 4YG0A 1DYKA 1SLCA 2R1DA 3UJQA 4PBOA 4Y1YA 5JOWA 2D3SA 2DU1A 4XYXA 5DUWA 2DUPA 1DQ0A 2WQZC 4BLIA 4YG6A 2BF6A 4Y1ZA 5F5QA 4B7RA 3MEPA 5FRAA 4WA4A 4Q8KA 1HQWA 2DTWA 4XTMA 4Y22A 1W8OA 3SISA 4P9XA 1DIWA 5DZEA 1GSLA 1AVBA 3ZVXA 3SANA 2VK5A 3WOGA 2A75A 2ZKNA 1NN2A 4PBPA 4YM0A 4UW4A 5M1ZA 3RMYA 4B7NA 1LOGA 2F12A 4UW3A 4FPFA 4Y26A 2BATA 3ZXFA 2BZDA 4GKXA 2VSMA 1FATA 1MS8A 2W68A 1LOFC 5F9TA 5DZFA 1FX5A 4YGCA 1Z4VA 2XCYA 1JN2P 5GJ6A 1MVEA 2WNEA 1FYUA 2CYFA 2D3RA 1XQNA 4BPZA 1VCJA 3IPVB 1BQPA 4FOWA 2GNTA 5GZDA 2W20A 2E7QA 3TI6A 1LGBA 4BQ1A 3AP7A 2DVDA 4Z8BA 3N35A 3VV1A 2HT5A 3ALWA 4QN4A 2QWCA 1C1LA 4YM2A 4XDQA 1NCBN 3NV1A 4LBNA 1KRIA 1YO8A 2DUOA 4FZHA 1IKQA 3AK0A 2ZBJA 2AUYA 4YW4A 3AJZA 4YG3A 5SV8A 3FBYA 4WEFA 1IVBA 5GZFA 3PVOA 1EPWA 1WW6A 2F24A 1LOFA 1CONA 2ZGSA 4X47A 1JW6A 3ASIA 1L7FA 2CMLA 1SCSA 3H0OA 2BQPA 1QMJA 3RS6A 2VXRA 2ZMLA 3TB0A 1FNYA 1VLNA 1C1FA 3B7EA 1WD3A 4JRAA 4FOYA 2EXKA 5L73A 4HZXA 3USUB 1I3HA 2VWDA 3QCWA 2QWAA 1Z0HA 2ZB6A 3CKZA 3SNMA 2W5OA 1YI7A 1INWA 4LBLA 2WLQA 4Q1RA 1ENRA 2VW1A 1V6NA 4Y20B 1AXZA 1DQ5A 5KXEA 1QOSA 4M4NA 1Q8QA 3BEQA 3ZSKA 3WV6A 1PZ8A 2GMEA 2DURA 2A71A 1LOCA 1S0BA 1XOEA 2QWFA 2VH9A 5DUVA 3SLIA 2A6ZA 5KXCA 4KS4A 2ZGLA 2AEQA 1N3PA 2OUJA 1W8NA 4FVKA 1DHKB 1V00A 5JOZA 3WDYA 2WSVA 4GZPA 4H55A 4FOVA 1JXNA 3MW4A 2UWAA 5EYXA 1NSDA 4XMAA 1GNZA 4LBMA 4GA9A 4MYEA 2AENA 1G9AA 1VALA 2D6PA 1ENSA 4GWNA 1RINA 2JE9A 1LHVA 5BYNA 2EALA 4XJZA 1W6PB 2C5DA 3D4KA 2JKBA 4QN6A 1NLSA 4AVTA 3WVJA 2D43A 4U2AA 1HKDA 3TI8A 3PVNA 4ZKTB 4YLZA 3W59A 2A7AA 1I1EA 2YZ4A 1AJOA 4TZDA 4I00A 1WW5A 1DYPA 1A8DA 1LHWA 4CPNA 2NMNA 3AYEA 3N3HA 3MPPG 2CL2A 1WBFA 3A72A 2Q5TA 1HLCA 3RRDA 1MS1A 4Q6KA 5CNAA 4C1WA 2D6LX 2DTYA 3OYWB 3WDTA 3VUOA 4Q1PA 1N1YA 4BOWA 4K1YA 3T1EA 4OZXA 2VW0A 1LOBA 1Q8OA 3Q9OA 2NN8A 1F9KA 4K1HA 3V64A 5B2CA 4C1XA 3RQ0A 4WA5A 4CZSA 1CR7A 4GKYA 1GBGA 3N36A 2EF6A 1B9SA 2H0BA 2ZHMA 3BODA 1W21A 1NNCA 1W0PA 5CBLA 4R9CA 1D2SA 3FLPA 5H9PA 3HN1A 3SH3A 4MWVA 1IKPA 1D0HA 3K38A 1AXYA 4XILA 4CTEA 3TI4A 3TAYA 1V6OA 1NCDN 1QKQA 1EUTA 3IPVA 2YV8A 1A4QA 1LTEA 4FPJA 1J1TA 5JLVA 3O0XA 1RITA 1V3CA 4AVSA 4QN5A 2V73A 4QN3A 2D3PA 1IS4A 4Y1UA 2F10A 3M2MA 1SBFA 1Z4WA 2OW4A 3WCRA 4GZOA 2B7YA 1DBNA 3T1MA 5T50A 2HT8A 4B7JA 4LBQB 3AFKA 2W52A 3AZZA 2VK6A 1MZ5A 1F8BA 3NWKA 1V6KA 3POYA 4CPLA 2DWRA 1KJLA 3M3EA 2YA5A 2A6VA 1B9VA 1INHA 1USXA 2SILA 5H9RA 1GICA 3NSSA 4KS5A 2YDPA 3L2YA 4CPMA 1SO7A 4XBNA 2YA6A 2DU0A 5NN9A 3UL2A 3IN9A 2XG3A 3ZXJA 3USUA 5T5LA 1USRA 3K37A 1YIFA 1V3BA 4HL0A 4YM3A 1GNHA 5HUKA 4WVVA 4IQPA 4JCKA 4Y20A 1F31A 1BXHA 3PVEA 4ATEA 4FPCA 2P37A 2GNBA 3HMYA 3CYEA 3WNXA 2C4AA 1AX2A 1AX1A 4DFSA 5GLUA 5GLVA 1NMAN 2EXJA 5EXOA 4XIKA 5T54A 1LGCA 3NV4A 1WLCA 4YZ4A 3OY8B 1WW4A 4M3MA 4DPNA 1A3KA 4YW2A 2GMPA 4XJQA 1VAVA 3ZYRA 4NOTA 1LGNA 1ZM1A 4M3CF 1BZWA 3FFZA 4H53A 4DQAA 5HCAA 1YYNA 3SITA 4K1KA 1S0JA 1GZCA 3LCPA 3FLTA 2XZJA 1EUSA 1N1SA 3CNAA 2WJSA 3T1LA 5E88A 1W6PA 3NN9A 2GMMA 4Q2FA 1IVEA 4XOGA 3V0BB 4PCRA 2G4IA 2W38A 7NN9A 1LOAA 2EXHA 3UJOA 3V0AB 5JVVA 4MWRA 1EUUA 4TYSA 3K3AA 3N7MA 4J9TA 4M01A 3B00A 3AJYA 5HX0A 1JBCA 1LHNA 2JJ6A 3OJBA 3GALA 1XOGA 1V0ZA 1N1TA 3CL0A 1V0FA 1NSCA 2W08A 1VAMA 1W6QB 1JYCA 4RA0A 2E53A 3TIAA 1LODA 2D6NA 4XIOA 3AXEA 1INYA 1UPSA 1G9FA 1C4RA 1F8DA 1Q8PA 3OYWA 1G9BA 2W5NA 3M3OA 2Z42A 4BBWA 4M4VA 5IT6A 3AZYA 1YXWA 5IK8A 5T5OA 2AYHA 4D8SA 2GNMA 1Y7BA 4XJWA 1S1AA 3WDVA 1GZWB 4CPZA 5IK5A 4JC1A 2R0FA 4YFZA 1NCAN 2NZ9A 1SBDA 3R05A 1CIWA 1W6NB 5JYYA 4FP3A 4GJTA 2AEPA 3FUQA 2NYYA 3AXDA 4K20A 3GNEA 4WA3A 4HZVA 3WCSA 2YY1A 1WLWA 1U0AA 4YM1A 4M00A 1VIWB 2F29A 4H52A 1DFQA 4YW5A 2C9AA 4MWUA 4NO4A 4KS2A 4LBQA 2GNDA 5HUMA 1SFYA 4R9AA 4MWLA 4M3CE 1NSBA 4QNPA 2ZA9A 2QWEA 1R1ZA 3AP6A 4X6KA 2ZGRA 2DYCA 2A70A 2A6YA 2AGSA 3ZXKA 4K3YA 1Z78A 2D6KA 5KXDA 2DVBA 1V3DA 2ZMKA 2RKCA 2A3XA 4MZAA 2NM1A 5T5PA 1WCSA 3LSEA 1H30A 1FAYA 4B7MA 5IK4A 3U4XA 1IVGA 4ITCA 1MS9A 2SLIA 4GDJA 1MACA 2AR6A 3SH5A 4LBKA 4XE9A 2HTVA 2WT1A 2A6WA 3WLUA 4MC7A 4SLIA 4R9BA 2R0HA 2P3JA 5E89A 2ZGTA 1G8WA 2PHUA 4X4AA 1QOTA 1IOAA 3OGGA 2XB6C 1A4GA 4FQ4A 2ZGQA 3IMNA 3ZSMA 3K39A 3H72A 4AGRA 2PHWA 1LEMA 2QWJA 4MX0A 2HTYA 4FPKA 4BLJA 4K1IA 2EIGA 4AGVA 4XJAA 1W1XA 3A71A 1JYIA 3WUCA 2ZGUA 3TIBA 1URXA 4FJ6A 1INFA 1N3QA 2VK7A 1JOJA 4GWMA 3AZVA 3W58A 1N1VA 4FPHA 2PHXA 3OY8A 2F25A 3BIWE 5T55A 1IVFA 3ZPYA 1Z50A 3O9JA 1PZ7A 4WZFA 1YRZA 4XBLA 2YDTA 3DUIA 4DS0A 1IS6A 1MZ6A 1O4ZA 2P34A 2WT0A 2DVGA 3BTAA 4FVVA 4GZQA 1S0IA 3R4SA 1INXA 2ZHKA 3N7LA 4XBQA 1QDCA 5GALA 2GN3A 2D7FA 1V2IA 2GALA 2R16A 3V0BA 3W09A 4MZEA 1W6OB 1JHNA 3I4IA 2QWGA 3V0AA 1V6IA 2SIMA 1LCLA 2PELA 2C4LA 4KS1A 3B3QE 5GZGA 4U36A 1E8VA 2PHRA 5H9SA 2F26A 1W6QA 2HTRA 1H9WA 1NMCA 4MWWA 2ENRA 1WCQA 3POWA 1IVCA 2OUHA 2NP0A 4HZYA 1GANA 4Y24A 4XXAA 3TICA 1LHOA 2UURA 2YMZA 4MWQA 4W65A 2QWKA 5GZCA 3ILFA 2HU4A 3NV2A 2CWSA 4R9DA 3D12A 4XMIA 1EURA 4DRRA 1GYKA 5KXBA 1GZWA 1NXD1 2QWBA 2CWMA 3WHUA 5LK5A 1A78A 1WW7A 3ATGA 1GZ9A 1LEDA 4Q26A 3VKNA 2OVUA 3B9CA 1UKGA 3T2TA 1OQ1A 1ONAA 4DRVA 5JOYA 4HZZA 2QWDA 1Z4YA 2PHFA 3AZWA 3DGTA 3WG2A 1W6NA 3JU9A 2F27A 4Q8LA 1LESA 4GDIA 3N7JA 2KM2A 3AYCA 2ARBA 4B7QA 5CB7A 4WEGA 1V6MA 2YA4A 4UF7A 4XJ9A 1W6MB 5CAZA 1OKQA 1KDMA 1WD4A 4GZXA 2HT7A 2CY6A 1JUIA 3O9KA 2ARXA 3JUUA 1LULA 1UL9A 2TEPA 4K1JA 1Q8SA 5E8AA 4KBBA 5GZEA 3WDXA 5DUXA 3RG0A 1OFSA 2ZAAA 5HCFA 3C2UA 3BOPA 4Q27A 2CNAA 4CRQA 2XZKA 3NV3A 3OPZA 3VKLA 1SLBA 1ULGA 4AWDA 4FPGA 4XJUA 1QF3A 1WUVA 1SACA 2F0ZA 5JMCA 1SBEA 1CVNA 3IM0A 1IS3A 4GALA 1G7YA 3SILA 4FPOB 2X9MA 1O4YA 2LTNA 1N47A 2I2SA 1UMZA 2QWIA 3AP9A 3ALXA 4AVVA 1S0FA 2P3IA 1S0GA 3WZ1A 2F13A 1QU0A 4JF7A 4MWYA 3KQRA 3WHTA 1MVQA 2ZZJA 1QNYA 4GZSA 5DXDA 3ZYPA 3B69A 4HZWA 3AP5A 5HCBA 5IK7A 1E8UA 1DQ2A 3AZXA 2HTUA 1HQLA 1NNBA 1L7GA 4UW5A 3H6JA 4K1ZA 4L8QA 4YGDA 3V65A 1W6OA 1SNTA 5T52A 3RMXA 2E51A 4XTPA 2NMOA 2VW2A 3I8TA 2ZABA 2JE7A 5JDBA 1WLDA 2D44A 2D6MA 4NCSA 3A4UA 1LU1A 2P3KA 3APBA 2HTWA 4YGEA 4M4UA 1G86A 3M1HA 3MW2A 3OBRA 2F28A 4NN9A 4GZWA 1G9DA 4Y1XA 2ZACA 2A3WA 2DV9A 4I30A 1GLHA 1Z4ZA 3HR9A 1RIRA 1PZ9A 4XZPA 2VUAA 2WSUA 1CN1A 1W0OA 2R49A 2QWHA 3AYAA 2YXSA 1GV9A 1A14N 2AH2A 3PMEA 5DG1A 4ASMB 3JU4A 4D69A 1BJQA 5T5JA 4ATFA 4LBOA 4ISRA 4YZ5A 4YZ2A 4MJUA 1Q8VA 3B01A 5CA6A 5GLZA 2B8HA 2VSKA 4CPYA 1SLAA 3WG1A 1QGLA 1KQRA 1DQ6A 2D6OX 1DGLA 4M3CB 4GB1A 2DUQA 2ES3A 2SBAA 3CL2A 3D11A 1H9PA 2JECA 2YROA 3QLQA 1ULDA 2EXIA 2LALA 2YA7A 4Y1VA 2ZGNA 1ULEA 2ZHLA 4BMBA 2GDFA 5JOXA 1G9CA 1LU2A 2VVZA 4FPLA 4MWXA 4HANA 4F83A 1DILA 1ZA4A 1FNZA 3IKWA 5HUGA 1S0CA 3FUOA 1W6MA 1AZDA 1ENQA 4NC5A 5EWSA 2VU9A 2ZHNA 1SLLA 1F8EA 3KM5A 1IS5A 2A5ZA 1Z4XA 2FMDA 1UZYA 4YGBA 1INVA 2A3YA 2ZMNA 5AVAA 2F11A 2P2KA 2CTVA 2UWBA 4Y22B 3WG4A 1KJRA 2DVAA 3O0WA 5DZGA 3SALA 3ILRA 2DVFA 3GVKA 1V3EA 1UAIA 5GLWA 4YFWA 3AP4A 1F5FA 3N7KA 4YW1A 3UK9A 1QOOA 4BM8A 1APNA 1LOEA 2ZGKA 3M3CA 4AYUA 1KITA 1SLIA 1VCUA 3WDWA 1KDKA 1MS4A 4XJ8A 2WT2A 1V0EA 5GLTA 1X50A 3INAA 4RL7A 5B2DA 4LBJA 4X49A 2W39A 1DZQA 4XXPA 2WKKA 3ZXLA 4GXLA 1NMBN 1UX6A 5H9QA 2EAKA 4KS3A 4YZ3A 5HUNA 5DG2A 3OBTA 4FPYA 1MR5A 1MS5A 3A0KA 4GZTA 5EYYA 4QN7A 1Q56A 4YZ1A 1B09A 3LSDA 2HYKA 3WDUA 1AX0A 4CPOA 2FHRA 2GN7A 4XJRA 4PF5A 4DGRA 3VKFC 2UWCA 3GVJA 1E8TA 1V6JA 3PJQA 1CQ9A 1WBLA 4GEZA 1B9TA 1MS0A 2A6XA 2ERFA 2ZGPA 3O0VA 1AXKA 1C57A 4P9YA 3POSA 3ILNA 3FLRA 4XHXA 2ZB5A 4P14A 1DLLA 3O5SA 4YW3A 2E7TA 1NNAA 2HU0A 2VY0A 3WG3A 3R4UA 1MS3A 2JD4A 3M3QA 5GM0A 4PQ9A 3MW3A 1ULCA 3ZSJA 1S0EA 3SH4A 3ENRA 4FPEA 2PHTA 3VKMA 1INGA 1LENA 2UU8A 1S0DA 1CPNA 3ZXEA 4BMEA 1QNWA 1QDOA 4ISQA 1FV3A 1V6LA 2ZGOA 4FP2A 2R1BA 1LECA 4LBQD 2V5YA 2ZGMA 3TI5A 4WV8A 4K21A 3D5OA 1BJIA 2HTQA 1SCRA 1LJ7A 2YA8A 3H73A 1ULFA 3WUDA 1TEIA 1CJPA 1UZZA 3K36A 1MWEA 1BYHA 1AJKA 1DQ4A 2AREA 3ZSLA 1GKBA 1CESA 1UN1A 2E6VA 2XZIA 6NN9A 3VKOA 1CPMA 1IVDA 1LHUA 3TI3A 4HIZA 2BERA 4XHBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H7LA 4AGGA 3A0NA 1DIMA 1YFUA 3RI9A 3TBDA 3ZR6A 3C7HA 3DL3A 3NJVA 4I09A 4NHLA 2UYBA 1DQ1A 4UW6A 3D6EA 4WVWA 1TNRA 3UKNA 3MLLA 4Q5OA 1F8CA 4MJVA 5F39A 5ABJC 1L7HA 4A7KA 4IXLA 4DXSA 4LKSA 5C9AB 2GVUA 3C7GA 2TBVA 1FV2A 4QPIC 4NIGA 4GD4A 1NCRC 2XJPA 3MIGA 4M3CA 4QDSA 4ZXKA 4BJ0A 2XQRA 1AF9A 3GVLA 4TLGA 1VBA3 2WBKA 3AX4A 3DXUA 1QEXA 1VB2A 4FQZA 3LDRA 4MO3M 5FFOC 5IUQA 1HDKA 3VB9A 4B1MA 5KBFA 4EWDA 3HQUA 2RHPA 1N3OA 3ZYJB 3NSTA 4XUNA 1SUUA 1NCCN 1CX1A 2WFF1 1W20A 3H71A 1Q5OA 2B39A 2K9ZA 3WX5A 5LCWL 4FOQA 5FREA 1H6XA 2ORXA 4CUCA 5M0TA 5BNQA 2WO7A 4QGLA 1RUE1 3AYDA 3RSJA 1VBD1 2OQ6A 2J1AA 5LA1A 1SLTA 3INBA 3LI4A 4MWJA 2DBNA 3NRUA 1F4AA 2Y6LA 1IJQA 5AFEA 4AFMA 1BKZA 2UYAA 2JDZA 3NO8A 4O9EA 4PDWA 4N7IA 3O12A 5DUUA 2D98A 2UY9A 5J7MA 4P9WA 4CSWA 2XVLA 4YG0A 3VBUA 1DYKA 2QZ3A 1SLCA 2B46X 2ZEXA 5FYIA 4HW6A 3DEMA 2R1DA 1HRV3 1PX4A 3UJQA 4PBOA 4Y1YA 5JOWA 3VBSB 2D3SA 1CZSA 5E1RA 1HRI2 1UNBA 2DU1A 2I45A 4XYXA 1W0NA 3SKVA 4COUA 5IVJA 5DUWA 5FP4A 5EO7A 2C26A 2DUPA 1DQ0A 4EN0A 2WQZC 5D8AC 5IFTA 1H2NA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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