4TQNA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with ul04
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Discovery of CREBBP Bromodomain Inhibitors by High-Throughput Docking and Hit Optimization Guided by Molecular Dynamics.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2014-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tqnA00
3LJWA 5DFCA 2LSPB 4Z1SA 5CUEA 5F62A 4CLBA 5I7YA 5F60A 5DYXA 4A9NA 4PY6A 5CRZA 3P1FA 3IU6A 4TZ8A 4CUTA 4BW2A 4QC1A 4TS8A 4BW3A 5DYCA 5IG6A 5FB0A 4LC2A 3AADA 5CRMA 3DWYA 4UYDA 5LKXA 5FH7A 5L97A 1ZS5A 5EM3A 4UYFA 5EI4A 3O37A 5H1VA 4CFKA 4WHUA 5FE7A 5C8GA 4CUUA 4Y03A 5HFQA 4Z6IA 2F6NA 5FE9A 4XYAA 4TU4A 3U5MA 5DLZA 5FFVA 4BW4A 5H1TA 4QUTA 3O35A 4IR3A 5ACYA 4HBXA 5HEMA 3LQJA 2L5EA 4QEWA 2FSAA 3LQHA 3K2JA 4MR3A 4QSQA 4UYHA 4O7AA 4NR7A 5F61A 3HMEA 4YK0A 4MR4A 4UIZA 5ENFA 5D0CA 5EA1A 3MB4A 3G0JA 2YW5A 4LRGA 5ETBA 5I1QA 2N9GA 4YYJA 4YH4A 4YYHA 5F25A 4HXKA 5CP5A 3U5NA 4N3WA 3GG3A 5ENJA 4QSSA 2R0VA 3UVXA 4E96A 5BT5A 4LZSA 4CURA 5IGMA 3LXJA 3U5JA 1X0JA 3Q2EA 5C85A 5E73A 5D7XA 4HXPA 2G4AA 4ZW1A 5HRWA 5IIDA 4TYLA 2E7OA 3JVLA 4WHWA 5ENCA 4QC3A 4YAXA 5IGLA 2D9EA 2R0SA 5FFWA 5EWCA 4A9IA 4MEOA 5F63A 5DLXA 3P5OA 5A83A 4AKNA 5TCMA 2DVSA 4NUCA 4HBVA 4X2IA 5E9YA 5F5ZA 4UYFB 4IR4A 2I7KA 2DVVA 5E9LA 4O76A 5LKTA 5E74A 2YYNA 5CTLA 4TT2A 3UVYA 4QB3A 4A9JA 3MXFA 4LYIA 4PKLA 5HQ7A 5BT3A 3UVDA 5I88A 3QZTA 3UV4A 3HMHA 5LVRA 4UIXA 5EPRA 5AD2A 3TLPA 4LDFA 1E6IA 3SVHA 4WIVA 5E0RA 4YYDA 5EU1A 5IGNA 2H60A 4QSRA 4YY6A 4O70A 4QSUA 5G4RA 5I7XA 5D3LA 5HQ6A 4YYMA 5KTWA 5II1A 5CUBA 4TZ2A 4KV4A 5FE2A 3P1EA 3HMFA 4NUEA 2DKWA 5FE3A 2NXBA 3S92A 5EWWA 5A85A 5HQ5A 3MB3A 5DKDA 5E3DA 5EP7A 2WP2A 4TT4A 2DVQA 4O77A 4A9HA 5DX4A 5FG5A 2YQDA 4YBSA 5L99A 5CUCA 5HRXA 5EV9A 4YH3A 5FG6A 3P1DA 5E3GA 4GPJA 4A9FA 5F2PA 3U5LA 4NR4A 2KTBB 4PCEA 5DBMA 5DFBA 5AMEA 3D7CA 4TT6A 3JVJA 4QSTA 4C66A 5D26A 4Z93A 5A5OA 3G0LA 5G4SA 3Q2FA 4HXNA 4QSPA 5CUAA 5DW1A 5J0DA 4HBWA 4DONA 5DYUA 4OGIA 5CUDA 2YDWA 5CGPA 4HXSA 5DKCA 3NXBA 5CQ3A 5C89A 5LJ1A 5CFWA 5KHMA 3ZYUA 3RCWA 5DFDA 5KTUA 5ENIA 3I3JA 5HFRA 4NYVA 3SVGA 4FLPA 4J0RA 5EVAA 5A5RA 5LJ0A 3P1CA 5LUUA 4QSVA 4HBYA 4N4IA 2YEKA 4KV1A 4IR5A 2OSSA 4UITA 5C87A 2E3KA 4XY9A 5HM0A 5C7NA 3UVWA 4BW1A 5H1UA 5LKUA 5CQTA 5ENHA 4YADA 5E9KA 4NQMA 5I40A 4PS5A 4MEQA 5A5PA 5HLSA 2RFJA 5FBXA 3LQIA 4O7EA 4UYGA 4Z6HA 5C4QA 4YATA 5D25A 5HJCA 5EPSA 3FKMX 5KTXA 5EWVA 5JI8A 1WUMA 5FE0A 3O36A 5CQ7A 4CUPA 4UIUA 5L8UA 5D3JA 2L85A 4O7CA 3MQMA 4YYKA 4QEUA 5FFYA 4QNSA 5I83A 5EK9A 3IU5A 5ENGA 5A5SA 4IOOA 4YC9A 2DWWA 4YY4A 3MUKA 4QZSA 4CFLA 5IGKA 1WUGA 4RVRA 4TQNA 2D82A 5I86A 4Z1QA 4UIYA 4A9LA 5CY9A 4ALHA 4BJXA 4CL9A 3JVKA 1JSPB 4QSWA 4NRCA 1EQFA 3JVMA 5FH8A 5FE6A 5CQ5A 5FDZA 4NR8A 2RS9B 4O7BA 5I89A 5A5NA 4O74A 4CUSA 5TB6A 5I29A 5D3HA 2DVRA 3O34A 4XY8A 5DKHA 4OUFA 5DYAA 5A82A 5D3PA 5EWDA 4LYSA 5CUGA 5E7DA 2I8NA 5KU3A 4O72A 5FE5A 4LYWA 4OGJA 4N4HA 2YELA 2OO1A 4O75A 1N72A 4J3IA 5CPEA 5LJ2A 4YBTA 4ALGA 5CQ4A 5ENEA 5K29A 5I80A 2RNXA 4QUUA 3U5OA 5AMFA 4LZRA 4A9EA 2RO1A 4QYLA 4YYNA 4MR5A 4MENA 4Q0OA 4ZC9A 4ZQLA 5ETDA 4A9OA 5FE4A 4PTBA 4IORA 4NRAA 3SVFA 4NR9A 5F1LA 5H85A 4LR6A 4QY4A 4O78A 4PCIA 3AQAA 5LKZA 3UV5A 5FB1A 4TTEA 5D24A 4LZ2A 5CQ8A 3UW9A 5IBNA 5DW2A 3U5KA 4YBMA 5D3RA 5EQ1A 1JM4B 3QZVA 5CZGA 2RNYA 4UIVA 2OUOA 5A5QA 5HELA 5F36A 4Q0NA 5EGUA 5E9VA 4QR4A 4UYEA 4NYWA 3U5PA 4NXJA 5E9MA 4KCXA 2DATA 4NR6A 4YABA 3S91A 5EICA 4NS5A 4XUBA 4UIWA 5F1HA 5A7CA 4YYIA 5HCLA 5BT4A 5L8TA 4C67A 2MJVB 5EWHA 4IR6A 5CQAA 5KO4A 2YEMA 4HXLA 3UV2A 5L98A 5JWMA 2RI7A 5D3TA 4BHWA 1F68A 4NR5A 4NYXA 5D3SA 5LVQA 5COIA 4CUQA 2E7NA 5FH6A 5L96A 4IOQA 5EPBA 4NUDA 2F6JA 5FG4A 3DAIA 2GRCA 2R0YA 4NQNA 4NRBA 4QSXA 4A9MA 4QR3A 4F3IA 4O7FA 5CS8A 5CU8A 5DY7A 5A81A 5E9IA 4QBMA 3O33A 4N4GA 4TU6A 4YYGA 5D3NA 2WP1A 5CQ6A 4MEPA 3QZSA 4MR6A 3ONIA 4HXMA 4N4FA 4HXRA 4HXOA 5FE8A 5II2A 5F3AA 4A9KA 4J0SA 5EISA 5HENA 2RNWA 2L84A 4QR5A 3MULA 5AD3A 4QEVA 2R10A 4J1PA 5FE1A 5ENBA 5HRVA 4O71A 4QYDA 4XUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LJWA 5DFCA 2LSPB 4Z1SA 5CUEA 5F62A 4CLBA 5I7YA 5F60A 5DYXA 4A9NA 4PY6A 5CRZA 3P1FA 3IU6A 4TZ8A 4CUTA 4BW2A 4QC1A 4TS8A 4BW3A 5DYCA 5IG6A 5FB0A 4LC2A 3AADA 5CRMA 3DWYA 4UYDA 5LKXA 5FH7A 5L97A 1ZS5A 5EM3A 1ZKRA 4UYFA 5EI4A 3O37A 5H1VA 4CFKA 4WHUA 5FE7A 5C8GA 4CUUA 4Y03A 5HFQA 4Z6IA 2F6NA 5FE9A 4XYAA 4TU4A 3U5MA 5DLZA 5FFVA 4BW4A 5H1TA 4QUTA 3O35A 4IR3A 5ACYA 4HBXA 5HEMA 3LQJA 2L5EA 4QEWA 2FSAA 3LQHA 3K2JA 4MR3A 4QSQA 4UYHA 4O7AA 4NR7A 5F61A 3HMEA 4YK0A 4MR4A 4UIZA 5ENFA 5D0CA 5EA1A 3MB4A 3G0JA 2YW5A 4LRGA 5ETBA 5I1QA 2N9GA 4YYJA 4YH4A 4YYHA 5F25A 4HXKA 5CP5A 3U5NA 4N3WA 3GG3A 5ENJA 4QSSA 2R0VA 3UVXA 2EJNA 4E96A 5BT5A 4LZSA 4CURA 5IGMA 3LXJA 3U5JA 1X0JA 3Q2EA 5C85A 5E73A 5D7XA 4HXPA 2G4AA 4ZW1A 5HRWA 5IIDA 4TYLA 2E7OA 3JVLA 4WHWA 5ENCA 4QC3A 4YAXA 5IGLA 2D9EA 2R0SA 5FFWA 5EWCA 4A9IA 4MEOA 5F63A 5DLXA 3P5OA 5A83A 4AKNA 5TCMA 2DVSA 4NUCA 4HBVA 4AKGA 4X2IA 5E9YA 5F5ZA 4UYFB 4IR4A 2I7KA 2DVVA 5E9LA 4O76A 5LKTA 5E74A 2YYNA 5CTLA 4TT2A 3UVYA 4QB3A 4A9JA 3MXFA 4LYIA 4PKLA 5HQ7A 5BT3A 3UVDA 5I88A 3QZTA 3UV4A 3HMHA 5LVRA 4UIXA 5EPRA 5AD2A 3TLPA 4LDFA 1E6IA 3SVHA 4WIVA 5E0RA 4YYDA 1PUOA 5EU1A 5IGNA 2H60A 4QSRA 4YY6A 4O70A 4QSUA 5G4RA 5I7XA 5D3LA 5HQ6A 4YYMA 5KTWA 5II1A 5CUBA 4TZ2A 4KV4A 5FE2A 3P1EA 3HMFA 4NUEA 2DKWA 5FE3A 2NXBA 3S92A 5EWWA 5A85A 5HQ5A 3MB3A 5DKDA 5E3DA 5EP7A 2WP2A 4TT4A 2DVQA 4O77A 4A9HA 5DX4A 5FG5A 2YQDA 4YBSA 5L99A 5CUCA 5HRXA 5EV9A 4YH3A 5FG6A 3P1DA 5E3GA 4GPJA 4A9FA 5F2PA 3U5LA 4NR4A 2KTBB 4PCEA 5DBMA 5DFBA 5AMEA 3D7CA 4TT6A 3JVJA 4QSTA 4C66A 5D26A 4Z93A 5A5OA 3G0LA 5G4SA 3Q2FA 4HXNA 4QSPA 5CUAA 5DW1A 5J0DA 4HBWA 4DONA 5DYUA 4OGIA 5CUDA 2YDWA 5CGPA 4HXSA 5DKCA 3NXBA 5CQ3A 5C89A 5LJ1A 5CFWA 5KHMA 3ZYUA 3RCWA 5DFDA 5KTUA 5ENIA 3I3JA 5HFRA 4NYVA 3SVGA 4FLPA 4J0RA 5EVAA 5A5RA 5LJ0A 3P1CA 5LUUA 4QSVA 4HBYA 4N4IA 2YEKA 4KV1A 4IR5A 2OSSA 4UITA 5C87A 2E3KA 4XY9A 5HM0A 5C7NA 3UVWA 4BW1A 5H1UA 5LKUA 5CQTA 5ENHA 4YADA 5E9KA 4NQMA 5I40A 4PS5A 4MEQA 5A5PA 5HLSA 2RFJA 5FBXA 3LQIA 4O7EA 4UYGA 4Z6HA 5C4QA 4YATA 5D25A 5HJCA 5EPSA 3FKMX 5KTXA 5EWVA 5JI8A 1WUMA 5FE0A 3O36A 5CQ7A 4CUPA 4UIUA 5L8UA 5D3JA 2L85A 4O7CA 3MQMA 3VKGA 4YYKA 4QEUA 5FFYA 4QNSA 3ERRA 5I83A 5EK9A 3IU5A 5ENGA 5A5SA 4IOOA 4YC9A 2DWWA 4YY4A 3MUKA 4QZSA 4CFLA 5IGKA 1WUGA 4RVRA 4TQNA 2D82A 5I86A 4Z1QA 4UIYA 4A9LA 5CY9A 4ALHA 4BJXA 4CL9A 3JVKA 1JSPB 4QSWA 4NRCA 1EQFA 3JVMA 5FH8A 5FE6A 5CQ5A 5FDZA 4NR8A 2RS9B 4O7BA 5I89A 5A5NA 4O74A 4CUSA 5TB6A 5I29A 5D3HA 2DVRA 3O34A 4XY8A 5DKHA 4OUFA 5DYAA 5A82A 5D3PA 5EWDA 4LYSA 5CUGA 5E7DA 2I8NA 5KU3A 4O72A 5FE5A 4LYWA 4OGJA 4N4HA 2YELA 2OO1A 3D1DA 4O75A 4AKIA 1N72A 4J3IA 5CPEA 5LJ2A 4YBTA 4ALGA 5CQ4A 5ENEA 5K29A 5I80A 2RNXA 4QUUA 3U5OA 5AMFA 4LZRA 4A9EA 2RO1A 4QYLA 4YYNA 4MR5A 4MENA 4Q0OA 4ZC9A 4ZQLA 4AI6A 5ETDA 4A9OA 5FE4A 4PTBA 4IORA 4NRAA 3SVFA 4NR9A 5F1LA 5H85A 4LR6A 4QY4A 4O78A 4PCIA 3AQAA 5LKZA 3UV5A 5FB1A 4TTEA 5D24A 4LZ2A 5CQ8A 3UW9A 5IBNA 5DW2A 3U5KA 4YBMA 5D3RA 5EQ1A 1JM4B 3QZVA 5CZGA 2RNYA 3D1BA 4UIVA 2OUOA 5A5QA 5HELA 5F36A 4Q0NA 5EGUA 5E9VA 4QR4A 4UYEA 4NYWA 3U5PA 4NXJA 3VKHA 5E9MA 4KCXA 2DATA 4NR6A 4YABA 3S91A 5EICA 4NS5A 4XUBA 4UIWA 5F1HA 5A7CA 4YYIA 5HCLA 5BT4A 5L8TA 4C67A 2MJVB 5EWHA 4IR6A 5CQAA 5KO4A 2YEMA 4HXLA 3UV2A 4AKHA 5L98A 5JWMA 2RI7A 5D3TA 4BHWA 1F68A 4NR5A 4NYXA 5D3SA 5LVQA 5COIA 4CUQA 2E7NA 5FH6A 5L96A 4IOQA 5EPBA 4NUDA 2F6JA 5FG4A 3DAIA 2GRCA 2R0YA 4NQNA 4NRBA 4QSXA 4A9MA 4QR3A 4F3IA 4O7FA 5CS8A 5CU8A 5DY7A 5A81A 5E9IA 4QBMA 3O33A 4N4GA 4TU6A 4YYGA 5D3NA 2WP1A 5CQ6A 4MEPA 3QZSA 4MR6A 3ONIA 4HXMA 4N4FA 4HXRA 4HXOA 5FE8A 5II2A 5F3AA 4A9KA 4J0SA 5EISA 5HENA 2RNWA 2L84A 4QR5A 3MULA 5AD3A 4QEVA 2R10A 4J1PA 5FE1A 5ENBA 5HRVA 4O71A 4QYDA 4XUAA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3LJW A;  5DFC A;  2LSP B;  4Z1S A;  5CUE A;  5F62 A;  4CLB A;  5I7Y A;  5F60 A;  5DYX A;  4A9N A;  4PY6 A;  5CRZ A;  3P1F A;  3IU6 A;  4TZ8 A;  4CUT A;  4BW2 A;  4QC1 A;  4TS8 A;  4BW3 A;  5DYC A;  5IG6 A;  5FB0 A;  4LC2 A;  3AAD A;  5CRM A;  3DWY A;  4UYD A;  5LKX A;  5FH7 A;  5L97 A;  1ZS5 A;  5EM3 A;  4UYF A;  5EI4 A;  3O37 A;  5H1V A;  4CFK A;  4WHU A;  5FE7 A;  5C8G A;  4CUU A;  4Y03 A;  5HFQ A;  4Z6I A;  2F6N A;  5FE9 A;  4XYA A;  4TU4 A;  3U5M A;  5DLZ A;  5FFV A;  4BW4 A;  5H1T A;  4QUT A;  3O35 A;  4IR3 A;  5ACY A;  4HBX A;  5HEM A;  3LQJ A;  2L5E A;  4QEW A;  2FSA A;  3LQH A;  3K2J A;  4MR3 A;  4QSQ A;  4UYH A;  4O7A A;  4NR7 A;  5F61 A;  3HME A;  4YK0 A;  4MR4 A;  4UIZ A;  5ENF A;  5D0C A;  5EA1 A;  3MB4 A;  3G0J A;  2YW5 A;  4LRG A;  5ETB A;  5I1Q A;  2N9G A;  4YYJ A;  4YH4 A;  4YYH A;  5F25 A;  4HXK A;  5CP5 A;  3U5N A;  4N3W A;  3GG3 A;  5ENJ A;  4QSS A;  2R0V A;  3UVX A;  4E96 A;  5BT5 A;  4LZS A;  4CUR A;  5IGM A;  3LXJ A;  3U5J A;  1X0J A;  3Q2E A;  5C85 A;  5E73 A;  5D7X A; 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