4TR0A

Crystal structure of gssg-bound cgrx2
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
92
structure length
91
Chain Sequence
b'MKNITIYTKNYCPYCKKAVSLLSSKGVDFKEVDVTHDSKAFEDVMAKTGWDTVPQVFVDEEFLGGDDIHALDRQGILDKKLGLKLEHHHHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The GSH- and GSSG-bound structures of glutaredoxin from Clostridium oremlandii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 3
source organism Alkaliphilus oremlandii
molecule tags Oxidoreductase
total genus 27
structure length 91
sequence length 92
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr0A00
2VCVA 4MP4A 3IHQA 4WR4A 2YJHA 5JCWA 1TK8B 3ZIVA 1V2AA 2LRTA 2VM1A 4RUVA 3G7JA 4DVCA 3Q6OA 1NHYA 1YZXA 3F4TA 4HQZA 1F2EA 2MBSA 5LCZA 4FIWA 4TOPA 1SL2B 2LNTA 5B7CA 3A2WA 5H5QA 3O6TA 1DUGA 1R26A 3HA9A 3W8JA 2OE1A 2M80A 3ZRDA 3IXRA 1XIYA 4JE1A 2DIZA 3TJFA 2V1MA 1TXXA 3HJPA 3Q74A 5HR0A 2HI7A 5GSSA 4I2UA 2CVDA 2E0QA 2PN8A 3GKXA 3ERFA 2GSSA 4PNFA 5D73A 3GSTA 4FO5A 4HZ4A 3G9BA 3FKFA 2A2SA 1HNAA 3TOUA 1T3BA 4CW9A 1U3IA 2C0FA 4I6XA 2C0GA 4KW6A 4XS1A 3NZNA 2GQKA 1SENA 4WKWA 3UVHA 2PMTA 2BJXA 3OR5A 2QGVA 2KUCA 2FLSA 3ED3A 3EE2A 2H6ZA 5ECPB 4JR6A 4YAVA 1K3LA 1EP8A 1ILOA 1Z3EA 4DEJA 1WRYA 5L71A 2FD3A 3IR4A 2HNLA 4IW9A 1OC9A 4K7OA 5IMZA 1BJXA 1SKRB 2ZNMA 2IMIA 1ERUA 2E2GA 1GP1A 3ZZXA 1X5DA 2M72A 3VFIA 3KM6A 4K2DA 2O7KA 1JLWA 17GSA 3D4TA 2PVQA 1Y6EA 4GSNA 3PGTA 4XS4A 4L5OA 2HSYA 1ST9A 1ZCPA 1QK8A 2IMEA 2PVOC 2P5RA 1HQOA 2NPBA 4LA1A 3UL3A 2G0FA 1JZDA 6GSTA 4F0CA 2H76A 2LQQA 4TKYA 3LFLA 2E7PA 2H74A 2L6CA 3C7MA 3I69A 2KP2A 5IIZA 2FHEA 4JU5A 2CVKA 4MH2A 1XWGA 2B7JA 3M9KA 1S3DA 1VF4A 2GVPA 4ECBA 3WYWA 3GTUB 3FW2A 4IGJA 5E59A 2LS5A 1AXDA 22GSA 4ID0A 2GDRA 3H93A 3E9JB 4TR0A 5CNWA 1QFNA 5ECMB 2DMLA 2V6KA 3CSIA 2JADA 3EYTA 4KSOA 2GQLA 2PERA 3DMLA 4ECJA 5KN0A 7GSSA 1G7OA 4WR5A 5HR3A 2B3SA 2HZEA 2KOKA 4PUFC 4ZBAA 2WULA 2H70A 4EVMA 3CSHA 2VLVA 2C80A 3JCML 4BA7A 1XBSA 3FK8A 2VLTA 4L0WA 2GSRA 5DCGA 2GSQA 3A2XA 3ERWA 1ZL9A 3LQ7A 2YPMA 5F0GA 3IPZA 2R2JA 3F4SA 1R5PA 4ILFA 2YWIA 2V6OA 3MDKA 1F6MC 2VL2A 2HFDA 1K0CA 4GLTA 1GLPA 4RI6A 1VGLA 2R4VA 5HR2A 2LEGA 2VCWA 3GNJA 4OD7A 2CQ9A 4KX4A 2OE3A 3IV4A 3ZREA 1TRSA 1OKDA 1F9MA 2L4CA 1VF1A 1FO5A 2C3TA 1EEMA 5CAXA 4EDZA 1NW2A 2HT9A 2H1AA 3IC4A 2LUSA 1X0RA 2F51A 3KD0A 1GNEA 2C3NA 5G5FA 1MDJA 2L6DA 3HZ4A 1T8EB 1VRSD 3GH6A 4KGIA 3EMPA 2E2MA 4HI7A 1AAZA 3QFBC 1TKDB 2IPAA 5IMVA 3EMXA 4WF4A 2DJ1A 4LMVA 2I9HA 4PQ1A 3MWHA 3EU3A 3F8UA 1ERTA 2J23A 1NM3A 2GSTA 3ZITA 1EP7A 1TU8A 2BMXA 4MJBA 1XWBA 5FWGA 4X1UA 5ECIB 3M8NA 2QKEA 3E0UA 2MYGA 4MA9A 2K9FA 4IP6A 2PU9C 3KIJA 1FAAA 4GSSA 5EPFA 2FCHA 4LL4B 1V98A 5J5NA 3VK9A 2AYTA 2DJKA 4BVXA 2RM5A 3VI5A 2OJLA 4G19A 4CDOA 5HFKA 4LMWA 1AQVA 2RLIA 1B9XC 1EV9A 3F9UA 3VURA 1MDKA 4ZL7A 5ECOB 2H66A 2I81A 1KBNA 2MMNA 1TI1A 1ERVA 4KE3A 2XC2A 1BEDA 4YQVA 4DSSB 4IS0A 2CZ2A 1YKAA 3TKSA 2OADA 4JR4A 3TOTA 4NMUA 4XTSA 1AW9A 2YV7A 1T7PB 5D9WA 3GURA 2AJQB 1FW1A 5JCGA 2CX3A 4FYCA 3A5WA 5G30A 4ZB9A 3J7Yb 3RHCA 3NOFA 2QC7A 1SYRA 14GSA 1GSYA 4LL1B 5ABRA 2HLSA 1FB6A 4POLA 3BCKA 1BAYA 1O81A 4PNGA 3CMIA 1FHEA 3L0HA 3LJRA 1JFUA 4MABA 3M9JA 2PGTA 5C04A 2FWGA 2VM2A 4POMA 2V32A 4J56E 3MAKA 2TRCP 2B5XA 3GX8A 3V1WA 5B8AA 3QAVA 1EZKA 1GSDA 5DALB 2K18A 2L57A 2OKAA 1BQ7A 2YP6A 2O8VB 3FYGA 2WZ9A 1USBA 4MF6A 3P90A 5DQSA 2CT6A 1ZGNA 2AUVA 5HFIA 4OFMA 1GSSA 1MD3A 2IN3A 2YV9A 5CRWA 5IMAA 3KP8A 2VLUA 3DRNA 1CQHA 4MPFA 5IO2A 1EV4A 1FVJA 3S9FA 5H5RA 5JWQB 1I9DA 1O73A 3NIVA 4GQFA 1VF3A 2V2GA 2VCZA 4HU9A 4PQHA 1JZRA 2C0EA 3ME7A 1X5EA 4EXJA 1N2AA 3QR6A 1LU4A 1Y25A 4N0VA 2K6VA 5IO0A 4K0GA 2VAFA 2I1UA 4WBJA 3VWWA 5ECLB 4MCUA 3TGZA 1Z6MA 3BOAA 3H79A 4PQIA 2LRCA 2VL2C 4NXIA 5ELGA 2Z9SA 3LSZA 3KXOA 1ZZYA 3HYPA 1Q4JA 4F2IA 1WPIA 5EVOA 3RDWA 4N10A 2HE3A 2OACA 4XHMA 1XXUA 2IFQA 2JL4A 3HJMA 3DVXA 3MSZA 1SJ6A 3TJBA 5B8BA 1T4YA 5COHA 2MZCA 1Z7RA 4ULXA 3P2AA 4XRDA 2C1YA 4IHUA 4HJ2A 3LXTA 4V2MA 1TK5B 1WE0A 1ZYEA 1XVWA 4GSTA 1TI3A 3LORA 1V57A 1OC8A 3FZ9A 1M2BA 1KEBA 4EE0A 3A3TA 3GKMA 3VWUA 5KN1A 4DSRA 4ZILA 3L9SA 2X64A 3UOMA 4OWYA 2LTKA 3BD2A 1OKTA 2GQMA 1B48A 4IELA 1S3AA 1XWCA 2MBTA 3LGCA 3QDNA 3N9JA 5G31A 1V9WA 3TRXA 4N0ZA 3G7YA 4KDXA 2LNSA 3CYNA 4QL7A 2WS2A 4GCIA 3HY2A 5ECRB 3C1RA 5A4VA 3HVXA 4AJ6A 1TW9A 3UARA 5CRGA 2ZCTA 1THXA 1GSFA 2B5YA 3Q18A 4F9ZA 3TKQA 4HDEA 3RHBA 1GNWA 3GIXA 1PQNA 2PUKC 3F3QA 1SJZA 3KMNA 5KN3A 3BBYA 2IFQB 1DBYA 4L0UA 5ENUA 4MF7A 4XIHA 2ALBA 1UA5A 3QD9A 1AIUA 3UBLA 3IBHA 3QCPA 5GAND 4KCAA 3GRXA 1GL8A 1F3BA 4MPGA 2WRTA 5J9BA 2TIRA 4ZL8A 3TKSC 1YDKA 3KMOA 1WP0A 1AUCA 3IOSA 2YZUA 4RI7A 2F3MA 1BYEA 3I9V2 3TB2A 4OCFA 3UIWA 3IE3A 5J41A 1G6WA 4KUNA 2H30A 19GSA 5KN2A 2VUPA 3R2QA 2DJ2A 5AIVA 3HZ8A 1TDIA 1EOGA 4LLRA 2YNXA 4ZBBA 2DMMA 1G6YA 3DGQA 3KEBA 3RPPA 1FOVA 1FB0A 3GV1A 5G1LA 4NAXA 2P31A 1A2JA 3VI7A 3WT2A 6GSYA 4FYUA 1TOFA 4D73A 4AF2A 1UC7A 3IK9A 4JRRA 3TJGA 3LWAA 3SBCA 4JBBA 4JEDA 5IMDA 4WETA 4FYBA 4HZ2A 4NV2A 1JZWA 1YEXA 6GSXA 3FR9A 1TJDA 4ECIA 1JHBA 2H8LA 3GL5A 1LBKA 4IQAA 5CRDA 1XFLA 3CTGA 4F03A 3FZ4A 4KA0A 4PXOA 2H6YA 2XPEA 3BCIA 3ZL5A 1OC9B 2N5FA 1XZOA 4TRXA 2B6MA 4KNDA 4V2LA 4Q5FA 1YEPA 2VL3A 2A4VA 3QFAC 6GSUA 1B8XA 4MZCA 3KTBA 4PGTA 3L78A 2H6XA 3CRUA 4K1FA 1TTZA 1EGOA 1GLQA 13GSA 1PX7A 5HQPA 3GUSA 2YWMA 3DXBA 4DSQA 2TRXA 2RM6A 4XS4B 5ID2A 1PMTA 5A5KA 5CREA 5DAKA 3I43A 1AC1A 1JZOA 4WXTA 5D9VA 2R6KA 3KZQA 3PH9A 5E4WA 5F05A 5ELAA 4L8EA 4TXOA 1OVNA 1N8JA 3QMXA 2EIQA 3ISOA 3D0ZA 4O7HA 4AJ7A 2FWFA 1XW6A 4Q5NA 2IMDA 4KDYA 5IM9A 3WT1A 1THOA 4NHZA 4OMVA 3A2VA 1H75A 1QXHA 3W8SA 4KAEA 4GQCA 2C3QA 2HSHA 1WIKA 1OC3A 1XVQA 2HRFA 5FT3A 4F82A 3IAM2 5CYYA 3QAGA 4EL1A 1X9SB 3KCMA 2R3XA 2LSTA 5ECHB 2HZEB 2H75A 4V1Ag 3H8QA 1SKSB 3RAZA 1EEJA 1J08A 5DCHA 1HYUA 3UVTA 2N5AA 4EDYA 2RUFA 4EKZA 2H0GA 4MZBA 4KH7A 2WDUA 2IJYA 4IQ1A 4PURA 4HUAA 1NSWA 2EIRA 2C0DA 2FNOA 5D9TA 4P3YB 1PGTA 1YKCA 3HJOA 3HCZA 3K8NA 4ML6A 4TR4A 4HJMA 3UAPA 3F3RA 4MF5A 1ML6A 1A0RP 3IAS2 1SJIA 1OYJA 3DKSA 3KH7A 1GTUA 1FG4A 3F63A 1SD9A 1OE8A 3GHAA 1PSQA 4HOJA 4N30A 2JZSA 4TXOB 1GUHA 5ECSA 1K3OA 5JWRB 3TCOA 1GRXA 4OO5A 1SK2A 3TKPA 1QQ2A 4OCEA 2QSIA 3GA4A 4K6XA 1EGRA 1M2DA 5D96A 4YAPA 1K3YA 1ABAA 1C72A 2GGTA 4ACSA 2LQOA 1HNBA 1A0FA 2ON7A 4K8MA 1O6JA 1XOAA 3LXZA 1GUKA 3VPTA 2AV4A 3HHVA 1RQMA 2GT5A 2NBSA 3TRPA 3GKNA 5D93A 4I97A 1YF0A 2VL9A 5J9CA 3IRAA 3VWXA 4OFTA 1T1VA 4GXZA 2LJKA 1X9MB 1X5CA 2JZRA 2AB6A 4JZQA 4TW5A 1GSUA 4MK3A 2OE0A 4KB3A 5ECNB 5HFGA 1H4OA 1TRUA 3ZVJD 5A4UA 2HXKA 3HD5A 16GSA 3M1GA 1B9YC 1YF1A 3KH9A 5B6NA 4X43A 1BX9A 2HZFA 3ZFLA 3TRQA 2VO4A 3U5RE 5C00A 1YQ1A 3D22A 1ON4A 4BWQA 2JSZA 5F06A 4K7IA 3WD6A 1XPVA 3WGEA 1XWKA 1K0OA 4IN0A 3I6AA 5G5EA 1IYHA 3LYKA 3GYKA 2YWOA 1O8WA 3EINA 4X0XA 5IMFA 5AN1A 5IPGA 1PN9A 3TUEA 4WF5A 2AHEA 4GTUA 1Z7PA 1DSBA 2FA8A 2XPDA 3UMAA 1FVKA 1R4WA 3HVVA 4MH3A 4ZB6A 3CRTA 4GF0A 2DLXA 2F8AA 3J7Yk 3E3EA 2LV3A 3GN3A 1ZOFA 2B5EA 2LKUA 1XOBA 2VCTA 2R5GA 2H0IA 2JSYA 5DQYA 1W4VA 4MJEA 1V58A 1WWJA 2JZTA 3TJJA 4MJAA 5DJLA 1YY7A 4ZB8A 1K0AA 1B4QA 2ON5A 2YWNA 5KEJA 4BWSA 2P5QA 3CTFA 1SYXA 2KHPA 3L9VA 2H01A 3D21A 4ZBDA 2FWEA 2CV4A 4N11A 5FHIA 1G0TA 4NWYA 4Q5RA 1K0DA 2F9SA 2RUEA 1EOHA 3ERGA 3APQA 1AQXA 3IA1A 2XBQA 3N5OA 5LNKe 1GULA 12GSA 2DSAA 3F6DA 1U6TA 4ZIJA 3ZIJA 2YJ7A 4QL9A 3O3TA 2M46A 3GL3A 2YZHA 4I8BA 3FZAA 1Z9HA 2KP1A 2O87A 3H4KA 5AISA 4YQMA 3IDVA 2VD1A 4G10A 5G1KA 4IP1A 1G7EA 4J57E 1QMVA 1ACVA 3Q19A 2B7KA 4L5LA 2FUG2 5LD0A 5J3RA 4PUAA 1QGVA 4G9HA 1WJKA 3HKRA 1T4ZA 1J9BA 3QPMA 1SL0B 2DBCA 5IOXA 1M2AA 3GFKA 1DE1A 2DC5A 2B1LA 4PX1A 2F8FA 2WFCA 5IPHA 4EO3A 3F4RA 2ZUPA 3C73A 2GZYA 9GSSA 5GAPD 1BG5A 1Z5YE 2L59A 3EC3A 2C4JA 2DJ3A 2HYXA 1S3CA 1K0BA 3H1NA 3QOUA 5G2ZA 3ZMKA 1A2LA 5CO3A 5D8IA 5JCUA 18GSA 3CSJA 1T00A 1JLVA 2CAQA 3F6FA 4ISDA 1KTEA 1OAZA 2I4AA 2GTUA 3DYRA 3GTUA 3HDCA 3EU4A 2CAIA 1TK0B 2X8CA 5CP1A 1TU7A 2ES7A 2IWTA 2DJ0A 2KLXA 1XCCA 3C1SA 3HXSA 1A2MA 4MJCA 2H1BA 1MEKA 1XW9A 2MMZA 5INYA 1WOUA 5J4UA 4GRFA 3ZFBA 2IMFA 1MTCA 3EWLA 3ZTLA 4ML1A 1ERWA 3FR6A 2REMA 1F37A 1I5GA 1HNCA 4CHSA 4I2TA 1ZMAA 2FWHA 3KTLA 4IVFA 2G2QA 4O32A 4KDUA 1SK1A 2DIYA 3FHKA 4G2EA 3GH9A 2H1GA 1GH2A 1E6BA 3ZLPA 8GSSA 4IJ3A 3ZVJA 20GSA 4OO4A 1M99A 4J2FA 1M7TA 4EF0A 2H1DA 3ZYWA 4ECCA 1MD4A 4RQRA 1K0MA 4BPYA 1A24A 5DDLA 1HD2A 5JWOB 2VCXA 3ZMLA 3RBTA 3CBUA 4K0NA 5AGYA 4QQ7A 1M9BA 2R37A 2O85A 1PD21 1GSEA 4KSMA 2AAWA 1OE7A 1NHOA 2VCQA 1O8XA 2GT6A 5DJMA 1SD8A 1URMA 3C71A 4K7NA 3EVIA 2NTOA 1WMJA 5EY6A 1EWXA 2IIYA 2IL3A 1SKWB 4TR3A 2GS3A 3P8WA 1PX6A 4H86A 1GTIA 3O76A 3D4MA 5B6MA 4RQXA 2IMKA 3PINA 1F3AA 1A8YA 1AQWA 3FZ5A 2H19A 1MDIA 3KJYA 1UN2A 1QUWA 3W6GA 2WJUA 3GX0A 1SK0A 4POKA 10GSA 1V40A 4IJIA 1PA3A 3LYPA 1ZYQB 4XCSA 2PWJA 3D6IA 3VPQA 3KP9A 1SL1B 2CVBA 5DBQA 4HS1A 3M0FA 4TVEA 3P7XA 1PL1A 3MNGA 2VIMA 2FY6A 3UJ1A 4D73B 1GTAA 2LRNA 1YJ6A 2V41A 5ECKB 3IK7A 2GZPA 3CXGA 1PRXA 4NHWA 3F0IA 3GSSA 4MZWA 1GWCA 4BL7A 2H0HA 4MMMA 4OFNA 1TP9A 4XRAA 4KCEA 2WGRA 4TN8A 2J9HA 4Z7XA 2XHFA 3VWVA 5A4WA 4V1Ap 2OBKA 4E8HA 4DSSA 4V2NA 1Z6NA 3APSA 2FA4A 2WCIA 3PR8A 1R7HA 3RPNA 2VD0A 4MDCA 5EL8A 4MLYA 3M3MA 2DJJA 3TKSE 5F07A 4IBPA 2JU5A 2O89A 1VF2A 5ID2B 2MMAA 3HVSA 2WB9A 4TR1A 5DAKB 3WGXA 2YN1A 4ZL9A 4ZXGA 5H5SA 4O5RA 1TRVA 1U3AA 2CX4A 2I3YA 3LG6A 4WEYA 2GZZA 5D9XA 1B4PA 1TRWA 1CQGA 5DALA 2D2ZA 2C8UA 1A23A 5IQYA 1U88A 3L4NA 4YH2A 4POBA 3FRCA 2H72A 3FR3A 4O92A 2NDOA 1GUMA 5DVBA 2GLRA 4Q5QA 1IYIA 2BTOT 2K8SA 2PPTA 2K8VA 4YQUA 3UEMA 5CRHA 4F0BA 3BJ5A 2LJRA 2NVLA 3DVWA 3EURA 4E8EA 2A2RA 2L5LA 5AIXA 3VLNA 3GKKA 4I5QA 3AY8A 4NPBA 3TJKA 2YCDA 2CZ3A 5ECQB 4XS6A 4IKHA 3GMFA 3TDGA 2X99A 2EC4A 2N5BA 5F8BA 5GZZB 3ME8A 6GSVA 3QAWA 4HEA2 2EIOA 4GWRA 1O85A 1K0NA 3UBKA 4TR1B 1A8LA 1J0FA 4AJ8A 4EUYA 1E2YA 2LJAA 6GSSA 11GSA 4BVYA 3SWLA 1RK4A 4AGSA 4HU7A 2RIIA 2L5OA 1DE2A 2YOIA 2B1KA 2H71A 3L9UA 3KGKA 1M0UA 3DEXA 4TXVA 2MMOA 1R5AA 1LJRA 2H73A 1X9WB 5IMCA 3D5JA 2OA7A 3APOA 1GTBA 1M9AA 1W89A 4NV5A 2L4QA 1XWAA 1O7UA 2XBIA 3U6VA 5IOWA 5HR1A 2X8GA 3G7IA 3C8EA 1KNGA 4FH8A 4WBRD 1PKZA 3WGDA 3LEFA 2PBJA 1PKWA 1GSQA 5GSTA 2VOCA 2X8HA 2OBIA 1XW5A 4K9ZA 2FGXA 3DWVA 1UVZA 1PL2A 2P0GA 4EC0A 1SU9A 3FEUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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