4TR1B

Crystal structure of gsh-bound cgrx2/c15s
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
92
structure length
91
Chain Sequence
MKNITIYTKNYCPYSKKAVSLLSSKGVDFKEVDVTHDSKAFEDVMAKTGWDTVPQVFVDEEFLGGDDIHALDRQGILDKKLGLKLEHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Alkaliphilus oremlandii
publication title The GSH- and GSSG-bound structures of glutaredoxin from Clostridium oremlandii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 3
total genus 27
structure length 91
sequence length 92
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr1B00
4TR1B 2RM6A 5DJLA 2C3NA 1ZYEA 1SU9A 4K0NA 17GSA 4PQIA 3Q18A 3TUEA 4EXJA 1K0NA 2OKAA 2X99A 1XCCA 1YZXA 3D4TA 3GHAA 4WBRD 5HR2A 3DRNA 4V1Ag 1ZCPA 1AQWA 1PX6A 1GL8A 2H76A 2GT6A 4KUNA 3VPQA 2LTKA 4WKWA 4TOPA 5ECMB 1XFLA 1IYHA 1KTEA 1TOFA 2PPTA 4JEDA 1B8XA 5FHIA 4HEA2 1Y6EA 2MMOA 2L6CA 4F2IA 5CRHA 1MDKA 2JADA 3IK9A 1GTUA 4GWRA 3I6AA 1G6WA 4O92A 3GTUA 2CZ3A 2GGTA 4MH3A 3FZ5A 3EE2A 3CSJA 3M9JA 2V32A 4TXOA 3FK8A 1TI1A 1GTIA 4ECIA 1ILOA 2MBSA 4Q5NA 1J08A 1Q4JA 1Z5YE 3DGQA 2DLXA 3KM6A 5HQPA 1DE2A 3TJFA 1VF4A 4DSSB 1AQVA 3QFBC 1JZRA 3IDVA 1LBKA 1NM3A 2L5OA 4WXTA 3M9KA 5JCWA 4G9HA 4WETA 4TR1A 3CRUA 2RLIA 3ZYWA 2KP2A 5IO0A 3AY8A 2JZSA 1XWKA 1PMTA 4MP4A 1TTZA 3LGCA 1BJXA 4MPFA 4O32A 5ECLB 4DVCA 3F6FA 1UA5A 3NZNA 5F06A 4FYCA 5CYYA 1ERWA 1V57A 4WF4A 1WJKA 2QSIA 4BWSA 2PVOC 1TI3A 4XHMA 1UC7A 4IJ3A 3ZL5A 1OC9B 3CTFA 1TKDB 2EIQA 3RPPA 2OACA 4DSQA 1GTBA 4MLYA 2HSYA 1HD2A 2C8UA 5ECOB 1U3AA 2P0GA 3F6DA 4EUYA 1OE7A 2MMNA 1SL1B 4XTSA 1QGVA 3ED3A 4K8MA 1A24A 3L78A 2FGXA 4FYBA 1XWAA 16GSA 1KEBA 2IN3A 1AC1A 4Q5FA 3GSTA 1WWJA 1XIYA 3GH9A 2E2MA 3FKFA 4DSSA 3QDNA 2EC4A 1PL1A 2YP6A 2LQOA 1AUCA 2HSHA 3IE3A 1N2AA 1JZWA 3R2QA 3APSA 3EC3A 3W6GA 1YDKA 4N10A 1A2MA 1URMA 2JACA 4EE0A 1PD21 1G7OA 1SK1A 1V9WA 1SD8A 1EOGA 2R6KA 2X8GA 1FVJA 3F4RA 2PMTA 1BX9A 2PERA 5F05A 1XWCA 2H1GA 2B5XA 2LUSA 1ZOFA 1XW9A 1O6JA 1T4ZA 4GLTA 4PURA 1FVKA 3F0IA 2OJLA 2F8FA 3I9V2 5G1KA 3PR8A 1J0FA 2B1KA 1K3OA 4DSRA 2VCZA 3HY2A 4YQVA 1GRXA 4IN0A 4LL4B 4BWQA 4PNFA 5GAPD 4XCSA 2XPDA 4X0XA 1WE0A 1X9MB 4IJIA 2FHEA 2YCDA 2PBJA 4ID0A 3HXSA 4F03A 1X5CA 4YAVA 4WR4A 4PXOA 2EIRA 2GT5A 3UL3A 3CRTA 4KSOA 3TJGA 4I2UA 1SKWB 3KZQA 5J4UA 3HHVA 1Y25A 3C1RA 4NAXA 4BVYA 3WD6A 14GSA 1VRSD 2GSRA 3EU4A 2VCTA 1OC3A 5CRGA 3FY7A 1W89A 2FWGA 2IMEA 4GSSA 2FWHA 2WJUA 1YF1A 3CMIA 3KTBA 4MK3A 2GDRA 2ZUPA 1A2JA 2C0EA 2K6VA 1VGLA 3WT2A 2FWFA 3GL3A 6GSWA 1Q98A 4ZL9A 1B4PA 2VLUA 2B7JA 1K3LA 1Z6MA 3F9UA 3L4NA 3ZIVA 3TCOA 1EGRA 1V40A 3KIJA 1I9DA 2AUVA 1SYXA 3IA1A 2YV9A 1CQHA 3D5JA 3US3A 2O85A 4HJ2A 2VAFA 4IQAA 2IFQB 2P31A 3UVTA 5J41A 2XBIA 1FW1A 3TB2A 1EOHA 2CVKA 1FB6A 4TVEA 1THOA 3GSSA 4L0WA 3KP9A 3LXTA 1Z3EA 2C3TA 3KMNA 2REMA 4MMMA 20GSA 2C0DA 3D0ZA 2DC5A 3KXOA 3KH7A 2HRNA 5C04A 2HXKA 2H73A 2NPBA 4BVXA 1M2DA 2HT9A 3VI5A 3CXGA 3C7MA 1YEPA 4X1UA 2M46A 2QC7A 2H0HA 5D8IA 3DD3A 2B7KA 3FR9A 3E9JB 13GSA 5B7CA 4HJMA 2VLTA 2H8LA 2VO4A 1TK8B 1SL2B 1BQ7A 5ECRB 3LYPA 5ID2B 3LSZA 2WCIA 2OE1A 5DVBA 3TGZA 3UAPA 1UN2A 4J2FA 5H5QA 4KNDA 1EEJA 3HD5A 2JZTA 2BTOT 3BCKA 1M2AA 4HU9A 1A2LA 3OR5A 2RIIA 4KSMA 4G19A 4GXZA 3BD2A 1NHOA 5COHA 3GKXA 6GSSA 4JZQA 3TKRA 1U88A 3LORA 4TW5A 4KW6A 1YKCA 1EV9A 5B6NA 5D9VA 1BAYA 2B1LA 3G7JA 3M0FA 4FO5A 1B48A 5JCUA 2FY6A 5ABRA 2MZCA 5DQYA 4AJ7A 3J7Yk 4YH2A 4ZBAA 3TJBA 2I1UA 3DEXA 1CQGA 5FT3A 2H0IA 5DAKB 4MF5A 4JRRA 3RBTA 3GFKA 4EL1A 3QOUA 3J7Yb 1JZOA 2FCHA 4YAPA 3GRXA 2LS5A 3EMPA 1AAZA 2VD1A 1SKSB 4L0UA 1AIUA 4LA1A 4MJAA 4KCAA 4EVMA 2VLVA 2VM2A 3TJKA 2NTOA 2CX4A 3UVHA 2YZUA 1VF3A 3FZAA 1PRXA 3NIVA 3E3EA 1T00A 5IMVA 1DE1A 4MA9A 4I6XA 4TXOB 1LU4A 4KCEA 3EWLA 4AJ6A 2O87A 3QAGA 5IOWA 1YF0A 3FR6A 4TR3A 2IMIA 1R4WA 2VM1A 4GSNA 5AIXA 2C4JA 1TDIA 1ZGNA 1F9MA 5IPHA 2IMFA 1FOVA 2DJKA 2YANA 2GTUA 2H6YA 4MZBA 2EIOA 5E59A 1R5AA 4IP6A 1G7EA 1K0AA 4I97A 3UARA 2H66A 3I43A 3U6VA 4EKZA 2MMAA 4HOJA 1O85A 2JU5A 1TK5B 2E2GA 4MJEA 1YQ1A 3TRXA 4E8HA 1A8LA 2LJRA 5DALB 2LEGA 4MPGA 2FD3A 1SJIA 1AW9A 9GSSA 5DAKA 1USBA 3VWWA 1JLWA 2HFDA 2Z9SA 4KH7A 1TRSA 1QUWA 3TKSE 2K18A 4ILFA 5ECNB 2K8VA 4Z7XA 1U6TA 5CRDA 4F0BA 3E0UA 1M0UA 19GSA 2XHFA 2HRFA 5H5RA 1VF2A 2A2RA 4HQZA 4HZ2A 1JZDA 1OE8A 4XS1A 4CDOA 1GSFA 3GNJA 1C72A 3CTGA 2VCQA 5CO3A 2O7KA 3WT1A 4JU5A 2ZNMA 1XOBA 2FUG2 3VWVA 3TRPA 2LRTA 4EDYA 4L5OA 1GH2A 3F4SA 3H93A 4GRFA 2L6DA 3F8UA 4ZB6A 2C1YA 2VCXA 1JFUA 2QGVA 11GSA 2B5EA 3BBYA 4K7NA 4NXIA 1PN9A 2IMKA 1ZMAA 3P90A 2L5LA 5CNWA 2L4CA 4HZ4A 3G7YA 5DALA 8GSSA 3TJJA 5F07A 2CA8A 4MZWA 1GLPA 4Q5RA 1GTAA 5IO2A 1AQXA 1NW2A 4LLRA 4OMVA 5ELAA 2XPEA 2I81A 1XVQA 3RHBA 2WB9A 5DQSA 2I9HA 3GV1A 2K8SA 4KE3A 1W4VA 5E4WA 2DIYA 2X64A 4NHWA 3IK7A 2CV4A 3C71A 4K1FA 5ECPB 3H79A 1OYJA 4G10A 5D93A 2H74A 4TKYA 4K7OA 1RW1A 2YWMA 4E8EA 3MDKA 3KCMA 4F0CA 3HZ4A 4KDYA 1SKRB 5B8AA 4PUAA 3ZTLA 4NV5A 4ECBA 2H1DA 5ECKB 3ZITA 1WMJA 3QAVA 2H19A 2N5BA 1M9BA 3MAKA 2HZEA 3CYNA 5AN1A 4QL7A 4ZB9A 4NPBA 4YQMA 4HQSA 5J9BA 4BA7A 1MTCA 4L8EA 1X9WB 2NDOA 1J9BA 3TKSA 3HDCA 5D96A 1XVWA 1YEXA 3G9BA 4I2TA 1OC8A 3VWXA 1R5PA 2KHPA 4OWYA 5KN3A 1T7PB 4OCFA 3ZFBA 2KOKA 4LMWA 3IBHA 4K0GA 2ES7A 1ZYQB 1H75A 3SBCA 1SL0B 4CW9A 5GSSA 3O6TA 3LG6A 2FNOA 3A2XA 1SK0A 5C00A 1SD9A 5G1LA 1F37A 5KN0A 4GQFA 3KGKA 2GSQA 3LYKA 5CP1A 2I4AA 3ME7A 2LSTA 2F8AA 4MF7A 2H6ZA 3ZMLA 1M99A 2OBKA 3EMXA 1QQ2A 3KD0A 1GNEA 1A0FA 3QPMA 2AAWA 3APQA 2WGRA 3TKSC 3UBKA 3GKKA 2PWJA 2C3QA 3IC4A 2DMMA 2YPMA 4V1Ap 2YWOA 1GUMA 2FWEA 2IWTA 4HDEA 5D9XA 3IXRA 2OADA 5LCZA 3TRQA 4MABA 2HZFA 2N5FA 1A0RP 6GSXA 1K0CA 4F9ZA 3CBUA 3FHKA 3HA9A 2H30A 5H5SA 3LFLA 2H75A 3D4MA 3HJPA 5DCGA 2L4QA 1SK2A 4IP1A 2L57A 2PGTA 3QR6A 4KDXA 4XRDA 1FG4A 1B9XC 1A8YA 5J9CA 3A5WA 3A2VA 4IGJA 4F82A 1Z6NA 5D9TA 4GSTA 3KH9A 1T8EB 1IYIA 1XBSA 3LQ7A 4K2DA 1GLQA 2PN8A 2KUCA 1X5DA 2GVPA 5G31A 3UMAA 2V2GA 3N9JA 5IMDA 1S3AA 2HLSA 3DYRA 1OKDA 1EEMA 2VD0A 1E2YA 3KJYA 3VWUA 6GSUA 2LRNA 2JSZA 2YWIA 4OCEA 3UOMA 2B3SA 4ML6A 5JWOB 1X9SB 2HE3A 3IPZA 3MNGA 1HNAA 5G5FA 5HR1A 1GNWA 3JCML 1PQNA 4EF0A 2QKEA 2LKUA 2CT6A 4NWYA 4POBA 1MEKA 4N11A 5GAND 1GP1A 2P5RA 2LJAA 2KP1A 3D6IA 3LJRA 3DXBA 3CSHA 5IIZA 2WULA 4HU7A 3CSIA 3ERFA 1T3BA 3RDWA 1GSDA 4XS4A 4ECCA 2WDUA 1DBYA 3ZLPA 2I3YA 2BMXA 2M72A 2LRCA 3F3QA 2DSAA 2JSYA 5EPFA 2PU9C 2YOIA 1QXHA 1TU7A 4BL7A 4O7HA 4K7IA 2HYXA 2R5GA 1MDJA 4XRAA 2RUFA 3RAZA 3WGDA 4ML1A 5IM9A 2V6OA 3UEMA 1XZOA 2WZ9A 3HJMA 4IKHA 5ECIB 1ST9A 2VL2A 3KEBA 4FIWA 4KGIA 3KTLA 3S9FA 5J5NA 2GQLA 5GZZB 1TK0B 1G6YA 5F8BA 1WRYA 5AISA 1WP0A 2O8VB 2AYTA 1I5GA 2TIRA 1TRWA 1U87A 3NOFA 1EGOA 1OAZA 5ELGA 3ZVJA 4AJ8A 2ON7A 2XC2A 3C1SA 3ERWA 3GKMA 1SYRA 2LV3A 4N0VA 2DBCA 4JR6A 4Q5QA 1R26A 4OD7A 2CQ9A 4I5QA 1M2BA 1GSYA 4NHZA 2J23A 1TXXA 5IMZA 1GUHA 5HR3A 2CZ2A 5G30A 2DIZA 3VURA 2TRCP 2OBIA 4LMVA 2MBTA 1EP7A 2H6XA 5DCHA 2H1BA 5IMCA 2DJ0A 3P2AA 1SENA 1WPIA 1M9AA 2BJXA 3GA4A 3ZREA 3FZ4A 3UBLA 5HFIA 2VL2C 3RPNA 1GUKA 5CRWA 5IMFA 2R37A 5A4WA 2CAIA 2CVDA 3M1GA 4TR0A 5AIVA 3GMFA 1MD4A 3DWVA 4POKA 1N8JA 5FWGA 4JBBA 3IRAA 3HVSA 1FAAA 2LQQA 5JWRB 1YJ6A 1S3DA 3QAWA 1GSEA 4IHUA 4RI6A 1FHEA 1O73A 1PKZA 1JHBA 3MWHA 2WS2A 2DMLA 3VI7A 1YKAA 3TKQA 3QMXA 3EINA 3DVWA 4J56E 3IR4A 3HVXA 2N5AA 1GSUA 2AJQB 4KX4A 2GZPA 2D2ZA 4PQHA 3W8JA 3LXZA 2NVLA 1ML6A 1R7HA 3D22A 4MF6A 3GN3A 2C80A 2GQMA 4WEYA 1ON4A 3H8QA 5G2ZA 4LL1B 3D21A 1TRUA 5KN2A 1EV4A 4QQ7A 1EWXA 2HZEB 3F63A 2DJJA 1EZKA 4KA0A 4MZCA 4IVFA 4H86A 5A5KA 3HVVA 4EC0A 1HNBA 1ACVA 1E6BA 4L5LA 3O3TA 1MDIA 2GZYA 1HQOA 2VUPA 3F4TA 3O76A 3PINA 5LD0A 3TDGA 3GIXA 3P7XA 2PUKC 2K9FA 1A23A 1U3IA 1HYUA 4GQCA 1O8XA 1H4OA 1OKTA 1G0TA 2X8CA 3FRCA 2YNXA 3H1NA 5LNKe 2IMDA 4X43A 1K0BA 3ERGA 1XWBA 2FLSA 1QK8A 1FB0A 4K9ZA 4PGTA 5EY6A 2V41A 5HR0A 4RI7A 4D73B 2C0GA 5DJMA 4AF2A 12GSA 2X8HA 4ZILA 5ENUA 3SWLA 4ZL8A 4CHSA 3GL5A 5A4UA 1GULA 3VPTA 4GCIA 2R4VA 1LJRA 2V6KA 4FH8A 2WRTA 2GQKA 2WFCA 4POMA 2ZCTA 1Z9HA 1BYEA 1OVNA 5AGYA 2B5YA 3BOAA 3ISOA 4WF5A 1M7TA 3M8NA 3QD9A 1THXA 2RM5A 2YV7A 1UVZA 4EO3A 1TW9A 2B6MA 4JE1A 5HFGA 4NV2A 5IPGA 1PX7A 2H0GA 1K0OA 2YZHA 2ON5A 5ECQB 1EP8A 5INYA 2GS3A 1O8WA 3UIWA 4ZB8A 1O7UA 2MYGA 2VIMA 1ERUA 4WR5A 1PA3A 4RQRA 2VCWA 4YQUA 1OC9A 1Z7PA 3GURA 2V1MA 4G2EA 5A4VA 5CREA 1T4YA 3GKNA 3KMOA 1XW6A 1WIKA 3IAM2 5DBQA 2R3XA 3I69A 4IQ1A 3PH9A 1ERVA 1MD3A 1GSQA 4D73A 4RUVA 5D73A 3QCPA 2LNSA 10GSA 4NMUA 3N5OA 5EL8A 1ZL9A 3IV4A 2RUEA 4HI7A 3WGEA 2GLRA 1DSBA 2J9HA 4V2MA 3EVIA 6GSVA 1GWCA 4J57E 5ECSA 2F3MA 2NBSA 4HUAA 2AHEA 2GSSA 4HS1A 2G0FA 3MSZA 2IPAA 2LJKA 3F3RA 4PX1A 1V58A 5ECHB 4ACSA 22GSA 3IOSA 2H72A 5D9WA 5L71A 4OFTA 7GSSA 4RQXA 3FW2A 3RHCA 3ZIJA 2HI7A 2P5QA 1QFNA 2G2QA 6GSYA 5IOXA 1B9YC 2GSTA 3UJ1A 2MMZA 3HKRA 4TRXA 3IHQA 1B4QA 3FEUA 4ZIJA 3LEFA 1TP9A 2E7PA 3WYWA 3C8EA 4GTUA 2DJ2A 1F6MC 4IS0A 4OFMA 1ABAA 2VOCA 3EU3A 4OO4A 1K3YA 1NHYA 2CVBA 4XIHA 4XS4B 3GX8A 2H70A 2TRXA 1ERTA 2DJ1A 3TOUA 1BEDA 2OE3A 4PUFC 3HZ8A 3VK9A 1T1VA 1FO5A 3V1WA 4JR4A 2AV4A 1XOAA 3IAS2 1NSWA 3G7IA 4QL9A 2E0QA 4K6XA 5KEJA 2M80A 1Z7RA 3DKSA 1PKWA 1SJ6A 4MJCA 3W8SA 3TOTA 4PQ1A 3U5RE 3DVXA 4XS6A 3ZMKA 3FR3A 1PSQA 1X5EA 1XW5A 3KP8A 2YWNA 1VF1A 3ZZXA 1X0RA 2FA8A 1AXDA 3Q74A 3APOA 3A3TA 3BJ5A 5DDLA 4ISDA 4MH2A 4WBJA 3PGTA 1K0DA 2IL3A 4DEJA 4ZBDA 1QMVA 4N0ZA 1F2EA 1RK4A 1O81A 4P3YB 4V2LA 3P8WA 18GSA 3EURA 4GF0A 1XPVA 3ZRDA 5B6MA 3Q6OA 3BCIA 3HJOA 4I8BA 3L0HA 4ZBBA 2O89A 5GSTA 2IFQA 3ZFLA 3GUSA 3FYGA 4MJBA 4KB3A 1TJDA 1SJZA 2DJ3A 5CAXA 1WOUA 3DMLA 4V2NA 4OO5A 2A4VA 2LNTA 2F9SA 1PL2A 3QFAC 2GZZA 3K8NA 5JCGA 1RQMA 2HNLA 4N30A 4MCUA 1XXUA 1V2AA 4TN8A 4AGSA 1F3AA 1TU8A 2H01A 2YJ7A 1S3CA 3TKPA 2FA4A 1TRVA 1GSSA 1F3BA 1XWGA 1KNGA 2JL4A 1BG5A 2OA7A 4O5RA 2VCVA 5IQYA 5J3RA 4ZXGA 2YN1A 3HCZA 2YJHA 1V98A 2IJYA 2VL9A 3VLNA 3A2WA 4PNGA 4KDUA 4BPYA 2OE0A 4IBPA 3LWAA 5G5EA 3DIEA 4FYUA 5KN1A 3WGXA 4EDZA 3EYTA 3HYPA 3ME8A 1HNCA 3L9SA 2H1AA 3H4KA 5HFKA 5IMAA 4ECJA 1YY7A 5JWQB 3GX0A 5ID2A 2AB6A 3ZVJD 5B8BA 3M3MA 3L9VA 6GSTA 3GTUB 5F0GA 2CX3A 4TXVA 2CAQA 2KLXA 2H71A 3C73A 4OFNA 2R2JA 4IELA 2L59A 2C0FA 2PVQA 2IIYA 1K0MA 2F51A 4ZL7A 3FZ9A 4KAEA 2A2SA 3L9UA 1KBNA 2XBQA 2JZRA 1DUGA 4IW9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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