4TR4A

Mouse iodothyronine deiodinase 3 catalytic core, active site mutant secys->cys
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
GIDPFTGQKLDFFKQAHEGGPAPNSEVVRPDGFQSQRILDYAQGTRPLVLNFGSCTCPPFMARMSAFQRLVTKYQRDVDFLIIYIEEAHPSDGWVTTDSPYVIPQHRSLEDRVSAARVLQQGAPGCALVLDTMANSSSSAYGAYFERLYVIQSGTIMYQGGRGPDGYQVSELRTWLERYDEQLHGTRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of mammalian selenocysteine-dependent iodothyronine deiodinase suggests a peroxiredoxin-like catalytic mechanism.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
molecule keywords Type III iodothyronine deiodinase
total genus 57
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature ec 1.21.99.3: Thyroxine 5-deiodinase.
pdb deposition date 2014-06-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tr4A00
3QAWA 4FYBA 1FO5A 2KHPA 1K3LA 1X5CA 3TCOA 2R4VA 3PGTA 2MYGA 4PUFC 2V6KA 4PUAA 5CNWA 4ZB8A 18GSA 3FZ4A 2K8VA 3I9V2 1MDJA 2H66A 4V1Ag 3HVSA 4ZBAA 1WRYA 2D2ZA 3D4TA 4XRAA 5ECIB 1DSBA 3GYKA 3P7XA 3ERWA 2LQQA 2OBIA 5IQYA 4D73B 1H75A 4LMVA 1GP1A 4IELA 2R2JA 1NSWA 2HRNA 1B4PA 1SD9A 3HCZA 2B1LA 1SD8A 4O32A 5EVOA 5B7CA 3D22A 1YEPA 4BWSA 5G31A 3KH9A 5HR2A 4MF6A 2OBKA 3M1GA 4CDOA 1TU8A 3HZ8A 2X8GA 4EE0A 2B3SA 4TKYA 1THOA 4ZBDA 3GKMA 3H4KA 4E8HA 2GS3A 3CRTA 3TJKA 5KN3A 4AJ8A 3ZITA 3C1RA 4N0VA 1V40A 4KUNA 2I3YA 1ACVA 4MPGA 3CYNA 3DIEA 1A8YA 4GWRA 4TR1A 2PBJA 4IP1A 2V1MA 4KSOA 2DJ3A 3F3QA 1E6BA 1GNWA 3DD3A 7GSSA 3UVHA 1FOVA 1CQHA 4I6XA 5CYYA 1PN9A 2VL2C 1M0UA 2HFDA 2JSZA 2YCDA 4KA0A 2N5BA 1QGVA 8GSSA 1PX7A 1ZYQB 5LNKe 1N2AA 3HD5A 4I2TA 1WPIA 4K7OA 2VIMA 5JCGA 3TJGA 2VAFA 4JE1A 5ECQB 3EINA 2XBIA 3A2WA 2E7PA 2GSQA 3ZMKA 1GLQA 3HVXA 4IQ1A 2LSTA 3IK7A 4FYUA 4TR1B 1ERUA 2FGXA 2GZPA 4EF0A 3DWVA 4MP4A 3RDWA 2TRXA 4O92A 4Q5RA 5LD0A 5IOWA 1ZMAA 3EMPA 2H74A 4MPFA 1A8LA 1PX6A 3ME8A 1TP9A 4BL7A 2GQLA 3FEUA 2IFQA 3VWXA 1PD21 4XS4B 3PR8A 2H8LA 16GSA 1U3AA 4KCEA 2X99A 1MTCA 4Z7XA 2HE3A 2NTOA 4AJ6A 1ZL9A 4MZWA 3DVWA 3FKFA 5IMDA 2MMAA 3ZTLA 2GT6A 1U88A 4HI7A 1T8EB 1YY7A 3D6IA 1GTBA 5G2ZA 2PPTA 1KBNA 3U6VA 1ERVA 2ZUPA 4NAXA 5HFGA 3CRUA 3ZVJD 3WGDA 2C3QA 2H1GA 4EKZA 5D96A 1JHBA 1XWCA 4EUYA 5KN0A 4POBA 2CVBA 1M2AA 3BD2A 3GKKA 2IFQB 2H30A 1GH2A 1XXUA 2FLSA 4J56E 3KMOA 4L5LA 5D8IA 1XPVA 1QMVA 1A2LA 2GZZA 4G2EA 4RQXA 1MD3A 1UC7A 2CV4A 2IIYA 3KJYA 3VPQA 1NHYA 2HYXA 3F0IA 1YF0A 3F4TA 4ISDA 5E4WA 2JZSA 3F9UA 3F63A 3KZQA 2CQ9A 1YKAA 1UVZA 1FG4A 1EP8A 4F0BA 2AV4A 2MMOA 1ABAA 2NDOA 3QDNA 3A2XA 3TB2A 2IMIA 2DJ2A 1GTAA 3ZFBA 2OE1A 1X9SB 6GSWA 2I1UA 3UJ1A 2E0QA 5CRGA 3G7IA 1S3DA 3Q19A 3CSIA 2P5QA 1SKWB 3FY7A 4OO5A 1TRUA 5IMVA 4GSTA 1T3BA 1JLVA 5DALB 2IWTA 2J9HA 1XW5A 4RI6A 1NM3A 5IO2A 4N30A 4PGTA 2K8SA 3HJMA 3LWAA 3L9SA 1HQOA 3M9JA 3GIXA 1DE2A 2VCTA 1TK0B 3SWLA 1XCCA 5D9XA 1F2EA 17GSA 1OVNA 1MDIA 1B8XA 3H93A 5G30A 1I5GA 2WRTA 4NXIA 2FNOA 5ECNB 5DQSA 6GSYA 3W6GA 1RQMA 4KB3A 1GUKA 1G7EA 2IL3A 2H0HA 5DVBA 4KGIA 2H6ZA 2IMKA 2XHFA 4GQFA 4MF7A 4DSQA 4OD7A 2VD1A 1X9MB 2VL3A 4BVYA 4QQ7A 1NHOA 2RUEA 2CX4A 4WBJA 5CRDA 3RAZA 5JCUA 1EGRA 2FD3A 2DJJA 5D93A 3WD6A 3IAM2 4ZXGA 2OJLA 4F03A 3EYTA 4K6XA 3M9KA 3WYWA 4IVFA 2LKUA 2V32A 1AQVA 2KP2A 4DSRA 4TVEA 3HVVA 2YANA 5C00A 4ECBA 5JWRB 1RK4A 4WKWA 3HA9A 4GQCA 5FWGA 4GCIA 1XOBA 3F8UA 3RPNA 4K0GA 4E8EA 4KW6A 4L0WA 1Z6NA 2PN8A 4EO3A 2IMEA 3CBUA 2H75A 5ELAA 2RUFA 1J9BA 1K0MA 1O81A 2MZCA 2J23A 3FZ5A 1Z6MA 3EU4A 4MMMA 3ZIVA 3BCKA 5B6MA 4IN0A 3M3MA 5CP1A 3FK8A 5JWQB 1FW1A 3E0UA 2H1BA 3TKSA 3H79A 4GXZA 3EWLA 2C8UA 1TXXA 5CRHA 4IS0A 2C4JA 3TRXA 1KTEA 1A2MA 1H4OA 3G7YA 5IMFA 2QSIA 4ID0A 1B4QA 1OYJA 2I4AA 4KE3A 2HRFA 4MCUA 2PVOC 2RIIA 2G2QA 2WZ9A 2I81A 4NPBA 3L9VA 2LNTA 1SK1A 4IHUA 1DUGA 4MK3A 1SL2B 4ULXA 3UIWA 2WFCA 1NW2A 1XBSA 1ZCPA 2C0DA 2X8HA 4JRRA 1TDIA 5KN2A 4GF0A 4GSNA 3P8WA 4N0ZA 3CTFA 1OKDA 3TJFA 1GWCA 2C0GA 1QQ2A 3TJJA 1G7OA 4HQZA 3LXZA 2VD0A 1M9BA 3M0FA 3CXGA 1XW6A 2GT5A 3C7MA 3GV1A 1C72A 4K7IA 5CREA 2AYTA 2ON5A 2DIYA 4FYCA 2CAQA 2PGTA 2B6MA 5H5RA 5DJMA 3I69A 4OO4A 2VCZA 2NPBA 3ZYWA 3EU3A 2PERA 3A2VA 1VF1A 4OFMA 2CVKA 3EMXA 3FZAA 3EC3A 2F8AA 3I6AA 2KLXA 1EV9A 1M99A 2LJAA 1EOGA 4AJ7A 3TKRA 3QAGA 2G0FA 2H70A 1VGLA 2CT6A 1TRVA 3SBCA 3Q74A 19GSA 1K3YA 2HI7A 2L59A 2PVQA 2L6CA 5FHIA 1EZKA 4I8BA 5J9CA 2WGRA 4HS1A 2H73A 2GSRA 3VI7A 4LL4B 4PNFA 4ML6A 3GFKA 3RBTA 3DYRA 3GKNA 4XCSA 1I9DA 2H76A 1ERTA 3QD9A 2H01A 3VFIA 3IBHA 4HU9A 2YWIA 1TRSA 4TRXA 5B8AA 1V58A 3UL3A 2EIRA 3PH9A 3TDGA 1SL0B 4TW5A 2O87A 6GSSA 2GGTA 1O73A 3GX0A 3EURA 1IYHA 4XS4A 1F6MC 1BYEA 3LYPA 1Z3EA 4TR0A 4L5OA 3D5JA 2RLIA 1VRSD 1QXHA 6GSVA 1XIYA 2WULA 4DVCA 1OKTA 3KTLA 2OA7A 4PQHA 1U3IA 3LEFA 1B48A 3L9UA 1GSDA 4XIHA 3MDKA 3MNGA 3ED3A 4FH8A 4RUVA 2JZRA 4HOJA 4PX1A 3E3EA 1EEMA 2M80A 3KP8A 5CAXA 2EIOA 4N11A 1EEJA 2ON7A 4Q5FA 2XBQA 3HY2A 1B9XC 3TOUA 1FB6A 3UARA 1O8WA 4YQUA 3LJRA 3UAPA 2IJYA 2K6VA 4KDXA 1GSQA 1SKRB 2R3XA 1GL8A 1GLPA 1MEKA 1AIUA 5ECOB 1KEBA 5A4VA 1ZYEA 1T00A 4JR4A 2H6YA 4KX4A 2B1KA 2K18A 2FUG2 1R5PA 1XWAA 4I97A 4OCFA 1V9WA 4ZIJA 5ECLB 3GMFA 2PMTA 1G6WA 2I9HA 4IQAA 1XVQA 1LU4A 1WWJA 2O7KA 3IC4A 3G9BA 2FWGA 2P31A 1Z7PA 3ME7A 4NMUA 2H0IA 4DEJA 4TN8A 2L4QA 2Z9SA 1BG5A 3BJ5A 1Y6EA 5IPGA 1GSYA 3LQ7A 5G5EA 1YQ1A 3KGKA 20GSA 2V41A 3C73A 2MBTA 5ENUA 4AF2A 4WR5A 5C04A 1R5AA 1XWBA 5F07A 2DSAA 3KEBA 1X0RA 4FO5A 1Z9HA 1K3OA 2RM6A 3QMXA 1SYXA 1M2DA 4FIWA 3FZ9A 4PQ1A 4L0UA 13GSA 1ZZYA 1AAZA 4G19A 1FVKA 3FRCA 1SENA 1ST9A 4F0CA 4BA7A 1JZWA 3ZIJA 5INYA 2PWJA 3VURA 5DALA 1O8XA 3GH9A 1T1VA 5IOXA 2JSYA 5ECRB 1HNBA 2ALBA 2IMFA 4HZ4A 4IBPA 4EDZA 1UN2A 2AJQB 4DSSA 1SKSB 5HR0A 1PQNA 5HFIA 1TRWA 2HSYA 5GAND 1USBA 1WJKA 1WP0A 2X64A 3UOMA 3KMNA 3QFAC 3FYGA 4GSSA 3N5OA 3UVTA 1F9MA 4V1Ap 4EC0A 1PKWA 1SU9A 2LTKA 1SK2A 4HJ2A 3D4MA 2DMMA 1PSQA 4KDYA 2B5EA 2B5XA 4IJ3A 2CZ2A 2GZYA 4XHMA 2OE0A 1R26A 1YEXA 5DCHA 3DMLA 1OC8A 2MMZA 1VF4A 1YJ6A 3HXSA 3CSJA 3IAS2 3R2QA 4K1FA 1URMA 2NBSA 2A2RA 3PINA 3F6FA 4DSSB 2FWEA 4MZBA 1ERWA 3FR3A 5F0GA 2R5GA 3VWVA 4EDYA 3JCML 1ZOFA 3WGEA 3DXBA 4MH3A 2CA8A 3WGXA 2JU5A 3GHAA 4JU5A 5LCZA 1KNGA 3QCPA 4L8EA 4N10A 4BWQA 1A0RP 1U87A 3NIVA 11GSA 5DDLA 10GSA 3TGZA 1XFLA 2YP6A 5ID2A 5IM9A 4AGSA 1K0AA 3LFLA 5ABRA 3J7Yk 3ZVJA 1TJDA 3E9JB 2KP1A 3ERGA 3UBLA 2B7JA 3HHVA 2H19A 1FHEA 3A5WA 3BBYA 1TTZA 1YF1A 3VWWA 4MJAA 2M46A 5FT3A 3HJPA 4EVMA 1M9AA 4H86A 2VO4A 1ON4A 3HKRA 5HFKA 3TKSE 2FHEA 4F9ZA 3DEXA 4WF5A 3TKSC 3RPPA 2HSHA 1RW1A 3GSSA 1SK0A 2HXKA 1JLWA 3IK9A 2WDUA 4PNGA 6GSUA 2VM2A 3KP9A 3TUEA 1WIKA 4GTUA 3IA1A 1S3CA 3GKXA 2LRTA 5ID2B 5L71A 1AQXA 6GSTA 1AC1A 1FB0A 5CRWA 2YWNA 3ZRDA 1YKCA 2V6OA 5ECPB 3NZNA 5DBQA 5AIXA 5AGYA 4HQSA 2C0EA 2C3NA 2ZCTA 4O5RA 1HNCA 1PA3A 1HYUA 3LGCA 2YZUA 2VCWA 5J41A 1PL2A 4K7NA 3QAVA 3GA4A 1Q4JA 1TU7A 2VUPA 3IV4A 3LG6A 1K0BA 3APSA 1O85A 5A5KA 2KOKA 3O6TA 1XWGA 3CSHA 1ILOA 3GL3A 5GAPD 4XS6A 4V2NA 4EL1A 2H0GA 1DE1A 4HEA2 3GRXA 3C1SA 2XPEA 4MJEA 4V2LA 5ECSA 2H1AA 4MJBA 4ILFA 5H5SA 2AAWA 4ECJA 4JR6A 3P2AA 2GSTA 3QR6A 3ISOA 1SL1B 5IO0A 2HZFA 4RQRA 1F3AA 1GUMA 5HR1A 5COHA 2CVDA 5DCGA 2LQOA 4WEYA 3GSTA 3WT1A 2OE3A 1B9YC 1OC3A 1AUCA 5GSSA 2AB6A 4WBRD 5DQYA 2GQMA 2F9SA 3MAKA 2LJRA 3F6DA 3DGQA 1V98A 5IMCA 4PQIA 5HR3A 3ZZXA 4POKA 1ML6A 1AW9A 1BEDA 1A23A 3QFBC 5ECMB 3BOAA 4MH2A 2QKEA 1EP7A 1IYIA 2GVPA 4IW9A 1K0OA 1THXA 2EIQA 2REMA 4MABA 12GSA 5H5QA 5F05A 4KH7A 2BMXA 4BVXA 3WT2A 4ZL8A 5F06A 5F8BA 2BTOT 2IMDA 2YPMA 2FA4A 2GTUA 3GURA 3MWHA 4F82A 3QOUA 4GRFA 3I43A 3W8JA 3LYKA 4CHSA 1GNEA 4JEDA 4ZB6A 4JZQA 2CZ3A 1G6YA 1FAAA 2FA8A 3ZL5A 4J2FA 1A0FA 2GLRA 1Z7RA 3M8NA 2FCHA 3C71A 3L4NA 3L78A 3J7Yb 1BAYA 4TR4A 2A2SA 2O8VB 1F37A 2BJXA 3H1NA 4RI7A 1GTUA 2LEGA 1V57A 4HU7A 2LJKA 2JACA 1J08A 2C3TA 4XS1A 1LBKA 1X5DA 2DJ1A 3D21A 1N8JA 3DKSA 2XC2A 2M72A 3TRPA 1VF3A 1EOHA 3KCMA 5KEJA 1GULA 1YZXA 5EY6A 4YQMA 5ECHB 2DIZA 4MA9A 4LL1B 2PUKC 3LORA 4OFNA 4I5QA 1T4ZA 5GSTA 1MDKA 3KTBA 2MBSA 14GSA 3GN3A 1HD2A 2VL9A 1W89A 2GSSA 4MJCA 2FWFA 4OMVA 4TR3A 4GLTA 4IP6A 1JZOA 1PL1A 2F8FA 3S9FA 3DVXA 5EL8A 4OFTA 4ZILA 3VI5A 3CTGA 2QGVA 4P3YB 2MMNA 3FW2A 5D9WA 2VL2A 3TKPA 4K0NA 3US3A 1O6JA 2LV3A 5DAKA 3EE2A 2R37A 3KH7A 3IOSA 1FVJA 1OE7A 2EC4A 1EGOA 3LXTA 2N5FA 2F51A 5G1LA 3LSZA 2DC5A 1BJXA 4POLA 4WXTA 3TKQA 4ZL7A 3TRQA 4K9ZA 4EXJA 5G5FA 3ZREA 2C0FA 2DMLA 2DJ0A 3ERFA 4V2MA 2O85A 2YJ7A 1GSSA 4K8MA 2NVLA 3AY8A 2VLVA 5IPHA 4KDUA 5IMZA 1QUWA 4KSMA 2CX3A 4KAEA 1X9WB 1CQGA 5A4UA 4MF5A 2YJHA 5HQPA 1W4VA 4TXVA 2VLTA 5D73A 3QPMA 2AUVA 5J9BA 2VCVA 4ML1A 4MLYA 2LS5A 1MD4A 5DAKB 1Q98A 4BPYA 2H71A 4K2DA 1JZRA 2YZHA 5JWOB 4TXOA 3GTUA 2WS2A 3VWUA 4KNDA 2FWHA 2YNXA 2LUSA 4G10A 1PKZA 1XZOA 4G9HA 1XW9A 1VF2A 2R6KA 3MSZA 4OCEA 2HT9A 4QL7A 1TW9A 4YAVA 1T7PB 2L5OA 1R7HA 1K0NA 2B5YA 1ZGNA 4KCAA 1DBYA 3VLNA 2TIRA 1GSUA 4Q5NA 4HJMA 2L57A 2HZEA 3IR4A 4QL9A 2LNSA 3F4RA 2WB9A 3IDVA 1TOFA 1GSFA 2CAIA 2KUCA 3FR9A 4IGJA 4NWYA 6GSXA 3GH6A 3EVIA 2DJKA 3HZ4A 2P0GA 3HDCA 5JCWA 2E2MA 1UA5A 3APQA 5G1KA 1SJZA 4TXOB 1Z5YE 1F3BA 3GTUB 2TRCP 2P5RA 3O3TA 1GRXA 2IPAA 3L0HA 4I2UA 2C80A 1SYRA 1BX9A 2C1YA 4JBBA 3TOTA 2AHEA 1HNAA 1PGTA 4ECIA 5D9VA 3Q18A 4WETA 1GSEA 2OACA 1U6TA 4ZB9A 2JADA 4CW9A 2WCIA 2HZEB 2L5LA 2L6DA 4F2IA 4PXOA 2X8CA 3KIJA 3KXOA 2WJUA 2GDRA 3IXRA 2DLXA 3KD0A 5J5NA 4X0XA 2FY6A 1QFNA 4HDEA 5CO3A 2YV7A 3ZFLA 3Q6OA 2XPDA 4PURA 1TI1A 4LLRA 5E59A 5IMAA 1YDKA 2QC7A 5IIZA 3IPZA 4OWYA 4POMA 1JZDA 9GSSA 1S3AA 2A4VA 2HLSA 3FHKA 3RHCA 4HZ2A 3VK9A 4X43A 1M7TA 2LRCA 2GQKA 3KM6A 2N5AA 1R4WA 2VM1A 5KN1A 3GUSA 1PMTA 1LJRA 2ES7A 2E2GA 4ECCA 1AXDA 1M2BA 3O76A 3P90A 4MZCA 2H6XA 2B7KA 2L4CA 1OAZA 4NV2A 4IJIA 1XVWA 1V2AA 2H72A 2RM5A 2K9FA 2YOIA 2YWOA 3IRAA 3GNJA 4TOPA 5DJLA 5D9TA 4ZL9A 3D0ZA 1OC9A 3IE3A 2V2GA 2O89A 1QK8A 1WOUA 2VLUA 4LMWA 4ACSA 3F4SA 22GSA 2JL4A 5A4WA 1EV4A 3UMAA 3RHBA 2DBCA 3UBKA 3F3RA 1A24A 4YAPA 1EWXA 2PU9C 4XTSA 3CMIA 3UEMA 3GL5A 5B8BA 3NOFA 1TK5B 2JZTA 2HNLA 2F3MA 5EPFA 3K8NA 5GZZB 3OR5A 3W8SA 1G0TA 5B6NA 4X1UA 2VOCA 3ZMLA 3FR6A 4NV5A 2YN1A 3V1WA 1Y25A 5J3RA 2VCQA 1XWKA 2OADA 3IHQA 1X5EA 5AN1A 3HYPA 1WE0A 1OC9B 3H8QA 4LA1A 4NHWA 1K0DA 1GUHA 4XRDA 2YV9A 1OE8A 5ELGA 4ZBBA 3HJOA 1TK8B 1GTIA 1JFUA 4J57E 3BCIA 4WF4A 3TJBA 1T4YA 1TI3A 1K0CA 3GX8A 5AISA 5ECKB 4MDCA 1A2JA 1PRXA 4Q5QA 4YQVA 4YH2A 1AQWA 1TKDB 2OKAA 3C8EA 4WR4A 4D73A 2H1DA 2IN3A 3A3TA 2LRNA 3U5RE 4NHZA 3N9JA 1O7UA 4O7HA 5J4UA 1SJ6A 1XOAA 1SJIA 3G7JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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