4TRXA

High-resolution three-dimensional structure of reduced recombinant human thioredoxin in solution
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
b'MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCTPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title High-resolution three-dimensional structure of reduced recombinant human thioredoxin in solution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Electron transport
total genus 19
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1990-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4trxA00
1YZXA 3UAPA 2GQMA 4XS4A 4I97A 1DUGA 3RPNA 2FY6A 5DALA 1Z3EA 2FD3A 4N0ZA 4KA0A 3KXOA 1KTEA 3APQA 5EVOA 4K0NA 5IMDA 3IHQA 4I6XA 3QCPA 5F05A 1ST9A 1TDIA 5IMZA 2FWGA 4ULXA 1G7OA 4NXIA 1O6JA 2GZZA 4XIHA 4X43A 1RW1A 1WRYA 5GSTA 2WJUA 3WT1A 4QL9A 4ECCA 4N10A 3H1NA 2PMTA 1TRVA 2VL3A 3TJJA 1EP8A 2DJKA 3MDKA 1AQVA 4OMVA 4N30A 5H5SA 3ZIVA 1UN2A 3ZZXA 4HUAA 4DSRA 1N2AA 3PINA 2VLTA 1GSEA 2C80A 3PR8A 2CX4A 2M46A 3TKSE 3QAVA 1NM3A 2LJAA 4AGSA 1EGRA 4XHMA 3HDCA 2ON5A 1AQWA 2L4CA 2GGTA 2N5AA 4IP6A 3ERWA 5J9CA 1X0RA 2B7JA 1XW5A 3F4RA 3O3TA 2L5LA 3O6TA 2GDRA 4JBBA 2WS2A 3FZAA 2XC2A 4ZXGA 1B4QA 2K8SA 3P7XA 2MBSA 2AV4A 1ZYQB 3IA1A 4NHZA 3SBCA 1TKDB 1G7EA 1HNAA 2C3QA 4HJ2A 3G7JA 2IMDA 5DAKA 4L5OA 5ECPB 5DJMA 2KOKA 3ZREA 3I9V2 5IMVA 4ZBAA 2P0GA 16GSA 4X1UA 3EWLA 3C8EA 4XTSA 5J9BA 2QC7A 1Z5YE 2H01A 1B4PA 1PGTA 2HE3A 2AHEA 3HKRA 2CVDA 17GSA 3CSHA 1MEKA 1GRXA 4TW5A 1XWBA 4XS1A 5C04A 3H4KA 3GKKA 2H1GA 3QDNA 4OFNA 1LU4A 2R6KA 4I2TA 4MJBA 4BWSA 2PERA 3QAGA 2DJJA 2TRCP 1ERTA 2IL3A 1MDJA 2OKAA 4TN8A 2NDOA 4OO5A 3HCZA 4GCIA 3U5RE 1FW1A 5FWGA 1YF0A 4MCUA 1YY7A 2L57A 1XVQA 3GV1A 4TVEA 5A5KA 3J7Yk 2DJ0A 1K0NA 2GQLA 2FHEA 1XW6A 2EIQA 2DLXA 1JFUA 2DC5A 2DSAA 1TU7A 1GLPA 3GN3A 4RQRA 1CQHA 3F6FA 6GSSA 3FZ9A 3FKFA 4IELA 3VI5A 4RQXA 1K3YA 2HSYA 1M99A 1WMJA 4WF5A 5CRHA 2C0FA 3L9VA 1EP7A 1DE2A 4GWRA 14GSA 2KLXA 5F06A 2YP6A 3IC4A 2GLRA 2CAQA 2C0EA 3H8QA 4ACSA 2ALBA 2IMKA 2GT6A 4EO3A 3QMXA 3N5OA 5IQYA 1XXUA 4TXOB 4J2FA 2QSIA 1PMTA 1T4YA 3FR3A 5IOXA 2R2JA 2LQOA 3HA9A 4GSNA 2LV3A 2IJYA 3TJFA 5EY6A 1B9XC 4MPGA 2C4JA 1GL8A 2MYGA 4MJCA 2FA4A 1K0OA 2VL2A 5G31A 2L6DA 3M3MA 3GKNA 3Q6OA 4PQIA 2F3MA 2ZCTA 2E0QA 5J41A 5J5NA 6GSUA 2DMMA 5ECNB 2WB9A 1SU9A 2RIIA 3GYKA 5E59A 2GQKA 3KM6A 3IBHA 4ZB6A 4TR1A 5JWQB 4WETA 4IJ3A 4YAPA 1HD2A 2YZHA 2A4VA 1R5PA 1XWAA 2HYXA 1F3BA 1WOUA 1F6MC 4MZBA 1MTCA 1QK8A 2MMOA 4MJAA 2O8VB 4KDYA 3HD5A 4X0XA 1X5DA 5H5QA 4BA7A 3Q74A 1AW9A 5EPFA 2H66A 4PXOA 5ID2B 1X9WB 1K0AA 1EGOA 3LSZA 2VL9A 1OC8A 5FT3A 4F2IA 1ZL9A 4GXZA 1BX9A 4IQAA 4L5LA 3H93A 1XW9A 2EIOA 3ME8A 2YPMA 5D96A 4TKYA 3A2XA 5CAXA 2CQ9A 2XPEA 4N11A 3A2WA 5DVBA 5A4VA 2EC4A 4LLRA 5DDLA 2MBTA 3ERFA 2WDUA 4TR4A 3KH7A 2IFQA 2HXKA 3CSIA 3VLNA 3UEMA 3UL3A 1OC3A 4JR6A 1B9YC 3FRCA 5B8AA 3F3RA 3KZQA 4PUFC 1O8WA 4EXJA 1A2LA 3CTGA 3APOA 1GLQA 3C1RA 2TRXA 2N5BA 1F3AA 4K7NA 1GNWA 4BL7A 1QUWA 1DBYA 3G9BA 2KUCA 3EC3A 1X5EA 4FH8A 3UMAA 5B6MA 1AIUA 2D2ZA 1G6YA 3GFKA 5AGYA 1YF1A 5IO2A 1S3CA 5ECHB 3HY2A 3ZITA 2LTKA 4V1Ap 3VFIA 3TJBA 3KH9A 3ZYWA 5DQSA 1R5AA 5KEJA 4HQSA 4ECIA 5GSSA 3F6DA 1SKRB 2FA8A 4F9ZA 1DSBA 4MLYA 2NVLA 4MK3A 3IAM2 2WZ9A 1A0RP 1YKAA 3ZVJD 3QOUA 1A24A 6GSVA 2V32A 1OAZA 5CYYA 4PGTA 4FYBA 4KCEA 1BQ7A 2XHFA 4F0BA 4LA1A 2LKUA 5KN0A 1O8XA 1K3OA 3FY7A 2H1BA 8GSSA 1TRWA 4BVYA 1Z7PA 2OBKA 2ZNMA 4D73B 3P2AA 3L9UA 4HU9A 2B3SA 2KHPA 2YV9A 1RQMA 4MZWA 5G1LA 3VWWA 1GSYA 3ZVJA 4KNDA 3TUEA 2L5OA 2J9HA 2Z9SA 4PQHA 1SENA 2B5XA 3DGQA 4EE0A 1J9BA 3CMIA 4AF2A 4EDYA 2C3NA 1SYXA 1GH2A 3LG6A 2BTOT 3APSA 2H6YA 3J7Yb 5HFIA 3RHBA 3EINA 3LJRA 5IIZA 1SL1B 2B6MA 3UJ1A 7GSSA 1KNGA 2CZ3A 5KN1A 2CVKA 1F2EA 1K0BA 3ZFBA 1XCCA 3P90A 2RM5A 1NHOA 3HHVA 1SJIA 3DXBA 4WEYA 1BAYA 4DVCA 1UVZA 4CHSA 1Z7RA 4PX1A 2O7KA 4CDOA 1GTUA 5HR3A 2H6XA 4GSTA 2VCQA 2I3YA 4NV2A 3QFBC 3I6AA 5ECLB 3CRUA 3LQ7A 4NWYA 4G10A 1V40A 3UVTA 1PSQA 4POKA 4IN0A 2H74A 2HLSA 3DRNA 1DE1A 2OADA 5CO3A 2AB6A 1SL0B 2F9SA 2YN1A 2HT9A 2JADA 2E2GA 3A2VA 4WBRD 1EV4A 4WBJA 2YCDA 4GRFA 2FWHA 2LRCA 3D5JA 4KUNA 3V1WA 3UIWA 5JCUA 3F8UA 2LS5A 2PBJA 4OD7A 2QKEA 5CRWA 5B8BA 4MF6A 1AAZA 4YQMA 5G5EA 4YAVA 3TRXA 4F82A 5ECMB 1WJKA 2GTUA 4LL4B 1EOHA 2VD0A 3LYPA 1X5CA 1BEDA 2C8UA 1A8YA 4WR5A 3EYTA 4XS6A 1BG5A 1TK0B 4KDXA 3D4TA 1PL2A 4MH3A 1EWXA 2YZUA 3IR4A 2YJ7A 3ZLPA 4JEDA 1MD3A 1U6TA 2E2MA 4EKZA 3TJGA 1TRSA 3GUSA 4YH2A 3C73A 2VLUA 2LRNA 2GVPA 3DVXA 1ZMAA 4HZ4A 1T8EB 1M9AA 2FWFA 1SKSB 4MABA 3TCOA 1C72A 4AJ6A 5LD0A 1AQXA 2LJKA 2PU9C 4EUYA 1FB0A 3LXZA 2K18A 3GMFA 1T1VA 4I2UA 1SK0A 4TRXA 3UBKA 5G1KA 1WWJA 2BJXA 2A2SA 4WKWA 4GF0A 1O73A 1JZWA 3R2QA 2K6VA 2VD1A 18GSA 1QGVA 2V1MA 4L0WA 4K2DA 2M80A 3VK9A 2IN3A 2HFDA 3KTBA 4PQ1A 1PA3A 4XCSA 4YQVA 4DEJA 3ZMKA 1M2BA 3BOAA 1FB6A 3RBTA 3UVHA 4JU5A 4AJ8A 4YQUA 6GSYA 4ECJA 5H5RA 4HQZA 2WRTA 2WGRA 12GSA 2YWOA 1YEXA 2LRTA 4HJMA 4XS4B 1OC9B 2K8VA 3BBYA 22GSA 5DALB 1R4WA 5ABRA 4I5QA 4O32A 2R5GA 3C1SA 4ZBBA 1GSSA 4IVFA 11GSA 2YJHA 3K8NA 1HNBA 2J23A 5F8BA 3UOMA 6GSXA 4E8HA 1FAAA 2XPDA 3GL5A 3U6VA 3W8JA 1PX7A 3RPPA 5HR0A 1GULA 2VAFA 2HI7A 5CRDA 4KDUA 3Q18A 4TOPA 1SYRA 4QL7A 5HQPA 1GP1A 1EZKA 2VCZA 1A2JA 1FVKA 5G2ZA 2IMFA 4MF7A 2PVQA 5DCGA 3QAWA 2JZSA 1YKCA 3LXTA 5DQYA 1OKDA 1U3IA 1NHYA 5JWRB 2O87A 2H6ZA 3CYNA 4GSSA 1ERWA 4DSSA 1XBSA 1GUKA 2LEGA 3LWAA 3IAS2 2X64A 3ZRDA 1M2DA 2MMAA 2H8LA 4Q5FA 3D6IA 4F0CA 1NSWA 3TOTA 1XZOA 3HZ4A 2KP2A 2G0FA 2AJQB 2GZPA 1JZDA 3M0FA 2DJ2A 1OE7A 3EU4A 1GSFA 3MNGA 4LMWA 3HJMA 2JSYA 4PNFA 5AISA 4K6XA 5A4WA 2I1UA 3M9JA 4RI6A 2MZCA 1UC7A 4K0GA 2WFCA 1E2YA 4IJIA 1GUHA 2C0DA 4BVXA 2K9FA 3E9JB 3OR5A 2PUKC 2NBSA 4IBPA 1CQGA 4XRDA 4HDEA 1U87A 4POLA 1TU8A 5D8IA 5DAKB 4TR3A 1ERVA 1XOAA 5AN1A 1Y25A 1TTZA 4KH7A 1SL2B 4OCFA 3VI7A 3ERGA 1WE0A 1ON4A 2H76A 2TIRA 2NPBA 1SK1A 1S3AA 2HZEA 3EU3A 3F4TA 4JRRA 3GKXA 3TKPA 3D0ZA 3MWHA 1XWCA 2RUFA 3TRQA 3QFAC 4OFMA 1A8LA 3IV4A 5ELAA 3CXGA 1T7PB 3ED3A 1T00A 1G6WA 3PH9A 2L59A 1LJRA 4NAXA 1TJDA 4GTUA 3EE2A 3GNJA 2H73A 3IK9A 4V2LA 3DEXA 4MH2A 3KEBA 3GSTA 2XBQA 2OA7A 5J4UA 1K3LA 3NZNA 4QQ7A 1I9DA 4MMMA 2I9HA 1PX6A 5D9XA 10GSA 3DKSA 3KP8A 3QPMA 2H19A 1YEPA 3DVWA 4IP1A 4O7HA 1A2MA 3D21A 4G9HA 2V6OA 1PL1A 4PNGA 2YWMA 1J08A 4V1Ag 3HJPA 4ZL9A 2VCVA 4OFTA 3M8NA 2JSZA 5F0GA 3GTUB 2B1KA 3MAKA 3BCKA 2DJ1A 3C7MA 1V9WA 2IMEA 1QXHA 4K1FA 4ZILA 2CV4A 2YNXA 3ZTLA 1VRSD 2LJRA 4L8EA 2OE0A 3F9UA 3TDGA 2L4QA 3WGXA 3ME7A 1G0TA 2WULA 4EL1A 1Q98A 5D9VA 5GAND 2X8GA 4FIWA 4N0VA 5B6NA 2F8FA 2JU5A 2X8CA 1ERUA 4MJEA 5D9TA 3TKSC 3UARA 5A4UA 2FUG2 5JWOB 2RM6A 4NMUA 2E7PA 5IPHA 1KBNA 1PKWA 3RDWA 1ACVA 3VWVA 5GZZB 4KSOA 3KTLA 4EVMA 5D73A 2I4AA 1TI3A 1IYHA 4IW9A 2VOCA 3KIJA 3VWUA 4J57E 1O7UA 1JLWA 1PRXA 2FCHA 1GWCA 3AY8A 5ECKB 1WIKA 3L4NA 4ZB8A 2X8HA 6GSTA 4K7OA 3WYWA 3RHCA 3M1GA 5G5FA 3NIVA 4TXVA 20GSA 4ILFA 4ZBDA 4Q5NA 1PN9A 1TK8B 2CT6A 1EEJA 2M72A 3KJYA 1FOVA 1V58A 1J0FA 4IS0A 2OACA 4CW9A 2B5YA 4PURA 2H70A 4V2NA 2OE1A 3FEUA 1QMVA 1I5GA 4MF5A 2F8AA 4P3YB 3TKRA 3G7YA 3VPTA 3JCML 1YJ6A 2V6KA 4KAEA 3MSZA 3GKMA 2ON7A 4KB3A 5JCWA 2O89A 2IFQB 2GT5A 2VCXA 3TKQA 3GIXA 2H0IA 2YV7A 4Q5QA 2IWTA 1VF2A 3L9SA 1IYIA 1OYJA 4KE3A 4G2EA 1OC9A 1VF3A 4KSMA 4WR4A 3HVVA 5IMCA 2CVBA 2I81A 3IDVA 4ECBA 4IHUA 1OE8A 1ML6A 4LMVA 2EIRA 1W89A 3LYKA 2JZTA 5ECRB 3WGEA 2OJLA 1ZGNA 3HVSA 4HEA2 5L71A 2AYTA 4POMA 4K9ZA 2C3TA 4FYUA 3GA4A 1JZOA 3ZMLA 1JZRA 3IE3A 3HZ8A 1T3BA 1FHEA 3KP9A 4GLTA 4NPBA 5ECQB 3KCMA 2C1YA 5AIXA 1X9SB 4RI7A 1EEMA 3KMOA 4K7IA 3DD3A 3EVIA 2F51A 1SD9A 5EL8A 4TXOA 1R7HA 2FNOA 3DMLA 3F3QA 2XBIA 2A2RA 3WT2A 3E3EA 5DCHA 5CP1A 3VPQA 4K8MA 1SKWB 3BD2A 4MP4A 1U88A 3GX8A 1Y6EA 2ES7A 1V57A 1XIYA 1ZOFA 1QQ2A 2R4VA 1YQ1A 2OBIA 4KW6A 2B5EA 2P5RA 2X99A 1B8XA 1MD4A 2O85A 1EV9A 2VM1A 1GSUA 3HYPA 1S3DA 5ECSA 3GX0A 2HZFA 2PVOC 1VF4A 2N5FA 5D93A 1FO5A 5B7CA 3S9FA 4WXTA 3GRXA 4WF4A 2LQQA 4GQFA 1XFLA 5ID2A 1ILOA 1TW9A 2PWJA 3Q19A 4OO4A 3I69A 4MDCA 9GSSA 2KP1A 1THOA 2QGVA 5CREA 2LNSA 5COHA 1K0CA 5ELGA 2MMNA 3GSSA 3GH6A 3D22A 2DBCA 1JLVA 4NHWA 1BYEA 1SK2A 3IK7A 2NTOA 2R37A 3IXRA 4HOJA 5J3RA 1H4OA 3F0IA 3FR6A 3DIEA 3LEFA 3ISOA 3ZL5A 3TKSA 3FW2A 3LORA 2JACA 5IMFA 4ZL7A 3WD6A 5KN3A 2FLSA 1TXXA 2JZRA 5G30A 2AUVA 3I43A 1K0DA 1GTAA 1ZCPA 2IIYA 4ML1A 4V2MA 2GSQA 2DIYA 4EDZA 2DIZA 4NV5A 1JHBA 1SJZA 3HJOA 5ECOB 3GTUA 1NW2A 2DJ3A 4EF0A 1AUCA 5HFKA 2MMZA 2H0HA 2YOIA 3H79A 5FHIA 5JCGA 3QD9A 4J56E 2CA8A 1TP9A 4Q5RA 3TOUA 3EMPA 4O5RA 2YWNA 3D4MA 1O81A 4ZL8A 2R3XA 4XRAA 4POBA 5HFGA 4I8BA 5ECIB 3O76A 3KD0A 3PGTA 4MZCA 3CBUA 4HZ2A 4H86A 3NOFA 1XOBA 1A23A 5CNWA 2JL4A 5INYA 1O85A 2PGTA 4PUAA 1M0UA 5GAPD 2GSSA 1OVNA 1YDKA 3QR6A 2L6CA 2RLIA 4ML6A 4ZB9A 2RUEA 4D73A 1MDIA 2AAWA 1H75A 3KGKA 2PN8A 4KGIA 2HNLA 4HS1A 3G7IA 5IMAA 4G19A 5E4WA 1RK4A 3TRPA 1QFNA 4IGJA 2ZUPA 3VWXA 4DSQA 2VIMA 3M9KA 4FYCA 2GS3A 2PPTA 2FGXA 5IPGA 4O92A 4HU7A 3FZ4A 4E8EA 1XWKA 2HRFA 2YWIA 2GSRA 2VCTA 2H72A 3RAZA 3FYGA 3GURA 1GSDA 2IMIA 3EMXA 1AXDA 1SD8A 3L0HA 3F4SA 5LNKe 1PKZA 1FG4A 1K0MA 1GUMA 5DJLA 3FR9A 1FVJA 1THXA 2VUPA 3A5WA 1TRUA 3KMNA 3LFLA 2GSTA 1HNCA 5LCZA 3N9JA 5C00A 3A3TA 1PQNA 3HVXA 4TR0A 4MA9A 5F07A 3DWVA 2DMLA 4Z7XA 1E6BA 1GTBA 4RUVA 5IO0A 5DBQA 1Z6MA 1OKTA 2CAIA 2GZYA 4KCAA 4IQ1A 1GSQA 2LSTA 3TGZA 2LNTA 1ABAA 1LBKA 2C0GA 4BPYA 3E0UA 5IM9A 5CRGA 1VGLA 2VCWA 1WPIA 1N8JA 4ISDA 3P8WA 4OCEA 2CX3A 1U3AA 3FHKA 1HQOA 3W8SA 4L0UA 1AC1A 4JZQA 2CZ2A 1VF1A 5AIVA 3GHAA 3HXSA 1V98A 2V41A 1TOFA 3IPZA 3L78A 2G2QA 5KN2A 1EOGA 2B1LA 4AJ7A 2H75A 6GSWA 4JE1A 2VLVA 4LL1B 3UBLA 5HR2A 3IOSA 1TI1A 3DYRA 5ENUA 4F03A 1GTIA 1PD21 1SJ6A 5D9WA 1B48A 2FWEA 2BMXA 2P31A 5HR1A 4DSSB 3TB2A 2REMA 1ZYEA 4ZIJA 3VURA 2YANA 1T4ZA 3FZ5A 1M2AA 4GQCA 1F9MA 2WCIA 4HI7A 1Q4JA 3FK8A 3F63A 2H1AA 3BJ5A 2VO4A 2H1DA 4JR4A 1R26A 2P5QA 19GSA 1X9MB 4EC0A 3W6GA 4IKHA 3TJKA 1F37A 3EURA 2HRNA 3BCIA 1A0FA 4MPFA 1Z9HA 2H71A 1ZZYA 1HYUA 3GH9A 4TR1B 4BWQA 1V2AA 4FO5A 2H0GA 3CSJA 1M7TA 3ZIJA 1XPVA 4KX4A 1URMA 3C71A 5IOWA 1TK5B 2LUSA 1WP0A 3CTFA 2OE3A 1KEBA 2H30A 3SWLA 2V2GA 2B7KA 3CRTA 1W4VA 1BJXA 1MDKA 3WGDA 1XWGA 1M9BA 2HZEB 4ID0A 3IRAA 3GL3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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