4TT2A

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with h4(1-20)k5ac peptide
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Gene regulation
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tt2A00
4UYEA 3MQMA 4O76A 5CZGA 4NUDA 3U5NA 4LC2A 5CQ7A 4CUUA 4Y03A 5D3TA 5EA1A 4QUTA 4QZSA 5E9MA 5I29A 4UIYA 4YATA 5BT3A 5D3HA 4DONA 5DFBA 5C89A 5CQ6A 5FE5A 3U5PA 5EI4A 3O37A 5EQ1A 4N4IA 5I80A 4NR7A 2N9GA 5F62A 2OSSA 5EPSA 5CQ8A 5D3RA 4HXMA 3QZTA 3UV2A 2MJVB 5EWWA 4J0SA 5CTLA 5ENHA 4MEPA 4Q0OA 5AMEA 1ZS5A 4NQMA 4Z1SA 4YY6A 5EM3A 4YBTA 5L8TA 2DKWA 4IR6A 5HCLA 5DYAA 3JVJA 4LDFA 3JVKA 4C66A 4YYKA 5LJ0A 4MR5A 5A5OA 5E9IA 5D3LA 4KV1A 2RNYA 4O7EA 4XYAA 5F2PA 3LQHA 4QSVA 5EGUA 4IR3A 4O78A 4TZ8A 4OUFA 4YYNA 2I8NA 1F68A 2YEKA 4YY4A 4LYIA 5HJCA 5HRWA 2KTBB 5D3SA 4E96A 5FG4A 3AADA 2WP2A 4A9HA 5AMFA 3MUKA 4QEUA 5E9YA 4HXSA 4QR3A 4NQNA 5IGMA 3UV4A 4OGIA 5D25A 4WHWA 4O72A 5F1HA 5HRVA 5HRXA 3IU5A 2L5EA 3MULA 4N4FA 5E0RA 5EU1A 5BT4A 3UVYA 4CUSA 4HXPA 5HM0A 4HBWA 4TS8A 5EVAA 5CRMA 5EPRA 4QC3A 5KTXA 2DVVA 5IBNA 3TLPA 5II2A 3G0JA 5CUBA 5I88A 4YADA 5F5ZA 5IG6A 4QSSA 4BW3A 2L84A 4YYJA 4PTBA 2RI7A 4TQNA 1N72A 5I89A 3P1FA 5I86A 3UVXA 5ACYA 4HXLA 5DY7A 4QBMA 5EWDA 5DLXA 5EWCA 4QUUA 4XY8A 3LJWA 5I7YA 3HMEA 3JVMA 3S92A 4PCIA 5CS8A 4LZ2A 5ENIA 4PY6A 3P1DA 4TT2A 5FH7A 4NR9A 2H60A 4HXRA 4MEQA 4TU6A 4O7BA 4UYFB 4XY9A 5CQAA 2RS9B 4BW2A 2R10A 4UIXA 5DX4A 4IR4A 2D9EA 4NR4A 5HQ7A 4QR5A 4NYWA 2I7KA 5D3NA 4CUTA 3U5LA 4MENA 5IIDA 4NUEA 3P5OA 4A9MA 5IGNA 4NR5A 4UYFA 5A5QA 5KHMA 4KV4A 3U5JA 2FSAA 5A5SA 4BW4A 5L97A 4UIZA 3QZVA 3MXFA 5A7CA 4PS5A 5ETDA 5A5NA 5DYUA 5A82A 4CUQA 1JSPB 4X2IA 5LVRA 3NXBA 5HELA 4NRBA 5KTUA 2YW5A 5LKXA 4TT6A 4A9FA 4Z6HA 3HMHA 3O35A 1WUGA 3UVWA 5A81A 4QSRA 5LKTA 4HXOA 2DVQA 4NXJA 5H85A 5H1VA 5A5PA 5F1LA 4NRCA 4OGJA 3LXJA 4LZSA 4ALGA 2YYNA 4PCEA 4AKNA 3JVLA 2E3KA 5CUDA 4HBXA 4XUAA 5F60A 3SVGA 5J0DA 4LZRA 5E9VA 5FE2A 5FB0A 5DBMA 4A9JA 4N3WA 5BT5A 2E7OA 4CURA 5AD2A 5HQ5A 5KO4A 5KTWA 3O33A 2YDWA 4Z1QA 5D0CA 4J1PA 3P1EA 5CY9A 5CUEA 5A83A 2RNWA 5FE7A 5FH8A 4Z6IA 5FH6A 4O7CA 3UV5A 4YYIA 4QSQA 3O34A 5DKHA 4QC1A 2OUOA 4QEWA 4NR6A 4CLBA 3RCWA 5FE6A 2F6JA 5CGPA 5DW1A 4TT4A 5CQ4A 5DW2A 5E73A 5JWMA 2DVRA 4MR6A 5LKZA 4YK0A 5EWHA 5C7NA 5FG5A 5L99A 4FLPA 4O7AA 5L96A 5E3DA 5JI8A 3DWYA 4A9EA 5D3PA 3SVFA 4HXKA 4QB3A 5EPBA 5CFWA 4MR4A 4XUBA 5CPEA 4A9LA 3U5MA 3HMFA 5F25A 5DYXA 3U5OA 3UVDA 4ZC9A 5H1UA 5LUUA 4NRAA 4IOQA 4Z93A 3U5KA 1JM4B 4QR4A 4QSUA 5CU8A 2R0VA 5CUGA 3K2JA 4WIVA 5CRZA 4IORA 5CP5A 5E3GA 4UIUA 2YEMA 4UIVA 5ENCA 4UIWA 3S91A 3MB4A 5ENFA 5C87A 4GPJA 3LQIA 5FFWA 5DFCA 3Q2EA 3UW9A 5EK9A 5F61A 5F63A 4YC9A 4UYHA 2F6NA 5EICA 5FE4A 4YYGA 5ENGA 5FBXA 5HFRA 2R0YA 4O77A 5C4QA 4A9IA 4Q0NA 5A85A 3DAIA 4J3IA 5E7DA 5E9LA 4CUPA 4F3IA 5CQ3A 5FE0A 4NR8A 3FKMX 3MB3A 5FE1A 5LJ1A 2YELA 4CFLA 5I40A 3D7CA 5E74A 4YBSA 5ENJA 5A5RA 5E9KA 4O71A 3G0LA 5L98A 4YH4A 5TB6A 4BJXA 5EISA 3Q2FA 5I83A 5C85A 4N4GA 1X0JA 5FB1A 2RNXA 5TCMA 2WP1A 1WUMA 5DKDA 5DKCA 5FDZA 4UYGA 5HLSA 3ONIA 5COIA 4TZ2A 4YYMA 1E6IA 4A9OA 4YYDA 4BHWA 3P1CA 5D24A 4QEVA 5LJ2A 3AQAA 2G4AA 5F3AA 2DATA 5HFQA 4IOOA 4TYLA 5FE8A 4LYSA 5FFYA 4LR6A 5DFDA 4YYHA 5IGKA 3O36A 4N4HA 4IR5A 4O70A 4HXNA 4MEOA 4RVRA 4CFKA 3LQJA 3IU6A 4QNSA 4CL9A 4NYVA 4TU4A 1EQFA 5CQ5A 4YAXA 5FE3A 4ZQLA 5H1TA 4TTEA 4YBMA 2RFJA 5CUAA 2L85A 2RO1A 5D26A 5G4RA 5I1QA 5C8GA 5IGLA 5DLZA 4YH3A 4YABA 5ETBA 5K29A 5HENA 4NUCA 5FFVA 2DWWA 4QSXA 5AD3A 4HBYA 4QSPA 4QY4A 4PKLA 2NXBA 5ENEA 4J0RA 5DYCA 4UITA 4WHUA 4ALHA 5D7XA 5EWVA 3GG3A 2OO1A 4O7FA 4KCXA 4UYDA 5G4SA 5D3JA 4LRGA 5HEMA 5ENBA 4ZW1A 4NYXA 5F36A 2DVSA 4O74A 3QZSA 5KU3A 4QYLA 4QSTA 5II1A 5FE9A 3ZYUA 2GRCA 5CQTA 5HQ6A 2D82A 4QSWA 2R0SA 2YQDA 5I7XA 2E7NA 4C67A 4BW1A 4HBVA 4A9NA 3SVHA 2LSPB 4QYDA 5EV9A 5FG6A 5L8UA 3I3JA 4NS5A 5LKUA 4MR3A 4O75A 5EP7A 4LYWA 5CUCA 4A9KA 5LVQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UYEA 3MQMA 4O76A 5CZGA 4NUDA 3U5NA 4LC2A 5CQ7A 4CUUA 4Y03A 5D3TA 5EA1A 4QUTA 4QZSA 5E9MA 5I29A 4UIYA 4YATA 5BT3A 5D3HA 4DONA 5DFBA 5C89A 5CQ6A 5FE5A 3U5PA 5EI4A 3O37A 5EQ1A 4N4IA 5I80A 4NR7A 2N9GA 5F62A 2OSSA 5EPSA 5CQ8A 5D3RA 4HXMA 3QZTA 3UV2A 2MJVB 5EWWA 4J0SA 5CTLA 5ENHA 4MEPA 4Q0OA 5AMEA 1ZS5A 4NQMA 4Z1SA 4YY6A 5EM3A 4YBTA 5L8TA 2DKWA 4IR6A 5HCLA 5DYAA 3JVJA 4LDFA 3JVKA 4C66A 4YYKA 5LJ0A 4MR5A 5A5OA 5E9IA 5D3LA 4KV1A 2RNYA 4O7EA 4XYAA 5F2PA 3LQHA 4QSVA 5EGUA 4IR3A 4O78A 4TZ8A 4OUFA 4YYNA 2I8NA 1F68A 2YEKA 4YY4A 4LYIA 5HJCA 5HRWA 2KTBB 5D3SA 4E96A 5FG4A 3AADA 2WP2A 4A9HA 5AMFA 3MUKA 4QEUA 5E9YA 4HXSA 4QR3A 4NQNA 5IGMA 3UV4A 4OGIA 5D25A 4WHWA 4O72A 5F1HA 5HRVA 5HRXA 3IU5A 2L5EA 3MULA 4N4FA 5E0RA 5EU1A 5BT4A 3UVYA 4CUSA 4HXPA 5HM0A 4HBWA 3VKHA 4TS8A 5EVAA 5CRMA 5EPRA 4QC3A 5KTXA 2DVVA 5IBNA 3TLPA 5II2A 3G0JA 5CUBA 5I88A 4YADA 5F5ZA 5IG6A 4QSSA 4BW3A 2L84A 4YYJA 4PTBA 2RI7A 4TQNA 1N72A 5I89A 3P1FA 5I86A 3UVXA 5ACYA 4HXLA 5DY7A 4QBMA 5EWDA 5DLXA 5EWCA 4QUUA 4XY8A 3LJWA 5I7YA 2EJNA 3HMEA 3JVMA 3S92A 4PCIA 4AI6A 5CS8A 4LZ2A 5ENIA 4PY6A 3P1DA 4TT2A 5FH7A 4NR9A 2H60A 4HXRA 4MEQA 4TU6A 4O7BA 4UYFB 4XY9A 5CQAA 2RS9B 4BW2A 2R10A 4UIXA 5DX4A 4IR4A 2D9EA 4NR4A 5HQ7A 4QR5A 3D1DA 4NYWA 2I7KA 5D3NA 4CUTA 3U5LA 4MENA 5IIDA 4NUEA 3P5OA 4A9MA 5IGNA 4NR5A 4UYFA 5A5QA 5KHMA 4KV4A 3U5JA 2FSAA 5A5SA 4BW4A 5L97A 4UIZA 3QZVA 3MXFA 5A7CA 4PS5A 5ETDA 5A5NA 5DYUA 5A82A 4CUQA 1JSPB 4X2IA 5LVRA 3NXBA 5HELA 4NRBA 5KTUA 2YW5A 5LKXA 4TT6A 4A9FA 4Z6HA 3HMHA 3O35A 1WUGA 3UVWA 5A81A 4QSRA 5LKTA 4HXOA 2DVQA 4NXJA 5H85A 5H1VA 5A5PA 5F1LA 4NRCA 4OGJA 3LXJA 4LZSA 4ALGA 2YYNA 4PCEA 4AKNA 3JVLA 2E3KA 5CUDA 4HBXA 4XUAA 5F60A 3SVGA 5J0DA 4LZRA 5E9VA 5FE2A 5FB0A 5DBMA 4A9JA 4N3WA 5BT5A 2E7OA 4CURA 5AD2A 5HQ5A 5KO4A 5KTWA 3O33A 2YDWA 4Z1QA 5D0CA 4J1PA 3P1EA 5CY9A 5CUEA 5A83A 2RNWA 5FE7A 5FH8A 4Z6IA 5FH6A 4O7CA 3UV5A 4YYIA 4QSQA 3O34A 5DKHA 4QC1A 2OUOA 4QEWA 4NR6A 4CLBA 3RCWA 5FE6A 2F6JA 5CGPA 5DW1A 4TT4A 5CQ4A 5DW2A 5E73A 5JWMA 2DVRA 4MR6A 5LKZA 4YK0A 5EWHA 5C7NA 5FG5A 5L99A 4FLPA 4O7AA 5L96A 5E3DA 5JI8A 3D1BA 3DWYA 4A9EA 5D3PA 3SVFA 4HXKA 4QB3A 5EPBA 5CFWA 4MR4A 4AKHA 4XUBA 5CPEA 4A9LA 3U5MA 3HMFA 5F25A 1PUOA 5DYXA 3U5OA 3UVDA 4ZC9A 5H1UA 5LUUA 4NRAA 4IOQA 4Z93A 3U5KA 1JM4B 4QR4A 4QSUA 5CU8A 2R0VA 5CUGA 3K2JA 4WIVA 5CRZA 4IORA 5CP5A 5E3GA 4UIUA 2YEMA 4UIVA 5ENCA 4UIWA 3S91A 3MB4A 5ENFA 5C87A 4GPJA 3LQIA 5FFWA 5DFCA 3Q2EA 3UW9A 5EK9A 5F61A 5F63A 4YC9A 4UYHA 2F6NA 5EICA 3ERRA 5FE4A 4YYGA 5ENGA 5FBXA 5HFRA 2R0YA 4O77A 5C4QA 4A9IA 4Q0NA 5A85A 3DAIA 4J3IA 5E7DA 5E9LA 4CUPA 4F3IA 5CQ3A 5FE0A 4NR8A 3FKMX 3MB3A 5FE1A 5LJ1A 2YELA 4CFLA 5I40A 3D7CA 5E74A 4YBSA 5ENJA 1ZKRA 5A5RA 5E9KA 4O71A 3G0LA 5L98A 4YH4A 5TB6A 4BJXA 5EISA 3Q2FA 5I83A 5C85A 4N4GA 1X0JA 5FB1A 2RNXA 5TCMA 2WP1A 1WUMA 5DKDA 5DKCA 5FDZA 4UYGA 5HLSA 3ONIA 5COIA 4TZ2A 4YYMA 1E6IA 4A9OA 4YYDA 4BHWA 3P1CA 5D24A 4QEVA 5LJ2A 3AQAA 2G4AA 5F3AA 2DATA 5HFQA 4IOOA 4TYLA 5FE8A 4LYSA 5FFYA 4LR6A 5DFDA 4YYHA 5IGKA 3O36A 4N4HA 4IR5A 4O70A 4HXNA 4MEOA 4RVRA 4CFKA 3LQJA 3IU6A 4QNSA 4CL9A 4NYVA 4TU4A 1EQFA 5CQ5A 4YAXA 5FE3A 4ZQLA 5H1TA 4TTEA 4YBMA 2RFJA 5CUAA 2L85A 2RO1A 5D26A 5G4RA 5I1QA 5C8GA 5IGLA 5DLZA 4YH3A 4YABA 5ETBA 5K29A 5HENA 4NUCA 5FFVA 2DWWA 4QSXA 5AD3A 4HBYA 4QSPA 4QY4A 4PKLA 2NXBA 5ENEA 4J0RA 5DYCA 4UITA 4WHUA 4ALHA 5D7XA 5EWVA 3GG3A 2OO1A 4O7FA 4KCXA 4UYDA 5G4SA 5D3JA 4LRGA 5HEMA 5ENBA 4ZW1A 4NYXA 5F36A 4AKGA 2DVSA 4O74A 3QZSA 5KU3A 4QYLA 4QSTA 5II1A 5FE9A 3ZYUA 2GRCA 5CQTA 5HQ6A 2D82A 4AKIA 4QSWA 2R0SA 2YQDA 5I7XA 2E7NA 4C67A 4BW1A 4HBVA 4A9NA 3SVHA 3VKGA 2LSPB 4QYDA 5EV9A 5FG6A 5L8UA 3I3JA 4NS5A 5LKUA 4MR3A 4O75A 5EP7A 4LYWA 5CUCA 4A9KA 5LVQA
chains in the Genus database with same CATH topology
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