4TVEA

Structure of the first two thioredoxin domains of naumovozyma dairenensis eps1p
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
SPEGFPKPLTGSTFDNEMKNGLHIVEFFSPYCHHCKSLAPIWEKTWESFHEEGSKLNITLSQVNCVEDGDLCSKENIEYFPYIKLYGPSGFIKNYDGARKEEAFIKFARKEALDPLNVDISHVESQSILLSKLEFAKYLAGKGKDPILISFWPTNEMKNSDDRIAFENCADCTTFQRAWKMLSKNLLADGVLTGHMNCEENPLICNELGFGELSKIKNHRSDRVPRVALVLPNRATNNLFIFKGDIASPLSQYQDFATRTYAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The eps1p protein disulfide isomerase conserves classic thioredoxin superfamily amino Acid motifs but not their functional geometries.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Naumovozyma dairenensis
molecule keywords Naumovozyma dairenensis Eps1p
total genus 79
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature ec 5.4.3.1: Deleted entry.
pdb deposition date 2014-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tveA01
1O6JA 3CSIA 4CW9A 1JZRA 4AGSA 2FWHA 3ME7A 2CA8A 1T4ZA 1SD9A 2GLRA 3P90A 2VO4A 3QFAC 1NSWA 5KN3A 2C8UA 1J08A 2QKEA 1XXUA 1T7PB 3I69A 1X5CA 1Q98A 3M9KA 2VOCA 1ST9A 2R37A 4IW9A 4OCFA 4TVEA 3RAZA 1G6WA 1C72A 4MZCA 3BJ5A 3BCIA 4EDZA 2PU9C 1F3AA 4O32A 3IHQA 4K7NA 4ML6A 5JCGA 5A4UA 1KTEA 1U3AA 4PXOA 4I6XA 1K0OA 3VWUA 2R5GA 4XTSA 3TKPA 3EURA 5J9CA 4IS0A 1R5AA 1GTUA 1ZL9A 3GL5A 4PNGA 2IMIA 1RQMA 4ECJA 1K0MA 1A0RP 5DCGA 4Q5FA 2CV4A 2OE1A 2LV3A 3SWLA 4KW6A 1X9MB 3KH9A 2FUG2 2ZUPA 2D2ZA 1QK8A 4ZB8A 2WS2A 2I1UA 3K8NA 3ZVJA 1URMA 2B6MA 1VRSD 1THXA 3WYWA 3US3A 3LYPA 4F0CA 3RBTA 4ZBDA 1FB6A 4XIHA 3ZIVA 4QL9A 3Q74A 4OWYA 2LUSA 1OVNA 2C1YA 4ZIJA 5DJLA 3A2XA 3IOSA 2O85A 4GWRA 4I97A 1UN2A 2F9SA 4MLYA 2CQ9A 4XS6A 3MNGA 4AF2A 2H30A 4DSSA 2VUPA 4XRAA 1TKDB 2OBIA 4K8MA 4F03A 4ZL7A 5AISA 2HFDA 3C71A 1PL1A 3GRXA 4BL7A 4NHZA 3ZZXA 2HNLA 3IRAA 2L5OA 2HRNA 4EO3A 1WIKA 2PGTA 1X9SB 4MF5A 4YQVA 2FWGA 4KDUA 4O5RA 5B6MA 3EU3A 2H1BA 1T3BA 4TXOB 3S9FA 1AUCA 1PX6A 2YV7A 4POBA 3WD6A 4EXJA 3MSZA 2K6VA 3M9JA 3APQA 3ZTLA 4YAVA 3F3QA 1SYRA 2RLIA 3J7Yb 2IIYA 2MMOA 3CXGA 4WR5A 2HXKA 1TRVA 5EPFA 2X99A 5DAKA 1TJDA 2JACA 3EMPA 2H6YA 3N5OA 3F0IA 2F3MA 1Z5YE 3GIXA 3HCZA 1SKRB 1YF1A 4PURA 3BOAA 3VI5A 4KDXA 1OE7A 3F4TA 4PNFA 5D9XA 3G9BA 4POLA 4GCIA 3IE3A 1A0FA 3DRNA 5LNKe 3GH6A 1NW2A 3ZVJD 4N0VA 5HR2A 5KEJA 4K0GA 2VCVA 1GL8A 1M99A 2V1MA 4EVMA 2E7PA 6GSXA 1EWXA 4L0WA 1G7OA 3IDVA 5DDLA 3DMLA 3GHAA 3HJPA 1QQ2A 4XS4B 2MYGA 4K0NA 2O7KA 2K8SA 2PMTA 4K7OA 1LJRA 1QXHA 2PWJA 3FR3A 2OE0A 3FHKA 4ULXA 4WR4A 3ZRDA 1EP8A 2LTKA 4Q5RA 1OKDA 4PQHA 1DUGA 1TU8A 3GX0A 3JCML 1EV9A 4AJ6A 1CQGA 5CRDA 3ZMLA 4WETA 1S3AA 4ZL8A 4NXIA 1BAYA 2DLXA 1SENA 4JR6A 2YWIA 2K18A 1OKTA 1XPVA 2KLXA 2GT5A 2GS3A 4RQXA 2QSIA 1GTAA 7GSSA 3E9JB 5JWQB 2GSRA 2H0IA 2F8AA 3GKKA 3IA1A 3EU4A 1JHBA 5ECQB 3UBKA 5ENUA 1KBNA 1S3CA 1YQ1A 1ON4A 3DEXA 3TRXA 4JBBA 2REMA 2YCDA 3TJFA 1MTCA 1R4WA 1YJ6A 4LMVA 5ECLB 3FRCA 2GZYA 1RW1A 3GTUB 5G5EA 2FLSA 2LS5A 3RHBA 3P2AA 2DC5A 5GSTA 4P3YB 4FH8A 3KH7A 1AXDA 3C1SA 5DQYA 4IELA 2EC4A 1B48A 3PH9A 1X0RA 3KXOA 5ID2B 3TKSE 2M80A 2RM5A 3W6GA 1MEKA 5D9TA 4J2FA 1VF4A 3FZ5A 9GSSA 1PGTA 2EIRA 1S3DA 1TP9A 1GSQA 1T00A 3GFKA 4HJ2A 3KP9A 5EL8A 3TDGA 3UVTA 4IP1A 2OE3A 1W89A 2VL9A 3TJBA 2VCQA 1PD21 4JU5A 2V41A 1HD2A 1TK5B 1TU7A 1ABAA 2CX3A 4HS1A 1WPIA 2GQLA 3F4SA 4WF4A 4EC0A 4Z7XA 2HSYA 3DWVA 2CZ2A 20GSA 2B1LA 1K0DA 2B3SA 3GUSA 1T4YA 3D4TA 4KCEA 1I5GA 2H0GA 1X5DA 3FW2A 4TR0A 5G2ZA 1U6TA 1XW5A 3L9SA 3ME8A 1QMVA 1GLPA 3H93A 1VF3A 1B8XA 5ECNB 1Z7PA 4TRXA 2VD0A 5JWOB 3GN3A 2YP6A 2H66A 3GA4A 1XOBA 4J56E 5DALB 4PX1A 3ZIJA 2V32A 2VCTA 3GSTA 3CYNA 2PVQA 1EGRA 2KOKA 2RIIA 1TDIA 2H71A 4PQIA 1EEJA 1A8YA 3GNJA 4K2DA 3BD2A 1EV4A 1O73A 11GSA 4QQ7A 1B9YC 4KDYA 3LSZA 3F3RA 5IMAA 1V57A 2J23A 1Q4JA 5J3RA 2P0GA 4MMMA 6GSUA 4K7IA 3WT2A 1MDJA 2N5FA 3GX8A 1K0BA 4TKYA 3QDNA 1FVJA 1CQHA 2JU5A 2CVDA 2VL2C 2B5XA 3D4MA 3HZ4A 5C00A 3KTBA 5F06A 4V2MA 4GF0A 4TXVA 3SBCA 2H70A 3WGDA 3RHCA 2HZFA 2GT6A 3G7YA 3WT1A 3ZYWA 8GSSA 3DVWA 1ACVA 3HKRA 2MBTA 3CTGA 5H5SA 1V58A 4MK3A 2MMNA 2AUVA 3TGZA 1W4VA 2H19A 4ZL9A 2PN8A 3DKSA 5H5RA 5CREA 4YQUA 1M2AA 1K0AA 1K0NA 3GURA 2HI7A 5ECMB 1JZDA 1O7UA 4E8HA 14GSA 3FK8A 3LG6A 5J9BA 4ZB9A 4MF7A 1GTBA 1PX7A 1OC9A 2CZ3A 5DBQA 3EMXA 3TUEA 5IMDA 4EKZA 3UIWA 1FB0A 5HFKA 2JSYA 2C3TA 4O7HA 3O3TA 1AQWA 1GSUA 4JE1A 3TOUA 4Q5NA 5LD0A 3HXSA 4L5OA 3FZ9A 3V1WA 5CO3A 3QPMA 4MPGA 2L6DA 4YQMA 4MJCA 1FOVA 3H79A 5B8BA 1HQOA 2IN3A 4N30A 3F4RA 2HLSA 3CRTA 2C0EA 4NPBA 4V2NA 2DMMA 3BCKA 2FA8A 2IFQA 2GTUA 2ES7A 1GSSA 4FYCA 2LNTA 1XFLA 3ZL5A 4L8EA 1FO5A 1O85A 3FKFA 2TIRA 4GRFA 2IL3A 18GSA 2WDUA 2HT9A 2IPAA 5ECHB 2YWOA 5L71A 4AJ7A 1Z9HA 1J0FA 1ML6A 1XWGA 5HR1A 5J4UA 3WGXA 1O81A 3MDKA 1ERUA 1GUMA 1PSQA 4ID0A 4TW5A 4MH3A 1AAZA 3VPQA 3IK9A 1GUKA 2WRTA 4HEA2 4IP6A 1XWCA 4GSSA 2GQMA 2H6ZA 4GTUA 4Q5QA 4TR1A 1TRWA 5IMZA 5D8IA 1SK0A 2I81A 2C3QA 3A3TA 4F82A 5IMVA 1G7EA 4KH7A 1PQNA 4ZB6A 2E2MA 2R4VA 3GSSA 3LXTA 1A23A 2V2GA 2LRTA 5CYYA 2B5EA 1M9BA 3IAS2 2C0GA 2KP2A 1LBKA 3ERGA 2RM6A 2YJHA 1M0UA 1FVKA 2VAFA 1EZKA 4XHMA 4GSTA 3QAGA 1AC1A 2VLVA 6GSWA 3QD9A 5IIZA 1TRSA 1XW9A 2YANA 3A2WA 3Q19A 1TI1A 1ZYEA 2EIQA 3KJYA 1Y6EA 4KCAA 2DJKA 1VGLA 2H1AA 5JCWA 2AJQB 3W8JA 4MPFA 5CAXA 4ZXGA 2P5QA 1MD4A 3P7XA 5B7CA 5LCZA 2DJ0A 2C0DA 1EOGA 2N5AA 3QFBC 5G1KA 4LL1B 2YNXA 5GSSA 4PUFC 3L9VA 2KUCA 3TB2A 3HHVA 3KIJA 1XCCA 4IHUA 1N2AA 2DIZA 3G7JA 4TR4A 5ABRA 5JWRB 2K8VA 3CMIA 3QCPA 3DVXA 4LMWA 2FD3A 1GSDA 3GKXA 4IKHA 1WOUA 1XW6A 3J7Yk 1U3IA 2YJ7A 3PGTA 3VI7A 3O6TA 2BMXA 3NIVA 4N0ZA 1SL0B 1HNCA 3E0UA 4IGJA 1TTZA 4TOPA 3HA9A 3EYTA 3C73A 5D9WA 2PERA 1SL1B 2C4JA 2GGTA 4ACSA 1B4PA 3CSJA 3VWWA 4DSQA 4QL7A 4IQ1A 4X43A 1JLVA 5IMFA 1K0CA 1B4QA 3CBUA 3LJRA 4XS1A 5INYA 5CNWA 5IMCA 3H4KA 1WMJA 1BQ7A 3HYPA 4MJBA 2HZEB 1NHYA 2H72A 4OCEA 2F51A 3ZFLA 1VF2A 4D73B 3KGKA 10GSA 1AQVA 3ERFA 1Z6MA 1JLWA 2LJAA 3L4NA 2VM1A 4HJMA 2GQKA 4ZILA 2L5LA 4I8BA 2YZUA 1WWJA 2ZNMA 1GULA 1AW9A 2NBSA 2M72A 3F9UA 1AQXA 4CDOA 1XIYA 3W8SA 5G5FA 1WE0A 3D0ZA 1BEDA 4V1Ap 4EF0A 5D96A 3WGEA 3TOTA 5ECPB 2JZSA 5FT3A 1PMTA 2DIYA 2KHPA 4MH2A 3VPTA 1GH2A 5B8AA 1GRXA 2MMZA 1BX9A 1GNWA 4KE3A 2L57A 1U87A 5DCHA 4X0XA 2N5BA 3FYGA 3P8WA 3H1NA 2FGXA 3A2VA 4RQRA 2V6KA 3CRUA 5COHA 5DQSA 5EY6A 2OKAA 3IV4A 5F05A 4BWSA 1ILOA 2O87A 1F6MC 1M7TA 2IMDA 3KCMA 3HVSA 4HZ2A 3MWHA 5ECRB 3Q6OA 1KNGA 3NZNA 1EP7A 3LGCA 2GVPA 5JCUA 1A2JA 4PGTA 3QOUA 4J57E 2H1DA 5F8BA 3L9UA 4MJAA 1PA3A 1OC3A 2R3XA 1TK8B 1G6YA 4G9HA 1MDKA 1OAZA 4WBJA 2QC7A 4MCUA 2X64A 3M3MA 2LRCA 3I9V2 1DE2A 3L78A 3GTUA 2E0QA 3ZREA 1F2EA 1VF1A 2YWMA 1UC7A 3N9JA 2G0FA 3IAM2 5E4WA 5ELAA 2TRXA 4OD7A 3VWXA 3DD3A 2HSHA 4GLTA 3D6IA 2AYTA 2VIMA 2ON5A 3HD5A 5ECOB 3FR6A 4HQSA 1JFUA 4POKA 2FWFA 1MDIA 4WF5A 4ZBAA 5IO2A 4XRDA 4OO5A 1BJXA 1FG4A 3Q18A 3KMNA 1B9XC 1HNBA 5IQYA 4HU7A 3PR8A 2IMFA 4OFNA 1IYIA 3FR9A 1TRUA 3QAWA 1GTIA 2H74A 1HNAA 1QGVA 3QMXA 3GYKA 4NV5A 2P31A 3GKMA 4G19A 2QGVA 3HY2A 1V98A 5A4WA 1FHEA 5ECIB 2WB9A 3UEMA 2H01A 1R7HA 2WZ9A 2CVKA 2H73A 2WFCA 2YZHA 4OMVA 1SJ6A 2RUFA 4MABA 3I6AA 3C8EA 3KMOA 3ISOA 4GSNA 2MBSA 4ZBBA 3M8NA 3C7MA 4MF6A 4RI6A 1XWBA 2MMAA 5IPHA 3EC3A 2IFQB 1K3LA 1EEMA 4FO5A 1F9MA 2LEGA 2PBJA 3UJ1A 2H6XA 3KZQA 1O8XA 1YZXA 2X8CA 2AAWA 4WKWA 4DEJA 1YF0A 2YOIA 3KTLA 1V9WA 2X8GA 4KNDA 1XBSA 3ZMKA 3LWAA 3HVVA 3M0FA 2IWTA 2L4QA 4F2IA 3TCOA 1V2AA 3E3EA 3CTFA 5AIXA 3RPPA 3KEBA 3IBHA 3FY7A 1BYEA 1EGOA 2J9HA 3APSA 3LEFA 4GQFA 2LQQA 3F6DA 3MAKA 3ERWA 1FW1A 2WCIA 3ZLPA 4NAXA 2GZZA 4BPYA 2H0HA 4F9ZA 4TR1B 2EIOA 3FEUA 2I4AA 1XVQA 4IVFA 3H8QA 2KP1A 3FZ4A 1O8WA 4HOJA 5IPGA 4DSSB 5KN2A 2Z9SA 2CT6A 1M9AA 1ZCPA 2A4VA 2GSTA 1SU9A 3DIEA 2X8HA 2JL4A 2VLUA 4JR4A 2PUKC 2B7JA 4EDYA 2IJYA 3M1GA 22GSA 3U6VA 3LXZA 1GWCA 2JZTA 3UL3A 5HFIA 2M46A 2NTOA 4YH2A 1YDKA 2XBQA 3OR5A 2H1GA 2I3YA 2OACA 2VD1A 3GV1A 3RPNA 2L4CA 5DAKB 5A4VA 1AIUA 1A24A 3TRPA 5ELGA 1SJIA 5FWGA 1E6BA 2VM2A 1ERTA 2YV9A 1Y25A 2O8VB 4LA1A 2NDOA 2XC2A 3IXRA 3TRQA 1WRYA 1X5EA 4FIWA 1SK2A 1YEXA 5E59A 1LU4A 1OYJA 12GSA 4EE0A 4PQ1A 2YWNA 5C04A 4LL4B 5IOXA 3QAVA 5ECSA 3IK7A 2JADA 1V40A 2MZCA 1DBYA 5AN1A 4JRRA 1Z7RA 1K3YA 2A2RA 3IPZA 5F0GA 4ILFA 3VLNA 2DJ1A 1TXXA 2H76A 4G2EA 1GSFA 3EVIA 1YY7A 3HJMA 4KAEA 2CAQA 2V6OA 1WP0A 4EL1A 4BVYA 1N8JA 3R2QA 3GKNA 1Z3EA 2AHEA 3EWLA 3TKSA 4DSRA 5CRWA 3D21A 4NHWA 3LFLA 1XVWA 2XPEA 2GSSA 1T8EB 1M2DA 2CX4A 1KEBA 2DJ2A 2NVLA 1A8LA 1BG5A 3IR4A 1T1VA 3F63A 4ECBA 2CVBA 19GSA 4K1FA 4RUVA 3APOA 5IO0A 2VCZA 3TKRA 3KM6A 3KD0A 4HDEA 1DSBA 5IM9A 1GNEA 4HUAA 4HU9A 6GSVA 2B5YA 2LRNA 3TKSC 2FNOA 1WJKA 4TXOA 2HYXA 3EINA 3U5RE 2FY6A 4IBPA 2VCWA 1YKCA 5J41A 3CSHA 4L0UA 5G1LA 2IMKA 4NWYA 4MZBA 4IQAA 3ZITA 1THOA 1USBA 2LKUA 16GSA 4TN8A 1TW9A 3UMAA 1RK4A 2F8FA 4JZQA 4X1UA 5AGYA 1YKAA 2DSAA 1GLQA 3GMFA 4MA9A 2DBCA 1F3BA 4IJ3A 5KN1A 2ON7A 3AY8A 5F07A 1GP1A 3G7IA 5KN0A 2L59A 4GQCA 4IJIA 1SD8A 2C3NA 1ZMAA 1SKSB 4BVXA 4V1Ag 2RUEA 2K9FA 4H86A 1JZOA 4MZWA 3RDWA 1U88A 2C80A 1J9BA 5CRGA 4O92A 3UAPA 1R5PA 4AJ8A 1PN9A 5B6NA 3QR6A 2FCHA 4MDCA 1FAAA 4L5LA 4RI7A 2ZCTA 5G30A 5H5QA 4WXTA 2C0FA 2OJLA 2OA7A 3VURA 1A2MA 1XWKA 4OFMA 4KGIA 3O76A 4YAPA 4XS4A 3DYRA 2LSTA 4ISDA 2BTOT 1K3OA 3HJOA 1SYXA 1TI3A 1X9WB 2G2QA 4TR3A 2DJJA 5GZZB 4BWQA 3HVXA 1I9DA 4HZ4A 3EE2A 1UVZA 4KSOA 2B7KA 2JZRA 2H8LA 1Z6NA 1OC8A 1GSYA 1SJZA 2WULA 1ZGNA 2FWEA 4NMUA 1XZOA 2GZPA 4LLRA 2HZEA 2OBKA 4FYUA 3UBLA 2WGRA 4F0BA 4D73A 4KA0A 4DVCA 1H75A 3HZ8A 2O89A 3GH9A 3TJJA 1PKZA 1M2BA 1UA5A 2OADA 1A2LA 3C1RA 3ED3A 5GAPD 2DJ3A 3F8UA 5HFGA 2DMLA 1ERVA 4I5QA 4OFTA 2YN1A 1GUHA 3VFIA 5J5NA 1F37A 5HR0A 4ML1A 4G10A 3GL3A 1SKWB 4EUYA 2B1KA 3NOFA 5HQPA 1PKWA 2LQOA 5EVOA 3VK9A 4MJEA 2HRFA 1SK1A 2XBIA 4V2LA 1OE8A 2LJKA 3LORA 2LJRA 1ZOFA 1XWAA 2H75A 3BBYA 4BA7A 5A5KA 1SL2B 4I2TA 1NHOA 3TKQA 3F6FA 4I2UA 3ZFBA 2E2GA 4KB3A 3L0HA 4KUNA 4XCSA 4K6XA 3FZAA 2L6CA 2GSQA 1QFNA 2GDRA 2PPTA 4CHSA 1EOHA 2A2SA 1ZYQB 6GSTA 5CRHA 4KSMA 2LNSA 2BJXA 13GSA 5ID2A 2IMEA 1PL2A 1YEPA 3KP8A 3UOMA 6GSYA 2AV4A 3HDCA 5D93A 2CAIA 4ECIA 3D5JA 2XHFA 4JEDA 2FHEA 4GXZA 2VL2A 3VWVA 3TJKA 5GAND 5DJMA 4HI7A 2NPBA 1OC9B 1XOAA 3TJGA 2YPMA 1G0TA 2VCXA 2PVOC 2VL3A 3LYKA 4WEYA 3D22A 5HR3A 3UVHA 2WJUA 3A5WA 5IOWA 3I43A 5D9VA 2TRCP 4HQZA 4NV2A 5G31A 4KX4A 5FHIA 2VLTA 1QUWA 2R2JA 4POMA 1DE1A 2XPDA 2AB6A 1NM3A 1TOFA 1H4OA 5AIVA 2ALBA 5D73A 1GSEA 17GSA 4ECCA 4MP4A 3PINA 4WBRD 1HYUA 1ERWA 4FYBA 1ZZYA 5DALA 4IN0A 4N11A 2FA4A 4N10A 1TK0B 1MD3A 2P5RA 1IYHA 1R26A 4K9ZA 4E8EA 1PRXA 6GSSA 4PUAA 1JZWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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