The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDEFKHLKTEAEMKASEDLKEHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATEHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Horse heart myoglobin mutant (K45E/K63E/K96E) with Zn-deuteroporphyrin IX
rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Equus caballus
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| total genus |
59
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ARK A; 1B86 A; 1Q1F A; 5EU2 A; 5CNE A; 5JDO D; 1O16 A; 5JGG A; 4N7P B; 2LHB A; 5HLU A; 2HBF B; 3ECL A; 1EBT A; 3DHT A; 5CN6 A; 3NG6 A; 3G52 A; 2EKU A; 1YEO A; 1GVH A; 1KFR A; 2W6V B; 4U8U C; 3TM9 A; 1YOG A; 2D2N D; 1IRC A; 1YEU B; 1Y7D A; 1QXD B; 1MLG A; 3UHT A; 3SDH A; 1A6M A; 2HBD B; 1SDL A; 2WTH A; 1MLU A; 5HLX A; 1Y4R B; 1DXD A; 1BZR A; 1J3Z A; 1O1P B; 1A6K A; 3D17 B; 3K8B A; 1XQ5 A; 5CMV A; 2IN4 A; 3UHU A; 2HBS B; 1LH2 A; 3FH9 A; 3P5Q B; 5CND A; 1Y0T A; 1VXD A; 2H8F A; 4H2L A; 2C0K A; 1Y8I A; 5D5R A; 4NK1 A; 4HRR A; 2ZS0 C; 3D1A B; 2RI4 B; 1HCO A; 1JP6 A; 1UIW A; 2R4X A; 2H35 B; 1JF4 A; 3WCW D; 2G11 A; 3WCV C; 5AZQ A; 1MWD A; 3HYU A; 3KUN A; 5CN4 A; 2O5O X; 1YHU D; 1JZL A; 4MAX A; 2ZLX B; 2BKM A; 1HBH B; 1Y5J A; 1PMB A; 2W6V A; 3LQD B; 3PEL B; 1CG8 A; 1MBA A; 1X3K A; 3WFT A; 4TWV A; 5F0B A; 4DWT A; 1LA6 A; 1YCB A; 2BLH A; 1XZU A; 2HBD A; 2R1H B; 1S0H B; 1Y4R A; 1Y83 B; 1R1Y B; 3S1J A; 3QM5 A; 1XCH A; 2MGF A; 3GQG B; 4M4B A; 2PGH A; 3MKB B; 3D17 A; 4MQK B; 1YCA A; 2AA1 B; 3NFE B; 1IBE B; 1SHR B; 1DWS A; 1HAC A; 1EWA A; 3LB3 A; 1DLW A; 4F6D A; 2IG3 A; 1F5O A; 1FSX B; 1G9V B; 2RI4 A; 1A01 B; 2GL3 A; 2G0V A; 1MTJ A; 2H35 A; 1YGF B; 4ZVA A; 3UBC A; 2AV3 A; 5CN8 A; 3WHM B; 1DXU B; 1RTE A; 2QSS B; 1LHS A; 1FN3 A; 1MBS A; 1DUO A; 2D2M D; 2H8D B; 3PI9 B; 3WCT C; 2W31 A; 2ZFO D; 2ZSQ A; 2BWH A; 2B7H B; 1V75 A; 3PEL A; 2ZLV A; 1JL6 A; 2BMM A; 4MXK A; 1A9W A; 1RQ4 A; 3WFW A; 2NRL A; 1YEV B; 3OZW A; 3QJB B; 1DKE A; 1GBU A; 3PT8 B; 1S0H A; 4FH6 A; 1XZ7 A; 5C6Y A; 3MKB A; 4MQK A; 1MBN A; 1G09 A; 1ECO A; 1YHR B; 3KMF A; 4MQC B; 3UI0 A; 1OJ6 A; 3KUO A; 4XDI A; 1SHR A; 1Y8H B; 3G46 A; 2FAM A; 1QSI A; 1BZZ B; 1DXV B; 1FSX A; 1G9V A; 4X0L A; 2ZSO A; 107M A; 1IRD B; 1CH7 A; 2QFK A; 4MBA A; 1NWI A; 2LH5 A; 3B75 B; 1A01 A; 1CQ2 A; 3O89 A; 1RQA B; 4N8T A; 3A2G A; 1MYM A; 2AUP A; 1UC3 A; 1LH6 A; 3UBV A; 2GKN A; 2MHB B; 3QZZ A; 1Y8W B; 3ORD A; 4IRO A; 3WHM A; 1DXU A; 1GLI B; 1J7S B; 3QJD A; 2V1J A; 1CH9 A; 1YEN A; 2H8D A; 3QJE B; 4F6F A; 1Y35 B; 3ZJH A; 5C6E B; 2GTL B; 1YZI A; 3QMA A; 2GDM A; 1YEV A; 1MYF A; 1W92 A; 3S65 A; 4QAU A; 4GZG A; 3UHW A; 1BIJ B; 1J40 B; 1YIH B; 1A9W E; 3GQR B; 1MBI A; 1RVW B; 1HDB B; 1NQP B; 4DWU A; 5CN7 A; 1LFV B; 3VRF B; 2QLS A; 1DXV A; 1AJG A; 2MGJ A; 3HXN B; 4M4A A; 3PI2 A; 1IRD A; 1GZX B; 2WY4 A; 1Y4B A; 2HBE A; 3B75 A; 1MLN A; 2FRI X; 1RQA A; 5KKK A; 1KR7 A; 3AG0 A; 3MYM A; 5JDO C; 1MOC A; 1Y0A A; 4NK2 A; 2RAO B; 3V2Z A; 3UHK A; 1MWB A; 2ZT2 A; 5EV5 A; 4F6I A; 2DXM B; 1Y35 A; 1Y22 B; 1CG5 B; 1S56 A; 2VYY A; 3ZH0 A; 1LFT B; 1MYH A; 1XXT B; 1V4X B; 1Y46 B; 4NI1 B; 2D2N C; 1O1K B; 1Y4F B; 4ROL A; 1BIJ A; 3WCU D; 1CQX A; 3OJ1 A; 1OUU A; 1J40 A; 1MKO B; 3E55 A; 2HHE B; 3ODQ B; 5EYS A; 1YIH A; 1XZ2 B; 1Y45 B; 1LFQ A; 1YVT B; 1YIE B; 4N7N B; 1QI8 B; 3WFX A; 2D60 B; 1XY0 A; 1C40 B; 3M3A A; 3MN0 A; 1DWT A; 1GZX A; 1MYI A; 3MJP B; 1IT3 A; 1HBA B; 1O1I B; 4HBI A; 1JW8 A; 3ONZ B; 1Y0D B; 1Y4P B; 1J3F A; 2ZLU A; 5HBI A; 3WCW C; 3AQ8 A; 2RAO A; 1F63 A; 4ROM A; 1O1M B; 1RQ3 A; 2R4W A; 4L7Y A; 1MOA A; 2ZSP A; 1C7B A; 4MXL A; 1YHU C; 4MQI B; 1MGN A; 1SI4 B; 1DTM A; 2R4Z A; 1NZ3 A; 3AQ5 A; 2XYK A; 1X9F D; 1Y2Z B; 2MYE A; 1CP5 A; 3OK5 A; 1HBR B; 4NI1 A; 1O1K A; 3RGK A; 3OVU C; 3CIU B; 3UH7 A; 3EDA A; 5CN5 A; 1MZ0 A; 1J3Y A; 4WCH D; 2JHO A; 1YH9 A; 2NSR A; 3ODQ A; 1H97 A; 111M A; 1Y4Q B; 2D5Z B; 1YIE A; 3NMM A; 1HGB A; 2D60 A; 2MGM A; 1Y0C A; 1C40 A; 2EKT A; 3G4Q A; 2MGA A; 3A0G B; 2G3H A; 1G08 B; 1UFP A; 1HBA A; 1RSE A; 4ESA B; 1Y0D A; 1MBO A; 1NS9 B; 3UHE A; 3GDJ B; 1HGC B; 1B0B A; 3PIA B; 1GCW A; 1LFZ B; 2NRM A; 1O1M A; 1DXC A; 2W72 C; 3UHS A; 1LJW A; 1SPG B; 2D2M C; 1SI4 A; 1C7D B; 3DR9 A; 2ZFO C; 1B86 B; 3WFU A; 1OFK A; 4G1V A; 1J7W A; 5EET A; 3R5I B; 1MBC A; 1QSH A; 1Y8K A; 3CIU A; 1A6N A; 4HSW A; 3OO4 B; 1UMO A; 3VRE A; 4U8U A; 2V1I A; 3NG6 B; 1MOH A; 5AZR A; 5EUI A; 4B4Y A; 2D5Z A; 1NXF A; 3NL7 A; 1UVY A; 4UUR A; 3UGY A; 3WR1 B; 1CBM A; 3A0G A; 102M A; 1SDL B; 3K3U A; 2O58 X; 1J3Z B; 1DO1 A; 3UHC A; 1BAB B; 3K8B B; 2ZS0 A; 2DC3 A; 1NS9 A; 1UFJ A; 2QFN A; 1HHO B; 3PIA A; 1VXC A; 1YEQ A; 1LFZ A; 2DHB B; 1MLS A; 1JDO A; 2GNV A; 3WCV A; 3HHB B; 1VXA A; 4HRR B; 1SPG A; 1MLJ A; 5D1V A; 1OBM A; 1HCO B; 1UIW B; 2HZ1 A; 3R5I A; 1MLM A; 1CH5 A; 2MYC A; 3MBA A; 2HCO A; 3A59 A; 3ECX A; 4FWY A; 3OO4 A; 2O5T X; 1JY7 A; 4TWU A; 5ILE A; 4F69 A; 4OOD A; 3HYU B; 3RJN B; 3AT5 B; 5EYJ A; 4F4O B; 1VWT B; 2QU0 A; 5IKS A; 1URY A; 2O5S X; 1MOD A; 1GDL A; 1X46 A; 1Y5J B; 3S66 A; 7HBI A; 1CG8 B; 2OH8 A; 2MYA A; 1CH3 A; 1SPE A; 5CNG A; 4O1T A; 3WR1 A; 4PQ6 A; 3ZJS A; 1LA6 B; 1XZU B; 2VM0 A; 1OUT A; 3GOU A; 1VRE A; 1BBB B; 4M4B B; 2PGH B; 1BAB A; 2ZSN A; 2VLX A; 2BLI A; 1HBS A; 1XZV B; 1HHO A; 1HAC B; 2DHB A; 3VRG A; 4MPM A; 2G14 A; 3IC0 B; 3HHB A; 3TLD A; 3UGZ A; 2Z6N B; 1MLF A; 3MYN A; 4F6J A; 2ZST A; 3WCT A; 1BZP A; 3EOK B; 4ILZ A; 3AT6 B; 5EQM A; 5HAV A; 2GRZ A; 2LH3 A; 4F4O A; 3AT5 A; 2ZWJ A; 1VWT A; 1FN3 B; 3WI8 A; 3WCU C; 1FDH G; 1BVD A; 1HSY A; 1WVP A; 1OR4 A; 4PQB A; 1V75 B; 2ZLV B; 1RQ4 B; 2VRY A; 3UHY A; 5HU6 B; 4FC3 A; 2G12 A; 2SPN A; 4H07 A; 1DKE B; 1GBU B; 1DO3 A; 2XKH A; 1XZ7 B; 1BBB A; 1NPG A; 1G09 B; 3LB2 A; 2BLJ M; 4G51 B; 3E5I A; 1XZV A; 3QM7 A; 1ABW A; 4IT8 A; 1O1J B; 5E6E B; 3HRW B; 2GTL D; 1QSI B; 2QMB A; 3A9M A; 2AUQ A; 3IC0 A; 4X0L B; 1NEJ B; 3AQ7 A; 2Z6N A; 3CY5 B; 3BJ1 B; 1GBV B; 4JYQ A; 1QXE B; 4MQG B; 4N8T B; 2ZSR A; 1COH B; 3PT7 B; 3ECZ A; 1U7S A; 3EOK A; 1X9F C; 3AT6 A; 4IRO B; 4PQC A; 1Y09 B; 3UHN A; 3QJD B; 106M A; 3IA3 B; 1YEN B; 1OR6 A; 5JOM A; 2MGI A; 3G53 A; 1DUK A; 4ODC A; 4HRT A; 1NAZ A; 1YZI B; 4FWZ A; 1MDN A; 2G0S A; 1HAB A; 5CNB A; 5HU6 A; 3S65 B; 3BJ3 B; 4NI0 A; 2HBG A; 1CMY A; 2ZLT A; 2VYZ A; 1SWM A; 4G51 A; 2KSC A; 1Y7C A; 1YMB A; 1O1J A; 5E6E A; 1S69 A; 3HRW A; 3UHD A; 1CIO A; 2QLS B; 4M4A B; 1NEJ A; 3M3B A; 2FAL A; 3UHR A; 3CY5 A; 1Y4B B; 3BJ1 A; 2HBE B; 1GBV A; 1LFY B; 4MQG A; 1QXE A; 2DN3 A; 1M9P A; 3AQ9 A; 1COH A; 3PT7 A; 4TYX A; 1N9I A; 3UHG A; 1YE2 A; 1IOP A; 1Y0A B; 5SW7 B; 2MYB A; 1KD2 A; 1Y09 A; 5MBA A; 4PNJ A; 2D2N A; 2Z6S A; 1ABY A; 1LUE A; 5KDQ A; 4O4Z A; 3FS4 B; 3UHQ A; 3ZJO A; 2G0Z A; 2R50 A; 1UT0 A; 4C44 A; 3BJ3 A; 1A00 A; 1GDK A; 4ROL B; 1A3O A; 2GNW A; 3QM8 A; 3AQ6 A; 3G4W A; 1JZK A; 5M3S A; 2V1F A; 1OUU B; 4O2G A; 5ILP A; 2HZ2 A; 3GKV A; 1LFQ B; 5E29 A; 4WJG 1; 3ZOL A; 1JWN A; 1SDK B; 1JP9 A; 1XY0 B; 1A6G A; 2D5X A; 3W4U A; 1J41 A; 1MLQ A; 1WLA A; 3WCW A; 3G4U A; 2AUR A; 1LFY A; 2VEB A; 1FSL A; 3DUT B; 1YHU A; 2BK9 A; 2ZLU B; 1LH1 A; 5JDO E; 4B3W A; 1K1K A; 5SW7 A; 2ZS1 B; 4ROM B; 1O1O B; 1RQ3 B; 1EW6 A; 4L7Y B; 1F5P A; 1XYE B; 4AVE A; 1C7B B; 2YRS B; 2HBC B; 3FS4 A; 4NXC A; 1VXF A; 3ZJJ A; 1MNJ A; 2MGB A; 4VHB A; 1J3Y B; 1UX8 A; 1YH9 B; 2MYD A; 1DXT B; 3E4N A; 1EBC A; 5AB8 A; 1DO7 A; 1URV A; 2OHA A; 1VXE A; 1OFJ A; 3NMM B; 1HGB B; 1SDK A; 2W6W A; 1Y0C B; 2HHB A; 5HY8 B; 2ZT0 A; 3H57 A; 3PI4 A; 1DWR A; 1Y5F A; 2O5B X; 3DUT A; 4WJG A; 2ZT3 A; 2D2M A; 3QM9 A; 2ZFO A; 4MQH A; 1GCW B; 1A0Z A; 2ZS1 A; 3ZJP A; 1Y0W A; 2NSS A; 1O1O A; 1XYE A; 1LJW B; 4FWX A; 2YRS A; 2HBC A; 1YE0 B; 1J7W B; 1QSH B; 1Y8K B; 1L2K A; 1S5X A; 5B85 A; 1HBB A; 3VRE B; 2AUO A; 4U8U B; 1NWN A; 1DXT A; 3MJU B; 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2O5M X; 1HGA A; 3D7O A; 2CMM A; 3OGB A; 1V4U A; 1J52 A; 3OO5 B; 1BUW A; 2OLP A; 4FC3 B; 1V4W A; 1FHJ A; 3QM6 A; 5E83 B; 1YOI A; 1RPS B; 2OIF A; 1XZ5 B; 3GKT A; 1CH1 A; 2LH6 A; 1AZI A; 3D4X A; 3ZHW A; 3BOM A; 1BZ0 A; 3QJC A; 1ABW B; 3ZJL A; 3ED9 A; 3TM3 A; 1NPF A; 3IC2 A; 1HV4 A; 2ZSZ A; 2QMB B; 1X9F A; 3ASE A; 3UHB A; 1NZ4 A; 3GK9 A; 1VXG A; 1T1N A; 1I3D A; 2MBW A; 1AJ9 A; 1Y5K A; 4N7O B; 1BVC A; 3M39 A; 1DO4 A; 3VAU A; 4FH7 A; 1Y7Z A; 1S5Y B; 1A4F A; 5HLQ A; 2M6Z A; 3HF4 B; 1CO8 A; 4DC7 A; 1DTI A; 1MNK A; 2VHB A; 3LR7 A; 3UHI A; 3EDB A; 4N7P A; 4HSX A; 2HBF A; 4ODC B; 4HRT B; 2EF2 A; 1D8U A; 3OO5 A; 1HAB B; 1F65 A; 4NI0 B; 1JF3 A; 3ARL A; 2G0R A; 5E83 A; 1CMY B; 1RPS A; 2ZLT B; 2O5Q X; 1MLK A; 1XZ5 A; 3HEP A; 2XKI A; 5EOH A; 1YEU A; 1MLL A; 3A5G A; 1QXD A; 1Y7C B; 2NX0 A; 1MYJ A; 3H58 A; 3RJ6 A; 1LH5 A; 4YU4 B; 4H0B A; 1O1P A; 1S6A A; 2HBS A; 3P5Q A; 2DN3 B; 1JEB B; 1M9P B; 3K9Z A; 2ZSY A; 1MNO A; 4N7O A; 2MB5 A; 2WTG A; 1V07 A; 1YE2 B; 5KER B; 1CLS B; 1S5Y A; 2V1K A; 1JP8 A; 1KD2 B; 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