4TXOA

Crystal structure of the mixed disulfide complex of thioredoxin-like tlpas(c110s) and copper chaperone scois(c74s)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
177
structure length
177
Chain Sequence
b'PTGDPACRAAVATAQKIAPLAHGEVAALTMASAPLKLPDLAFEDADGKPKKLSDFRGKTLLVNLWATWCVPSRKEMPALDELQGKLSGPNFEVVAINIDTRDPEKPKTFLKEANLTRLGYFNDQKAKVFQDLKAIGRALGMPTSVLVDPQGCEIATIAGPAEWASEDALKLIRAATG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How Periplasmic Thioredoxin TlpA Reduces Bacterial Copper Chaperone ScoI and Cytochrome Oxidase Subunit II (CoxB) Prior to Metallation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein TlpA
source organism Bradyrhizobium diazoefficiens usda 110
molecule tags Oxidodreductase/copper binding protein
total genus 47
structure length 177
sequence length 177
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4txoA00
3FR6A 1XZOA 7GSSA 1K0OA 4EL1A 1XXUA 1BAYA 18GSA 4XCSA 3PR8A 2VL2C 1AQVA 5IPHA 2GSQA 4KA0A 1TK0B 4O32A 5AGYA 3KCMA 2JZRA 1OE8A 1GL8A 1BJXA 2TIRA 3GNJA 2LV3A 1TJDA 2IMEA 4NV5A 1GUHA 2R4VA 3UARA 1GULA 3DEXA 3I43A 4DVCA 1DE1A 2ON7A 4TN8A 4HS1A 1EWXA 2YJ7A 1WRYA 3M9JA 3MNGA 3HVVA 1A8LA 4AJ6A 2EIOA 5HFGA 3ZRDA 1ZYEA 3A3TA 2GVPA 5DJLA 1GSDA 2YV9A 3PINA 1TKDB 2B5EA 2QGVA 4OD7A 3E9JB 1ILOA 2OE1A 5IMFA 4NAXA 4MCUA 1EP8A 2VD0A 3QAWA 3LSZA 1AAZA 2REMA 3TJBA 2K6VA 2B6MA 2K9FA 5IO0A 4ZBAA 3RHBA 5GSTA 1UA5A 1A2JA 5EPFA 1SD9A 1JZOA 3K8NA 3ISOA 4MJAA 1AC1A 1SD8A 2C4JA 3UBLA 5DBQA 4IS0A 2RM5A 5ID2A 3KP9A 1Z7RA 3KXOA 3G7JA 2E7PA 3V1WA 1OAZA 1TI3A 2WJUA 1ZYQB 1ZOFA 4BWSA 1J9BA 1X9MB 2CVDA 3QR6A 1F9MA 2F8AA 1A2MA 2R6KA 4MPFA 5ECNB 3P7XA 1KNGA 3F4SA 1Z3EA 3KTLA 4OO4A 4MJCA 3HVXA 3EYTA 1GNEA 2B1KA 2GDRA 4F2IA 3GURA 4IN0A 2WB9A 5CNWA 3OR5A 2YWIA 4IQ1A 2HZEB 4KAEA 1SJZA 4KNDA 4LMVA 4X0XA 4RQRA 4F0CA 4XIHA 3IBHA 2DIZA 5JWQB 1EZKA 5INYA 2QC7A 4KDYA 3PH9A 1XOAA 5E4WA 3HZ8A 2MMAA 5D8IA 1TXXA 4X43A 4TR1A 2J23A 1A2LA 3FK8A 3TUEA 5H5RA 3VURA 4HI7A 5F05A 1BYEA 3W8SA 2MYGA 3ED3A 1PRXA 3D4MA 5B7CA 5B6MA 2V32A 2YJHA 4WR4A 1DUGA 3LYKA 1K0NA 1G0TA 3L9UA 3C71A 4ML6A 4V1Ag 1VGLA 3H8QA 3C1RA 3Q74A 3VWXA 4HUAA 3UVHA 5JWOB 4ULXA 2VCQA 4ECIA 1FO5A 3DYRA 4L0WA 3F4TA 2D2ZA 4KGIA 2VLTA 1R5PA 5HR1A 2E2MA 5DALA 5ELAA 2V1MA 1ST9A 3ZIVA 4ZXGA 4NXIA 1M9BA 1SYXA 2DJKA 5D73A 2VLUA 1V9WA 4PUAA 4XS4A 3HY2A 6GSSA 3D4TA 2FWHA 4ZBDA 2PU9C 5ECHB 3W6GA 1EOHA 6GSYA 2B3SA 3D22A 4OFMA 3KH7A 4N0VA 2VAFA 4GTUA 1JZWA 2DJ2A 3KIJA 2B1LA 5IMZA 6GSWA 10GSA 2V2GA 5G30A 3ZVJA 1SL1B 1PL2A 1TRVA 1DSBA 2LQOA 4HDEA 2DJ0A 1XVWA 2GSSA 4DSSA 2YNXA 2XBIA 1OC3A 4HEA2 5CRWA 5A5KA 1RQMA 4OCFA 3TOTA 1DBYA 5J9CA 2HFDA 4KH7A 3UVTA 4IJIA 1OVNA 3TGZA 1EGOA 3CSJA 3FEUA 5D9VA 5KN2A 2E0QA 2LRTA 2JACA 3ZVJD 4D73A 2H71A 3VWVA 4RI6A 4GXZA 2YWOA 3ZZXA 4DSRA 3QDNA 1XIYA 4EDYA 3IAS2 3HD5A 1WMJA 1GTIA 2P31A 3HHVA 1KEBA 1B8XA 4IBPA 1OC8A 3C7MA 3KGKA 2RIIA 3GSSA 2J9HA 4V2NA 3HA9A 5ENUA 2F8FA 1X5EA 1TW9A 4TR0A 2FNOA 2EIQA 3MAKA 2B5XA 4ILFA 4FIWA 3SWLA 3GUSA 3UIWA 1EV9A 3LORA 4V2LA 2CZ2A 1A0FA 1O73A 2Z9SA 3TCOA 3EU3A 2LTKA 3RBTA 3ZYWA 3LJRA 3M1GA 2R2JA 4K1FA 2PBJA 1WE0A 2VM1A 3E0UA 3IXRA 5IOWA 2P0GA 2QKEA 1N2AA 3ZIJA 1PKWA 1LBKA 3H93A 1XW9A 4KDXA 1Z9HA 3F9UA 3GKNA 3Q19A 4IW9A 4YQVA 4OMVA 3GKMA 3F6FA 2BTOT 5DQSA 3O6TA 1QMVA 5A4UA 2PMTA 1M9AA 3LYPA 1UC7A 4MA9A 5J5NA 1A0RP 1THOA 1MTCA 4MJEA 1R26A 5B6NA 4ECCA 2OE0A 5D9WA 3DGQA 2LKUA 2GLRA 2O87A 4ZIJA 4TR1B 1K3LA 3HKRA 2LEGA 3KD0A 3QPMA 1GP1A 1QK8A 1UN2A 1GWCA 4ZBBA 2OACA 1ERWA 4J56E 1OKTA 5HR3A 4XHMA 2DBCA 3CTFA 5CRDA 1Z6MA 4GSTA 4I97A 2VCXA 3DXBA 1W4VA 3CBUA 1FW1A 3KZQA 4K0GA 20GSA 2C0DA 3DWVA 3E3EA 2IMIA 3S9FA 3KMOA 1K0DA 3GA4A 1ZL9A 4KSMA 4RI7A 3WT1A 2A2SA 1XWKA 1I5GA 5C04A 1ZZYA 2GT5A 2M80A 1I9DA 1RK4A 4JEDA 3QD9A 2N5BA 4AGSA 3M3MA 1Y25A 1EEMA 1Z6NA 5DALB 3BD2A 5IMVA 4Q5QA 4MMMA 1SU9A 2XPDA 2GGTA 4HOJA 2VM2A 1UVZA 4XS4B 4N11A 5DCGA 2JADA 3IA1A 2L5LA 2FD3A 4GQCA 3TKSA 4IELA 3I69A 2HE3A 5D96A 1O81A 4F0BA 4L5LA 1TDIA 4HQZA 2DJJA 2G2QA 2JSYA 1GSQA 1HNBA 2AAWA 1RW1A 2OBKA 5CRHA 2OKAA 2NPBA 5AISA 3MDKA 1YY7A 3D5JA 2HNLA 4DSSB 2C0FA 3QOUA 1T4ZA 5B8BA 4HJ2A 4F03A 5IMDA 1QUWA 4TR3A 2C0EA 5ECMB 3ZITA 2VCWA 2CX4A 1BG5A 1BX9A 4Q5RA 4WEYA 2NDOA 4D73B 2H6YA 4NMUA 2PVQA 2GZPA 1Q98A 1V40A 3A2XA 3WGDA 1MDIA 3BCIA 3M8NA 2VOCA 3TJFA 1FG4A 2DSAA 3LXTA 1YDKA 1XPVA 1PSQA 3LEFA 3O76A 2CV4A 2L5OA 3RPNA 3EVIA 3GHAA 5DJMA 4IVFA 2NVLA 2RUFA 2HSYA 4ID0A 4IP6A 2LRNA 1JZRA 3ZL5A 4ZB9A 1GLQA 3L9SA 5FWGA 16GSA 1ZCPA 1O7UA 2HI7A 4GSNA 5C00A 14GSA 1Y6EA 2JU5A 3WD6A 1HNAA 2WRTA 2IMKA 4PQ1A 5B8AA 2P5QA 4KW6A 2H30A 19GSA 2H8LA 3BJ5A 1WJKA 3EWLA 3ZMLA 1SJIA 1PKZA 1MDJA 3FYGA 2PGTA 4BL7A 1ACVA 8GSSA 3HDCA 4HJMA 3F0IA 4WBJA 4K2DA 2ON5A 3MSZA 3QAGA 4EC0A 2ALBA 1NSWA 2MMNA 3GFKA 3UJ1A 1SYRA 2AJQB 5EL8A 3G9BA 3A2WA 3FHKA 4P3YB 3SBCA 5IMCA 5KN1A 3DKSA 2X64A 5IPGA 1EGRA 6GSVA 2GZYA 2C80A 3ERFA 2EIRA 4OFTA 1AQWA 4ZILA 4HU9A 2VL3A 1E6BA 4V2MA 4WXTA 5IIZA 4I8BA 3G7IA 1TK5B 2MMOA 5DCHA 4YH2A 2WULA 3ERGA 5CRGA 2CVBA 2OE3A 5HR0A 4G10A 3GL5A 2GSTA 2GTUA 3F8UA 5LD0A 1M7TA 1OC9A 2LJKA 4IKHA 4LLRA 1O85A 2K8SA 3TRQA 1CQHA 1K3YA 1QGVA 4TW5A 1XCCA 1GSUA 1SK1A 2LRCA 4TRXA 4QL9A 1U88A 3U6VA 2IMDA 3W8JA 1A8YA 1WWJA 3US3A 3RPPA 4POMA 5CAXA 3A5WA 4KB3A 4NWYA 2GZZA 1TK8B 1MEKA 1MD3A 1F37A 1PQNA 2O89A 4TOPA 6GSUA 1OKDA 1M2AA 2CVKA 4AJ8A 1SKWB 3ZLPA 3P2AA 3ZMKA 1F2EA 2OADA 3A2VA 2IIYA 2V6OA 4JZQA 4CHSA 4H86A 4PNFA 1YEXA 1GUMA 1NHYA 2FA4A 1YKAA 4PURA 3I9V2 1YQ1A 2I81A 2WDUA 3C73A 1X9WB 5GAND 4O7HA 2H75A 3NZNA 1WOUA 3ZTLA 5ECLB 1VRSD 4I6XA 1J08A 1KTEA 4JU5A 4GCIA 3LFLA 2NBSA 4TVEA 4K9ZA 2KP1A 2CT6A 3CMIA 3GTUB 3FW2A 2IPAA 3TKPA 2XBQA 1SKRB 2C3NA 2KHPA 2MMZA 4YAVA 3TRPA 5ABRA 3FZAA 4J57E 1T00A 4TXOA 3ERWA 2YANA 3TKSE 4BVYA 3VLNA 2L59A 1ON4A 2LUSA 3EINA 3VWWA 4K7OA 3IHQA 4JR6A 1K0MA 2DIYA 2IWTA 5CO3A 1XWGA 3IAM2 3GV1A 3IK7A 1ZGNA 2A2RA 2LQQA 2M46A 5FT3A 4DEJA 4WETA 2C3QA 4MH3A 2XHFA 3CSIA 3UEMA 3LXZA 1C72A 3LQ7A 3FR3A 4I5QA 4PGTA 4MJBA 5CREA 2DJ1A 3HCZA 1S3CA 3AY8A 4XRAA 1V98A 3DRNA 3EMPA 1AXDA 3TOUA 3MWHA 2CAQA 2FY6A 2C8UA 4YAPA 3GH6A 4BPYA 1TTZA 5G31A 2ZNMA 1OE7A 4XTSA 2JL4A 3IDVA 1SK2A 1QFNA 1ABAA 2IN3A 3L78A 1K0AA 1Z5YE 4WF4A 2H0HA 5DVBA 2YOIA 4KCAA 5JCUA 1USBA 1GSEA 2B7JA 3APQA 2OBIA 2PUKC 1TRSA 4MF6A 4KSOA 2C3TA 3TKQA 2CAIA 3C8EA 2KUCA 4NHZA 4L5OA 2JSZA 4FH8A 2O85A 4WR5A 6GSTA 3TKRA 4PQIA 5ECPB 22GSA 4POKA 3FZ5A 3TDGA 5G5EA 4OCEA 1PX6A 1G7EA 2RLIA 3IC4A 1XW5A 4BWQA 3APOA 3BBYA 3H79A 5G1KA 1JLVA 2C1YA 1AIUA 2L57A 1O8WA 1H4OA 3R2QA 4IQAA 1OC9B 2XPEA 5ECRB 4AJ7A 1PX7A 4N0ZA 1T1VA 1GNWA 4JE1A 1JLWA 1OYJA 1WIKA 3BOAA 2N5FA 3J7Yk 1XVQA 4NHWA 3N5OA 3WGXA 5KEJA 5IO2A 2O7KA 3VWUA 3Q6OA 4JRRA 3KMNA 3VI7A 4ML1A 5ECQB 3ZREA 1BEDA 5COHA 5F06A 4K0NA 5DQYA 2PERA 4RQXA 4MZCA 1FB0A 3VPTA 2H19A 1PGTA 1S3DA 3UL3A 4G2EA 2VL2A 4G19A 3CRTA 1U87A 2YWMA 5D9TA 1T4YA 2XC2A 2I9HA 2OJLA 5HFKA 3HZ4A 2I4AA 4MZWA 1JHBA 1GSFA 1A23A 4MF7A 4IHUA 4MF5A 1SL0B 4XS1A 3ZFBA 2MBSA 1GTBA 3F6DA 5J3RA 3KH9A 2IMFA 4JR4A 4N10A 4CW9A 2HRNA 4EVMA 2H76A 4FYCA 2L6CA 4LL1B 1VF1A 3HVSA 3IR4A 4IGJA 3RAZA 2FWEA 5ECKB 4J2FA 4CDOA 2WS2A 2AYTA 3ME8A 2KP2A 3Q18A 4TXOB 1M2DA 2FA8A 3GIXA 2JZTA 2VCTA 2E2GA 1GTUA 1R7HA 2I3YA 5AN1A 2H6ZA 4YQMA 1EP7A 3CTGA 2H1AA 2PN8A 1KBNA 1XOBA 3JCML 5J41A 4TKYA 3NIVA 1YF1A 4JBBA 1ML6A 2HT9A 1FAAA 3QAVA 4ZB6A 1GUKA 5JWRB 3CRUA 1ERUA 3ME7A 1FHEA 2H1GA 12GSA 2X8HA 3LGCA 3KM6A 1EEJA 4ACSA 2H1BA 4MP4A 2HSHA 9GSSA 4MH2A 4L8EA 5F07A 3FZ9A 3GTUA 4XRDA 1R5AA 2QSIA 5L71A 3DD3A 1MD4A 1ZMAA 2WFCA 1WPIA 2GQMA 5CYYA 4L0UA 1B4QA 4GQFA 1SL2B 1XWCA 3U5RE 1GSSA 2HXKA 3F4RA 5J9BA 2ES7A 4MPGA 6GSXA 1YF0A 2F3MA 4ECBA 2P5RA 3FZ4A 4K7NA 3WGEA 1XBSA 4KUNA 4LL4B 4K7IA 5ECSA 4WKWA 1AW9A 3VPQA 2VO4A 1G6WA 2TRCP 17GSA 1F3BA 5AIXA 1NHOA 3TJKA 4BVXA 3TKSC 2OA7A 3F3QA 1HNCA 1QQ2A 2RM6A 2V6KA 3QMXA 1THXA 4HZ2A 2YN1A 3VK9A 5D9XA 1YEPA 3H1NA 3IRAA 4QQ7A 5IMAA 3QCPA 1X0RA 3G7YA 4POBA 5DAKA 2LJAA 3CSHA 2YZHA 1YZXA 3N9JA 5ELGA 3KP8A 1TRWA 3H4KA 1AQXA 2KOKA 4PQHA 3RHCA 3GX8A 5JCGA 1FVJA 4PXOA 3ZFLA 1GSYA 2FLSA 2K8VA 2GT6A 2IL3A 2WGRA 1H75A 3RDWA 1HQOA 2YPMA 1ERVA 1X5DA 1GTAA 4ZL7A 2YCDA 3BCKA 3TB2A 1PA3A 1TU7A 3UMAA 5CP1A 2YZUA 3EC3A 4BA7A 3GKXA 3EURA 3CYNA 4LA1A 5A4VA 3F63A 2FHEA 5EY6A 2LSTA 1B4PA 3FKFA 4EXJA 4G9HA 3DVXA 4DSQA 2FWFA 1G6YA 2RUEA 3IOSA 4POLA 2H70A 2HRFA 3QFBC 2YV7A 3HJPA 2WZ9A 3UAPA 3IPZA 5LCZA 3C1SA 2YWNA 1VF2A 3KJYA 2F9SA 4X1UA 2AHEA 4K6XA 2F51A 2IJYA 2R3XA 3VI5A 1B9XC 2DMMA 3M0FA 4MABA 4HZ4A 5KN0A 1XFLA 4KX4A 2H1DA 2LS5A 4MK3A 1F6MC 1EOGA 3L4NA 2FCHA 5EVOA 3DVWA 2IFQA 1YJ6A 3GH9A 2K18A 1BQ7A 1TU8A 1SKSB 1LU4A 3IV4A 4KCEA 3L0HA 3NOFA 3GX0A 4EUYA 2GQKA 3EMXA 2ZCTA 2R37A 4XS6A 3F3RA 1T7PB 3GSTA 3HJOA 5G2ZA 5KN3A 1VF4A 1XWAA 2HYXA 5IM9A 4EF0A 5J4UA 2PVOC 4I2UA 2AUVA 4MDCA 4EDZA 1PN9A 2H73A 4O5RA 2VIMA 1GRXA 4OO5A 1XW6A 2N5AA 3P90A 4RUVA 4QL7A 3KEBA 3CXGA 2MBTA 2PWJA 1TRUA 2L4QA 4FYUA 5IQYA 5AIVA 2ZUPA 3IE3A 4PX1A 1LJRA 4I2TA 3WYWA 1F3AA 4Q5FA 3WT2A 1ERTA 1K3OA 1Q4JA 2O8VB 4EKZA 2FWGA 1XWBA 4OFNA 4TXVA 5F8BA 2VUPA 4NV2A 4V1Ap 5GZZB 2VD1A 5H5QA 4E8EA 3EU4A 2B7KA 1S3AA 1YKCA 4E8HA 4N30A 3GMFA 1FB6A 2R5GA 4IP1A 1GH2A 1IYHA 3FY7A 5JCWA 2FGXA 4AF2A 1AUCA 3VFIA 4EE0A 4ZB8A 1V57A 2CZ3A 1N8JA 1URMA 3LG6A 5F0GA 3PGTA 1DE2A 4GSSA 5D93A 1GLPA 4K8MA 2DMLA 3L9VA 5FHIA 1M0UA 2CX3A 5DAKB 3D6IA 5GAPD 2CQ9A 3TRXA 1T3BA 1HYUA 3UOMA 5IOXA 1J0FA 2GSRA 2LNSA 4WF5A 1O8XA 2EC4A 1E2YA 4ZL9A 4KE3A 4PUFC 3GL3A 1FOVA 1TI1A 1U6TA 13GSA 3IK9A 3KTBA 5HFIA 5ID2B 2LNTA 2HLSA 1HD2A 1W89A 3EE2A 1WP0A 3TJGA 1MDKA 4MLYA 1FVKA 1M99A 4YQUA 2AV4A 4PNGA 1JZDA 1Z7PA 1U3IA 2TRXA 1SENA 3DIEA 2BJXA 5HQPA 1X9SB 2B5YA 4LMWA 1NW2A 2H0GA 5G1LA 5LNKe 1CQGA 2HZFA 2H74A 1EV4A 2DC5A 2X8GA 2H72A 2DLXA 3FRCA 5ECOB 3GYKA 1T8EB 5E59A 4WBRD 2M72A 2H66A 2WCIA 1TOFA 1B48A 11GSA 2VCZA 4TR4A 2G0FA 4IJ3A 3P8WA 1K0CA 3FR9A 3LWAA 4HQSA 4O92A 4FO5A 4GLTA 4ECJA 1U3AA 1K0BA 2CA8A 4ISDA 2A4VA 4GRFA 1G7OA 1V58A 5H5SA 3HYPA 1SK0A 3GN3A 3QFAC 4FYBA 2H01A 2IFQB 2VL9A 3UBKA 4MZBA 1B9YC 1M2BA 3HJMA 2JZSA 2H0IA 2BMXA 3J7Yb 2GQLA 2X8CA 4F82A 4GWRA 2DJ3A 1NM3A 2LJRA 2C0GA 5HR2A 1A24A 3GKKA 3I6AA 1JFUA 1TP9A 2H6XA 4ZL8A 5G5FA 2I1UA 2VLVA 2L4CA 3TJJA 2HZEA 2NTOA 2X99A 2MZCA 4OWYA 3D21A 4GF0A 1PL1A 3GRXA 4Z7XA 1R4WA 4EO3A 2GS3A 2AB6A 3HXSA 1PMTA 2VCVA 5ECIB 2KLXA 1V2AA 1IYIA 3D0ZA 3APSA 3DMLA 2YP6A 2PPTA 4Q5NA 4F9ZA 2L6DA 5GSSA 4NPBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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