4TZ2A

Fragment-based screening of the bromodomain of atad2
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
129
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRAALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Fragment-Based Screening of the Bromodomain of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 129
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tz2A00
5G4RA 2NXBA 4A9IA 2FSAA 5I29A 4HXSA 5CUCA 3FKMX 3O34A 3U5KA 4XUBA 4ALGA 5LVQA 5A5OA 5FG5A 5E9KA 4TS8A 5KU3A 5C8GA 4Z93A 5ENCA 1WUMA 5D3RA 5HLSA 3G0LA 4YBTA 5I89A 4IOQA 5I86A 4UYFB 5CUBA 3I3JA 4CUUA 4WIVA 2WP1A 4QYDA 4NQMA 5EVAA 5F63A 4A9NA 4BHWA 4CUPA 5LJ0A 5CQ8A 5EPBA 5EPRA 5D24A 3O35A 4MR4A 5EWCA 5D3HA 4CUTA 5F2PA 3JVJA 4A9LA 5HM0A 4BW1A 5LUUA 5EWDA 4NRBA 4NS5A 4O7BA 2RNWA 2DVRA 2YQDA 5E9YA 5I88A 4O71A 4MEPA 5DKCA 4HXKA 5F25A 2RS9B 4O74A 4QEWA 4IR3A 4QEUA 5II1A 4QSSA 5IBNA 2E7OA 4TU4A 3U5PA 4A9FA 4MR5A 4J0RA 5HFRA 2I7KA 4ZW1A 4HXPA 5CY9A 4N4HA 4QEVA 5FE8A 4AKNA 3U5LA 3O33A 3DWYA 4QUUA 3UW9A 5ETBA 3GG3A 4XY8A 5A81A 4UIUA 5H1TA 4UYEA 5FE2A 4O7FA 5HRVA 4LRGA 5D3SA 2YW5A 4N4IA 4Z6IA 3MULA 4A9OA 3IU6A 3IU5A 2H60A 4O76A 4Z6HA 5IG6A 3LXJA 5I40A 2YELA 4GPJA 2YDWA 3MB4A 5FBXA 5E9VA 5CP5A 5DYXA 3JVMA 1JM4B 5HRWA 4DONA 3QZSA 4QC1A 5EWWA 5AMEA 5EA1A 5LKZA 5ETDA 4UITA 4A9EA 5E9IA 5EWHA 5FH7A 5CTLA 5D3PA 1WUGA 4NR9A 2LSPB 5A5SA 5F3AA 5HRXA 4Z1SA 3AADA 4CFLA 4YH3A 5DFDA 5LVRA 2I8NA 2N9GA 5EV9A 4NXJA 4J1PA 3NXBA 5FDZA 5E3DA 4HBXA 4O7CA 5ENEA 5F36A 4QSWA 4J0SA 5FFYA 2RFJA 5A85A 4QNSA 5DBMA 5CUAA 4Q0NA 4Z1QA 5I1QA 4YYIA 3UVWA 4QB3A 2MJVB 5L96A 4A9MA 5F5ZA 5D7XA 5DW2A 5HFQA 2R0SA 3MB3A 5LKTA 3D7CA 3U5MA 5I7XA 5EWVA 5E3GA 4O70A 5HENA 5ENGA 5AD3A 2OSSA 3JVLA 4O7AA 5CPEA 2DATA 5HELA 5FB1A 4LDFA 5CQ3A 4MR6A 4PCEA 5KTUA 2YEMA 4QC3A 4BJXA 4PKLA 4QSTA 4XY9A 4OGIA 5EM3A 5CQ4A 4RVRA 5F60A 4QR4A 4HXOA 4TU6A 3S91A 5CUGA 5FH8A 2OUOA 5AMFA 5TB6A 5FE7A 4OGJA 3TLPA 4HBWA 5A7CA 2KTBB 4UYHA 5DFCA 4CFKA 4FLPA 4YAXA 5EPSA 3P1EA 5G4SA 4UIZA 4YATA 5AD2A 4YADA 5E9LA 5ENFA 4KV4A 5H1VA 4HBVA 5D3JA 4YYHA 3Q2FA 1N72A 5ENBA 5EQ1A 5A83A 5EISA 4NUDA 5C87A 5HQ6A 4TTEA 5IGLA 5JI8A 5L99A 4QSUA 5A5NA 1E6IA 4YYKA 3U5NA 5BT5A 3HMEA 5FFWA 4CUQA 4QSVA 4NR5A 3ONIA 3P1FA 4O72A 4A9KA 5FE0A 4OUFA 4QUTA 4YK0A 5L98A 4NRCA 4IOOA 2RNXA 4IR5A 5D25A 4BW2A 4CL9A 4N4FA 5TCMA 2R0VA 2R10A 5EI4A 5FB0A 4NQNA 4A9JA 4NR6A 3P1CA 1JSPB 5J0DA 5FG6A 5LKUA 3LQHA 3U5JA 2OO1A 5D3LA 5CUEA 2L85A 5DKDA 5EK9A 4NYVA 3S92A 5D26A 5DKHA 5FE6A 4O78A 5FE3A 4BW3A 3SVHA 5CUDA 3LQIA 2DKWA 4LYIA 4YABA 1X0JA 3HMFA 5ENJA 4YBSA 5LJ2A 5F1HA 4IR4A 5L8TA 5FFVA 4TZ8A 5C85A 3SVFA 4CUSA 5A82A 4CURA 2D9EA 5DFBA 4PCIA 5FE4A 4NR7A 3SVGA 3UV4A 4NRAA 4N4GA 5CQAA 4QR3A 3UVDA 3QZTA 2YEKA 4YBMA 5FE9A 4PTBA 5IIDA 3P1DA 4ZQLA 2L5EA 4MR3A 4UIVA 4HXRA 5F62A 4XYAA 4KV1A 4LYWA 5D3NA 3Q2EA 5CQTA 2D82A 4QBMA 5K29A 4QR5A 3MQMA 4C66A 5DYCA 5HQ5A 4ALHA 3UVXA 3MXFA 5E9MA 5EGUA 4UYGA 5IGNA 5A5QA 4LYSA 4Y03A 4UYDA 2RI7A 5I83A 3K2JA 3HMHA 5FG4A 4C67A 5E73A 3RCWA 4MENA 5EU1A 5II2A 4QSXA 5HQ7A 3DAIA 4HBYA 4IR6A 4YYGA 4TQNA 3UV2A 4O77A 5CRZA 4UYFA 5I7YA 5CU8A 5L97A 4NR8A 4TZ2A 5CZGA 4MEOA 5CRMA 4KCXA 4LC2A 3JVKA 3LQJA 1EQFA 4LZSA 2WP2A 5ENHA 4QYLA 5KTWA 3P5OA 2E3KA 4ZC9A 5E0RA 4YY6A 5F1LA 5D3TA 4NYXA 5FH6A 5FE5A 5JWMA 5DYAA 5EICA 5DYUA 4A9HA 5DLXA 5CGPA 3ZYUA 2DWWA 2RO1A 2DVVA 5KHMA 5I80A 2DVSA 5BT3A 3MUKA 4UIXA 5CFWA 5CS8A 4UIYA 5H1UA 5E7DA 4N3WA 4NR4A 5KO4A 5DW1A 1F68A 4X2IA 4IORA 5HCLA 4J3IA 4YYJA 5F61A 4NUCA 4QSQA 4QSPA 5LJ1A 4YYMA 4TT2A 4YY4A 4LZ2A 4YYNA 5C7NA 4UIWA 4TT6A 1ZS5A 3LJWA 4HXNA 4YH4A 5C89A 5A5RA 2E7NA 4HXLA 4QY4A 2F6JA 5DX4A 5HEMA 2F6NA 5BT4A 4XUAA 4QSRA 5CQ7A 3U5OA 3O37A 5HJCA 5IGMA 2RNYA 4QZSA 5A5PA 3G0JA 3AQAA 5DY7A 5KTXA 3UVYA 4CLBA 4MEQA 4NYWA 4Q0OA 2DVQA 4E96A 4O7EA 4YYDA 5E74A 3UV5A 4TT4A 5FE1A 4WHWA 4HXMA 5CQ6A 5D0CA 4WHUA 5LKXA 3QZVA 4NUEA 2GRCA 5DLZA 3O36A 4BW4A 5COIA 4PS5A 2R0YA 5IGKA 2YYNA 4O75A 4LR6A 2L84A 4PY6A 5ACYA 5C4QA 5H85A 5ENIA 5L8UA 5EP7A 5CQ5A 4TYLA 4LZRA 4F3IA 4YC9A 2G4AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5G4RA 2NXBA 4A9IA 2FSAA 5I29A 4HXSA 5CUCA 3FKMX 3O34A 3U5KA 4XUBA 4ALGA 5LVQA 5A5OA 5FG5A 5E9KA 4TS8A 5KU3A 5C8GA 4Z93A 5ENCA 1WUMA 5D3RA 5HLSA 3G0LA 4YBTA 5I89A 4IOQA 5I86A 4UYFB 5CUBA 3I3JA 4CUUA 4WIVA 2WP1A 4QYDA 4NQMA 5EVAA 5F63A 4A9NA 4BHWA 4CUPA 5LJ0A 5CQ8A 5EPBA 5EPRA 5D24A 3O35A 4MR4A 5EWCA 5D3HA 4CUTA 5F2PA 3JVJA 4A9LA 5HM0A 4BW1A 5LUUA 5EWDA 4NRBA 4NS5A 4O7BA 2RNWA 2DVRA 2YQDA 5E9YA 5I88A 4O71A 4MEPA 5DKCA 4HXKA 5F25A 2RS9B 4O74A 4QEWA 4IR3A 4QEUA 5II1A 4QSSA 5IBNA 2E7OA 4TU4A 3U5PA 3D1DA 4A9FA 3VKHA 4MR5A 4J0RA 5HFRA 4AKHA 2I7KA 4ZW1A 4HXPA 5CY9A 4N4HA 4QEVA 5FE8A 4AKNA 3U5LA 3O33A 3DWYA 4QUUA 3UW9A 5ETBA 3GG3A 4XY8A 5A81A 4UIUA 5H1TA 4UYEA 5FE2A 4O7FA 5HRVA 4LRGA 5D3SA 2YW5A 4N4IA 4Z6IA 3MULA 4A9OA 3IU6A 3IU5A 2H60A 4O76A 4Z6HA 5IG6A 3LXJA 5I40A 2YELA 4GPJA 2YDWA 3MB4A 5FBXA 5E9VA 5CP5A 5DYXA 3JVMA 1JM4B 5HRWA 4DONA 3QZSA 4QC1A 5EWWA 5AMEA 5EA1A 5LKZA 5ETDA 4AI6A 4UITA 4A9EA 5E9IA 5EWHA 5FH7A 5CTLA 5D3PA 1WUGA 4NR9A 2LSPB 5A5SA 5F3AA 5HRXA 4Z1SA 3AADA 4CFLA 4YH3A 5DFDA 5LVRA 2I8NA 2N9GA 5EV9A 4NXJA 4J1PA 3NXBA 5FDZA 5E3DA 4HBXA 4O7CA 5ENEA 5F36A 4QSWA 4J0SA 5FFYA 2RFJA 5A85A 4QNSA 5DBMA 5CUAA 4Q0NA 4Z1QA 5I1QA 4YYIA 3UVWA 4QB3A 2MJVB 5L96A 4A9MA 5F5ZA 5D7XA 5DW2A 5HFQA 2R0SA 3MB3A 5LKTA 3D7CA 3U5MA 5I7XA 5EWVA 5E3GA 4O70A 5HENA 5ENGA 5AD3A 2OSSA 3JVLA 4O7AA 5CPEA 2DATA 5HELA 5FB1A 4LDFA 5CQ3A 4MR6A 4PCEA 5KTUA 2YEMA 4QC3A 4BJXA 4PKLA 4QSTA 4XY9A 4OGIA 5EM3A 5CQ4A 4RVRA 5F60A 4QR4A 4HXOA 2EJNA 4TU6A 3S91A 5CUGA 5FH8A 2OUOA 5AMFA 5TB6A 5FE7A 4OGJA 3TLPA 4HBWA 5A7CA 2KTBB 4UYHA 5DFCA 4CFKA 4FLPA 4YAXA 5EPSA 3P1EA 5G4SA 4UIZA 4YATA 5AD2A 4YADA 5E9LA 5ENFA 4KV4A 5H1VA 4HBVA 5D3JA 4YYHA 3Q2FA 1N72A 5ENBA 5EQ1A 5A83A 5EISA 4NUDA 5C87A 5HQ6A 4TTEA 5IGLA 5JI8A 5L99A 4QSUA 5A5NA 1E6IA 4YYKA 3U5NA 5BT5A 3HMEA 5FFWA 4CUQA 4QSVA 4NR5A 3ONIA 3ERRA 3P1FA 4O72A 4A9KA 5FE0A 4OUFA 4QUTA 4YK0A 5L98A 4NRCA 4IOOA 2RNXA 4IR5A 5D25A 4BW2A 4CL9A 4N4FA 4AKIA 5TCMA 2R0VA 2R10A 5EI4A 5FB0A 4NQNA 4A9JA 4NR6A 3P1CA 1JSPB 5J0DA 5FG6A 5LKUA 3LQHA 3U5JA 2OO1A 5D3LA 5CUEA 2L85A 5DKDA 5EK9A 4NYVA 3S92A 5D26A 5DKHA 5FE6A 4O78A 5FE3A 4BW3A 3SVHA 5CUDA 3LQIA 2DKWA 4LYIA 4YABA 1X0JA 3HMFA 5ENJA 4YBSA 5LJ2A 5F1HA 4IR4A 5L8TA 5FFVA 4TZ8A 5C85A 3SVFA 4CUSA 5A82A 4CURA 2D9EA 5DFBA 4PCIA 5FE4A 4NR7A 3SVGA 3UV4A 4NRAA 4N4GA 5CQAA 4QR3A 3UVDA 3QZTA 2YEKA 4AKGA 4YBMA 5FE9A 4PTBA 5IIDA 3P1DA 4ZQLA 2L5EA 4MR3A 4UIVA 4HXRA 1PUOA 5F62A 4XYAA 4KV1A 4LYWA 5D3NA 3Q2EA 5CQTA 2D82A 4QBMA 5K29A 4QR5A 3MQMA 4C66A 5DYCA 5HQ5A 4ALHA 3UVXA 3MXFA 5E9MA 5EGUA 4UYGA 5IGNA 5A5QA 4LYSA 4Y03A 4UYDA 2RI7A 5I83A 3K2JA 3HMHA 5FG4A 4C67A 5E73A 3RCWA 4MENA 5EU1A 5II2A 4QSXA 5HQ7A 3DAIA 4HBYA 4IR6A 4YYGA 4TQNA 3UV2A 4O77A 5CRZA 4UYFA 5I7YA 5CU8A 5L97A 4NR8A 4TZ2A 5CZGA 4MEOA 5CRMA 4KCXA 4LC2A 3JVKA 3LQJA 1EQFA 4LZSA 2WP2A 5ENHA 4QYLA 5KTWA 3P5OA 2E3KA 4ZC9A 5E0RA 4YY6A 5F1LA 5D3TA 4NYXA 5FH6A 5FE5A 5JWMA 5DYAA 5EICA 5DYUA 4A9HA 5DLXA 5CGPA 3ZYUA 2DWWA 2RO1A 2DVVA 5KHMA 5I80A 1ZKRA 2DVSA 5BT3A 3MUKA 4UIXA 5CFWA 5CS8A 4UIYA 5H1UA 5E7DA 4N3WA 4NR4A 5KO4A 5DW1A 1F68A 4X2IA 4IORA 5HCLA 4J3IA 4YYJA 5F61A 4NUCA 4QSQA 4QSPA 5LJ1A 4YYMA 4TT2A 4YY4A 4LZ2A 4YYNA 5C7NA 4UIWA 4TT6A 1ZS5A 3LJWA 4HXNA 4YH4A 5C89A 5A5RA 2E7NA 3D1BA 4HXLA 4QY4A 2F6JA 5DX4A 5HEMA 2F6NA 5BT4A 4XUAA 4QSRA 5CQ7A 3U5OA 3O37A 5HJCA 5IGMA 2RNYA 4QZSA 5A5PA 3G0JA 3AQAA 5DY7A 5KTXA 3UVYA 4CLBA 4MEQA 4NYWA 4Q0OA 3VKGA 2DVQA 4E96A 4O7EA 4YYDA 5E74A 3UV5A 4TT4A 5FE1A 4WHWA 4HXMA 5CQ6A 5D0CA 4WHUA 5LKXA 3QZVA 4NUEA 2GRCA 5DLZA 3O36A 4BW4A 5COIA 4PS5A 2R0YA 5IGKA 2YYNA 4O75A 4LR6A 2L84A 4PY6A 5ACYA 5C4QA 5H85A 5ENIA 5L8UA 5EP7A 5CQ5A 4TYLA 4LZRA 4F3IA 4YC9A 2G4AA
chains in the Genus database with same CATH topology
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