4TZ2A

Fragment-based screening of the bromodomain of atad2
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
129
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRAALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Fragment-Based Screening of the Bromodomain of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 129
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tz2A00
5IIDA 4LYWA 5FDZA 2FSAA 4CFLA 3ONIA 4Z93A 4NRBA 5C4QA 4QSVA 5E73A 4MENA 2RO1A 4NR5A 5EICA 3U5OA 5ENFA 2DKWA 4UITA 5A5PA 4QC3A 5CQ6A 5D24A 5D3PA 5HRVA 5I1QA 4QY4A 5A85A 5HQ5A 5HELA 3P1CA 3U5NA 5LKZA 5FFWA 5HCLA 4A9NA 5TB6A 5D3RA 4CUQA 3Q2FA 4QUUA 4NYXA 3FKMX 5E9YA 2DVQA 5ENIA 5II2A 2R0YA 4ALHA 5ACYA 4BW4A 5H1UA 5JWMA 4IORA 4LDFA 4NR4A 2E7NA 5D3JA 2WP2A 5EU1A 4QR4A 5HQ7A 5A81A 5DLXA 5F63A 5E3DA 3SVHA 5EWCA 4YAXA 4OUFA 5EVAA 4QNSA 3ZYUA 2NXBA 5A5SA 4O72A 4NR8A 3LQHA 2RNWA 3DAIA 5E9VA 3P5OA 4J0SA 3JVMA 4UYFA 5CPEA 2R0VA 1WUGA 5ENCA 5IGKA 4UIWA 4QSRA 4GPJA 2F6JA 3MULA 4QEVA 5LJ1A 3P1DA 3S91A 5LKUA 4WIVA 2YYNA 4LYSA 4O76A 4TU4A 4O77A 5D0CA 4BHWA 4TZ2A 5JI8A 2DVSA 4N4FA 3UVWA 5A5QA 4YBMA 5J0DA 4J1PA 4RVRA 3O36A 3UV5A 4QR5A 5CQAA 4CLBA 5LVRA 4QSSA 4YK0A 4YY4A 4KV1A 5HM0A 4A9JA 4A9MA 5HRWA 5CUGA 5HENA 4KCXA 4LYIA 4UIYA 3K2JA 4O7EA 1ZS5A 4OGJA 4UYGA 4QSXA 4TYLA 4NXJA 5BT4A 5I80A 5AMFA 1E6IA 4IR5A 4TQNA 5D3NA 2R10A 4Q0OA 4YH4A 5KHMA 2RNYA 5DKCA 4QEUA 5DBMA 2KTBB 4O70A 5F61A 3AADA 1WUMA 2YELA 5CQ8A 5H1TA 4UIVA 3MB4A 5AMEA 5EISA 4O78A 4HXOA 4N4IA 4NUDA 5I83A 4TT2A 4YYHA 5FH7A 5HRXA 4QSPA 5DYAA 5E3GA 5CQTA 5CZGA 3SVFA 4YYKA 4QYDA 5CS8A 5A7CA 3GG3A 4YYIA 3O37A 4QR3A 4YATA 5DW1A 5ENBA 4QUTA 4J3IA 5CP5A 3MUKA 4NYVA 5F62A 5BT5A 4NYWA 5FB1A 4O71A 4QSWA 4QSUA 4YYGA 4PCIA 5KO4A 4QC1A 5DKHA 5BT3A 5FE7A 3UVYA 2OSSA 4FLPA 4TU6A 5CUAA 4C66A 1JSPB 4LC2A 5FH6A 5FE0A 2L85A 4NUCA 4UIUA 1N72A 5D25A 5EV9A 5L97A 4Z1SA 2E7OA 3QZTA 5FFVA 2E3KA 2DVVA 4NUEA 4O7AA 5KTWA 4NR9A 4YYMA 4PTBA 4QYLA 4CUSA 2DATA 4A9FA 4A9EA 2GRCA 5I40A 4YYNA 5DKDA 5I7XA 5FE3A 3UV2A 4TZ8A 4XUBA 5CUCA 5A5RA 5K29A 5FE2A 3RCWA 5C7NA 5HFRA 2I8NA 2DVRA 5LJ2A 5F60A 5CUBA 4E96A 5EM3A 3IU6A 5A5OA 5CQ3A 5EGUA 4LZ2A 4F3IA 5COIA 4UYFB 5FG6A 4NQMA 5IGMA 5FE4A 5F3AA 5D7XA 5ETBA 4CUUA 5F5ZA 5CU8A 3LQIA 5FE6A 4TS8A 2RFJA 5E7DA 5CY9A 5FG5A 3HMEA 5ENGA 3O33A 5H85A 5HEMA 5G4SA 4WHUA 3U5LA 5LKXA 5LVQA 4NRCA 3IU5A 2G4AA 5CQ5A 2YW5A 5EWHA 4HXNA 4UIZA 5CRZA 4YYDA 4MR3A 5E0RA 5DLZA 4MEQA 4TT4A 2YEKA 3JVJA 5DYCA 4A9KA 5EWDA 5TCMA 5E9MA 5C87A 4CUPA 5D3HA 3P1FA 4QEWA 4HBYA 5EPRA 4HXRA 5ETDA 4N4HA 4J0RA 4A9OA 1F68A 4LR6A 5A5NA 4ALGA 5L8UA 5EP7A 4NRAA 4YABA 5D3SA 5ENJA 3SVGA 4IR4A 4ZW1A 4A9IA 3MQMA 3UW9A 5EK9A 1JM4B 4LZSA 4MEOA 2OUOA 5EQ1A 2F6NA 5L98A 4XYAA 2RI7A 3U5JA 5C8GA 3MXFA 4HXSA 3G0JA 4UYEA 5L8TA 4XY9A 5I89A 5E9KA 4X2IA 5F1LA 4CUTA 5ENEA 3UVDA 5I88A 5D3TA 5HFQA 5CUEA 3LXJA 3JVKA 4HBWA 5FH8A 5CQ7A 4PCEA 4YC9A 5E9IA 2N9GA 5DFDA 5L96A 5EA1A 5EPBA 4LZRA 2WP1A 4KV4A 4Z6IA 4YYJA 5I7YA 4QZSA 4CFKA 3G0LA 3Q2EA 5L99A 3NXBA 4NS5A 5EWWA 5H1VA 5IGNA 4HXKA 2RNXA 3LJWA 4CL9A 4UIXA 2I7KA 5CGPA 4MR5A 4NQNA 3O34A 5DW2A 5FE8A 4O7CA 4IR3A 4HXPA 4YADA 4YY6A 5LKTA 4BW1A 5CQ4A 5AD2A 4CURA 5I29A 2H60A 4O75A 5C85A 3JVLA 4LRGA 5FFYA 4UYHA 2R0SA 2D9EA 3AQAA 4HXLA 5KTUA 5CRMA 5DY7A 5F25A 4QSQA 5DYXA 3O35A 4O7BA 4QB3A 4PKLA 4WHWA 5KU3A 4IOOA 5KTXA 2MJVB 5F2PA 4Q0NA 5CTLA 4XUAA 4A9HA 5HJCA 5IGLA 3I3JA 2L5EA 4QBMA 5A82A 4XY8A 4O74A 2D82A 3DWYA 4IOQA 4HBXA 4HBVA 4N3WA 3HMFA 5CFWA 5FBXA 4MR6A 2LSPB 4C67A 5I86A 5A83A 4Z6HA 4O7FA 4PS5A 3UV4A 5DYUA 3HMHA 4Y03A 4Z1QA 5E9LA 4BJXA 5AD3A 4IR6A 4BW2A 4YBSA 4YBTA 4TT6A 5FB0A 5D3LA 4AKNA 3QZSA 5F36A 5F1HA 2YEMA 5EI4A 4PY6A 2RS9B 1X0JA 3S92A 4HXMA 4N4GA 2YQDA 5FE9A 5CUDA 2DWWA 4MEPA 3P1EA 5D26A 3U5PA 4YH3A 5FG4A 4QSTA 4DONA 4ZC9A 3UVXA 5FE1A 4TTEA 5E74A 3MB3A 4OGIA 5HLSA 3TLPA 5DX4A 4A9LA 5FE5A 2YDWA 5EWVA 1EQFA 5IG6A 2L84A 5DFCA 5HQ6A 4NR7A 4NR6A 4BW3A 5DFBA 5ENHA 3U5KA 3QZVA 5IBNA 5LJ0A 5C89A 5LUUA 3D7CA 4UYDA 5G4RA 3U5MA 4ZQLA 4MR4A 5II1A 3LQJA 2OO1A 5EPSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IIDA 4LYWA 5FDZA 2FSAA 4CFLA 3ONIA 4Z93A 4NRBA 5C4QA 4QSVA 5E73A 4MENA 2RO1A 1ZKRA 4NR5A 5EICA 3U5OA 5ENFA 2DKWA 4UITA 5A5PA 4QC3A 5CQ6A 5D24A 5D3PA 5HRVA 5I1QA 4QY4A 5A85A 5HQ5A 5HELA 3P1CA 3U5NA 5LKZA 5FFWA 5HCLA 4A9NA 5TB6A 5D3RA 4CUQA 3Q2FA 4QUUA 4NYXA 3FKMX 5E9YA 2DVQA 5ENIA 5II2A 2R0YA 4ALHA 5ACYA 4BW4A 5H1UA 5JWMA 4IORA 4LDFA 4NR4A 2E7NA 5D3JA 2WP2A 5EU1A 4QR4A 5HQ7A 5A81A 5DLXA 5F63A 5E3DA 3SVHA 5EWCA 4YAXA 4OUFA 4AI6A 5EVAA 4QNSA 3ZYUA 2NXBA 5A5SA 4O72A 4NR8A 3LQHA 2RNWA 3DAIA 5E9VA 3P5OA 4J0SA 3JVMA 4UYFA 5CPEA 2R0VA 1WUGA 5ENCA 5IGKA 4UIWA 4QSRA 4GPJA 2F6JA 3MULA 4QEVA 5LJ1A 3P1DA 3S91A 5LKUA 4WIVA 2YYNA 4LYSA 4O76A 4TU4A 4O77A 5D0CA 4BHWA 4TZ2A 5JI8A 2DVSA 4N4FA 3UVWA 5A5QA 4YBMA 5J0DA 4J1PA 4RVRA 3O36A 3UV5A 4QR5A 5CQAA 4CLBA 5LVRA 4QSSA 4YK0A 4YY4A 4KV1A 5HM0A 4A9JA 4A9MA 5HRWA 5CUGA 5HENA 4KCXA 4LYIA 4UIYA 3K2JA 4O7EA 1ZS5A 4OGJA 4UYGA 4QSXA 4TYLA 4NXJA 5BT4A 5I80A 5AMFA 1E6IA 4IR5A 4TQNA 5D3NA 2R10A 4Q0OA 4YH4A 5KHMA 2RNYA 5DKCA 4QEUA 5DBMA 2KTBB 4AKHA 4O70A 5F61A 3AADA 1WUMA 2YELA 5CQ8A 5H1TA 4UIVA 3MB4A 5AMEA 5EISA 4O78A 4HXOA 4N4IA 4NUDA 5I83A 4TT2A 3D1BA 4YYHA 5FH7A 5HRXA 4QSPA 5DYAA 5E3GA 5CQTA 5CZGA 3SVFA 4YYKA 4QYDA 5CS8A 5A7CA 3GG3A 4YYIA 3O37A 4QR3A 4YATA 5DW1A 5ENBA 4QUTA 4J3IA 5CP5A 3MUKA 4NYVA 5F62A 5BT5A 4NYWA 5FB1A 4O71A 4AKGA 4QSWA 4QSUA 4YYGA 4PCIA 5KO4A 4QC1A 5DKHA 5BT3A 5FE7A 3UVYA 2OSSA 4FLPA 4TU6A 5CUAA 4C66A 1JSPB 4LC2A 5FH6A 5FE0A 2L85A 4NUCA 4UIUA 1N72A 5D25A 5EV9A 5L97A 4Z1SA 2E7OA 3QZTA 5FFVA 2E3KA 3VKGA 2DVVA 4NUEA 4O7AA 5KTWA 4NR9A 4YYMA 4PTBA 4AKIA 4QYLA 4CUSA 2DATA 4A9FA 4A9EA 2GRCA 5I40A 4YYNA 5DKDA 5I7XA 3D1DA 5FE3A 3UV2A 4TZ8A 4XUBA 5CUCA 5A5RA 5K29A 5FE2A 3RCWA 5C7NA 5HFRA 2I8NA 2DVRA 5LJ2A 5F60A 5CUBA 3VKHA 4E96A 5EM3A 3IU6A 5A5OA 5CQ3A 5EGUA 4LZ2A 4F3IA 5COIA 4UYFB 5FG6A 4NQMA 5IGMA 5FE4A 5F3AA 5D7XA 5ETBA 4CUUA 5F5ZA 5CU8A 3LQIA 5FE6A 4TS8A 2RFJA 5E7DA 5CY9A 5FG5A 3HMEA 5ENGA 3O33A 5H85A 5HEMA 5G4SA 4WHUA 3U5LA 5LKXA 5LVQA 4NRCA 3IU5A 2G4AA 5CQ5A 2YW5A 5EWHA 4HXNA 4UIZA 5CRZA 4YYDA 4MR3A 5E0RA 5DLZA 4MEQA 4TT4A 2YEKA 3JVJA 5DYCA 4A9KA 5EWDA 5TCMA 5E9MA 5C87A 4CUPA 5D3HA 3P1FA 4QEWA 4HBYA 5EPRA 4HXRA 5ETDA 4N4HA 4J0RA 4A9OA 1F68A 4LR6A 5A5NA 4ALGA 5L8UA 5EP7A 4NRAA 4YABA 5D3SA 5ENJA 3SVGA 4IR4A 4ZW1A 4A9IA 3MQMA 3UW9A 5EK9A 1JM4B 4LZSA 4MEOA 2OUOA 5EQ1A 2F6NA 5L98A 4XYAA 2RI7A 3U5JA 5C8GA 3MXFA 4HXSA 3G0JA 4UYEA 5L8TA 4XY9A 5I89A 5E9KA 4X2IA 5F1LA 4CUTA 5ENEA 3UVDA 5I88A 5D3TA 5HFQA 5CUEA 3LXJA 3JVKA 4HBWA 5FH8A 5CQ7A 4PCEA 4YC9A 5E9IA 2N9GA 5DFDA 5L96A 5EA1A 3ERRA 5EPBA 4LZRA 2WP1A 4KV4A 4Z6IA 4YYJA 5I7YA 4QZSA 4CFKA 3G0LA 3Q2EA 5L99A 3NXBA 4NS5A 5EWWA 5H1VA 5IGNA 4HXKA 2RNXA 3LJWA 4CL9A 4UIXA 2I7KA 5CGPA 4MR5A 4NQNA 3O34A 5DW2A 5FE8A 4O7CA 4IR3A 4HXPA 4YADA 4YY6A 5LKTA 4BW1A 5CQ4A 5AD2A 4CURA 5I29A 2H60A 4O75A 5C85A 1PUOA 3JVLA 4LRGA 5FFYA 4UYHA 2R0SA 2D9EA 3AQAA 4HXLA 5KTUA 5CRMA 5DY7A 5F25A 4QSQA 5DYXA 3O35A 4O7BA 4QB3A 4PKLA 4WHWA 5KU3A 4IOOA 5KTXA 2MJVB 5F2PA 4Q0NA 5CTLA 4XUAA 4A9HA 5HJCA 5IGLA 3I3JA 2L5EA 4QBMA 5A82A 4XY8A 4O74A 2D82A 3DWYA 4IOQA 4HBXA 4HBVA 4N3WA 3HMFA 5CFWA 5FBXA 4MR6A 2LSPB 4C67A 5I86A 5A83A 4Z6HA 4O7FA 4PS5A 3UV4A 5DYUA 3HMHA 4Y03A 4Z1QA 5E9LA 4BJXA 5AD3A 4IR6A 4BW2A 4YBSA 4YBTA 4TT6A 5FB0A 5D3LA 4AKNA 3QZSA 5F36A 5F1HA 2YEMA 5EI4A 4PY6A 2RS9B 1X0JA 3S92A 4HXMA 4N4GA 2YQDA 5FE9A 5CUDA 2DWWA 4MEPA 3P1EA 5D26A 3U5PA 4YH3A 5FG4A 4QSTA 4DONA 4ZC9A 3UVXA 5FE1A 4TTEA 5E74A 3MB3A 4OGIA 5HLSA 3TLPA 5DX4A 4A9LA 5FE5A 2YDWA 5EWVA 2EJNA 1EQFA 5IG6A 2L84A 5DFCA 5HQ6A 4NR7A 4NR6A 4BW3A 5DFBA 5ENHA 3U5KA 3QZVA 5IBNA 5LJ0A 5C89A 5LUUA 3D7CA 4UYDA 5G4RA 3U5MA 4ZQLA 4MR4A 5II1A 3LQJA 2OO1A 5EPSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5IID A;  4LYW A;  5FDZ A;  2FSA A;  4CFL A;  3ONI A;  4Z93 A;  4NRB A;  5C4Q A;  4QSV A;  5E73 A;  4MEN A;  2RO1 A;  4NR5 A;  5EIC A;  3U5O A;  5ENF A;  2DKW A;  4UIT A;  5A5P A;  4QC3 A;  5CQ6 A;  5D24 A;  5D3P A;  5HRV A;  5I1Q A;  4QY4 A;  5A85 A;  5HQ5 A;  5HEL A;  3P1C A;  3U5N A;  5LKZ A;  5FFW A;  5HCL A;  4A9N A;  5TB6 A;  5D3R A;  4CUQ A;  3Q2F A;  4QUU A;  4NYX A;  3FKM X;  5E9Y A;  2DVQ A;  5ENI A;  5II2 A;  2R0Y A;  4ALH A;  5ACY A;  4BW4 A;  5H1U A;  5JWM A;  4IOR A;  4LDF A;  4NR4 A;  2E7N A;  5D3J A;  2WP2 A;  5EU1 A;  4QR4 A;  5HQ7 A;  5A81 A;  5DLX A;  5F63 A;  5E3D A;  3SVH A;  5EWC A;  4YAX A;  4OUF A;  5EVA A;  4QNS A;  3ZYU A;  2NXB A;  5A5S A;  4O72 A;  4NR8 A;  3LQH A;  2RNW A;  3DAI A;  5E9V A;  3P5O A;  4J0S A;  3JVM A;  4UYF A;  5CPE A;  2R0V A;  1WUG A;  5ENC A;  5IGK A;  4UIW A;  4QSR A;  4GPJ A;  2F6J A;  3MUL A;  4QEV A;  5LJ1 A;  3P1D A;  3S91 A;  5LKU A;  4WIV A;  2YYN A;  4LYS A;  4O76 A;  4TU4 A;  4O77 A;  5D0C A;  4BHW A;  4TZ2 A;  5JI8 A;  2DVS A;  4N4F A; 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