4U1ZA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form d
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 85
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA02
3TZAA 1CE2A 2DWHA 1N76A 1A8FA 4U4SA 3U92A 3A09A 3FXUA 1MRPA 2VD3A 3O28A 4F3SA 4R9FA 2A5SA 4NF8B 4BLAA 3KOTA 4F39A 2I3VA 1B4ZA 2ESNA 5AA4B 2ZYKA 5I2KB 4M4GA 4RA1A 4P11A 2QSXA 1EZPA 4DZ1A 3LSWA 3PD9A 2NOOA 4PP0A 4HCYA 1PBPA 1RYXA 3FVNA 3SDFA 4NF4A 2XD2A 3SEUA 5AA2D 1MDP1 4H67A 5DEXB 3V5AA 2PT1A 4LUBA 2D21A 3FJMA 5IKBA 5EHMA 1RKMA 3V8XB 5AA3A 1B6HA 3MWBA 3G3HA 1B7HA 2E1SA 3DM0A 3LSLA 4MFIA 2O7IA 3Q26A 4NF5A 3MW0A 4RYAA 4IB2A 3FD3A 1P99A 5H8HB 1QKBA 2ZXTA 2VHAA 3CSGA 3EHTA 1FQFA 4R2BA 4EXLA 1SBPA 4FORA 4THIA 1MM7A 3PUWE 2XXWA 1MDQA 1N3WA 1JQFA 1SYHA 1NMUA 4JXIA 3MP8A 3DP4A 2QS2A 1NNPA 1NFTA 1M5BA 1D9VA 4MLQA 2DE3A 2DQVA 3TTMA 3PMWA 4P0GA 3FVKA 1IITA 3FVOA 5DYHA 2G93A 1QUKA 1XS5A 4F3PA 2XXXA 1FQAA 2GRVA 3SERA 1DOTA 4HS7A 5DT6A 4POWA 1UQWA 3C31A 3C9HA 1LCTA 3DP6A 5CM6A 5I57A 5DTBA 1XC1A 3KSJA 4GL8A 3K01A 1XVYA 2DSFA 2YLNA 4LQ5A 3PPPA 1WODA 5CI5A 2HEUA 5TU0A 3N5LA 4PFYA 4FE8A 1LFGA 2ONKE 1JNFA 2D5WA 4U1ZA 5JEIA 1R1NA 4RK9A 4R75A 5H8QA 4WEPA 1TT1A 3U93A 1OVBA 1BKAA 3IR1A 1QW0A 5CMCA 3CFZA 1YTVA 3AXFA 2QS4A 1TFAA 4IY6A 3M3KA 1OIBA 2H9BA 3K1NA 4K3FA 4UACA 2FNCA 3M8UA 3EQ1A 3SETA 1R9QA 1B40A 1IEJA 1SW1A 2I0BA 1LB9A 2XXYA 1Y3NA 3VE1B 2G29A 2VD2A 4G2ZA 4HCWA 1XT8A 4R6HA 1D3KA 1DMBA 4OEVA 1I6QA 2I3WA 2O1MA 2XXQA 3O6HA 1B7ZA 4OXVA 2QJEA 1MY0A 4F2QA 3MPLA 3DELB 4H8IA 2FA7A 1ATGA 1WVJA 5AA2B 1LBBA 2XX8A 2DE2A 3F11A 4KYEA 4F1YA 2UYFA 5I57B 4OQOA 3M3FA 1B7UA 3D4GA 1Z7NE 4G4PA 5H8NB 3O97A 2YJPA 3U1OA 5I56A 3PUVE 3WAEA 3RT8A 4DLDA 5KZTA 2I4CA 3TELA 1XHYA 4GOTA 4YAHX 1JEUA 3IX1A 2XXHA 1KWHA 1M5DA 4GF8A 4C1TA 1A8EA 2DWAA 3KZGA 1IIWA 3T9XB 1LFHA 3PPRA 3QK6A 3MUQA 2Y7PA 1P1OA 1LGBC 4DXBA 1DPPA 3GBAA 4FIMA 3E13X 4QF9A 3KN7A 4MLVA 5DVIA 4QSEA 4PQJA 3N94A 1Q35A 1MQJA 5CC2A 5I2NB 3HO7A 2V25A 2R9JA 4OFJA 3PPOA 3TMGA 4ZS9A 3C33A 3G3GA 3B7DA 1R9LA 1IQ7A 4QFPA 4AB5A 4OFOA 3MJNA 2M8CA 4GXAA 1Y1ZA 4NE4A 1P1NA 4GRKA 3ZSFA 1VR5A 2Y7IA 2P0SA 2RC7A 1ZTYA 1A55A 1ZIUA 3OO6A 5KDTA 4R6YA 3IOTA 4IGTA 1H76A 3K0VA 4C1UA 2O1LA 3CI8A 4HTGA 4ZEKA 4IGRA 2H4IA 2Z23A 3JZJA 3OO7A 4R73A 4BDLA 1MS7A 3EPEA 4ESXA 1AH5A 3MPKA 4F19A 2Y84A 1B3HA 4OFLA 4ZEBA 2O69A 4NTLA 1B5IA 4MBPA 4R74A 3GZGA 4N07A 1UTHA 3C36A 3TUSA 1WDNA 2UVHA 1M5FA 1IXHA 3CG1A 2Q2CA 4F1VA 1Z7ME 4XKQA 4HW8A 1AL3A 2XHDA 3MVWA 2H99A 2UXAA 4F1UA 3HCQA 1MY1A 3KSXA 2F8DA 2F5XA 1OQHA 3TTKA 4F2OA 4ELPA 2QL3A 4GIZA 4O3CA 5ELVA 3B6QA 2QS3A 1ZMGA 4KI0E 3QIMA 3S9NC 3T9UA 4JDFA 2DE4A 3FJGA 3LBSA 5DVJA 1A54A 4XXUA 3OSQA 4FECA 5CBRA 2RCAA 4ZE8A 3EF7A 2H25A 5H8FB 3TKDA 3RGYA 2DVZA 3G3JA 3OSRA 2F34A 3BFTA 1S7YA 3ONMA 3SEWA 4NEDA 4FEDA 1HSLA 3DLNA 4F31B 4LP2B 5KDTB 2UVJA 4ZEFA 3S9EA 5FTHA 4LA9A 2V93A 1UIUA 5CMMA 3HN0A 3TQWA 5LOMA 1P1QA 2X7PA 4YMBA 1J1NA 1MY4A 3I5OA 3QYTA 4KQPA 2O84X 2ALUA 4ELQA 1B3FA 4F29A 2NVUB 1JEVA 1LSTA 3SEYA 5CRYA 4TLLB 1B5HA 1SVXB 2R6GE 4KYSA 5I58A 1LFIA 4RY1A 2THIA 1UTHB 4KYDA 2OZZA 2ZMBA 3E4RA 3KJ7A 2F6PA 2IEEA 1II5A 3G3KA 1PB7A 2H5YA 4ZEDA 3T22A 3KN8A 4XKNA 1EU8A 5CMKA 3HPIA 5ITOA 2F7CA 1FW0A 1MQGA 4G68A 2XXUA 4EQBA 3IJOB 3CSBA 4WXJA 3H4ZA 5HBCA 4QHQA 3GBBA 3IOUA 3IB1A 1SQYA 1T0KA 4TOZA 4OESA 3TFLA 4H65A 2V3QA 3O9PA 5TPAA 5JTYA 3TTRA 3MZBA 4QRZA 2GFEA 1USYH 5TP9A 3T93B 3FASA 1B9JA 2GHBA 4QFLA 4ZZEA 1FCKA 1B2HA 4DDDA 1ELJA 1IZ1A 2NXOA 1ZBMA 3Q28A 4H8JA 4G8MA 5FTIA 1JW4A 3HHGA 1MXXA 1JETA 4BDRA 4R6KA 1Q1KA 5I58B 4U23A 3VFJA 4JBZA 5AE4A 2ZYOA 3K00A 2RCBA 4NF4B 1QULA 1AMFA 3CG3A 3CR9A 1GV8A 1B0HA 2XXVA 4YKIA 1ZU0A 3O29A 1B3LA 3RY3A 3A3CA 3DP8A 2O68A 3MVYA 5ICTA 4JSDA 2OWSA 2F97A 1O7TA 3KFMA 4XKPA 5CBSA 1US5A 2PBWA 3RLFE 4Z0IA 3UP9A 3PPQA 4X1DA 3UK4A 3IAZA 3FXQA 5HM4B 4U2RA 4NF5B 4X1BA 5K2YA 3K6UA 3ZKLA 4C0RA 3GLBA 1EH3A 2R71A 3I3VA 3UN6A 2DXYA 4YB5A 3FXRA 3KN3A 5EHSA 2AL4A 1R6ZA 4BDOA 2V3TA 3RPWA 3MVZA 2RINA 2Q2AA 4QSCA 4BDQA 4F3BA 4Z7EA 4U22A 3MP1A 5DVFA 3CIJA 2I0CA 2H98A 2VGQA 5JTYB 5FHMA 3U8QA 1VSOA 1OMPA 3PPNA 4O3AA 5BWJA 1NKXA 5TP9B 4Q5TA 3OEKA 4JB7A 3OD7A 2I48A 3K1PA 1GR2A 2HAUA 4OVJA 3G3IA 1FQEA 1NL5A 4PFTA 3B6WA 4Q8RA 1UIVA 1DTZA 4IO7A 3H6TA 1USYE 1POY1 3C32A 3FATA 1MXZA 3FVGA 3V83A 4I1DA 4OHNA 3CRBA 3RUMA 4X9TA 5L9OA 1MXUA 4YKJA 1N7WA 2XX7A 1A99A 4QFOA 2X7QA 3D4CA 1LCFA 3UORA 3BFUA 3PGFA 3O2AA 1MY3A 1ZLQA 4EQ7A 1Y20A 1IXIA 2AYSA 2I6EA 2Y7RA 3SEVA 3T66A 1UTBA 4G8HA 3K6XA 4F18A 4DCYA 4U1OA 3C35A 3IOWA 4DXCA 2Y7WA 5I84A 4YKPA 5H8QB 3RT6B 4LZ5A 3TCHA 4DXUA 1TXFA 5L8DA 1ZKBA 2RC8A 1I6AA 1H3DA 4MF3A 3PMXA 1FTKA 4EF1A 1JW5A 5F1QA 2Q89A 3BBRA 1B3EA 4U21A 3EN3A 1US4A 3OMBA 2O7UA 3FIRA 1DTGA 3N6TA 4ELRA 3N26A 1URDA 3P7IA 1SDXA 4F3GA 4ELOA 4UA8A 3QUFA 4YMAA 2ABHA 1EZ9A 2REJA 4KHZE 4NF6A 3LR1A 4OERA 1EZOA 1Y1MA 2F36A 2V3UA 3QXMA 2PX1A 2BJJX 1H43A 1SW2A 1B1HA 2DWIA 4YICA 4OWDA 1M5EA 2ZYMA 1B4HA 4GLIA 2V84A 2DOJA 3TDJA 3IO6A 4OZ9A 4EXKA 3H6WA 2HCAA 3PMVA 3ODBA 1YPNA 3KG2A 3ECRA 2KLFA 4R2FA 3G7WA 3ILUB 4N13A 1GTKA 3MAMA 3RTWB 4OETA 4EF2A 3TAJA 4JWYA 1MPDA 3KBRA 4ZZAA 4M1VA 5I56B 1S50A 4ONYA 1N84A 4EDPA 1H44A 1UTBB 2UVGA 3MP6A 1N04A 3H3GA 1JVYA 2DVCA 1P1UA 2AIXA 4NF8A 2WKYA 3W9WA 4KCCA 3K6VA 3V89B 3VVDA 3PUYE 1OLCA 5I2KA 1QKAA 1QJMA 4TQUQ 1N3XA 2FYIA 2Z8FA 2ZNTA 4R9GA 4ZECA 4IO5A 3TTNA 1TWYA 1NNTA 4IY5A 3SESA 1MG1A 5M2VA 1D4NA 1Y3QA 1BIYA 5CMBA 4XIGQ 1GGGA 4NF6B 1O63A 3W9VA 3RTFB 2ONSA 3TCGA 2XXTA 2RC9A 3BKIB 2F6GA 2XXRA 1B1XA 3G3FA 1A40A 3KEIA 4ND9A 1B05A 1P1WA 3VLUA 2HFBA 2P2AA 2RKMA 2PYYA 3N6UA 1I69A 3JV9A 3UGWA 4YB7A 3HHFA 3TQLA 3MQ9A 2IA4A 4TLMB 1O64A 5F7VA 1B0LA 2HZLA 4X48A 5H8HA 1FTJA 5JK4A 4U4XA 4G68C 3QSLA 3T9HB 2QPQA 4GL0A 1FTLA 5AA1A 2XXPA 3S9MC 1N7XA 2I4BA 3EHSA 1N0TA 1SW5A 2Q88A 1LAFE 1SI0A 1CB6A 4JWOA 4LZ8A 5I59A 4QSDA 3OENA 4KR5A 4LATA 4NMYA 2OJTA 1MXVA 1RYOA 4H5FA 3FZVA 4RPNA 2GHAA 1B52A 1B32A 4RXLA 2RF1A 5A5XA 3TODA 4YB6A 2Z8EA 3PUXE 2F35A 4G8NA 2B3BA 2QRYA 1AOVA 3QAXA 3RN8A 4GQOA 3EHUA 2ZYNA 4O3BA 3TYHA 5FHOA 1VE4A 3IO4A 2Z22A 1AIVA 4KFQA 4LQ2A 4YU0A 3S2VA 2OK2A 2DP8A 1Y9UA 3Q27A 3L6HA 5HPQA 3VVEA 2PT2A 3FV1A 1FQCA 3OEMA 2F7BA 1NH7A 4IO2A 4PETA 2I58A 5ICQA 3IB0A 3E3KA 2DS9A 3CFLA 3IJXB 1NNFA 3S4UA 4EQ9A 1VFDA 4YKKA 2F7AA 2AL5A 1ZJLA 2YPNA 1IXGA 3M3LA 3IB2A 2XD3A 3MBPA 4NWDA 4FEBA 1FQBA 4DCXA 1URSA 3C4MA 2DYXA 5I59B 2HAVA 2CZLA 1IXCA 1PC3A 1MQIA 4WEDA 3K6WA 2P1SA 5B70A 4JSOA 3Q29A 3I6VA 4H6DA 1FTOA 1F9BA 5A5XB 1IUDA 3SKPA 1H45A 4KD5A 3PD8A 2HZKA 3H03A 1XOCA 5AA2A 4ISUA 3U94A 1B58A 2OLBA 3IORA 3QUJA 3RNNA 2ANJA 4ECFA 4G77A 4G68B 4GFRA 3WAFA 1LB8A 5H8NA 1MXWA 1BP5A 2W7YA 1MY2A 1JW1A 1BLFA 1MH4A 2PVUA 2VOZA 1OLAA 1OVTA 3T9VA 4Q30B 4OYVA 4GD5A 2PMSA 4L17A 2I49A 3GXAA 2ZNUA 4OENA 3USDA 4AQ4A 3IL1B 3JYRA 2GH9A 4ZEIA 4LVQA 5TPAB 2UVIA 4P0IA 4GVOA 1LAHE 4KPTA 1B46A 3FUZA 1LAXA 2VP1A 1HSJA 2NUVA 2OWTA 3RQTA 1BTJA 3R6UA 2HQ0A 1NH8A 3MZ1A 5K2XA 4OEUA 5I2NA 4YZZA 2Z8DA 3LUYA 2O51A 4OMBA 3CFXA 3KJTA 1YAEA 3ZS6A 1MM6A 1LBCA 4ESWA 1MPCA 4F22A 3R7XA 1URGA 4IO6A 3UIFA 2QS1A 4FAJA 3HSTA 4E0XA 3T96B 4DIGA 3L6GA 3MVXA 3K4UA 1Y4CA 3OELA 1YCJA 3OO8A 4OTEA 3KOSA 3LSFB 1JVXA 4I9DA 2F78A 4XKRA 4H0WA 1B51A 4LONB 2DWJA 2O6AA 4KCDA 1SW4A 2DXRA 4MH5A 5ITPA 3THIA 1SI1A 1FQDA 4N6PA 2REGA 1M5CA 1OQGA 4PFWA 1POTA 2ZNSA 3MZ9A 3HV1A 2HXWA 1B5JA 5KCJA 3VXBA 1ANFA 4XTCQ 3KGCA 5J1DA 4RK2A 1TFDA 4PFUA 3VDFA 3LC8A 1D9YA 4GWOA 2XX9A 3H6VA 4WKMA 3OOAA 3TPAA 3R26A 4H5GA 1I6BA 1Y3PA 4I62A 1SD3A 1Y4TA 4H1XA 5L9MA 3IOVA 3K2DA 2NWJA 2QMXA 3H7MA 3TEPA 4BDMA 1MXYA 2A5TA 2OBGA 2E0SA 5IAIA 4DE8A 3VXCA 4RPOA 1MQHA 1LLSA 5H8FA 3OO9A 3FV2A 1S9TA 1MQDA 2LAOA 1QUJA 3VV5A 1A7LA 1PB9A 4E0WA 3Q25A 2ONRA 3PV0E 4Q0CA 3SEXA 3K1MA 3ZKKA 1QVSA 3K02A 1SYIA 5L9SA 4GXSB 3FJ7A 4JWXA 4LZ7A 3VLWA 3IK6B 3CVGA 2B65A 5B7DA 3U72A 1L5TA 3B6TA 1DPEA 1PEBA 2Q8JA 3O6GA 4EUOA 5AA4A 4AB6A 3E9XA 3LSXA 3MC2A 5H8SA 2OCUA 1NNKA 4QFNA 1VFEA 3O6IA 4POXA 3W15C 5KCJB 4I8CA 1MH3A 3O66A 4FATA 2Y7KA 5FHNA 5DEXA 3TTLA 2QMWA 4NWCA 3PU5A 2Q9TA 1PBQA 4RJZA 4FJPA 2XXIA 3UA8A 1XVXA 3A3UA 5BUUA 1HSEA 1B3GA 3FGSA 4QFKA 4PE5B 3VVFA 1LAGE 3H6UA 3ILTB 4IO3A 2B3FA 3VLVA 2CMOA 4RNSA 3OXNA 3C34A 2A5TB 1PDAA 4R72A 1PB8A 2UYEA 5ISUA 4IO4A 3S9LC 4ZE9A 1FTMA 1GVCA 5EYFA 2D3IA 2X26A 4ZDMA 4BDNA 3TCFA 3H06B 3PUZE 1QUIA 1DSNA 1MPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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