4U1ZA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form d
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 85
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA02
5CMMA 3VVEA 5I58A 3FATA 1H43A 3H03A 4PFTA 4Q0CA 4FJPA 3SEYA 1LBBA 1USYH 1JVYA 4C1UA 2CMOA 2B3FA 3E3KA 2AL5A 1SVXB 2F7BA 2E0SA 1Z7NE 3EF7A 1URSA 2PT1A 1D9YA 3VDFA 4QFLA 4IGTA 5AA4A 4HCYA 1GR2A 1LSTA 3DELB 4LZ7A 1ELJA 4O3BA 3LBSA 5CC2A 4GXSB 3BFTA 5DEXA 1MG1A 4F3BA 3KBRA 1B52A 1SYIA 4DCXA 3U72A 1MY0A 4KR5A 3CSBA 4AB6A 2B3BA 1D9VA 1ZJLA 2I4BA 4GD5A 4YMAA 2Y84A 2HZLA 1P99A 4FATA 1R6ZA 3FUZA 1UTHB 3O97A 5F1QA 2XX9A 4U22A 1RYXA 4AB5A 3K1NA 4LATA 2V3QA 4OERA 1MY4A 3SESA 4GXAA 3IL1B 1P1OA 3TCGA 4H0WA 1MXUA 3DM0A 3PUXE 1Y4TA 3A09A 3F11A 5ISUA 3FXUA 4F29A 1BIYA 2R71A 2ESNA 1Q35A 3UA8A 1BLFA 4H5FA 1B3HA 1YPNA 2H25A 2OCUA 4M4GA 4ZEIA 4GF8A 2LAOA 2I48A 2ABHA 3HCQA 4JWOA 4EXLA 4OEUA 4YKPA 1Y20A 4NWCA 3IK6B 3KN3A 4ZECA 5L9OA 4RXLA 3O66A 3QUFA 4Q30B 5ITOA 3S9EA 3M3FA 5H8FB 1O64A 4KCCA 4LZ5A 3KN7A 3CR9A 4ZZAA 3CG3A 2F34A 3VV5A 1SW1A 2NVUB 3N6TA 1B1HA 5CRYA 2W7YA 3O9PA 1B58A 1B1XA 2F5XA 1LLSA 2O84X 3SETA 4YAHX 1B0LA 3EHUA 3PGFA 3KOTA 3CFZA 2HEUA 3N94A 5CM6A 1F9BA 2AYSA 4AQ4A 3TUSA 3Q29A 1YTVA 4ELQA 5TU0A 1TXFA 4GVOA 3D4GA 1TFDA 3ILTB 1NNFA 3ZKKA 1FQDA 2Z23A 5I2NB 5CMBA 1M5FA 5I2KA 3TQWA 4BLAA 1DPEA 2HAVA 3UIFA 3U1OA 1QKAA 1B3LA 1AIVA 3G3FA 4NMYA 3FV1A 1FW0A 3TYHA 2QS4A 5HM4B 3L6GA 5DVIA 4KQPA 1NL5A 4NF5B 3VLUA 2ZNUA 4R9GA 2RKMA 2F6PA 3VLWA 4BDRA 1YCJA 3BKIB 4F22A 2O1LA 3H6WA 5AA2A 3V5AA 2O1MA 4IY5A 4FEBA 3LSFB 2IEEA 4NTLA 4QFPA 3SEWA 5B70A 3LSWA 1GTKA 1SQYA 4N6PA 3MVWA 3FVGA 1UIUA 2A5SA 1N7XA 1M5EA 4DDDA 1O63A 3QIMA 4XKQA 3MVYA 3C31A 3H3GA 3RT6B 1PC3A 1MXVA 5DTBA 3ZKLA 3IX1A 1VFEA 3PUZE 5ITPA 1ATGA 1MRPA 4NF6A 1MDQA 2XD2A 1QKBA 3G7WA 1FQFA 1IXIA 4BDNA 3S4UA 3ONMA 4U2RA 5CMKA 1BTJA 2QMXA 3T96B 5H8HA 2FYIA 4NE4A 4POWA 2Y7KA 2I49A 4PE5B 2HZKA 4WXJA 5B7DA 1MPCA 2UYFA 2X26A 3LSLA 4G68B 3MVXA 1B5JA 3DP8A 3TFLA 3FVOA 3SDFA 1FTOA 4ZE9A 4JWXA 1OVBA 3UORA 3M8UA 2R9JA 4ZEBA 2QL3A 1MY2A 2DS9A 2PBWA 3PPQA 5H8SA 1MM7A 3TAJA 1NNPA 1MQJA 5KCJB 4G4PA 2Z8FA 4C0RA 4JDFA 1MXYA 1LFGA 1MM6A 3AXFA 1Y1MA 1N04A 4GWOA 2DE4A 2X7QA 2DWAA 5I57A 5I56B 3H4ZA 4ZDMA 4KHZE 3K01A 5BWJA 4LQ2A 1S7YA 2UVJA 1M5BA 3K0VA 1XS5A 1LAXA 3LC8A 1URDA 1POTA 2XXHA 4OYVA 4TQUQ 2Q2AA 4I1DA 4OZ9A 4BDLA 1NH7A 2O6AA 4LP2B 1N3XA 5I84A 1CE2A 4QFKA 4F19A 5A5XB 5KDTA 1IIWA 2PYYA 4U4SA 1POY1 2XXQA 2GFEA 2YLNA 2G29A 3A3UA 4U23A 1Y3QA 1VR5A 3Q25A 4MF3A 3TCHA 4FEDA 2O7UA 3K1PA 1B05A 3EHSA 1MPDA 4RNSA 4N13A 2DVZA 1B5HA 1NMUA 3PUWE 3SKPA 5TP9A 3VXBA 1IEJA 3MW0A 1B3FA 4GRKA 3O28A 5ELVA 4O3AA 2V25A 1LAHE 3N6UA 3KZGA 1B4ZA 3MP8A 3C33A 4MLVA 1ZKBA 1XHYA 2OWSA 3E13X 3OO7A 2OLBA 2QS3A 3FASA 2HQ0A 4R72A 1JQFA 4ELRA 1Y3NA 3MWBA 4WEPA 2H98A 2M8CA 3IO6A 4EXKA 1NKXA 1SDXA 4JXIA 4H6DA 3WAEA 1MQHA 3RUMA 4ZE8A 1B7UA 3IB1A 1ZIUA 3QXMA 2O69A 2I3WA 1UQWA 3FJMA 3IB0A 4LONB 4F3GA 5DVFA 4G2ZA 3E9XA 1LGBC 4U4XA 3TZAA 2UVGA 3CI8A 2Y7IA 4YZZA 3FXRA 3R26A 2VOZA 4QFNA 1YAEA 1N76A 2PMSA 3VLVA 3BBRA 4I9DA 1N0TA 3PPNA 2OK2A 5TPAB 1QVSA 1EU8A 4GLIA 3R7XA 3RTFB 3VE1B 3L6HA 3HPIA 2RC9A 4F39A 1MH3A 3WAFA 4JSOA 4EQBA 3KN8A 1B9JA 2XXVA 4KD5A 1OLAA 2O51A 1S50A 3W15C 4DCYA 2GHAA 1A40A 3QSLA 5JK4A 4KCDA 4R6YA 1TWYA 3N26A 1B46A 2I0CA 2R6GE 3FV2A 3IOTA 3PUYE 4NF4A 2AL4A 3RY3A 2G93A 1DTZA 5LOMA 2ZYNA 5HBCA 1DOTA 4EUOA 1OVTA 4ZS9A 1ANFA 4OXVA 5JTYB 1I6QA 4F31B 1PEBA 2OWTA 2UXAA 4GOTA 3T93B 4ELPA 1OIBA 2DWJA 3K1MA 1UTBA 2XXWA 1SI1A 3W9VA 4X9TA 2DSFA 5BUUA 3RPWA 1LB9A 4QSEA 1SW4A 3IORA 3RNNA 4N07A 2Q89A 4THIA 3OO8A 5A5XA 2XX7A 4BDMA 3OELA 3CRBA 3UP9A 1MY3A 1I69A 3K4UA 4I62A 1BKAA 2A5TB 4FORA 3B7DA 4EF2A 4F2QA 3SERA 1SBPA 1B7ZA 4QFOA 1WODA 1Z7ME 3PPRA 5EYFA 4YKIA 3T9HB 4NF8B 3U8QA 1B5IA 3RLFE 3C36A 3FIRA 2QJEA 4LVQA 3QYTA 1VFDA 1B3EA 3G3GA 2DE2A 2PT2A 1OMPA 4KYDA 1KWHA 4OEVA 1RYOA 4OFOA 4RJZA 3GBBA 2QS1A 3QK6A 4L17A 4KI0E 2VHAA 4O3CA 1B7HA 1SYHA 4YB7A 4ND9A 2NWJA 1D4NA 3W9WA 4F1UA 4BDOA 1MS7A 3KG2A 2DWIA 1FQBA 4LZ8A 1SW2A 3HSTA 1GV8A 1FCKA 2GHBA 2XXIA 4LUBA 4BDQA 1I6BA 4RA1A 5EHMA 1B0HA 4PQJA 2NOOA 2H4IA 3IOUA 2Z8EA 3H6TA 4R73A 3TODA 3KEIA 1XC1A 4TLLB 1JEUA 4P0GA 3LSXA 1XT8A 1XVYA 1UIVA 5ICTA 3CVGA 5DVJA 4GQOA 4YKJA 2XXUA 4RPOA 4HW8A 1NNKA 2GRVA 2V93A 3QUJA 3KSXA 1FTMA 1OLCA 3Q28A 5TPAA 1FTKA 3PMXA 5J1DA 3O6HA 1B4HA 2DXRA 2UVHA 1JETA 3QAXA 2D3IA 1GVCA 4QF9A 4RK2A 3C34A 4GL8A 3Q27A 3CFLA 3TPAA 3OMBA 3FVKA 1A55A 2D5WA 3KOSA 4UA8A 3O6IA 3PUVE 4RYAA 2ZNTA 1ZBMA 1LCTA 1JNFA 1B6HA 2P2AA 2DP8A 2XXYA 2VGQA 3VVDA 4TOZA 1UTHA 3OO9A 1QULA 1N84A 5CBRA 4DXBA 5M2VA 2CZLA 2HCAA 1EZPA 4OETA 4X1DA 4OFLA 4PETA 1Y3PA 1JEVA 5CMCA 5AA3A 2ZYMA 3GLBA 3GZGA 2DE3A 2QRYA 1LBCA 5I58B 2DWHA 3JYRA 4JB7A 5CBSA 5DYHA 2I58A 4R75A 2RINA 3C35A 3D4CA 2XX8A 3M3LA 3DP6A 3OSRA 3OENA 5AA4B 3V89B 4IO4A 4FAJA 3TTLA 5H8FA 3SEUA 1A54A 1P1NA 3ILUB 1FQAA 5DEXB 4ESXA 4R2FA 2E1SA 2OJTA 3S9LC 3RQTA 3JV9A 4OQOA 2DYXA 4RPNA 1B2HA 2RF1A 1MDP1 3I6VA 4F3SA 2DVCA 4R9FA 4RY1A 1EZOA 3N5LA 3EHTA 4TLMB 3VFJA 1SI0A 1WVJA 2HXWA 3H7MA 2H99A 2AIXA 2X7PA 1R1NA 3FJGA 4KFQA 4E0XA 4YB6A 3TELA 3TTNA 1HSLA 5I59B 4U1ZA 2XXPA 1QJMA 5I2NA 1JW4A 3PU5A 2RC8A 1IXGA 2O7IA 1NFTA 1B32A 3LR1A 3V83A 1MXWA 1T0KA 1LAFE 4R74A 3BFUA 3KSJA 4E0WA 4NF5A 2QS2A 1N7WA 2KLFA 1IQ7A 1R9LA 4EQ9A 3FVNA 1LCFA 4MBPA 3MJNA 2O68A 2NXOA 5CI5A 4NEDA 3OEMA 3RN8A 4OHNA 4YICA 1MQIA 4G77A 4XKPA 5HPQA 1ZMGA 5AA1A 3USDA 4XXUA 3TTMA 1RKMA 1JW1A 5JEIA 3VXCA 4POXA 2Q88A 3T9UA 3A3CA 3B6WA 3MZBA 1PB8A 3DLNA 3IOVA 1B3GA 3G3JA 1IUDA 3KJTA 2I3VA 1L5TA 2P1SA 1AMFA 2B65A 2VP1A 4OMBA 3SEVA 3ODBA 3K2DA 1PBQA 2V3UA 4IY6A 3SEXA 4G8MA 4YKKA 4OESA 1CB6A 4IO5A 3RTWB 4LA9A 1XOCA 1M5CA 4IO7A 2QMWA 4MH5A 1FTLA 5I2KB 1XVXA 2V84A 3IAZA 3P7IA 5H8NB 4X1BA 3MBPA 3IO4A 1BP5A 4Q8RA 4G68A 2DQVA 3ECRA 3UGWA 4P11A 1MQDA 4G8NA 2GH9A 3MVZA 5IAIA 3OEKA 3CIJA 5AA2B 5KCJA 1H45A 1VE4A 3O2AA 2XHDA 4WKMA 4DE8A 3G3KA 5EHSA 4GIZA 2YPNA 4ZEFA 4Z7EA 2WKYA 5I56A 3MPKA 3MC2A 3HN0A 1PB7A 1B51A 2ONKE 3C4MA 1MY1A 2IA4A 2Y7WA 4XTCQ 2YJPA 1LFHA 3ZS6A 4KYEA 1LAGE 4U21A 1A7LA 3VVFA 1HSJA 3MZ9A 3T22A 4IGRA 4XKNA 4DZ1A 1USYE 3UK4A 1J1NA 1TT1A 3Q26A 2OBGA 5FHMA 3THIA 2F97A 1P1UA 4NF6B 3H6VA 5H8QB 5I59A 3DP4A 4FE8A 3TCFA 4F18A 3K6WA 5K2XA 1M5DA 3CFXA 2RCBA 4I8CA 4GFRA 5H8HB 4PP0A 2HAUA 3FJ7A 3RGYA 4DXCA 2Q8JA 3R6UA 4P0IA 5AA2D 3HO7A 1AOVA 4QRZA 4DIGA 3MQ9A 1D3KA 4ISUA 3I5OA 3FGSA 4H67A 4EQ7A 2D21A 2FNCA 3S2VA 5FTHA 2XXRA 1R9QA 3FXQA 4YMBA 2FA7A 4ELOA 4K3FA 2VD2A 2THIA 2ZYKA 2XD3A 1LFIA 4H5GA 3TDJA 4KPTA 3CG1A 1SD3A 5I57B 1OQGA 2VD3A 1US5A 3PV0E 4ONYA 3C32A 3E4RA 3MZ1A 1H3DA 3FZVA 2I4CA 4EF1A 4ESWA 5FHNA 5K2YA 1WDNA 4OFJA 3K00A 3T9VA 3M3KA 2NUVA 4H8JA 4IO6A 1MPBA 4OVJA 4WEDA 3T9XB 2V3TA 1MH4A 4Z0IA 4M1VA 3TEPA 2F7AA 3K02A 3B6QA 2I0BA 2ZXTA 4R6HA 2ZNSA 3IB2A 5KDTB 2F36A 1MQGA 3IR1A 1Q1KA 1ZU0A 4F1YA 1MXZA 5H8NA 1GGGA 4HTGA 1AH5A 4C1TA 1B40A 3TTKA 4IO3A 1EZ9A 4LQ5A 2HFBA 4DXUA 4PFYA 3U92A 5TP9B 5FTIA 4ECFA 4FECA 1Y4CA 1S9TA 2ALUA 4OENA 4FIMA 1A8EA 3ZSFA 3TTRA 3HHGA 4JWYA 3EN3A 5L9SA 4JSDA 4NWDA 1MXXA 2H9BA 1VSOA 3MP1A 1QUIA 2I6EA 3OSQA 4HCWA 1P1QA 2XXTA 1AL3A 2Y7RA 5JTYA 3RT8A 4MFIA 2Z22A 3FD3A 1URGA 4UACA 2QSXA 4RK9A 4KYSA 1ZLQA 2UYEA 4X48A 2Q2CA 4Q5TA 1IITA 5L8DA 2OZZA 5H8QA 2QPQA 2A5TA 2ONRA 3UN6A 1TFAA 2F6GA 3O6GA 2BJJX 3G3HA 5KZTA 1OQHA 5FHOA 4NF8A 4IO2A 4G68C 3MPLA 3KFMA 1NNTA 2REGA 4F1VA 3KJ7A 3S9MC 3LUYA 1O7TA 1HSEA 3MP6A 4ZEDA 1I6AA 1DTGA 3K6UA 1A99A 3O29A 3K6XA 4H65A 1II5A 1IXHA 1QUJA 4ZZEA 5L9MA 4PFUA 2Z8DA 4NF4B 5IKBA 5DT6A 2H5YA 3I3VA 1EH3A 3IJOB 1A8FA 2F8DA 3PMWA 3MAMA 2ONSA 3S9NC 1QUKA 4DLDA 4QSCA 1FQCA 3OD7A 1IZ1A 2DXYA 1SW5A 3MUQA 2PX1A 1UTBB 3PPPA 3CSGA 3B6TA 4F2OA 2REJA 3V8XB 3HHFA 4QSDA 4MLQA 2RC7A 2Y7PA 3EQ1A 3HV1A 4JBZA 2XXXA 2Q9TA 4YB5A 4XKRA 1DMBA 3PD8A 1IXCA 1N3WA 1JVXA 2UVIA 5AE4A 4HS7A 3PMVA 3H06B 3PPOA 5ICQA 3IJXB 4G8HA 4IB2A 2DOJA 2ZYOA 2PVUA 3K6VA 2F78A 4U1OA 4GL0A 3OO6A 1JW5A 4R2BA 1US4A 3TMGA 1NH8A 2ZMBA 2P0SA 1LB8A 3G3IA 2F35A 3GXAA 1FTJA 5F7VA 4R6KA 3C9HA 4EDPA 1PB9A 4QHQA 3U93A 1ZTYA 1H76A 1FQEA 3TKDA 3EPEA 3TQLA 3JZJA 4H1XA 3IOWA 3OOAA 3KGCA 3U94A 3T66A 2RCAA 1PDAA 1DPPA 4H8IA 4F3PA 1PBPA 1DSNA 3PD9A 1H44A 4XIGQ 3H6UA 4OTEA 1Y9UA 4YU0A 4ZEKA 1QW0A 1P1WA 2F7CA 2ANJA 4PFWA 3GBAA 3OXNA 4OWDA 1Y1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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