4U1ZA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form d
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA02
1LCTA 3MZBA 3GLBA 3A3UA 2QMWA 3ZKLA 5H8FA 3FJMA 2D5WA 2YPNA 2DWHA 2RKMA 3GZGA 4EQ9A 4G8HA 1NNTA 4F1YA 4GWOA 3ODBA 3OEMA 3OSQA 3TTKA 4R9GA 3IL1B 3RTFB 1J1NA 1DTGA 1PC3A 3KJTA 4X48A 2DE2A 3SEYA 5TP9A 1EZPA 1JVXA 1UQWA 2ESNA 3IOWA 1TWYA 3LSWA 4ZEIA 4YICA 1PEBA 4YZZA 1T0KA 1CB6A 4OESA 4ZS9A 1RKMA 3TZAA 1M5EA 3TCHA 5KDTA 1DMBA 2QSXA 4IO6A 3MVZA 4NWDA 4E0XA 5A5XA 1FTJA 1PB8A 4BDRA 1LFGA 1MY0A 5FTHA 1TT1A 3KSJA 3MAMA 4GL0A 4IB2A 4IY5A 1FQFA 4PFUA 5TU0A 5KCJB 3S9LC 4LZ7A 4YMAA 1ZMGA 4NMYA 3OO6A 4XXUA 4FE8A 1R6ZA 2XHDA 2QS4A 1B05A 3OO7A 4NF8B 3K6VA 1B3GA 3S9MC 4KYSA 3DP8A 4ELQA 5L9SA 1B7UA 1I6QA 5ISUA 1MS7A 1MQDA 3K0VA 2FNCA 4LZ5A 4LONB 3SDFA 3T22A 3RN8A 3W9VA 1OLAA 4BDNA 1Z7NE 3C36A 3PPQA 1NFTA 4H0WA 4JDFA 1GVCA 3KJ7A 5ITOA 4H67A 4GL8A 1A8FA 3TEPA 1Q1KA 1OQGA 4KCDA 4RK2A 5CI5A 2DVZA 1N3WA 2VD3A 3KN7A 2F7CA 3FASA 3M8UA 5IAIA 1SW2A 3IJXB 2H4IA 5AE4A 3Q28A 3G3HA 2I0CA 5FTIA 1S50A 2XXXA 3SERA 2F6GA 1B4HA 4NWCA 2PT2A 1VR5A 3UP9A 2F78A 2I0BA 3IO4A 4FECA 3V5AA 3FATA 3IB1A 3SEXA 2DS9A 1N76A 1R9QA 3DP4A 3N6UA 3TFLA 3CG1A 3OO8A 2OJTA 4G8MA 1FCKA 1S9TA 3E13X 3HHGA 3B7DA 2XXWA 2ZNSA 1M5CA 4LP2B 3FV1A 1FTOA 1LAXA 4HCYA 2H99A 4R72A 4RJZA 4IO7A 4XKPA 1ZU0A 2F36A 3Q25A 1PB7A 1ZTYA 3VLVA 3G7WA 5I2NA 1B7HA 1UIVA 3MJNA 2UXAA 3S9EA 5TP9B 3G3GA 4H8JA 1JW4A 1OLCA 1S7YA 1NNFA 5B7DA 3V83A 4IY6A 3UGWA 1MPCA 1MG1A 1MXXA 1MY4A 1QKAA 1XVXA 4H1XA 4JSDA 4ZEKA 4AB5A 2F8DA 3PGFA 1POY1 5EHSA 5CMKA 4KD5A 1N7WA 3TTMA 3KFMA 1EU8A 5I57B 2X26A 3QXMA 3HO7A 4NF4A 4UACA 2O51A 4G77A 3T9UA 4IO3A 3VLWA 4Q8RA 3CFXA 3QYTA 2F7AA 2RC8A 3H6TA 4ZECA 5K2XA 1IITA 4MFIA 2P1SA 4NF6B 3DELB 3FXRA 2PVUA 4QFLA 5DEXA 4HW8A 5KDTB 2UVGA 3K2DA 1AOVA 2DQVA 1O63A 1Y1MA 3OENA 4YKJA 3MVYA 4YKPA 4XKNA 4AQ4A 4QRZA 1ZLQA 5H8FB 3I5OA 3G3FA 5FHOA 2XD3A 1N3XA 3KZGA 1QW0A 3OXNA 4ZE9A 1A99A 4U2RA 3TELA 1URGA 1XT8A 2Q2AA 4FEDA 5HPQA 3RY3A 4F3BA 4RA1A 2OBGA 2R71A 4LA9A 3S2VA 1IUDA 1N0TA 2OK2A 3EHUA 1TFAA 5HBCA 3TKDA 3UIFA 4NF5B 4FEBA 1SDXA 2Y7KA 2I49A 4GLIA 1JW1A 1B0LA 1JVYA 1WVJA 2IA4A 3RT8A 4ELPA 1P1QA 2Q88A 2H25A 2RC9A 4PFYA 4F1UA 5KCJA 2QPQA 1NH8A 3CI8A 2A5SA 3VXBA 4DXBA 3FUZA 2ZYNA 1PBPA 4F18A 1IXGA 2ZNTA 3C33A 1JQFA 4E0WA 2DE4A 1LBBA 4MH5A 1FW0A 1Q35A 1MDP1 1PDAA 2PX1A 3IK6B 1B2HA 2QJEA 2V3QA 3CR9A 4YAHX 5H8HB 1LB9A 1QUIA 2AYSA 2Z22A 3C34A 3PMXA 4H5FA 1GTKA 4I1DA 1MDQA 1H3DA 2DOJA 4U4XA 2GHAA 2OWSA 4X1BA 2XXHA 2Y7RA 1MQHA 4P0IA 4YB6A 5DVIA 2Y7PA 3IB2A 4XTCQ 1LSTA 3EPEA 3DP6A 3HV1A 3Q29A 1O7TA 4G4PA 1MQGA 2QRYA 1USYE 2XXUA 3RNNA 1VFDA 1WDNA 1JNFA 1WODA 4Z0IA 3MUQA 3FVKA 4F2QA 1MRPA 3LBSA 4OVJA 1LFHA 2I3WA 2VOZA 5JTYB 1B5IA 1IZ1A 2DSFA 1KWHA 2O1LA 2XD2A 3H6VA 3MVWA 3MVXA 4YKKA 5L8DA 3OO9A 2X7QA 1MXWA 1UTHA 3HN0A 4YU0A 1ATGA 1LAHE 5DYHA 5I2KB 3PPOA 2CMOA 1Y20A 2B65A 3IX1A 4NF4B 2Q8JA 4XIGQ 4TLLB 3T96B 4DXUA 5JEIA 3FVNA 4OHNA 3SESA 3TAJA 3UK4A 1B1XA 1BLFA 5TPAB 1B51A 5DT6A 3T9VA 2H9BA 4QFPA 3RUMA 4QFOA 3TCFA 1UIUA 4KQPA 3OELA 3FD3A 2VD2A 3TCGA 1MM6A 1QJMA 5M2VA 2Z23A 4ESWA 4I62A 4RNSA 2LAOA 2B3BA 3L6GA 5I2NB 4JSOA 2O84X 3QIMA 2GRVA 3MQ9A 1B9JA 2M8CA 2P2AA 4PE5B 4POWA 1D9VA 4MLQA 3PPRA 4RPOA 5L9OA 2UVHA 4I9DA 2HCAA 2O6AA 4F39A 5ICQA 3B6QA 3R26A 4K3FA 3OOAA 2ZNUA 3SKPA 4BDQA 4DCXA 4U21A 1OMPA 3FGSA 3CIJA 2WKYA 2DXRA 1DSNA 4GXSB 1FQDA 4TQUQ 3TTNA 3U93A 1DPEA 3ZKKA 3GBAA 3BFTA 5HM4B 1BIYA 4OMBA 5H8QA 2XX7A 2HAUA 1B4ZA 3HCQA 2A5TA 3EN3A 4ND9A 1D4NA 4N13A 4OEUA 2ALUA 2RINA 3E4RA 3G3KA 2W7YA 3LSLA 5H8NB 4Q30B 1FQAA 1Z7ME 2Z8DA 5CMBA 4LZ8A 1IQ7A 2OZZA 1A7LA 1TXFA 4FIMA 3W15C 3PMWA 4F1VA 1OIBA 1QULA 5TPAA 4O3AA 2I58A 5ELVA 5F1QA 3THIA 3V8XB 1Y4TA 1N04A 3O6GA 1LLSA 1FTLA 2ZXTA 1B46A 3I3VA 4GXAA 4XKQA 3LR1A 3VFJA 1LAFE 2B3FA 2V3TA 3BBRA 1H76A 1EH3A 1XOCA 2HFBA 3LSXA 4JWXA 1MY3A 2F7BA 4KYEA 4EXKA 3R6UA 5AA2A 5JTYA 2HZKA 1Y1ZA 2DXYA 4ISUA 3SETA 4QFNA 3MP1A 3QUFA 1NNPA 1FQCA 1GGGA 3H6WA 2PT1A 4U1OA 4QSDA 5AA2D 4DDDA 4PP0A 3H03A 4NEDA 4LUBA 3SEUA 4H6DA 2Y7IA 1OQHA 3PMVA 3Q26A 1JW5A 2KLFA 2Z8FA 3CFZA 1B1HA 3H6UA 4H8IA 5L9MA 3TYHA 3L6HA 1NMUA 2QL3A 1FQBA 3N5LA 5AA1A 2AL5A 2OCUA 4JWOA 4U22A 3VVFA 1ELJA 4EF1A 4ESXA 3V89B 1SBPA 3C31A 1N84A 4X9TA 1P99A 4ECFA 3M3KA 4LQ2A 2REJA 3H7MA 4H65A 1NKXA 1O64A 4QSCA 5H8NA 1GV8A 1FTMA 2ZMBA 3MW0A 2HXWA 1MH3A 2QMXA 3W9WA 3LUYA 4ZZAA 3TTLA 2A5TB 3A3CA 3IJOB 5AA4B 1MXZA 2I48A 3MZ1A 3FJ7A 4OERA 1II5A 3BKIB 4QF9A 4ZEFA 4IO4A 3DM0A 2HAVA 4P11A 3AXFA 1MH4A 5K2YA 3WAFA 1SW4A 3R7XA 3K00A 5FHNA 4G68B 4ZZEA 2ONSA 2PYYA 3LSFB 1B52A 1D3KA 1SW5A 3D4GA 3PU5A 4ELRA 3G3IA 2R6GE 1IIWA 3IOVA 1OVTA 2ZYMA 4RK9A 2Q9TA 5EHMA 1M5FA 1IEJA 1PB9A 4U1ZA 4R6KA 3N94A 4R9FA 1N7XA 4LATA 1B0HA 3HHFA 4H5GA 4HCWA 3EHTA 1B3LA 4R6HA 4U23A 1DOTA 1P1UA 4GQOA 3TMGA 3E3KA 2H98A 3MPLA 2RCAA 5B70A 1LAGE 4KI0E 4OYVA 1UTBB 2DVCA 1YTVA 2XXRA 1EZOA 3VLUA 4OWDA 2HEUA 3ILTB 3T66A 1A54A 4Q5TA 4QHQA 2ZYKA 4OETA 2DP8A 3LC8A 5DVFA 4ELOA 4NTLA 3VE1B 2D3IA 1SYIA 1MPDA 1US4A 3TODA 3PUYE 1M5BA 4ZDMA 2V84A 4GIZA 1Y3PA 4OENA 5I57A 4G8NA 4IGRA 1B3EA 1AH5A 3OSRA 4U4SA 5A5XB 2GH9A 3KN3A 3QSLA 3VVDA 1SI1A 4LQ5A 1ZIUA 3U92A 5IKBA 3F11A 1BKAA 3CSBA 2CZLA 3K1NA 1B3FA 2F6PA 3KEIA 3PPPA 1SD3A 1EZ9A 2XX8A 4NE4A 5H8QB 3UN6A 4R6YA 3H4ZA 1US5A 1B5JA 2ANJA 3P7IA 3T9XB 4C0RA 1ANFA 5BWJA 4F3GA 1JEUA 2DWJA 3RPWA 3CFLA 3MC2A 2XXPA 3U94A 5J1DA 3G3JA 3TPAA 1XVYA 2UYEA 4OEVA 3C9HA 3FJGA 5H8SA 1H44A 4LVQA 1Y3NA 4WEDA 3RTWB 4G68A 4PQJA 4C1UA 3O9PA 2R9JA 1A40A 1B32A 1VSOA 1XHYA 2HQ0A 2OWTA 3EF7A 2QS2A 3O2AA 2V3UA 3E9XA 4ONYA 4WXJA 4BDOA 2P0SA 1P1NA 3IB0A 4IGTA 1ZBMA 4QSEA 2IEEA 4EF2A 3ZSFA 1AMFA 1LGBC 2UVJA 3FV2A 1NL5A 3C4MA 3ILUB 3K4UA 3T93B 2X7PA 3VDFA 4Z7EA 2QS3A 3C32A 1I6BA 2H5YA 2XXIA 4NF6A 2O69A 4WKMA 4AB6A 2ABHA 1BP5A 2FYIA 3O6HA 1PBQA 1MQIA 4MBPA 2Z8EA 2F5XA 1B7ZA 4POXA 1SW1A 4BDLA 5CBSA 1H45A 2I6EA 3K6UA 4N6PA 4DIGA 4THIA 1IXHA 2G29A 3JV9A 4FAJA 4O3BA 2NVUB 3KSXA 3FZVA 3KOSA 3MBPA 3S4UA 1ZJLA 2G93A 3FVOA 4KFQA 5F7VA 2NWJA 4OFJA 4ZEDA 4FJPA 1UTBA 4X1DA 4OFOA 4R75A 2O7UA 1Y9UA 1VFEA 3GXAA 2PBWA 1SI0A 3I6VA 3HSTA 4KHZE 3TUSA 1YAEA 2REGA 1P1WA 3OMBA 3T9HB 4IO5A 1F9BA 3RLFE 4FORA 2DWAA 1HSLA 4DZ1A 4F31B 4F22A 5CBRA 2GHBA 1SQYA 4RYAA 2ONRA 3HPIA 5I2KA 1ZKBA 1LFIA 1XS5A 4F2OA 1LBCA 2F97A 3CVGA 4OQOA 4EUOA 5CM6A 1JEVA 2F35A 3CG3A 2O1MA 3CSGA 1QUKA 2ZYOA 1HSJA 3FXQA 3IO6A 4O3CA 1Y4CA 1B5HA 3MWBA 4WEPA 1QUJA 5AA4A 3M3FA 2AL4A 4UA8A 2E0SA 5DVJA 4KCCA 4ZE8A 3USDA 4YB7A 3RQTA 4F3SA 1P1OA 5BUUA 2XXVA 2YJPA 3PUXE 4XKRA 1HSEA 3VXCA 5LOMA 1M5DA 2UVIA 3RT6B 1NNKA 3TTRA 1L5TA 4YMBA 3PD8A 3PPNA 1A55A 2DE3A 5H8HA 3GBBA 3IOUA 3K1MA 2F34A 3S9NC 1BTJA 4G2ZA 4YKIA 3M3LA 4EDPA 4BLAA 3O29A 4KYDA 4OFLA 5I56A 1YCJA 1URSA 2E1SA 3WAEA 4C1TA 5FHMA 3FXUA 3IOTA 3MP6A 5AA3A 1R1NA 3H06B 3MPKA 1I6AA 5DTBA 3UA8A 4IO2A 3BFUA 1D9YA 4GRKA 4Q0CA 4DXCA 3SEVA 3A09A 3PUVE 3VV5A 1MXVA 1YPNA 3MZ9A 3Q27A 1VE4A 5DEXB 1DTZA 4JBZA 4FATA 2XXQA 3B6WA 3FIRA 5ITPA 1XC1A 2XX9A 3PV0E 2QS1A 2DYXA 2THIA 3JYRA 4GFRA 3UORA 1QKBA 4R2FA 5CC2A 2ONKE 3D4CA 4GD5A 5JK4A 4JXIA 4M4GA 3U8QA 4YB5A 5I56B 2VGQA 5CMMA 2YLNA 4EQ7A 3KG2A 2AIXA 3MP8A 3CRBA 1MM7A 5EYFA 1IXCA 1B3HA 1FTKA 3VVEA 2I3VA 2FA7A 2V93A 2UYFA 3U1OA 4BDMA 1H43A 1RYXA 2GFEA 4R2BA 1NH7A 1B6HA 2I4BA 3O28A 1AIVA 2NXOA 4TOZA 2NOOA 3H3GA 2PMSA 4JB7A 4RXLA 1R9LA 1DPPA 2I4CA 3IORA 4I8CA 5CMCA 1AL3A 3B6TA 4HS7A 4QFKA 5I59B 3K02A 1FQEA 3K1PA 1B40A 3QAXA 1QVSA 2RF1A 3DLNA 4PFWA 4TLMB 5I58B 3U72A 3O66A 4F29A 4MF3A 2O7IA 4L17A 3SEWA 1MPBA 2RC7A 4R73A 3FVGA 1LCFA 1LB8A 3OD7A 3PD9A 1POTA 4ZEBA 3RGYA 4PFTA 1SVXB 3N6TA 3JZJA 2HZLA 4PETA 2Y7WA 1UTHB 1MXUA 5KZTA 1CE2A 3IR1A 1TFDA 1MQJA 4KR5A 4GF8A 4M1VA 4P0GA 3PUWE 2XXTA 2RCBA 4RPNA 3KGCA 1GR2A 2Y84A 5CRYA 3QUJA 3K6XA 4EXLA 4EQBA 3K01A 2VP1A 2D21A 1OVBA 2XXYA 4RY1A 4OTEA 4HTGA 1Y3QA 3TDJA 2DWIA 1RYOA 5ICTA 1B58A 3K6WA 5I59A 4OXVA 1MY1A 1IXIA 4DLDA 3PUZE 2OLBA 3ZS6A 2NUVA 3KN8A 4G68C 1JETA 2O68A 4OZ9A 3KOTA 5I84A 4MLVA 4GOTA 2V25A 3EQ1A 2Q2CA 3KBRA 3N26A 4NF8A 2BJJX 2VHAA 3IAZA 3OEKA 4DCYA 4F3PA 4R74A 1MXYA 1URDA 5AA2B 3TQWA 1A8EA 3O97A 3QK6A 2Q89A 1USYH 4JWYA 4N07A 4NF5A 1SYHA 4DE8A 4F19A 3C35A 1MY2A 3O6IA 3TQLA 5I58A 3ONMA 3EHSA 1I69A 3ECRA 4KPTA 4GVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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