4U1ZA

Glua2flip slbd complexed with kainate and (r,r)-2b crystal form d
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u1zA02
1D3KA 1SYHA 5TP9A 3OO6A 1PBPA 4POXA 4FECA 3T9UA 3MVZA 3OENA 5FTHA 3RN8A 3IORA 4IGTA 1HSJA 2O69A 5AA1A 3O6GA 2RC8A 4H5FA 1MY3A 3N6UA 1LAGE 4OTEA 3SERA 3ODBA 2VD2A 5H8HA 4E0WA 1JEUA 2ZYKA 4H67A 1M5BA 4DDDA 3OEKA 4NF5A 3ILTB 2HZKA 3C36A 3U93A 3MUQA 3SEWA 3K1MA 2O6AA 2DOJA 4ZEFA 2AL5A 3HV1A 4YAHX 1I69A 3BBRA 3KEIA 1BKAA 1ZLQA 1A8FA 1GVCA 2X7PA 1Y3PA 3O29A 4ELOA 3EPEA 2QMWA 1UIVA 4UA8A 5F1QA 4ZZAA 1B40A 3VXBA 4QFNA 3FIRA 1ZBMA 2Z23A 4NE4A 2QPQA 4R9FA 3CRBA 1P1NA 2Q2AA 2G93A 4IY6A 4YKIA 1QVSA 4Z0IA 3E13X 2HZLA 4HCWA 2O7IA 4U23A 3ECRA 2WKYA 1RYOA 3H6WA 3TCFA 2DVCA 3VVEA 4F2OA 2XD2A 1Q1KA 3TQLA 4EDPA 3OMBA 3S9LC 3E3KA 1MQIA 4L17A 1EZOA 2ZMBA 3G3JA 1QKAA 2O1MA 4BDRA 3LSFB 4H5GA 1J1NA 3LSXA 3VLUA 4YB5A 5KDTB 4IO7A 4KCDA 2BJJX 4RXLA 1TFDA 1MQDA 3RTFB 1CB6A 2XXRA 1SW1A 3KSJA 4M1VA 1P1UA 2R71A 3TPAA 4NMYA 3VVDA 3V83A 2THIA 4OESA 3KBRA 5DEXA 1MXUA 2V3TA 3TKDA 2G29A 2GRVA 4LQ5A 2XX7A 1XS5A 2F5XA 1YTVA 1EZ9A 2PT1A 1FTMA 1MM7A 3TODA 1Q35A 3FJMA 4MLQA 4U22A 3Q28A 4F3PA 2NWJA 1WODA 1N7XA 2V3UA 4BDOA 1JVXA 1GTKA 1B1HA 3ZSFA 3V89B 3CR9A 4NEDA 4IY5A 4GQOA 4YICA 4OZ9A 4P11A 3S9EA 1OMPA 4HW8A 1CE2A 2OZZA 2UVHA 1OIBA 2OWSA 1DTGA 3M3FA 1LAXA 1LGBC 3RUMA 1I6AA 3U1OA 2E0SA 1N3WA 4JWOA 3OXNA 1WDNA 5DVFA 4R6YA 5I56A 3TUSA 1MQJA 3UN6A 1RYXA 1R6ZA 1QUKA 1B32A 4BDLA 4U4SA 5L9OA 4TQUQ 1O63A 4YKJA 5DTBA 3MVYA 2Y7WA 1R1NA 2ESNA 2B3BA 1IZ1A 5H8NA 1Y1MA 1USYE 3C32A 5EYFA 3MP8A 5CMMA 3DELB 1A40A 4EXLA 1H43A 3O6HA 3M8UA 4PFTA 2DP8A 2NVUB 3UP9A 3RNNA 1FQBA 1MXYA 5CMCA 1OQHA 3PMXA 2H98A 3T9HB 3VXCA 1N76A 1QW0A 3K6VA 1B3GA 4IO3A 3CVGA 2Q8JA 3L6GA 5CMBA 4DXBA 1M5FA 3LBSA 4KFQA 4O3CA 4NTLA 4YU0A 2IA4A 4PQJA 4ESXA 1IXHA 4U4XA 4LQ2A 2XXUA 3CG3A 4NF6A 1P1OA 2DWIA 3HHFA 5AA2D 4X48A 1NNFA 2DVZA 5KZTA 3FVKA 1QJMA 3T93B 4ELRA 1Z7ME 2GFEA 3PV0E 4BDMA 5AA4A 4DE8A 4F18A 1IXCA 4IO4A 2IEEA 4GVOA 4GWOA 4LZ8A 1FCKA 1LBBA 4DCYA 2PMSA 3TAJA 4OFJA 1O64A 1Y3QA 4OWDA 2F6GA 3RGYA 3H6TA 5J1DA 3T66A 4ZE8A 4QFOA 2A5SA 4ONYA 1JW4A 3KSXA 3RQTA 4LZ5A 4QRZA 4KI0E 3O6IA 4U1ZA 2OLBA 4HCYA 3M3KA 2VHAA 3SDFA 2UYFA 5ELVA 2P0SA 2F34A 3UORA 2XXPA 3CFZA 1ANFA 3VFJA 3PD9A 1UIUA 2ZYMA 1Y4CA 4PFUA 4LA9A 1YPNA 5DYHA 4F3BA 3DLNA 3IB1A 1JVYA 5I2KB 3PUWE 4LUBA 2YPNA 3TZAA 2DXYA 1MY1A 3Q27A 1MG1A 3PMVA 4GFRA 4PP0A 3K02A 3BKIB 4FATA 2A5TB 4FORA 4UACA 3O97A 1XVXA 2H99A 3OO9A 4OMBA 4XKQA 1PEBA 4MLVA 4OFOA 3C4MA 1MXZA 4H6DA 2UVJA 4R72A 4G8MA 5H8QA 1I6BA 4Q5TA 4QSDA 4KHZE 2Z8DA 4EUOA 4NF8A 4JBZA 2Z8FA 3H3GA 3E9XA 1UTHA 1MY4A 5FHOA 1F9BA 3KN7A 3OSRA 4IO2A 4GRKA 4ZE9A 2REJA 2F78A 3CIJA 1A99A 4C0RA 4FEDA 2Y7PA 5TPAB 4PE5B 4WXJA 3I6VA 4G8HA 2PT2A 1SW4A 4P0IA 3V5AA 5CM6A 2Y7RA 3K1NA 4H8IA 2ALUA 4AQ4A 4O3BA 2AYSA 3S9NC 1MDP1 2XXWA 3AXFA 2YLNA 2I3WA 3TFLA 4BDNA 3KJ7A 1SI1A 2NXOA 3O2AA 1SVXB 5I57B 5LOMA 1H76A 1AOVA 2M8CA 2D3IA 4G4PA 3FUZA 3LR1A 4ECFA 3K4UA 2FNCA 3R6UA 3GBAA 2XXIA 3ZKLA 5JEIA 2PYYA 3M3LA 3G3HA 1N04A 2QJEA 2HEUA 1DPEA 1NFTA 4O3AA 5BWJA 3FJGA 4F22A 5AA2B 5HBCA 2AIXA 3LSLA 3TMGA 3T9VA 4LATA 4R73A 2D5WA 1DTZA 5L8DA 3GLBA 2QSXA 5JTYA 4XIGQ 1EZPA 2XD3A 4ISUA 3SESA 4LVQA 1MY2A 1Y4TA 4HTGA 3KOTA 2XX8A 1WVJA 4ZEDA 1OLAA 2RC9A 3N94A 4N13A 1HSLA 3ILUB 3KGCA 3C9HA 4Q8RA 4DZ1A 4JXIA 1BIYA 5I84A 1UTBB 4RPOA 2QS1A 1MS7A 3QXMA 5FHMA 5K2XA 3KG2A 4ZS9A 4C1TA 2I0BA 5I58B 1DPPA 4LP2B 3HCQA 1B52A 4GL0A 5TU0A 3MWBA 4KD5A 5I2NB 1MH3A 2DE4A 4TLMB 4H1XA 2O51A 4U2RA 3SEXA 3TEPA 5M2VA 3K6UA 1NH7A 3MP6A 5EHSA 4RK9A 3U72A 1MH4A 3QUJA 2CZLA 5ISUA 2OCUA 4F1YA 1NH8A 4JWYA 4G68A 1URSA 3B6TA 5ITPA 1LCFA 3U92A 1FQDA 4X9TA 3QK6A 2XXYA 5B7DA 1MQHA 4GLIA 1US4A 4JSDA 2V25A 1A8EA 1P1QA 3ZS6A 4XXUA 3O66A 3LC8A 3QAXA 2H4IA 1YAEA 3O9PA 4FAJA 5TPAA 3THIA 1M5EA 3K00A 2Y7KA 4KR5A 4ZECA 4NF4A 2B65A 1Y9UA 1B5HA 4JSOA 3SKPA 1TWYA 3KFMA 3W15C 4EF1A 1MXWA 2PVUA 2X26A 1A55A 2DS9A 3DM0A 3PPRA 3I3VA 1LFGA 2RCAA 3C35A 3OO7A 1B4HA 3GXAA 2H5YA 2AL4A 4R6KA 4WEPA 4E0XA 2DWJA 2E1SA 3OSQA 3B7DA 4FIMA 3C34A 3G3FA 2QMXA 1B4ZA 3FZVA 5DT6A 3BFUA 1IITA 1R9LA 2O84X 5HPQA 2DQVA 2DXRA 2GHAA 2VD3A 2ONRA 1B3HA 3G3IA 3MAMA 3H06B 2Q88A 2ZNSA 1GGGA 1B7ZA 3HN0A 3MW0A 5BUUA 2GH9A 3GBBA 2Y7IA 2QS2A 1SW5A 4Q0CA 2I48A 4PFYA 3FV2A 2F7AA 3HSTA 1DOTA 1ZKBA 3GZGA 3A09A 4OVJA 3Q25A 3TDJA 5L9MA 1DMBA 3A3CA 3RTWB 1OVTA 3MC2A 1VSOA 4JDFA 2OWTA 1HSEA 2YJPA 4YB6A 1ATGA 1FQEA 2H9BA 1N84A 1R9QA 4EXKA 4AB6A 3SEVA 4GL8A 1M5CA 5TP9B 3C33A 5KCJB 3K6WA 2UXAA 1S50A 5IKBA 2FYIA 3FVNA 3A3UA 2OK2A 1JQFA 1B5JA 5KDTA 1QUIA 5DVJA 3IOUA 4PETA 1ZJLA 3T9XB 4KQPA 3MZ1A 1EH3A 5H8HB 1MM6A 3MZBA 4OFLA 1ELJA 1QUJA 4ND9A 2PX1A 1OLCA 4XKRA 1B5IA 2R9JA 2ZYNA 2F7CA 2NOOA 2B3FA 1GR2A 4P0GA 3K6XA 4FJPA 2NUVA 4QFLA 2VP1A 3VE1B 2I49A 5H8SA 3B6QA 1XHYA 4F29A 1ZMGA 2P2AA 3FV1A 3MP1A 1QULA 4GF8A 1UQWA 4X1DA 4GXSB 4IO5A 3IAZA 5AA3A 3C31A 4ELPA 2I6EA 1B3LA 1PB8A 3D4CA 3U8QA 4DXCA 4RK2A 2HQ0A 1B0LA 2V84A 1B46A 4OERA 3VVFA 1D4NA 2Q2CA 2DE3A 4XTCQ 3N26A 5FTIA 5FHNA 1ZTYA 5EHMA 5ICQA 1LFHA 1A7LA 1PB9A 3EN3A 1SI0A 2ZNUA 3F11A 2RKMA 3IR1A 2DWAA 4RPNA 3MQ9A 4FE8A 4GOTA 4MFIA 3IOTA 5CC2A 2Z8EA 4TLLB 5JK4A 1Y20A 3EQ1A 3IO6A 1MXXA 4KYDA 2XHDA 3KZGA 4JWXA 3EHUA 4NWCA 4OYVA 1MPDA 3FD3A 5DEXB 1USYH 1S9TA 3H6UA 2F7BA 1H44A 4F3SA 4THIA 1US5A 4EQ7A 3UA8A 2I3VA 3FASA 4OENA 3PPOA 1TT1A 3LSWA 4RYAA 4ZEKA 3CSBA 4R74A 1JETA 3H03A 4YMBA 4QHQA 1XC1A 3CSGA 4H0WA 4DLDA 1FQFA 1NL5A 4I62A 1VFDA 3RT8A 4U21A 1Y1ZA 4IO6A 3SEUA 4ZEIA 1Y3NA 4R2BA 1MXVA 1VR5A 5KCJA 4H8JA 1N0TA 3PD8A 2XX9A 3PU5A 2ONKE 1LB9A 4H65A 3FVGA 3TCGA 3JZJA 3OO8A 4KCCA 1ZU0A 4QSEA 4G8NA 3UK4A 3PUVE 1FTJA 1FQAA 5I56B 1BLFA 1LAHE 4GXAA 4RNSA 3PUYE 3S2VA 4MBPA 3Q29A 4QSCA 1BP5A 5HM4B 1B51A 5ICTA 4F3GA 1IEJA 4BDQA 3TCHA 1SYIA 5H8NB 2VOZA 4BLAA 4OEVA 5I59B 1XVYA 4IB2A 3SETA 5CRYA 2UVIA 4DXUA 3VV5A 5H8FB 4HS7A 4KYSA 3N5LA 1XT8A 3MPLA 3ONMA 1P99A 3PUZE 1AL3A 5A5XB 4DCXA 1YCJA 4FEBA 4RJZA 1B0HA 3FATA 1T0KA 3KJTA 2RC7A 4ZEBA 3WAEA 5I2KA 3IL1B 4KPTA 3QIMA 4IGRA 1MRPA 5K2YA 4OXVA 2Q89A 4I1DA 2LAOA 4EF2A 3D4GA 3FXRA 3TYHA 2A5TA 5IAIA 3CG1A 3H6VA 1IQ7A 1O7TA 2XXXA 4NF6B 4R75A 3OD7A 4YKPA 1PDAA 5AE4A 4R9GA 4WKMA 3R7XA 5CMKA 2QRYA 2ZYOA 2HCAA 1OVBA 2Z22A 4DIGA 2XXQA 1S7YA 2HFBA 2UVGA 5CI5A 4I9DA 5AA4B 1NKXA 4R2FA 4WEDA 3N6TA 4OETA 4LZ7A 1IXIA 2R6GE 4KYEA 1SBPA 3IOWA 4K3FA 3EHSA 2D21A 4QFPA 1URGA 3VLWA 3JYRA 1IXGA 3V8XB 3KN3A 2HAUA 4GIZA 4U1OA 2ZXTA 3KN8A 2I4CA 2Y84A 3G3KA 1POY1 2Q9TA 3MJNA 3HPIA 2ONSA 3KOSA 1B7UA 2DYXA 3IB2A 1JW5A 4LONB 3FXQA 3TELA 1XOCA 1B7HA 4M4GA 2FA7A 4TOZA 1B3EA 1TXFA 3B6WA 5I57A 1FTOA 4N6PA 2ANJA 2V3QA 5CBRA 1GV8A 3R26A 1MQGA 3S9MC 4YKKA 2PBWA 4ESWA 1B3FA 3VDFA 1MDQA 1RKMA 3PUXE 1VE4A 1LCTA 1D9VA 5CBSA 3IX1A 1NNTA 1KWHA 3DP4A 4XKPA 5H8QB 5AA2A 3CI8A 3WAFA 1FQCA 3QUFA 1Z7NE 4F39A 3PMWA 3CFXA 2HXWA 4R6HA 4NF8B 5L9SA 2XXVA 3I5OA 1UTHB 3DP8A 1MY0A 2V93A 1L5TA 4ZDMA 1FTLA 4G2ZA 3PPNA 4MF3A 3OELA 3OEMA 3IK6B 2DWHA 1LLSA 5I59A 4XKNA 1B05A 3FXUA 3G7WA 1B9JA 1PB7A 2W7YA 3MVXA 4C1UA 1B58A 1POTA 5H8FA 3OOAA 3HO7A 3UGWA 1UTBA 4F2QA 4ZZEA 2XXTA 3PPQA 3O28A 1LB8A 1ZIUA 5A5XA 2ABHA 3JV9A 5I58A 2KLFA 3CFLA 5I2NA 2OBGA 1H3DA 4N07A 3S4UA 5ITOA 1DSNA 4QF9A 3P7IA 3T22A 4F1UA 1N7WA 2GHBA 1EU8A 1NMUA 3TTMA 1AIVA 4EQBA 3W9VA 2QS3A 4G68C 3TTNA 3H7MA 2X7QA 2F35A 3K1PA 4ELQA 2H25A 4NF5B 4G77A 4YZZA 4OEUA 4MH5A 2OJTA 3E4RA 3QYTA 4F1VA 1BTJA 1LBCA 3BFTA 3TQWA 3FVOA 1VFEA 4EQ9A 1A54A 5JTYB 2DSFA 3ZKKA 2VGQA 2QL3A 3L6HA 2P1SA 1B2HA 1PBQA 1AH5A 1AMFA 2O1LA 1LFIA 1TFAA 3TTRA 2RF1A 3USDA 3PGFA 1JNFA 1PC3A 3RY3A 1JEVA 2I0CA 3RLFE 4JB7A 1IUDA 1SD3A 1LSTA 1P1WA 2CMOA 1NNKA 5DVIA 1I6QA 3UIFA 2HAVA 4NWDA 3FJ7A 2F8DA 3TTLA 4OQOA 1MPBA 3T96B 3IOVA 2DE2A 2XXHA 2RINA 4QFKA 2RCBA 2F6PA 3K2DA 3PPPA 2F36A 3EHTA 3MVWA 3IJOB 4F31B 4AB5A 3W9WA 4RY1A 3IO4A 3RPWA 3HHGA 3U94A 5F7VA 1II5A 2REGA 5B70A 3EF7A 2I58A 3SEYA 1SDXA 2O68A 4G68B 3IJXB 3DP6A 3FGSA 4F19A 1JW1A 3Q26A 2QS4A 1FW0A 1OQGA 4Z7EA 1H45A 1FTKA 1URDA 4Q30B 1D9YA 1SQYA 4YB7A 3RT6B 3K01A 4I8CA 4OHNA 2F97A 1LAFE 1QKBA 3MPKA 4RA1A 3LUYA 2I4BA 1NNPA 1M5DA 3G3GA 3MZ9A 1N3XA 4PFWA 1B1XA 4X1BA 4YMAA 3IB0A 4NF4B 2O7UA 1MPCA 2UYEA 1B6HA 1IIWA 2ZNTA 3QSLA 3H4ZA 4GD5A 3MBPA 3K0VA 3VLVA 3TTKA 4POWA 1SW2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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