4U21A

Glua2flip slbd complexed with fw and (r,r)-2b crystal form e
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A02
3OELA 2CZLA 3TKDA 3MVZA 3I3VA 1D3KA 3U72A 4H8IA 2XX8A 1NNFA 2O68A 3GBBA 4ECFA 4U4XA 4U21A 4DXCA 3HN0A 1Q35A 1FQEA 3G3HA 1MH4A 5JTYB 4IGTA 1H44A 3SEVA 4NE4A 4R75A 3SDFA 1GGGA 3EPEA 2OBGA 1QKAA 1N84A 3W9VA 3S9EA 4NWCA 5AA2B 1N76A 2H5YA 4JSOA 4XKPA 1JVXA 4BLAA 3E3KA 4FATA 3DP8A 3TAJA 4QFOA 1SD3A 1D4NA 3FJMA 3THIA 1SW2A 3TQWA 3C31A 5FHNA 1PB7A 3O2AA 1POY1 4OHNA 4X1BA 2DE2A 4F29A 1DMBA 2XXWA 3RY3A 2BJJX 2QJEA 3FATA 1FQCA 3OO9A 4PQJA 2F6PA 4QSCA 3KOSA 2OWTA 4MLQA 1MQGA 4R9FA 4DDDA 1UIUA 4XTCQ 5CMKA 3T66A 3T93B 2ZMBA 4DLDA 1IXIA 3OOAA 3QUJA 4P11A 2DWHA 1SYIA 1A99A 5H8HA 3K6VA 3HCQA 1JNFA 2X7QA 1B3LA 2ONSA 1SYHA 1BP5A 1P1WA 1OVTA 1YPNA 2VHAA 1MXXA 2XX7A 5A5XA 4XXUA 4LATA 4XKRA 4RNSA 3V89B 1TXFA 2OK2A 2P2AA 3IAZA 3QUFA 4H6DA 2QL3A 1FTJA 3K6WA 3VXBA 3MC2A 1PEBA 4YAHX 3S4UA 1B5HA 3PD8A 3EHTA 1VSOA 1IQ7A 1OLCA 1LGBC 3RN8A 3H6UA 2OZZA 2F35A 4ISUA 4R6KA 1MPDA 2E0SA 5JK4A 4JWOA 3EF7A 1ANFA 3G3JA 4JDFA 3SERA 3L6HA 3QAXA 3USDA 3GLBA 4GFRA 4ZDMA 1EZPA 2Q2CA 5TP9A 4R6HA 3WAFA 3OSRA 3TQLA 4IO7A 3TFLA 5TPAB 2XXPA 3W15C 4QFLA 1UTBA 3PV0E 3FASA 3KN8A 4OENA 2PMSA 2RC7A 3N6TA 1J1NA 5BWJA 3FXRA 3FXUA 1YTVA 1P1NA 3B6WA 4NF4B 3A3CA 2RCAA 4NF8B 1SI1A 2O7IA 2PT2A 1GR2A 3M8UA 1A8EA 1UTHA 1Q1KA 4KHZE 3B6QA 3CI8A 3K01A 3IB1A 1PBPA 2ZYNA 1BKAA 3CG3A 4R72A 4GRKA 1B40A 1LFGA 3FV1A 4X9TA 4FEBA 1JW1A 1D9YA 3HHGA 2B65A 1FTLA 2X7PA 4ELOA 1O63A 5ICTA 4WXJA 4OMBA 2NXOA 4TQUQ 2Z23A 3PUYE 1QUKA 1DTGA 1FCKA 2UXAA 3H06B 3BFTA 5I57B 3ZKLA 2I58A 1H43A 5H8NB 3U8QA 2XHDA 4QSEA 4GF8A 4ZEFA 2YLNA 3O6GA 4OYVA 5IAIA 1DTZA 2A5TA 4FAJA 5H8FA 1I6BA 2DP8A 4PP0A 1LB9A 2RC9A 3CR9A 2V3QA 4U23A 1N7XA 1Y3NA 3MW0A 5DVJA 4BDQA 1BTJA 2A5SA 4E0XA 3M3KA 4POWA 1OVBA 5KCJA 5KDTA 3N5LA 3GZGA 2Y7IA 4NEDA 3HO7A 1MDQA 3ECRA 5I56B 2I4BA 2FA7A 4I8CA 2PBWA 5AA4A 5DTBA 3MPKA 1FW0A 3IOWA 3TCHA 4OERA 4FEDA 5AA2D 2V25A 2XXRA 3OO7A 3MQ9A 4PETA 4OFJA 4QFKA 3RUMA 3SESA 1B3GA 3FJ7A 3MAMA 4RYAA 4F3GA 3PU5A 4YKPA 3VFJA 1MXYA 4H5FA 4G8HA 4IY6A 1FQBA 3U94A 3T9XB 5ITOA 5LOMA 5JTYA 4UACA 1I69A 2XX9A 1P99A 1LBCA 4F18A 1PC3A 1IXGA 5DYHA 5EYFA 3FJGA 3KN3A 1IZ1A 3VDFA 1AOVA 2HAVA 3I6VA 2Y7KA 1MY4A 3TELA 3N26A 3FGSA 3FUZA 5AA2A 4YB7A 4DXUA 2V3TA 3OO6A 1MQJA 1MXVA 4JSDA 3HHFA 4KQPA 4Q30B 3KEIA 3RLFE 1MY2A 3KOTA 2Y84A 2H25A 5TU0A 1IXCA 2HQ0A 1TFAA 3H6WA 3MZBA 1IITA 1SQYA 3H3GA 2DOJA 4YU0A 1MY0A 3WAEA 2DS9A 2ZYMA 3JYRA 3QK6A 3PPPA 2F7CA 3S9NC 4TLMB 3TTNA 1B7ZA 5I2NB 1B5IA 4MF3A 3S9MC 2B3BA 3C35A 1ZU0A 2R9JA 4G8MA 3MP6A 1XOCA 2O84X 4NTLA 1PBQA 4UA8A 4BDRA 3TCGA 2FNCA 3C33A 1SVXB 4FORA 2QS3A 3H6VA 2G29A 2XXXA 5I59B 3N6UA 4OWDA 2ABHA 2IEEA 4XKQA 4RPNA 2F8DA 3QXMA 2B3FA 2UVIA 5B70A 3TUSA 4MFIA 3PMWA 4YKJA 3UN6A 2V3UA 3MWBA 3O29A 4KR5A 3EQ1A 1MXUA 1FTKA 1H3DA 1VFDA 2Q2AA 4EDPA 4R2BA 1Y4TA 2QPQA 1HSEA 4F2OA 2O6AA 1LFIA 3O97A 1GVCA 4LP2B 4GLIA 3RTWB 4O3CA 4KYEA 4YICA 4F39A 1USYE 3KJTA 3UA8A 1M5EA 4HTGA 1MXWA 3PGFA 3PPRA 1AH5A 3HPIA 3PD9A 1Y1ZA 1MPBA 1JQFA 3FVOA 5FTIA 2F7AA 4GXSB 5H8QB 3K1NA 1B0LA 1QKBA 3BBRA 1LCFA 2X26A 1P1UA 1CB6A 1ZKBA 1ZTYA 1AIVA 4ZZEA 2F7BA 3K1MA 4Q5TA 3F11A 1XVYA 3M3LA 4RXLA 3S9LC 2H4IA 5TPAA 1RYOA 4KD5A 1LB8A 3VXCA 3A09A 4GL0A 2UYFA 4WKMA 2I48A 3R7XA 4ELPA 2XD2A 2VGQA 2ONKE 1SW4A 2DVZA 1B58A 2I6EA 3K0VA 4IO4A 4NF4A 3QIMA 4OXVA 5DT6A 1POTA 3ILTB 4H1XA 2GRVA 3K4UA 4NF8A 4EUOA 3ZKKA 3GXAA 3IJXB 3D4GA 1RYXA 4H0WA 3K1PA 4XIGQ 3RQTA 1LAFE 1N7WA 4U4SA 5DVFA 4NF5B 4ZE8A 3VLVA 2ONRA 2OJTA 3O9PA 3TTKA 4GD5A 1UIVA 4KYDA 2RCBA 3OO8A 3H03A 4KCCA 3DELB 1JW5A 3Q26A 2HFBA 1B32A 1OMPA 2O51A 3G7WA 3U93A 2F78A 2HEUA 4G68B 3KFMA 3IB2A 5I2KB 4C1TA 1B52A 4DZ1A 3RNNA 1H45A 3MZ1A 2V84A 1N3WA 2QMXA 3MP8A 2GHAA 3UGWA 2GHBA 4MH5A 2OCUA 5I57A 5CMCA 1D9VA 5H8NA 3RT8A 3IO6A 4ONYA 2PT1A 1QW0A 2HZKA 3T22A 1LAXA 5EHMA 4ESXA 2XXIA 3IO4A 2RINA 2OWSA 5HPQA 3V83A 1SI0A 2VD3A 1S50A 4P0IA 1N3XA 4ELRA 2LAOA 4LZ7A 2HCAA 4O3AA 1MS7A 3D4CA 4AQ4A 3Q28A 3KJ7A 2VOZA 4MLVA 2ZNSA 4H67A 3SEUA 1ZJLA 4QF9A 5I56A 3FIRA 1KWHA 1M5CA 3CIJA 4ZEKA 3RT6B 4ELQA 5ISUA 1B9JA 3PMVA 1NNPA 3CFZA 4LA9A 4RA1A 1IXHA 2QS1A 2P0SA 5ICQA 4Z7EA 4R9GA 4AB5A 4M1VA 3K00A 2GH9A 4EXKA 5JEIA 5EHSA 3O6IA 1XS5A 3VVDA 2I4CA 3OXNA 5L8DA 2ALUA 1ZLQA 2NWJA 1B1HA 5CC2A 3FVKA 3OSQA 1R9QA 1SW1A 4IGRA 5FHOA 5ITPA 5I58B 3E13X 2DXRA 2ZNTA 4F22A 3IORA 4LUBA 1B05A 3K2DA 3K6UA 1NL5A 2AL4A 1URGA 1N0TA 3ILUB 1ZMGA 4GXAA 1B6HA 3FVGA 3HV1A 2DQVA 1BLFA 4BDLA 4RPOA 1Y3QA 2V93A 4PFYA 2RC8A 2XXTA 1LAGE 4YKKA 3IOTA 3ODBA 1DPEA 1B7HA 3VVFA 3OD7A 1B3EA 3GBAA 3KN7A 3H6TA 5H8SA 3PUXE 4U1ZA 2QS2A 1LFHA 5I2NA 4N6PA 1MDP1 2WKYA 4G68C 2Z8FA 3C9HA 1B4ZA 4GVOA 3SEYA 3HSTA 1YAEA 2VP1A 5I84A 4YB6A 1Z7NE 4O3BA 3TTLA 4I62A 1B7UA 2ZYKA 2F5XA 3OENA 4ZEDA 3IL1B 3RPWA 4F3SA 4EQ7A 2FYIA 5I59A 4KPTA 2ZNUA 1JVYA 1Y4CA 1LCTA 1LAHE 4QFNA 1FTOA 1XVXA 1F9BA 1I6AA 4BDNA 1A40A 2Q8JA 2M8CA 2Q88A 4AB6A 4ZEBA 5HBCA 1WVJA 1XT8A 4OFLA 1MRPA 4YMBA 1II5A 1NNTA 1PB8A 4R2FA 4GL8A 1O64A 4LZ8A 4POXA 5AA1A 4IB2A 4R73A 1GV8A 4I1DA 5DEXB 4EF2A 3FVNA 1QVSA 1DOTA 3T9VA 4LZ5A 3LSFB 3DM0A 2HAUA 3EN3A 5KZTA 4G77A 2G93A 3PUVE 1ZIUA 4JB7A 4PE5B 5B7DA 2I0CA 5H8QA 2D5WA 3PUWE 2Q9TA 3KGCA 4OVJA 4OTEA 4RK9A 3TTRA 3TZAA 3KBRA 1UQWA 2H9BA 2F36A 1Z7ME 3K6XA 1VR5A 5CI5A 3MVYA 5CMBA 2R71A 2REJA 4MBPA 1ELJA 1B2HA 4IY5A 2NOOA 3CVGA 3V5AA 3SEXA 3QYTA 4NF6B 1M5DA 1LLSA 1MY1A 4RY1A 1EZ9A 3C4MA 3LSLA 4ESWA 3IB0A 4QFPA 1NMUA 2Y7RA 1CE2A 2DVCA 4NF5A 4U1OA 1P1QA 3LC8A 1A7LA 4OETA 2E1SA 1NNKA 3SEWA 2UVGA 4ZS9A 1AMFA 3BKIB 2UVHA 1Y1MA 3C36A 3SKPA 2DWIA 2I3VA 4LVQA 4HCWA 3P7IA 1L5TA 4G68A 1JEVA 3EHSA 2F97A 5I2KA 4U22A 3LSWA 3G3FA 4ZE9A 1SW5A 2Y7PA 2GFEA 3KSJA 2DSFA 4JWYA 1VFEA 1JEUA 4XKNA 1US5A 3ONMA 3TDJA 4DIGA 3DP6A 2XXQA 2HZLA 2O1MA 2YJPA 2AL5A 1OQHA 2IA4A 3FD3A 4JBZA 1VE4A 3RTFB 1OQGA 1S7YA 2RKMA 1MQDA 5L9OA 4RK2A 3R26A 4QRZA 5F1QA 2I0BA 3A3UA 4Z0IA 1I6QA 3TPAA 5FTHA 2QSXA 3PPNA 2F6GA 5AA3A 3VLWA 4JXIA 5BUUA 3Q25A 1B3HA 4R6YA 2D21A 3K02A 2NVUB 1EU8A 2UYEA 1URDA 4FIMA 4F31B 4HS7A 4H8JA 1Y3PA 4GQOA 2Q89A 4F19A 1QUJA 3KZGA 2DXYA 1EH3A 3H4ZA 3UORA 4LONB 2XXHA 3LSXA 1B51A 3T9UA 3TMGA 3G3IA 1MM7A 1IUDA 4LQ2A 1RKMA 2DE4A 4WEDA 1QJMA 2NUVA 3N94A 1HSJA 3G3KA 5FHMA 3VLUA 1M5FA 4BDMA 4NWDA 4F3BA 1XC1A 1A55A 3C32A 2R6GE 2RF1A 1SDXA 3KSXA 1FQDA 1NH7A 4ZECA 3FZVA 2XXUA 4DCYA 3IR1A 1YCJA 5I58A 3TEPA 3JZJA 1Y9UA 1H76A 4H65A 1ZBMA 2OLBA 2UVJA 1WDNA 4TOZA 1TT1A 2O69A 5IKBA 1P1OA 5F7VA 3CSGA 1IIWA 3AXFA 3MVXA 4YZZA 3O66A 4M4GA 1ATGA 1B5JA 4GIZA 3UP9A 4QSDA 5CM6A 2ZXTA 2YPNA 2AIXA 3E4RA 1B0HA 1O7TA 2VD2A 4IO6A 3Q27A 4P0GA 4PFWA 3TODA 3PMXA 4LQ5A 1HSLA 4OQOA 1TFDA 4KCDA 1US4A 4U2RA 2I3WA 2H99A 1MH3A 4X48A 5H8HB 2F34A 1GTKA 4WEPA 5ELVA 4IO5A 5K2XA 3H7MA 1NKXA 2ANJA 1SBPA 4YMAA 5A5XB 1MY3A 3LUYA 1Y20A 2QMWA 1QUIA 4ZZAA 4ZEIA 3PPOA 3B6TA 3TTMA 2XXVA 4KYSA 3MVWA 5AE4A 2DWJA 1DPPA 2QRYA 4PFTA 1B3FA 1MQHA 4KI0E 1JETA 3MPLA 3O6HA 3T9HB 3M3FA 4EQBA 4IO3A 1A8FA 1PB9A 4FE8A 4G2ZA 5J1DA 3CRBA 5L9MA 4RJZA 1LBBA 5CMMA 3CSBA 2PYYA 4OEVA 3O28A 4OZ9A 4OEUA 4H5GA 5DEXA 3Q29A 4EF1A 3IOUA 4Q8RA 3FXQA 1FQAA 2XXYA 4N07A 4OFOA 5K2YA 5L9SA 1TWYA 1N04A 1BIYA 1B46A 4DE8A 3B7DA 4C0RA 3L6GA 4ND9A 2Z8EA 3DLNA 3R6UA 5TP9B 3RGYA 4OESA 1JW4A 3V8XB 1FQFA 4N13A 1UTBB 3IJOB 3EHUA 1XHYA 3TYHA 3I5OA 4BDOA 3SETA 4DXBA 2DE3A 1B1XA 1R1NA 4GWOA 2KLFA 2O7UA 2DYXA 2O1LA 3CFXA 5DVIA 4QHQA 4F1VA 4F3PA 2I49A 3VVEA 4NF6A 2P1SA 3IK6B 1UTHB 1WODA 2HXWA 2XD3A 3ZS6A 3UIFA 5HM4B 4F1YA 2REGA 1DSNA 1OLAA 4K3FA 1A54A 3QSLA 4IO2A 3KG2A 1QULA 4E0WA 3OEKA 3LBSA 3S2VA 2THIA 1NH8A 2QS4A 3T96B 2ZYOA 2Z8DA 3UK4A 3JV9A 1URSA 3U92A 2CMOA 2H98A 4L17A 3LR1A 4EQ9A 2Y7WA 1MXZA 5CBRA 4EXLA 4X1DA 2ESNA 3MBPA 3TCFA 3E9XA 3PUZE 1MPCA 4PFUA 3IX1A 2A5TB 3CG1A 3IOVA 1NFTA 5H8FB 2PVUA 4I9DA 3FV2A 1MM6A 3OMBA 2AYSA 4HCYA 1IEJA 2W7YA 4YKIA 1EZOA 3VE1B 3MJNA 4GOTA 4F1UA 4C1UA 1T0KA 3VV5A 4DCXA 3MUQA 4HW8A 1LSTA 1USYH 4R74A 1PDAA 1OIBA 1R6ZA 5KCJB 4THIA 5KDTB 5CRYA 1AL3A 4G4PA 3G3GA 3C34A 1R9LA 4TLLB 4FECA 1FTMA 4G8NA 2D3IA 4F2QA 4JWXA 1MQIA 3DP4A 5AA4B 3MZ9A 3BFUA 1M5BA 3MP1A 1S9TA 2DWAA 1MG1A 4Q0CA 3W9WA 4NMYA 5M2VA 2Z22A 4YB5A 1B4HA 3CFLA 3OEMA 3ZSFA 4KFQA 3PPQA 2PX1A 3U1OA 4FJPA 5CBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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