4U21A

Glua2flip slbd complexed with fw and (r,r)-2b crystal form e
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u21A02
3CVGA 1NNPA 4GIZA 4H65A 2ESNA 4IO4A 4JWYA 1MY3A 2Z22A 1S50A 2ZYOA 4YICA 3IO4A 3H6UA 3K6XA 4H8JA 1AMFA 4LQ5A 3PUVE 5B7DA 4ZZAA 3PMVA 4DCYA 1MXYA 2PBWA 3QIMA 1UIUA 2DXYA 4DIGA 3JV9A 4FIMA 1LBBA 3DM0A 5F1QA 4YKJA 2I3WA 4KFQA 4XXUA 1SW1A 1RKMA 1NH7A 4OMBA 3Q26A 1J1NA 3MBPA 4EF1A 3IJXB 4POWA 2Y7KA 4KR5A 1FW0A 4HW8A 1XOCA 3M3FA 1XS5A 2YJPA 4PFYA 1BIYA 4FORA 1QKBA 3KJTA 1MPCA 3OELA 4G68B 3TCGA 4KYEA 1SYIA 3Q27A 3ZS6A 4JWOA 3C33A 2ABHA 1DTZA 1QJMA 1JEVA 3EQ1A 1MQDA 4IGRA 1EU8A 3S4UA 3H03A 3IORA 4QSEA 2ZNTA 3QK6A 1WDNA 1PEBA 1SQYA 3WAFA 3C31A 3KEIA 3KSJA 3G3FA 5CMBA 3MVWA 1LAFE 4KCDA 4QFOA 4U1OA 1NNFA 3K6WA 3TQWA 1HSLA 2VHAA 3FJ7A 3M8UA 1B4ZA 3RY3A 3RN8A 1D3KA 4LZ8A 4LZ7A 2B3FA 3TPAA 2X7PA 2Z8DA 2DSFA 2F35A 1VSOA 1VFEA 1MPDA 4O3BA 4ZECA 3O6HA 1CB6A 3N94A 3TYHA 4X1DA 3FD3A 3ONMA 5KCJA 3VDFA 3E13X 1B5IA 1JNFA 4I62A 2D21A 1QKAA 3K01A 4RPNA 3K4UA 3FUZA 2NWJA 5I2NA 4F31B 3EHSA 4LONB 2HAUA 4I9DA 1M5FA 1R9LA 4RA1A 3TTRA 4IY6A 3CG1A 2X7QA 2NVUB 3OD7A 3T9UA 3K6UA 4IO5A 4OEVA 1TT1A 2I0BA 4KPTA 4KD5A 3FXQA 2XHDA 1SW5A 4GOTA 1DSNA 1A7LA 2HZLA 3QYTA 5AA4A 1BKAA 3O6IA 3W9WA 1SDXA 4MLQA 2Q9TA 2FNCA 2LAOA 3PPRA 1VR5A 5CMKA 2O51A 1QULA 4YKPA 1B2HA 4R6YA 4R74A 1OMPA 1ELJA 2V3QA 4GLIA 1UQWA 4MH5A 5I56A 2O6AA 3PUXE 1EH3A 4HCYA 4YB7A 1QUKA 1FTKA 1IXHA 3G7WA 1PBPA 4BDQA 1YCJA 4G77A 2I0CA 3F11A 3H4ZA 4JB7A 2I4CA 1H45A 1MM6A 5CRYA 4HTGA 4LA9A 5DEXB 2RINA 3DELB 4ELRA 3A09A 3UN6A 3IOTA 3A3CA 4G8NA 2REGA 3EPEA 1MXXA 4AB6A 1DPEA 4LZ5A 3PGFA 3PUYE 4OWDA 3B6WA 1USYH 3B7DA 3OEMA 4DCXA 5DVFA 1JVYA 3PD9A 4QHQA 1Y1MA 3FXRA 2A5TA 3HHFA 2HEUA 2F78A 4FATA 2XXUA 2V3UA 4YB5A 1MM7A 4ZEKA 5A5XB 3H6VA 4P11A 3S9EA 4KCCA 1IZ1A 1US4A 3IK6B 3SEWA 1N0TA 4WKMA 4R2BA 3SEYA 2H98A 3IR1A 1I69A 3LC8A 3UA8A 2DWAA 3OO7A 4NF6B 4POXA 3MW0A 4F3GA 1GV8A 1WVJA 1AH5A 3MZ9A 2ZMBA 1OLAA 1SI0A 3CSGA 2XXPA 1FQEA 1MH3A 1GGGA 4ELPA 3L6GA 5HBCA 1US5A 5JTYA 5KDTA 1FQFA 2M8CA 4GD5A 3HN0A 2V93A 4NF4B 3VLWA 4MBPA 2UVIA 4IO2A 1Y3NA 4XTCQ 3VV5A 1NH8A 4PQJA 4GFRA 2HAVA 1WODA 4H0WA 4I1DA 1IUDA 3UORA 3PUZE 4JSOA 4JSDA 5TPAA 1M5DA 1QUIA 3BFUA 2UVGA 4XKRA 3GXAA 1DPPA 1B3LA 4NWCA 2FYIA 1I6QA 2IA4A 3KZGA 4KYDA 3U93A 2QMXA 2REJA 3HSTA 4ONYA 1NFTA 4JBZA 1OVTA 3TDJA 3FVNA 3KFMA 4GF8A 4EQ7A 2XX9A 2OWSA 3MZ1A 3O28A 4ESWA 4RY1A 5CBRA 4R72A 2OBGA 3RLFE 3LUYA 1N3WA 4YKIA 3OO6A 5HM4B 2H25A 1B52A 4DZ1A 4G8MA 3DP8A 4R6HA 4IO7A 2DVZA 2QS2A 1URDA 4X9TA 2XXWA 3K1MA 4HCWA 5IAIA 3MC2A 1T0KA 4OHNA 2I3VA 5CC2A 2F7AA 2PVUA 4E0XA 1MPBA 3E9XA 1DMBA 1O63A 1SW2A 2E1SA 4BLAA 4GQOA 3FVOA 3VXBA 4OYVA 4PP0A 4AB5A 3KJ7A 2R9JA 1A8FA 1ZMGA 3OEKA 4UACA 4OVJA 2I58A 4DXBA 5H8HA 4M1VA 2Q2AA 3UK4A 4H6DA 2DYXA 1MXVA 3RNNA 3HO7A 1OVBA 3VVDA 3VXCA 1Y3QA 3MPLA 4U4SA 1A99A 2QS1A 1SYHA 1P1QA 3USDA 4BDOA 2DS9A 4DXUA 4QF9A 5BWJA 4ZEDA 3OXNA 2XXVA 4EF2A 1QUJA 1CE2A 5KCJB 1H43A 3KG2A 3RQTA 1URGA 3K1PA 3PMWA 5I2NB 3TELA 3FGSA 4YMAA 3THIA 1UTHA 3TZAA 1MQIA 1NMUA 4GL8A 1PB7A 1MDP1 4OZ9A 1B46A 3Q29A 2GH9A 1Q35A 4YKKA 1HSEA 3IOUA 4WEDA 2W7YA 3UP9A 4RYAA 3LR1A 3OSRA 4C1UA 4OENA 4XKPA 5AA4B 1TFAA 1TXFA 5AA3A 3KBRA 5CMCA 5CBSA 3AXFA 1B3HA 3SEVA 4DLDA 2I4BA 1LB8A 3CFXA 5ITOA 4OFLA 3L6HA 4K3FA 3FASA 3TEPA 2RC9A 1S9TA 3IOVA 3V8XB 5I56B 1EZPA 2F5XA 3MPKA 4BDRA 4F18A 3RTFB 4NF5A 1N76A 3I5OA 4F1VA 4EQ9A 4YB6A 4F2QA 1NKXA 4KHZE 4QSCA 4RJZA 2XXRA 3PPQA 1JQFA 1D9YA 2GHAA 4F3SA 1PB9A 3N6TA 1HSJA 3Q25A 4PE5B 3HV1A 4U21A 1M5CA 1OIBA 2YLNA 2P1SA 1ZJLA 2HCAA 1ZTYA 5H8NB 3C32A 4JDFA 5AA2A 3ODBA 1LSTA 3OSQA 5I58A 5I2KA 4WXJA 2VD2A 1Y20A 3H06B 3MVZA 2A5TB 4UA8A 1D9VA 1R9QA 4AQ4A 3LSXA 4LQ2A 4OXVA 2Z8EA 5FTHA 2VGQA 5ICQA 2RC7A 1N7XA 3LSFB 2O1LA 1MY4A 5IKBA 4GWOA 3VLVA 3D4CA 5FHOA 1B05A 3K00A 3P7IA 2Q8JA 4Q0CA 2PX1A 2B65A 3H3GA 4N13A 4R73A 4ZE9A 3TMGA 5AA2D 1MH4A 2WKYA 2DP8A 4OEUA 4Q5TA 4ZE8A 2QMWA 3W9VA 2G93A 2DWJA 3PD8A 4YU0A 2AIXA 3SERA 4RPOA 2Z8FA 1ZKBA 3FXUA 4M4GA 4NF8A 5JTYB 3C35A 3EHUA 2XD3A 3SEUA 2QS4A 4PFTA 5JEIA 2ANJA 1P99A 1B5HA 4XKNA 3RPWA 5F7VA 1FTOA 2OWTA 1ZBMA 3PMXA 1QW0A 3I3VA 5TPAB 4U2RA 1JW1A 1Y1ZA 4FECA 4H5GA 4F3PA 3R6UA 3B6TA 2Y7RA 1OQGA 1M5EA 3HPIA 2P0SA 1B32A 3O66A 1P1WA 4QFLA 4G2ZA 3CIJA 2OK2A 3G3GA 5TU0A 3PPNA 2X26A 3TAJA 2PT1A 4R6KA 1BTJA 3TQLA 3U8QA 3MP6A 4F3BA 4OQOA 1FQAA 3PU5A 2HFBA 4MLVA 2Q88A 1GVCA 3IB1A 2UXAA 1MQHA 1A40A 1XT8A 4EUOA 2H5YA 2QSXA 1O7TA 3TKDA 3CR9A 3K0VA 3GBBA 3LBSA 5BUUA 2CMOA 4FEDA 4IO6A 5FHNA 3U72A 4MF3A 3K6VA 3G3IA 4F29A 5I59A 1Y9UA 4NEDA 5I57A 5ITPA 1IITA 3FVGA 4L17A 4U22A 4BDNA 1UTBB 4G8HA 1N84A 3CSBA 3MAMA 1B6HA 2VD3A 3VVFA 3KSXA 3ECRA 1JETA 5B70A 1SBPA 1NNKA 5H8HB 3C4MA 4GL0A 1Q1KA 3MQ9A 4LP2B 4EXLA 3V83A 1DOTA 4ESXA 4F22A 3BBRA 3TUSA 3S9MC 2H99A 1P1OA 3C9HA 1RYOA 1B4HA 3SESA 3S9NC 4Q8RA 3O9PA 3IJOB 1H3DA 3S2VA 4OFOA 3H7MA 2D3IA 1BLFA 4RXLA 2ONSA 3MVXA 3QAXA 3RGYA 3TTNA 2B3BA 4I8CA 3TTKA 4ZZEA 1B3FA 5K2YA 3EN3A 5H8FA 1LLSA 4NTLA 1UTHB 4BDLA 4E0WA 1MQJA 4G68C 4RK2A 3C36A 3T22A 1LCTA 1LFGA 3MWBA 1LBCA 2XD2A 3N26A 1B1HA 1EZOA 4R9FA 3B6QA 1MY0A 2AL4A 4F19A 4ZEIA 1SD3A 1VE4A 1R1NA 2XX8A 1EZ9A 1JVXA 3N5LA 3R26A 1AOVA 3IX1A 2I48A 3JZJA 3CRBA 2DWHA 1ATGA 3QUFA 2RCBA 2ALUA 4ECFA 1OQHA 2F34A 2E0SA 3FJMA 1ANFA 1B7UA 2QRYA 3EHTA 4H67A 3ZKKA 3KGCA 3FIRA 1B58A 1YTVA 2Y7WA 1MXUA 2HXWA 1QVSA 2PMSA 3OOAA 1LFIA 2ONKE 4OERA 1N04A 1IQ7A 2O7UA 3T66A 2HZKA 2ZYKA 2RC8A 3BKIB 4NF5B 4NF6A 1A54A 5HPQA 2F6PA 3TFLA 3MZBA 3FZVA 1JW4A 1ZIUA 4IO3A 3FV2A 3ZSFA 2R6GE 2O7IA 4R9GA 2DE4A 3FJGA 1TFDA 1NL5A 2PT2A 3FVKA 1FTLA 3V89B 5FTIA 4Z7EA 5L9MA 3E3KA 1MRPA 1SVXB 4LUBA 4P0GA 5EHSA 5J1DA 3QUJA 2KLFA 4TOZA 5AA2B 4ZDMA 3WAEA 1I6AA 2RKMA 5I58B 5I2KB 3I6VA 2UVHA 3ILTB 4GXSB 2FA7A 3R7XA 1PB8A 3PUWE 1LAGE 5EYFA 5KZTA 3PV0E 4IY5A 2OLBA 2NXOA 3S9LC 1YAEA 2XXXA 1B7HA 2Q2CA 4R75A 1IEJA 4YZZA 3K1NA 5LOMA 3RTWB 1UIVA 3GBAA 2Y7PA 3O6GA 4DXCA 1MY1A 3OO9A 1LAXA 2OZZA 1AIVA 3DLNA 5DVIA 2ZNSA 3KN3A 3Q28A 2QPQA 1SI1A 3VE1B 1PDAA 1LAHE 2RCAA 3A3UA 1XVXA 2F6GA 3OO8A 3T96B 2Y7IA 4QFNA 5JK4A 4EQBA 4NF8B 3HHGA 3SDFA 1LCFA 1POTA 4FJPA 4WEPA 3OENA 2UYFA 5H8SA 1Z7ME 1FQCA 1I6BA 4GVOA 2XXIA 1Y4CA 1PBQA 4C0RA 4U23A 2DVCA 4QFKA 4ELQA 5H8QA 2DQVA 1B0HA 4XIGQ 5DYHA 3LSLA 4IB2A 4MFIA 4OFJA 1R6ZA 2VP1A 4C1TA 1FQBA 3RT8A 3RT6B 1A55A 4OTEA 5EHMA 1D4NA 4GXAA 1XVYA 1PC3A 2OJTA 4KYSA 2HQ0A 5TP9A 4Z0IA 2O68A 3MVYA 5DVJA 1Z7NE 5AE4A 1GTKA 3MP1A 1A8EA 4PFWA 4TLLB 1USYE 1B3GA 4G4PA 2XXQA 1MQGA 4U1ZA 1IXCA 3N6UA 4IGTA 3T93B 1B9JA 3MJNA 2O84X 3M3KA 3U94A 4DDDA 3IAZA 1URSA 3CI8A 2AL5A 2GHBA 5I59B 1B7ZA 2GRVA 1S7YA 5L8DA 3C34A 5I57B 4YAHX 1AL3A 3TTMA 3UGWA 4F2OA 1LFHA 4X1BA 2ZNUA 1IXIA 5ISUA 3O29A 5CM6A 3K2DA 4OETA 1MG1A 2V25A 4ZS9A 4RNSA 5DTBA 2F7BA 4G68A 4X48A 5KDTB 1N3XA 2ZYNA 4F39A 1LB9A 1ZLQA 3HCQA 2G29A 2H4IA 5L9OA 3TCHA 4QFPA 4F1YA 4DE8A 1MXZA 4H5FA 1B3EA 3QXMA 3BFTA 1IIWA 4ZEFA 2RF1A 3PPOA 2DOJA 4O3AA 1H44A 4PETA 3FV1A 1Y4TA 2A5SA 2CZLA 2F8DA 1P1NA 3T9HB 3GLBA 1KWHA 1SW4A 2AYSA 1JW5A 1JEUA 3RUMA 3G3KA 1RYXA 4LVQA 5H8FB 3D4GA 1LGBC 2I6EA 5CI5A 4BDMA 1MS7A 3E4RA 1O64A 2F36A 3PPPA 3CG3A 2V3TA 4P0IA 3ILUB 2YPNA 2Y84A 5ELVA 2QL3A 5H8NA 2XXTA 4NWDA 4GRKA 3T9VA 3KN8A 4PFUA 4N07A 1MDQA 2DWIA 3ZKLA 5K2XA 2V84A 3H6TA 2D5WA 1POY1 4ND9A 4FAJA 1N7WA 3IO6A 4KQPA 1MXWA 3VVEA 1YPNA 3H6WA 3MP8A 1VFDA 3T9XB 2NOOA 1P1UA 4ELOA 2NUVA 3SEXA 4XKQA 3V5AA 1M5BA 2O1MA 3DP4A 3GZGA 1XC1A 1MY2A 2H9BA 3CFZA 3EF7A 2XX7A 2Q89A 1B40A 3DP6A 4JXIA 4NMYA 1Y3PA 1GR2A 2R71A 3JYRA 3O2AA 4HS7A 2ONRA 2XXYA 2OCUA 2BJJX 4LATA 4ISUA 3O97A 3G3HA 4JWXA 1OLCA 4N6PA 4EDPA 1H76A 3TODA 3KN7A 4NE4A 4YMBA 5DEXA 4ZEBA 4RK9A 2F97A 4H1XA 3OMBA 2I49A 2GFEA 4THIA 3W15C 3MUQA 5ICTA 1B51A 2VOZA 3QSLA 5I84A 1F9BA 3FATA 2QJEA 3M3LA 1DTGA 2ZYMA 1B0LA 5CMMA 4TLMB 2DXRA 1ZU0A 2IEEA 3SKPA 3G3JA 4U4XA 2O69A 2QS3A 2Z23A 1TWYA 3IB2A 3UIFA 3U1OA 3TTLA 5A5XA 2XXHA 1L5TA 3SETA 4R2FA 4FEBA 4KI0E 2UYEA 4Q30B 4F1UA 2ZXTA 5AA1A 4OESA 4QSDA 1B5JA 3IB0A 3KOSA 3LSWA 2DE3A 3IL1B 5M2VA 3KOTA 4O3CA 1II5A 1FTMA 4EXKA 1BP5A 5DT6A 1FQDA 1UTBA 2UVJA 5H8QB 3TCFA 2DE2A 1XHYA 4FE8A 4H8IA 1IXGA 1FTJA 2P2AA 2THIA 4QRZA 3K02A 3VFJA 3U92A 1FCKA 3VLUA 3CFLA 4NF4A 1B1XA 2PYYA 2F7CA 5TP9B 1NNTA 5L9SA 3IOWA 4TQUQ 5FHMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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