4U2RA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j, flip variant) in the apo state
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA02
3S2VA 2XXXA 3OO7A 1B3EA 4EQ9A 4RK9A 1JW4A 4C0RA 3U1OA 1NL5A 3JV9A 4DIGA 3LUYA 4XKQA 4OQOA 1MS7A 2XHDA 4JXIA 3KGCA 2I0BA 3BKIB 3G3GA 3QIMA 4YKPA 4EDPA 4YAHX 3DP6A 5B7DA 2OWSA 3MWBA 3KSXA 1I69A 5ISUA 5FHNA 4ZEFA 4ZEBA 3Q28A 4WXJA 3OENA 4OWDA 4QFNA 4BDQA 2F36A 3JZJA 3E4RA 4JB7A 2OK2A 5I56B 2RKMA 1L5TA 1LFHA 1NH8A 3SETA 1FTOA 2REJA 2Q2AA 3RY3A 3CR9A 1B3LA 4WEPA 4EXKA 4PFYA 3Q27A 3T9UA 2I3VA 1SQYA 3FXQA 3OSQA 4IO4A 3PUXE 2F5XA 1DOTA 5KZTA 4OTEA 1SI0A 3FGSA 3IO4A 4AQ4A 4GFRA 5EHSA 3USDA 3IAZA 1PEBA 5TP9B 1LB8A 1ZMGA 1YPNA 2GRVA 3VLWA 3B7DA 2VOZA 2Q9TA 2F34A 3M8UA 2QMXA 2B3BA 1B3HA 4KI0E 1AMFA 1YAEA 3QUFA 3HCQA 3SEXA 1II5A 4KYEA 4OFJA 4R6KA 4H65A 2XXHA 1MXZA 4GRKA 1SDXA 1JW5A 1Y9UA 1IUDA 4EQBA 3CG1A 3A09A 5AA4A 2DSFA 3SEUA 1Y4TA 2WKYA 1JETA 2I49A 1A8EA 3N94A 1NNKA 3DP4A 4THIA 3OOAA 3FIRA 1M5DA 1POY1 5TU0A 1MG1A 1B0HA 3VVEA 1S9TA 4LONB 3MZ9A 3A3CA 1MQIA 3L6GA 1BLFA 4BDMA 3G3FA 1SVXB 1Z7ME 4HS7A 3PV0E 2ESNA 4KCCA 5DVFA 1B4ZA 3FV2A 5L9MA 2Z22A 1HSEA 4POXA 1O7TA 3H7MA 4PP0A 4F29A 5ITOA 1PB7A 1Y3QA 1XVXA 5A5XB 1IXGA 3O9PA 1RKMA 5JTYB 3KZGA 5I2KA 3WAEA 1FQDA 1LAXA 1SI1A 3U93A 3W9VA 4QFOA 2DE4A 3K1PA 3HV1A 1LBBA 4FJPA 1I6QA 4R6HA 3CIJA 3Q26A 4TQUQ 2DP8A 4QFPA 1PBQA 1LAHE 5EHMA 3O6HA 4QRZA 1AH5A 1MQGA 2H98A 5L9SA 5K2YA 2RC8A 3HHGA 4G8NA 3C33A 3QUJA 4R72A 3Q25A 1IEJA 4G8MA 2Y7KA 4NE4A 5H8QA 3FXRA 3A3UA 3QYTA 3G3JA 4NF5B 1MXUA 1IZ1A 4ZZEA 1UTHA 4NF4B 5KDTB 3VXBA 1B5HA 3OMBA 1LLSA 1MM6A 1OLCA 5I58A 2XX7A 4YMAA 2XXQA 3K6WA 2HAUA 1N3WA 2HFBA 4EXLA 4KCDA 3F11A 2NWJA 3HN0A 3MPLA 4QSEA 2G93A 1A55A 2HXWA 4KYSA 4KHZE 1FQEA 4ELRA 4MH5A 3OD7A 5H8SA 4ELOA 2VGQA 1B1XA 3KOTA 2PT2A 4M1VA 1LFIA 3PPRA 4WKMA 1P1WA 2QS2A 3PUWE 4QSCA 1FW0A 5AA2B 3OEKA 1FTKA 3ZKKA 4LZ7A 5CBRA 4FECA 1Z7NE 3K2DA 4F1UA 1SW5A 4ZE9A 3CSBA 4LP2B 3PPNA 4MFIA 5I56A 1B46A 4OYVA 1FQAA 4U4XA 3ILUB 3K1NA 3R26A 4YMBA 1XC1A 4ZEDA 4GIZA 1MQHA 3DLNA 1IXHA 3EF7A 1H44A 4F3PA 4OENA 5EYFA 2O7IA 1UIUA 4QHQA 1P1UA 1QW0A 1FQBA 1B7ZA 3VVFA 3L6HA 3K01A 1LGBC 4JSOA 3VVDA 4GLIA 1R6ZA 2HEUA 1TT1A 1EZ9A 1HSLA 3OO8A 1ZU0A 3DELB 3S4UA 1PB9A 2Q88A 4YKKA 5IAIA 3PMWA 4MBPA 3W15C 4R74A 5TP9A 3H3GA 3RTFB 1SYHA 2ZYOA 2X26A 3FVNA 5I2NB 3ZSFA 2Z8DA 3FV1A 4GL8A 5CRYA 5DT6A 4ZE8A 1Q1KA 3FJMA 3IJOB 3PD8A 4GL0A 4LUBA 3GBAA 3VLVA 5FHMA 3IORA 1H76A 3ILTB 3H6VA 4PQJA 1UIVA 3B6TA 1ZBMA 1B5JA 3CSGA 4TOZA 2REGA 1BP5A 2F97A 1CE2A 1JEUA 4GVOA 1IQ7A 4Z0IA 1MQDA 3U92A 2A5TB 1H3DA 4JWOA 3UA8A 1MQJA 3PPPA 2O84X 3N6UA 1XS5A 3HSTA 3KN8A 5H8QB 4DXBA 4H5GA 2F7BA 1ANFA 4HCYA 3ONMA 4F1YA 5L9OA 3C9HA 4OERA 2UVIA 3S9MC 3VV5A 1M5BA 4DXUA 5ELVA 1EH3A 3RUMA 5CMBA 2H5YA 1JW1A 1OQHA 4HTGA 1N84A 4FEDA 2CZLA 2DWAA 4XXUA 3PU5A 4K3FA 4LZ5A 1SBPA 3E3KA 4F2OA 1IIWA 2HCAA 3MVYA 2F78A 1TFDA 5A5XA 2XXVA 4BDLA 3QXMA 1WDNA 4H8JA 1B32A 5K2XA 5JTYA 2B3FA 3GXAA 3T9VA 1Y3NA 3PUVE 4YKJA 4IO6A 2Z8EA 1VSOA 4YU0A 1QUIA 2NUVA 1QULA 3SDFA 3O28A 1URSA 1USYE 3G3IA 3FVKA 3G7WA 4X1BA 3C31A 1J1NA 4N07A 1Y4CA 1MY2A 4NEDA 4IB2A 3I3VA 4FATA 1B7UA 4F3GA 3O97A 5CBSA 4EUOA 3B6WA 3H6UA 1O63A 1AOVA 4Q0CA 2GH9A 4JBZA 4FE8A 4NF5A 2GFEA 1ELJA 1P99A 4IO7A 3K4UA 3S9NC 4YB7A 2X7QA 4NF4A 2I3WA 5KDTA 1IITA 4XTCQ 1A54A 4ND9A 1YTVA 2XXRA 3UP9A 4EQ7A 2QMWA 2P1SA 4QFKA 5LOMA 4X9TA 5HPQA 2DVZA 1LBCA 1MDP1 1NKXA 2DXRA 2FYIA 3MZ1A 2RINA 1ATGA 4DE8A 4Z7EA 4IGTA 2I4CA 4F3SA 1B5IA 4R9FA 2R71A 1FQCA 3CFXA 3M3FA 1N04A 2H4IA 2HAVA 5DTBA 1OIBA 1JEVA 3IR1A 5AA2A 1LAFE 4Q8RA 3FATA 1I6BA 1GVCA 1MM7A 2HQ0A 2XD2A 3TTKA 4BDNA 2Q2CA 2DOJA 5I84A 2V93A 3VXCA 5DEXB 2DXYA 4E0WA 4X1DA 1LCFA 1FQFA 3EHSA 1MDQA 1ZJLA 2O1LA 3C35A 4YKIA 2O51A 3UORA 1P1NA 2VP1A 3S9EA 3TCGA 2PVUA 1FTJA 2PBWA 1IXIA 3ODBA 2F8DA 1A8FA 1NFTA 1WODA 3T9XB 3LSWA 1UTBB 4ZS9A 4RJZA 3VDFA 1TXFA 1PC3A 3KOSA 4XKPA 3TAJA 3I5OA 3MP8A 4L17A 3BBRA 4ZEIA 4H1XA 3FUZA 2D5WA 4IY6A 5I2NA 4WEDA 1N0TA 5B70A 3V8XB 1QUKA 4BDRA 1VFEA 2I48A 3V83A 4ZECA 1MXYA 1YCJA 2UYFA 1AIVA 2QPQA 4DCXA 4BDOA 3KN3A 1F9BA 2DWIA 1QVSA 2ZNTA 4U2RA 3ECRA 3MVXA 3PGFA 3CRBA 3IOUA 2ALUA 3VLUA 4R9GA 3U8QA 4DCYA 4HW8A 5I59B 1MY4A 4JDFA 3TTMA 1URDA 2QS3A 2A5TA 2R9JA 1B0LA 2FA7A 3H6WA 4IGRA 3W9WA 2IA4A 3D4CA 3PD9A 1ZKBA 2O1MA 4QSDA 1S7YA 1ZTYA 2KLFA 1B4HA 4MLQA 2Y84A 1OQGA 4ZEKA 3V5AA 3HPIA 4PETA 1FCKA 1DMBA 3N6TA 1Y1ZA 3DP8A 1US4A 1JVXA 3FJ7A 3K6XA 1IXCA 1FTMA 3DM0A 1HSJA 5IKBA 3MJNA 1NH7A 5I57B 4FAJA 2RC9A 3TMGA 5JK4A 4OESA 1N76A 1LB9A 5CI5A 2ABHA 4XKRA 3VFJA 3PUYE 1MY1A 2PT1A 5DYHA 2GHAA 4O3CA 3FASA 1PB8A 1UQWA 2D21A 1MY3A 4C1TA 3C32A 3UIFA 4R75A 3IOWA 4HCWA 3TKDA 4P11A 3IO6A 2F35A 3QAXA 2XXYA 4Q5TA 3O6IA 5ICTA 3EN3A 4AB6A 1FTLA 3Q29A 1N3XA 1A40A 3C34A 3OXNA 3B6QA 4R6YA 1M5EA 1VR5A 2NOOA 4IO3A 3N5LA 1OMPA 2OJTA 4G68C 4H6DA 4M4GA 2NVUB 1OVBA 4OZ9A 3TPAA 5HM4B 3IJXB 4KD5A 1M5CA 5DVJA 2DYXA 2W7YA 3R6UA 4H0WA 3TUSA 4H8IA 4N13A 2I0CA 4YB5A 4RNSA 4GWOA 2OZZA 4OETA 3IOVA 1AL3A 1B52A 3K0VA 4QFLA 3EHTA 1XOCA 1GR2A 3MP6A 4H67A 3U72A 1QKAA 2F6GA 5AA2D 2O68A 1QUJA 1O64A 4R73A 3LC8A 2NXOA 4OVJA 1EU8A 1SW2A 2PX1A 3CFLA 1QKBA 3T22A 3V89B 4MF3A 4I8CA 2DVCA 1RYOA 3IOTA 3BFUA 1MXWA 1DPPA 2PYYA 2UVGA 2H99A 4BLAA 1USYH 3IB2A 2ONSA 2QS4A 2ONKE 1SW4A 2V25A 1B1HA 2Z23A 5DEXA 1B2HA 3TCFA 2H9BA 4F18A 4PFUA 3CI8A 5KCJB 2RCBA 5L8DA 1I6AA 1T0KA 1H43A 2R6GE 2XXIA 4I9DA 3KJTA 1ZLQA 2AL5A 3TQWA 3QSLA 5H8FB 3UK4A 1P1OA 2AL4A 1UTBA 3G3KA 3UGWA 3KFMA 1H45A 3E13X 2DE2A 5TPAB 3SEYA 2G29A 2D3IA 2XXPA 2ANJA 3RT8A 1MXXA 1MY0A 1B51A 4LA9A 2DS9A 3FZVA 3H06B 3CG3A 4PFTA 2HZKA 3RPWA 2Y7PA 4KFQA 2VD3A 4NF6B 4OFOA 1Y20A 4OXVA 3FVOA 4G68B 4X48A 4LQ2A 2UVJA 1D9VA 3BFTA 2A5SA 5F7VA 3C4MA 2QJEA 5BUUA 3TTRA 3LBSA 1LCTA 4UACA 2YLNA 5H8NB 3RT6B 4RA1A 1SW1A 1URGA 4H5FA 4RY1A 1ZIUA 5H8HB 4R2FA 1TWYA 5I59A 1B9JA 1A7LA 3TYHA 4YICA 5AA3A 4NF8B 3MW0A 1MH4A 2OLBA 5HBCA 1M5FA 4ECFA 5CC2A 3RGYA 4JWXA 1D4NA 3MQ9A 2E0SA 1QJMA 1B05A 2O69A 2FNCA 2PMSA 1Y3PA 1LAGE 1EZOA 1B7HA 4JWYA 1DTGA 3TDJA 1RYXA 3MP1A 2ZNUA 3U94A 4IY5A 1NNPA 4LZ8A 1B6HA 3KJ7A 3P7IA 2XXUA 4FEBA 3D4GA 2Y7WA 2IEEA 3O29A 1JVYA 5CMCA 3TFLA 2DQVA 4POWA 5I57A 2VHAA 3ZS6A 3MVZA 4OHNA 3AXFA 4G8HA 1B40A 4PFWA 2P0SA 3MUQA 3EQ1A 4KYDA 4NWDA 3K6VA 1XT8A 2B65A 2V3UA 4TLMB 1POTA 3SKPA 1MPCA 3T96B 3K1MA 1JNFA 1N7WA 3FD3A 2ZNSA 1PBPA 4FORA 4XKNA 2QL3A 3TEPA 3OO6A 2Z8FA 4GD5A 3IX1A 1LFGA 3LR1A 4AB5A 2RC7A 3C36A 4ELQA 3WAFA 4OEVA 2XX8A 1DPEA 4U1ZA 2V3QA 4LQ5A 5AA1A 4F2QA 4OMBA 3TCHA 4I1DA 3T66A 5JEIA 3OSRA 2DWHA 5FTHA 2AIXA 1TFAA 3HHFA 3N26A 4U4SA 5CMMA 1NNTA 3RN8A 3SEVA 3IB0A 3O2AA 4ESXA 4YZZA 5FHOA 2XD3A 5BWJA 3OELA 3UN6A 2CMOA 1BKAA 3K00A 1SD3A 3KSJA 3FJGA 2M8CA 4EF2A 1OLAA 1KWHA 1PDAA 2UYEA 4IO5A 4G2ZA 3M3KA 3LSLA 2ZYMA 2ZMBA 3MC2A 1D3KA 2GHBA 1Y1MA 1JQFA 3KG2A 2UXAA 4ISUA 4PE5B 2LAOA 2DWJA 4G77A 3KEIA 1GTKA 3CFZA 3OEMA 3PMXA 1VFDA 3M3LA 4O3AA 3IB1A 3PUZE 1XVYA 5KCJA 1WVJA 3MAMA 1DSNA 4F22A 1DTZA 3CVGA 4U23A 3MBPA 4G4PA 4DDDA 3GBBA 1OVTA 3K02A 3MVWA 4N6PA 2DE3A 5CM6A 1BIYA 4F31B 5H8FA 1US5A 2O6AA 3GZGA 3G3HA 3VE1B 1MRPA 4GOTA 5TPAA 1R1NA 4ESWA 1A99A 1Q35A 2ONRA 3LSFB 3TTLA 1D9YA 5ICQA 2I4BA 2Q89A 2BJJX 3T9HB 1BTJA 4NF6A 1NNFA 4G68A 1R9LA 4ELPA 5M2VA 3TELA 2QRYA 3O6GA 2ZYNA 4C1UA 3TTNA 3RNNA 4EF1A 4RPNA 3FXUA 1GGGA 2ZYKA 3OO9A 5ITPA 5CMKA 5H8NA 3THIA 3S9LC 2OCUA 3RQTA 3O66A 5H8HA 2I6EA 2XXTA 3KBRA 3MPKA 1MPBA 1R9QA 2O7UA 4UA8A 1CB6A 2Y7IA 4NTLA 4NF8A 2ZXTA 4FIMA 4RXLA 3EHUA 4P0GA 4R2BA 2VD2A 4KR5A 5AE4A 2QSXA 1GV8A 3RLFE 2F7CA 3RTWB 5DVIA 4JSDA 3T93B 1VE4A 3QK6A 4ONYA 5AA4B 4LATA 3HO7A 4P0IA 1MXVA 4ZDMA 1MPDA 2YJPA 1XHYA 4E0XA 4O3BA 4DLDA 2RF1A 2V3TA 1N7XA 3FVGA 1MH3A 4ZZAA 1LSTA 4XIGQ 4DXCA 3ZKLA 3PPOA 4I62A 3PPQA 2Q8JA 5FTIA 4YB6A 4GQOA 2AYSA 4IO2A 4Q30B 4GF8A 2F7AA 2F6PA 2XX9A 2V84A 5F1QA 1NMUA 3IL1B 2H25A 1B58A 3H6TA 3IK6B 1B3GA 4U21A 2OBGA 3JYRA 4GXAA 4U1OA 2I58A 4OFLA 5I2KB 1S50A 3H03A 4NMYA 3E9XA 3R7XA 3KN7A 2HZLA 2X7PA 4F1VA 3TZAA 2P2AA 3EPEA 5J1DA 4F3BA 3K6UA 4MLVA 3GLBA 4U22A 1SYIA 3H4ZA 2OWTA 3SEWA 2UVHA 4QF9A 4DZ1A 2XXWA 3LSXA 1B3FA 2YPNA 2RCAA 3TQLA 4KQPA 3I6VA 3TODA 4F39A 2QS1A 4NWCA 4RYAA 1P1QA 4OEUA 4TLLB 3PMVA 4RK2A 3SESA 1UTHB 2E1SA 4RPOA 2Y7RA 4LVQA 4KPTA 3MZBA 3SERA 1EZPA 4GXSB 4F19A 5I58B 2THIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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