4U2RA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j, flip variant) in the apo state
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA02
2QMWA 1URGA 1SW5A 3B6QA 1DPEA 3AXFA 2B3BA 2I4CA 1T0KA 4KD5A 4QF9A 1D9YA 3TEPA 2O7UA 4MFIA 3W15C 4F1UA 4ZEDA 2R6GE 4ZDMA 4LONB 1LBCA 5AA4B 3RT6B 3OENA 1MG1A 1B7ZA 3KJ7A 2DWJA 3TFLA 1GV8A 5L9SA 1Z7NE 1Y3PA 3LC8A 2HFBA 3EN3A 1AIVA 4EF2A 4YB7A 3T9XB 4BLAA 1MPBA 2VGQA 2I0CA 2QPQA 3RNNA 4UA8A 5EHSA 2IEEA 1NNTA 4U4XA 3C36A 2AYSA 1QKBA 3VVEA 4OXVA 3K6WA 4LP2B 4K3FA 4KR5A 5I84A 3IB2A 4PE5B 3VV5A 2YJPA 2ZYOA 1N0TA 3OO6A 1MDQA 4WKMA 3I5OA 4YKJA 4F2OA 3N6TA 3TTMA 4C0RA 1B9JA 4R74A 3DLNA 4JWOA 5TP9A 3Q29A 1F9BA 4RPNA 1QUIA 4YICA 5I57B 3VE1B 4GIZA 1WODA 3SEXA 1SDXA 2M8CA 3QUJA 2G29A 2I49A 3KFMA 4QSEA 4U1ZA 4U23A 1A7LA 3THIA 2P2AA 3PUZE 4R2BA 4PFWA 3DM0A 2I48A 3Q25A 1B0LA 1M5CA 4F3SA 3K1NA 3BBRA 4F31B 4NF6A 4IO4A 1S9TA 2W7YA 4C1UA 3TTKA 2ZYNA 5AE4A 1LFGA 3H6TA 3CG3A 3CIJA 4F3GA 1O63A 4KYSA 1A8FA 3O97A 5ITPA 2Y84A 4ELOA 2FA7A 4R6YA 4ELRA 1JW5A 4LUBA 3TTNA 5CM6A 2UVJA 1FW0A 3FXUA 2O51A 2Z8DA 3O29A 5EYFA 1Q35A 2DXYA 1A99A 1TFDA 1FQFA 4G2ZA 2ZXTA 4RY1A 4RK9A 4ELQA 4ZE8A 2ZNSA 2XHDA 5IKBA 3VXCA 2ZYKA 3IX1A 3VVDA 3MQ9A 3RQTA 1J1NA 3O2AA 4DLDA 3IO6A 1A40A 1LFHA 2O1MA 3FJ7A 4XIGQ 1GGGA 4XKQA 3I6VA 5A5XB 5A5XA 1MH3A 1LB8A 1MM6A 3V83A 4H1XA 1TFAA 5EHMA 5K2YA 2Q9TA 2DWIA 4F3BA 5TU0A 2QSXA 3FXQA 1QJMA 3K6VA 2NVUB 3TMGA 2B3FA 5JK4A 3R26A 2AL5A 4GL8A 3CFLA 3K4UA 4YMAA 2Z8EA 3T22A 3S9EA 2VHAA 3GLBA 3PGFA 4ZEFA 2QL3A 3HSTA 1IZ1A 3T9HB 4GLIA 3CFZA 2XXHA 2DE3A 2HXWA 2HZKA 3H6WA 3TELA 4MBPA 1TT1A 4Z7EA 4QRZA 1I6QA 3HO7A 4EQ7A 4LQ5A 1SI1A 1OLAA 3JV9A 1M5BA 4POWA 1VSOA 3IK6B 1UIVA 1II5A 2ANJA 3PPOA 2PMSA 1NH8A 4PFTA 4EDPA 4G68A 4EXLA 2O68A 4YU0A 3UP9A 5I2KB 3SEUA 3IAZA 3H6UA 4NE4A 4U1OA 1B5HA 2Q2CA 2NUVA 3ILUB 4P0IA 2I3WA 1EZOA 3TQWA 1FQCA 1Y4CA 5CMBA 1FQDA 3PU5A 4ESWA 1LB9A 3RT8A 1URDA 3VFJA 4Q5TA 1JQFA 1A8EA 1B52A 5AA3A 3HCQA 3CG1A 1GVCA 4M1VA 5FHOA 2I0BA 4H5FA 4TLMB 2XXTA 3KSXA 2UVIA 2PX1A 5I2NA 2F5XA 2OJTA 1BLFA 2F34A 1DTZA 4PETA 2V84A 1N04A 4ZZEA 3C32A 1Y20A 1OMPA 2RKMA 3E4RA 2ALUA 3CRBA 1BIYA 2OK2A 4JWXA 4FJPA 1MDP1 2PBWA 2Y7PA 3PMVA 2GFEA 3IOWA 3SDFA 1PBQA 3M8UA 1R6ZA 4JSOA 3EHUA 2DSFA 2F97A 4IY6A 1XVYA 1PB9A 2ZYMA 4EQBA 3S2VA 4WXJA 4IGRA 3SEVA 3T9VA 3LUYA 3OELA 2BJJX 2HCAA 4ESXA 2I4BA 4X48A 3FV1A 2LAOA 1ZBMA 2G93A 4ZEIA 1B2HA 1R1NA 3OSQA 2RC7A 1Y9UA 1D3KA 4YB6A 3USDA 4NWDA 4AB5A 1JVYA 2CMOA 2XXUA 1DOTA 5CBSA 1MY3A 1XHYA 1PB8A 3TYHA 1B58A 4WEDA 2V3TA 2O7IA 3UIFA 4Q0CA 2NXOA 4OTEA 1OVBA 1M5DA 1B32A 3EHTA 5H8QB 4ELPA 5DT6A 5H8QA 4RJZA 3DELB 3K6XA 1LAHE 3IL1B 2F7BA 4X1BA 5DTBA 2F78A 3D4GA 1O7TA 3SEYA 3ZS6A 1EH3A 5KDTA 2O84X 1URSA 1P1QA 1PBPA 3UA8A 1B40A 1DMBA 4H8IA 3R6UA 3MP1A 1VR5A 3VDFA 4NF4B 4FEDA 5DVJA 2PYYA 4EXKA 3PUXE 1P1NA 3BFUA 4YAHX 2QS3A 3IJXB 4F1YA 1SVXB 2UYEA 3G3KA 1Z7ME 2P1SA 1PDAA 5AA4A 2D3IA 3KN3A 5FHNA 4N6PA 4FE8A 2DP8A 3MUQA 3V8XB 5H8SA 2ZMBA 3MVZA 4U4SA 4ZE9A 2XD2A 4H0WA 4HTGA 3A3UA 2B65A 1JNFA 4FORA 3OO8A 4OQOA 1WDNA 3VLUA 3PD8A 3M3FA 1CE2A 5AA2B 4IO7A 3KOSA 1M5EA 1FTJA 3ZKLA 5HM4B 4LZ7A 4DXBA 1NNPA 1LCTA 3EF7A 1RKMA 2ZNUA 3K1MA 3P7IA 3PPRA 3O28A 3CR9A 3IO4A 3EHSA 4WEPA 3M3LA 3IOUA 3KOTA 4FIMA 5I59B 4GOTA 5I59A 3IR1A 1Y1ZA 4GRKA 4X1DA 1YAEA 1AOVA 3PV0E 3S9MC 4JB7A 5DEXB 3ZKKA 5DEXA 4FATA 4R75A 2H25A 1D9VA 5ICQA 5I58B 3H06B 5I58A 4YB5A 1B05A 1JEUA 3O6IA 3VLWA 5I57A 2REJA 1TXFA 1B7HA 2REGA 1USYH 3O9PA 1MS7A 4O3CA 4PFYA 1NMUA 3PPQA 1LSTA 1B3HA 3TPAA 5CMMA 1BKAA 2XD3A 3LSLA 1FCKA 4H67A 4QHQA 2YLNA 2ONSA 2OZZA 2XXVA 3UGWA 5ICTA 4BDMA 4R9FA 2DS9A 4R6HA 4E0XA 4BDRA 3W9WA 3VXBA 2ZNTA 3Q26A 5F7VA 3OSRA 1MXWA 1MQHA 2F6GA 4TLLB 3QXMA 2QRYA 1FTOA 4YKKA 4GF8A 2X7PA 2OLBA 4ZS9A 1SBPA 4XTCQ 5F1QA 3U8QA 3KJTA 1JEVA 3MVXA 5M2VA 3KN8A 3SETA 3FGSA 1YTVA 3PPPA 2XXPA 3WAFA 1KWHA 4OFLA 3VLVA 1NFTA 4OETA 1Y3QA 1XOCA 3SERA 2DWAA 5BWJA 2H98A 4OMBA 1IXIA 2F36A 4KYDA 3E3KA 3RLFE 2Z8FA 1YPNA 1B3LA 5FTHA 2R71A 1FTMA 2DXRA 4RNSA 4KCDA 1B4ZA 3OMBA 3TZAA 3TKDA 4FAJA 3PPNA 3K2DA 2F6PA 3TTRA 4GL0A 1B5IA 1A55A 3LSWA 1NL5A 1POY1 3TCFA 4MH5A 4LATA 4P11A 3QUFA 3T9UA 1MY2A 2O6AA 3LBSA 5JEIA 1LFIA 1Q1KA 2DQVA 5HPQA 1LBBA 3K1PA 3KSJA 1EZ9A 4DCYA 3KEIA 1BTJA 4DDDA 3K0VA 3H6VA 1OQHA 4YKPA 3DP8A 1IXHA 4EUOA 1JVXA 5CC2A 2AIXA 3H3GA 3V89B 4THIA 1XC1A 4JXIA 1OQGA 1FTKA 1SQYA 2QMXA 4GQOA 3E13X 2A5SA 4JSDA 4KHZE 3GZGA 1MY4A 3LSXA 1FQEA 2GRVA 1B6HA 1NNKA 4RA1A 4NF5B 1OIBA 2IA4A 4NF5A 1MXUA 4L17A 3KBRA 4G77A 4OWDA 4ECFA 5I2KA 4DZ1A 1USYE 4FEBA 1B46A 5JTYB 3T96B 3FVNA 4QFOA 5CRYA 3FVOA 2XX8A 3O66A 5K2XA 1LCFA 2HAVA 4LZ5A 3KGCA 4IY5A 3A09A 4OFOA 4OENA 1LLSA 4OESA 4ONYA 4F18A 1H76A 2UVHA 3FD3A 4HW8A 1N7XA 2X26A 3RGYA 4O3AA 1MQGA 1MXZA 3HV1A 1MXYA 2Y7IA 4XXUA 1ZLQA 5H8FB 5H8FA 2F8DA 5I56B 2VD2A 5I56A 1B1XA 1RYXA 3PUYE 1HSLA 2F35A 1MXVA 3FVKA 3KN7A 1QW0A 4X9TA 2PVUA 1B3GA 3FVGA 5LOMA 4RXLA 3B6TA 3CSBA 3T93B 2V3QA 4G8MA 1POTA 2GH9A 4KCCA 1MPCA 2KLFA 2XX9A 2D5WA 4IGTA 3C34A 3CVGA 3U94A 5B7DA 3V5AA 4H65A 3KZGA 3GBBA 5L9OA 1UTHB 1FTLA 2Y7WA 3OO7A 2UXAA 5H8HB 1US5A 1Y3NA 3FV2A 5H8HA 4YMBA 2UVGA 1H44A 1S7YA 2Q89A 2VD3A 1ELJA 5CMKA 3Q28A 4IO6A 2VP1A 1ZIUA 2XX7A 2ONRA 2DE4A 5ITOA 2H4IA 1JW4A 4GWOA 1SW1A 3IOTA 1H3DA 2FNCA 4NF8B 1N76A 3H7MA 2R9JA 1US4A 4QFKA 1H45A 4AQ4A 1Y4TA 5L9MA 5ISUA 1MQIA 3O6HA 1I69A 1XT8A 1SYHA 3U92A 2ESNA 3MPKA 4OFJA 3A3CA 3QIMA 1B3FA 4H6DA 3CFXA 5TPAB 2D21A 1VE4A 5AA1A 4IO2A 4HS7A 1ZMGA 1Y1MA 2Z22A 3G3HA 3U1OA 1R9QA 4IO3A 2X7QA 2HAUA 2DOJA 1TWYA 1AMFA 2A5TB 4NF4A 4AB6A 3H03A 3IB0A 1IQ7A 3K00A 4BDLA 1DPPA 4OHNA 1CB6A 3K6UA 1MRPA 3OEKA 3G7WA 3OXNA 4RPOA 3SEWA 4I62A 1N7WA 3FUZA 4POXA 4TOZA 3G3FA 3K02A 4PFUA 3RTWB 4Q30B 3FATA 1EU8A 4UACA 1P99A 1AH5A 3R7XA 4KYEA 4F19A 2I58A 3UK4A 1B3EA 2RINA 2XXYA 4I1DA 3WAEA 3MP8A 5CMCA 1I6AA 3RTFB 5ELVA 5AA2A 1MQJA 3JZJA 1QUKA 1ANFA 4JWYA 5DVIA 3TQLA 4KI0E 3PUWE 3C31A 3ODBA 3MJNA 2F7AA 4OZ9A 2V25A 3RN8A 4HCYA 1B1HA 2Y7RA 5DVFA 1A54A 2QS1A 4OYVA 3U72A 3KG2A 1RYOA 1B4HA 3LSFB 3HHGA 4XKPA 1WVJA 1H43A 2I6EA 2ONKE 2XXXA 4G4PA 1ZKBA 4NTLA 1ZU0A 5H8NB 5H8NA 1M5FA 2NWJA 1S50A 1OVTA 2DE2A 4R73A 4RYAA 3Q27A 4QSCA 4H5GA 5HBCA 3RY3A 1MH4A 2E1SA 4ISUA 2QS4A 3OO9A 1I6BA 3FXRA 4BDOA 4R6KA 5TP9B 3TODA 3DP6A 4XKNA 4GXSB 1P1WA 5FTIA 4KQPA 4F1VA 5J1DA 2GHAA 3L6GA 3G3GA 3O6GA 4QFNA 1XVXA 1UQWA 2O1LA 1IEJA 1AL3A 3I3VA 4F2QA 1DTGA 2FYIA 4FECA 4OVJA 3W9VA 2HZLA 3HN0A 1N84A 1O64A 3HHFA 2PT1A 4I8CA 3H4ZA 1FQBA 1NH7A 2P0SA 1QKAA 4XKRA 1OLCA 2OBGA 4OEVA 3MZBA 3TCHA 4NF6B 4ZEBA 4GD5A 1SYIA 3TCGA 2YPNA 1IUDA 2RC8A 2HQ0A 4ZEKA 2CZLA 2THIA 4NMYA 3MC2A 4MLVA 3HPIA 4F39A 1MY1A 2Q88A 3EQ1A 5CBRA 5B70A 3FIRA 3IB1A 1QULA 3MBPA 3IORA 2DYXA 1FQAA 3F11A 3FJMA 3MZ9A 3OOAA 2Z23A 2Y7KA 1HSEA 4E0WA 1QVSA 1LAGE 3ONMA 5IAIA 2OWSA 4HCWA 1LGBC 3PUVE 4G8HA 3BKIB 1B5JA 4N13A 4DE8A 2RCBA 4YKIA 2UYFA 3DP4A 4IB2A 2DVZA 1UTBB 1UTBA 1VFDA 4EQ9A 1D4NA 3U93A 3GXAA 4O3BA 3N6UA 2OWTA 1MPDA 4DIGA 3ECRA 4R72A 4KFQA 3MW0A 4C1TA 3D4CA 3IJOB 3B6WA 1GTKA 4Z0IA 1N3XA 1P1OA 2V3UA 3FASA 4N07A 3T66A 2H9BA 1EZPA 3E9XA 3TTLA 3G3JA 4F22A 3RUMA 3MVYA 1XS5A 4TQUQ 1MQDA 2V93A 4OEUA 4LVQA 2I3VA 4LZ8A 4ZZAA 3UN6A 3N5LA 1JETA 5JTYA 4I9DA 1QUJA 4GFRA 4ND9A 1PB7A 4YZZA 3OEMA 3FZVA 3QK6A 1ZJLA 4KPTA 3UORA 4U21A 1N3WA 3OD7A 4G68B 3QSLA 2XXRA 3PD9A 2NOOA 4G68C 3QYTA 1B51A 3SKPA 5KZTA 2XXWA 3MWBA 4F3PA 5AA2D 4R9GA 4F29A 1IIWA 1VFEA 3S9LC 2QJEA 3M3KA 3ILTB 3EPEA 4U22A 4QSDA 3S9NC 3ZSFA 3BFTA 3QAXA 3SESA 4LQ2A 3IOVA 1UIUA 2E0SA 3MPLA 3MVWA 4PP0A 2PT2A 4OERA 4BDNA 1B7UA 4M4GA 1MXXA 4EF1A 1GR2A 5DYHA 1IXGA 2DVCA 3L6HA 3GBAA 2XXIA 4DXUA 5I2NB 1SI0A 2OCUA 2RC9A 3CI8A 3FJGA 3TDJA 1YCJA 2WKYA 5BUUA 3PMWA 2GHBA 4ZECA 4G8NA 3N94A 1HSJA 4BDQA 4R2FA 4QFPA 3JYRA 4GVOA 1NNFA 3CSGA 1MM7A 3C9HA 3RPWA 4MF3A 2RCAA 1UTHA 3TAJA 4GXAA 4NWCA 4Q8RA 1P1UA 2HEUA 1SW2A 4JDFA 3C33A 3PMXA 2QS2A 4RK2A 4IO5A 4U2RA 1L5TA 3VVFA 4DCXA 1IXCA 1R9LA 5CI5A 1BP5A 3N26A 4MLQA 4NF8A 2Q8JA 1PC3A 4H8JA 3MAMA 3K01A 1LAXA 4PQJA 2RF1A 2F7CA 1PEBA 3B7DA 5KCJB 5KCJA 2H5YA 1SW4A 2DWHA 4QFLA 1SD3A 5TPAA 1NKXA 1LAFE 2XXQA 3LR1A 3S4UA 3C35A 3MZ1A 1MY0A 3TUSA 1ATGA 4NEDA 1ZTYA 2O69A 4P0GA 3G3IA 2H99A 1B0HA 4JBZA 2VOZA 4DXCA 2A5TA 5KDTB 4LA9A 5L8DA 5FHMA 1JW1A 1DSNA 2ABHA 3MP6A 2AL4A 1IITA 3C4MA 2Q2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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