4U2RA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j, flip variant) in the apo state
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA02
3TQWA 1MPCA 4K3FA 3TZAA 4GRKA 1S50A 3QUFA 2Y7IA 1USYE 4LVQA 4EF2A 2ZYOA 4ELPA 1TFAA 3G3KA 3IAZA 4EXLA 1B0LA 4M4GA 3K0VA 2HAVA 2HXWA 4JXIA 4GL8A 1L5TA 4DCYA 3OO6A 1ZMGA 2O6AA 3M3LA 3FV1A 3IR1A 1US4A 3FIRA 1OMPA 1NL5A 4PFWA 1B9JA 3M8UA 1UQWA 2XXIA 2D5WA 2Y7WA 3FD3A 4YICA 1HSEA 4IO6A 2Z23A 3IJXB 4M1VA 3ZS6A 2ABHA 1TXFA 4H1XA 3KN8A 3QK6A 4BDMA 1S9TA 4MF3A 4UACA 1MPBA 1MH4A 5I57A 4GIZA 5CC2A 4TQUQ 2ZNTA 1MY3A 2DS9A 2F97A 1US5A 3B7DA 4NF5B 1DOTA 5ITOA 5AA4B 4HCWA 1N7XA 1PC3A 2OZZA 2UVIA 3USDA 5EHMA 2REGA 2IEEA 4KPTA 4NF4A 3SKPA 1KWHA 3IX1A 3K1PA 5I59B 1H76A 1IEJA 3OENA 3FUZA 2LAOA 3D4GA 3G3HA 1VR5A 1MRPA 3CRBA 3FASA 1II5A 4OHNA 5FTHA 2PYYA 4LP2B 3S2VA 4P0GA 4ZDMA 1AIVA 5JTYA 4OFLA 1SW2A 1XOCA 1TWYA 1FQAA 3CR9A 2THIA 3H3GA 1Z7NE 2AL5A 3KGCA 3K2DA 3KOTA 2V3TA 3PD8A 4JBZA 4F3PA 4C1TA 2ANJA 1J1NA 3JYRA 3A09A 1B4ZA 1YPNA 3K1NA 1EU8A 1MQDA 1MY4A 2I6EA 2VD2A 4ZZAA 4ELQA 2P2AA 5H8NB 5H8FA 4G77A 1B40A 2XXTA 2ZYMA 4GXAA 5A5XA 1SQYA 4WEDA 5KCJB 4U21A 4LZ8A 2XXRA 3CI8A 2GRVA 5CBRA 1N0TA 4GLIA 4MH5A 4H0WA 1A55A 3SEYA 2BJJX 4QFNA 4R75A 5CI5A 3EHUA 1FTKA 5H8QB 5J1DA 4HCYA 4ZZEA 5ELVA 4IY6A 2DXYA 4G68A 4QSDA 3RT6B 5CMBA 3EHTA 5F1QA 2O1MA 3ZSFA 3EF7A 3H6WA 4G2ZA 2ZYKA 1IXCA 1OQHA 3I5OA 4GVOA 2D3IA 3IOWA 1D9YA 3MZ1A 1M5BA 3GBBA 1Y9UA 3TCFA 1WDNA 3RY3A 4ISUA 4LA9A 4QRZA 3T93B 3C36A 3TEPA 4C0RA 1P1NA 3AXFA 2I0CA 3I3VA 3OO9A 1HSJA 3T9VA 3TYHA 1SD3A 1MQHA 2FYIA 1UTHB 2X7QA 3FVNA 3FXUA 4I9DA 1UIUA 5A5XB 3MVYA 3ONMA 4G4PA 4IGRA 5HM4B 1AH5A 2PT1A 3PUWE 3Q29A 3V89B 5CMKA 1HSLA 5K2YA 4PFUA 2ZNUA 1LB9A 4N13A 3PPOA 4DCXA 2DVCA 1R6ZA 4F3SA 4ZECA 3DLNA 2XD2A 3U93A 1IZ1A 1PB9A 3CFLA 4OERA 2Z8EA 3CIJA 4OMBA 3BKIB 1GGGA 4NWCA 2V84A 1WVJA 4OENA 2F7AA 4ZS9A 4FAJA 3PUZE 5H8FB 2PBWA 3CVGA 1UIVA 1A40A 3C9HA 1ZTYA 2DYXA 4R73A 3OEMA 1BIYA 4NMYA 3HV1A 4LZ7A 4H5GA 3TDJA 1JW4A 1N84A 1SVXB 2RCAA 4ESWA 3MQ9A 3TTRA 4IO3A 2ONRA 3L6HA 2UVJA 3H6VA 1EZ9A 4R72A 1QVSA 4ZE9A 1B05A 2V3UA 3WAFA 2HQ0A 3OO8A 4OVJA 1ZJLA 2F7BA 4U4SA 3H4ZA 4POXA 5I2KB 3TPAA 4ONYA 4XKQA 3GZGA 1ATGA 4OQOA 4F3BA 2YPNA 5AA2D 4R2FA 3RGYA 1A99A 1MQIA 1IUDA 2F7CA 3DM0A 4EQBA 3MBPA 3OOAA 3UIFA 1BLFA 1Y3NA 3MVXA 1IITA 1SYIA 4H65A 4RNSA 3TELA 2HAUA 3C34A 2OWSA 3THIA 1BTJA 3MP1A 3KJ7A 3Q27A 4BDLA 2XXHA 1IXHA 5LOMA 1JW1A 4AB5A 4NTLA 1SW5A 4DIGA 3IB2A 1Y1MA 2B65A 5TPAB 4LQ2A 3G7WA 1B5JA 5KZTA 1LAHE 1N7WA 3IL1B 1I6QA 2HCAA 1XVYA 1A8EA 3S9NC 1I69A 2A5SA 5FHMA 1LCTA 1MXZA 2QSXA 2ESNA 4O3BA 2I4CA 2H99A 3KZGA 3DP8A 1MXXA 4IO7A 3QUJA 4F2OA 5I56B 4O3AA 3V5AA 4NF8A 3K6XA 3DP6A 1AOVA 1EZPA 2I4BA 2RINA 4ZE8A 3TFLA 3Q26A 2R9JA 1B3LA 4G8HA 1NMUA 3FATA 2RCBA 2DSFA 5I2NA 5I57B 4LONB 3T9UA 4E0XA 4F1VA 3OMBA 5I59A 4U4XA 3G3JA 4RYAA 3TUSA 3U8QA 4THIA 1DTZA 1PB7A 3ECRA 2OK2A 1IXIA 3LSWA 3C31A 4P0IA 4GQOA 3T66A 3HCQA 4X9TA 4F18A 1B3GA 2Z8FA 1BP5A 1MY1A 1B3FA 2PVUA 1D3KA 4XKNA 5K2XA 2HZLA 4ESXA 1LCFA 3CFZA 3O28A 3T96B 2CZLA 4L17A 1CB6A 2PX1A 4ELOA 3S9EA 3W15C 3DP4A 1N3XA 3KG2A 2P1SA 1URSA 3O6GA 3PD9A 3QXMA 5JEIA 3MVWA 2V93A 2QL3A 4NF6B 5H8SA 1NH8A 4F1UA 3TKDA 4N07A 1QULA 3LR1A 3V8XB 1B1HA 3MPKA 2Y7RA 1LAGE 1POTA 3A3CA 1B5IA 3OSRA 2DP8A 5I58A 1M5CA 2QRYA 2XXVA 5ISUA 3O6HA 3GBAA 3H6UA 3IB0A 1MXYA 1FQDA 3HSTA 4WEPA 4GL0A 2F8DA 5ITPA 3TTNA 3VLVA 3SEVA 3Q25A 3IOTA 2VOZA 4R9FA 5JK4A 4F3GA 1ZLQA 2I48A 1QKAA 3RLFE 4U1ZA 4LUBA 4MLVA 3MVZA 1SBPA 3W9VA 4ECFA 1FTOA 3FJMA 3QSLA 5FTIA 4YB5A 1P1QA 2Y7PA 3V83A 3KJTA 2HZKA 5TP9B 5HBCA 3ILUB 2ALUA 1B5HA 2F5XA 1RYXA 3FVGA 2A5TA 3GLBA 3O9PA 1MXUA 1NKXA 3PV0E 1P1OA 3R6UA 3VXCA 3IO6A 1N76A 5H8NA 1VSOA 3IORA 2B3BA 2ONSA 3E9XA 2X26A 1GTKA 3K6UA 3HO7A 3PPNA 2XXWA 4NEDA 3N6TA 1R1NA 4PFYA 1QKBA 2Y84A 4LZ5A 4OXVA 1YCJA 4OEUA 4XKRA 2G29A 2ZMBA 3RNNA 3QYTA 1XS5A 1H43A 2Y7KA 1JW5A 2GH9A 1Z7ME 3S9LC 3OSQA 2I0BA 4IO5A 4TOZA 3RQTA 1B6HA 3TTMA 2HEUA 2CMOA 4Z7EA 1QUIA 4GOTA 1JEUA 2ZXTA 3TMGA 1A54A 2OJTA 3CFXA 3PGFA 1S7YA 3EN3A 3OO7A 4JB7A 4YZZA 3GXAA 2R71A 3ZKLA 4YKIA 4EUOA 3KSJA 4PP0A 4OTEA 1M5DA 1PEBA 3FGSA 1ZKBA 2I3VA 1A8FA 2H98A 3KN3A 3U94A 4E0WA 3UORA 4OZ9A 3LSLA 1NH7A 2FA7A 2Q88A 2XD3A 3MZ9A 2QS2A 2VP1A 1MS7A 4FEDA 4PQJA 3UK4A 2F6PA 1N04A 3HHGA 4R2BA 1ANFA 1FTLA 2AYSA 3K00A 3RN8A 2YLNA 3A3UA 3L6GA 4JSOA 2O84X 1F9BA 3H06B 4H67A 4QFLA 4R6HA 3UN6A 4IO4A 1URDA 4JWOA 4ZEIA 2XHDA 4OWDA 5BWJA 3I6VA 3ILTB 1RKMA 2QJEA 3MP6A 4XXUA 5ICQA 1H3DA 5I2KA 4U1OA 3HHFA 1UTBA 1B7UA 4RPOA 1Y3QA 3C33A 2QS3A 4EF1A 5AA3A 3K6WA 2DWHA 3E3KA 4YKKA 1B7HA 2Q89A 4WXJA 3MP8A 3RUMA 2NXOA 4R6YA 1QW0A 4YAHX 1LB8A 4GXSB 2UYEA 3OEKA 4ELRA 1SI1A 2Z22A 3H6TA 1XT8A 5IKBA 3PPRA 2Q9TA 4F1YA 2R6GE 4KYSA 2WKYA 3B6WA 1LLSA 2PT2A 4LATA 4NE4A 1PBQA 4ZEKA 4H8JA 3VVEA 5DVIA 2XXYA 2QMXA 3S4UA 4BDRA 3UP9A 4X1DA 2NOOA 1B3HA 4IB2A 4YKPA 4DLDA 4EQ7A 2ZYNA 3IB1A 2GHBA 4POWA 1DSNA 1MY2A 3RTFB 2VHAA 3HPIA 1JQFA 4F19A 3IO4A 4H8IA 4NF8B 3W9WA 1MXWA 3G3IA 3CG3A 2DXRA 5CM6A 2XXUA 4BDNA 1Q35A 2AIXA 3C35A 3IOUA 1ZIUA 2RC9A 4BDQA 1N3WA 4YMBA 3TTLA 5KCJA 1R9LA 3P7IA 2FNCA 2QMWA 4Q0CA 2E1SA 2DVZA 1SDXA 2QS4A 1PDAA 1DPPA 2M8CA 3QAXA 2RKMA 2UYFA 4JDFA 1NNKA 2GHAA 3M3FA 4G8NA 4Q5TA 1VE4A 2UXAA 4X48A 4FEBA 4IGTA 4YB7A 2X7PA 1OLCA 1FTJA 3M3KA 3KSXA 3PU5A 2NVUB 4C1UA 2KLFA 4WKMA 1MDQA 4KCDA 1B52A 3EHSA 3N6UA 4KHZE 2DWJA 3G3FA 2QPQA 5CRYA 1LFIA 1FW0A 5I84A 2VGQA 3FV2A 3FVKA 3LBSA 3RT8A 5IAIA 3KFMA 3VFJA 3VXBA 2NWJA 1CE2A 1B7ZA 3H03A 1AMFA 2Q2AA 3KOSA 3PMXA 1LBBA 5EHSA 4EDPA 1LFHA 1DPEA 3IK6B 2UVGA 1P1UA 4OESA 1MM6A 4PETA 3K02A 3VVDA 1MH3A 1POY1 4AQ4A 1MM7A 5F7VA 1EZOA 1NNTA 4U2RA 3O66A 2ZNSA 4NWDA 1PBPA 2F78A 5TU0A 3SESA 3E4RA 2DWAA 3CG1A 2V25A 3LC8A 1A7LA 1FQBA 4MFIA 4U23A 1GVCA 4GWOA 5I2NB 1WODA 2O68A 2QS1A 4JWXA 2IA4A 4Q30B 1GV8A 5L9OA 1Y1ZA 4RY1A 2OLBA 2F6GA 3K4UA 1ELJA 3EQ1A 4FE8A 4N6PA 3UGWA 1I6AA 2Z8DA 3DELB 4G68B 2OCUA 3HN0A 2XX7A 1B32A 3VLUA 1SW1A 4GFRA 1TT1A 3K6VA 3B6QA 1QJMA 3S9MC 4XIGQ 3MZBA 1MDP1 2H5YA 1UTBB 2I3WA 3F11A 4FECA 1NNPA 2G93A 1B4HA 3WAEA 4KD5A 5DEXA 4YU0A 3T22A 4F39A 1XC1A 1Y20A 1TFDA 5CBSA 4NF6A 1BKAA 4ZEDA 1M5FA 1H45A 2XXQA 4HTGA 3U72A 4I8CA 4FORA 4KYDA 2RC8A 4RK9A 2RC7A 2F36A 2I49A 4R9GA 3N26A 1MXVA 1DMBA 2XXPA 2YJPA 3PPQA 4EQ9A 4NF4B 5KDTA 4AB6A 2I58A 4QFPA 3LUYA 1OLAA 3OXNA 3ODBA 1RYOA 4R74A 1SW4A 1FQCA 1R9QA 5L9SA 3VDFA 4P11A 2F34A 3PUVE 3SEWA 4DDDA 4XTCQ 5DYHA 4YKJA 1MG1A 2D21A 4YMAA 2O69A 1OVTA 5BUUA 2O7IA 5CMCA 4F29A 1P99A 3TODA 1URGA 1Y4TA 4F22A 1AL3A 1MQJA 4U22A 4KFQA 4QFOA 1YTVA 4QFKA 4IO2A 4QSCA 1VFDA 1QUKA 1XVXA 4DXUA 3BFUA 4OYVA 4G8MA 2Q2CA 4KCCA 2NUVA 4YB6A 5M2VA 1JVYA 4QSEA 2ONKE 4KYEA 4BLAA 4O3CA 4R6KA 1LAXA 3U1OA 4I1DA 1EH3A 5JTYB 1OIBA 3H7MA 4FATA 5KDTB 3PUYE 1JVXA 4RPNA 4X1BA 4F2QA 5AA4A 4TLLB 5B7DA 5FHNA 3KN7A 1UTHA 3R26A 4QF9A 5DVJA 4RJZA 2E0SA 1LGBC 1FCKA 2DE2A 2P0SA 5H8HB 5ICTA 1Y3PA 5AA1A 4QHQA 1P1WA 1B0HA 1IXGA 1JNFA 1ZBMA 2H4IA 3U92A 1FQEA 1LAFE 4DXCA 3BFTA 3OD7A 4LQ5A 4EXKA 1B2HA 2O1LA 3K1MA 3Q28A 3T9XB 1B3EA 2RF1A 3IOVA 4Z0IA 3PUXE 3TCGA 3CSGA 3KEIA 3TTKA 1D9VA 5H8QA 4KI0E 5TP9A 4RXLA 5AA2A 2REJA 2DE3A 2F35A 1Q1KA 3VLWA 5FHOA 1LBCA 2DQVA 4JWYA 4DE8A 3C4MA 5L8DA 3TQLA 2AL4A 3O2AA 3D4CA 4RK2A 1IQ7A 3R7XA 1O7TA 4FIMA 4H6DA 2V3QA 1M5EA 1VFEA 2XX9A 3SERA 5AA2B 3MJNA 3MUQA 4PFTA 1Y4CA 2DE4A 2XX8A 1B58A 1SI0A 3FXQA 3TAJA 4F31B 5I58B 1JETA 2OBGA 3CSBA 3SETA 1LFGA 1USYH 1FTMA 5L9MA 1YAEA 2O51A 3MW0A 4G68C 4DZ1A 3VV5A 5HPQA 1XHYA 1ZU0A 2O7UA 1MPDA 1O64A 2H9BA 3G3GA 3LSXA 4ND9A 2PMSA 4XKPA 5AE4A 5CMMA 5B70A 1B46A 4RA1A 1IIWA 3OELA 3LSFB 3RTWB 4OFJA 1OQGA 3JV9A 4Q8RA 3FZVA 3MC2A 4UA8A 1GR2A 2UVHA 3N94A 1H44A 4GF8A 3MWBA 4KR5A 3O97A 3IJOB 1QUJA 3JZJA 3VVFA 4OFOA 4GD5A 2A5TB 4JSDA 1PB8A 3FJGA 2DOJA 2B3FA 1MY0A 3EPEA 1NNFA 5H8HA 1D4NA 1OVBA 4FJPA 4H5FA 1MQGA 2H25A 2W7YA 4HW8A 2VD3A 2XXXA 3FXRA 3FJ7A 3FVOA 3MAMA 5DT6A 1JEVA 5EYFA 5DVFA 1B1XA 1I6BA 4NF5A 1LSTA 3VE1B 3QIMA 4I62A 2Q8JA 3SDFA 2GFEA 1T0KA 4OETA 4ZEBA 5I56A 3UA8A 3KBRA 3N5LA 4ZEFA 3PMVA 3MPLA 3PMWA 4PE5B 3B6TA 1B51A 3C32A 3O6IA 2HFBA 3K01A 3TCHA 1O63A 4IY5A 4MLQA 3ZKKA 3O29A 1NFTA 2OWTA 3PPPA 4BDOA 5TPAA 3T9HB 3SEUA 2DWIA 3BBRA 4TLMB 4KQPA 1DTGA 4DXBA 4OEVA 1SYHA 5DTBA 4MBPA 3SEXA 5DEXB 1FQFA 4HS7A 3E13X 3RPWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TQWA 4K3FA 3QUFA 2FIEA 1USYE 4LVQA 1B0LA 2CZIA 3M3LA 3IR1A 1NL5A 2D5WA 4H1XA 4TQUQ 2ZNTA 3B7DA 1DOTA 1PC3A 2OZZA 2UVIA 1KWHA 3G3HA 1MRPA 2HXRA 3FASA 4LP2B 1FPLA 3CR9A 3KOTA 1CNQA 1Z7NE 2AL5A 1MQDA 2VD2A 5H8NB 2P2AA 5H8FA 1B40A 2ZYMA 1SQYA 4MHFA 2XXRA 1N0TA 1A55A 5CI5A 5J1DA 2P3NA 4IY6A 5F1QA 3LUZA 3I5OA 3T0JA 5IZ3B 1M5BA 3RY3A 3TEPA 3T93B 4LA9A 4C0RA 5A5XB 3MVYA 1LBWA 3PUWE 3Q29A 5K2YA 2ZNUA 1LB9A 4DCXA 1R6ZA 3GYYA 3CIJA 3BKIB 2V84A 4OENA 3CVGA 1UIVA 1A40A 3C9HA 4DXBA 1JW4A 1N84A 2RCAA 2UVJA 1B05A 2V3UA 4OVJA 3TPAA 4XKQA 3GZGA 1ATGA 2YPNA 2HPGA 1A99A 2F7CA 4PDDA 1NV2A 3KJ7A 1IXHA 4NTLA 3IB2A 3G7WA 4X8RA 1XVYA 4O3BA 2ESNA 4IO7A 5I56B 3V5AA 4NF8A 1AOVA 4DI4B 1EZPA 4I3YA 5I2NA 2R9JA 5I57B 2RCBA 2DSFA 4F1VA 3G3JA 4RYAA 3U8QA 1PB7A 4P0IA 3B50A 3C31A 4GQOA 1EYKA 3T66A 1B3GA 1BP5A 1MY1A 3BIGA 5K2XA 4XKNA 1LCFA 3O28A 4L17A 3S9EA 4MNPA 3DP4A 1N3XA 1YXIA 5EQ8A 1QULA 1POTA 3OSRA 5I58A 3IB0A 1MXYA 3HSTA 4MNCA 5ITPA 3TTNA 3Q25A 3IOTA 4R9FA 4F3GA 2I48A 4MLVA 1FTOA 3FJMA 5FTIA 3KJTA 5TP9B 3O9PA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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