4U2RA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j, flip variant) in the apo state
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure and Dynamics of AMPA Receptor GluA2 in Resting, Pre-Open, and Desensitized States.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, membrane protein
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u2rA02
2FNCA 4R73A 4OVJA 1EH3A 4QFPA 5I58B 2A5SA 4ZZEA 1A40A 1FQCA 3CRBA 5AA2A 3A3CA 3TCFA 2V3QA 4R72A 4OETA 1S7YA 1SYHA 1QVSA 3PUYE 3IL1B 5FTHA 1Y1ZA 3OEMA 1PEBA 3K00A 5CI5A 1B3LA 3PMVA 1GVCA 1QW0A 3KSJA 3CR9A 3OSQA 1MQGA 3IO4A 4F3BA 3VE1B 2CZLA 2I6EA 2UVJA 2UYEA 3OO7A 2I49A 4EF2A 1A55A 4ZDMA 2Z8EA 2IA4A 2RC9A 2PVUA 4F19A 4ISUA 2ZYNA 2O69A 4OXVA 1B3HA 5AA3A 3F11A 3UGWA 3IX1A 4G8HA 2F8DA 4F31B 1IZ1A 5CMMA 1BIYA 3PD9A 1JW4A 4LUBA 2GFEA 4P11A 4ZZAA 1LBBA 3MVYA 1B5IA 4RK9A 1OVBA 3VFJA 4KFQA 1FTOA 4NTLA 3K6UA 2ANJA 1YAEA 4OENA 2HAUA 1FTMA 2R6GE 4Q5TA 4MBPA 5A5XB 5FHOA 5H8HA 1SI0A 4OEUA 1UTHA 3G3IA 3EQ1A 3MPKA 3OENA 1ZMGA 3TTLA 4GF8A 4IO7A 1I6QA 1B0LA 1N7XA 2XXYA 1N76A 3VLWA 2XXVA 4HS7A 3RT6B 2A5TB 5A5XA 3KSXA 4JWOA 1Q1KA 2V84A 3C35A 4DDDA 3IB2A 1OMPA 4U1OA 2OLBA 3FASA 3T66A 1JVXA 1OIBA 3G3GA 2OZZA 1RKMA 4QSDA 1A8FA 3TDJA 1NKXA 3JYRA 1B5HA 1BP5A 2QL3A 2NVUB 1TFDA 4KYDA 3N94A 2WKYA 4FJPA 1Q35A 2F7BA 1SDXA 1MQIA 1P1UA 3W15C 1H45A 4GRKA 3VVDA 1TWYA 2V3TA 5AA2D 4U21A 3LSFB 2F7CA 4YB6A 5ICTA 2UVIA 4G68A 1FQBA 2QS4A 1Y4CA 2F5XA 3FVOA 3OO8A 3RUMA 3IK6B 1YTVA 1VFEA 1M5EA 1D9VA 4C1UA 1WVJA 2DXRA 4YU0A 4U4SA 1JETA 2D21A 4ZEDA 1LFGA 3K1PA 4F18A 3C31A 4MLVA 2O7IA 5I2NB 1QUJA 2O68A 2AL5A 3GBBA 3M3KA 3V83A 4YAHX 3FUZA 3GLBA 3BKIB 2G29A 1OLAA 4U2RA 1XHYA 5I2NA 1FQDA 1SW4A 1XS5A 3FJMA 3K6XA 2PYYA 1KWHA 3G7WA 1B4ZA 1MY0A 4PP0A 2ZMBA 3U92A 1CE2A 3S2VA 2B3FA 3KBRA 5H8QA 2Z23A 2AIXA 1B7ZA 2DWIA 4XKQA 1QUIA 3JZJA 1B3GA 1MXUA 4FECA 3KZGA 4UA8A 3TFLA 3JV9A 1II5A 5ITOA 1LB8A 3OOAA 1SW5A 5HBCA 1DMBA 4TQUQ 1US4A 1B9JA 4QFKA 1A99A 2F35A 1B05A 4E0WA 1VSOA 3QYTA 5JTYB 1MM7A 3KN8A 3O97A 2O1LA 4ESWA 3SDFA 4YKKA 2BJJX 4YKPA 4QSCA 2X26A 1QJMA 2H5YA 3H6WA 2QJEA 3O9PA 1WODA 3ZKLA 5FHMA 3RTFB 1LAHE 1Y3NA 4JBZA 4OFJA 3MPLA 4P0IA 3SEXA 5ITPA 3Q26A 5JTYA 2O6AA 4F2QA 4AB5A 4ELQA 2VP1A 2OCUA 3TPAA 3PPPA 3H4ZA 4U1ZA 2ALUA 4FE8A 3T96B 4DCXA 3IB1A 1ATGA 1P99A 4G8MA 4F29A 3QIMA 4LONB 3A3UA 4X9TA 4IO5A 2REGA 4MLQA 1MQHA 2DE2A 3M8UA 3EHSA 3U94A 3HHGA 4MFIA 4ELOA 4XXUA 4YKJA 4H6DA 4HW8A 1ELJA 3DELB 4LA9A 2NUVA 4M1VA 3RN8A 1MXXA 5EYFA 4TOZA 4DIGA 3PPQA 1Y9UA 2Y7WA 2O1MA 3M3LA 3MBPA 4R2FA 4N6PA 4EDPA 5IAIA 4BDRA 4DE8A 2Y7RA 4TLLB 1R1NA 3D4GA 3TEPA 4H65A 1ANFA 1P1WA 4IO2A 4HTGA 4RK2A 4ELRA 3B6TA 3R26A 2CMOA 3PPOA 4OEVA 2QS2A 5TP9B 3UN6A 2Q2CA 3SEVA 1OQGA 4EXLA 3RNNA 1NH8A 3UORA 3U72A 4ND9A 3EPEA 4EQBA 1M5BA 2Q88A 5I84A 2XXTA 4H1XA 5AA2B 1BLFA 1B6HA 4QRZA 4XKPA 4YICA 4Q8RA 2OK2A 4FEBA 2HZLA 1MS7A 4I9DA 5DVFA 4RPNA 3K4UA 3FJGA 4GQOA 3LSLA 1JW1A 4LP2B 4GWOA 4ZECA 4F1VA 3MP6A 3S9LC 1URDA 1MDQA 3SESA 1MH3A 2DWJA 1IXHA 3TKDA 1B40A 4H5FA 3TTRA 5I56B 4FATA 4ONYA 3TQLA 3FVGA 4O3CA 1SI1A 3CIJA 1N84A 3G3FA 1NFTA 2PMSA 2Q2AA 3K1NA 4PE5B 2FA7A 3V89B 2E0SA 2RF1A 1AH5A 2D5WA 3OMBA 3T9UA 4DXCA 5I56A 3I5OA 3C4MA 3ZKKA 3TCHA 5AA4B 4IGTA 1XT8A 3UIFA 1LAXA 5AA1A 5KCJB 4C0RA 2RKMA 5K2XA 4R74A 1GV8A 1DPEA 3E13X 2B3BA 1ZJLA 3IOWA 2OWSA 5AA4A 2XXRA 3AXFA 3UA8A 2QPQA 3L6GA 1HSJA 3ILTB 4F39A 3OD7A 5KCJA 3MC2A 2V25A 5H8HB 1QUKA 5K2YA 3GZGA 1UTHB 3MQ9A 1LLSA 4H5GA 1I69A 3SEWA 3A09A 4NF5A 2RCAA 3FXQA 4JWXA 2XXQA 3MP1A 4FORA 1FQEA 3H06B 3K1MA 1BTJA 3TQWA 5CMBA 1SW1A 2XD3A 3G3JA 3MP8A 4R6KA 1BKAA 3MZ1A 4F22A 4OERA 2VD2A 4QFOA 5KDTA 2NWJA 3SKPA 3C9HA 3LBSA 1MPCA 4XIGQ 3VVFA 2E1SA 3O28A 4RXLA 4X48A 3THIA 4KI0E 1SYIA 2I0BA 4WEDA 3G3HA 3UP9A 4DXBA 1NNKA 2Q9TA 3EF7A 4I8CA 5TPAA 2VOZA 4XKNA 3WAFA 1FTJA 2PT2A 1B51A 1EZ9A 2RINA 1A8EA 1JVYA 2ONSA 2ZNSA 1CB6A 3N6TA 3VXBA 1NH7A 4G68B 4R9GA 3MAMA 1N0TA 1IXCA 3TELA 3K02A 4F2OA 3MZBA 4TLMB 4KCCA 1N7WA 1MG1A 4OMBA 1P1OA 2ONKE 4QFNA 5H8FA 3KGCA 1SQYA 3LR1A 5EHMA 5FTIA 5EHSA 3OXNA 3O6IA 3HN0A 4MF3A 2ZNTA 1A7LA 4DXUA 1R9QA 2F7AA 4R2BA 1HSLA 3FD3A 4YKIA 2W7YA 4LZ5A 3BBRA 1M5FA 1N04A 4RYAA 4KYEA 2ZYMA 4N07A 3FJ7A 1IEJA 2I4CA 2Z8FA 1H3DA 5L9MA 1OLCA 3CG3A 3DLNA 4PETA 1MRPA 2KLFA 2OWTA 1TXFA 1RYXA 4HCWA 2ABHA 5H8QB 2GH9A 1VE4A 1IXIA 3IOUA 1B58A 1Y1MA 2XD2A 4Q0CA 2ZYKA 1UQWA 2QSXA 2I48A 3OO9A 4PFWA 2HXWA 1DSNA 1PDAA 1Y3QA 2F36A 2QS3A 3IJXB 2YJPA 5CBRA 4FAJA 2RCBA 4ZE9A 3RLFE 1JNFA 4U22A 1LAFE 1MXYA 2VGQA 3V8XB 1MPBA 1TT1A 1USYH 1XVXA 5DEXB 3RTWB 2F6GA 3PMWA 3PUZE 3KN7A 3SEUA 2VHAA 1O7TA 3OEKA 4KQPA 3QXMA 2I58A 4I62A 1POY1 2OBGA 5CMKA 1AMFA 2LAOA 4I1DA 5DEXA 3TUSA 3VLUA 3HSTA 4LQ2A 3WAEA 2Y7PA 1B46A 1MM6A 2Z22A 1JW5A 2XXUA 3G3KA 1MQDA 4OFLA 3L6HA 1OVTA 4EQ7A 4NF6B 2DYXA 3RPWA 1J1NA 1D9YA 2Q8JA 1US5A 3UK4A 4R75A 3K2DA 3PPRA 3S9EA 3N5LA 1B0HA 3MVZA 3CVGA 1JEVA 3H6TA 4PFYA 3HCQA 2HZKA 4LQ5A 4NF6A 3U93A 1PBPA 4IY6A 3KFMA 4EF1A 1B52A 1UIUA 2XXHA 3VV5A 1OQHA 2YLNA 4PFTA 1IQ7A 5I59A 1LCTA 4JSOA 2HQ0A 4JWYA 2F78A 4EQ9A 3PU5A 1B1HA 3O2AA 3N6UA 1MY2A 2UXAA 5DYHA 2O84X 1ZLQA 4GL0A 3T9HB 3TMGA 3EN3A 4LZ8A 3SETA 1SD3A 3MVXA 4HCYA 3HPIA 5F7VA 4H67A 1PB9A 2AL4A 2Y7IA 2HFBA 2V93A 3K6VA 4OWDA 3KEIA 3W9WA 5H8NA 3C32A 1GTKA 4AB6A 3RT8A 2H99A 3T9VA 3PV0E 3CFXA 1POTA 4M4GA 3IAZA 2XXXA 2GHBA 4FIMA 4F3PA 1JEUA 3E3KA 4Z7EA 3DP4A 1ZTYA 2Z8DA 4DZ1A 2XX9A 3ECRA 3MZ9A 2DWAA 3KN3A 4GVOA 5HM4B 4QSEA 4LZ7A 3MUQA 2P1SA 4X1BA 4IY5A 3KG2A 3T93B 5IKBA 3Q28A 2P2AA 3FV1A 2DWHA 1H76A 4KPTA 1DOTA 1LCFA 3IJOB 1B3FA 3B6WA 3DP8A 3FGSA 3SEYA 2DOJA 3QSLA 1R6ZA 2THIA 3LSWA 3MW0A 4RPOA 4P0GA 3K01A 3RQTA 4F3GA 1MXVA 1I6BA 5FHNA 3S4UA 3IOTA 4GD5A 3OO6A 1MPDA 3TTNA 3V5AA 3KOSA 3R6UA 3K0VA 4XTCQ 1H44A 4NWDA 3QUJA 3EHTA 5AE4A 3R7XA 3B7DA 5I58A 4NE4A 1MY3A 3PPNA 2NOOA 1DTGA 4G68C 5HPQA 3MVWA 3GXAA 1N3XA 1M5DA 2I3WA 3PD8A 1SW2A 3CFZA 1UIVA 4LATA 4KR5A 1T0KA 1D3KA 2RC8A 1SVXB 3U1OA 1Z7NE 4OHNA 4NF5B 4QHQA 4ESXA 4H8JA 5L9OA 1R9LA 4R6YA 3TAJA 2D3IA 1NL5A 4NMYA 2VD3A 4OFOA 2ZXTA 4FEDA 2DE3A 1LSTA 5LOMA 3IR1A 4G8NA 3FATA 2V3UA 4YMAA 4R6HA 2I4BA 1Y4TA 5KDTB 4BDMA 3VLVA 3ZSFA 4U23A 1XC1A 1ZKBA 5DT6A 3TTMA 2H25A 3IB0A 1QULA 4KYSA 1GGGA 5BUUA 1L5TA 1Y20A 3Q25A 4BDQA 4JSDA 4DCYA 1FTKA 1LBCA 3EHUA 1MY4A 5CC2A 1B7HA 1S50A 5TPAB 3VXCA 2O51A 3O6GA 3QUFA 2FYIA 1PBQA 2XXIA 5I57B 3HHFA 2XHDA 3FXRA 5DVIA 4U4XA 2F34A 4ZEBA 4NWCA 4ECFA 3H3GA 3M3FA 1MXZA 1QKAA 3W9VA 4GXSB 5DTBA 3MWBA 2DE4A 5B7DA 2B65A 2QMWA 4QF9A 4O3BA 3OSRA 1IXGA 4H8IA 3SERA 3PUVE 2F97A 3QAXA 5I57A 3B6QA 4GLIA 4ELPA 3H7MA 2XX7A 1B2HA 3FVNA 3Q27A 1Y3PA 3HV1A 3LUYA 3QK6A 3ILUB 3HO7A 2A5TA 4BDLA 2UVHA 5F1QA 4KD5A 5H8FB 4AQ4A 2M8CA 1B5JA 3C36A 5L8DA 4MH5A 4IO4A 1FQAA 3E4RA 1MQJA 4GIZA 1A54A 2R9JA 1MH4A 3BFTA 1EZOA 4YZZA 3CSBA 5H8SA 1YPNA 3GBAA 2UVGA 3D4CA 3TODA 1IIWA 3IOVA 4EUOA 2NXOA 4QFLA 1JQFA 5B70A 3USDA 1USYE 3ONMA 1MY1A 3ODBA 1URGA 4ZEIA 4NEDA 1SBPA 1B32A 1EU8A 2DVCA 2H9BA 3FZVA 2X7PA 3PMXA 3VVEA 5ISUA 4G77A 2GRVA 4C1TA 4NF4B 2ONRA 4LVQA 2O7UA 1IUDA 1AL3A 4XKRA 3T22A 3CG1A 4GL8A 5JEIA 2XXWA 4YB7A 2Y84A 4NF4A 5JK4A 3IORA 2QRYA 5I2KB 1B1XA 4Z0IA 4ZEKA 1PC3A 4IB2A 4RNSA 5KZTA 2IEEA 2DS9A 5J1DA 1IITA 3TTKA 3T9XB 3O29A 4ZE8A 4N13A 2AYSA 2PX1A 2DVZA 2REJA 1AIVA 2PBWA 5I2KA 4POWA 4DLDA 4Q30B 4JDFA 4OESA 2RC7A 3DP6A 1PB7A 3U8QA 4L17A 4BLAA 1ZIUA 1PB8A 2HCAA 3KJ7A 5M2VA 1URSA 4WKMA 1LB9A 1H43A 5L9SA 3CSGA 3IO6A 4E0XA 3VDFA 4IGRA 2GHAA 4G4PA 3S9NC 2Q89A 1NMUA 4RJZA 3KOTA 1Z7ME 2R71A 3S9MC 1ZBMA 3CFLA 1B7UA 4GXAA 2P0SA 4F1UA 1WDNA 3FXUA 2DQVA 3TZAA 2I3VA 1HSEA 3N26A 1RYOA 4BDOA 1AOVA 3LC8A 2QS1A 3CI8A 2QMXA 4RY1A 2G93A 1LGBC 3K6WA 4NF8B 4IO6A 3TYHA 1UTBB 4WEPA 3ZS6A 5TU0A 3KJTA 2OJTA 1B4HA 1DPPA 4GFRA 3H6VA 5ICQA 1O64A 4KHZE 1P1NA 2F6PA 5CMCA 5BWJA 4OTEA 4EXKA 4H0WA 5DVJA 4NF8A 1P1QA 3RGYA 1D4NA 3Q29A 1UTBA 1LFHA 1NNFA 4K3FA 4POXA 5ELVA 1FTLA 3I6VA 5I59B 5CBSA 1XOCA 4ZS9A 3H6UA 2ZNUA 3C33A 3MJNA 1XVYA 4X1DA 2H4IA 4OQOA 4JXIA 2HAVA 1F9BA 4JB7A 3RY3A 2YPNA 4ZEFA 2HEUA 1LFIA 1FQFA 5CRYA 2XXPA 1YCJA 1LAGE 2ESNA 5H8NB 2Y7KA 4G2ZA 3H03A 2XX8A 4F3SA 4KCDA 2PT1A 4UACA 3BFUA 3PGFA 4OZ9A 4IO3A 4YMBA 1QKBA 1GR2A 3FV2A 3PUXE 2UYFA 3O66A 1N3WA 1S9TA 4PQJA 1NNPA 2I0CA 1FW0A 1I6AA 3TCGA 2DSFA 3DM0A 3OELA 1M5CA 5CM6A 4WXJA 1MXWA 1VR5A 2H98A 1ZU0A 3LSXA 4OYVA 3FIRA 4YB5A 3PUWE 3I3VA 2X7QA 1FCKA 1EZPA 3FVKA 4RA1A 4GOTA 4THIA 1MDP1 2DP8A 1NNTA 1TFAA 1O63A 1VFDA 4PFUA 3O6HA 3E9XA 1B3EA 1DTZA 4R9FA 2ZYOA 4F1YA 3P7IA 5TP9A 4BDNA 2DXYA 4O3AA 3C34A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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