4U3AA

Crystal structure of ctcel5e
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
304
structure length
292
Chain Sequence
AVDPFEMVRKMGMGTNLGNTLEAPYEGSWSKSAMEYYFDDFKAAGYKNVRIPVRWDNHTMRTYPYTIDKAFLDRVEQVVDWSLSRGFVTIINSHHDDWIKEDYNGNIERFEKIWEQIAERFKNKSENLLFEIMNEPFGNITDEQIDDMNSRILKIIRKTNPTRIVIIGGGYWNSYNTLVNIKIPDDPYLIGTFHYYDPYETWGTQEDMDTVVRVFDFVKSWSDRNNIPVYFGEFAVMAYADRTSRVKWYDFISDAALERGFACSVWDNGVFDMAIYNRDTRTFDTEILNALF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum atcc 27405
publication title Biochemical Characterization and Structural Analysis of a Bifunctional Cellulase/Xylanase from Clostridium thermocellum
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase H
total genus 119
structure length 292
sequence length 304
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2014-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4u3aA00
1GQJA 3WEZA 1B3YA 2VVNA 1LWJA 4RE2A 1WDQA 3IANA 3WBEA 3IJ9A 1CGVA 1EOKA 1LL4A 1KBBA 5EB8A 1HF6A 5A95A 1J18A 1GPFA 3WEMA 1XHGA 3O2LA 3GXDA 1E1FA 4Q7NA 3WQ4A 4ML4A 3EDDA 1NOFA 2DSKA 3VTRA 4W86A 4P7LA 1E56A 2DGAA 4YPJA 2XVNA 2FDMA 4W7VA 5IFPA 4PUDA 4OZOA 2GDUA 4DUWA 1JZ4A 3VMNA 4W5ZA 4NZCA 2ZXDA 3ARRA 4PMDA 3VIMA 2VNCA 3CMJA 4KRUA 4BCEA 2YIHA 3CHDA 2XSAA 4JFVA 3CPUA 1G94A 1US2A 2E8YA 3PZQA 1C90A 1GZJA 1HJUA 4ATLA 1B90A 1EIBA 7TAAA 2DIJA 3WNKA 4PEEA 1SFSA 1LQ0A 4M81A 1QVBA 3W82A 5CSUA 2BVDA 3AZTA 5DO8A 3WBAA 1J01A 3BMVA 1VBUA 3WFZA 4AISA 1JG9A 2WMIB 1G9HA 2QHAA 3WNPA 4PTVA 1V3HA 3ARZA 3BC9A 3G6LA 1UH4A 4M80A 4RE4A 3T0AA 1U2YA 1TZ7A 1XD1A 2EQDA 2EJ1A 4CU7A 1QI3A 3L4YA 1BG9A 1UD2A 4H2CA 3NIYA 1QI4A 4XB3A 2QMKA 4WIWA 3K8KA 1MW0A 4HOXA 3WY1A 3KEHA 4UFJA 4AD5A 4U3CA 1NARA 1UR1A 4Z2HA 2DEPA 1CPUA 2VR4A 3I3EA 1L0PA 2CPUA 2G3JA 4F9JA 1EDTA 5CPQA 3DYMA 4MJ4A 1W3KA 4OIFA 1RD6A 1UD5A 4J3UA 1K9FA 1GOQA 1VFFA 1CYGA 2VX6A 2WBGA 1UWQA 1YQ2A 4D71A 2ESCA 1AQ0A 4OOZA 4P8UA 2PWDA 5JIWA 3SCWA 1E40A 3CZGA 3FHAA 3T0DA 1CLXA 1WZLA 4GXPA 1MFVA 1XH2A 2WK2A 1KWGA 3RM4A 1JDCA 1CGWA 1LJYA 3D3AA 3PHAA 3AIQA 1C8YA 1R86A 2O92A 3VDAA 4PMOA 1SMDA 4U3AA 2DIEA 2XVLA 5GQBA 1TVPA 2DSWA 3WUBA 1WDRA 4BQ2A 2ZX7A 1QW9A 3RIKA 4HP5A 3II1A 3S6TA 3IJ7A 2G8ZA 2WBKA 4D1JA 3PN8A 1E3XA 3VNYA 1FH8A 4E2OA 1E4NA 3NSNA 4AMCA 1K9TA 2D1ZA 3ECQA 4M56A 3PZTA 3UCQA 3WDJA 4HA4A 5M3WA 3CZKA 1GQIA 3ZJ6A 3F5LA 5ABFB 2GDVA 1IV8A 3M6DA 4GO8A 3OZOA 4B16A 4ZEPA 1RPKA 4UCFA 1WAWA 3GBEA 3VMPA 5D9MA 2YDRA 2J7EA 3D5HA 4JKKA 4JCLA 2QMJA 1KR0A 2WHJA 3ARVA 1TMQA 1DWIM 2VZVA 3AZSA 1XYZA 5HPCA 3SCOA 1E6QM 3VD4A 5A1AA 2VOTA 4E8DA 4D6DA 4CN6A 4CCCA 3LPFA 1GHSA 3M7SA 3T0BA 2JE8A 2A3EA 3MS8A 2VURA 3SIMA 2VZSA 4D1IA 1TCMA 1MFUA 1G0CA 2O9PA 5F7UA 4IPLA 5E6YA 4J3SA 3ZSSA 3U57A 1QI2A 5C8BB 1GVIA 1U30A 4W7UA 1BYBA 2BY2A 2YLAA 1UYQA 4KGJA 3NSXA 4ZE5A 1W2PA 4MPKA 2BXZA 4KGLA 2WZEA 2EBNA 1JD9A 2JALA 3POCA 1GORA 2VZOA 1FH9A 6CGTA 1TE1A 3KZSA 2C0HA 4W88A 4AZGA 3ZMRA 4DWSD 2XFRA 7CGTA 1QNOA 2YKKA 3BLPX 4UQEA 3QGVA 4AYSA 1J12A 1CIUA 1NM9A 1S46A 1BGGA 3PZMA 1JXJA 4D6GA 3VIFA 2W4XA 2WVVB 1V3IA 3W25A 4EAMA 4AZ5A 2DH2A 4MAZA 5CPTA 2RGMA 1E6PA 3J7HA 5GNXA 2CYGA 1Q6GA 4HU0A 1US3A 2J78A 4EE9A 1OT1A 2WVUA 1Q6CA 3MMWA 3I3BA 3AIWA 2IUZA 2BY1A 4GI9A 2QPSA 2WYSA 3VDCA 3VVGA 3B8SA 2CITA 4PMXA 4W8AA 2UWFA 1JDDA 1EGZA 1NWSA 3OB8A 4OJYA 2EPNA 5ABFA 4DM1A 1MXGA 4AZBA 3AISA 1GOMA 3AMLA 3AMCA 3OGVA 3SCVA 2J7HA 3WD4A 1PX8A 2OYLA 4M8UA 2TAAA 5C71A 3WIJA 4F66A 1XH1A 1M04A 5A2AA 1EA9C 2BVYA 1H4PA 1HKJA 5I23A 1KGWA 2VX7A 1ITCA 1NH6A 4TTGA 4WJXA 1MVYA 2EEXA 4MAVA 5FOOA 4J3WA 2CBUA 2GJXB 3PZOA 1WE5A 2VJXA 1X1NA 3PZGA 1X6LA 4RL3A 3UG5A 3VILA 2WNWA 4AZCA 3GNRA 2DPEA 2VQTA 1C92A 3PTKA 3ZQ9A 4HA1A 4C7GA 4B3KA 4CGTA 4QAWA 1E6NA 1QNQA 4AD2A 1V6XA 4K68A 3MKKA 4JL2A 3N18A 3KL0A 4UOJA 3AHZA 2ZWYA 4YHGA 1XC6A 2VRQA 5D8WA 2XGIA 1JZ7A 5CPSA 2J77A 4EKJA 1HKIA 3GXMA 4ATDA 3WDPP 1R85A 3GXFA 2JIWA 1OWQA 4OBSA 2WPGA 4FK9A 1IZJA 1B9ZA 4F8XA 2G3NA 2XFYA 1O7AA 5A2CA 2X0HA 1CEOA 1HJSA 1WNOA 2QLYA 2XM2A 1R7OA 4GKLA 2VQUA 2QF8A 1CBGA 3VGGA 2JIEA 1HL9A 3L4TA 2AMGA 4UFHA 2XWDA 1W2VA 4X0VA 3WQ5A 3VGFA 3VNZA 2CERA 4TX8A 3SEPA 1WPCA 3EDJA 1KXTA 1LWHA 1R87A 2WLZA 1VIWA 5M03A 1ISVA 5ABGA 5E9AA 1PEZA 1UR0A 3VD5A 1GQKA 3MUZ1 2EPKX 4AZHA 4PTXA 3RCNA 4Q22A 2VR5A 3T08A 2VC9A 5FCZA 2FGLA 3WQVA 4GQRA 4TX6A 1CXLA 3NSMA 4UQCA 2J47A 4W8BA 3VM7A 3IJ8A 3AIBA 1CWYA 2X1IA 4J7RA 3AIUA 3OIHA 1N82A 1E0XA 1E71M 1KGUA 1BLIA 2XVGA 1B0IA 3VPLA 3ZIZA 4AD1A 3LPOA 5CZKA 5D9NA 2YDSA 5A6LA 1PX4A 1XSKA 2PBGA 3N17A 1UKOA 2WHMA 1NOUA 2J4GA 4Z2GA 2GJPA 2DT2A 1UH3A 2XIBA 2OLHA 2CCRA 3TA9A 1MQQA 4LXFA 1ZBCA 3DHPA 1Q6EA 3SCQA 1CENA 5BROA 4WSJA 3OLIA 4AD0A 4P8WA 1E6RA 3U7BA 3PZIA 1YHTA 1MQRA 3WL1A 3WH9A 3K4DA 1V08A 3HN3A 4HU8A 5A6KA 4CD5A 4HZ7A 3WNNA 1JI2A 2QV4A 5FIPA 5LA0A 3G6MA 2ZIDA 1I1XA 5I3DA 4GQQA 1AMYA 5FD0A 5BXPA 4DUXA 4QFUA 2J7DA 1UA3A 4PUEA 3CUIA 1TG7A 1EDGA 1GOIA 3ZT5A 3L4UA 3VIHA 4A4AA 3AS1A 1KQZA 4NRSA 1MW2A 5HXMA 4CKQA 1JZ2A 1KXQA 2UY2A 2GFTA 3WD1A 1PBGA 1J10A 2JF7A 2WSKA 5BYWA 2W63A 4GZIA 1EH9A 1WDSA 5HDRA 3MU7A 4EK7A 5AC4A 1OT2A 1Z32X 1BPLB 2OWWA 4BS0A 2Z1SA 1E72M 1HJVA 3VM5A 3A3HA 5IFTA 1UWIA 3GDBA 2VZTA 2DT0A 3ZT6A 1JYXA 3RILA 1J0HA 3ALFA 4LPCA 4UTFA 1HIZA 5A8NA 1FA2A 5GNZA 1PZ2A 2XPKA 5A6JA 1XSIA 3MO4A 7A3HA 3MSGA 1UD4A 3VO0A 4GIAA 5DEZA 2ZUNA 1E6XM 4AIOA 1G01A 1GW1A 3AZRA 1E0VA 4LYQA 3L2LA 1FOBA 4MADA 4H7VA 5AYBA 2JEQA 3L4VA 1F4AA 4JCMA 1DHKA 4CVUA 1UUQA 4PMQA 1V0LA 4B9YA 6TAAA 4V27A 1M01A 1W3HA 3AMDA 4M82A 3S2CA 1JAKA 3CBWA 3CUGA 5HNNA 2VI0A 1JZ6A 1D2KA 3SUWA 3WN6A 1TVNA 3AICA 3LPPA 4U2ZA 4TOQA 2WC3A 1H2JA 2D3LA 3WSUA 2UY4A 2YBTA 4QLLA 4XV0A 1PX3A 3ARWA 5HBFA 2WKLA 4PTMA 1CTNA 2YL9A 3BAWA 1ZJBA 4W89A 1HX0A 3I3DA 4W7WA 3N9KA 2XJ7A 2A3BA 4MB5A 2VUYA 1VFOA 3ARSA 1V0NA 1G5AA 3ARTA 3WUEA 1ISWA 2DT3A 1XV8A 1E0WA 2D24A 3PZUA 2CEQA 3L4WA 4MDOA 3L4ZA 1K6AA 3CZEA 2ZICA 1VF8A 5JBFA 1E5JA 2J8FA 3K8LA 3PZ9A 3N13A 1B3VA 3WQWA 1HKMA 2WLYA 2WMKA 2XIIA 4HZ6A 4PBGA 3AS3A 3OLGA 1V3KA 2F8QA 1EQCA 1TR1A 1DTUA 1E3ZA 1GUVA 1MYRA 1B3WA 1H5VA 5IHSA 1JF6A 2DSUA 2W61A 1C91A 4CD7A 3EDEA 4H41A 4ZXOA 2OYMA 3AXIA 4OOUA 1OB0A 3AS0A 3L2MA 2YLLA 3RJYA 2A3CA 3GTNA 3OBAA 3GNPA 4IM4A 3ZJ7A 4ACZB 1KCLA 3W37A 2E8ZA 2Y4SA 3AI0A 2DDXA 1GQLA 2Z1KA 3AQUA 5AY7A 5IDIA 1V6VA 5I24A 1BVNP 4UOQA 1GJWA 1PZ3A 2E4TA 3WD0A 1CZ1A 1JNEA 4JFTA 3KE0A 1WB0A 2VVSA 4QDMA 2JFEX 3UETA 2BHUA 5CSYA 3W29A 3OA5A 2WZIA 3THDA 2YBUA 3QOKA 1WO2A 3N15A 3VOCA 8A3HA 1JAEA 2IXUA 3DYOA 4W8LA 2BNJA 3DC0A 1M03A 1UD3A 2VZUA 2VCCA 2WAGA 4CN1A 3VIJA 4KH2A 3BMWA 2O9OA 4HOWA 2WMIA 1CDGA 4AIUA 3W38A 3N04A 1WZAA 5CLTA 4AZ6A 1WZKA 3T09A 2O9RA 4TXEA 5I6SA 1J0ZA 1UG6A 2D3NA 1VFUA 3U5UA 4HZ8A 1RH9A 1FFRA 2F61A 5CJ5A 1UD6A 1JL8A 1M53A 3MV01 3FHQA 5GPRA 4WF7A 2VX4A 1CGXA 1KXVA 1GNXA 1ZBVA 3EDKA 1H1NA 1I75A 2FHCA 1V6YA 3CZLA 1PIGA 2WM0A 3CMGA 4PCSA 1ZBWA 1XGZA 2VL4A 1I1WA 3BAIA 1E5NA 2ZUWA 4WLCA 5BRQA 3FY1A 4JZ5A 4XX6A 1MW3A 1UR2A 3CUFA 5LYRA 1XRVA 4UZSA 3CZJA 3GZAA 2V38A 5JIPA 4PMRA 1BF2A 1AQMA 3WH8A 4PCTA 3VIGA 1PAMA 3POHA 4Z2LA 1FH7A 2ZUVA 1TUXA 4YHEA 2XUCA 3VKKA 5A8PA 2OWXA 1RP9A 1FP8A 1F4HA 5HPOA 1DWFM 3ZOAA 4UR9A 2GUYA 3TONA 2BVTA 4D72A 4D6CA 1ZB5A 1W9UA 2WKGA 4N42A 3WMBA 1CNVA 1XYFA 2AAAA 4CCEA 1UOKA 5DT7A 3WQ6A 3UESA 3UR8A 1CGTA 1W9VA 3WEOA 3F5KA 3AXHA 3RDKA 4E8CA 1UWUA 4ZFMA 4HPGA 2J7CA 3NDYA 4AXNA 3CUHA 2AOSA 1SMAA 5HOSA 4MB4A 4IUGA 4M24A 1LLOA 1B2YA 1B3XA 2ZX5A 1KCKA 1EQPA 3ZSTA 1WZMA 3PZVA 5ABHA 1NOWA 3PBGA 2A3AA 1C8XA 1KQYA 3GH4A 3RM8A 3W28A 1ECEA 3OGRA 2W92A 1J9YA 4AEFA 1UKQA 4DWSB 1QBBA 1TA3B 3SUVA 1BYAA 3KL3A 4D6IA 1JFHA 4P7OA 2MANA 2NW0A 3WF1A 2IXVA 5CG0A 1BQCA 2FH8A 2WMGA 3AIRA 3APGA 1E6SM 4OUEA 4BZYA 9CGTA 1JIBA 2ZWZA 1OINA 1H11A 5A6BA 3W81A 4L4PA 4C7FA 2CBVA 3W0KA 3PTMA 4PSPA 1HNYA 4AWEA 1KR1A 3SCRA 1DP0A 3DHUA 4UQAA 1W3LA 1JNDA 3OGSA 4ZE4A 2BY0A 4XZBA 4X0NA 4CD4A 2D0GA 3TTSA 2EPLX 1B30A 2C8NA 1WKYA 4W85A 2A3HA 4MDPA 1B1YA 2Y24A 3WMCA 4MTVA 4RE3A 4PMYA 2HISA 3VIKA 5DFAA 3NYDA 2YL5A 1GONA 1V0KA 1V02E 1VENA 2GJRA 2ZXQA 1UKTA 3CTTA 1JD7A 1HJXA 3WNOA 4J3VA 5D9PA 3ARYA 1E55A 4TVCA 4CD8A 2D0HA 2WVVA 3BAYA 2J79A 5E0CA 1JZ5A 1W9BM 2WMFA 4GPNA 2WXDM 3ZT7A 2PWFA 3CUJA 3DECA 2W66A 4U5IA 3SURA 1J0IA 3WNLA 4PSRA 4JKMA 5FL0A 3WD3A 2D23A 4U2YA 4UQBA 4GI8A 1CECA 3CZ8A 5E6ZA 3LMYA 1VEMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GQJ A;  3WEZ A;  1B3Y A;  2VVN A;  1LWJ A;  4RE2 A;  1WDQ A;  3IAN A;  3WBE A;  3IJ9 A;  1CGV A;  1EOK A;  1LL4 A;  1KBB A;  5EB8 A;  1HF6 A;  5A95 A;  1J18 A;  1GPF A;  3WEM A;  1XHG A;  3O2L A;  3GXD A;  1E1F A;  4Q7N A;  3WQ4 A;  4ML4 A;  3EDD A;  1NOF A;  2DSK A;  3VTR A;  4W86 A;  4P7L A;  1E56 A;  2DGA A;  4YPJ A;  2XVN A;  2FDM A;  4W7V A;  5IFP A;  4PUD A;  4OZO A;  2GDU A;  4DUW A;  1JZ4 A;  3VMN A;  4W5Z A;  4NZC A;  2ZXD A;  3ARR A;  4PMD A;  3VIM A;  2VNC A;  3CMJ A;  4KRU A;  4BCE A;  2YIH A;  3CHD A;  2XSA A;  4JFV A;  3CPU A;  1G94 A;  1US2 A;  2E8Y A;  3PZQ A;  1C90 A;  1GZJ A;  1HJU A;  4ATL A;  1B90 A;  1EIB A;  7TAA A;  2DIJ A;  3WNK A;  4PEE A;  1SFS A;  1LQ0 A;  4M81 A;  1QVB A;  3W82 A;  5CSU A;  2BVD A;  3AZT A;  5DO8 A;  3WBA A;  1J01 A;  3BMV A;  1VBU A;  3WFZ A;  4AIS A;  1JG9 A;  2WMI B;  1G9H A;  2QHA A;  3WNP A;  4PTV A;  1V3H A;  3ARZ A;  3BC9 A;  3G6L A;  1UH4 A;  4M80 A;  4RE4 A;  3T0A A;  1U2Y A;  1TZ7 A;  1XD1 A;  2EQD A;  2EJ1 A;  4CU7 A;  1QI3 A;  3L4Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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