4U4SA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam25 at 1.90 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
256
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 256
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA02
4GLIA 4H6DA 1LFGA 5DVFA 1N04A 1N7XA 2GHBA 3N5LA 2OJTA 4I8CA 5TP9A 3T66A 1B5IA 1MH3A 2AL4A 2F8DA 1R9LA 4QFLA 3LSWA 3HN0A 4F19A 1D4NA 5I56A 1OQGA 1EU8A 1Q35A 3H6TA 1B52A 1Y20A 5F7VA 1GVCA 2B65A 4Q8RA 2OWTA 5AA2A 5FTHA 3PUVE 4JDFA 4H8IA 1IEJA 1A8FA 5I2NB 1DOTA 1MXVA 3HHFA 3LR1A 4C0RA 4P0IA 2O69A 4JSDA 4BDRA 3QIMA 1H76A 4FATA 2Y7WA 1FQCA 4RXLA 3RN8A 2VP1A 4KPTA 4LQ2A 1NL5A 4XKRA 4QSCA 3EHUA 2VD3A 5JK4A 1UTBB 4OHNA 2I0CA 2DWHA 3SETA 3QK6A 4PFTA 2QJEA 3TMGA 1ELJA 1FTMA 4IY5A 2YPNA 1MXWA 3G3FA 3LC8A 4XTCQ 2DVZA 3T9VA 3E3KA 1JW5A 3HCQA 3KJ7A 2LAOA 1LBBA 3FVGA 4OMBA 2BJJX 3O6IA 1Y4TA 4M4GA 2FA7A 5KDTA 3B6QA 2CZLA 3EHTA 1URGA 3MVZA 2XX8A 3DP6A 1A40A 2ANJA 3I3VA 3TODA 4ZEDA 4XXUA 3KN7A 4LUBA 4KYSA 3ONMA 3KOTA 4NMYA 4WKMA 2HAUA 1QULA 5TP9B 3Q28A 1M5DA 1RYOA 3K00A 2NUVA 4NF8B 4IGTA 4NF4B 3SEXA 2V3QA 5I56B 5H8FA 4BDOA 1IITA 2RCBA 1O64A 3USDA 3FVOA 4FE8A 4P0GA 2I49A 4M1VA 5J1DA 1B46A 2ZXTA 2XX7A 5I2KB 4YU0A 2Y7PA 2OZZA 5BUUA 2WKYA 1VSOA 4MH5A 1FW0A 4FEBA 2ABHA 4H1XA 2DOJA 5A5XA 4H8JA 1Y3NA 3C32A 5EYFA 3PUYE 3MP6A 1MQGA 2VGQA 3KGCA 3UK4A 3MBPA 3OSRA 4ESXA 4ND9A 3HO7A 3GBAA 3PPPA 3TZAA 1CB6A 1OIBA 3FIRA 4DDDA 5AA4B 1IXIA 3DM0A 3LSXA 1JEUA 3FD3A 3OD7A 3FJ7A 2DWJA 3EN3A 1BLFA 1B5JA 1JW4A 4YKIA 5DVJA 4O3AA 5HPQA 4AB5A 5IKBA 3TFLA 2YLNA 4QFPA 2OWSA 1TWYA 4EXKA 1NH8A 1FQBA 3IAZA 1B4HA 1PBQA 1GV8A 2QRYA 4DXBA 3IB2A 4BDQA 1FQAA 1I6BA 5ITPA 2VOZA 1J1NA 2NWJA 3Q26A 4IO6A 1MQDA 2X26A 3OOAA 2O84X 4NTLA 1LBCA 5EHSA 4QHQA 3H06B 1Y3PA 2O1MA 1HSJA 2Y7IA 3OSQA 3O2AA 3DLNA 5DVIA 1RKMA 3PMWA 4GD5A 5TPAB 2X7QA 3O9PA 4E0WA 1EZPA 3IL1B 4KD5A 2QMXA 5CMCA 2Y7KA 3MAMA 1P1WA 4RK2A 2VD2A 3KZGA 3BFUA 5A5XB 3QSLA 4OESA 1MXUA 3H6UA 1XS5A 1LAXA 2ONKE 1FQEA 4R9FA 2VHAA 1QKBA 4ZE9A 4ZEKA 4F1UA 2ZNUA 3E4RA 3CI8A 1BIYA 3SEUA 1QKAA 2ONRA 2UYEA 3CG3A 1UTHB 4R74A 4HCYA 1NNKA 3T9HB 5AA3A 1B0HA 4G2ZA 1SI0A 4IO2A 4PETA 1AH5A 3W9VA 2REGA 2P1SA 3PMXA 4POWA 3DP4A 1VFEA 4XIGQ 3Q27A 3V5AA 3S9MC 1URDA 3SEYA 2UVIA 2Z8DA 3T9UA 4OVJA 4IB2A 4P11A 5I59A 3JZJA 1MS7A 3ZSFA 1S50A 5H8QB 1MY3A 5CMKA 4ISUA 4FAJA 1PEBA 2KLFA 1LFHA 2V25A 1B5HA 1ZMGA 1L5TA 4OYVA 3DP8A 1OLCA 1H43A 3K01A 1EZ9A 4ZE8A 4FEDA 4IGRA 2ALUA 2Y84A 4YMBA 4GFRA 1AIVA 3CFXA 4ELRA 1MM6A 2Z22A 3H4ZA 4I9DA 3CR9A 1JQFA 2I58A 3RUMA 4GXSB 4MBPA 1SI1A 4QRZA 2HAVA 3U1OA 2YJPA 1POY1 3CFLA 4G77A 2H99A 3PU5A 3RPWA 4G8NA 3H7MA 3MPLA 4F3PA 3C34A 4LZ8A 1GTKA 3TELA 1IXHA 4YKKA 4JWYA 3QUFA 1LB9A 1H3DA 4PP0A 4IO7A 4KCCA 2DVCA 4H5FA 4WXJA 3VXCA 2OBGA 4R6YA 3PPQA 5ISUA 3T22A 4HW8A 2ZNTA 3C35A 1NNFA 4NF5A 3KEIA 3PUWE 3N26A 4I1DA 1MRPA 2DXYA 4DXUA 4XKNA 3OELA 1MY0A 1ZKBA 4R6HA 4RK9A 1ANFA 4YKPA 1OLAA 3VVFA 4EXLA 4IY6A 1PB7A 3FXRA 2F6PA 3MVXA 4NWCA 2D3IA 1KWHA 3B7DA 1B05A 3PPOA 4E0XA 4EF1A 1DTZA 3A09A 4MF3A 1ZBMA 3ZS6A 2I3WA 1QJMA 4FIMA 2DE3A 3SEVA 3D4GA 3MC2A 4NF8A 4R72A 5I59B 2AIXA 1MXXA 4NF4A 4DIGA 1R1NA 2F78A 4GWOA 2V84A 4G8MA 5CRYA 3C4MA 5FHMA 4EDPA 4OFJA 5I2KA 4BDNA 1B7HA 4UACA 1M5CA 4TOZA 1OQHA 3KOSA 4Q5TA 1I6AA 4F3SA 3K1NA 3FJMA 4GL8A 3D4CA 1Y3QA 1USYH 3LSLA 1F9BA 1BP5A 4OXVA 4F31B 1P1OA 3M3KA 3SDFA 5KCJA 3OEMA 2QL3A 3B6WA 5IAIA 1D9YA 4NEDA 4R2BA 2PVUA 2XXXA 2XXTA 1MDP1 5AA4A 1B9JA 3FXUA 2XXQA 5H8NB 5B70A 3Q25A 2E1SA 3FVNA 1MPBA 3KN3A 1B3LA 3G3KA 3B6TA 2ZYOA 4GF8A 3LUYA 4L17A 3M8UA 2PYYA 5CBSA 2HXWA 4NF5B 4NF6A 4KR5A 3RTWB 1JNFA 5I57A 1SYIA 4ZEFA 2X7PA 4H65A 2GFEA 3A3CA 5EHMA 1DPPA 4MLVA 3FV1A 3TTKA 5LOMA 3R7XA 2H9BA 2QPQA 5K2YA 3UN6A 2I48A 1JEVA 3IJOB 4EQ9A 1USYE 2F5XA 5I58B 1I6QA 1HSEA 4HCWA 3FASA 3C36A 1FTLA 2A5TB 2XXUA 5TPAA 1R6ZA 4ELPA 1B1XA 1OVTA 3MQ9A 4G68B 3RQTA 3O6HA 3G3JA 1GGGA 1DPEA 4LP2B 3JV9A 4N13A 3TUSA 4EF2A 5CI5A 2F36A 3A3UA 4OFOA 3O6GA 1LAHE 5AE4A 1US5A 1LLSA 4R75A 1SVXB 1S9TA 4KI0E 2XX9A 3FGSA 1MQIA 5KCJB 4U1ZA 3JYRA 2DXRA 5H8SA 3RTFB 3O97A 4YB6A 1QVSA 3MWBA 4GRKA 2HZKA 3O29A 2XXVA 3O66A 5M2VA 3ILUB 2UVJA 3C9HA 1FTJA 1UTHA 3TTRA 3UORA 5H8HA 4ZECA 2REJA 4FJPA 2GRVA 3VLWA 3V83A 2G29A 1Z7ME 4U2RA 2I4BA 2QS1A 3S4UA 4YICA 2O1LA 4DXCA 4NF6B 4LQ5A 2UYFA 1JETA 4F1YA 4OFLA 5I57B 1TXFA 1SYHA 1TFDA 1B1HA 1M5BA 2HEUA 5H8QA 3TCHA 4YAHX 2O7IA 1LFIA 4JBZA 4BLAA 1SW1A 3LBSA 4G4PA 5DYHA 2DS9A 5ITOA 2GHAA 1NNTA 4GXAA 2I6EA 1MQHA 4Z7EA 4OQOA 2P0SA 3CSBA 3OO6A 4RY1A 2XXYA 1B6HA 3IJXB 2H5YA 1N76A 2F97A 5FTIA 4LVQA 3OEKA 4ZS9A 4F18A 3CVGA 3GXAA 3H3GA 3K6WA 4ZZAA 5K2XA 2F6GA 2Z8FA 5JTYB 1PDAA 3CG1A 2RC9A 5DEXB 1A54A 3MP8A 2ZYKA 3I5OA 2R9JA 4OEVA 1LAFE 4KHZE 3N6TA 2NXOA 1FTOA 2Q88A 4RA1A 1B51A 3GBBA 3V89B 1IXGA 1MPDA 1XOCA 3K0VA 2FYIA 3TTNA 1H44A 3KG2A 1P1NA 1ZU0A 4X1BA 4K3FA 4RPNA 3IX1A 5H8HB 1ZJLA 1IQ7A 1B40A 4LATA 4ELQA 3VXBA 3IOWA 1TT1A 1H45A 4ZEIA 3FVKA 1Y1MA 5CC2A 5FHOA 3SESA 1XT8A 3IOVA 2ESNA 3EPEA 5DTBA 4KYDA 4JWOA 3WAFA 4RNSA 2DQVA 4U4XA 4HS7A 4GOTA 3I6VA 1NH7A 1M5EA 4KQPA 3TKDA 4FORA 3OXNA 3EHSA 3TQLA 1Q1KA 4EUOA 4JWXA 3K2DA 1B3EA 3SEWA 2V93A 1VR5A 1M5FA 3UA8A 1MG1A 1QUIA 4WEDA 3H6WA 1OMPA 4F2QA 1ATGA 4POXA 1FTKA 3OMBA 2Z23A 3S2VA 1T0KA 4R9GA 2M8CA 3QUJA 4LZ5A 1QUKA 1P1QA 4RJZA 2Q2CA 4MLQA 4ZDMA 3KSJA 1A7LA 5HM4B 1O7TA 3MZ9A 3OENA 3CSGA 5H8NA 1I69A 3IB0A 4QFNA 1B3GA 2QS3A 1UIUA 3E9XA 3KFMA 2XXIA 1LAGE 4Z0IA 3CRBA 1YTVA 5B7DA 4JXIA 4F29A 2F7AA 3IR1A 4XKQA 3VVEA 4YB5A 3S9LC 2F35A 2R71A 4BDMA 1SW5A 2NOOA 1Y4CA 2Q9TA 3VFJA 1B3FA 4YKJA 3K6XA 4DZ1A 2IEEA 1LSTA 2O6AA 1NFTA 4C1UA 4X9TA 3AXFA 3N6UA 4N6PA 5I58A 2XXPA 2PT2A 5L9OA 3U93A 4LA9A 1ZTYA 4QF9A 2O51A 2F7CA 3U8QA 4GL0A 2A5TA 3M3FA 3MZ1A 4DCXA 4EQ7A 1WDNA 2OK2A 3M3LA 4OERA 4G68A 4QSEA 1MY1A 5CBRA 3L6HA 3TAJA 1FQDA 1IXCA 4ONYA 5CMMA 3T93B 1SBPA 1P1UA 4H5GA 1CE2A 1YPNA 5FHNA 4X1DA 2H25A 1MM7A 3PV0E 2FNCA 3FXQA 3H6VA 3KJTA 2Q89A 2ZYMA 4G68C 3HHGA 4YB7A 4F3GA 4U4SA 4U23A 4ELOA 1MY4A 2F34A 3K1MA 3QXMA 3DELB 1SW2A 4JSOA 3KSXA 2UVGA 2HQ0A 2DSFA 2I0BA 3IORA 4I62A 4GIZA 4ECFA 3FATA 1Y1ZA 2ZYNA 1VE4A 4KYEA 4QFOA 4U22A 3RNNA 3TTLA 3T9XB 1AMFA 2Q2AA 1AL3A 3G3IA 3T96B 1URSA 1B3HA 1DMBA 2XXRA 2RF1A 2H4IA 1LB8A 3BBRA 2PMSA 4MFIA 3HSTA 3H03A 3W15C 3LSFB 3K02A 3R6UA 3ZKLA 3TCGA 4AQ4A 2Y7RA 3VLVA 2V3UA 3IO6A 4XKPA 5AA2D 5AA1A 1B7UA 2B3BA 2P2AA 1O63A 4DCYA 3FV2A 4F22A 2IA4A 1OVBA 1FQFA 1GR2A 4OZ9A 1B4ZA 1B58A 5L9MA 4QSDA 2HFBA 2D21A 1TFAA 3ZKKA 5JEIA 2XD2A 1MH4A 1ZLQA 3G3HA 2DP8A 1A55A 1A8EA 3HV1A 1B32A 3U92A 3L6GA 3CIJA 4U21A 2RKMA 3PPRA 1AOVA 4DE8A 4LONB 3R26A 3KBRA 1N3XA 3ILTB 3UGWA 1JVYA 3MP1A 2QSXA 3SERA 5JTYA 5DEXA 1B0LA 1PB8A 5AA2B 3RY3A 1MDQA 2UVHA 1QUJA 2AL5A 4U1OA 2XXHA 5ELVA 4R2FA 2QMWA 1MPCA 2HZLA 4PQJA 3IO4A 1XC1A 1VFDA 3PUZE 3P7IA 3U94A 3TDJA 2HCAA 4PFUA 3V8XB 1S7YA 4Q30B 3F11A 3KN8A 4OEUA 3IOTA 2DE2A 5I84A 4O3BA 3S9EA 2DYXA 1YAEA 1NMUA 3TPAA 5CM6A 3TCFA 1XHYA 2G93A 4ESWA 4PE5B 3C33A 2XHDA 5TU0A 4IO4A 1MQJA 2RCAA 4H67A 4YZZA 3K6UA 4TQUQ 3HPIA 4F39A 2ONSA 1MXYA 2UXAA 4F3BA 3UP9A 4EQBA 2NVUB 5KDTB 3FJGA 4UA8A 2DE4A 3VDFA 4DLDA 5L8DA 5DT6A 3G7WA 2Q8JA 2B3FA 3N94A 2PX1A 2V3TA 1SD3A 2OCUA 5ICTA 3Q29A 3TEPA 2GH9A 3O28A 5KZTA 2RC8A 3MZBA 2AYSA 4RPOA 2QS4A 3RGYA 4IO3A 4AB6A 2F7BA 3ECRA 5H8FB 2O7UA 3MJNA 3WAEA 1XVYA 3E13X 1JW1A 4OENA 4R73A 3OO8A 3S9NC 4JB7A 3K1PA 3THIA 2XD3A 4NWDA 3GLBA 4GVOA 5BWJA 1LGBC 3PUXE 1R9QA 4GQOA 1IIWA 3IB1A 2RC7A 3U72A 1D9VA 2ZNSA 3PD8A 5HBCA 4F1VA 4TLLB 3MVYA 4NE4A 4LZ7A 4ZZEA 3EF7A 3QAXA 4N07A 1EH3A 3UIFA 1LCFA 2RINA 4RYAA 4O3CA 1N3WA 4THIA 1SDXA 3IK6B 1WODA 4IO5A 3RT6B 1QW0A 1B7ZA 3RLFE 4QFKA 3OO9A 1US4A 3RT8A 1PC3A 3VE1B 2I4CA 4OWDA 3QYTA 3MVWA 2E0SA 3VLUA 2I3VA 5F1QA 2W7YA 3EQ1A 1N84A 1NNPA 4WEPA 4C1TA 1YCJA 3ODBA 3CFZA 2A5SA 3VVDA 2THIA 2PT1A 3TQWA 3K6VA 1FCKA 1DTGA 1WVJA 1P99A 2R6GE 3FZVA 5CMBA 1UIVA 1A99A 3SKPA 3TYHA 2OLBA 3MW0A 5I2NA 5L9SA 4HTGA 2DWAA 1MXZA 3PD9A 2PBWA 4YMAA 2O68A 3FUZA 1B2HA 1SW4A 3MPKA 2Z8EA 1XVXA 1PBPA 2ZMBA 5ICQA 3MUQA 4F2OA 4G8HA 2XXWA 3W9WA 1PB9A 1Z7NE 3PPNA 4X48A 1HSLA 1ZIUA 3BKIB 1UTBA 1BKAA 2D5WA 1NKXA 2DWIA 4TLMB 4R6KA 3OO7A 1POTA 1BTJA 4KCDA 4OETA 3IOUA 3C31A 3G3GA 1DSNA 1JVXA 3BFTA 1N0TA 3PGFA 1D3KA 1SQYA 3TTMA 1MY2A 2CMOA 4PFYA 3PMVA 2H98A 4H0WA 4FECA 4BDLA 1Y9UA 3VV5A 1UQWA 1II5A 4PFWA 1IUDA 4KFQA 3K4UA 1EZOA 1IZ1A 4OTEA 1LCTA 1N7WA 4Q0CA 4ZEBA 1RYXA 2QS2A 3GZGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GLIA 4H6DA 1LFGA 3A29A 1FBDA 5DVFA 1N04A 4MEVA 1N7XA 2GHBA 3N5LA 2OJTA 4I8CA 5TP9A 3T66A 1B5IA 1MH3A 2AL4A 3FBPA 2F8DA 1R9LA 2F3BA 4QFLA 3LSWA 3HN0A 4F19A 1D4NA 5I56A 1OQGA 2CEYA 1EU8A 1Q35A 2HPGA 3H6TA 1B52A 1Y20A 5F7VA 1GVCA 2B65A 4NF0A 4N8YA 4Q8RA 2OWTA 4N6KA 5AA2A 4PAFA 4JVIA 3SZPA 5FTHA 4NAPA 4JVDA 3PUVE 4JDFA 4H8IA 1IEJA 2WEFA 1A8FA 5I2NB 1DOTA 1MXVA 3HHFA 3LR1A 4C0RA 4P0IA 2O69A 4JSDA 4BDRA 3QIMA 1H76A 4FATA 2Y7WA 1K9YA 1FQCA 4RXLA 3RN8A 2VP1A 4KPTA 1LEVA 4MJOA 4LQ2A 1NL5A 4XKRA 4QSCA 2QVUA 3EHUA 2VD3A 5JK4A 1UTBB 4OHNA 2I0CA 2DWHA 3SETA 3QK6A 4P1LA 4DI4B 4PFTA 2XWIA 1LBWA 2QJEA 3TMGA 1ELJA 2VPNA 1EYIA 4I40A 2FIXA 1FTMA 4IY5A 2YPNA 1MXWA 1DBZA 3G3FA 3LC8A 4XTCQ 2DVZA 3T9VA 1NV0A 3E3KA 1JW5A 3HCQA 3KJ7A 1FPJA 2LAOA 1LBBA 4NQ8A 3FVGA 4OMBA 2BJJX 3O6IA 1Y4TA 4M4GA 2FBPA 5IZ3A 2FA7A 5KDTA 3B6QA 2CZLA 3EHTA 1URGA 3MVZA 4P1EA 2XX8A 3DP6A 4OVQA 1A40A 2ANJA 2WYPA 3I3VA 3TODA 4ZEDA 4XXUA 3KN7A 2XWVA 4LUBA 4KYSA 3ONMA 3KOTA 4NMYA 4WKMA 3B50A 2HAUA 4GBWA 4XF5A 1QULA 5TP9B 1YZ0A 3Q28A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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