4U4SA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam25 at 1.90 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
256
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 256
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA02
2RKMA 1DOTA 3H3GA 3DP6A 3MZBA 3RTFB 3HHFA 3CRBA 4IGRA 4RJZA 3N94A 3N5LA 4BDQA 3HO7A 4RY1A 1JQFA 5FHOA 3CG3A 3TDJA 3Q27A 1JVXA 4DXUA 4IY6A 1UIVA 3QXMA 4OYVA 2I0CA 1IXIA 1I6BA 3TQLA 3C34A 1BP5A 3ONMA 5KCJB 3RPWA 3MVYA 4ECFA 2A5TA 2BJJX 1B0LA 4K3FA 3CG1A 1XOCA 4G8HA 2XXWA 5I57B 3DM0A 1OLAA 5IKBA 5L9OA 5DVJA 3B6WA 3V8XB 4AQ4A 2HEUA 4KR5A 1P1QA 2I4CA 2VD3A 1JEUA 3EHUA 3Q28A 3EHTA 3MVWA 1IITA 4BDOA 4E0WA 3KEIA 5I2KA 5DYHA 3H6VA 1FQDA 3C4MA 4YB7A 2NUVA 4F31B 4ZEBA 1KWHA 2UVHA 4AB5A 3OO7A 4POWA 3KBRA 4P0IA 1LAXA 1A54A 3QIMA 1OLCA 1P99A 5FHNA 2XXHA 2HXWA 2NXOA 2P0SA 4KPTA 2NVUB 4XIGQ 1ZU0A 3FV2A 4O3AA 1VFEA 4NMYA 4OZ9A 4F3SA 1GR2A 4GRKA 2H5YA 4MH5A 3OO9A 4F3GA 4RXLA 3M3LA 1Y1MA 2I3WA 4R9FA 5L9MA 4R72A 4PP0A 1LBCA 4ELRA 2DQVA 4I1DA 3UORA 4JSOA 2F78A 3IJOB 1MY3A 1NNPA 1QVSA 5KCJA 2PX1A 3VFJA 4ZEFA 3G3HA 4YU0A 3T9VA 1B7ZA 2PVUA 1SI0A 4FIMA 1B51A 3FIRA 3SEWA 1YTVA 3WAFA 1S50A 3U94A 5I57A 3MC2A 2UVJA 3VDFA 3PPQA 1ELJA 3UA8A 3GBBA 1JW1A 5DVFA 3HPIA 2AL4A 4MFIA 5ITOA 3O2AA 5FTHA 1USYE 3U72A 3VVDA 3U1OA 5I84A 3HSTA 4FE8A 3G3GA 1BLFA 2F7BA 5FTIA 3RN8A 4F22A 5AA4B 1PB9A 4GD5A 3T9UA 1M5FA 4H65A 2A5SA 2UXAA 1POTA 3TYHA 4THIA 1UQWA 3IB0A 3KGCA 3W9WA 4OFLA 1USYH 1XVYA 3RGYA 4EQ7A 3TFLA 1B3EA 5HBCA 3S9LC 1QUKA 2QMWA 3VVEA 3K6UA 2RC9A 4G4PA 4WEPA 3L6GA 1AIVA 2KLFA 1P1NA 4PETA 3CFXA 1YPNA 4DXBA 1ZLQA 3K2DA 4YKJA 1N7XA 4RYAA 2Q88A 4TLMB 4F1YA 3SKPA 4OXVA 4R73A 4RK9A 3MZ1A 4R6YA 3A3UA 4H5GA 3CSGA 3N6UA 2I6EA 4OTEA 4EF2A 1XS5A 2G29A 2B65A 4ELPA 1O7TA 1AOVA 2V25A 1A7LA 1Y1ZA 4MLQA 1ANFA 2Y7PA 4NE4A 2Z8EA 3A09A 3ZKLA 1OVTA 1LCFA 3KOTA 1B5JA 1EU8A 4KI0E 1MDQA 3I6VA 4IO7A 3O6IA 4ESXA 4OMBA 1URGA 3IORA 1A40A 4KYDA 3T93B 3UK4A 3C33A 4F3BA 2DWJA 3KFMA 3LBSA 1EZ9A 3OEKA 1GV8A 1PC3A 2XD3A 4FORA 4R9GA 3PUZE 4OEVA 4R2FA 1H45A 2Q8JA 4NEDA 5AA4A 2RCBA 3EN3A 2QS2A 4N07A 1LAHE 3H6WA 2I4BA 2PMSA 1B40A 3RT8A 4FAJA 4LVQA 3MPLA 3HV1A 2QL3A 1JW4A 2HAVA 2QRYA 5EHMA 1MPCA 4MF3A 1B3GA 4QSEA 2F6PA 2D5WA 1M5CA 4G8MA 4LP2B 3BKIB 1B2HA 1B9JA 5CBRA 4YMAA 2O51A 4KHZE 5KZTA 3S9MC 4HCYA 2I48A 2ANJA 3Q25A 3PUXE 1TWYA 3IOUA 3CSBA 5ITPA 1MQHA 3ZSFA 1DPEA 1Y3PA 4F1VA 1SYIA 1Y9UA 3TMGA 4ELQA 2PBWA 3K02A 3LC8A 2O68A 3T22A 3OO8A 3G7WA 1OIBA 5CC2A 4BDNA 2OJTA 1I69A 3HN0A 2HZKA 3PUYE 3V83A 2Q9TA 3E3KA 3N26A 4XTCQ 4NF5B 2FYIA 4LATA 3SEXA 1B52A 5TP9B 4JSDA 3U93A 5BWJA 5ELVA 3OO6A 1B05A 1B1XA 1M5EA 2V3UA 3PMVA 3B7DA 3IL1B 1FQCA 1H76A 4HTGA 4QFNA 3I5OA 5I56B 2HAUA 4PFTA 1JEVA 3LSLA 2I58A 4G77A 5I2NB 5ICTA 3MVZA 2PT1A 5CI5A 3S4UA 4N13A 3MAMA 4BDRA 4F2OA 4QSDA 3VV5A 4YMBA 3PUVE 2QS3A 1AMFA 5AE4A 5AA2D 4ZEDA 3T66A 2QS1A 2O1LA 3FZVA 1US4A 1P1OA 3OOAA 4OETA 3S9EA 2IEEA 3B6TA 3WAEA 4FEDA 4F1UA 3HCQA 2XXXA 3TTKA 3K6WA 3KN3A 3OD7A 4EF1A 3DELB 3KSXA 4F3PA 1NFTA 1LFHA 2THIA 3DP4A 4EQBA 4HW8A 2V3QA 2F35A 4QFPA 5HM4B 2QMXA 3O28A 2Z8FA 2OLBA 1HSJA 1L5TA 4LA9A 4C1TA 1A8FA 3K6VA 1A8EA 3V5AA 2D3IA 3TTNA 3FXRA 1I6AA 1MG1A 5H8HB 2YPNA 4XXUA 2UVGA 5CMBA 3USDA 2QJEA 4R2BA 4NF4B 3C31A 2OWTA 4G68C 3TEPA 4PFWA 3FVGA 2Y7WA 1GGGA 1H3DA 3C35A 3EHSA 1JNFA 4NF5A 1FTKA 4IO3A 1LAGE 3IO4A 5TP9A 3QUJA 1QKAA 4U21A 3MQ9A 2F34A 3FASA 3ECRA 4F19A 3SERA 1FTOA 3H7MA 2OBGA 3TCGA 4PQJA 1Y4TA 4ZEIA 4IY5A 1FQAA 4JWYA 1R9LA 3OSRA 5I56A 3H03A 3SETA 1JW5A 1TFDA 5I2NA 4ZEKA 4ZZEA 2DVZA 3VXCA 3W9VA 3FGSA 1OQGA 4MBPA 4DLDA 2DE3A 2DWAA 1PB7A 1YAEA 5K2YA 3GBAA 1GVCA 3KSJA 4KD5A 2ZYMA 5H8QB 1MQJA 3GZGA 3D4CA 4KFQA 2ZYKA 4I8CA 4HCWA 4QFKA 5AA2B 1S7YA 3JV9A 2H4IA 5EYFA 3BFUA 2DWIA 3O29A 2H9BA 3VVFA 3G3FA 3TAJA 1ZTYA 1MRPA 3T9HB 1LCTA 5DVIA 1LB9A 1S9TA 4H6DA 1N7WA 3F11A 3PMXA 5DT6A 4Q8RA 2ABHA 4BLAA 4EDPA 5AA1A 3SEUA 4DCYA 4ND9A 2UVIA 4OQOA 2Y7IA 2HZLA 1EZOA 4LZ8A 1F9BA 4OESA 3H6UA 5AA3A 5H8HA 1IZ1A 4R6KA 1MY2A 3IJXB 2OZZA 3EF7A 4NF4A 4X9TA 4MLVA 4RPOA 2ZYNA 4RK2A 1SD3A 2VGQA 4PE5B 2I49A 3R26A 4YAHX 1MDP1 1MPDA 1URSA 3U92A 3MP6A 1DTZA 2UYFA 4OEUA 5H8FB 3MVXA 3E13X 1SI1A 3PUWE 3K0VA 1B32A 1OMPA 1OVBA 3FVNA 1B7UA 2GH9A 4LQ2A 2XXIA 5HPQA 5FHMA 1XT8A 1B4ZA 3KJ7A 2ZYOA 2Q2CA 3D4GA 3M3FA 4ZE8A 1RKMA 3P7IA 1N0TA 2Z22A 1SW4A 3TELA 3H6TA 3FVKA 1MXXA 2REGA 5DEXB 3VXBA 1IEJA 4G68B 1R6ZA 1TXFA 5H8QA 5JK4A 4R75A 4BDLA 2E0SA 4QFLA 5AA2A 1SW2A 1Z7NE 4AB6A 1MH3A 4KCCA 2XHDA 1LFGA 1TFAA 3C9HA 4F2QA 3QSLA 1NL5A 5BUUA 4Q0CA 1DSNA 3FATA 2D21A 2VHAA 2F6GA 5A5XB 3IOWA 1LFIA 3RNNA 2CZLA 1UIUA 1HSEA 3FD3A 2Y84A 4R6HA 1QKBA 4IO4A 5CRYA 4P11A 1AL3A 3EQ1A 1N84A 3VE1B 2ZNTA 4IO6A 3ILUB 2X7PA 5JEIA 5LOMA 1ZIUA 1LBBA 2HFBA 3R7XA 1URDA 2F97A 2R6GE 1DMBA 2VP1A 4NF8B 5DTBA 4U1OA 1B1HA 1MPBA 2F8DA 3SDFA 1BKAA 5F1QA 4M4GA 1AH5A 2FA7A 4Q30B 2DOJA 1DTGA 4GL8A 1QUJA 2NWJA 5H8FA 2DSFA 1NKXA 1TT1A 4DCXA 2GRVA 4QSCA 3K4UA 2OCUA 2P2AA 2XXVA 5H8NB 1J1NA 3LR1A 4IB2A 3DP8A 4ZE9A 3MPKA 4BDMA 5TU0A 2IA4A 3O97A 1N04A 1SW1A 2XXUA 1LAFE 3FJMA 5DEXA 4QFOA 4FECA 1Q1KA 4OWDA 1II5A 4RA1A 4G68A 1B4HA 2HQ0A 2M8CA 4H8IA 4X48A 1GTKA 3PPOA 2DP8A 2Z23A 4ZDMA 3RTWB 1FW0A 3UN6A 3SEYA 2PYYA 2O84X 1QW0A 3G3IA 2XXPA 1IQ7A 2V3TA 2DYXA 1NNKA 2F36A 5CMCA 5A5XA 4QF9A 1XVXA 2DE4A 1IIWA 3FJ7A 4GLIA 3MWBA 4YKPA 4HS7A 4I9DA 3PMWA 1R9QA 2VD2A 2H98A 3FJGA 1Y4CA 1ZJLA 5IAIA 1P1UA 1Z7ME 1D3KA 3H4ZA 3T9XB 2P1SA 1UTBB 4NF8A 1MQDA 1FQEA 2DXRA 4GXSB 1JVYA 4NWDA 3CFLA 4U22A 1FTJA 1HSLA 3QAXA 3OENA 4DXCA 2RINA 4DZ1A 2XX7A 5CM6A 3V89B 4F29A 2XXTA 1B3FA 5H8NA 4Z0IA 1LGBC 3PGFA 5L9SA 4O3BA 1NH7A 2ONKE 2V84A 3KZGA 4KQPA 2XXYA 2Y7RA 4GQOA 1O64A 2XX8A 2XX9A 4EUOA 3KG2A 1MXUA 1MS7A 5F7VA 3ILTB 3PU5A 2XXQA 2RF1A 3CFZA 2PT2A 2CMOA 4G2ZA 5JTYB 1VR5A 4OHNA 1NNTA 1PEBA 3RLFE 5H8SA 3C32A 5CMMA 3ZKKA 1NNFA 3SESA 2Z8DA 2ZMBA 1A55A 2AL5A 4ZZAA 3THIA 3MBPA 1H44A 3IO6A 3PD8A 3TPAA 1MY1A 4RPNA 1SW5A 1FTLA 1SYHA 2I3VA 4Q5TA 4JWOA 4EXKA 1O63A 3HHGA 3KOSA 2WKYA 4YB5A 4OENA 3LSWA 1P1WA 4YKKA 3VLUA 4GXAA 1N3WA 2R9JA 2OWSA 1B5HA 1MQIA 4H1XA 3CVGA 1UTBA 2F5XA 2Q2AA 1B5IA 3EPEA 5CBSA 5EHSA 1A99A 3RT6B 4WXJA 2F7CA 5I58B 4F18A 3FVOA 4GOTA 4ZECA 4U1ZA 2NOOA 3CIJA 3LSFB 3QYTA 4EQ9A 2H25A 1Y3QA 3K00A 4U4XA 1NMUA 3S9NC 3S2VA 3IOVA 1FCKA 2ONRA 3K1MA 3ODBA 3GXAA 4X1BA 2DE2A 1VFDA 3DLNA 1CE2A 1D4NA 2ALUA 3OELA 1XHYA 4GVOA 4TLLB 1MXWA 4WKMA 4LQ5A 3GLBA 2Y7KA 1MY0A 1MH4A 4XKPA 2X26A 2GHBA 3PPRA 3TODA 1FQFA 3QUFA 2R71A 3IB1A 2REJA 3IK6B 1MM6A 1QUIA 3FXUA 1WDNA 3Q29A 1ATGA 3TTRA 4NTLA 4YICA 5JTYA 2QSXA 3PD9A 2B3BA 4GF8A 3RQTA 1MY4A 1JETA 3TCHA 2ZNSA 2HCAA 3R6UA 4IO2A 2V93A 4QHQA 4OERA 5K2XA 3K01A 1MM7A 2QPQA 4YZZA 2DWHA 3MJNA 1SQYA 4P0GA 1B3HA 4NF6B 4M1VA 2AIXA 4FATA 1FQBA 1EZPA 2ONSA 2DS9A 3A3CA 2YJPA 4PFUA 3UP9A 4NWCA 3TTMA 2GFEA 3TZAA 5KDTB 3SEVA 3U8QA 4KCDA 3UIFA 4LZ5A 1B7HA 2DVCA 1IUDA 4DDDA 3K1NA 1PDAA 2LAOA 2XXRA 5CMKA 4C1UA 4F39A 5ISUA 1R1NA 1IXHA 3MUQA 3FV1A 4IO5A 1POY1 5I58A 1H43A 4DIGA 3Q26A 1PBQA 2DXYA 1ZKBA 4LZ7A 4GL0A 1FTMA 5M2VA 2QS4A 5I59B 1PBPA 3OMBA 1VSOA 2B3FA 1PB8A 4U2RA 5TPAB 1ZBMA 2O69A 1Q35A 4G8NA 3OEMA 4OFOA 3I3VA 2O6AA 3PPNA 4C0RA 3FXQA 4FEBA 4TQUQ 4LONB 1LLSA 2OK2A 4DE8A 1RYXA 4FJPA 1ZMGA 3IR1A 1D9VA 3O6GA 2H99A 3M8UA 4U23A 2VOZA 3K1PA 1B3LA 3E9XA 3O6HA 1T0KA 3C36A 2ZXTA 4KYEA 3LUYA 1LB8A 4XKQA 4JB7A 2ZNUA 4XKRA 3ZS6A 1B6HA 2UYEA 4R74A 1M5DA 2Q89A 3TQWA 4KYSA 1EH3A 3KJTA 1LSTA 4U4SA 1BIYA 4ISUA 4QRZA 4NF6A 1IXGA 4XKNA 5B7DA 1DPPA 2G93A 1YCJA 3PV0E 2RC7A 5KDTA 4RNSA 3VLVA 4GIZA 3O66A 1MXVA 3BBRA 3CR9A 4ELOA 3RUMA 5J1DA 3MP1A 1VE4A 2X7QA 4Z7EA 3LSXA 3MZ9A 2W7YA 4O3CA 4YKIA 3OSQA 3MW0A 4TOZA 1WODA 1SDXA 4JXIA 1OQHA 1B0HA 3L6HA 4N6PA 5I59A 4JDFA 3JYRA 5TPAA 3IOTA 3RY3A 1UTHB 3FUZA 1D9YA 4GFRA 1SVXB 1MXYA 3PPPA 4ESWA 1Y3NA 4ONYA 1QULA 3TCFA 1NH8A 4GWOA 3OXNA 3TKDA 3KN8A 4ZS9A 1B46A 1QJMA 1MQGA 2O7IA 4E0XA 4H8JA 2RC8A 4JBZA 4H0WA 2YLNA 3W15C 3CI8A 3UGWA 4PFYA 1MXZA 4IGTA 3E4RA 3H06B 2GHAA 4WEDA 2A5TB 2F7AA 2RCAA 1XC1A 5ICQA 2O1MA 3IB2A 1N76A 4POXA 1US5A 5L8DA 3TTLA 4H5FA 4L17A 2ESNA 3IAZA 2AYSA 1SBPA 4OVJA 3BFTA 1RYOA 3G3JA 3JZJA 1M5BA 4H67A 4OFJA 1WVJA 4UA8A 5I2KB 4I62A 4EXLA 1N3XA 4UACA 3B6QA 2FNCA 3KN7A 3MP8A 3G3KA 4YB6A 1B58A 1Y20A 1I6QA 3QK6A 1BTJA 2I0BA 4JWXA 5B70A 3K6XA 3O9PA 2XD2A 3IX1A 2E1SA 2O7UA 3N6TA 3VLWA 4X1DA 1CB6A 3AXFA 3T96B 1IXCA 3TUSA 3M3KA 1UTHA 4LUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RKMA 1DOTA 3EKIA 3H3GA 3DP6A 3MZBA 3RTFB 3HHFA 3CRBA 4IGRA 4RJZA 3N94A 3N5LA 4BDQA 3HO7A 4RY1A 1DCUA 1JQFA 5FHOA 3CG3A 3TDJA 3Q27A 1JVXA 1Q9DA 4DXUA 4HE0A 4IY6A 1UIVA 3QXMA 4OYVA 2I0CA 1IXIA 1I6BA 3TQLA 3C34A 1BP5A 3ONMA 1NV6A 5KCJB 3RPWA 3MVYA 4ECFA 2A5TA 4QXDA 2BJJX 1B0LA 4K3FA 3CG1A 1XOCA 4G8HA 1FJ9A 4DI4B 2XXWA 4MNPA 1FBCA 5I57B 3DM0A 1OLAA 4PDHA 1FPFA 3MSTA 5IKBA 5L9OA 5DVJA 4NQ8A 3B6WA 3V8XB 4AQ4A 2HEUA 4KR5A 1P1QA 2I4CA 2VD3A 1JEUA 3EHUA 3Q28A 3EHTA 3MVWA 1IITA 4BDOA 4E0WA 3KEIA 5I2KA 5DYHA 2FHYA 3H6VA 1FQDA 3C4MA 4YB7A 2NUVA 4F31B 4ZEBA 1KWHA 5I7IA 2UVHA 4AB5A 3OO7A 4POWA 3KBRA 4P0IA 1LAXA 5IZ3B 4O7MA 1YZ0A 1LBVA 1A54A 3QIMA 1OLCA 1P99A 2Y5KA 5FHNA 2B4LA 2XXHA 4MCOA 4PTKA 2HXWA 2NXOA 2P0SA 4KPTA 1NV7A 2NVUB 1FBDA 2P3VA 4XIGQ 1ZU0A 3FV2A 2MKZA 4O3AA 1VFEA 4NMYA 4OZ9A 4GRKA 1GR2A 4F3SA 2H5YA 4PBQA 4MH5A 3OO9A 4F3GA 4RXLA 3M3LA 1Y1MA 3A29A 2I3WA 4R9FA 5L9MA 4R72A 4PP0A 1LBCA 4ELRA 2DQVA 4I1DA 3UORA 4JSOA 2F78A 3IJOB 1MY3A 1NNPA 1FPGA 1QVSA 5KCJA 2PX1A 3VFJA 4ZEFA 3G3HA 4YU0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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