4U4SA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam25 at 1.90 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
256
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Positive Allosteric Modulators of 2-Amino-3-(3-hydroxy-5-methylisoxazol-4-yl)propionic Acid Receptors Belonging to 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-pyridothiadiazine Dioxides and Diversely Chloro-Substituted 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 256
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4u4sA02
1SYHA 5AA4A 4QSEA 1Z7ME 4F22A 4QFNA 4YB5A 3O97A 1JW4A 2AYSA 1AOVA 1NH7A 3H4ZA 3HHGA 4FAJA 3SERA 1Y4CA 1N84A 4YU0A 2HFBA 4JDFA 2Y7RA 4FATA 1DTZA 3PPRA 4XTCQ 3R6UA 1BLFA 5CMKA 4DXCA 5ITPA 5K2XA 3DLNA 4NF4A 4PE5B 3U1OA 1S7YA 1Y3NA 3GZGA 1ZMGA 3OOAA 3UK4A 5JK4A 5FHOA 2Y84A 4G8HA 3QUJA 1N0TA 2DE3A 4PFTA 3R26A 3MVZA 4MLVA 1URGA 4IB2A 3E13X 4NF5B 1M5FA 1GGGA 3IB0A 5I2NB 1PC3A 1URSA 5TP9B 3IOTA 4NTLA 4GXAA 3KZGA 3HN0A 4ZZEA 4H1XA 4GD5A 2RF1A 4NEDA 3H6WA 3TYHA 4P11A 3SEYA 3CI8A 5DEXA 3G3KA 2R71A 2RINA 3C31A 3IB1A 4K3FA 3MUQA 4HW8A 2NXOA 3K02A 4RK9A 1MM6A 2F6GA 1I69A 3IX1A 4H5GA 4YICA 1WVJA 2Z23A 4LQ5A 5ELVA 3FVGA 1B51A 1URDA 3IO4A 4LA9A 3A3UA 2Z8DA 3KG2A 3OD7A 1TWYA 3VVDA 3M3LA 4ZECA 4G8MA 2Q9TA 5H8FB 5DT6A 4AB6A 3EHSA 2QMWA 4OEUA 1D9VA 4MBPA 4NF6B 1FTJA 5I59B 3RY3A 2GHAA 1ELJA 5TPAB 2X7QA 4F3PA 4GVOA 4ZE9A 3TKDA 1IXGA 1F9BA 4LZ7A 2H9BA 1QUIA 4ESXA 4PFYA 2OWTA 2F97A 5KCJA 1D4NA 1SYIA 1QJMA 3VVFA 2THIA 3QIMA 1N3WA 3DP4A 4U1OA 5TU0A 4BDMA 1MQHA 1NKXA 4GQOA 3O6GA 4ZE8A 4OZ9A 3FVNA 3T9VA 4RK2A 2UYEA 4EUOA 5HPQA 4KR5A 5KDTA 1NNTA 3LSWA 1RKMA 4X9TA 2BJJX 4IO3A 2H4IA 2P2AA 4F1YA 1YPNA 3JV9A 2I4CA 1P1OA 4UA8A 2ZNUA 4YKIA 1B46A 2W7YA 1MDQA 4EQ9A 3TTLA 5DVIA 4ZEIA 3T9HB 5AA2B 3PD8A 3PMWA 4KCCA 3L6HA 4UACA 3FASA 1NMUA 1PBPA 4JXIA 1B3FA 5H8NB 3FVOA 4KI0E 4ZEKA 4I8CA 3VLWA 5A5XA 3OSQA 1LAXA 3G3FA 4F2QA 2NUVA 2OK2A 1B40A 4M4GA 2O7IA 2FNCA 2A5TB 3OO6A 3IORA 3IOWA 3FXUA 4R75A 1SW4A 3SEUA 4I9DA 1XT8A 1B3HA 4AB5A 1OQGA 2OCUA 1N7XA 3V5AA 1HSLA 2X7PA 1RYXA 1RYOA 5I2KA 5CBRA 2QJEA 4I1DA 2UVJA 4GWOA 4YKKA 1US4A 2ZNTA 2R9JA 3K6UA 4OHNA 4XKPA 5JEIA 2O7UA 3CRBA 2G93A 4F3GA 2NWJA 3RTWB 4OVJA 4GRKA 2I49A 1FQCA 3IJOB 1QVSA 2P0SA 4RNSA 5H8HB 3T93B 5AE4A 3C4MA 1P1UA 4BDRA 3U92A 2NVUB 3K1PA 3O2AA 3OXNA 2UVHA 5I57B 5FTIA 3TQWA 3LSLA 4THIA 4QSCA 2Q89A 1EZOA 3U94A 3S4UA 1MY1A 3THIA 4F1UA 4Q30B 1DPPA 4O3AA 1DSNA 1M5EA 2HCAA 5CRYA 1XVYA 3B6QA 4LZ8A 1BKAA 4YZZA 1MXZA 3CIJA 4NMYA 5DYHA 3TCGA 5BWJA 1LFHA 1BTJA 1EU8A 2GHBA 1B1HA 1O7TA 4FORA 3LR1A 2B65A 1P1WA 3T9XB 4X48A 1QUKA 1GV8A 3SESA 1OIBA 1TT1A 5IKBA 1MPCA 1ZBMA 3CSGA 2O1LA 2AL4A 1B5IA 1AH5A 1LBCA 4R6YA 2LAOA 4X1DA 2E1SA 1USYH 2RCAA 3TTNA 4QFOA 2AL5A 3G3GA 3MBPA 4KFQA 1YAEA 3S9MC 3E3KA 1VSOA 1MRPA 1GVCA 5L8DA 3QXMA 4R74A 5JTYA 4U4SA 5CMBA 4ISUA 1MY0A 3PUXE 1FTLA 3VDFA 1LB8A 3MPLA 5BUUA 4NE4A 2Y7WA 4HCYA 3SETA 2PX1A 3V89B 1B3LA 4KPTA 3CFZA 3U72A 3JZJA 3RN8A 2DWJA 3UP9A 3KOTA 3CR9A 3DELB 1ZJLA 2D5WA 1UTBB 3MW0A 2HZKA 4C1TA 2OZZA 4GL0A 4R6KA 2HEUA 1XHYA 4NF8A 3PUWE 3PMVA 3MZ1A 3A3CA 4Z0IA 4FE8A 2QS3A 4EXLA 1OLAA 3FXRA 5M2VA 5ICQA 2O1MA 2FYIA 2DXRA 3O66A 5F7VA 3TDJA 2UYFA 4GF8A 4U4XA 2QPQA 5AA3A 4E0WA 2XD2A 5DVFA 1OMPA 4U22A 3MP6A 2O68A 3KN7A 3SEXA 1LBBA 1A55A 4RJZA 3TTKA 1IITA 3CG1A 1XS5A 4QFLA 1FCKA 1VFEA 2Q2CA 3FV2A 3E9XA 2D3IA 2XX8A 3QYTA 3K2DA 1WDNA 1GTKA 1IXHA 5I56B 3TUSA 4U2RA 5CMCA 3HSTA 4YKJA 2QSXA 1JEUA 4H65A 4F1VA 3FXQA 3KSXA 5CC2A 4IGTA 3KN3A 1PB7A 3PPQA 3PUYE 3PUVE 3OELA 1POTA 1B0HA 3CFLA 3T9UA 1I6QA 1OLCA 3MP8A 3MVXA 1SDXA 4OEVA 4IY6A 4FECA 2ZYMA 1LCFA 1B3EA 5I84A 4JWXA 4IO7A 3IJXB 2F8DA 4TQUQ 5IAIA 3DP6A 4N6PA 3H3GA 2XX7A 3BKIB 3EPEA 3G3IA 2XX9A 1B6HA 2I48A 5K2YA 2F36A 3TELA 1LGBC 1B5JA 1B7HA 3T22A 4IGRA 3PUZE 4EQ7A 1JETA 3N94A 1MPDA 2XXIA 2DS9A 3FV1A 4P0IA 4GL8A 4LONB 1NNKA 4XKQA 4NF8B 3S9NC 4JSDA 1CE2A 1II5A 2H5YA 5AA4B 1AL3A 2OWSA 4POWA 1B7UA 3ILTB 4MH5A 1UTHA 3SEWA 1N7WA 3MVWA 3TTMA 3K1MA 4XXUA 4PQJA 2IA4A 4MFIA 5EHSA 2ZYOA 5CI5A 5FHNA 2PVUA 4DXUA 4GXSB 4NF4B 4OFLA 5L9OA 4F18A 3SDFA 4F19A 1UIUA 2F34A 3N6UA 3KEIA 1IUDA 1S9TA 1Y4TA 1MPBA 2XXHA 2WKYA 5I58A 1OVBA 3EF7A 5DTBA 3EQ1A 3MVYA 3Q27A 3PMXA 4LVQA 1ZIUA 4ECFA 4XIGQ 1ZTYA 3K4UA 3H6UA 5H8QA 4H0WA 4KYEA 2DE2A 1NL5A 1Q35A 2ALUA 2I0BA 1LCTA 5AA1A 2I4BA 2O51A 3B6TA 5L9SA 2B3BA 3HV1A 4R72A 4DDDA 4HCWA 3UIFA 2PT1A 3ONMA 4ESWA 2I6EA 4ELOA 5B7DA 4WEDA 4ELRA 4P0GA 1Z7NE 5DEXB 2VOZA 4O3BA 4YKPA 1FQBA 3FIRA 3KSJA 1MXXA 4PETA 1FTMA 4JSOA 3U93A 1JW1A 3KJ7A 2ZYNA 4OESA 3ODBA 3WAEA 3KN8A 4DZ1A 2XXUA 2REGA 2XXXA 4OTEA 4Q8RA 3EHUA 1MH4A 1GR2A 1MY2A 4JBZA 3AXFA 2OJTA 3RGYA 2ABHA 3OO7A 2R6GE 3V83A 3S9EA 1NNFA 4N13A 1MQIA 1NFTA 5J1DA 2PMSA 3S2VA 1IIWA 4Q0CA 1EZPA 4C1UA 2VHAA 1PBQA 1R9LA 1LAHE 2Z8EA 1UQWA 4IO2A 2DE4A 3MAMA 3K01A 5KCJB 1D9YA 1SVXB 1Y3QA 3PD9A 2AIXA 4C0RA 3VXBA 1P99A 4OYVA 3H03A 1ANFA 3N26A 4N07A 1LLSA 3JYRA 3K0VA 2VP1A 4YMAA 4ZEDA 4DLDA 2V93A 3KOSA 5KDTB 1Q1KA 5I58B 3EHTA 3W9WA 3PU5A 4YAHX 3PV0E 2UXAA 3TZAA 4NWDA 4OQOA 2DSFA 1DTGA 2E0SA 3S9LC 3N5LA 1B58A 4LZ5A 2F7BA 1LAFE 4NWCA 2Z22A 2Y7PA 4G68A 3GBAA 3FJMA 2VGQA 4DE8A 5H8SA 4G8NA 2XXVA 4G68C 3T96B 2PT2A 1N76A 3BFUA 2XHDA 1FQFA 3LSFB 1LSTA 1MXUA 1SQYA 4OFJA 4FEDA 3PPNA 5A5XB 3HCQA 2UVGA 1Y3PA 1A8FA 1Y20A 3MWBA 4DXBA 3QAXA 4F3SA 4AQ4A 1MQGA 3ZKLA 1YTVA 1B4ZA 1H44A 4KHZE 1MQDA 3OEKA 5I2KB 3H6TA 3TODA 4QFPA 1B4HA 3RQTA 1JQFA 1WODA 3L6GA 1FTKA 4QFKA 1D3KA 1A7LA 1MY4A 2XXRA 3KFMA 3Q25A 5TP9A 4FJPA 4OMBA 2ANJA 2GRVA 1MXYA 4KYSA 3USDA 4KD5A 1ZLQA 3K1NA 2UVIA 4QSDA 4RYAA 3HO7A 1B3GA 2XD3A 4H67A 1J1NA 2QRYA 2IEEA 1H3DA 4OXVA 1EH3A 1B9JA 1B1XA 1TFAA 4ELPA 2PBWA 3U8QA 4H8JA 3P7IA 4G4PA 3GBBA 3RUMA 1FW0A 3FJ7A 2GFEA 3RPWA 4H6DA 3VV5A 1AIVA 3C33A 2PYYA 2QS1A 4OENA 4HTGA 5H8FA 3ECRA 2RC9A 1SW1A 3VXCA 4ZS9A 2DWHA 4RY1A 4BDQA 3FGSA 5I59A 1S50A 3VLUA 1R6ZA 3RT8A 1TFDA 5TPAA 1N3XA 4XKNA 3C32A 1ATGA 4WKMA 4L17A 1HSJA 3D4CA 2ONKE 1IQ7A 3UN6A 1UIVA 4MF3A 4U21A 1M5CA 3BFTA 3OO8A 2QS4A 1MXVA 3DP8A 2DVCA 1BP5A 5KZTA 1JW5A 3ZSFA 1FQDA 1A54A 4IO6A 3O28A 4KYDA 2RKMA 3VE1B 1XOCA 3VVEA 1BIYA 1JNFA 3LUYA 4OERA 5FTHA 4LUBA 3KBRA 3R7XA 3IL1B 3W9VA 1OQHA 1H45A 4TLMB 4BDNA 1P1QA 3O9PA 5CM6A 3QK6A 1MH3A 3UGWA 1DOTA 5CMMA 3IO6A 1A8EA 3RLFE 5ISUA 4ND9A 2V84A 1VFDA 2F7CA 5JTYB 4YMBA 1DPEA 3G7WA 2F6PA 2RCBA 1MM7A 4LATA 5CBSA 5AA2A 4DIGA 3H6VA 3MP1A 5HM4B 2O84X 2Q88A 5H8NA 1QKBA 3B7DA 3C35A 3RT6B 4RPOA 3Q29A 2V3QA 2F35A 4QRZA 1B52A 3O6IA 4GLIA 1US5A 4U23A 3VLVA 4R9GA 2A5TA 5F1QA 1O64A 1B7ZA 1KWHA 4KCDA 2YJPA 2I0CA 3MPKA 5FHMA 4O3CA 3G3HA 4EF1A 3CSBA 1FQEA 1FTOA 3KJTA 2CMOA 1TXFA 4YB7A 1B5HA 2VD3A 2F5XA 2X26A 4PFWA 3MC2A 4R2FA 4ZDMA 4BDOA 3CG3A 1M5DA 3DM0A 2H98A 2YLNA 1QULA 2HQ0A 2GH9A 2CZLA 1AMFA 1IEJA 4RPNA 5H8HA 4TLLB 3PGFA 2DOJA 3HHFA 1NNPA 4R9FA 2F78A 4M1VA 3I5OA 4EF2A 2HAUA 2F7AA 2I58A 3MZBA 2V3TA 3M3KA 1B2HA 5I57A 4ONYA 4ZEBA 3OEMA 2A5SA 3TQLA 4JWOA 1QUJA 3ZS6A 4E0XA 1MS7A 1IXIA 3C9HA 1JVXA 2DWIA 3H7MA 4F39A 3RTFB 3PPOA 3IOUA 1A99A 1ZKBA 1IZ1A 1USYE 2DXYA 3IR1A 4R6HA 3D4GA 1ZU0A 5DVJA 1QKAA 2QMXA 2YPNA 2QL3A 1H76A 1VR5A 3W15C 2H99A 4XKRA 1A40A 3T66A 2HZLA 3IB2A 4U1ZA 3K6XA 1O63A 1NH8A 4DCYA 4YB6A 1VE4A 1MXWA 4IO4A 2ONRA 2HAVA 4JB7A 3KGCA 4QHQA 3K00A 1PB8A 4EDPA 2Q2AA 3OMBA 4G77A 3E4RA 3TTRA 3ZKKA 2O6AA 3VFJA 2XXYA 3G3JA 1R9QA 1UTHB 4Z7EA 4LQ2A 4H8IA 3TEPA 1IXCA 4F29A 4F2OA 1LFIA 4R2BA 2DP8A 1JEVA 2VD2A 2DYXA 3CVGA 4QF9A 3PPPA 4I62A 2ESNA 2XXTA 1FQAA 1MQJA 1PB9A 4KQPA 4GFRA 3IAZA 3TCHA 3C36A 4FIMA 3I3VA 4WEPA 3A09A 1LAGE 1LFGA 1Y1ZA 2D21A 5EYFA 4ZZAA 2DWAA 1L5TA 1SW2A 3O29A 3MJNA 3TAJA 4POXA 3FUZA 3ILUB 4WXJA 5H8QB 3FD3A 3LBSA 3RNNA 4EXKA 3H06B 3O6HA 1UTBA 2B3FA 4BLAA 4OFOA 4F3BA 3BBRA 2I3VA 1MDP1 3MZ9A 1SI0A 3FVKA 3UORA 4LP2B 3GLBA 5AA2D 2ZYKA 2Q8JA 2HXWA 5HBCA 1QW0A 1B05A 3K6VA 3TCFA 2Y7KA 2FA7A 4TOZA 3I6VA 4G2ZA 1LB9A 1HSEA 3LSXA 2V25A 1B0LA 3SEVA 5ICTA 2Y7IA 3QUFA 4R73A 1I6AA 2XXQA 1P1NA 1SBPA 2DQVA 1H43A 4RA1A 1EZ9A 3LC8A 3CFXA 1YCJA 3EN3A 3Q28A 3MQ9A 2I3WA 3N6TA 1XVXA 3OSRA 4MLQA 2P1SA 1N04A 4OWDA 2XXPA 1CB6A 3TMGA 3K6WA 3GXAA 4JWYA 2H25A 1PDAA 5I56A 5ITOA 4DCXA 2KLFA 4X1BA 4NF5A 2NOOA 2Z8FA 3F11A 1MG1A 5I2NA 1OVTA 1DMBA 3SKPA 3UA8A 1POY1 5B70A 2ONSA 2REJA 4EQBA 3V8XB 5EHMA 1I6BA 4Q5TA 4PP0A 2RC7A 1SD3A 3FJGA 3IOVA 4ELQA 2OLBA 1Y9UA 3Q26A 4H5FA 3TFLA 3WAFA 3TPAA 4OETA 4HS7A 5L9MA 4BDLA 1JVYA 4GIZA 4GOTA 3M3FA 1R1NA 2QS2A 1B32A 3HPIA 1PEBA 3FZVA 4IO5A 2O69A 1SW5A 2OBGA 1SI1A 3OO9A 2ZMBA 1T0KA 3C34A 2V3UA 4IY5A 2RC8A 4PFUA 3M8UA 3B6WA 4F31B 4G68B 1XC1A 1MY3A 2M8CA 3IK6B 4FEBA 2G29A 2XXWA 3FATA 5LOMA 2DVZA 2ZNSA 2ZXTA 3QSLA 1M5BA 4NF6A 3OENA 4ZEFA 4RXLA 1Y1MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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