4U6RA

Crystal structure of human ire1 cytoplasmic domains in complex with a sulfonamide inhibitor.
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
403
structure length
403
Chain Sequence
TSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKRILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAHLGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAVGRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGTLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPYYFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Unfolded Protein Response in Cancer: IRE1 alpha Inhibition by Selective Kinase Ligands Does Not Impair Tumor Cell Viability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 123
structure length 403
sequence length 403
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF06479 Ribonuc_2-5A Ribonuclease 2-5A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4u6rA02
1.20.1440.180 Mainly Alpha Up-down Bundle de novo design (two linked rop proteins) de novo design (two linked rop proteins) 4u6rA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4u6rA01
3PA5A 3GU4A 3QC9A 3SLSA 4RC3A 2VTHA 3ZTXA 3LAUA 2X1NA 2PE1A 2W9FB 3W33A 3UYSA 4F63A 3QRTA 4MD9E 1NVSA 3AC1A 5AP1A 1MQBA 5E1EA 5CXZA 1F3MC 4A9SA 4CMTA 3BV2A 4O7TA 4B99A 3QRIA 1IAJA 3G2FA 4M67A 4NIFA 3HZTA 4EHZA 3MTLA 3AC3A 4BHNA 3OT8A 2OICA 4DEDA 2DS1A 3VBXA 2YDKA 1PYEA 4PQNA 4Z16A 3B8RA 4IZAA 3RMFA 3C0IA 4D4RA 2CHLA 4O7ZA 3KEXA 3TKHA 5D9HA 1MUOA 5KZ0A 2UW3A 4NM3A 5IEXA 1KV2A 4HYUA 4WSQA 5CS6A 4EOKA 5I9XA 5EOLA 2A1AB 4IANA 4E3CA 4WNOA 4RJ5A 4V01A 3QF9A 1WVYA 5BUEA 4PTCA 3F7WA 2O64A 3FZTA 4YLJA 3PP1A 5AR2A 5L3AA 3KA0A 1JBPE 2G2IA 3ORPA 4LUEA 2C30A 2BIKB 4X3FB 2P2HA 3SXSA 1R1WA 3ULZA 2I0YA 3RWPA 3QD4A 2H8HA 4I93A 4YJTA 5GIOE 3F2NA 4QYYA 1ZOGA 5JT2A 4O0VA 5GZAA 4FTOA 4ZOGA 3VC4A 1UU3A 3WBLA 4FKGA 1H8FA 3OOGA 3GBZA 3DJ7A 3R1SA 1DAYA 5CNOA 4PDOA 4F9YA 1SNXA 4RT7A 3DLZA 5HORA 3TIYA 2ETMA 4XV2A 3DGKA 4HGTA 2VWXA 3AT4A 4AT3A 3HAVA 5J9ZA 3EQIA 4FICA 4GUEA 4YSJA 3DXQA 4YZNA 1XBCA 3S4QA 4YO6A 3NUNA 3BGZA 3BHYA 2C4GA 4WG5A 1R78A 3I6WA 2OW3A 3OZ6A 4AP7A 4BCPA 3UZRA 4ZLOA 3POOA 4Y95A 2G9XA 1PHKA 4WNMA 4CQEA 4DFYA 3U6IA 3LZBA 4AOTA 5EM8A 1W7HA 2VWIA 2A19B 3QFVA 5ETCA 1FMOE 3NGAA 5HG9A 4M97A 4YP8A 4X6QC 5DRDA 4L7SA 3SD0A 3VS6A 5E91A 1U4DA 3U55A 4HZSA 1LUFA 4IWDA 4N6ZA 5J1VA 4GT5A 3GP0A 3CD8A 3WF7A 4FI1A 4BIEA 4OT6A 3K54A 4XMOA 5E9EA 3D4QA 2H34A 4L45A 2JIVA 1QPJA 4E8AA 3PWYA 4WHZA 4FSNA 5M4IA 2OZAB 2R3LA 4TYEA 5HVKA 2F7ZE 3GUBA 4UMTA 5DI1A 2WKMA 4N0SA 3CTHA 4O0XA 3R1QA 4M68A 4YU2A 3IDCA 2O0UA 5H8GA 3ATSA 3MFSA 3FLWA 3TZ7A 4JL9A 3GFWA 4XS2A 3JXWA 5IUHA 1SVGA 3O7LD 4D2PA 4O38A 2FSLX 2VTLA 2OU7A 1WBPA 3POZA 3QUPA 4I5CA 5CVGA 3ZC6A 2GS6A 2X39A 5FTQA 3UIMA 4KIPA 3VVHA 3KXMA 4DFBA 2RIOA 3GCVA 4IACA 4U40A 3PVUA 4BVUA 3TNIA 3VS5A 5HTBA 4QMQA 5HTIA 5M07A 2YZAA 2ERKA 4MNEA 4PY1A 4IMYA 4CYJA 3ENMA 5TO8A 5IQDA 5KX8A 2F49A 3NNVA 4WNKA 3UOHA 4YMJA 2VWZA 4AFJA 4ZS4A 4C4IA 5JKGA 1XO2B 2B9HA 4IC8A 3V6RA 3WZJA 4USFA 2A2AA 3LXPA 3ID6C 2XS0A 5IQCA 3NYOA 4BR3A 5H9BA 5M55A 4O1OA 2CLXA 2XUUA 4BTFA 3R0TA 4EORA 4LL0A 4ZP5A 2E9NA 2KULA 4BWXA 5JGAA 4QTEA 5E8VA 4AE6A 5TF9A 5C1QB 1OBGA 3QTRA 2FH9A 3Q2JA 3UMWA 5AV3A 2RFEA 4EZ5A 4D5HA 4QMTA 1YXXA 2W5BA 3C4EA 5IMEA 5I9WA 4M69A 2B9IA 2ZYBA 5HCZA 1JPAA 1ZYCA 3NX8A 2R2PA 3CCNA 3TI1A 2IVTA 5IH5A 3NAXA 3ANRA 3CC6A 4ERKA 4ONAA 4LOPA 4TWNA 4F0GA 3KXZA 4L53A 3ZRMA 3OCSA 4MQ1A 3MY0A 5E8WA 5HICA 3R28A 2BIYA 3BHHA 3FDNA 4FNXA 3EN5A 3JVSA 4O0WA 4BGHA 4EEVA 5HE0A 2FVDA 3KRWA 1P14A 3PPJA 3FBVA 2R3KA 4O91A 3ORXA 5AUWA 5JMSA 3IW5A 3LIJA 3TT0A 3KRLA 1KWPA 3G51A 2YITA 1OGUA 1FVTA 5DRBA 5AAGA 4IX5A 3UIUA 2WMWA 4QD6A 1RDQE 2W1DA 2OIQA 2WPAA 5FM3A 2Y6MA 2QOOA 3LCTA 3CPCA 2VTOA 2YIYA 3VAPA 4LGHA 3PZHA 3AC5A 3UC3A 3H30A 4GT4A 4H39A 5CEMA 2E9UA 4EOOA 3U87A 2YCQA 3FV8A 4IAAA 4J8NA 3QGYA 3R00A 4FNZA 2HXQA 5FP6A 4ACCA 1H27A 1O6KA 3EHAA 4JOAA 4ALUA 4BKJA 5AMNA 4DH7A 4JG7A 5AR5A 5AP6A 3CBLA 3EJ1A 4G3CA 4RBLA 3WE8A 3ORTA 5IMXA 2RG6A 1M7NA 2PULA 2WFYA 3HNGA 1ZARA 1CM8A 2YLFA 5CYIA 3WZKA 2C5OA 5DGZA 3S3IA 4DAWA 1KOAA 4ZZNA 3DNDA 2PTKA 2OLCA 4XRLA 2V7OA 4GYIA 4IZYA 3Q4CA 4EHGA 4YZCA 4JDKA 4WO5A 2GTNA 5CSVA 5IISA 1P4OA 4UYNA 5A9UA 3IOPA 4K6ZA 4ANQA 4G3DA 4I5HA 2YCSA 1UWJA 1W84A 3PYYA 4DGMA 4X2NA 3QTWA 5M57A 1OM1A 2I7QA 2BAJA 5CX9A 3ZZEA 1KE9A 1YWNA 3LQ5A 5KE0A 1XH9A 2Z2WA 4FNYA 2WD1A 4EH4A 3KMUA 3AMBA 4ENXA 4BHZA 3C0HA 3C13A 2PVFA 4KS8A 3BBWA 3MH3A 4QP9A 4BCKA 2FGIA 3LFAA 1OVEA 1ND4A 3VQHA 3QTXA 4C37A 3OD6X 5CI7A 5M51A 1ZOHA 2B0QA 4QTAA 4LI5A 4TXCA 4RIXB 3QYZA 4B8MA 4I21A 1ZMUA 5CF8A 5FTGA 3HGKA 3P5KA 1SYKA 4NKAA 5DOSA 2QLUA 5DT3A 5BVKA 5CU3A 3OHTA 3R9DA 3PDTA 5CQWA 3RM7A 4H1MA 1GJOA 2EXEA 3HRFA 4B6LA 4RWIA 4O7YA 4CG8A 4RQVA 2ESMA 3VHKA 5BYLA 4ANBA 4B7TA 4EKLA 2PZYA 5H8BA 4IWOA 4F0IA 3MFTA 2CNVA 4FKTA 3NVMB 4N57A 2PVJA 2XNMA 1ERKA 2RFDA 3BE2A 3QXOA 5L2WA 4HOKA 3VW6A 1JSTA 3F2RA 3ZEPA 4O22A 1BX6A 3L8XA 3MH2A 3UIXA 4Z3VA 5DHJA 4CLJA 2CNUA 4EH2A 1OL5A 1Y8GA 2CN8A 2YM6A 3DPKA 4YBKA 5EDRA 4MNFA 4MXOA 5DNRA 3VS1A 3KB7A 3EN7A 2XK4A 3IG7A 1Q97A 5M4CA 4F9WA 2OWBA 4J52A 4ZZOA 3OROA 4MBJA 3UO6A 4RZVA 4CCUA 2CKPA 5K4IA 4GRBA 2J51A 3FMMA 3IECA 3PFQA 2WMTA 3DZOA 2X2LA 4MEDA 2FUMA 5EDQA 3E3PA 5C27A 3DQXA 4XH6A 2GNIA 2QOQA 3D5VA 4G9RA 4D2TA 3LW0A 4QO9A 4DEIA 4APPA 2Z8CA 3R30A 5EK7A 3BX5A 3LHJA 2C6IA 4DGNA 3PIXA 4EQCA 4F7SA 4YLLA 1NVQA 2R3PA 4RFZA 3FZ1A 3CJFA 1IEPA 2W1IA 3QQHA 2UVYA 1OI9A 1J1CA 1JNKA 4D2SA 1VZOA 4QNAA 4TT7A 4PP7A 1VR2A 3W2CA 3PRFA 4L3JA 4EONA 1ZLTA 2PVRA 4YJVA 4NT4A 4D9TA 2XCKA 5HKMA 3QCXA 4FL3A 4FTAA 5JZNA 4FG7A 3ZH8A 3FMDA 2UZTA 3HP5A 3OY3A 3TZMA 3PVGA 2J6MA 1GY3A 2UZUE 4NUSA 5HG5A 4ZEGA 1OKWA 4FODA 3EQGA 3TNQB 4QMSA 4DFXE 3P9JA 3GC9A 4RSSA 1O6YA 1FGKA 5EI8A 4DITA 1JVPP 2WMSA 5HD7A 1P2AA 2YDJA 3LJ1A 4J71A 3HRCA 1SVHA 4L46A 4U3YA 3LFBA 1LR4A 3KCKA 1GZKA 4EHVA 3QCSA 3ZC5A 3AQVA 3LE6A 4A4LA 2BRMA 3EL7A 4O6LA 2C6MA 2YJSA 4K1BA 5E8XA 2HK5A 5DH3A 1YXUA 5EYMA 2OZAA 5A4EA 4CG9A 5A54A 4I1ZA 5CEQA 4UX9A 3G90X 3L9MA 3IW7A 2WHBA 3F5XA 2JBOA 3Q4UA 4BI1A 4BIBA 3OC1A 4H1JA 4QMZA 2H6DA 3QD0A 2A0CX 4FTJA 5H3QA 2QOHA 4TRLA 2WTKC 3DFCB 5HOAA 3TIZA 4E1ZA 5A4QA 3CE3A 3NPCA 4NM0A 2GNLA 4PNIA 4Q5EA 1ZY4A 5F94A 4QP3A 4AN9A 5AA8A 2PPQA 3EWHA 2EWAA 4FBXA 4FX3A 3A62A 4R1YA 4AE9A 3I0OA 4EHEA 4EYJA 3H4JA 4FKOA 1H00A 5L8LA 1ZYDA 4P5QA 2GFSA 2PVYA 3A60A 3CP9A 3G6HA 4JXFA 3W1FA 2V7AA 4A9YA 4CFVA 5LVOA 4Q9ZA 1PW2A 4QP1A 3UDBA 3ZUTA 3QHRA 3TUCA 2R3MA 2I0EA 4FG8A 5I9VA 1OIYA 2W4OA 3QTZA 5ITAA 4BDCA 4BZOA 5HIDA 5TE0A 4L9IA 4C4JA 3RAIA 4YJPA 4RIYA 5IG1A 4C4GA 3LFQA 4PL5A 4FEVA 1K9AA 3U9NA 3CTQA 3ZFXA 1FVVA 5ACKA 4M14A 1DAWA 3QKLA 3DOGA 2BDFA 2WEVA 4KWPA 2QKRA 4QMYA 3KXXA 2PMLX 2WEIA 5EH0A 3IO7A 2E9VA 1PYXA 4JQEA 4DN5A 3UZTA 3M2WA 3DU8A 5AX9A 3C1XA 3HUBA 3MV5A 4X3JA 5K0XA 5DR9A 5KMNA 2YIXA 3NYVA 1WBSA 3BEGA 4Y46A 5KMOA 3ANQA 3UQCA 1HCLA 4F7LA 5J9YA 1URCA 2C68A 4U44A 2JDSA 3AC8A 5FUTA 3SC1A 3CKXA 3DDPA 2HY81 4E20A 4HGSA 3ZUUA 4B9DA 4QYEA 5AUXA 4O7NA 3QRUA 4F9BA 3A7HA 4QMUA 4ANMA 3A4PA 4EC9A 1KSWA 2KTYA 3HV6A 3AT2A 3HDMA 3HKOA 2EXMA 4IAZA 3D7TB 3QCQA 4CTCA 3A7FA 3RNIA 4FSYA 5IQEA 2UW8A 2BFYA 1I09A 1P4FA 1UNHA 3QD3A 4V0GB 3ULIA 2CGUA 4X6RA 5HI2A 4CMUA 4QPAA 3PXRA 3DBFA 4GEOA 5CF5A 1WAKA 4Z55A 3GU6A 4EWHA 5E92A 3RNYA 2IO6A 3NIZA 4H36A 4LV8A 3GC8A 3HDNA 5I0BA 4HYHA 1MP8A 4H3BA 1DM2A 5BX0A 2XNGA 4FKIA 4TWPA 3VBVA 2X7GA 3D9VA 4NJDA 2F7XE 3FMEA 4IEBA 4TWOA 4YZ9A 2F9GA 1BKXA 3LCDA 4PL4A 4UZHA 5ANEA 3LFDA 3VJOA 3ZRKA 3PVWA 4CZYB 4EI4A 5BUIA 1L8TA 2YM3A 1E1VA 1B6CB 2XIYA 1W8CA 5CALA 4KD1A 5LVMA 4RMZA 3NW6A 5AIRA 3FLYA 4CFWA 5CF6A 1JKKA 4ZSAA 2WOTA 4S2ZA 4OTHA 3Q5ZA 3B2WA 2R3JA 4OT5A 3AT3A 4C4HA 4L43A 1BMKA 1HCKA 3PXZA 3R04A 3MSSA 4I6FA 5TT7A 1GNGA 4RRVA 3WZUA 3CGOA 4HVGA 4O21A 5AP7A 4BDBA 4O0SA 5KHXA 4DGOA 1QPEA 4RX9A 5K5NA 5LMAA 3QAME 1OIQA 4FGBA 4EBVA 4FKJA 4XBRA 1M2QA 4AW2A 4IWPA 2VO7A 3FKLA 3GFEA 3O50A 2Z60A 4O27B 3JPVA 2QHMA 3MTFA 4O82A 4UMQA 1XQZA 1ZRZA 4GG5A 4RIXA 3TNWA 1YW2A 2OXDA 3NWWA 4O7SA 3EFWA 3MBLA 5EQPA 4OTGA 3ZFYA 2CSNA 2ZM1A 2O65A 2OFUA 3QTQA 2C5XA 2JFMA 3PG3A 3AMAA 3H9RA 2HZIA 4IZ5A 4BCHA 4LL5A 3MY1A 4EOIA 1H07A 3M42A 2PVKA 1UKIA 3MJ1A 4XJ0A 4CYIA 2C3LA 4DFUA 2IVSA 1ZOEA 4LV5A 3RVGA 5I3OA 4E4MA 4G3FA 4BN1A 2Y7JA 5AADA 1IASA 3O0GA 2QO2A 4PRJA 5AAEA 3N4TA 5EHLA 2X2MA 3COKA 4X3FC 2SRCA 1VYZA 5GJFA 1YWRA 4W8DA 4IB0A 3Q9YA 4W4YA 5LWMA 4UMRA 2YDIA 3BEAA 5GINE 2O8YA 5L2QA 4JJRA 4O0RA 4O2ZA 4UBAA 4X7QA 2J0JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PA5 A;  3GU4 A;  3QC9 A;  3SLS A;  4RC3 A;  2VTH A;  3ZTX A;  3LAU A;  2X1N A;  2PE1 A;  2W9F B;  3W33 A;  3UYS A;  4F63 A;  3QRT A;  4MD9 E;  1NVS A;  3AC1 A;  5AP1 A;  1MQB A;  5E1E A;  5CXZ A;  1F3M C;  4A9S A;  4CMT A;  3BV2 A;  4O7T A;  4B99 A;  3QRI A;  1IAJ A;  3G2F A;  4M67 A;  4NIF A;  3HZT A;  4EHZ A;  3MTL A;  3AC3 A;  4BHN A;  3OT8 A;  2OIC A;  4DED A;  2DS1 A;  3VBX A;  2YDK A;  1PYE A;  4PQN A;  4Z16 A;  3B8R A;  4IZA A;  3RMF A;  3C0I A;  4D4R A;  2CHL A;  4O7Z A;  3KEX A;  3TKH A;  5D9H A;  1MUO A;  5KZ0 A;  2UW3 A;  4NM3 A;  5IEX A;  1KV2 A;  4HYU A;  4WSQ A;  5CS6 A;  4EOK A;  5I9X A;  5EOL A;  2A1A B;  4IAN A;  4E3C A;  4WNO A;  4RJ5 A;  4V01 A;  3QF9 A;  1WVY A;  5BUE A;  4PTC A;  3F7W A;  2O64 A;  3FZT A;  4YLJ A;  3PP1 A;  5AR2 A;  5L3A A;  3KA0 A;  1JBP E;  2G2I A;  3ORP A;  4LUE A;  2C30 A;  2BIK B;  4X3F B;  2P2H A;  3SXS A;  1R1W A;  3ULZ A;  2I0Y A;  3RWP A;  3QD4 A;  2H8H A;  4I93 A;  4YJT A;  5GIO E;  3F2N A;  4QYY A;  1ZOG A;  5JT2 A;  4O0V A;  5GZA A;  4FTO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PA5 A;  3GU4 A;  3QC9 A;  3SLS A;  4RC3 A;  2VTH A;  3ZTX A;  3LAU A;  2X1N A;  2PE1 A;  2W9F B;  3W33 A;  3UYS A;  4F63 A;  3QRT A;  4MD9 E;  1NVS A;  3AC1 A;  5AP1 A;  1MQB A;  5E1E A;  5CXZ A;  1F3M C;  4A9S A;  4CMT A;  3BV2 A;  4O7T A;  4B99 A;  3QRI A;  1IAJ A;  3G2F A;  4M67 A;  4NIF A;  3HZT A;  4EHZ A;  3MTL A;  3AC3 A;  4BHN A;  3OT8 A;  2OIC A;  4DED A;  2DS1 A;  3VBX A;  2YDK A;  1PYE A;  4PQN A;  4Z16 A;  3B8R A;  4IZA A;  3RMF A;  3C0I A;  4D4R A;  2CHL A;  4O4D A;  4O7Z A;  3KEX A;  3TKH A;  5D9H A;  1MUO A;  5KZ0 A;  2UW3 A;  4NM3 A;  5IEX A;  1KV2 A;  4HYU A;  4WSQ A;  5CS6 A;  4EOK A;  5I9X A;  3BL7 A;  5EOL A;  2A1A B;  4IAN A;  4E3C A;  4WNO A;  4RJ5 A;  4V01 A;  3QF9 A;  1WVY A;  5BUE A;  4PTC A;  3F7W A;  2O64 A;  3TYK A;  3FZT A;  4YLJ A;  3PP1 A;  5AR2 A;  5L3A A;  3KA0 A;  1JBP E;  2G2I A;  3ORP A;  4LUE A;  2C30 A;  2BIK B;  4X3F B;  2P2H A;  3SXS A;  1R1W A;  3ULZ A;  2I0Y A;  3RWP A;  3QD4 A;  2H8H A;  4I93 A;  4YJT A;  5GIO E;  3F2N A;  4QYY A;  1ZOG A;  5JT2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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