The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
SECDVLTRLKVKAQWRRAYSHGHNREDFAQAIWRALFAQVPDSRTLFKRVHGHDTTSPEFQAHALRVLAGFDIAISTLDQPDALKAELDHLEKQHEGRHIPDNYFDAFKTALLHVLPAQLGRCWDKDAWSACFDHIAHGIKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Globin a chain
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| publication title |
The structure of the giant haemoglobin from Glossoscolex paulistus.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
61
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
F, J, Q, U, Y, f, j, n
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-08-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1C7B B; 1FAW B; 3WCW D; 3P5Q A; 1DKE B; 3UGZ A; 1BZ1 B; 4H2L A; 1Y5F A; 1X9F A; 1MYI A; 2ZS0 D; 2XYK A; 4N7O B; 3ED9 A; 4O2G A; 4MU5 A; 1QSH A; 1Y7C A; 5E83 A; 1Y5K B; 2ZS1 A; 2C0K A; 1DM1 A; 3BJ2 B; 1XYE B; 3PI1 A; 1IT2 A; 3H58 A; 1AJH A; 3AQ7 A; 2R4Z A; 2W6Y A; 3OGB A; 1BBB A; 5EET A; 1LHT A; 2D5X B; 1Y22 B; 1ABS A; 3GYS A; 2GRH A; 2H8F A; 2DN1 A; 3KMF A; 2D2M D; 2O5S X; 3A2G A; 1MOB A; 5EYJ A; 1O1J B; 1HCO B; 2HHD A; 3WCW C; 1J41 A; 3LB3 A; 2MGB A; 4XDI A; 3QZX A; 1MLL A; 3MYN A; 4HRR A; 4MQH B; 1A6M A; 4WCH D; 3QJC B; 2ZS0 C; 3K8B B; 1HBR B; 3G52 A; 4MQI B; 5EUI A; 1MTK A; 3W4U A; 1WVP A; 3OJ1 A; 3B75 A; 1AJ9 B; 3PI3 A; 2G10 A; 2BW9 M; 1G08 A; 3UHB A; 1Y7D A; 4F4O B; 1YCB A; 2GRZ A; 4MQK A; 2QFK A; 1NWN A; 1YEN A; 3FS4 A; 2MGK A; 1XZ4 A; 3NMM B; 1UT0 A; 1JPB A; 1YH9 A; 1OR6 A; 3MKB B; 1V07 A; 3IC0 B; 2R80 B; 3UHT A; 2R1H A; 1LH5 A; 2D2M C; 3ASE A; 2Z6N B; 1ABY A; 3PEL A; 5CN7 A; 5F2A A; 2RAO B; 3M3B A; 1S69 A; 1HJT A; 4NXA A; 1JF4 A; 1GLI B; 5JGG B; 4TWU A; 1J7W B; 1J3Z A; 3ZJP A; 2O5Q X; 1Y8I A; 4FH7 A; 1J3Y A; 1YEV A; 1Y8K B; 3PI8 A; 1HLB A; 101M A; 1SI4 A; 4U8U D; 3WCT B; 2YRS A; 4ESA B; 1YOG A; 1Y45 A; 1MLG A; 2VLZ A; 4KJT A; 4NI1 B; 3P5Q B; 1MBN A; 1M6M A; 4H2L B; 5EV5 A; 3E5O A; 3WCV D; 4WJG A; 1X9F B; 1O1K A; 1O1L B; 2ZT4 A; 2ZS1 B; 1DTI A; 2VLX A; 2VEE A; 1BBB B; 1GVH A; 3S48 C; 104M A; 2EKT A; 4FWX A; 2ZSP A; 3RJN B; 1UMO A; 1LH2 A; 4M4A A; 3WFU A; 1K1K A; 2H8F B; 2MGA A; 2DN1 B; 5CN6 A; 3QJD A; 5CN9 A; 4NS2 A; 1YDZ A; 1J3F A; 1GDI A; 3OO5 A; 3IA3 B; 3ZJO A; 2D2N A; 1KR7 A; 2GTL A; 2HHD B; 1MOA A; 1V75 A; 1MTI A; 2RI4 A; 3NG6 A; 2BMM A; 2EB8 A; 1LJW A; 3MOU A; 4HRR B; 1EBC A; 1NQP A; 3WCV C; 4LPI A; 2GL3 A; 1HBG A; 1YHR A; 4YU4 A; 4ODC A; 3QM6 A; 1JL6 A; 2BLJ M; 4HRT A; 1J7Y A; 3W4U B; 1CP5 A; 3IXF A; 3B75 B; 5KER B; 3WI8 A; 1G08 B; 1CBL A; 1IRC A; 4MQK B; 3WCW A; 5CMV A; 2GLN A; 6HBI A; 1BUW A; 1YEN B; 1XZ4 B; 3UH5 A; 1YH9 B; 4DC7 A; 2CMM A; 2R1H B; 4IT8 A; 2HBE A; 1ABY B; 3PEL B; 1O1P A; 2ZS0 A; 1YEQ A; 2O5O X; 1FSX B; 1JWN A; 1MBD A; 1DUO A; 2LHB A; 3S65 A; 1J3Z B; 3MJP A; 5HBI A; 1QXE A; 1SDL A; 1MLR A; 1J3Y B; 3UHR A; 3UHZ A; 1YEV B; 1C40 A; 2W6W A; 3PI8 B; 2DC3 A; 1SI4 B; 5AZR A; 3WR1 A; 1Q1F A; 2YRS B; 1Y45 B; 4H0B A; 3GDJ A; 3ZJN A; 3G4Y A; 1LA6 A; 3BOM A; 1HGB A; 2D2M A; 3TM3 A; 3QJB A; 1O1K B; 3WCU B; 3QM9 A; 4OF9 A; 2MYA A; 4ZVB A; 102M A; 1S56 A; 2ZT3 A; 1C7C A; 1Y0W A; 1ECN A; 1URY A; 1MLH A; 1V4X A; 1A0Z A; 4N7P A; 1K0Y A; 4MXK A; 1VXG A; 1VRF A; 2W31 A; 4M4A B; 1K1K B; 1F63 A; 3DR9 A; 1DO4 A; 1XZV B; 1YFF B; 3GQP B; 3QJD B; 1MLU A; 1YDZ B; 5HY8 A; 3OO5 B; 2D2N B; 5HLX A; 1YEO B; 3MYM A; 5EE4 D; 2GTL B; 2R50 A; 3IC2 B; 1J7S A; 1YIE A; 1YHE A; 2RI4 B; 3NG6 B; 1LJW B; 5HU6 A; 1Y4F A; 1NQP B; 3EOK A; 5F0B A; 3VRG A; 4NK2 A; 1YHR B; 4YU4 B; 1XXT A; 4MBA A; 4ODC B; 1YVT A; 3MN0 A; 4HRT B; 1J7Y B; 3AQ6 A; 5EU2 A; 1DTM A; 1MYJ A; 1HHO A; 1LFT B; 4U8U A; 3RGK A; 1HGA A; 1MKO A; 2O5B X; 2LH5 A; 1MLF A; 1MNI A; 2ZFB A; 3ECZ A; 3WCW B; 3WFX A; 4BJA A; 1BUW B; 2V1I A; 2NSS A; 5E29 A; 2W6V B; 3WCV A; 2HBE B; 4F6B A; 1SHR A; 1O1P B; 2ZS0 B; 3HEP A; 3SZK A; 3TM9 A; 3S65 B; 3MJP B; 4F6D A; 1MNH A; 1IRD A; 2WY4 A; 1CPW A; 3M3A A; 1C40 B; 1Y0T A; 3VRE A; 1Y7Z A; 3RJ6 A; 4N7O A; 1YZI A; 2LH3 A; 3ZH0 A; 3WR1 B; 108M A; 3S1J A; 1LA6 B; 3BOM B; 1HGB B; 3BJ2 A; 2D2M B; 1BAB A; 3D7O A; 2AUO A; 1V9Q A; 1Y4V A; 7HBI A; 3QJB B; 2O5L X; 2ZSN A; 4DC8 A; 2ZT0 A; 2GNV A; 1Y8H A; 4M4B B; 3G4V A; 1C7C B; 1Y0W B; 1UX9 A; 1V4X B; 1A0Z B; 4N7P B; 1QI8 A; 1K0Y B; 2FAM A; 3WCU D; 3QQR A; 3A5G A; 5ILM A; 4PQ6 A; 1VRE A; 3QJC A; 5HY8 B; 1WLA A; 1G09 A; 5CNC A; 2EVP A; 2MGI A; 1YMB A; 1RQ3 A; 1J7S B; 1YIE B; 1RVW A; 5JOM A; 1JZM A; 1YHE B; 1Y4F B; 2AA1 A; 1BZP A; 2GKM A; 2V1J A; 1HBB B; 1OR4 A; 1XXT B; 3BA2 A; 105M A; 1A6K A; 4PQC A; 3A0G A; 1YVT B; 2AUR A; 1S5Y B; 4F69 A; 1UIW A; 2QMB A; 1HHO B; 1R1Y A; 5JDO C; 1O1I A; 4QAU A; 2MGG A; 1HGA B; 1MKO B; 1M6C A; 1O1O A; 1O1M B; 2HHB A; 2ZFB B; 1A01 A; 2ZT1 A; 111M A; 3GQG A; 1V5H A; 5E29 B; 3WCV B; 1Y8W A; 1SHR B; 3OO4 A; 1Y7G A; 1YHU C; 1VXF A; 2ZFO D; 1MNJ A; 3SZK B; 2G0R A; 3BJ1 A; 4IRO A; 4NI1 A; 1CMY B; 2Z6T A; 5CHQ A; 5MBN A; 1CLS A; 3HXN A; 1IRD B; 1CH7 A; 1UVX A; 1EWA A; 1CH5 A; 2DXM A; 1Y0T B; 3VRE B; 1Y7Z B; 1O1L A; 2NSR A; 1YZI B; 2QFN A; 3UBC A; 1T1N A; 3ZJI A; 4ROL A; 1GDL A; 3AT6 A; 4AVE A; 1FCS A; 3K3U A; 1MTJ A; 1BAB B; 3GK9 A; 4F6I A; 3D7O B; 1UX8 A; 1Y4V B; 4DWT A; 1IOP A; 1UFP A; 1Y46 A; 3ARL A; 1RPS A; 3QJE A; 1LFV B; 1O16 A; 5HLQ A; 1YE2 A; 1Y8H B; 1XZ5 A; 4F6J A; 1LH6 A; 5CHR A; 1JL7 A; 1QI8 B; 2ZFO C; 2VHB A; 3QM7 A; 2W6X A; 2VYZ A; 4NI0 A; 1A9W A; 2EF2 A; 1C7D B; 1G09 B; 1IDR A; 3UHW A; 3R0G A; 1RQ3 B; 1RVW B; 5KER A; 4NZI A; 2ZSS A; 2FRF A; 2AA1 B; 1O1N A; 2VRY A; 4B3W A; 1OFK A; 2MYC A; 1S5X A; 1LH3 A; 5ILE A; 4H07 A; 1V4W A; 1RTE A; 4FC3 A; 1MOD A; 1RQ4 A; 1HLM A; 1QSI A; 2V1F A; 1PBX A; 3D4X A; 2HHE A; 3A0G B; 3NML A; 5CNB A; 1HDS A; 1UIW B; 2QMB B; 1FSL A; 1R1Y B; 1O1I B; 1KFR A; 2GRF A; 1FSX A; 4G1B A; 3EU1 A; 1O1O B; 2HHB B; 1A01 B; 1CO9 A; 3FH9 A; 3GQG B; 1YVQ A; 1MBI A; 3PI4 A; 1MBO A; 3OZW A; 1JF3 A; 1Y8W B; 3OO4 B; 1Y7G B; 3D1A A; 2HBF A; 3BJ1 B; 4IRO B; 2MYD A; 1S6A A; 1Y0C A; 3HYU A; 1CLS B; 3HXN B; 3ONZ A; 1MLO A; 1HGC A; 2G0S A; 2DXM B; 1DO7 A; 1NEJ A; 5CND A; 1CG8 A; 3WCU A; 1YMC A; 1T1N B; 1DXT A; 2LH7 A; 3MVC A; 4ROL B; 3AT6 B; 2SPM A; 1GBU A; 4X0L A; 4PQB A; 1MLS A; 4MXL A; 2JHO A; 3BJ3 B; 1Y46 B; 1RPS B; 3QJE B; 2H35 A; 3GOU A; 1YE2 B; 3CY5 A; 1XZV A; 1XZ5 B; 1YFF A; 3GQP A; 3VRF A; 3ARK A; 1Y01 B; 1YEO A; 3MJU B; 1URV A; 2ZSY A; 4ZVA A; 3IC2 A; 1X46 A; 2ZSZ A; 4TWV A; 3TLD A; 1FDH G; 2MHB B; 3QM5 A; 2MGM A; 3VHB A; 2QRW A; 4NI0 B; 5HAV A; 2ZWJ A; 1X3K A; 2AUP A; 4TYX A; 1NZ3 A; 1LHS A; 2VEB A; 2V1H A; 3HHB A; 1LFT A; 1QXD A; 3E5I A; 2DN2 B; 1A9W E; 1JW8 A; 1O1N B; 1H97 A; 2BKM A; 3UHK A; 2ZFO A; 1S5X B; 1Y5J A; 3OZU A; 3SDH A; 2AUQ A; 4FH6 A; 1V4W B; 1Y4G B; 4FC3 B; 1RQ4 B; 1QSI B; 1PBX B; 2HBG A; 3D4X B; 3HRW A; 2HHE B; 1S0H B; 2W6V A; 1HDS B; 4UZV A; 2G0Z A; 1B86 A; 2ZLT A; 3PI9 A; 3SDN A; 3EU1 B; 1JP8 A; 3FH9 B; 4G51 B; 1SWM A; 3WTG A; 1YVQ B; 2FRI X; 1BVD A; 1XQ5 A; 5JDO F; 2LH2 A; 3WCP A; 1HBA A; 1XZ2 A; 3HEO A; 3G53 A; 3D1A B; 1EMY A; 3UHH A; 2HBF B; 3UHN A; 2KSC A; 1Y0C B; 2BWH A; 3HYU B; 1KD2 A; 3ONZ B; 1HGC B; 3GKT A; 1XZ7 A; 3UHC A; 1GDK A; 2MYB A; 1JY7 A; 2DN3 A; 1NEJ B; 1CG8 B; 4XS0 A; 4GZG A; 1DXT B; 3ZJM A; 2ZT2 A; 4M4B A; 2FAL A; 5JDO E; 1GBU B; 5KKK A; 1MWB A; 2MBW A; 4X0L B; 2AV3 A; 1YHU B; 3UH7 A; 1YE0 A; 2G3H A; 1I3D A; 2MGL A; 2H35 B; 2OH8 A; 1LFZ B; 3KUO A; 3GOU B; 5CNE A; 3CY5 B; 1A6N A; 3VRF B; 1VXD A; 1GJN A; 3GQR A; 1MLM A; 1YOI A; 2QLS A; 1NPF A; 4HSX A; 5SW7 A; 1MNK A; 2ZSQ A; 1JP9 A; 2IG3 A; 1DXU A; 3ECX A; 1NAZ A; 1HDB A; 2Z85 A; 4G1V A; 3ODQ A; 2HBC A; 5AZQ A; 4UIQ A; 1HBB A; 4ROM A; 1LH7 A; 1HV4 A; 3UH6 A; 1IWH A; 1S5Y A; 6HBW A; 1U7S A; 3HHB B; 1QXD B; 4O4T A; 2V1K A; 107M A; 1O1M A; 2ZFO B; 1Y5J B; 3HF4 A; 1MZ0 A; 1CIO A; 3NL7 A; 3HRW B; 2M6Z A; 1L2K A; 3PI9 B; 1B86 B; 2ZLT B; 1Y4B A; 2SPN A; 3EDA A; 5ILP A; 2BLI A; 1CMY A; 2MGE A; 112M A; 1MYZ A; 3WTG B; 5EYS A; 2NRL A; 1CG5 A; 2ZS1 C; 4NK1 A; 1XQ5 B; 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1YEU A; 3LQD B; 5CNF A; 3AQ9 A; 3A5A A; 4MPM A; 2VYY A; 5ILR A; 1Y0A A; 3BJ3 A; 110M A; 2BNL A; 1BZ0 A; 2E2Y A; 3PT8 B; 3GKV B; 2D2N C; 1ECD A; 3G4Q A; 2GTL C; 1COH B; 1DLY A; 5AB8 A; 1N9I A; 1VHB A; 1OBM A; 1N9F A; 2EKU A; 3CIU A; 1IT3 A; 3UHS A; 2H8D B; 1A3O B; 109M A; 4HHB B; 3MJU A; 1W92 A; 1RQA B; 2NRM A; 4MQC B; 3UHD A; 3V2V A; 2MHB A; 1BZZ A; 1DXV B; 3UHV A; 3HC9 A; 3K9Z A; 2D5Z B; 1OJ6 A; 3ECL A; 1LFQ B; 3EDB A; 5EOH A; 1HAB A; 1SDK A; 1YG5 B; 2HBD B; 1Y31 A; 3ZJQ A; 1UVY A; 2DN2 A; 1A00 A; 1MDN A; 1MYM A; 1NZ2 A; 2ZLX A; 1CQX A; 1Y4G A; 1HAC A; 1LFL A; 2NX0 A; 1S0H A; 1UC3 A; 2ZLV A; 3NFE A; 2D60 B; 1Y0D A; 2QSP B; 4YU3 A; 3R5I B; 4MQG A; 1R1X A; 2G0X A; 1G0B A; 1NWI A; 2PGH B; 4G51 A; 1LH1 A; 3LB4 A; 1MLN A; 1QPW B; 2PEG A; 3QQQ A; 1YIH A; 1NIH B; 2ZSO A; 1Y83 A; 1WMU A; 1F5P A; 1YOH A; 2ZLU B; 1YGD B; 1GCW B; 2VM0 A; 4NXC A; 1HDA B; 1BZR A; 1DWT A; 1CO8 A; 3D17 B; 2EB9 A; 2HBS A; 3QM8 A; 1HBS B; 5C6E B; 2R4X A; 1HBH B; 2ZLW B; 3UHI A; 4B4Y A; 1VXC A; 1Y4R A; 4KMW A; 3LB2 A; 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