The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
DCSILELLKVKNQWREAFGEGHHRVQFGLELWKRFFDTHPEVKGLFKGVNGDNIYSPEFAAHAERVLSGLDMTIGLLDDTNAFKAQVTHLHSQHVERSINPEFYEHFLGALLHVLPKYLGTKLDQDAWTKCFHTIADGIKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Globin a chain
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| publication title |
The structure of the giant haemoglobin from Glossoscolex paulistus.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
56
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
H, L, S, W, a, h, l, p
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-08-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1V4X A; 1MLJ A; 2QSP B; 1CH9 A; 1FAW B; 3PI1 A; 1DLY A; 2AV0 A; 1MYZ A; 4BJA A; 3CY5 B; 1C40 A; 2ZT0 A; 3A5A A; 1Y45 A; 2M6Z B; 1HGC B; 3E55 A; 4MQC B; 2MGL A; 5EOH A; 1OR4 A; 1DUK A; 3UHS A; 1OUU B; 2ZLT A; 1HLB A; 2O5T X; 4UIQ A; 1XZ7 B; 4B3W A; 2ZS0 B; 1JZK A; 5MBA A; 3G4Y A; 1KD2 B; 3WCT C; 1KFR A; 2AV3 A; 1HCO B; 4MQK A; 1A3O B; 3QMA A; 1Y8H B; 1YGD A; 3GDJ B; 3OZU A; 1NZ4 A; 4PQB A; 4KJT A; 1NZ3 A; 1J3F A; 1F65 A; 1XYE B; 1XZ4 A; 2ZLV B; 2FAL A; 3ZOL A; 4O1T A; 2HBS B; 1CO9 A; 2D2M A; 1MLK A; 3QQQ A; 1YMA A; 1G09 A; 2YRS A; 3K9Z A; 1XZU A; 3ECL A; 2GTL C; 1O1I B; 2OHA A; 4MBA A; 4LPI A; 3WCV B; 1YVQ A; 2D2M D; 5EUI B; 2HBE B; 2NSR A; 3ZJP A; 5ILE A; 1YE2 B; 5EQM A; 1MWC A; 1O1N B; 3ONZ A; 1N9F A; 3DUT B; 1VXB A; 3QJD B; 5HU6 A; 2VYW A; 5HLQ A; 1O1M B; 3QM8 A; 1MTK A; 1BZ6 A; 2MGE A; 1UX8 A; 1VXG A; 3S66 A; 4N7P B; 5CN8 A; 1Y31 A; 1Y4F A; 3GQP B; 3G4R A; 1Y22 B; 3M38 A; 5HLU A; 3AT6 B; 3ZJI A; 3BCQ A; 2VLY A; 1NS6 A; 1GDL A; 3PT8 A; 1LJW B; 1HAC A; 3UBC A; 3ZJL A; 1XZ2 B; 3EDA A; 2EVP A; 5EE4 C; 1S0H B; 2D5X B; 1NZ2 A; 1WMU A; 4F6I A; 3CIU A; 3HF4 A; 2HCO B; 3OO5 A; 4WCH D; 1XZ5 A; 1J40 B; 1HV4 A; 4MXL A; 1Y0T A; 1K0Y B; 2ZFO A; 1UFJ A; 3ED9 A; 3MJU A; 1J52 A; 2HBD A; 1RQ3 A; 3S65 A; 2D2N C; 1G9V B; 1Y0A B; 3DHT A; 3UHH A; 1CLS B; 3GKV A; 2ZFO D; 112M A; 2SPN A; 3H58 A; 3PI3 A; 3GYS B; 1RQ4 B; 5CNC A; 1QXE A; 3OO4 B; 1SDL B; 1YDZ B; 2MYB A; 1LA6 A; 5E83 B; 3K3U A; 1YIE B; 1RQA B; 1XCH A; 1JWN A; 3UHY A; 3UHQ A; 4HHB B; 2BMM A; 1HBR A; 1HBH B; 1CH5 A; 1GVH A; 3HRW B; 2HZ2 A; 1M6C A; 2LH2 A; 1BBB B; 2R1H A; 3QZZ A; 5HAV A; 4IT8 A; 3M3B A; 1Y4B A; 5AZQ A; 3GQR A; 2XKH A; 2GNW A; 3HXN B; 3LB4 A; 1V07 A; 2BKM A; 1VXF A; 1LFL B; 3D4X B; 2GTL B; 1CMY B; 5CMV A; 4F68 A; 1Y4V A; 1LH6 A; 4ESA B; 1Y0W A; 1C7C A; 3D17 B; 3HHB A; 1GBV A; 1S5X B; 3ORD A; 2D60 A; 1DXC A; 1J3Z A; 3HYU B; 1LH3 A; 1SHR B; 1DO4 A; 2H8D B; 3BJ2 B; 1Y8K B; 1DM1 A; 1FSX B; 5AZR A; 1B86 B; 2VRY A; 1CBL A; 3SZK B; 1X9F C; 1NPF A; 2HBG A; 3VRE B; 1IT2 A; 2AUO A; 1Y8I A; 3NL7 A; 4N7O A; 3EOK B; 1JY7 B; 4MXK A; 3DHR B; 3G4Q A; 1IBE A; 1MYF A; 2ZLW A; 1FHJ A; 1YMC A; 3A0G A; 5B84 A; 5EYJ A; 1UFP A; 4MAX A; 1XY0 A; 1O1K A; 5ILR A; 1FDH A; 1V75 B; 1A9W E; 2ZS1 A; 2G3H A; 1MBC A; 1I3E A; 2BLH A; 1J7W B; 1CIO A; 1GJN A; 1Y5J B; 3G4U A; 1S69 A; 1Y7C B; 1ECN A; 1QSH B; 3UHB A; 3ZJS A; 1CH3 A; 1DTI A; 2W6W A; 2ZSQ A; 2ZSN A; 2ZS1 D; 3PEL B; 2GNV A; 5JDO E; 2H35 B; 2ZSX A; 3WHM B; 5C6E B; 2BNL A; 1JDO A; 3SDN A; 1EBT A; 1IWH A; 2HHD B; 3FH9 A; 4YU4 A; 3QJE B; 5KDQ B; 5KKK A; 2ZWJ A; 2D2N B; 3BOM A; 1J3Y A; 2VLZ A; 1BJE A; 2MYD A; 1MYM A; 2ZFB A; 1J7S A; 1J7Y B; 4N8T A; 1OBM A; 1R1Y B; 1YCA A; 1NQP A; 1YHR A; 2D5Z A; 4M4A A; 5CN6 A; 1BZ1 B; 3NMM A; 1UIW A; 1SI4 B; 1YHE A; 2W72 C; 2MGD A; 1AZI A; 2MBW A; 4M4B A; 1V4W A; 5HY8 A; 1CH7 A; 1SPG A; 3WCU A; 3UHD A; 1HBA A; 2O5Q X; 2HHE B; 4XS0 A; 3MVC A; 2EKU A; 3ZJJ A; 4UZV A; 2W6X A; 3LR7 A; 1G09 B; 1L2K A; 2YRS B; 1MLO A; 4NI0 B; 4ODC A; 2ZSO A; 1C7D B; 3WCU D; 1CG8 B; 4H0B A; 1C7B A; 5MBN A; 2AA1 A; 4FH6 A; 1YOI A; 4ZVA A; 1LH2 A; 3OZW A; 1JPB A; 2ZLU A; 4FWY A; 1X9F B; 3LB2 A; 3UH7 A; 1YEQ B; 1COH A; 1Y0C A; 3OK5 A; 2QU0 B; 1DXU A; 3MOU A; 2O58 X; 3BJ1 A; 2ZS0 C; 3AQ6 A; 1HDA A; 2H8F B; 1LH1 A; 1YOG A; 3AT5 A; 3RGK A; 3WCT A; 2R4W A; 1XXT A; 2FRI X; 1MWD A; 4B4Y A; 1Y31 B; 4ZVB A; 1A3N A; 1KR7 A; 4F4O A; 1Y83 B; 2ZT4 A; 4MQG A; 1PBX B; 2ZSY A; 4ROL B; 3NG6 B; 5CND A; 3WCT D; 3GQG A; 4F6D A; 2VHB A; 2NRL A; 1NAZ A; 2MGK A; 3K8B B; 1SDK B; 1A0Z B; 1G0A B; 2QLS A; 1YEN B; 1YVT B; 3WCV C; 1BIJ B; 1LFQ A; 1IDR A; 4PQC A; 2G11 A; 4HSW A; 3TM9 A; 3MJP A; 1YG5 B; 3UH3 A; 3SDH A; 3CIU B; 4N7N A; 1V4U B; 1Y5F A; 4QAU A; 3A59 A; 1DKE A; 1MYI A; 1PMB A; 5AB8 A; 4MQJ B; 2FRJ X; 1THB B; 4MQI B; 2PGH B; 1A6G A; 1QXD A; 4NI1 B; 3QM5 A; 1BZ0 A; 3PT7 A; 5JGG A; 1XQ5 A; 2LHB A; 1JP8 A; 3OVU C; 2HBF A; 2SPM A; 3IC0 A; 1Y4G A; 3WFX A; 2AUP A; 1BAB A; 2XYK A; 3WCW C; 1DXV A; 1GCW B; 1RSE A; 2W72 B; 1GZX B; 1I3D A; 1YEU A; 1Y09 B; 1MCY A; 1K1K A; 4OOD A; 1LFV B; 1LFT A; 1AJ9 A; 2HZ1 A; 1Y0D A; 3D1K A; 2EB9 A; 4U8U C; 3E5I A; 3ARJ A; 2ZLX B; 1YGF B; 2GRZ A; 1UT0 A; 4L2M A; 2C0K A; 5E29 B; 3FS4 A; 1Y46 A; 1O1L B; 1GCV B; 2DN1 B; 1Y85 B; 4FH7 A; 1VWT B; 1JEB A; 5CHR A; 2O5O X; 1A0U B; 4SDH A; 5JDO C; 4HSX A; 1BUW A; 1MOC A; 2LH1 A; 2OH8 A; 4JYQ A; 1YZI B; 1VRE A; 1Y8W A; 2O5L X; 4HRR A; 1LFY A; 4G1B A; 3MBA A; 111M A; 5SW7 A; 1CPW A; 3LB3 A; 4N7O B; 2QFK A; 1MLR A; 1A6K A; 2DXM A; 1MDN A; 2Z6S A; 3RJN B; 3PI8 A; 1WLA A; 105M A; 3MKB A; 1MBI A; 1YHU A; 4ROM A; 2MGF A; 1ABY A; 6HBW B; 1Y4Q B; 1Y7G B; 3GOU A; 4IRO B; 2MGH A; 2W6V A; 1HHO B; 1MNI A; 1G08 A; 1NXF A; 3W4U A; 1YHU D; 1GDK A; 2MHB A; 2V1I A; 2NRM A; 3WTG B; 3ZH0 A; 1MOB A; 1Y7Z B; 3D7O B; 1B0B A; 1A4F A; 1YCB A; 1Y5K A; 1M9P A; 1OUT A; 3R5I B; 3VRG B; 5M3S A; 2QSS B; 2DHB A; 2RAO A; 2VEB A; 1Y4R B; 2DN3 B; 3DR9 A; 2LH7 A; 1A01 A; 2DN2 A; 4H07 A; 3U3E A; 4H2L B; 1A00 A; 1S6A A; 102M A; 3LQD A; 1FDH G; 1YE0 B; 1CO8 A; 2MYE A; 3UHZ A; 2Z6T A; 5CNB A; 2VYY A; 2O5B X; 3WCW B; 3ODQ B; 3WR1 A; 2GKN A; 1O1J A; 3NMM B; 4YU3 A; 2ZSP A; 1HDB B; 2RI4 B; 4AVD A; 5CNE A; 5CHQ A; 110M A; 5B85 A; 3ZJO A; 3LHB A; 3AQ9 A; 4FWZ A; 3TLD A; 3GKT A; 1CH1 A; 4PNJ A; 1LFZ A; 109M A; 1O1O A; 4U8U B; 3H57 A; 5CN4 A; 3VRF B; 3BJ3 A; 1NGK A; 3G46 A; 1MKO B; 5KER B; 2MGB A; 1Y2Z A; 3LB1 A; 1QPW A; 1Y35 A; 1MYH A; 1NIH A; 3PI9 A; 3EDB A; 1N9H A; 2Z6N B; 1RPS A; 1GBU A; 2MB5 A; 1HAB B; 3ZJR A; 1MLG A; 1Y7D B; 1BIN A; 3QJB B; 4JAC A; 4O2G A; 3RJ6 A; 1FN3 B; 1H1X A; 1HBG A; 3IC2 A; 1YEO B; 2BWH A; 3UHG A; 1GDI A; 2XKG A; 1QI8 B; 3EU1 B; 101M A; 1UC3 A; 3P5Q B; 1YFF A; 2ZST A; 1Z8U B; 1VXE A; 3WCP A; 4MQH B; 1URV A; 5IKS A; 1HGA A; 1GLI A; 1QSI A; 4X0L B; 1CP5 A; 1HSY A; 2R80 B; 2D2M C; 2OIF A; 1MLQ A; 1Y4P B; 3PI2 A; 1MZ0 A; 1O1P B; 3V2Z A; 3VAU A; 3BA2 A; 2CMM A; 1YEV B; 2QSP A; 1FAW A; 1DXT B; 1ECD A; 1HBB B; 2MYC A; 3CY5 A; 4G51 B; 1S61 A; 4L7Y B; 2M6Z A; 1HGC A; 1CQ2 A; 1CG5 B; 4MQC A; 2HBC B; 1F5O A; 3S1J A; 1HBS B; 1BZZ B; 1YIH B; 2R4X A; 1OUU A; 1YH9 B; 1MBO A; 3UHX A; 1XZ7 A; 1RVW B; 3UH6 A; 2ZS0 A; 1G0B B; 4HRT B; 2G0Z A; 3ZJQ A; 1JZM A; 3D1A B; 1KD2 A; 1MLS A; 1NS9 B; 5E6E B; 1HGB B; 1HCO A; 1A3O A; 1Y8H A; 2PEG B; 3GDJ A; 3MYM A; 1D8U A; 4O4T A; 2ZS0 D; 5HBI A; 1XZV B; 3AG0 A; 1IRD B; 3ECX A; 1XYE A; 2ZLV A; 3ZOM A; 1FCS A; 1VXA A; 2B7H B; 2HBS A; 4FC3 B; 1R1X B; 1V9Q A; 2W6Y A; 3WFW A; 3QJC B; 1AJ9 B; 1MBD A; 3A5B A; 1HDS B; 1MYJ A; 1BZR A; 1Q1F A; 1O1I A; 1DWR A; 1V4X B; 3HEN A; 4TWV A; 3WCV A; 5EUI A; 1DO7 A; 2HBE A; 2MGJ A; 1HJT A; 1YE2 A; 1C40 B; 2HHB A; 1LH5 A; 1O1N A; 2ZFO C; 1Y45 B; 3DUT A; 1N9I A; 3V2V A; 4OF9 A; 3OJ1 A; 3QJD A; 2E2Y A; 2ZLT B; 1O1M A; 1DLW A; 1Y01 B; 2Z8A A; 1JEB B; 1O16 A; 1T1N A; 1OR6 A; 3AQ7 A; 4NXA A; 1MTJ A; 1BUW B; 2W31 A; 4N7P A; 108M A; 4WJG A; 1IT3 A; 4MQK B; 1Y22 A; 1YGD B; 1RTE A; 3AT6 A; 2FRK X; 2MGC A; 2AUQ A; 2GRF A; 1N9X A; 2R50 A; 1LTW A; 5EU2 A; 1XZ4 B; 1ABY B; 4F6B A; 1LJW A; 1JL7 A; 3UHC A; 1JP6 A; 1XZ2 A; 2D2M B; 1S5Y A; 3ARL A; 1MWB A; 2R4Z A; 3GLN A; 3O7N A; 5CN7 A; 1S0H A; 2D5X A; 6HBI A; 1XZU B; 4NK2 A; 1MYG A; 1W92 A; 2MGM A; 106M A; 1YVQ B; 2HCO A; 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3HC9 A; 1J7W A; 1J41 A; 2R1H B; 1Y5J A; 1Y4B B; 1Y7C A; 3GQR B; 1NWN A; 3WCU C; 1GLI B; 2LH3 A; 2LH6 A; 3PEL A; 2OH9 A; 2H35 A; 2ZSZ A; 1Y4V B; 3WHM A; 5C6E A; 4DWU A; 1Y0W B; 1C7C B; 3HHB B; 1GBV B; 1NPG A; 1HRM A; 5CN5 A; 2D60 B; 2O5M X; 2EB8 A; 5EE4 D; 1J3Z B; 2HHD A; 3QJE A; 5KDQ A; 4NXC A; 4TWU A; 2D2N A; 1M6M A; 2V1F A; 3NL7 B; 1Y8I B; 104M A; 2WTG A; 1J7Y A; 1A6N A; 2DC3 A; 1IBE B; 2R4Y A; 2G0V A; 4NZI A; 1R1Y A; 1JF4 A; 2ZLW B; 2D2N D; 1VXC A; 1GDJ A; 1CP0 A; 2G10 A; 1FHJ B; 3A0G B; 1BVD A; 1BZ1 A; 1VXH A; 3UI0 A; 1XY0 B; 2XKI A; 1O1K B; 1SWM A; 2ZT2 A; 1SI4 A; 2ZS1 B; 1MNO A; 1ECO A; 1JP9 A; 2HHE A; 1MLM A; 1WVP A; 4AVE A; 1NWI A; 3UGZ A; 4NI0 A; 3AQ5 A; 4KN3 A; 1C7D A; 1EMY A; 5F2A A; 1CG8 A; 1IWH B; 3FH9 B; 4YU4 B; 3KMF C; 2KSC A; 1X9F A; 2HHB B; 3BOM B; 1J3Y B; 1YEQ A; 3AQ8 A; 2QU0 A; 2ZFB B; 1TU9 A; 1J7S B; 2H8F A; 4N8T B; 3PI4 A; 4PQ6 A; 1T1N B; 1X9F D; 1HLM A; 1NQP B; 4DWT A; 1YHR B; 2D5Z B; 3M3A A; 4M4A B; 1ABW A; 1CQX A; 3QZX A; 1UIW B; 1MLN A; 2ZT1 A; 1MOH A; 2GL3 A; 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