4U97A

Crystal structure of asymmetric irak4 dimer
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
293
structure length
272
Chain Sequence
HSFSFYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLAALKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGINFLHENHHIHRNIKSANILLDEAFTAKISDFGLATVMTSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDKKMNDADSTSVEAMYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQEMT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title IRAK4 Dimerization and trans-Autophosphorylation Are Induced by Myddosome Assembly.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Interleukin-1 receptor-associated kinase 4
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 272
sequence length 293
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2014-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4u97A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4u97A01
4PPBA 5KE0A 2VRXA 3UZRA 3GQIA 4QP3A 5HNGA 3VW6A 4DEBA 4EK5A 5L6WL 3HV7A 3OOMA 1P2AA 5M4FA 2WAJA 3DXPA 1JSTA 3EL7A 5DFPA 3UPXA 1OB3A 1CKPA 2QR7A 3OW4A 1OL5A 4FV0A 5CAVA 5IA2A 3CQEA 3TZ7A 4FKUA 1BYGA 3AXWA 4E6AA 3KN5A 3ZC6A 4AG8A 4HVIA 2G2HA 4PDYA 4A9TA 1SZMA 4E6DA 4P4CA 4RFMA 2P2HA 4L3LA 2I0EA 3LMGA 4DEEA 5CVHA 4AOJA 2BMCA 2NO3A 3OS3A 3FPMA 4QPSA 3KF7A 5CNOA 3ZXTA 3QD4A 1I44A 1IAJA 2IVUA 5FP6A 4JBQA 4ENXA 4MWHA 4EH7A 5KKRB 4OTWA 5KUPA 5L8LA 1J7LA 4AP7A 4C2WA 4D5HA 4QMPA 3FXXA 2Z7LA 2YISA 5I9XA 5AUXA 3E5AA 5IU2A 4M13A 3FMDA 3CBLA 3V8WA 3FLYA 3MA6A 4BDAA 4JLCA 4TL0A 4F64A 3FPQA 3CE3A 3WILA 4YJNA 1H28A 4YHFA 1FMKA 4JG6A 3AC1A 3PPZA 4O6EA 2PZYA 3GP0A 4HNFA 4U0IA 3ODZX 1YOMA 2YERA 3PFQA 2B53A 2BIKB 4EEVA 2IZRA 3D2KA 4UZHA 1TQIA 3ORPA 4G3GA 2RKUA 4H3QA 3TZMA 3EL8A 2GTNA 4ZY4A 5AV4A 2PUNA 3LCSA 4HZSA 4ZTNA 5DT0A 4XJ0A 4IAYA 4DH8A 2H34A 3NAYA 4FIFA 4GRBA 4Y85A 5FEDA 5AAFA 1LEZA 4ZSGA 3ZTXA 3UC3A 1YRPA 4AUAA 3FLWA 4YP8A 4YTCA 4ANNA 3Q2MA 3QHWA 3TKHA 2JDSA 4L53A 4JBPA 4TW9A 4ZSEA 2C3KA 5HE0A 2LAVA 1WBVA 1ZRZA 2VWBA 4I5MA 5I3OA 3WYXA 2X6DA 2QOIA 2IWIA 3NS9A 4U80A 4QPMA 3ZO4A 4O2PA 3FI2A 3OWJA 3QAME 3VBXA 5BYYA 5AX3A 3RAWA 3VUMA 2HENA 2PPQA 3AC4A 2X8DA 3EQCA 4RC4A 4F4PA 5HBJA 3E8CA 1JPAA 5AP0A 4A9UA 1QPJA 5L3AA 1MQ4A 1XQZA 3KRXA 2QO2A 3OUKA 3L8XA 2JIUA 5CLPA 3L9MA 3JR1A 2YABA 3WZUA 4I1ZA 4D0XA 4F99A 4YNEA 4ZZNA 2JDTA 2VTLA 3F6XA 4BDDA 5E9EA 3D4QA 1Y57A 2OK1A 4K9YA 4O6LA 3MIAA 3F2NA 5J95A 4F6SA 5CY3A 5AR5A 3RK7A 4QPAA 3EFJA 4GFOA 4PTEA 1DAWA 3U87A 3DQXA 5FG8A 1JSVA 1Q3DA 3F3ZA 4FKVA 4JDJA 4BI2A 2HIWA 1FGIA 4EH4A 5J7HA 1YDSE 2FB8A 3PE1A 3TI1A 4P5QA 3NNXA 1PKGA 3TZ9A 4NK9A 2GDOA 4UMTA 2G1TA 2P0CA 4CFUA 1WMKA 5EM8A 2F4JA 5DYJA 1J91A 3GOKA 3E8DA 1SMHA 3A7IA 5FD2A 1A48A 3MW1A 5I3RA 4LV5A 4DTKA 3LXLA 2QOKA 2E9NA 3A7FA 5DLSA 4JG8A 4HJOA 5BNJA 3BLQA 3HKOA 4JVGA 2C5VA 5E8WA 4NZWB 2ZB0A 5E8UA 4FVQA 4YTIA 2ITOA 4XRJA 1O6YA 4KKEA 2ZMDA 4ZTLA 2ITTA 1Y91A 4TYEA 3BI6A 4MXOA 1PYXA 2NNWB 2I0YA 3Q53A 4RVMA 1E1VA 1UU7A 1ZOHA 2AYPA 2XK7A 3RPSA 3LFCA 2CKPA 3KMWA 2EVAA 3MH1A 4QQ5A 4EKLA 1PMNA 4R8QA 5J9LA 3FI3A 4BHZA 1W8CA 4CSVA 5IQHA 4IMYA 4DG3E 2WQMA 1IRKA 1U5QA 1KE6A 4FI1A 4ASZA 5AA9A 4FNWA 4DINA 4JL9A 4R78A 1PY5A 4E8AA 2JKMA 4AA5A 2OH0E 5M51A 2XRUA 4I6HA 5C27A 4KUJA 3NR9A 4EJ7A 5FLFA 2PE1A 3ZHPC 4D1SA 2BRGA 4HPUE 1G5SA 2PMLX 3F5GA 4W4XA 5H8GA 4UEUA 2ZMCA 5HHWA 5EDPA 4FG9A 2UW3A 2WHBA 3PG3A 4FTAA 3JY9A 4R5SA 4ACCA 1VZOA 4KIQA 2PVHA 4EHVA 3LXKA 5HICA 4C4IA 1YI6A 5DMZA 4K6ZA 4UXQA 4FT3A 4BCHA 1WAKA 4ZK5A 4FIEA 5K0KA 4QYGA 5FDPA 3G33A 3VWAA 3WF5A 4WSQA 3ZO1A 4FOBA 5JRSA 2VNYA 5IH6A 2YZAA 3V51A 4EHGA 2R7IA 3D5UA 3CTHA 2C6IA 2R3RA 2PUIA 1PMUA 2XYNA 2Y6OA 3NYXA 5ANOA 3R1YA 5AP3A 3UNKA 4M68A 5AEPA 5L2TA 3OP5A 4FKSA 1WFCA 3GC9A 1PHKA 3CGFA 4J8NA 4DH7A 5ITAA 4A4LA 3FMJA 3ZSHA 4DN5A 3WYYA 2W9FB 2WOTA 4FT7A 1M17A 3AD4A 3KRLA 4B4LA 3AT2A 4A9SA 3DBEA 3SVVA 3I6UA 2YCFA 4EWQA 3ZU7A 3ZMMA 3TL8A 1JNKA 2OBJA 1SVGA 4KSQA 4DFZE 5DT3A 4F63A 3HMNA 3RWQA 4EH6A 4G6NA 4HVDA 5IQBA 1BX6A 5AV1A 4FGRA 4QYEA 3U6IA 4I4FA 5A9UA 1KE9A 4QT1A 3O2MA 4YJVA 3VS2A 3R04A 5CAOA 3U9CA 5FEEA 5CWZA 3CC6A 2OF4A 1URCA 3HV6A 4PDOA 2QKWB 1UWHA 3FZTA 3VS5A 5I4NA 2OZAA 3LAUA 5AP7A 2JIVA 2X2MA 5LVLA 4E6QA 4QMZA 2W1CA 3D9VA 3QCQA 4XS2A 4UB7A 3LVPA 3R02A 5TO8A 2NRYA 4I6QA 5C4LA 5E92A 3VRZA 3NW5A 3NMUF 3VS4A 3MYGA 3R71A 3BEAA 3COHA 1OUYA 4NL0A 4RBLA 5CNNA 1IAHA 1MQBA 3C4FA 4C62A 2YIQA 3W8LA 4YC8A 3HA6A 3Q5IA 4ORKA 3C5IA 3ZZWA 4P5ZA 4BN1A 5GZ8A 3GUBA 4YBJA 2C1AA 3NRMA 2WMQA 4BGGA 3QWKA 4S31A 3C51A 3P08A 5IA1A 4YURA 3GOPA 3ZBFA 2C69A 2R0UA 1YXXA 4B6LA 4JI9A 4AF3A 1PXIA 2ZDTA 4BCMA 4U97A 4AZFA 4OTIA 1PJKA 4Z7HA 4PNIA 3G90X 3F66A 4FOCA 4O38A 3VS3A 4QP7A 4KKGA 1AD5A 4PTGA 3QTQA 2QU5A 2VTPA 4QTDA 3HMIA 4DLJA 3OOGA 1PKDA 4ZIMA 4M66A 3OCTA 5LWNA 3OMVA 2B9JA 4FSQA 4U5JA 4BZOA 3MPTA 3LZBA 3UVPA 3R2BA 2VTTA 3SX9A 3UZPA 4A4XA 5JKGA 2Z02A 3BZ3A 1BI8A 2UZLA 4FZAB 2BKZA 2XM9A 3UIMA 2BILB 3OROA 3BYSA 2OZAB 4C35A 5TOZA 5KCVA 2UW6A 3MH2A 2J5EA 2V7AA 4DEDA 2C5NA 4FVPA 5AR8A 3VHEA 2C1BA 2EXMA 4Y95A 2QC6A 5HVJA 4BTFA 3FXZA 4L43A 2G01A 3DJ5A 2F7EE 5A6OA 2PZIA 1IA8A 3GCSA 3T3UA 4O7RA 3AMAA 3DZOA 2Y9QA 4EI4A 3LFQA 5B2KA 5BVOA 3VUDA 4WT6A 3U55A 3HYHA 3LLTA 4YNOA 3CJGA 4NT4A 2BCJA 2FUMA 2Y8OA 3DKCA 3Q5ZA 4Y73A 5HD7A 3RCJA 1YXUA 2O3PA 4GVAA 4MBJA 4BKZA 3DXQA 4NSTA 2XKFA 3FWQA 3F3UA 4O7VA 1GZNA 2GSFA 3Q6UA 4XLVA 3ROCA 3DNEA 3DKGA 4A9YA 3Q2JA 1XWSA 4QTBA 5K5XA 3P86A 4GFMA 3SDJA 4IAAA 1PXPA 1PXJA 3UQFA 2WMUA 4AE6A 3SA0A 4L7SA 2BHEA 4CRLA 3I6WA 4U3ZA 4UBAA 2HZNA 5HO6A 1OGUA 1U5RA 5EM6A 2QHNA 3B8RA 3CY2A 5AA8A 4OW8A 3LJ0A 4F7JA 5L8KA 5BMMA 4CKRA 3WF8A 4NWMA 4UMPA 3RK9A 3W8QA 4F0IA 1XHAA 3THBA 2P33A 3AD5A 5D11A 4RIYB 4DH1A 3KXZA 3UO6A 1FINA 1H1SA 2UZDA 3RK5A 3VNTA 3N51A 2GFSA 4L01A 3RWPA 4F9BA 4O1OA 5CU6A 1X8BA 3DZQA 3COIA 2JDVA 3LM0A 2R2PA 3FKLA 2XP2A 3GB2A 2XJ1A 5JH6A 1DM2A 5AUYA 3BGPA 3EIDA 1DI9A 4HVGA 5M08A 5A4QA 3QXOA 2DS1A 1VJYA 5HZNA 4QP2A 2GQGA 3QTIA 3TNPC 3EZVA 3WF7A 4RLLA 1YOJA 4S34A 4WD5A 3RHXA 3DBFA 4GUBA 2QD9A 3QD2B 4IWPA 4NKAA 2OXDA 4YLJA 3R7UA 4A07A 1J1BA 2W5AA 3HV4A 5D9HA 2W5HA 2ZM1A 2BUJA 2OJFE 4BF2A 4ZJVA 3OHTA 3MWUA 3W2OA 4O83A 3L9NA 5L2SA 2JDOA 5LQFA 5JFWA 4FIGA 3DB8A 4C02A 4L67A 4EOOA 4DG2E 2QOCA 3AG9A 5BUJA 4D28A 2CHLA 2XH5A 4QNAA 3NSZA 1M7QA 5BVDA 4M14A 4RWKA 4ZJJA 3GT8A 3I0QA 4Q2AA 4QQCA 3PJ8A 3PRIA 5BQ0A 2WMTA 2IZUA 4RIXA 4E93A 2WXVA 3C4WA 2J0JA 2QLQA 3G0FA 3RM6A 4NW6A 5JGDA 3PVBA 5LMBA 2JAVA 3FI8A 3EN6A 4ZSJA 3E7OA 3FMHA 5HOAA 5JFSA 1YWVA 4JQEA 1B39A 2OWBA 1MRVA 2OH4A 3A8WA 5C01A 3VS6A 4W4VA 5AIRA 3EFLA 5AADA 5IPJA 5M07A 4D2RA 1LP4A 3L1SA 3UE4A 4R3CA 4C37A 4RJ8A 2VV9A 2QQ7A 3Q4CA 2X8IA 3GU7A 3NNUA 4NEUA 4EQUA 4FE2A 2QO9A 2I6LA 2Y4IC 3FKOA 2C6TA 4IH8A 4JBOA 4RJ5A 5EI2A 3D83A 3WBLA 4KINA 5KMLA 1H0VA 3TUBA 1OUKA 3F69A 4BDEA 3OZ6A 4E4MA 3MB7A 3CKXA 4QTAA 3UMXA 3W18A 4BIEA 5GINE 5EH0A 3CQWA 3P7BA 4DGNA 5AUVA 5KHWA 4ZTHA 4K0YA 2C3IB 2BHHA 5JQ8A 5KO1A 5LOHA 4FSRA 4GJ2A 4JT3A 1B38A 3RAHA 4IX4A 3UVQA 1YXSA 2I40A 4BIBA 2BDWA 4BR3A 1YOLA 4E7WA 5JK3A 4FV4A 3I81A 1HCKA 1O6KA 3MTLA 3C7QA 3QLGA 4I5CA 3U8WA 4RX8A 4CFWA 1M7NA 3KXGA 4ONAA 3PYYA 4IAZA 1XH6A 5HGIA 1G3NA 4RC3A 3BBTB 5HX8A 2EB3A 4W8DA 4DH5A 4YTHA 1KV2A 1JLUE 4Z16A 1V1KA 3NUPA 3LJ2A 1OBDA 4A9RA 2X2LA 3FL5A 5IKWA 2C5XA 2XCHA 5I9ZA 4IACA 4CZYB 5CSPA 3HRBA 4RIXB 4JQ8A 3ZOSA 5E4HA 1H1WA 3PWDA 4O0SA 2OJ9A 3FMLA 3PY1A 3PVWA 4M69A 1GIHA 4QP4A 3G6HA 5CTPA 4E5WA 4J71A 3GFEA 4MQ2A 5BUEA 5ANEA 2PVLA 4XX9A 4C4GA 2VGOA 5HG5A 4BFMA 3FZOA 4QYFA 1H00A 3CPCA 4Z3VA 2XKEA 3QQHA 2X8EA 3H9FA 4X2FA 4ITHA 2PK9A 3MVLA 4ANSA 1CKJA 3NCZA 2WELA 4L00A 2R5TA 4TT7A 3UG1A 2VWIA 1Q8UA 3TNWA 4O7NA 4C3FA 2I7QA 2NPQA 3I79A 5F94A 3IW5A 3KFAA 4TPTA 4DFLA 4RJ6A 5AP2A 5DT4A 4XV1A 1AGWA 4OTGA 2VO7A 5B7VA 5J87A 2CNVA 5IQIA 4KD1A 4O7ZA 5EQEA 4EK3A 3ZRMA 4MF0A 4UYNA 3ZM4A 4X21A 5K9IA 2ZB1A 1NA7A 3AGLA 3RI1A 1BMKA 4X0MA 2Y4IB 1LR4A 3JVRA 1F3MC 4GCJA 4O0YA 3UGCA 3QWJA 3PSDA 4PP9A 4BYIA 4O7WA 2R3IA 3VF8A 3EQBA 5B2MA 1GNGA 4R7HA 3R30A 1Y8YA 4BDBA 1FVRA 3VO3A 3O8TA 4FKJA 4QRCA 5EHLA 2J9MA 1XO2B 3P78A 4O21A 4J97A 4O7LA 4E3CA 4AW1A 5HTBA 4WIHA 3RCDA 3RM7A 2QG7A 1LUFA 4EYJA 2B0QA 4QMQA 2PVJA 2WQBA 5M4UA 4IZYA 3SHEA 3IW4A 3TDVA 5FWKK 3ZSGA 1Q8YA 1ZLTA 3PA3A 2BFYA 3PSBA 3T8OA 3W2PA 1JVPP 3W1FA 4F0GA 2PULA 1ZYCA 4DLIA 3LFSA 4CRSA 1JKSA 2HXLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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