4UIWA

Bromodomain of human brd9 with n-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)-5-ethyl-4- oxo-7-3-(trifluoromethyl)phenyl-4h,5h-thieno-3,2-c-pyridine-2- carboximidamide
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
101
structure length
101
Chain Sequence
b'STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Discovery of I-Brd9, a Selective Cell Active Chemical Probe for Bromodomain Containing Protein 9 Inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 9
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 37
structure length 101
sequence length 101
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4uiwA00
4NQNA 4A9LA 5JWMA 2D82A 3DAIA 4O74A 5CQ4A 4NXJA 4QR4A 5BT3A 5FE1A 3UV4A 5D3NA 4UIYA 4N4FA 4XUBA 4PTBA 2GRCA 4ZC9A 5A5SA 4A9OA 5FBXA 3GG3A 4TT2A 4N3WA 2YDWA 4UIWA 4YYMA 2YEKA 4OGIA 5KO4A 4NRCA 5D3RA 4MEOA 4OUFA 5FE4A 5HFQA 3P1DA 3MQMA 4PS5A 4XUAA 5I7XA 3SVGA 4Z6IA 4QSSA 5A5OA 5LVRA 5FE9A 3LQJA 5E9IA 3UVXA 4QSVA 4HXMA 5F36A 2MJVB 5EWVA 4QYDA 4LZSA 5EV9A 2YYNA 4N4GA 4NR6A 4UYGA 3LQHA 5ENFA 3G0JA 5AMFA 5E9MA 5K29A 5LKUA 2WP1A 5CQTA 4Z93A 5E0RA 2E3KA 4TT6A 5EWWA 5CUGA 4QSUA 4UITA 5I29A 5G4RA 4UIUA 3JVKA 5FH8A 5IBNA 5H1VA 3HMEA 3U5PA 2L85A 1N72A 4Z1SA 1WUMA 4KCXA 4LRGA 4QYLA 3U5JA 5L98A 5CQAA 5F5ZA 1F68A 2DWWA 4O76A 5I7YA 3O34A 2DKWA 5C8GA 3SVHA 3AADA 5FE8A 4NR9A 5CQ3A 5ACYA 2DATA 3O37A 4QR3A 5EP7A 4CURA 5H85A 5HELA 4MR5A 5DFCA 1JM4B 4O7BA 4NRAA 5EWHA 4A9HA 4NR8A 5CPEA 4KV1A 2F6JA 5I89A 5LUUA 3NXBA 2L84A 4YH4A 3IU5A 4YH3A 4J0RA 5DFBA 5HEMA 5FE2A 5ENGA 4LC2A 5FH7A 4NYVA 2F6NA 4IR5A 5TCMA 5D0CA 4F3IA 4HXLA 5DW1A 3QZSA 5F3AA 4BHWA 5ENJA 4NYXA 5L97A 3MB4A 4NUCA 5EWDA 4HBXA 5FB1A 5AD2A 5HLSA 3LQIA 3DWYA 2N9GA 4QNSA 5FE6A 5FB0A 5DYCA 5LVQA 3O36A 4YY6A 5DYAA 4PCEA 4A9EA 5DFDA 4BW4A 4MR4A 5D24A 4CUUA 2DVQA 4MEQA 4CUSA 5AD3A 3TLPA 5FFVA 5CTLA 4A9FA 3P1CA 2NXBA 5E9VA 5C85A 5A5QA 2YQDA 5DLZA 4UYFB 5DKHA 5H1TA 5ENBA 3AQAA 4TQNA 4HXSA 4NR5A 5L8UA 4IOQA 5EPRA 2DVSA 5A82A 4Y03A 3UV2A 2RS9B 5ENEA 4Z1QA 4PKLA 2H60A 1JSPB 2YW5A 4ALHA 5CQ6A 4YBMA 5I88A 4NR7A 5JI8A 4O75A 4J0SA 5C4QA 4NQMA 4O78A 5C7NA 4PY6A 4C67A 2I8NA 2KTBB 4QUUA 4MR3A 5A5PA 5LJ2A 5KU3A 1E6IA 4QSQA 5ENCA 5EWCA 4YK0A 3RCWA 5CZGA 5A5RA 4UYDA 5F60A 5D25A 3UVWA 4QSWA 3LJWA 4N4HA 3U5NA 5H1UA 4TYLA 5DX4A 5DW2A 3HMHA 4QEWA 3ONIA 4YC9A 4AKNA 5BT5A 4QC3A 5HM0A 2OSSA 2D9EA 5FG5A 4E96A 2LSPB 5DBMA 4YYHA 5D7XA 5D26A 5CS8A 4ZW1A 4ALGA 5ENIA 4YATA 5C87A 5EQ1A 5E73A 3U5KA 5CQ7A 4O77A 4QSXA 5HRWA 5FE5A 4PCIA 5FFWA 2R10A 5IGMA 4FLPA 4RVRA 5F25A 3MULA 2R0SA 5LKXA 4TU4A 4A9KA 5I80A 2OO1A 2R0VA 5EM3A 4Q0OA 3UW9A 3U5LA 3MB3A 4QC1A 4XY9A 4A9NA 2E7NA 3LXJA 5I83A 5A5NA 4QUTA 5DY7A 5A85A 5HCLA 3D7CA 5IG6A 4IR6A 5E3DA 3Q2EA 4HXOA 4WHUA 3P1FA 3MUKA 4HXKA 3Q2FA 5FH6A 5EI4A 2I7KA 1WUGA 4NUDA 4CFLA 4LYSA 5I40A 5HRXA 5C89A 5DKCA 5DYUA 4TZ2A 5I86A 5LJ1A 4XY8A 4Z6HA 5I1QA 3QZVA 5KTUA 4IR3A 4UIZA 2RI7A 4HBYA 4QSRA 5II2A 5FDZA 4MR6A 2RO1A 5G4SA 5COIA 5CUBA 2RNXA 4IR4A 3UVYA 4TU6A 5D3LA 4CUPA 5HRVA 4NUEA 3JVLA 3ZYUA 4X2IA 4XYAA 5ETBA 3IU6A 3JVMA 3O33A 5D3HA 5LKZA 4YYGA 4QY4A 4HBWA 4NRBA 5F2PA 1EQFA 5E3GA 5TB6A 5EPBA 5E9KA 3JVJA 5A81A 5F1LA 2YEMA 4IOOA 5KTXA 5DKDA 4QBMA 5J0DA 4KV4A 4GPJA 4O7FA 4OGJA 4YBTA 4YYIA 3G0LA 5EPSA 4WIVA 5EVAA 3P5OA 4BJXA 4YYKA 5LKTA 4TTEA 5L8TA 5DLXA 5HQ5A 5CP5A 4QB3A 3P1EA 4UYHA 4YYJA 4LR6A 4HXNA 3I3JA 4TZ8A 2RNYA 5E9YA 5LJ0A 5E7DA 4QR5A 2YELA 4A9MA 5FE0A 1ZS5A 5HENA 4HBVA 5IGLA 4LDFA 5A7CA 4LZRA 4HXRA 4O72A 5BT4A 5L99A 5F61A 3S92A 4YADA 4O7CA 5D3JA 5ENHA 4YAXA 5A83A 4YABA 3K2JA 2RFJA 5F62A 4TS8A 4BW1A 2E7OA 5FE3A 4A9IA 4QEUA 4LYWA 5KTWA 5D3SA 4TT4A 4DONA 3FKMX 4O7EA 4O7AA 5CUEA 5EU1A 3U5MA 5FG4A 4CLBA 5CQ8A 5II1A 5D3TA 4ZQLA 5HJCA 4C66A 4YYNA 2DVVA 5CFWA 4UYEA 4NYWA 5CY9A 2OUOA 4MEPA 4O70A 5L96A 4A9JA 5FFYA 4CUQA 4CUTA 5CU8A 4YBSA 4YY4A 2RNWA 5IGNA 4QEVA 4J1PA 4LYIA 1X0JA 5CQ5A 5EGUA 5KHMA 3S91A 5FG6A 5EA1A 4BW2A 5CUAA 4N4IA 4J3IA 5CUDA 4QZSA 5AMEA 4UYFA 4WHWA 5CGPA 5EICA 5EISA 5DYXA 2R0YA 3QZTA 5CRZA 5CRMA 5IIDA 5HQ7A 2G4AA 5HQ6A 2L5EA 4CFKA 5F1HA 2WP2A 5E9LA 3MXFA 3HMFA 4QSTA 5E74A 4LZ2A 4UIVA 5FE7A 4Q0NA 5D3PA 2FSAA 3O35A 5IGKA 4MENA 5HFRA 3UV5A 5F63A 4NS5A 4O71A 4IORA 3UVDA 2DVRA 3U5OA 4BW3A 3SVFA 5CUCA 4QSPA 5EK9A 4CL9A 5ETDA 4HXPA 4UIXA 4NR4A 4YYDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NQNA 4A9LA 5JWMA 2D82A 1PUOA 3DAIA 4O74A 5CQ4A 4NXJA 4QR4A 5BT3A 5FE1A 3UV4A 5D3NA 4UIYA 4N4FA 4XUBA 4PTBA 2GRCA 4ZC9A 5A5SA 4A9OA 5FBXA 4AKHA 3GG3A 4TT2A 4N3WA 2YDWA 4UIWA 4YYMA 2YEKA 4OGIA 5KO4A 4NRCA 5D3RA 4MEOA 4OUFA 5FE4A 5HFQA 3P1DA 3MQMA 4PS5A 4XUAA 5I7XA 3SVGA 4Z6IA 4QSSA 5A5OA 5LVRA 5FE9A 3LQJA 5E9IA 3UVXA 4QSVA 4HXMA 5F36A 2MJVB 5EWVA 4QYDA 4LZSA 3D1BA 2YYNA 5EV9A 4N4GA 4NR6A 4UYGA 3LQHA 5ENFA 3G0JA 5AMFA 5E9MA 5K29A 5LKUA 2WP1A 5CQTA 4Z93A 5E0RA 2E3KA 4TT6A 5EWWA 5CUGA 4QSUA 4UITA 5I29A 5G4RA 4UIUA 3JVKA 4AI6A 5FH8A 5IBNA 5H1VA 3HMEA 3U5PA 2L85A 1N72A 4Z1SA 1WUMA 4KCXA 4LRGA 4QYLA 3U5JA 5L98A 5CQAA 5F5ZA 1F68A 2DWWA 4O76A 5I7YA 3O34A 2DKWA 5C8GA 3SVHA 3AADA 5FE8A 4NR9A 5CQ3A 5ACYA 2DATA 3O37A 4QR3A 5EP7A 4CURA 3VKGA 5H85A 5HELA 4MR5A 5DFCA 1JM4B 4O7BA 4NRAA 5EWHA 4A9HA 4NR8A 5CPEA 4KV1A 2F6JA 5I89A 5LUUA 3NXBA 2L84A 4YH4A 3IU5A 4YH3A 4J0RA 5DFBA 5HEMA 5FE2A 5ENGA 4LC2A 5FH7A 4NYVA 2F6NA 4IR5A 5TCMA 5D0CA 4F3IA 4HXLA 5DW1A 3QZSA 5F3AA 4BHWA 5ENJA 4NYXA 5L97A 3MB4A 4NUCA 5EWDA 4HBXA 5FB1A 5AD2A 5HLSA 3LQIA 3DWYA 2N9GA 4QNSA 5FE6A 5FB0A 5DYCA 5LVQA 3O36A 4YY6A 5DYAA 4PCEA 4A9EA 5DFDA 4BW4A 4MR4A 5D24A 4CUUA 2DVQA 4MEQA 4CUSA 5AD3A 3TLPA 5FFVA 5CTLA 4A9FA 3P1CA 2NXBA 5E9VA 5C85A 5A5QA 2YQDA 5DLZA 4UYFB 5DKHA 5H1TA 5ENBA 3AQAA 4TQNA 4HXSA 4NR5A 5L8UA 4IOQA 5EPRA 2DVSA 5A82A 4AKGA 4Y03A 3UV2A 2RS9B 5ENEA 4Z1QA 4PKLA 2H60A 1JSPB 2YW5A 4ALHA 5CQ6A 4YBMA 5I88A 4NR7A 5JI8A 4O75A 4J0SA 5C4QA 4NQMA 4O78A 5C7NA 4PY6A 4C67A 2I8NA 2KTBB 4QUUA 4MR3A 5A5PA 5LJ2A 5KU3A 1E6IA 4QSQA 5ENCA 5EWCA 4YK0A 3RCWA 5CZGA 5A5RA 4UYDA 5F60A 5D25A 3UVWA 4QSWA 3LJWA 4N4HA 3U5NA 5H1UA 4TYLA 5DX4A 5DW2A 3HMHA 4QEWA 3ONIA 4YC9A 4AKNA 5BT5A 4QC3A 5HM0A 2OSSA 2D9EA 4AKIA 5FG5A 4E96A 2LSPB 5DBMA 4YYHA 5D7XA 5D26A 5CS8A 4ZW1A 4ALGA 5ENIA 4YATA 5C87A 5EQ1A 5E73A 3U5KA 5CQ7A 4O77A 4QSXA 5HRWA 5FE5A 4PCIA 5FFWA 2R10A 5IGMA 4FLPA 4RVRA 5F25A 3MULA 2R0SA 5LKXA 4TU4A 3D1DA 4A9KA 5I80A 2OO1A 2R0VA 5EM3A 4Q0OA 3UW9A 3U5LA 3MB3A 4QC1A 4XY9A 4A9NA 2E7NA 3LXJA 5I83A 5A5NA 4QUTA 5DY7A 5A85A 5HCLA 3D7CA 5IG6A 4IR6A 5E3DA 3Q2EA 4HXOA 4WHUA 3P1FA 3MUKA 4HXKA 3Q2FA 5FH6A 3ERRA 5EI4A 2I7KA 1WUGA 4NUDA 4CFLA 4LYSA 5I40A 5HRXA 5C89A 5DKCA 5DYUA 4TZ2A 5I86A 5LJ1A 4XY8A 4Z6HA 5I1QA 3QZVA 5KTUA 4IR3A 4UIZA 2RI7A 4HBYA 4QSRA 5II2A 5FDZA 4MR6A 2RO1A 5G4SA 5COIA 5CUBA 2RNXA 4IR4A 3UVYA 4TU6A 5D3LA 2EJNA 4CUPA 5HRVA 4NUEA 3JVLA 3ZYUA 4X2IA 4XYAA 5ETBA 3IU6A 3JVMA 3O33A 5D3HA 5LKZA 4YYGA 4QY4A 4HBWA 4NRBA 5F2PA 1EQFA 5E3GA 5TB6A 5EPBA 5E9KA 3JVJA 5A81A 5F1LA 2YEMA 4IOOA 5KTXA 5DKDA 4QBMA 5J0DA 4KV4A 4GPJA 4O7FA 4OGJA 4YBTA 4YYIA 3G0LA 5EPSA 4WIVA 5EVAA 3P5OA 4BJXA 4YYKA 5LKTA 4TTEA 5L8TA 5DLXA 5HQ5A 5CP5A 4QB3A 3P1EA 4UYHA 4YYJA 4LR6A 4HXNA 3I3JA 4TZ8A 2RNYA 5E9YA 5LJ0A 5E7DA 4QR5A 2YELA 4A9MA 5FE0A 1ZS5A 5HENA 4HBVA 5IGLA 4LDFA 5A7CA 4LZRA 4HXRA 4O72A 5BT4A 5L99A 5F61A 3S92A 4YADA 4O7CA 5D3JA 5ENHA 4YAXA 5A83A 4YABA 3K2JA 2RFJA 5F62A 4TS8A 4BW1A 2E7OA 5FE3A 4A9IA 4QEUA 4LYWA 5KTWA 5D3SA 4TT4A 4DONA 3FKMX 4O7EA 4O7AA 5CUEA 5EU1A 3U5MA 5FG4A 3VKHA 4CLBA 5CQ8A 1ZKRA 5II1A 5D3TA 4ZQLA 5HJCA 4C66A 4YYNA 2DVVA 5CFWA 4UYEA 4NYWA 5CY9A 2OUOA 4MEPA 4O70A 5L96A 4A9JA 5FFYA 4CUQA 4CUTA 5CU8A 4YBSA 4YY4A 2RNWA 5IGNA 4QEVA 4J1PA 4LYIA 1X0JA 5CQ5A 5EGUA 5KHMA 3S91A 5FG6A 5EA1A 4BW2A 5CUAA 4N4IA 4J3IA 5CUDA 4QZSA 5AMEA 4UYFA 4WHWA 5CGPA 5EICA 5EISA 5DYXA 2R0YA 3QZTA 5CRZA 5CRMA 5IIDA 5HQ7A 2G4AA 5HQ6A 2L5EA 4CFKA 5F1HA 2WP2A 5E9LA 3MXFA 3HMFA 4QSTA 5E74A 4LZ2A 4UIVA 5FE7A 4Q0NA 5D3PA 2FSAA 3O35A 5IGKA 4MENA 5HFRA 3UV5A 5F63A 4NS5A 4O71A 4IORA 3UVDA 2DVRA 3U5OA 4BW3A 3SVFA 5CUCA 4QSPA 5EK9A 4CL9A 5ETDA 4HXPA 4UIXA 4NR4A 4YYDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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