4UIWA

Bromodomain of human brd9 with n-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)-5-ethyl-4- oxo-7-3-(trifluoromethyl)phenyl-4h,5h-thieno-3,2-c-pyridine-2- carboximidamide
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
101
structure length
101
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 9
publication title The Discovery of I-Brd9, a Selective Cell Active Chemical Probe for Bromodomain Containing Protein 9 Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 101
sequence length 101
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4uiwA00
5DBMA 2WP2A 5A5RA 4HBYA 5A83A 4YYKA 4ALGA 5LJ1A 5DW1A 5F62A 4BJXA 1JSPB 5FFVA 4O76A 5IGKA 2YW5A 5LKXA 2E7NA 4QSUA 5E9VA 5FFYA 5FE1A 4UYFA 4YC9A 5ENHA 5FE3A 5A82A 5DFBA 4TT6A 5IGLA 4ZC9A 5CQ6A 4N3WA 2YELA 3P1EA 5D3PA 4ZW1A 1F68A 2KTBB 4LR6A 4WHUA 4YABA 4TT2A 1JM4B 5FG4A 2DVQA 1E6IA 2L85A 4LYIA 5L8UA 4YYJA 4HXLA 2L84A 3NXBA 4PKLA 5L96A 5LVQA 4CFKA 5HLSA 5D3NA 4HXMA 4PCIA 4QUUA 4TQNA 2N9GA 2YYNA 4NRBA 4QEUA 5ENIA 2FSAA 5FFWA 4LDFA 3U5OA 4QR3A 5CUCA 3HMEA 4IR3A 4XYAA 5F63A 2MJVB 2D82A 3FKMX 4A9KA 4YYGA 5H1UA 5KTXA 5L8TA 4QEWA 5H1TA 4J0SA 5D3LA 4MEPA 2RFJA 5EK9A 5EWHA 4NUDA 4UYGA 5DYCA 4LYWA 4MR4A 5D3TA 5LJ0A 5AD2A 3SVGA 4BW1A 2RNYA 4HBWA 5CY9A 3MQMA 5I80A 4HXSA 5KHMA 4N4FA 5FE4A 4BHWA 5D7XA 5LKTA 3UVWA 1EQFA 5E3DA 5FH6A 3Q2FA 5EWCA 4MR3A 3RCWA 5IG6A 5HRVA 5CUAA 3Q2EA 4MEOA 4UYEA 5EI4A 5HFQA 5DW2A 5HQ5A 4O7FA 4TS8A 2D9EA 4C67A 4O75A 2DATA 4CLBA 4UYDA 3UW9A 3MXFA 3GG3A 1WUMA 5L98A 4UIWA 5DYXA 4CURA 4QB3A 4MENA 3IU5A 2GRCA 4NYVA 4Y03A 5D26A 5EPSA 5LKZA 5FE0A 4IOQA 2R0YA 4QNSA 4QY4A 2YEMA 5A5PA 5CS8A 5CUGA 4Q0OA 5DLXA 4YY6A 3QZVA 5H1VA 2RNXA 4Z93A 5A5SA 5EV9A 4ZQLA 4NRCA 4UIUA 5ETDA 3JVKA 5G4SA 4J0RA 4YATA 5CZGA 5CFWA 4UYFB 4O71A 5FB0A 5I89A 4YYNA 3AADA 5EVAA 4XY9A 5FB1A 4YBMA 3UVDA 4QEVA 2H60A 5I88A 5HENA 4A9HA 5ACYA 4QSXA 4KV1A 4QUTA 4XUAA 5CU8A 2RNWA 5CQ8A 3MB3A 2L5EA 5FH8A 2R10A 4NR9A 3D7CA 4GPJA 4NUEA 3U5NA 4YBTA 5KO4A 4LRGA 5D25A 5CUDA 5DYAA 2OO1A 3U5LA 2DVRA 4Q0NA 5JI8A 4KCXA 5C7NA 4AKNA 5C87A 5L97A 4TU6A 5IGMA 5I86A 4O7CA 4FLPA 5FG6A 4O7AA 5FE5A 5EPRA 4LC2A 4NQMA 5C8GA 4IR4A 5FE9A 4WIVA 4CL9A 2E3KA 5CQTA 5CRMA 5D3HA 4A9MA 4DONA 4QBMA 3LQIA 5II2A 5F25A 4MR6A 5F61A 3U5MA 4IORA 1N72A 5F5ZA 5CP5A 5II1A 4NR8A 5E74A 5FBXA 5EM3A 3UVYA 4QC1A 5I40A 2YQDA 5DX4A 5DLZA 5FE8A 5EWWA 3UV5A 5A5NA 5J0DA 5ENFA 5HM0A 5ENEA 3HMHA 5FDZA 3P5OA 4NS5A 4QSWA 4CUUA 4NUCA 3UV4A 3QZSA 2WP1A 4NRAA 4NYWA 4UIYA 5D24A 3P1CA 5A85A 4LZRA 5EGUA 4LZ2A 4IOOA 2YDWA 5COIA 5AMEA 4RVRA 3TLPA 2G4AA 5E9YA 4CFLA 4QR4A 5JWMA 4OUFA 4CUTA 3S92A 4YH4A 5AD3A 4HBXA 5HCLA 4BW4A 5CRZA 5BT5A 5C4QA 2I7KA 5F1HA 3K2JA 4Z1SA 5EA1A 5F3AA 4X2IA 5KU3A 4TT4A 2OUOA 5EWDA 1WUGA 4QSVA 5F2PA 3AQAA 4O74A 5EU1A 5F1LA 3IU6A 5D3RA 4A9IA 4Z6HA 2F6JA 4YK0A 3U5JA 4NQNA 5CQ3A 5D3SA 4XUBA 4QYDA 5DY7A 2RO1A 4Z1QA 4NXJA 4QR5A 4YBSA 4NR4A 3MB4A 5DKDA 4MR5A 5DKHA 5HELA 3ZYUA 5FE2A 5EWVA 5FG5A 4O78A 2NXBA 3LQJA 5D3JA 5E9LA 3JVMA 5I29A 4CUPA 4A9FA 4YYDA 5F36A 5HRXA 3G0JA 3DWYA 5A5OA 5G4RA 2RS9B 4YADA 5I7XA 4HBVA 4N4HA 4UITA 4ALHA 3MUKA 5LKUA 3SVFA 3SVHA 4A9NA 5KTWA 4CUQA 4TZ2A 5ENCA 3JVLA 4A9LA 4TYLA 4YH3A 4NYXA 4O70A 4A9EA 4NR5A 5K29A 5DFDA 4KV4A 5EPBA 3O36A 3UVXA 5E0RA 5E7DA 5CTLA 4HXKA 4A9JA 3QZTA 4YYHA 5HQ6A 4QSRA 5CQ4A 5HEMA 5E73A 5CUBA 5EISA 5BT3A 4PCEA 4IR6A 5CQAA 5D0CA 5CPEA 5EP7A 3O33A 4O7EA 5FE6A 3MULA 2LSPB 4QC3A 5A7CA 3O37A 1X0JA 4UYHA 5ETBA 5IGNA 5FH7A 2E7OA 4QZSA 5LUUA 3LXJA 2DKWA 2F6NA 5I1QA 4NR6A 3HMFA 4UIZA 4N4IA 4WHWA 5CQ7A 4O72A 4HXNA 4J1PA 5F60A 3G0LA 5IBNA 2DWWA 5L99A 4OGJA 3ONIA 4NR7A 2OSSA 4PTBA 4HXRA 5FE7A 4OGIA 4BW2A 4BW3A 5I7YA 4J3IA 4LZSA 5DYUA 5HQ7A 5A81A 5CGPA 4TZ8A 4YY4A 5EQ1A 5C85A 3DAIA 3P1DA 4YYIA 4CUSA 2DVVA 3U5KA 3JVJA 1ZS5A 4YYMA 4HXPA 4UIVA 5LJ2A 4QSQA 4A9OA 5E9KA 4YAXA 4QYLA 5TCMA 4PS5A 5H85A 4O77A 5HJCA 2R0SA 4N4GA 5BT4A 4QSTA 5HRWA 2RI7A 5I83A 4PY6A 4C66A 5ENJA 4Z6IA 5AMFA 3O35A 4QSPA 4IR5A 5EICA 2DVSA 5ENGA 3I3JA 5E9IA 3UV2A 5DKCA 5DFCA 5IIDA 5KTUA 5C89A 4TU4A 4TTEA 2R0VA 4E96A 4HXOA 3O34A 4QSSA 4XY8A 3LQHA 5E9MA 4MEQA 3S91A 5ENBA 5A5QA 4UIXA 5E3GA 4LYSA 3LJWA 5CQ5A 2I8NA 4F3IA 5TB6A 5HFRA 3U5PA 3P1FA 5CUEA 4O7BA 5LVRA 2YEKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DBMA 2WP2A 5A5RA 4HBYA 5A83A 4YYKA 4ALGA 5LJ1A 5DW1A 5F62A 4BJXA 1JSPB 5FFVA 4O76A 5IGKA 2YW5A 5LKXA 2E7NA 4QSUA 5E9VA 5FFYA 5FE1A 4UYFA 4YC9A 5ENHA 5FE3A 5A82A 5DFBA 4TT6A 5IGLA 4ZC9A 5CQ6A 4N3WA 2YELA 3P1EA 5D3PA 4ZW1A 1F68A 2KTBB 4LR6A 4WHUA 4YABA 4TT2A 1JM4B 5FG4A 2DVQA 1E6IA 2L85A 4LYIA 5L8UA 4YYJA 4HXLA 2L84A 3NXBA 4PKLA 5L96A 5LVQA 4CFKA 5HLSA 5D3NA 4HXMA 4PCIA 4QUUA 4TQNA 2N9GA 2YYNA 4NRBA 4QEUA 5ENIA 2FSAA 5FFWA 4LDFA 3U5OA 4QR3A 5CUCA 3HMEA 4IR3A 4XYAA 5F63A 2MJVB 2D82A 3FKMX 4A9KA 4YYGA 5H1UA 5KTXA 5L8TA 4QEWA 5H1TA 4J0SA 5D3LA 4MEPA 2RFJA 5EK9A 5EWHA 4NUDA 4UYGA 5DYCA 4LYWA 4MR4A 5D3TA 5LJ0A 5AD2A 3SVGA 4BW1A 2RNYA 4HBWA 5CY9A 3MQMA 5I80A 4HXSA 5KHMA 4N4FA 5FE4A 4BHWA 5D7XA 5LKTA 3UVWA 1EQFA 5E3DA 5FH6A 3Q2FA 5EWCA 4MR3A 3RCWA 5IG6A 3VKHA 5HRVA 5CUAA 3Q2EA 4MEOA 4UYEA 5EI4A 5HFQA 5DW2A 5HQ5A 4O7FA 4TS8A 2D9EA 4C67A 4O75A 2DATA 4CLBA 4UYDA 3UW9A 3MXFA 3GG3A 1WUMA 5L98A 4UIWA 5DYXA 4CURA 4QB3A 4MENA 3IU5A 2GRCA 4NYVA 4Y03A 5D26A 5EPSA 5LKZA 5FE0A 1ZKRA 2R0YA 4IOQA 4QY4A 2YEMA 4QNSA 5A5PA 5CS8A 4AI6A 5CUGA 4Q0OA 5DLXA 4YY6A 3QZVA 5H1VA 2RNXA 4Z93A 5A5SA 5EV9A 4ZQLA 4NRCA 3D1DA 4UIUA 5ETDA 3JVKA 5G4SA 4J0RA 4YATA 5CZGA 5CFWA 4UYFB 4O71A 5FB0A 5I89A 4YYNA 3AADA 5EVAA 4XY9A 5FB1A 4YBMA 3UVDA 4QEVA 2H60A 5I88A 5HENA 4A9HA 5ACYA 4QSXA 4KV1A 4QUTA 4XUAA 5CU8A 2RNWA 5CQ8A 3MB3A 2L5EA 5FH8A 2R10A 4NR9A 3D7CA 4GPJA 4NUEA 3U5NA 4YBTA 5KO4A 4LRGA 5D25A 5CUDA 5DYAA 2OO1A 3U5LA 2DVRA 4Q0NA 5JI8A 4KCXA 5C7NA 4AKNA 5C87A 5L97A 4TU6A 5IGMA 5I86A 4O7CA 4FLPA 5FG6A 4O7AA 5FE5A 5EPRA 4LC2A 4NQMA 5C8GA 4IR4A 5FE9A 4WIVA 4CL9A 2E3KA 5CQTA 5CRMA 5D3HA 4A9MA 4DONA 4QBMA 3LQIA 5II2A 5F25A 4MR6A 5F61A 3U5MA 4IORA 1N72A 5F5ZA 5CP5A 5II1A 4NR8A 5E74A 5FBXA 5EM3A 3UVYA 4QC1A 5I40A 2YQDA 5DX4A 5DLZA 5FE8A 5EWWA 3UV5A 5A5NA 5J0DA 5ENFA 5HM0A 5ENEA 3HMHA 5FDZA 3P5OA 4NS5A 4QSWA 4CUUA 4NUCA 3UV4A 3QZSA 2WP1A 4NRAA 4NYWA 4UIYA 5D24A 3P1CA 5A85A 4LZRA 5EGUA 4LZ2A 4IOOA 2YDWA 5COIA 5AMEA 4RVRA 3TLPA 2G4AA 5E9YA 4CFLA 4QR4A 5JWMA 4OUFA 4CUTA 3S92A 4YH4A 5AD3A 4HBXA 5HCLA 4BW4A 5CRZA 5BT5A 5C4QA 2I7KA 5F1HA 3K2JA 3ERRA 4Z1SA 5EA1A 5F3AA 4X2IA 5KU3A 4TT4A 2OUOA 5EWDA 1WUGA 4QSVA 5F2PA 3AQAA 4O74A 3VKGA 5EU1A 5F1LA 3IU6A 5D3RA 4A9IA 4Z6HA 2F6JA 4AKHA 4YK0A 3U5JA 4NQNA 5CQ3A 5D3SA 4XUBA 4QYDA 5DY7A 2RO1A 4Z1QA 4NXJA 4QR5A 4YBSA 4NR4A 3MB4A 5DKDA 4MR5A 5DKHA 5HELA 3ZYUA 5FE2A 5EWVA 5FG5A 4O78A 2NXBA 3LQJA 5D3JA 5E9LA 3JVMA 5I29A 4CUPA 4A9FA 4YYDA 5F36A 5HRXA 3G0JA 3DWYA 5A5OA 5G4RA 2RS9B 4YADA 5I7XA 4HBVA 4AKIA 4N4HA 4UITA 4ALHA 3MUKA 5LKUA 3SVFA 3SVHA 4A9NA 5KTWA 4CUQA 4TZ2A 5ENCA 3JVLA 4A9LA 4TYLA 4YH3A 4NYXA 4O70A 4A9EA 4NR5A 5K29A 5DFDA 4KV4A 5EPBA 3O36A 3UVXA 5E0RA 5E7DA 5CTLA 4HXKA 4A9JA 3QZTA 4YYHA 5HQ6A 4QSRA 5CQ4A 5HEMA 5E73A 5CUBA 5EISA 5BT3A 4PCEA 4IR6A 5CQAA 5D0CA 5CPEA 5EP7A 3O33A 4O7EA 5FE6A 3MULA 2LSPB 4QC3A 5A7CA 3O37A 1X0JA 4UYHA 5ETBA 5IGNA 5FH7A 2E7OA 4QZSA 5LUUA 3LXJA 2DKWA 2F6NA 5I1QA 4NR6A 3HMFA 4UIZA 4N4IA 4WHWA 5CQ7A 4O72A 4HXNA 4J1PA 5F60A 3G0LA 5IBNA 2DWWA 5L99A 4OGJA 3ONIA 4NR7A 2OSSA 4PTBA 4HXRA 1PUOA 5FE7A 4OGIA 4BW2A 4BW3A 5I7YA 4J3IA 4LZSA 5DYUA 5HQ7A 5A81A 4AKGA 5CGPA 4TZ8A 4YY4A 5EQ1A 3D1BA 5C85A 3DAIA 3P1DA 4YYIA 4CUSA 2DVVA 3U5KA 3JVJA 1ZS5A 4YYMA 4HXPA 4UIVA 5LJ2A 4QSQA 4A9OA 5E9KA 4YAXA 4QYLA 5TCMA 4PS5A 5H85A 4O77A 5HJCA 2R0SA 4N4GA 5BT4A 4QSTA 5HRWA 2RI7A 5I83A 4PY6A 4C66A 5ENJA 4Z6IA 5AMFA 3O35A 4QSPA 4IR5A 5EICA 2DVSA 5ENGA 3I3JA 5E9IA 3UV2A 5DKCA 5DFCA 5IIDA 5KTUA 5C89A 4TU4A 4TTEA 2R0VA 4E96A 4HXOA 3O34A 4QSSA 4XY8A 3LQHA 5E9MA 4MEQA 3S91A 2EJNA 5ENBA 5A5QA 4UIXA 5E3GA 4LYSA 3LJWA 5CQ5A 2I8NA 4F3IA 5TB6A 5HFRA 3U5PA 3P1FA 5CUEA 4O7BA 5LVRA 2YEKA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DBM A;  2WP2 A;  5A5R A;  4HBY A;  5A83 A;  4YYK A;  4ALG A;  5LJ1 A;  5DW1 A;  5F62 A;  4BJX A;  1JSP B;  5FFV A;  4O76 A;  5IGK A;  2YW5 A;  5LKX A;  2E7N A;  4QSU A;  5E9V A;  5FFY A;  5FE1 A;  4UYF A;  4YC9 A;  5ENH A;  5FE3 A;  5A82 A;  5DFB A;  4TT6 A;  5IGL A;  4ZC9 A;  5CQ6 A;  4N3W A;  2YEL A;  3P1E A;  5D3P A;  4ZW1 A;  1F68 A;  2KTB B;  4LR6 A;  4WHU A;  4YAB A;  4TT2 A;  1JM4 B;  5FG4 A;  2DVQ A;  1E6I A;  2L85 A;  4LYI A;  5L8U A;  4YYJ A;  4HXL A;  2L84 A;  3NXB A;  4PKL A;  5L96 A;  5LVQ A;  4CFK A;  5HLS A;  5D3N A;  4HXM A;  4PCI A;  4QUU A;  4TQN A;  2N9G A;  2YYN A;  4NRB A;  4QEU A;  5ENI A;  2FSA A;  5FFW A;  4LDF A;  3U5O A;  4QR3 A;  5CUC A;  3HME A;  4IR3 A;  4XYA A;  5F63 A;  2MJV B;  2D82 A;  3FKM X;  4A9K A;  4YYG A;  5H1U A;  5KTX A;  5L8T A;  4QEW A;  5H1T A;  4J0S A;  5D3L A;  4MEP A;  2RFJ A;  5EK9 A;  5EWH A;  4NUD A;  4UYG A;  5DYC A;  4LYW A;  4MR4 A;  5D3T A;  5LJ0 A;  5AD2 A;  3SVG A;  4BW1 A;  2RNY A;  4HBW A;  5CY9 A;  3MQM A;  5I80 A;  4HXS A;  5KHM A; 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