4UIZA

N-terminal bromodomain of human brd4 with 7-(3,4-dimethoxyphenyl)-2-(4-methanesulfonylpiperazine-1-carbonyl)-5-methyl-4h,5h-thieno-3,2-c- pyridin-4-one
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title The Discovery of I-Brd9, a Selective Cell Active Chemical Probe for Bromodomain Containing Protein 9 Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4uizA01
3O34A 4O7EA 4MR6A 4QUUA 5I40A 4X2IA 4UIYA 4HBVA 5FG4A 4TQNA 5EU1A 2R0YA 5L96A 4MEQA 4QYLA 4MR4A 5CS8A 5IBNA 5CZGA 5D24A 4LYIA 3LXJA 5ENGA 5HENA 1JSPB 4A9LA 2RO1A 4NR8A 4TZ2A 4NYWA 4J0RA 5E9MA 3K2JA 5BT3A 2YW5A 3U5KA 2OO1A 5HEMA 5K29A 5FDZA 4QSVA 5FB1A 4Z1SA 4A9HA 3AQAA 3QZTA 5HRVA 4Z6IA 4YAXA 3JVKA 4O71A 4J1PA 5LKUA 5H1TA 2E7OA 4QC3A 3UV2A 5L8TA 5FFWA 4O77A 4NRCA 3Q2FA 4XY8A 5H1VA 4NR5A 4XUBA 5FE6A 5A7CA 4N3WA 3P1DA 3HMHA 4N4GA 4Z93A 2R10A 4CUQA 3JVMA 3NXBA 4MR5A 4CUTA 1ZS5A 5EPRA 4A9KA 2YEKA 5CQ7A 5AMEA 2DVVA 4QSTA 5H85A 5CTLA 4O70A 4QZSA 4RVRA 5EGUA 3JVJA 4HXRA 5FE5A 4TS8A 5EVAA 5KHMA 3G0JA 5FG6A 5CQ5A 4O72A 2RNYA 4KCXA 5D3PA 4CUSA 5FE8A 4YBSA 5A5RA 1EQFA 4HXKA 4GPJA 2LSPB 5I80A 2E7NA 2DVSA 4QBMA 3QZVA 3U5OA 4MEPA 2L85A 5E9IA 3S92A 4C67A 5J0DA 3P1EA 4Q0OA 5TCMA 5ENEA 3U5MA 4HXLA 4LYWA 2RS9B 5FE0A 2DVQA 5A81A 4HBYA 5DW1A 4PTBA 5DY7A 4WIVA 3GG3A 5AMFA 2NXBA 2YEMA 5EI4A 5HM0A 5F2PA 2RI7A 5HRWA 4A9EA 4A9NA 5CUAA 4QR4A 4O7FA 4QSUA 2N9GA 5TB6A 4PKLA 5LVQA 4UYDA 4OUFA 4J3IA 5FE2A 1N72A 5ENCA 5E3GA 5A5QA 5DLZA 5F1HA 4Z1QA 3U5PA 4LZSA 4NUCA 5F36A 4YYHA 5G4SA 3O35A 5BT5A 4TZ8A 4Z6HA 4NR9A 2YDWA 5C4QA 5F62A 5FBXA 4NR7A 5CQAA 4LRGA 4CUUA 4YADA 4O75A 4QR3A 3QZSA 4WHWA 5E3DA 5D3RA 4YYIA 5HJCA 1F68A 2R0SA 3IU6A 4UYHA 5EA1A 4ALGA 5EV9A 4C66A 4OGJA 5II1A 5D26A 4E96A 4FLPA 5CUGA 2DWWA 4O78A 5C87A 5FE3A 5DW2A 5IIDA 5KU3A 5FH6A 5EPSA 5I88A 4NRBA 2F6JA 4CUPA 4UIXA 4QSSA 5KTUA 4YABA 5I7YA 4QY4A 5D7XA 4QSXA 5DYAA 5EWWA 5HFQA 3RCWA 5IG6A 2L5EA 4AKNA 3I3JA 5CRZA 5DKDA 4HXOA 5CUDA 3FKMX 5D3NA 3UV4A 5ENFA 4BHWA 5D25A 3UW9A 3AADA 4BW3A 5DBMA 4QR5A 4UYEA 5EK9A 5F61A 5H1UA 5LJ1A 4NUEA 3D7CA 4UITA 2I7KA 4ZC9A 3MB3A 5L8UA 3P1CA 2R0VA 5DYCA 3HMFA 4HXSA 3UVWA 2DATA 4TU4A 5F3AA 5HRXA 4UIVA 4LYSA 4CFLA 5ACYA 5G4RA 4O74A 3IU5A 5II2A 4NR4A 4YYKA 5CQ8A 4UIUA 2MJVB 1E6IA 4IORA 2WP1A 3O33A 3U5JA 5E73A 5FFYA 2FSAA 5FE1A 5DFDA 4A9JA 3MUKA 5HFRA 5CUBA 5LUUA 4MENA 4YYNA 4ZW1A 5HLSA 4XUAA 5CPEA 5C85A 4UYFB 5HQ7A 4QYDA 5C7NA 5LKXA 5HELA 5HCLA 5D3HA 3UVXA 5KTXA 3SVHA 2RNXA 4N4HA 5DYXA 5D0CA 4A9OA 4QSPA 5ENBA 5CQTA 4CURA 3UVDA 4IR3A 2OSSA 4BW2A 5IGMA 4ALHA 5FG5A 4IR6A 5DX4A 2RFJA 4WHUA 5F25A 4MEOA 4KV4A 4NXJA 4QSQA 5LKZA 4LDFA 4YH4A 4HBWA 4NYXA 5ENIA 4N4FA 5COIA 4TT6A 2F6NA 5CRMA 5FE7A 5D3TA 5JI8A 3LQJA 5EQ1A 5E0RA 5IGKA 4O7BA 5FE4A 4PCIA 5FH7A 5EP7A 4CL9A 5KTWA 3DAIA 4YATA 4QNSA 2D82A 5I1QA 3P1FA 2H60A 4QSWA 3HMEA 4LC2A 3LJWA 5L98A 5HQ6A 5A85A 5ETBA 4YY6A 5EISA 5E7DA 3S91A 3LQHA 5A82A 3O36A 5LVRA 4TT2A 5EICA 5EWDA 4PS5A 5CUEA 4HXMA 5FE9A 4OGIA 3MULA 3U5NA 4A9MA 4O7AA 2WP2A 5I83A 4NUDA 4HXPA 4A9FA 5I7XA 5A5NA 4NQNA 3SVFA 5FFVA 2G4AA 4NYVA 4QSRA 4UYFA 4N4IA 4J0SA 4UIZA 3JVLA 5A5PA 5LJ2A 5CQ6A 4YK0A 2L84A 5EWVA 5A83A 4LZRA 5CUCA 5DYUA 3ONIA 5EM3A 3U5LA 4PCEA 4Q0NA 5I86A 2GRCA 5IGNA 2DKWA 4XY9A 4LZ2A 4QEUA 5FB0A 5ETDA 4YYMA 4O7CA 3TLPA 5ENJA 5KO4A 4XYAA 4BJXA 2OUOA 4NRAA 5FH8A 4NQMA 4UIWA 1WUMA 3DWYA 5D3LA 3LQIA 4LR6A 5A5SA 5E9LA 3MXFA 5L99A 4YBMA 5BT4A 5CQ3A 3MB4A 5A5OA 5CGPA 5C89A 5HQ5A 5LJ0A 5EPBA 2YQDA 4IR4A 5EWHA 4BW1A 4DONA 5DLXA 4Y03A 4YBTA 5IGLA 2RNWA 2YYNA 4TYLA 4NR6A 5DFBA 5CY9A 4YY4A 2D9EA 5D3SA 5ENHA 4QC1A 5F5ZA 5D3JA 5E9VA 4QUTA 4QEVA 4UYGA 5E74A 4F3IA 5EWCA 4A9IA 4BW4A 4YYJA 1X0JA 4IOOA 5AD2A 5F63A 4CFKA 3SVGA 1JM4B 3P5OA 5DKCA 2E3KA 2DVRA 3ZYUA 4MR3A 3MQMA 2YELA 5I89A 4YC9A 2I8NA 4TT4A 5CQ4A 5DKHA 5I29A 4TU6A 5E9KA 4QEWA 4YH3A 1WUGA 4ZQLA 4IOQA 4IR5A 4KV1A 4HBXA 5F60A 5E9YA 5CU8A 5JWMA 4TTEA 5LKTA 3Q2EA 5C8GA 3UV5A 3G0LA 4QB3A 5CFWA 5CP5A 4NS5A 4PY6A 5DFCA 4HXNA 4CLBA 2KTBB 4O76A 5L97A 4YYDA 5AD3A 3UVYA 4YYGA 3O37A 5F1LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O34A 4O7EA 4MR6A 4QUUA 5I40A 4X2IA 4UIYA 4HBVA 5FG4A 4TQNA 5EU1A 2R0YA 5L96A 4MEQA 4QYLA 4MR4A 5CS8A 5IBNA 5CZGA 5D24A 4LYIA 3LXJA 5ENGA 5HENA 1JSPB 4A9LA 2RO1A 4NR8A 4TZ2A 4NYWA 4J0RA 5E9MA 3K2JA 5BT3A 2YW5A 3U5KA 2OO1A 1PUOA 5HEMA 5K29A 5FDZA 4QSVA 5FB1A 4Z1SA 4A9HA 3D1DA 3AQAA 3QZTA 5HRVA 4Z6IA 4YAXA 3JVKA 4O71A 4J1PA 5LKUA 5H1TA 2E7OA 4QC3A 3UV2A 5L8TA 5FFWA 4O77A 4NRCA 3Q2FA 4XY8A 5H1VA 4NR5A 4XUBA 5FE6A 5A7CA 4N3WA 3P1DA 3HMHA 4N4GA 4Z93A 2R10A 4CUQA 3JVMA 3NXBA 4MR5A 4CUTA 1ZS5A 5EPRA 4A9KA 2YEKA 5CQ7A 5AMEA 2DVVA 4QSTA 5H85A 5CTLA 4O70A 4QZSA 4RVRA 5EGUA 3JVJA 4HXRA 5FE5A 4TS8A 5EVAA 5KHMA 3G0JA 5FG6A 5CQ5A 4O72A 2RNYA 4KCXA 5D3PA 4CUSA 5FE8A 1ZKRA 4YBSA 5A5RA 1EQFA 4HXKA 4GPJA 2LSPB 5I80A 2E7NA 2DVSA 4QBMA 3QZVA 3ERRA 3U5OA 4MEPA 3VKGA 2L85A 5E9IA 3S92A 4C67A 5J0DA 3P1EA 4Q0OA 5TCMA 5ENEA 3U5MA 4HXLA 4LYWA 2RS9B 5FE0A 2DVQA 5A81A 4AKIA 4HBYA 5DW1A 4PTBA 5DY7A 4WIVA 3GG3A 5AMFA 2NXBA 2YEMA 5EI4A 5HM0A 5F2PA 2RI7A 5HRWA 4A9EA 4A9NA 5CUAA 4QR4A 4O7FA 4QSUA 2N9GA 5TB6A 4PKLA 5LVQA 4UYDA 4OUFA 4J3IA 5FE2A 1N72A 5ENCA 5E3GA 5A5QA 5DLZA 5F1HA 4Z1QA 3U5PA 4LZSA 4NUCA 5F36A 4YYHA 5G4SA 3O35A 5BT5A 4TZ8A 4Z6HA 4NR9A 2YDWA 5C4QA 5F62A 5FBXA 4NR7A 5CQAA 4LRGA 4CUUA 4YADA 4O75A 4QR3A 3QZSA 4WHWA 5E3DA 5D3RA 4YYIA 5HJCA 1F68A 2R0SA 3IU6A 4UYHA 5EA1A 4ALGA 5EV9A 4C66A 4OGJA 5II1A 5D26A 4E96A 4FLPA 5CUGA 2DWWA 4O78A 5C87A 5FE3A 5DW2A 5IIDA 5KU3A 5FH6A 5EPSA 5I88A 4NRBA 2F6JA 4CUPA 4UIXA 4QSSA 5KTUA 4YABA 5I7YA 4QY4A 5D7XA 4QSXA 5DYAA 5EWWA 5HFQA 3RCWA 5IG6A 2L5EA 4AKNA 3I3JA 5CRZA 5DKDA 4AI6A 4HXOA 5CUDA 3FKMX 5D3NA 3UV4A 5ENFA 4BHWA 5D25A 3UW9A 3AADA 4BW3A 5DBMA 4QR5A 4UYEA 5EK9A 5F61A 5H1UA 5LJ1A 4NUEA 3D7CA 4UITA 2I7KA 4ZC9A 3MB3A 5L8UA 3P1CA 2R0VA 5DYCA 3HMFA 4HXSA 3UVWA 2DATA 4TU4A 5F3AA 5HRXA 4UIVA 4LYSA 4CFLA 5ACYA 5G4RA 4O74A 3IU5A 5II2A 4NR4A 4YYKA 5CQ8A 4UIUA 2MJVB 1E6IA 4IORA 2WP1A 3O33A 3U5JA 5E73A 5FFYA 2FSAA 5FE1A 5DFDA 2EJNA 4A9JA 3MUKA 5HFRA 5CUBA 5LUUA 4MENA 4YYNA 4ZW1A 5HLSA 4XUAA 5CPEA 5C85A 4UYFB 5HQ7A 4QYDA 5C7NA 5LKXA 5HELA 5HCLA 5D3HA 3UVXA 5KTXA 3SVHA 2RNXA 4N4HA 5DYXA 5D0CA 4A9OA 4QSPA 5ENBA 5CQTA 4CURA 3UVDA 4IR3A 2OSSA 4BW2A 5IGMA 4ALHA 5FG5A 4IR6A 5DX4A 2RFJA 4WHUA 5F25A 4MEOA 4KV4A 4NXJA 4QSQA 5LKZA 4LDFA 4YH4A 4HBWA 4NYXA 4AKHA 5ENIA 4N4FA 5COIA 4TT6A 2F6NA 5CRMA 5FE7A 5D3TA 5JI8A 3LQJA 5EQ1A 5E0RA 5IGKA 4O7BA 5FE4A 4PCIA 5FH7A 5EP7A 4CL9A 5KTWA 3DAIA 4YATA 4QNSA 2D82A 5I1QA 3P1FA 2H60A 4QSWA 3HMEA 4LC2A 3LJWA 5L98A 5HQ6A 5A85A 5ETBA 4YY6A 5EISA 5E7DA 3S91A 3LQHA 5A82A 3O36A 5LVRA 4TT2A 5EICA 5EWDA 4PS5A 5CUEA 4HXMA 5FE9A 4OGIA 3MULA 3U5NA 4A9MA 4O7AA 2WP2A 5I83A 4NUDA 4HXPA 4A9FA 5I7XA 5A5NA 4NQNA 3SVFA 5FFVA 3D1BA 2G4AA 4NYVA 4QSRA 4UYFA 4N4IA 4J0SA 4UIZA 3JVLA 4AKGA 5A5PA 5LJ2A 5CQ6A 4YK0A 2L84A 5EWVA 5A83A 4LZRA 5CUCA 5DYUA 3ONIA 5EM3A 3U5LA 4PCEA 4Q0NA 5I86A 2GRCA 5IGNA 2DKWA 4XY9A 4LZ2A 4QEUA 5FB0A 5ETDA 4YYMA 4O7CA 3TLPA 5ENJA 5KO4A 4XYAA 4BJXA 2OUOA 4NRAA 5FH8A 4NQMA 4UIWA 1WUMA 3DWYA 5D3LA 3LQIA 4LR6A 5A5SA 5E9LA 3MXFA 5L99A 4YBMA 5BT4A 5CQ3A 3MB4A 5A5OA 5CGPA 5C89A 5HQ5A 5LJ0A 5EPBA 2YQDA 4IR4A 5EWHA 4BW1A 4DONA 5DLXA 4Y03A 4YBTA 5IGLA 2RNWA 2YYNA 4TYLA 4NR6A 5DFBA 5CY9A 4YY4A 2D9EA 5D3SA 5ENHA 4QC1A 5F5ZA 5D3JA 5E9VA 4QUTA 4QEVA 4UYGA 5E74A 4F3IA 5EWCA 4A9IA 4BW4A 4YYJA 1X0JA 4IOOA 5AD2A 5F63A 4CFKA 3SVGA 1JM4B 3P5OA 5DKCA 2E3KA 2DVRA 3ZYUA 4MR3A 3MQMA 3VKHA 2YELA 5I89A 4YC9A 2I8NA 4TT4A 5CQ4A 5DKHA 5I29A 4TU6A 5E9KA 4QEWA 4YH3A 1WUGA 4ZQLA 4IOQA 4IR5A 4KV1A 4HBXA 5F60A 5E9YA 5CU8A 5JWMA 4TTEA 5LKTA 3Q2EA 5C8GA 3UV5A 3G0LA 4QB3A 5CFWA 5CP5A 4NS5A 4PY6A 5DFCA 4HXNA 4CLBA 2KTBB 4O76A 5L97A 4YYDA 5AD3A 3UVYA 4YYGA 3O37A 5F1LA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O34 A;  4O7E A;  4MR6 A;  4QUU A;  5I40 A;  4X2I A;  4UIY A;  4HBV A;  5FG4 A;  4TQN A;  5EU1 A;  2R0Y A;  5L96 A;  4MEQ A;  4QYL A;  4MR4 A;  5CS8 A;  5IBN A;  5CZG A;  5D24 A;  4LYI A;  3LXJ A;  5ENG A;  5HEN A;  1JSP B;  4A9L A;  2RO1 A;  4NR8 A;  4TZ2 A;  4NYW A;  4J0R A;  5E9M A;  3K2J A;  5BT3 A;  2YW5 A;  3U5K A;  2OO1 A;  1PUO A;  5HEM A;  5K29 A;  5FDZ A;  4QSV A;  5FB1 A;  4Z1S A;  4A9H A;  3D1D A;  3AQA A;  3QZT A;  5HRV A;  4Z6I A;  4YAX A;  3JVK A;  4O71 A;  4J1P A;  5LKU A;  5H1T A;  2E7O A;  4QC3 A;  3UV2 A;  5L8T A;  5FFW A;  4O77 A;  4NRC A;  3Q2F A;  4XY8 A;  5H1V A;  4NR5 A;  4XUB A;  5FE6 A;  5A7C A;  4N3W A;  3P1D A;  3HMH A;  4N4G A;  4Z93 A;  2R10 A;  4CUQ A;  3JVM A;  3NXB A;  4MR5 A;  4CUT A;  1ZS5 A;  5EPR A;  4A9K A;  2YEK A;  5CQ7 A;  5AME A;  2DVV A;  4QST A;  5H85 A;  5CTL A;  4O70 A;  4QZS A;  4RVR A;  5EGU A;  3JVJ A;  4HXR A;  5FE5 A;  4TS8 A;  5EVA A;  5KHM A;  3G0J A;  5FG6 A;  5CQ5 A;  4O72 A;  2RNY A;  4KCX A;  5D3P A;  4CUS A;  5FE8 A;  1ZKR A;  4YBS A; 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