4UWNA

Lysozyme soaked with a ruthenium based corm with a methione oxide ligand (complex 6b)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title A Contribution to the Rational Design of Ru(Co)3Cl2L Complexes for in Vivo Delivery of Co.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4uwnA00
1B5WA 1OQMA 7LYZA 1JITA 1LMOA 2Z19A 4J0LA 1HNLA 3ZVQA 1HENA 3HBHA 4HSFA 4NGJA 1UCOA 4W96A 1F6RA 2BAAA 1B7OA 1VATA 1VFBC 4GN4A 1VDQA 2MEGA 1QUTA 5I54A 2LYZA 1GXV2 5FSTA 3OJPA 2BQEA 4N8ZA 1JKCA 4DDBA 4QY9A 5KXXA 5I5QA 1IC7Y 4WM5A 5LAGA 1IP3A 5T3FA 4LFPA 2MEEA 3WXTA 4LT1A 1LYOA 4WLTA 1WQPA 1C7PA 4J1AA 4TTDA 4YEMA 4PHIA 5F9UA 1REXA 2F4AA 1LZBA 4NSHA 3LYZA 1GB3A 3LYTA 1OUHA 4XENA 3TXJA 5F16A 1NHEA 3WUMA 1HHLA 1DI5A 1G7MC 1GDXA 2GV0A 3RW8A 193LA 2Z38A 2BQNA 5HQ1A 1FKQA 5I4YA 1B5UA 2BQGA 1HEQA 132LA 2ZQ4A 3A96A 4CJ2A 1DI3A 2YDGA 4ANRA 1YROA 5F81A 133LA 1B7PA 2HEAA 2ZNXY 2W1MA 3B72A 4MCKA 2MECA 1FLWA 1I56A 9LYZA 3CSZA 4DYGA 1LJFA 4LFXA 4WL7A 1IP4A 1CKGA 1GBZA 4LYTA 3WUAA 1DKJA 5B1FA 1IWXA 1LZNA 1REMA 1C46A 2W1YA 4N1EI 4DD7A 1LZTA 1IVMA 1IO5A 1VDSA 3A34A 3P65A 1FLYA 1LSNA 1B5VA 1OUAA 2XBRA 4HP0A 5KY1A 1GE0A 1TDYA 4H9AA 3WU7A 2ZNWY 2ZIKA 1UICA 1LZDA 4H91A 4H93A 1AT6A 1LZ5A 2AUBA 5I4WA 1FLQA 3AGIA 1OUIA 3VWOA 2DQCY 1RI8B 207LA 3RNXA 4RLNA 2Z12A 1E8LA 4WO9A 1NWGA 1LMTA 5K7OA 1AKIA 4ML7A 1AT5A 1HFZA 2A7FA 3F6ZA 1YAMA 4NGVA 1LZ8A 1O23A 1WQNA 4WO6A 1DKKA 2YBIA 4H9BA 1NMMA 3IJUA 3N9CA 1QSAA 1B5ZA 5KXZA 3GXRA 3TXEA 3W6DA 4WOAA 1LAAA 3T6UA 3EBAB 3HBEX 1WQRA 1UUZC 5DL9A 5KJ9A 1IR9A 4P2EA 1LZRA 2ZQ3A 3EMSA 1JKAA 1BB5A 1LHHA 2EIZC 3LN2A 3B6LA 2EKSC 3RU5A 1GF6A 5ILCA 1IWTA 4BADA 1REYA 4ET9A 2MEDA 2W1XA 1J1PY 3EXDA 4NHSA 1BWIA 4WM6A 5ILFA 1YL0X 2BQLA 2H9KA 3G3AB 1LOZA 2CJLA 3B0IA 3CB7A 3CQLA 5KXKA 4UWUA 1OUGA 1GFEA 1IWWA 2DQDY 3LZ2A 1LYYA 5L3IA 1GF0A 2ZIJA 1D0KA 2YBHA 3TXFA 3W6CA 4DDCA 5LYTA 5KXWA 4C5FA 1WQQA 1OUBA 1YL1X 4I0CA 2D6BA 5LVGA 1GE1A 1JSFA 4IJ4A 2C8PA 4YENA 4N9RA 2DQJY 2LHMA 2Y8PA 1JUGA 1DI4A 1YKZX 1LJ4A 2Z2EA 3AGHA 4XADA 4YOPA 153LA 1LSAA 2BQMA 4DT3A 1RE2A 3K3TA 4GCBA 4WM1A 1GB9A 2I6ZA 2YSSC 1OP9B 1XEIA 1LMAA 3IJVA 1LKSA 1XGQC 1JHLA 1GE2A 1GE4A 2YBLA 3CT1A 2DBTA 1EQ5A 1HEWA 1LZGA 3W3EA 1IOCA 1B7SA 2BQAA 4E3UA 1ZMYL 3A6BY 3W6AA 5AMYA 3AW6A 5KXSA 3TXBA 1GBWA 1TBYA 1LJHA 4ETCA 1IP1A 1LHMA 1GFRA 3HFMY 4HJZA 5LAFA 2FBDA 4NFVA 4WM4A 4M6DA 1LZYA 1YIKA 3BKHA 3A95A 5KXYA 3AW7A 1UIBA 1LJJA 2G4NA 1UACY 4I8SA 1GFKA 1JTPL 1WQMA 2Z2FA 2HEBA 1WVUA 1GFTA 1TCYA 1GXXA 4HTQA 3ZVQB 2HU3A 1LHLA 4YEOA 1JSEA 1EQ4A 4LGKA 1TAYA 1GAZA 1LSBA 1F0WA 1W08A 3WULA 5LXWA 2BQBA 5DN5A 1LSZA 1UIDA 3FI7A 4NHTA 4XJHA 1VDTA 1IX0A 4DD3A 1INUA 1IC5Y 4NGIA 4OWBA 2RSCA 4NEBA 1C10A 2FBBA 4G49A 1HSWA 1GB6A 4H9HA 5A3ZA 2DQEY 1LSFA 4WMGA 1HMLA 1HC0A 4ETBA 5LA8A 4M4OA 1XGRC 3A94A 4QGZA 1GEZA 1BWJA 5E9RA 4XJDA 4XJFA 1B9OA 4HV1A 5J7CA 1QIOA 1GB8A 1VEDA 4NY5A 3LZTA 4AGAA 4H1PA 4ET8A 4LYCA 4MSTA 1JIYA 5I53A 4MR1A 5KXTA 5LYMA 1DPXA 4LYMA 3AYQA 5F9XA 1H6MA 4RW1A 3A92A 1JISA 1QTEA 4D9ZA 1DXJA 4XJGA 1RFPA 4TSCA 2BQCA 3BKVA 2BQKA 3B0KA 1BHZA 1W6ZA 4NGOA 5L3HA 5LIOA 4B1AA 1GFAA 3A90A 3WU8A 4WLXA 5FCPA 1BQLY 1B5YA 1EQEA 3A93A 3TXHA 1BB6A 1KIPC 4ZIXA 1GBYA 1LSYA 1YAPA 1LMPA 1NDMC 3N9EA 4DD1A 3WPKA 1HMKA 3A8ZA 4UWVA 1D9UA 4H8YA 4ZEEA 1BVKC 4CFPA 2H5ZA 1GBSA 1XEKA 5KXLA 1ZV5L 4WLYA 5DM9A 1HSXA 4U3XB 1G7HC 1LJEA 2ZILA 194LA 2DQAA 4NIJA 1JTTL 1J1XY 1CKHA 4EOFA 2D4KA 1UIEA 1GHLA 3J4GA 2BLYA 3B0OA 1AM7A 1CJ6A 1MLCE 1IR8A 1NBZC 1B2KA 1WQOA 2YBNA 4KPMA 3WVXA 5C6JA 3WUNA 1HFXA 4CGEA 1PZYA 3AZ7A 2W1LA 2C8OA 5LVKA 2FYCA 5L9JA 1C43A 1IP7A 3P68A 1HELA 4Z41A 3M3UA 1QSWA 1GF7A 4DC4A 3CT0A 4N5RA 1XSFA 2DQIY 2VB1A 5FEKA 3TMUA 1YILA 3WH1A 4B4IA 1CNSA 1LZ4A 1BWHA 1JEFA 8LYZA 3IWRA 2YBMA 2BQHA 2DKVA 2Z37A 2CWIA 1D0LA 1CJ7A 1LMCA 1GFVA 3GXKA 1YANA 4NHIA 2IHLA 2MEHA 1LTMA 5D5CA 3ZEKA 1VAUA 1LCNA 1FN5A 1WVVA 4QDNA 2HECA 1BVXA 4H9IA 5B1GA 3WPJA 4DD9A 4ETAA 5KXRA 3CSQA 1XGTC 5KXNA 2BPUA 2BQIA 1GB5A 4TX7A 4H9FA 1I1ZA 1C45A 4GCEA 1LMNA 3WVYA 4B49A 4HJYA 3WW5A 1FDLY 4HJVA 4LT2A 4Z98A 4NGYA 1JTOL 3QNGA 1JWRA 1XGUC 2XJWA 4HTNA 5IELA 1QUSA 2G4QA 2Z39A 4BAFA 3J6KA 2DQHY 1H87A 1CKDA 5DLAA 1IIZA 4L41A 4G4HA 5I4XA 1G7LC 4OW1A 1HF4A 2A7DA 5EBHA 3AZ4A 1KXYA 1LZ9A 1XGPC 1YKXX 1BGIA 1IC4Y 1LSEA 1XFPL 4J1BA 3W6BA 1UIGA 5HNCA 1IP6A 1DPWA 1QDRA 4O34A 5HNLA 4NGKA 1IWYA 5LVJA 3AB6A 2XTHA 3WPLA 6LYTA 4WM2A 1HERA 4A7DA 1NKHA 2MEBA 1IORA 5B05A 2Z18A 5FELA 2PC2A 4HPIA 3TMVA 1GF5A 4DWXA 4ETEA 4HTKA 2BQFA 1WTMA 3A67Y 1IOQA 1LJNA 3M18B 4H9CA 1LZCA 1GE3A 1GEVA 1J1OY 4NGLA 4EMNA 2ZWBA 4OWEA 1AZFA 1XEJA 3ATNA 2FYDA 1CKFA 5D5FA 4W94A 1NQIA 1GB7A 1LKRA 3P64A 5KXOA 1QQYA 1MELL 1NBYC 4LYBA 1IP5A 3EO5A 4CHXA 5C6IA 1A2YC 1GBOA 1GFUA 1LYZA 4NHPA 4OWHA 1GBXA 3G3BB 3LHMA 1OUJA 2I25L 4KXIA 2BLXA 1GAYA 4HV2A 1B7MA 3RT5X 1UIFA 4TSBA 4G4CA 1KIRC 5APEA 1LJGA 1LJ3A 3A6CY 1EL1A 4WL6A 5LVIA 4B4EA 5HMVA 1QTKA 4GLAA 4NHQA 1LPIA 4KL7A 4LYOA 3WU9A 1DQJC 3WXUA 5DN4A 2DQFC 1GPQC 1GWDA 1HEMA 1REZA 1LZ6A 5FHWA 2HTXA 3AJNA 3TMWA 1Z55A 1GDWA 1HFYA 3SP3A 1HEPA 1LSGA 4G9SA 2B5ZA 1IOTA 2D91A 1ZVYB 4TWSA 4XJBA 1LJIA 4R6CA 1B7LA 1UA6Y 3W6EA 4C3WA 1ALCA 1IY3A 1YQVY 1GFJA 2YVBA 4YM8A 1JJ1A 1GFHA 4FJRA 1F10A 2EQLA 2D4JA 1UC0A 1UBZA 3TMXA 1V7TA 154LA 4KT3A 4TUNA 5KKJA 4Z3MA 1D6PA 4LT0A 4IASA 1ZVHL 1CJ9A 1V7SA 5APDA 3A3QA 1IEEA 1B7NA 4H8ZA 4J7VA 4DD0A 4NGZA 4BS7A 4NWEA 5LINA 2WARA 3RZ4A 3LYMA 1LMQA 2CGIA 3D9AC 4G4BA 4YF2A 1GF3A 2HEEA 4GN5C 4RDSA 5KKIA 3AZ6A 4OWAA 4NSIA 1JPOA 5KXMA 5B59A 5A3EA 4PGJB 4RW2A 1IWVA 5M1YA 2EPEA 2NWDX 1T6VL 2MEIA 3TXKA 3W6FA 1A4VA 2BQOA 4XN6A 4ZFPA 2DQGY 1LSCA 4NG8A 2F30A 1GD6A 3CSRA 1TEWA 1F6SA 3OK0A 5APCA 5LA5A 2LYOA 2D4IA 1GF8A 2HUBA 1LHIA 3HBDA 4R0FA 4ETDA 4FDYA 4N0JA 1OUCA 1FKVA 1OUFA 2Q0MX 1IP2A 1FBIX 1P2CC 1VDPA 3WL2A 4LT3A 2HU1A 2G4PA 1LZEA 1T3PA 2MEFA 5B06A 4AXTA 3QE8A 1JKBA 1KIQC 5II3A 4XJIA 4B0DA 5IHGA 4PPOA 3P4ZA 4H94A 1IOSA 1D0MA 1QDTA 3ATOA 3CT5A 2BQJA 4WG1A 1LZAA 1DZBX 4DDAA 4GCDA 1YAOA 208LA 1GFGA 4UWNA 3E3DA 4X3BA 1GB0A 1GF4A 1I20A 1NDGC 3LYOA 3TXGA 4Z46A 5JENB 4B4JA 3WYHA 1BB3A 1HEOA 2H9JA 4LZTA 3P66A 4N1CC 5E4PA 1JKDA 1RCMA 3FE0A 5C6LA 2ZYCA 4WM3A 4H9EA 5KXPA 2F4GA 1LHJA 2LYMA 1YKYX 3TXDA 4RLMA 1KXXA 3N9AA 134LA 3QY4A 4NWHA 4OOTA 4IATA 2XBSA 4HPEA 4OWCA 3ULRA 1D6QA 4GN3A 1YAQA 2BQDA 3A3RX 1OUDA 4H92A 4NSJA 2CDSA 4BAPA 4LYZA 1IWUA 3MGWA 3WW6A 1SQ2L 1B0DA 5F14A 6LYZA 1LSMA 4H90A 1JJ0A 2LZTA 1GB2A 1IWZA 1B5XA 1UIAA 1LSPA 2IFFY 1C08C 4WG7A 5HMJA 2YBJA 5IDDA 1LHKA 1LJKA 4NSGA 1N4FA 5LVHA 1RJCB 2F2NA 4GCFA 4PRUA 3KAMA 4PJ2C 3D3DA 4H8XA 2N5ZA 1IY4A 1SLYA 3TXIA 1KXWA 1CJ8A 4DD2A 1BB7A 1IR7A 1G7IC 3A91A 1WTNA 1B7RA 5B07A 2MEAA 1CKCA 1LZ1A 2HEDA 3AGGG 1G7JC 3AZ5A 4II8A 4GCCA 5APFA 2X0AA 5LYZA 4NG1A 4GLVA 4QEQA 1GF9A 4PRQA 1BB4A 1NF5A 2HEFA 5HLLA 4XYYA 2LZ2A 3WMKA 5FDJA 1PS5A 1OUEA 3T36A 1LYSA 4NGWA 1LZSA 1LSDA 2ZYPA 1B7QA 2I26L 135LA 1JJ3A 4CFOA 4WLDA 1UIHA 1FLUA 4OOOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4J0LA 250LA 4NGJA 4I7RA 1F6RA 3C7ZA 1B7OA 2RB2X 1GXV2 4DDBA 3OJPA 5KXXA 158LA 5T3FA 3UONA 138LA 4LFPA 1KNIA 4LT1A 1LW9A 3HUQA 5F9UA 1PQKA 1L84A 1NHEA 1C6LA 1HHLA 1DI5A 3RW8A 5I4YA 1B5UA 2YDGA 5F81A 1B7PA 2HUMA 2RBRA 1L83A 4DYGA 1C6PA 137LA 4LYTA 234LA 2W1YA 1QT8A 1LZTA 1FLYA 1LSNA 4IAPA 1B5VA 2ZNWY 1L54A 1UICA 247LA 4H91A 2AUBA 3PDSA 5I4WA 3VWOA 1OV5A 1OVJA 1RI8B 3RNXA 4RLNA 2Z12A 254LA 178LA 1SX2A 3F6ZA 1LZ8A 120LA 1DKKA 5KXZA 3DN8A 1L93A 3HBEX 4PK0A 2ZQ3A 3EMSA 1LHHA 3RU5A 5ILCA 1GF6A 4BADA 2MEDA 2W1XA 4NHSA 1LYJA 4EKPA 4W51A 1P7SA 4W55A 248LA 1OUGA 199LA 3SBAA 4ARMB 4EKSA 2RH1A 5LYTA 1YL1X 4DQ7A 5LVGA 1CU5A 1L03A 4IJ4A 1C6JA 1DI4A 2Z2EA 4XADA 1D3JA 2BQMA 4DT3A 262LA 156LA 1OP9B 1XEIA 1LMAA 1JHLA 1GE4A 175LA 3HTGA 1B7SA 183LA 3AW6A 3TXBA 2Z6BA 4ETCA 1GFRA 3HFMY 2NTGA 1G07A 3AW7A 1L41A 2Z2FA 2RB1X 1LHLA 4YEOA 1EQ4A 2QARC 1D9WA 1LSBA 1LSZA 3FI7A 4NHTA 4XJHA 1L04A 1EPYA 5A3ZA 1HMLA 1HC0A 1L01A 1LYDA 3RUNA 185LA 1GEZA 5E9RA 1KY1A 1B9OA 1LI3A 1C6KA 1L69A 1LYGA 4ET8A 1JIYA 1P64A 3G3VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B5W A;  1OQM A;  7LYZ A;  1JIT A;  1LMO A;  2Z19 A;  4J0L A;  1HNL A;  3ZVQ A;  1HEN A;  3HBH A;  4HSF A;  4NGJ A;  1UCO A;  4W96 A;  1F6R A;  2BAA A;  1B7O A;  1VAT A;  1VFB C;  4GN4 A;  1VDQ A;  2MEG A;  1QUT A;  5I54 A;  2LYZ A;  1GXV 2;  5FST A;  3OJP A;  2BQE A;  4N8Z A;  1JKC A;  4DDB A;  4QY9 A;  5KXX A;  5I5Q A;  1IC7 Y;  4WM5 A;  5LAG A;  1IP3 A;  5T3F A;  4LFP A;  2MEE A;  3WXT A;  4LT1 A;  1LYO A;  4WLT A;  1WQP A;  1C7P A;  4J1A A;  4TTD A;  4YEM A;  4PHI A;  5F9U A;  1REX A;  2F4A A;  1LZB A;  4NSH A;  3LYZ A;  1GB3 A;  3LYT A;  1OUH A;  4XEN A;  3TXJ A;  5F16 A;  1NHE A;  3WUM A;  1HHL A;  1DI5 A;  1G7M C;  1GDX A;  2GV0 A;  3RW8 A;  193L A;  2Z38 A;  2BQN A;  5HQ1 A;  1FKQ A;  5I4Y A;  1B5U A;  2BQG A;  1HEQ A;  132L A;  2ZQ4 A;  3A96 A;  4CJ2 A;  1DI3 A;  2YDG A;  4ANR A;  1YRO A;  5F81 A;  133L A;  1B7P A;  2HEA A;  2ZNX Y;  2W1M A;  3B72 A;  4MCK A;  2MEC A;  1FLW A;  1I56 A;  9LYZ A;  3CSZ A;  4DYG A;  1LJF A;  4LFX A;  4WL7 A;  1IP4 A;  1CKG A;  1GBZ A;  4LYT A;  3WUA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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